SCREENING OF BIOSURFACTANT PRODUCED BY YEAST WITHIN PRODUCTION PROCESS SCREENING VLASTNOSTÍ KVASINKOVÝCH BIOSURFAKTANTŮ NA POZADÍ PRODUKČNÍHO PROCESU



Podobné dokumenty

STANOVENÍ, CHARAKTERIZACE A IDENTIFIKACE BIOREMEDIAČNÍCH MIKROORGANISMŮ

Vysoká škola chemicko-technologická v Praze Ústav chemie ochrany prostředí

USE OF BIOSURFACTANT FOR WASHING OF SOILS CONTAMINATED BY PESTICIDES POUŽITÍ BIOSURFAKTANTU PRO SANAČNÍ PROMÝVÁNÍ ZEMIN KONTAMINOVANÝCH PESTICIDY

Protokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test

ODSTRAŇOVÁNÍ KYANIDŮ Z MODELOVÝCH VOD

MIKROORGANISMY EDÍ. Ústav inženýrstv. enýrství ochrany ŽP FT UTB ve Zlíně

Přímé stanovení celkového počtu buněk kvasinek pomocí Bürkerovy komůrky Provedení vitálního testu

Látka toxická pro mikroorganismy a vyšší živočichy i v nízké koncentraci. Do prostředí se dostává: Používá se například:

LIFE IN THE CRUDE OIL THE POTENTIAL OF BIOREMEDIATION ŽIVOT V ROPĚ BIOREMEDIAČNÍ POTENCIÁL

Hodnocení pekařského droždí

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KVASINEK RODU SACCHAROMYCES

Aplikace anaerobního membránového bioreaktoru pro čištění farmaceutických odpadních vod

Biologické čištění odpadních vod - anaerobní procesy

AEROBNÍ MIKROORGANISMY UMOŽŇUJÍCÍ BIOREMEDIACI PŮDNÍ MATRICE KONTAMINOVANÉ TCE, DCE

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

Bioremediace ftalátů, endogenních disruptorů

ONLINE BIOSENZORY PŘI HLEDÁNÍ KONTAMINACE PITNÉ VODY

5. Bioreaktory. Schematicky jsou jednotlivé typy bioreaktorů znázorněny na obr Nejpoužívanějšími bioreaktory jsou míchací tanky.

Metody sterilní práce. Očkování a uchovávání mikroorganismů.

Poměr CNP v bioremediacích

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:

1) Pojem biotechnologický proces a jeho fázování 2) Suroviny pro fermentaci 3) Procesy sterilizace 4) Bioreaktory a fermentory 5) Procesy kultivace,

Využití stripování plynem při separaci acetonu, 1-butanolu a ethanolu z kultivačního média

ANAEROBNÍ LABORATOŘ VYUŽITÍ FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE PRO STUDIUM BIOREMEDIAČNÍCH PROCESŮ ZA ANAEROBNÍCH PODMÍNEK. Fluorescenční analytika

MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková

Využití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém

TEORETICKÝ ÚVOD. Počítání buněk

OPTIMALIZACE PROCESU KULTIVACE ZELENÝCH ŘAS S VYUŽITÍM DIGESČNÍCH ZBYTKŮ ZE ZEMĚDĚLSKÝCH BIOPLYNOVÝCH STANIC. Ing. Pavla Hrychová

Víme, co vám nabízíme

Zkouška inhibice růstu řas

Mykologická analýza potravin

THE USE OF HIGH PRESSURE PROCESSING ON ELIMINATION OF MICROORGANISMS IN VEGETABLE AND FRUIT JUICES

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

RESEARCH OF ANAEROBIC FERMENTATION OF ORGANIC MATERIALS IN SMALL VOLUME BIOREACTORS

Biologické čištění odpadních vod - anaerobní procesy

Průmyslová mikrobiologie a genové inženýrství

Biologické odstraňování nutrientů

Kultivační metody stanovení mikroorganismů

Zbytky léčiv v ŽP a jejich dopady na potravinářské technologie

Fouling a biofouling membrán při provozu MBR, metody potlačení Mgr. Ing. Bc. Lukáš Dvořák, Ph.D.

MYKOLOGICKÁ ANALÝZA POTRAVIN

FUNKČNÍ VZOREK. OPTIMALIZOVANÝ BIOKATALYZÁTOR LENTIKATS S IMOBILIZOVANÝMI KVASINKAMI SACCHAROMYCES sp. PRO BIOTECHNOLOGICKÉ APLIKACE

2.01 Aerobní/anaerobní reakce aneb kvasinky v akci. Projekt Trojlístek

Chemické složení buňky

MECHANISMUS TVORBY PORÉZNÍCH NANOVLÁKEN Z POLYKAPROLAKTONU PŘIPRAVENÝCH ELEKTROSTATICKÝM ZVLÁKŇOVÁNÍM

Ukázky: CCM katalog Anaerostat + generátor anaerobní atmosféry Plastové kličky Termostat se třepačkou. Očkovánía kultivace

N Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie

MYKOTOXINY. Jarmila Vytřasová. Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra biologických a biochemických věd

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Směsi a čisté látky, metody dělení

BIOLOGICKÉ LOUŽENÍ KAMÍNKU Z VÝROBY OLOVA

1.03 Důkaz tuků ve stravě. Projekt Trojlístek

Anaerobní mikrobiální procesy - teorie, praxe a potenciál pro bioremediace ANAEROBNÍ LABORATOŘ. Metabolismus. Respirace. Fermentace.

