Ochrana na úrovni populací: od lokální populace k metapopulacím
|
|
- Marian Neduchal
- před 8 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Ochrana na úrovni populací: od lokální populace k metapopulacím
2 POPULACE - množina jedinců mezi nimiž probíhá vzájemné párování - ideálně obývá vyhraněné území - základní jednotka v evoluci, druhové ochraně N t+1 = (N M) + (I E) r vnitřní rychlost růstu, K nosná kapacita prostředí Hrozby v malých populacích: demografická stochasticita environmentální stochasticita genetické ochuzení
3 Demografická stochasticita smůla postihne spíše malou než velkou populaci - nevhodná věková struktura - nevhodná pohlavní struktura P = 1 / 2 n 1 - pohlaví se nepotkají. 0.6 P (všichni jedno pohlaví) Velikost populace
4 Protandrie okáče jílkového
5 Demografické problémy okáče skalního
6 Environmentální stochasticita Nepředvídatelné výkyvy prostředí - počasí - výkyvy v nabídce potravy - disturbance - živelné katastrofy -
7 Změna klimatu a stochasticita: Onager v Izraeli sucho mírně (15%) snižuje počet odstavených mláďat, což silně (30%) zvyšuje variabilitu v růstu populace (Saltz et al., Conserv. Biol. 20: ) Všivec Pedicularis exaltata jediná populace v ČR málem zničena sesuvem půdy (80. léta)
8 Negativní závislost na hustotě
9 Biologická pozadí Alleeho efektu potíže s nalezením partnera (medvědi v Beskydech ) zhoršená obrana před predátory někteří bahňáci (čejka) horší získání / obrana potravy (velikost smeček psa hyenovitého) zhroucená sociální struktura (holub stěhovavý, tetřev) vyřazení jedinců z reprodukce (zvl. u nadbytky samců)
10 Genetické problémy Sewall Wright (30. léta): izolovaná populace, 2 alely na lokus, náhodné párování Ztráta variability na generaci: F = 1 / 2N % ztráty variability za generaci Velikost populace Proč to vadí: - ztráta momentálně i potenciálně užitečných alel (prostředí se neustále mění) - ztráta evolučního potenciálu
11 Lacy (1987) pokles genetické variability (% heterozygotů) v různě velkých populacích
12 Inbreeding příbuzenské párování Proč vadí: - fixace škodlivých alel - snížená plodnost, životaschopnost spermií - menší velikost - vyšší mortalita mláďat - poruchy imunity - (snížená inteligence) -
13 F-statistika (fixační index) stupeň poklesu heterozygotnosti vinou odklonu od H-W rovnováhy Systém dvou alel, As Kde očekávaná hodnota, při Hardy-Weinbergově rovnováze, je F IT lze rozdělit na F IS - ztráta v rámci jedinců uvnitř subpopulace (inbrední koeficient) F ST - ztráta způsobená diferenciací populace (většinou izolací, driftem)
14 Drift: náhodný proces (jedinci se páří a frekvence fluktuují) Hardy- Weinberg (H = 2pq) Důsledky obdobné jako u inbreedingu, ale mechanismus jiný. Výrazný v malých populacích, neviditelný ve velkých Hráčské dilema: kdo hraje dostatečně dlouho, vyhraje nebo prohraje všechno
15 Inbrední deprese v přírodě Felis concolor coryi ( Florida panther ) - posledních jedinců - 95% spermií k ničemu - vrozené srdeční vady Žije v hustě zalidněné oblasti, problém najít dostatečně velké území Taxonomické spory: zaslouží si ochranu, jestliže nejde o poddruh?