Základní stavební kameny buňky Kurz 1 Struktura -7

TUKY. Autor: Mgr. Stanislava Bubíková. Datum (období) tvorby: Ročník: devátý

Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie

IMPLEMENTACE BIOVENTINGU

Bioremediace půd a podzemních vod

LANDFILL LEACHATE PURIFICATION USING MEMBRANE SEPARATION METHODS ČIŠTĚNÍ PRŮSAKOVÝCH VOD ZE SKLÁDEK METODAMI MEMBRÁNOVÉ SEPARACE

Chemické speciality. Chemické speciality přednáška I

ANAEROBNÍ FERMENTACE

VLIV IRADIACE ULTRAZVUKEM NA PRODUKCI BIOPLYNU

ČIŠTĚNÍ A PŘEDÚPRAVA PROCESNÍCH A ODPADNÍCH VOD Z VÝROBY PAPÍRU ELEKTROCHEMICKÝM - FENTONOVÝM PROCESEM

ZKOUŠENÍ MALÝCH ČISTÍREN ODPADNÍCH VOD VE VÚV TGM, V.V.I

Cílená konstrukce bioaugmentačních preparátů a jejich pozice v procesu efektivních bioremediací

ÚLOHA MIKROBIÁLNÍHO SPOLEČENSTVA V BIOREMEDIACÍCH

Oxidační účinek ferátů na autotrofní a heterotrofní mikroorganismy

PŘENOS KYSLÍKU V BIOTECHNOLOGII. Úvod. Limitace metabolismu kyslíkem

DIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE V LABORATORNÍCH PODMÍNKÁCH

Biologické odstraňování nutrientů

VYUŽITÍ PRŮTOKOVÉ CYTOMETRIE PRO DETEKCI ÚČINNOSTI FILTRACE BAKTERIÍ V PROCESECH ČIŠTĚNÍ ODPADNÍCH VOD

Mykologická analýza potravin

VLIV IRADIACE ULTRAZVUKEM NA PRODUKCI BIOPLYNU

BIOLOGICKÉ ODBOURÁNÍ KYSELIN. Baroň M.

VYUŽITÍ SCREENINGOVÝCH MIKROBIOLOGICKÝCH TESTERŮ HACH LANGE

PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE - PERSPEKTIVNÍ ALTERNATIVA V ANALÝZE MIKROBIOLOGICKÝCH UKAZATELŮ KVALITY VOD

Cvičení 4: CHEMICKÉ SLOŽENÍ BUŇKY, PROKARYOTA Jméno: PROKARYOTA PŘÍPRAVA TRVALÉHO PREPARÁTU SUCHOU CESTOU ROZTĚR BAKTERIÍ

PODPOROVANÁ ATENUACE V PRAXI. Vít Matějů, ENVISAN-GEM, a.s. Tomáš Charvát, VZH, a.s. Robin Kyclt, ENVISAN-GEM, a.s.

EFFECT OF CADMIUM ON TOBACCO CELL SUSPENSION BY-2

Organická chemie 1. ročník studijního oboru - gastronomie.

ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

Prezentace navazuje na základní znalosti z biochemie (lipidy, proteiny, sacharidy) Dynamický fluidní model membrány 2008/11

Izolace nukleových kyselin

Máte rádi kuřata??? Jiří Hanika. Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i., Praha

Stanovení celkového počtu mikroorganismů

Mnohobuněčné kvasinky

BIODEGRADACE SPECIFICKÝCH POLUTANTŮ ZÁKLADNÍ PODMÍNKY

KOLONOVÉ TESTY ISCO K INTENZIFIKACI AEROBNÍ BIODEGRADACE LETECKÉHO PETROLEJE

Ž i v o t n o s t (= životaschopnost = vitalita = viabilita)

NÁVOD PRO STANOVENÍ ŽIVOTASCHOPNÝCH MIKROORGANISMŮ V BIOAEROSOLECH MONITORING VNITŘNÍHO PROSTŘEDÍ V MATEŘSKÝCH ŠKOLKÁCH 2016

DYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU

Zpráva o účincích bioenzymatické směsi PTP PLUS na kvalitu povrchových vod.