16 Ohrožené druhy bez inbr. deprese Falco punctatus (poštolka mauricijská) - v r populace klesla na 4 jedince - chovná skupina z odebraných vajíček - Durrellova ZOO (Jersey) - dnes na 800 ks (v přírodě ca 50) Anas layasensis (kachna laysanská) - havajský ostrov Laysan - původně na celém souostroví, vyh. Polynésany, krysami, nakonec kompetice s králíky : 7 dospělých, 5 mláďat; od 20. let ochrana, hubení králíků a krys - v 50. letech ca 500, pak El Nino, pokles na ca 100, dnes opět přes 500 (i na jiných ostrovech)
17 Genetic rescue (opak inbreedingu): přidáním malého počtu nepříbuzných jedinců jasoňčervenooký v Pieninách Genetic purging: během bottlenecku vymizí škodlivé alely severní populace rypouše sloního
18 Outbrední deprese - narušením koadaptovaných genových kompexů - méně zdokumentovaná - obecně se projevuje později než i.d. Příklad: genetická inkompatibilita rostlin
19 Genetic swamping (případ outbrední deprese?) Canis rufus (vlk rudohnědý) vs.canis latrans (kojot) - JV USA : 17 posledních přeneseno do záchranného chovu : ca 100 jedinců v přírodě (20 rodin ) - hrozí hybridizace s kojotem - někteří autoři druh pokládali za hybrida, dnes se věří, že jde o druh Viola sudetica vs. Viola tricolor - hybridní roje v Krkonoších, méně v Jeseníkách
20 EFEKTIVNÍ VELIKOST POPULACE - ideální populace se stejnou H e jako pozorovaná populace - počet reprodukujících se jedinců (1) Poměr pohlaví N e = (4)(N m )(N f ) / (N m + N f ) harémové" struktury savců (N m << N f ) Ex.: if N m = 1 alfa samec + N f = 200 N e = (4)(1)(200)/( ) = 3.98 eusociální hmyz Ex.: if N f = 1 královna" a N m = 1,000 trubců N e = (4)(1)(1,000)/(1 + 1,000) = 3.99
21 2) Nerovnoměrná reprodukční úspěšnost N e = 4 N / ( σ 2 + 2) sigma: rozptyl počtu mláďat na samici plemenné knihy: snaží se minimalizovat jmenovatele 3) Fluktuace početnosti N e = harmonický průměr za x generací obrácená hodnota průměru obrácených hodnot 1 / N e = 1/t (1/N 1 + 1/N 2 + 1/ N t )
22 Jak velké populace tedy potřebujeme? Pravidlo 50 / na základě simulací a zkušeností 50 = okamžité minimum, zabrání inbreedingu + driftu 500 = přežití 100 let Ale co populace v přírodních podmínkách? Fagan et al., Ecology Letters 4(2001): reálnéčasovéřady pro 1941 populací 758 druhů z Global Population Dynamics Database -časová dynamika 46-90% druhů je tak velká, že ani velmi velké populace nezabrání extinkci do 100 let
23 Fagan et al. (Ecology Letters 4(2001): )
24 Analýza životaschopnosti populací v přírodních podmínkách Reed et al. (Biological Conservation 113 (2003) 23 34) časovéřady, 102 druhů obratlovců PVA simuluje budoucnost populací na základě r, N, variačního koeficientu atd.
25 Reed et al. (Biological Conservation 113 (2003) 23 34) - potřebujeme tisíce jedinců obratlovců! - bezobratlých??? - význam kontextu, imigrace, propojenosti
26 Příklad ze střední Evropy hnědásek osikový hnízdních stromů hnízd imága
27 Jak to, že nějaké populace ještě existují? - většina populací je velká - selekce, zejména frekvenčně závislá selekce vzácných alelel -nenáhodné párování (assortative mating) - mutace vznik variability de novo - migrace genový tok mezi populacemi - jediný imigrant za generaci (pokud se rozmnoží) udělá tolik, co absolutně nereálná mutační rychlost 1%
28 Migrace vs. velikost populace Je-li k dispozici dost imigrantů, na velikosti populace tolik nezáleží
29 Extinkční víry: čím je populace menší, tím je na tom hůř Demografická a environmentální stochasticita snižují početnost => genetické ochuzení => větší náchylnost k demografickým a environmentálním rizikům
30 Co když je populací více: METAPOPULACE 1. jen málo druhů se vyskytují plošně 2. většina tvoří lokální populace (= kolonie, local colonies) omezené na plošky (patches) vhodných prostředí 3. málokterá lokální populace je dost velká, aby přežila sama o sobě 4. obsazenost plošek se mění v prostoru a čase 5. závisí na velikosti (kvalitě) a izolovanosti plošek METAPOPULACE - soubor lokálních populací, z nichž málokterá je schopna přežít sama o sobě - jejich vnitřní dynamika je asynchronní, navz. nezávislá - jsou propojeny migrací jedinců
31 Tři britští motýli: závislost obsazenosti plošek na jejich velikosti a izolaci Thomas, Thomas & Warren, 1992, Oecologia 92:
32 Levinsův model (1970s) - všechny plošky rovnoprávné, shodně propojené - vliv disperze << vliv událostí v ploškách - vnitřní dynamika zanedbána, zajímají nás jen kolonizace c a extinkce - e Změna počtu obsazených plošek v čase t závisí na počtu kolonizací a extinckí Metapopulace v rovnováze: N < 1, část plošek bude vždy prázdná
33
34 Prostorově realistické modely Ilka Hanski a další Plošky se liší velikostí, propojeností (tzv. konektivitou) Hlavní proměnné: Plocha Konektivita / izolace Riziko extinkce Kolonizace Velikost plošky souvisí s extinkcí (vnitřní dynamika) i kolonizací (větší cíl )
35 Hnědásek kostkovaný (Melitaea cinxia) na Alandech, Finsko
36 Svět je složitý: plošky se od sebe liší
37 Rescue effect ( samozachránění metapopulace ) Imigrace může zabránit extinkci - velké kolonie vymírají s menší pravděpodobností a produkují více kolonistů - bližší plošky jsou kolonizovány spíše, než vzdálené - kolonizované plošky se opět stávají zdroji kolonistů => metapopulaci můžeme zachránit pouhým zvýšením počtu plošek a/nebo zvýšením konektivity
38 Rescue efekt však platí i naopak! - celá metapopulace může vyhynout, když s pouze klesne počet a/nebo velikost plošek Critical thresholds in metapopulation dynamics - klesne počet plošek - uvnitř plošek dál funguje nezávislá vnitřní dynamika, včetně extinkcí - plošky sice produkují emigranty (= kolonisty), ale pokud ti nenajdou vhodné neobsazené plošky, jsou de facto ztraceni - metapopulace se zřeďuje ---- bez zvýšení počtu plošek není síla, která by proces zastavila
39 Několik dalších poznámek Matrix matters! Metapopulační modely s dichotomií ploška x matrix nejsou realistické Vedle rozlohy plošky záleží na kvalitě - sources and sinks (zroje a propady) - kvalita může být důležitější než rozloha (modely zde často předpokládají přímou úměru) - strašně důležité v kulturní krajině!!!
40 Dynamické metapopulace vedle vnitropopulační dynamiky a kolonizace se mění i kvalita plošek - nepředvídatelně (pak asi lze skrýt do vnitropopulační dynamiky) - předvídatelně -- lidskáčinnost -- sukcesní změny - staré stromy - lesní světliny - spáleniště, říční náplavy - tůně - ponořené dřevo - mycetofágní druhy v houbách V přírodních podmínkách by většina metapopulací byla dynamická
41 Hnědásek jitrocelový: u nás není ohrožen, v Anglii je obdobou našeho h. osikového
42
43 V celé krajině: kácet 2.3% ročně V jednotlivých lesích: kácet mnohem víc Hodgson et al.: Biological Conservation 142 (2009)
44 1. Vliv inbreedingu na vymírání přírodních populací - nikdo dlouho nepochybuje o i. v zajetí. - v přírodě se předpokládal > vliv environmentální stochasticity atd. Metapopulace hnědáska kostkovaného, Melitaea cinxia, na Alandských ostrovech Sledována po > 10 let, zná se poloha, velikost, fluktuace atd. každé kolonie
45 Jak ale vliv inbreedingu dokázat? - 42 kolonií, známá velikost, konektivita, množství živné rostliny atd. - 7 z a nich příští rok vyhynulo - alozymové a mikrosatelitové markery - multiple - regrese ukázaly, že za vymírání mohla nízká heterozygotnost a nikoli environmentální faktory
46