NÁVRH METODIKY PRO TESTOVÁNÍ ODOLNOSTI STAVEBNÍCH HMOT PROTI NAPADENÍ PLÍSNĚMI

Pouţití hydrolytických enzymů při produkci bioplynu z odpadů: Výsledky z praxe

Biodegradace zemin kontaminovaných leteckým petrolejem v kombinaci s chemickou oxidací kolonové testy

RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013)

Anaerobní proces. Anaerobní rozklad organických látek. Bioplyn

Transkript:

SCREENING OF BIOSURFACTANT PRODUCED BY YEAST WITHIN PRODUCTION PROCESS SCREENING VLASTNOSTÍ KVASINKOVÝCH BIOSURFAKTANTŮ NA POZADÍ PRODUKČNÍHO PROCESU Kristina Turnvaldová 1), Marek Šír 2), Zuzana Honzajková 2), Juraj Grígel 1), Jiří Mikeš 1), Martina Siglová 1), Miroslav Minařík 1) 1) EPS, s.r.o., V Pastouškách 205, 686 04, Kunovice, Czech Republic, e-mail: eps@epssro.cz 2) Institute of Chemical Technology Prague, Faculty of Environmental Technology, Technická 5, 166 28 Praha 6, Czech Republic, e-mail: sirm@vscht.cz Abstract: This paper deals with the description and optimization of the production process of biosurfactant produced by yeasts. Generally, nine yeast species were pre-selected as potential producers of biological surface-active compounds biosurfactants. Two yeast species were finally selected, based on the cultivation and production properties - Yarrowia lipolytica and Candida bombicola as reference microorganism. Optimization of the cultivation - isolation - purification process was then carried out with the particular yeast species. Influence of medium composition and cultivation conditions was studied in order to maximize biosurfactant production followed by isolation and purification steps, which are necessary for product characterization and yield determination. Biosurfactants YAR and CAN were isolated from the production medium by triple extraction into ethylacetate (volume ratio 3:1) with yields 100-500 mg.l -1. Keywords: Biosurfactant, lipophilic yeast, carbon source, remediation, soil washing, Oil Spreading test Abstrakt: Příspěvek se týká popisu a optimalizace produkčního procesu biosurfaktantu, jehož producentem jsou kvasinky. Celkem devět kvasinkových taxonů bylo vytipováno coby potenciální producenti biologických povrchově aktivních látek biosurfaktantů. Na základě kultivačních a produkčních vlastností pak byly vybrány dva taxony Yarrowia lipolytica a referenční Candida bombicola, na kterých byl dále optimalizován proces kultivace-izolace-purifikace produktu. Studován byl vliv složení média a dalších kultivačních podmínek, který je určující pro množství vyprodukovaného biosurfaktantu. Následné izolační a purifikační kroky jsou nezbytné pro získání co nejčistšího produktu pro jeho charakterizaci a určení výtěžku. Biosurfaktanty označené jako YAR a CAN byly izolovány z produkčního média trojnásobnou extrakcí do ethylacetátu v objemovém poměru 3:1 s výtěžky 100-500 mg.l -1. Klíčová slova: Biosurfaktant, lipofilní kvasinka, zdroj uhlíku, sanační promývání, Oil Spreading test Úvod Kontaminace různých matric životního prostředí nepolárními látkami je závažný ekologický i technologický problém. Důvodem je tvorba fázových rozhraní, zejména v systému kapalinakapalina na pozadí značně heterogenních prostředí. Nicméně týká se to i jiných typů odpadů, např. vytěžených sedimentů nebo půdy, popř. znečištěných sanačních sutí. Konkrétní odpovědí na překlenutí uvedených problémů je aplikace povrchově aktivních látek. Nejrozšířenější je používání synteticky vyráběných surfaktantů, v poslední době ale stále více sílí důraz na minimalizaci vedlejších zatížení životního prostředí, jimiž jsou v mnoha případech neúměrně velké dávky těchto látek. Za důvod lze na prvním místě označit silnou perzistenci surfaktantů a jejich negativní vliv na biologické membrány, což působí toxicky na mnoho organismů. Surfaktanty jsou látky, které vykazují jak hydrofilní, tak hydrofobní charakter. Mezi jejich nejvýznamnější vlastnosti patří schopnost snižovat povrchové napětí akumulací na fázové rozhraní