47 Experimentální důkaz: - dvě (hodně vzdálené) populace - vychována inbrední a outbrední linie, vysazeny do neobsazených ale vhodných lokalit (N=12) - mark-recapture: rozdíly se netýkaly přežívání dospělců, ale reprodukčních vlastností (např. mortalita larev, délka života samic ) - do příští sezóny přežily jen dvě inbrední, ale 6 outbredních kolonií Saccheri I, Kuussaari M, Kankare M, et al., 1998, Inbreeding and extinction in a butterfly metapopulation. Nature 392 (6675):
48
49 2. Historická izolace versus zakladatelský bottleneck Okáč horský (Erebia epiphron), endemický poddruh silesiana
50 - velká jesnická populace: 10^5 jedinců - malá jesenická populace: 10^3 jedinců, albinotičtí jedinci - krkonošská populace: původně 50 jedinců, dnes statisíce Table 1: Parameters of genetic heterogeneity of all studied populations of Erebia epiphron from northern Czechia Abbreviations: H e : expected percentage of heterozygosity; P tot : total percentage of polymorphic loci; P 95 : polymorphic loci with the most common allele not exceeding 95%; A: mean number of alleles per locus; N: number of studied individuals L1 L2 L3 S I1 I2 mean ± sd H e 12.1% 9.6% 8.2% 5.5% 11.7% 11.5% 9.8% ± 2.6 P tot 52.9% 52.9% 47.1% 41.2% 41.2% 41.2% 46.1% ± 5.8 P % 35.3% 23.5% 17.6% 41.2% 41.2% 32.4% ± 9.7 A ± 0.11 N a ± 6.2 a Total N = žádný škodlivý dopad v introdukované populaci - malá původní populace naopak geneticky ochuzená navzdory velké početnosti (pamatuj 500/5000) - ale variační koeficient (za 5 let) 0.78! Schmitt, Čížek & Konvička, Biological Conservation, in press
51 3. Znamená to, že k introdukcím nám stačí 50 jedinců? Asi ne, snížení variability pozorovány u jiných introdukovaných zvířat perleťovec mokřadní (Proclossiana eunomia): 24 ks - rozdíl mezi kontinuálním a fragmentovaným prostředím - falangové vs. steppning stones šíření - endemiti (Erebia) jsou ochuzeni od začátku, z menší variability se pak nemá co ztratit modrásek černolemý (Plebejus argus): 90ks
52 4. Nejhorší situace u náhle zmenšených populací Rana Oblik Srdov Dlouha Vranik Kamyk mean ± SD Germany H e [%] ± ± 1.3 H o [%] ± 2.5 A ± ± 0.07 P tot [%] ± ± 5.7 P 95 [%] ± ± 3.5 N F IS = F ST = minimální diferenciace, malý inbreeding => Populace je zatím geneticky v pořádku, ale už se projevuje diferenciace
53 Co si odnést - většina populací by v izolaci zanikla, kromě populací extrémně velkých - proti genetickému ochuzení pracují selekce, migrace - pravidlo 50/500 spíše v zajetí, v přírodě spíše tisíce jedinců - metapopulační přežívání druhů ve fragmentované krajině: význam rozlohy a propojenosti - vedle geometrie plošek (stanovišť) důležitá i kvalita - tu často lze ovlivnit péčí o stanoviště - příroda je dynamická, dynamickými změnami procházejí i stanoviště - v přírodních poměrech většina druhů fungovat v dynamických metapopulacích
Genetika vzácných druhů zuzmun
Genetika vzácných druhů Publikace Frankham et al. (2003) Introduction to conservation genetics Časopis Conservation genetics, založeno 2000 (máme online) Objekt studia Genetická diversita Rozložení genetické
VícePROSTOROVÁ EKOLOGIE, metapopulace, kvantitativní změny populace
Partnerství pro rozvoj vzdělávání a komunikace v ochraně přírody reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/17.0073 PROSTOROVÁ EKOLOGIE, metapopulace, kvantitativní změny populace Filip Harabiš Katedra ekologie, FŽP,
VíceTEORIE OSTROVNÍ BIOGEOGRAFIE (TOB)
Organismy v krajině krajinné uspořádání a jeho vliv na organismy, populace a společenstva teorie ostrovní biogeografie metapopulační teorie zdroje a propady 34 TEORIE OSTROVNÍ BIOGEOGRAFIE (TOB) MacArthur
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
VícePropojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Genetika populací Studium dědičnosti a proměnlivosti skupin jedinců (populací)
VíceKonzervační genetika INBREEDING. Dana Šafářová Katedra buněčné biologie a genetiky Univerzita Palackého, Olomouc OPVK (CZ.1.07/2.2.00/28.