dvou navzájem nemísitelných kapalin, dále pak stabilizace emulzí a v neposlední řadě zvyšování rozpustnosti hydrofobních, nerozpustných organických látek ve vodném prostředí. Známější jsou tyto látky produkované synteticky, ale mnoho mikroorganismů je schopných produkovat tyto látky za účelem překonání fázového rozhraní mezi nepolárním zdrojem uhlíku a vodným prostředím, ve kterém žijí. Výhodou biologicky produkovaných surfaktantů je jejich nižší toxicita, vyšší biodegradabilita, lepší slučitelnost s prostředím, vyšší selektivita a specifická aktivita při extrémních podmínkách (teplota, ph a salinita). Atraktivní je také možnost produkce těchto látek z obnovitelných surovin (odpadní oleje apod.). V literatuře je popsáno mnoho biologických povrchově aktivních látek zejména bakteriálního původu, nicméně tuto schopnost mají i eukaryotní organismy vláknité houby a lipofilní kvasinky. Nespornou výhodou kvasinek oproti bakteriím je jejich statut netoxických a nepatogenních organismů (GRAS = generally regarded as safe), což umožňuje jejich využití v mnoha odvětvích (potravinářství, farmaceutický průmysl, environmentální technologie). Kvasinky jsou heterotrofní eukaryotní organismy, řadící se do říše hub (Fungi). Průmyslově využívány jsou zejména pro svou schopnost zkvašovat sacharidy na etanol a oxid uhličitý. Některé druhy kvasinek jsou schopny využívat jako zdroj uhlíku také látky nepolárního charakteru, jako například ropu nebo oleje rostlinného původu. Dostupnost nepolárních hydrofobních substrátů pro mikroorganismy žijící ve vodném prostředí je však omezená, proto jsou některé druhy kvasinek schopné produkovat povrchově aktivní látky, které jim umožňují překonat fázové rozhraní mezi prostředím a nepolárním substrátem a tento substrát metabolizovat. Známými producenty biologických povrchově aktivních látek jsou rody Candida sp., Yarrowia sp., Debaryomyces sp., Rhodotorula sp. a další. Kvasinka Yarrowia lipolytica (původně anamorfní druh Candida lipolytica) ochotně odbourává ropné produkty, n-alkany a rostlinné oleje. Candida bombicola má dle všech dostupných pramenů obrovský potenciál v tvorbě sophorolipidů (Daverey a kol., 2009 a 2010). Surfaktanty produkované biologickou cestou jsou atraktivní látky s širokým spektrem potenciálních aplikací. Největší potenciál mají biosurfaktanty pravděpodobně v bioremediačních technologiích a jako pokročilá technologie zvýšení těžby ropy. Široké pole možností se otvírá i v oblasti výroby detergentů a využití emulzifikačních možností v potravinářství, farmaceutickém a kosmetickém průmyslu. Biosurfaktanty se na rozdíl od synteticky vyráběných surfaktantů, tříděných podle povahy svých hydrofilních skupin, třídí podle chemického složení a mikrobiálního původu. Hydrofilní část se obecně skládá z aminokyselin nebo peptidových aniontů či kationtů, mono-, di- nebo polysacharidů. Hydrofobní část je tvořena nasycenými, nenasycenými nebo mastnými kyselinami. Hlavní skupiny biosurfaktantů jsou glykolipidy, lipopeptidy a lipoproteiny, fosfolipidy a mastné kyseliny a polymerní surfaktanty. Glykolipidy se skládají z dlouhého řetězce mastné kyseliny a mono-, di- a tetra sacharidů (glukóza, manóza, galaktóza, kyselina glukuronová, rhamnosa, sophorosa a sulfát galaktózy). Nejznámějšími glykolipidy jsou rhamnolipidy (Pseudomonas aeruginosa), trehalolipidy (Rhodococcus erythropolis) a sophorolipidy (Candida bombicola, C. apicola). Lipopeptidy a lipoproteiny jsou cyklické formy surfaktantů s antibiotickými účinky gramicidiny (Bacillus brevis). Do této skupiny patří např. viscosin (Pseudomonas fluorescens). Polymerní surfaktanty mají svou hydrofilní část složenou z heteropolysacharidů. Nejlépe prozkoumanými surfaktanty této skupiny jsou emulsan (Acinetobacter sp.), liposan (tvořený z 83 % sacharid + 17 % protein, Y. lipolytica), sacharid-protein-lipidové komplexy (Pseudomonas fluorescens, P. aeruginosa, Debaryomyces polymorphus) nebo mannoprotein, tvořený z 44 % manózou a ze 17 % proteinem a produkovaný Saccharomyces cerevisiae (Desai a kol., 1997). Biosurfaktanty pro sanační aplikaci jsou v současné době většinou rhamnolipidy produkované bakteriemi.

Mezi faktory ovlivňující produkci biosurfaktantu patří zdroj uhlíku, dusíku a přítomnost biogenních prvků. Produkci ovlivňují ve svém důsledku i environmentální faktory působící na růst buněk a jejich aktivitu, jako je ph, teplota, míchání a dostupnost kyslíku. V případě zdroje uhlíku jsou obvykle sledovány sloučeniny rozpustné ve vodě (glycerol, glukosa, mannitol, ethanol) a sloučeniny ve vodě nerozpustné jako n-alkany, olivový olej, parafín atd. Studie, prováděné za účelem sledování parametrů zvyšování produkce sophorolipidů, uvádějí výhodnost použití dvou zdrojů uhlíku v médiu, jeden hydrofilní (zpravidla glukóza) a druhý hydrofobní (např.rostlinné oleje, ropa, letecký petrolej). Metodika Kultivace v tekutém médiu počíná inokulací sterilního kultivačního média se zdrojem uhlíku substrátem. Kultivace probíhá ve sterilních Erlenmeyerových baňkách o různém objemu na třepačce při laboratorní teplotě a 120 rpm nebo v bioreaktoru. Technika Oil Spreading je metoda pro prokázání přítomnosti surfaktantu ve vzorku. Do Petriho misky l ropy a doprostřed je potom nadávkováno 5 ml vzorku. Přítomnost povrchově aktivní látky ve vzorku vytvoří čirou zónu, jejíž průměr je měřen (Techaoei a kol., 2007). Možnosti tvorby čiré zóny ukazuje obr. 1. Pokud vzorek povrchově aktivní látku neobsahuje, nedochází k tvorbě čiré zóny vůbec (vlevo nahoře). Průměr čiré zóny se s obsahem PAL zvyšuje (zleva). Obr. 1: Technika Oil Spreading možnosti tvorby čiré zóny Stanovením povrchového napětí roztoku surfaktantu v dostatečně širokém koncentračním rozmezí lze získat další charakteristiku daného surfaktantu. Pro měření povrchového napětí byl použit tenziometr K6 (Kruss GmbH) Du Noüyho metodou odtrhování prstence. Měření bylo prováděno na 20 ml vzorku produkčního média. Tributyrinový test se používá k určení lipolytické aktivity mikroorganismu na základě schopnosti mikroorganismu hydrolyzovat tributyrin. Principem testu je změna barvy indikátoru v případě, že proběhne hydrolýza tributyrinu. V 1 ml pufrovaného fyziologického roztoku (ph 7,2) se připraví hustá suspenze testovaného kmene, která se nechá inkubovat při 37 + 1 C po dobu 20 hodin. V případě pozitivní reakce (tributyrin +) dochází k zežloutnutí suspenze, při negativní reakci (tributyrin ) zůstává barva suspenze červená. Vitální barvení methylenovou modří umožňuje pozorovat morfologii buněk a také životaschopnost preparátu. Živé buňky mají cytoplazmatickou membránu polopropustnou a zachovávají si tak své přirozené zbarvení, zatímco cytoplazmatická membrána mrtvých buněk je zcela propustná, barvivo

proniká dovnitř buňky a obarvuje ji modře. Kultura (20 µl) je nadávkována na podložní sklíčko, nechá se zaschnout, zafixuje se nad plamenem a poté metanolem, vychlazeným na -18 C po dobu 5 minut. Po přidání 5 µl methylenové modři se provádí pozorování preparátu při zvětšení 40x10 a 100x10 fázovým kontrastem. Výsledky 1. Výběr produkčního mikroorganismu Testován byl soubor devíti kvasinkových taxonů, jejichž přehled je uveden v tabulce. Výběr vhodného producenta biosurfaktantu byl prováděn na základě několika kritérií. Hlavním kritériem byla samotná produkce povrchově aktivních látek na základě průběžného měření průměru čiré zóny (Oil Spreading) a výtěžků extrakcí. Jako doplňková metoda byl využit test lipolytické aktivity s tributyrinem, výsledky viz tab. 1. (pozitivní reakce je označena + a negativní -). Důležitým hlediskem je pak náročnost kultivace, požadavky na médium, substrát, rychlost růstu biomasy a náchylnost ke kontaminacím. Doplňujícím faktorem je pak dostupnost informací o typech biosurfaktantů produkovaných jednotlivými taxony a jejich charakterizace v literatuře. Tab. 1: Výběr produkčního taxonu dle kritérií Kvasinka Produkce biopal Lipolytická aktivita Kultivace, požadavky na C-zdroj Typ biopal (Desai et al. 1997, Amaral et al. 2008) Candida bombicola 1 + 1 C-zdroj Sophorolipid Yarrowia lipolytica Debaryomyces hansenii 1 + 2 + 2 C-zdroje testován 1C-zdroj Sophorolipid Lipopolysacharid (Liposan) Sacharid-protein-lipid komplex (D. polymorphus) Geotrichum candidum 2 + testován 1C-zdroj Neznámý Lipomyces starkeyi 3 + testován 1C-zdroj Neznámý Saccharomyces cerevisiae Rhodotorula mucilaginosa 3-4 + Náročná, 2 C-zdroje, častá kontaminace Náročná, 2 C-zdroje Mannoproteiny Polyollipidy (R. glutinus a R. graminus) Candida maltosa 4 - Nenáročná Více typů (Candida sp.) Candida utilis 4 + Nenáročná Více typů (Candida sp.) 2. Složení kultivačního média a podmínky kultivace Po výběru produkčního taxonu, resp. dvou zástupců - Yarrowia lipolytica a Candida bombicola bylo přikročeno k optimalizaci produkčního média. Zdroj uhlíku: biosurfaktanty jsou většinou tvořeny sacharidovou hydrofilní hlavou a hydrofobním řetězcem mastné kyseliny, proto je vždy doporučováno produkční médium se dvěma zdroji uhlíku. Pro