Konzervační genetika INBREEDING Dana Šafářová Katedra buněčné biologie a genetiky Univerzita Palackého, Olomouc OPVK (CZ.1.07/2.2.00/28.0032) Hardy-Weinbergova rovnováha Hardy-Weinbergův zákon praví, že
VíceHardy-Weinbergův zákon - cvičení
Genetika a šlechtění lesních dřevin Hardy-Weinbergův zákon - cvičení Doc. Ing. RNDr. Eva Palátová, PhD. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním
VíceOchrana na úrovni druhů a populací
Ochrana na úrovni druhů a populací NÁCHYLNOST DRUHŮ K VYMÍRÁNÍ malý areál - endemiti malý počet populací - přírodní faktory (zemětřesení, požáry, nákazy), vliv člověka malá velikost populace paradigma
VíceProblémy malých populací
Problémy malých populací Rozložení velikostí populací Velikost populace Pocet pripadu 1 2 3 4 5 6 7 3 52 12 151 21 25 3 349 399 448 497 547 596 646 695 745 794 843 893 942 992 141 191 114 119 1239 1288
VícePropojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Genetika populací Studium dědičnosti a proměnlivosti skupin jedinců (populací)
VíceFisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).
Populační studie Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae). American Journal of Botany 87(8): 1128
VíceRozptyl a migrace. Petra Hamplová
Rozptyl a migrace Petra Hamplová Terminologie Rozptyl a migrace jsou dva nejčastější termíny k označení prostorových pohybů ROZPTYL Krátká vzdálenost Individuální Zpravidla bez návratu Nesměrované Nepravidelné
VíceS = c.a z. log(s) = log(c) + z.log(a) Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie. The species-area relationship. The species-area relationship
Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie equilibrium theory of island biogeography Robert MacArthur & Edward Osborne Wilson (1963, 1967) proč druhů přibývá s plochou ostrova? proč druhů ubývá s izolovaností
VíceGenetika populací. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek
Genetika populací KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek Genetika populací Populace je soubor genotypově různých, ale geneticky vzájemně příbuzných jedinců téhož druhu. Genový fond je společný fond gamet a zygot
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
VícePříbuznost a inbreeding
Příbuznost a inbreeding Příbuznost Přímá (z předka na potomka). Souběžná (mezi libovolnými jedinci). Inbreeding Inbrední koeficient je pravděpodobnost, že dva geny přítomné v lokuse daného jedince jsou
VíceDůsledky selekce v populaci - cvičení
Genetika a šlechtění lesních dřevin Důsledky selekce v populaci - cvičení Doc. Ing. RNDr. Eva Palátová, PhD. Ing. R. Longauer, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
VíceTomimatsu H. &OharaM. (2003): Genetic diversity and local population structure of fragmented populations of Trillium camschatcense (Trilliaceae).
Populační studie Tomimatsu H. &OharaM. (2003): Genetic diversity and local population structure of fragmented populations of Trillium camschatcense (Trilliaceae). Biological Conservation 109: 249 258.
VíceDůsledky ex-situ kultivace pro populace vzácných druhů
Důsledky ex-situ kultivace pro populace vzácných druhů Zuzana Münzbergová Katedra botaniky, PřF UK Botanický ústav AV ČR Ex-situ kultivace Možnost záchrany druhu pro případ jeho ztráty in-situ Materiál
VícePopulace, populační dynamika a hmyzí gradace
Populace, populační dynamika a hmyzí gradace Zdeněk Landa sekce rostlinolékařství KRV ZF JU Populace definice Skupina jedinců téhož druhu Subjednotka druhu Odlišnosti populace od druhu: omezení areálem
VíceWorld of Plants Sources for Botanical Courses
Speciace a extinkce Speciace Pojetí speciace dominuje proces, při němž vznikají nové druhy organismů z jednoho předka = kladogeneze, štěpná speciace jsou možné i další procesy hybridizace (rekuticulate
VíceSelekce v populaci a její důsledky
Genetika a šlechtění lesních dřevin Selekce v populaci a její důsledky Doc. Ing. RNDr. Eva Palátová, PhD. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním
VíceGenotypy absolutní frekvence relativní frekvence
Genetika populací vychází z: Genetická data populace mohou být vyjádřena jako rekvence (četnosti) alel a genotypů. Každý gen má nejméně dvě alely (diploidní organizmy). Součet všech rekvencí alel v populaci
VíceKooperace a Aleeho efekt. Kristýna Kopperová
Kooperace a Aleeho efekt Kristýna Kopperová Kooperace uvnitř populace Chování dvou a více jedinců, které je ve výsledku výhodné Může zlepšit přežívání a plodnost (a tím zvýšit populační růst) Altruismus
VícePopulační genetika Radka Reifová
Populační genetika Radka Reifová Prezentace ke stažení: http://web.natur.cuni.cz/~radkas v záložce Courses Literatura An Introduction to Population Genetics. Rasmus Nielsen and Montgomery Slatkin. 2013.