tyto účely bylo zkoušeno médium BSM 2C (minerální médium s obsahem glukózy a rostlinného oleje) a YEPG (kvasničný extrakt, pepton, glukóza, rostlinný olej). Pro srovnání a také z důvodu snahy snížit náklady velkoobjemových kultivací a riziko kontaminací bylo do experimentů zahrnuto i médium s jedním, nepolárním zdrojem uhlíku (BSM 1C). Porovnávány byly maximální výtěžky extrakcí (tab. 2). Tab. 2: Porovnání výtěžku biosurfaktantu pro 1 zdroj uhlíku (1C) a 2 zdroje uhlíku (2C) v médiu Kvasinka Zdroj uhlíku maximální produkce (mg.l -1 ) 1C 2C Rozdíl ve výtěžku (%) Yarrowia lipolytica 300 500 o 40 pro 2C Candida bombicola 150 100 o 50 pro 1C Podmínky kultivace: základní faktory určující každou kultivaci jsou teplota, ph a potřeba kyslíku. U kvasinek obecně dochází v průběhu kultivace k okyselování prostředí, typický průběh ph je pokles z 6,5 na hodnotu 3 během 48 hodin. V literatuře se přístupy liší, některé prameny uvádějí vhodnost regulace ph na hodnotu 6,5, a naopak jiné nechávají kultivaci volný průběh. Během experimentů s udržováním ph na hodnotě 6,5 došlo v našem případě opakovaně ke kontaminaci kultivace, výtěžky extrakcí byly minimální. Kvasinky jsou fakultativně anaerobní mikroorganismy, v případě produkce surfaktantů je třeba zajistit maximální vzdušnění produkčního média, aby nedocházelo k fermentaci. Kultivace probíhaly za laboratorní teploty 20-25 C. 3. Monitoring produkce biosurfaktantu Důležitou otázkou v procesu produkce biosurfaktantů je určení optimálního stavu produkčního média, kdy je v něm dosaženo maximální produkce těchto látek. V rámci experimentálních prací bylo zvoleno několik metod metody pro sledování růstu buněk, Oil Spreading test, měření povrchového napětí a mikroskopie. V průběhu kultivací byly odebírány vzorky a všechny parametry byly sledovány zároveň. Metody používané ke sledování růstové fáze vycházejí z existence vztahu mezi růstem, využitím substrátu a produkcí biosurfaktantu. Mikroorganismy tvoří biosurfaktanty částečně jako primární součást svého metabolismu, ke zvýšené produkci jsou však zpravidla donuceny ve stacionární fázi růstu z důvodu limitace substrátem, a zejména pak dusíkem a mikroelementy (Desai a kol., 1997). Tvorba povrchově aktivních látek za účelem získání co nejvíce substrátu pak může znamenat konkurenční výhodu. Pro experimentální účely bylo použito počítání kolonií (CFU, český ekvivalent KTJ kolonie tvořící jednotka) a měření optické denzity při 550 nm (OD 550nm ). Jak ukazuje graf 1, při měření tyto hodnoty odpovídají, pro další experimenty proto byl využíván hlavně parametr OD a CFU bylo prováděno kontrolně. Technika Oil Spreading je jednoduchý orientační test bez nároků na vybavení, který lze uchopit jako nástroj k rychlému určení produkce biosurfaktantu ve vzorku. Graf 2 znázorňuje průběh OD a průměru čiré zóny v čase. Maximální hodnoty čiré zóny byly zjištěny na konci exponenciální fáze a dále pak ve stacionární fázi růstu. Při použití metody měření povrchového napětí se vycházelo z předpokladu, že produkce biosurfaktantu bude indikována snížením povrchového napětí. To by se také během kultivace nemělo zvyšovat, pouze zůstávat stejné jako na počátku. Zároveň bylo cílem experimentů ověřit, zda spolu koreluje průběh tvorby čirých zón v čase a hodnoty povrchového napětí. Zde byl logický předpoklad, že při snížení povrchového napětí dojde k zvětšení průměru čiré zóny. Reálně však došlo ke snížení ihned po inokulaci produkčního média a následující snížení v průběhu kultivace již bylo pouze minimální, popřípadě docházelo i ke zvyšování naměřených hodnot. Tyto změny se řádově pohybovaly v jednotkách. Průběh měření ilustruje graf 3. Co se týče korelace s hodnotami průměru čirých zón v čase (viz graf 4), do jisté míry vskutku dochází ke kopírování trendu, nicméně opakovaná měření již nebyla tak průkazná. Povrchové napětí lze doporučit pro měření roztoků s izolovaným biosurfaktantem (viz příspěvek Ing. M. Šíra a kol. v posterové sekci).

Graf 1: Průběh OD a CFU v čase (Candida bombicola) Graf 2: Průběh OD a průměru čirých zón v čase (Candida bombicola) Graf 3: Povrchové napětí v různých produkčních médiích s Candida bombicola Graf 4: Průběh povrchového napětí a tvorby čirých zón v čase Yarrowia lipolytica Další možností pro určení takového stavu produkčního média, kdy je dosaženo maximální produkce biosurfaktantů, by mohlo být pozorování morfologických změn buněk kvasinek mikroskopicky. Tento koncept vychází z vysoké plasticity kvasinkových taxonů, která se projevuje mj. existencí anamorfní a teleomorfní formy. Výskyt těchto forem je často determinován stresovými environmentálními faktory (Herrera a Sentandreu, 2002). Dimorfismus v podobě střídání fáze kvasinky a fáze tvorby hyf (pseudomycelární růst) může zásadním způsobem ovlivňovat i produkci pomocných metabolických látek, mezi které biosurfaktanty bezesporu patří. Bylo publikováno několik studií, které se podrobně zabývaly dimorfismem ve vazbě na biodegradaci (Yeast Biotechnology: Diversity and Applications upravili: T. Satyanarayana, Gotthard Kunze). Ve spojení s biosurfaktanty je téma vysoce aktuální a neuspokojivě řešené z hlediska kvantity informací i jejich vypovídací hodnoty pro reálné aplikace. 4. Izolace a purifikace produktu Po ukončení kultivace je kultivační médium ve sterilním prostředí rozděleno do centrifugačních zkumavek. Cílem centrifugace je odstranění biomasy, popřípadě získání dalších povrchově aktivních látek obsažených v buňkách kvasinek. Proto je vhodné zvolit vysokou rychlost otáček po delší dobu, jako optimální se ukázalo nastavení na 10 000 rpm po dobu 15 minut. Biomasa je oddělena a zlikvidována, získaný supernatant je odlit do sběrné nádoby a vstupuje do dalšího kroku extrakce. Pro ověření funkčnosti centrifugace při získávání produktu byl proveden srovnávací experiment. Polovina objemu kultivační směsi (homogenizována mícháním) byla centrifugována výše uvedeným postupem. Druhá polovina byla ponechána bez centrifugace a extrahována i s biomasou. V případě Yarrowia lipolytica (BSM 2C) byl výtěžek vyšší při použití extrakce produkčního média s biomasou, ošetřeného ultrazvukem, v případě Candida bombicola tento rozdíl není tolik významný (viz tab. 3).

Tab. 3: Porovnání separačních technik pro izolaci biosurfaktantu z hlediska výtěžku Kvasinka Metoda izolace Rozdíl ve výtěžku (%) centrifuga ultrazvuk pro ultrazvuk Yarrowia lipolytica 300 400 25 Candida bombicola 150 170 12 Pro získání čistého produktu je nutné provést extrakci roztoku, který prošel úpravou na centrifuze či ultrazvuku. Pro účely extrakce byla zkoušena organická rozpouštědla (ethylacetát, chloroform), směsná rozpouštědla (ethylacetát+isopropanol, chloroform+methanol) i kyselá extrakce s následným vymražováním. Největších výtěžků bylo dosaženo třístupňovou extrakcí ethylacetátem. Produkt, extrahovaný do ethylacetátu byl pětkrát promyt hexanem a odpařen na rotační vakuové odparce. Popis a přehled výtěžků získaných produktů je uveden v Tabulka 4. Tabulka 4: Přehled získaných produktů popis a výtěžky Kvasinka Popis produktu - látka Výtěžky (mg/l) Médium, C-zdroj max. (prům.) Candida bombicola bílá semikrystalická 170 (140) BSM, 1 C-zdroj Yarrowia lipolytica světle hnědá viskózní 400 (275) BSM, 2 C-zdroje Debaryomyces hansenii světle hnědá semikrystalická 50 BSM, 1 C-zdroj Geotrichum candidum zelená viskózní < 50 BSM, 1 C-zdroj Lipomyces starkeyi světle hnědá viskózní 50 BSM, 1 C-zdroj Saccharomyces cerevisiae šedá semikrystalická < 50 BSM, 1 C-zdroj Rhodotorula mucilaginosa světle hnědá viskózní < 50 BSM, 1 C-zdroj Diskuse Na základě screeningových testů byly vybrány dvě kvasinky Yarrowia lipolytica a Candida bombicola. Oba taxony vykazují nejvyšší produkci biosurfaktantů z testovaného souboru, byla pro ně vyvinuta a optimalizována izolační a purifikační metoda a jejich struktura je popsána v literatuře. Otázka přítomnosti dvou zdrojů uhlíku v produkčním médiu se zatím jeví pro oba taxony rozdílně. V případě Y. lipolytica byl při kultivaci se dvěma zdroji uhlíku konečný výtěžek extrakce až o 40 % vyšší. Naopak u C. bombicola bylo získáno více produktu jen s nepolárním zdrojem uhlíku (rostlinný olej), navíc při přítomnosti glukózy v produkčním médiu nastávaly při extrakci problémy s vytvářením emulzí a tím zhoršování účinnosti extrakce a zvyšování potřeby rozpouštědla. Přístupy k vlivu ph se v literatuře liší, některé prameny uvádějí vhodnost regulace ph na hodnotu 6,5 (Amaral a kol., 2006), a naopak jiné nechávají kultivaci volný průběh (Desai a kol., 1997). Okyselování prostředí je základním životním projevem kvasinek, které si tak zajišťují optimální podmínky pro svůj růst a naopak znemožní rozvoj svým konkurentům (bakteriím). Dále pak tento proces funguje proti přerůstání kultivace. Vzhledem k náchylnosti kultivací ke kontaminaci a z toho plynoucích nízkých výtěžků se jako vhodnější jeví ponechání přirozeného průběhu ph v produkčním médiu. V neposlední řadě pak je tento postup výhodnější i z ekonomických důvodů. Dlouhodobým testováním metody Oil Spreading coby důkazu přítomnosti povrchově aktivní látky ve vzorku se ukazuje, že test je vhodné použít v kombinaci s dalšími metodami, nejlépe sledování růstu měřením optické denzity nebo počítáním kolonií. Ovlivnění tvorby zón může být způsobeno přesností dávkování vzorku, způsobem jeho odběru a také přítomností oleje ve vzorku. Samotné médium (BSM, YEPG) zóny netvoří. Mikroorganismy mohou produkovat jak extracelulární biosurfaktanty, tak biosurfaktanty vázané na buňku (Desai a kol., 1993), proto je vhodné porovnat jak vzorek surového produkčního média, tak i média s porušenou strukturou buněk (po odstředění nebo ošetření ultrazvukem).