VícePopulačně-genetická data
Populačně-genetická data Základy analýzy diploidních kodominantních znaků (Mendelovská dědičnost) mikrosatelity T jaderné sekvence (např. SSCP) CCGATCAATGCGGCAA G CCGATCACTGCGGCAA SNPs Typ získaných dat
Více- Definice inbreedingu a jeho teorie
Negativní důsledky inbrední deprese v chovu skotu Ing. Jiří Bezdíček, Ph.D. Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o., Rapotín 26. listopadu 2009 - Definice inbreedingu a jeho teorie - Proč je inbreeding v
VíceDrift nejen v malých populacích (nebo při bottlenecku resp. efektu zakladatele)
Drift nejen v malých populacích (nebo při bottlenecku resp. efektu zakladatele) Nově vzniklé mutace: nová mutace většinou v 1 kopii u 1 jedince mutace modelovány Poissonovým procesem Jaká je pravděpodobnost,
VícePopulace. Rozmístění jedinců v populaci = DISPERZE
Populace = soubor jedinců téhož druhu vyskytující se v určitém prostoru, má atributy jednotlivců i speciální skupinové. = homotypický soubor jedinců všech vývojových stádií v určitém prostoru, ten lze
VícePředmluva Hodnota biodiverzity 71 Ekologická ekonomie 74 Přímé ekonomické hodnoty 79
Předmluva 13 1 Definice biologie ochrany přírody 15 Podstata a původ biologie ochrany přírody 17 Filozofické základy biologie ochrany přírody 19 Význam biologie ochrany přírody 22 Mezioborový přístup -
VíceIX. Populační dynamika
IX. Populační dynamika Thomas Maltus Otec populační ekologie Definoval již v roce 1789 ve své eseji základní principy růstu a velikosti populace Většina základních principů byla formulována v matematických
VíceZákladní pojmy I. EVOLUCE
Základní pojmy I. EVOLUCE Medvěd jeskynní Ursus spelaeus - 5 mil. let? - 10 tis. let - 200 tis. let? Medvěd hnědý Ursus arctos Medvěd lední Ursus maritimus Základní otázky EVOLUCE Jakto, že jsou tu různé
VíceZáklady genetiky populací
Základy genetiky populací Jedním z významných odvětví genetiky je genetika populací, která se zabývá studiem dědičnosti a proměnlivosti u velkých skupin jedinců v celých populacích. Populace je v genetickém
VíceKameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.
Populační studie Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis. Molecular Ecology 10:205 216 Proč to studovali?