Výše zmíněné rozlišení extracelulárních a na buňku vázaných biosurfaktantů souvisí zřejmě také s vyšší účinností ošetření produkčního média ultrazvukem než odstředěním v rámci procesu izolace produktu. Tato otázka by měla být dále řešena v aplikovaném výzkumu. Závěr Kvasinkami produkované biosurfaktanty mohou mít potenciál při odstraňování kontaminací nepolárními polutanty. Oba vybrané taxony - Yarrowia lipolytica a Candida bombicola vykazují dobrou produkci povrchově aktivních látek a zároveň pro ně byla vyvinuta uspokojivá metoda izolace a purifikace biosurfaktantu z produkčního média extrakcí ethylacetátem. Nástrojem pro určení maximální produkce byly zvoleny metody pro sledování růstu (OD a CFU) v kombinaci s testem Oil Spreading. Poděkování Tento příspěvek referuje o výsledcích řešení projektu TA01020482, který byl vytvořen s finanční podporou TA ČR. Literatura: Daverey A., Pakshirajan K. 2009. Production, Characterization, and Properties of Sophorolipids from the Yeast Candida bombicola using a Low-cost Fermentative Medium. Applied Biochemistry and Biotechnology 158, pp. 663-674. Daverey A., Pakshirajan K. 2010. Sophorolipids from Candida bombicola using mixed hydrophilic substrates: Production, purification and characterization. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 79, pp. 246-253. Desai J. D., Banat I. M. 1997. Microbial production of surfactants and their commercial potential. Microbiology and Molecular Biology Reviews 61, pp. 47-64. Techaoei S., Leelapornpisid P., Santiarwarn D., Lumyong S. 2007. Preliminary screening of biosurfactant-producing microorganisms isolated from hot spring and ganges in northern Thailand. Sci. Tech. J. 7, pp. 38-43. Amaral P. F. F., Coelho M. A. Z., Marrucho I. M., Coutinho J. A. P. 2008. Biosurfactants from Yeasts: Characteristics, Production and Application. In: Ramkrishna Sen (ed.). Biosurfactants, Springer, pp. 236-249. Ruiz-Herrera J., Sentandreu R. 2002. Different effectors of dimorphism in Yarrowia lipolytica. Archives of Microbiology 178, pp. 477-483. Doiphode N., Joshi C., Ghormade, V., Desphande M. 2006. Biotechnological applications of Dimorphic Yeasts. In Satyanarayana T., Kunze G. (ed.). Yeast Biotechnology: Diversity and Applications. Springer, pp. 636 647. Amaral P. F. F., Silva J. M., Lehocky M., Barros-Timmons A. M. V., Coelho M. A. Z., Marrucho I. M., Coutinho J. A. P. 2006. Production and Characterization of a Bioemulsifier from Yarrowia lipolytica. Process Biochemistry 41, pp. 1894-1898. Desai J. D., Desai A. J. 1993. Production of Biosurfactants. In: Kosaric N. (ed.), Biosurfactants: Production, Properties, Applications. Marcel Dekker, New York, pp. 65-97.