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
VíceMgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita
Mgr. et Mgr. Lenka Falková Laboratoř agrogenomiky Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita 9. 9. 2015 Šlechtění Užitek hospodářská zvířata X zájmová zvířata Zemědělství X chovatelství
VíceMODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/ Ochrana přírody. (semestrální přednáška)
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/15.0204 Ochrana přírody (semestrální přednáška) Využití populační biologie v ochraně přírody Dipl.-Biol. Jiří Schlaghamerský, Ph.D. Ústav
VíceJak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST
Jak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST 1) Genetická vzdálenost a její stanovení Pomocí genetické rozmanitosti, kterou se populace liší, můžeme určit do jaké míry jsou si příbuznější jaká je
VícePopulační genetika III. Radka Reifová
Populační genetika III Radka Reifová Genealogie, speciace a fylogeneze Genové genealogie Rodokmeny jednotlivých kopií určitého genu v populaci. Popisují vztahy mezi kopiemi určitého genu v populaci napříč
VíceVypracovaly: Mirka Hladilová, Kateřina Pecová, Petra Pospíšilová
Endemity ČR Vypracovaly: Mirka Hladilová, Kateřina Pecová, Petra Pospíšilová Endemit Endemit, respektive endemicky se vyskytující organismus, je organismus, který vznikl a je rozšířen jen v určitém omezeném
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
VíceTento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018 Základy populační genetiky Osnova 1. Genetická struktura populace 2. Způsob reprodukce v
VíceGENETIKA Monogenní dědičnost (Mendelovská) Polygenní dědičnost Multifaktoriální dědičnost
GENETIKA vědecké studium dědičnosti a jejich variant studium kontinuity života ve vztahu ke konečné délce života individuálních organismů Monogenní dědičnost (Mendelovská) Polygenní dědičnost Multifaktoriální
VícePopulační genetika Radka Reifová
Populační genetika Radka Reifová Prezentace ke stažení: http://web.natur.cuni.cz/~radkas v záložce Courses Literatura An Introduction to Population Genetics. Rasmus Nielsen and Montgomery Slatkin. 2013.
VíceVliv dopravy na mortalitu a fragmentaci populací (s příklady pro vydru říční) Vznik migračních bariér, fragmentace
Přímá mortalita na silnicích Vlivy dopravy na faunu Vliv dopravy na mortalitu a fragmentaci populací (s příklady pro vydru říční) Vznik migračních bariér, fragmentace Ministerstvo životního prostředí Vršovická
VícePropojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Nepříjemné vlastnosti biodiverzity Faktory přispívající k extinkci Případové
Více= oplození mezi biologicky příbuznými jedinci
= oplození mezi biologicky příbuznými jedinci Jestliže každý z nás má 2 rodiče, pak má 4 prarodiče, 8 praprarodičů... obecně 2 n předků tj. po 10 generacích 2 10 = 1024, po 30 generacích = 1 073 741 824
VíceTeorie neutrální evoluce a molekulární hodiny
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny Teorie neutrální evoluce Konec 60. a začátek 70. let 20. stol. Ukazuje jak bude vypadat genetická variabilita v populaci a jaká bude rychlost divergence druhů
VíceGenetika populací. kvalitativních znaků
Genetika populací kvalitativních znaků Úroveň studia genetických procesů Molekulární - struktura a funkce nukleových kyselin Buněčná buněčné struktury s významem pro genetiku, genetické procesy na buněčné
VíceJ i h l a v a Základy ekologie
S třední škola stavební J i h l a v a Základy ekologie 13. Některé důležité jevy v ekosystémech Digitální učební materiál projektu: SŠS Jihlava šablony registrační číslo projektu:cz.1.09/1.5.00/34.0284
VíceNáhodný genový posun
1) Změny alelových četností v malých populacích 2) Náhodný posun genů 3) Důsledky náhodného genového posunu 4) Zvýšení fixačního indexu náhodným posunem genů 5) Fixační index a genetická rozdílnost mezi
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/..00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG) Tento
VícePopulační genetika Radka Reifová
Populační genetika Radka Reifová Prezentace ke stažení: http://web.natur.cuni.cz/~radkas v záložce Courses Populační genetika Obor zabývající se genetickou variabilitou v populacích a procesy, které ji
VíceNIKA A KOEXISTENCE. Populační ekologie živočichů
NIKA A KOEXISTENCE Populační ekologie živočichů Ekologická nika nároky druhu na podmínky a zdroje, které organismu umožňují přežívat a rozmnožovat se různé koncepce: Grinell (1917) stanovištní nika, vztah
VícePopulační genetika II
Populační genetika II 4. Mechanismy měnící frekvence alel v populaci Genetický draft (genetické svezení se) Genetický draft = zvýšení frekvence alely díky genetické vazbě s výhodnou mutací. Selekční vymetení
VíceCvičeníč. 9: Dědičnost kvantitativních znaků; Genetika populací. KBI/GENE: Mgr. Zbyněk Houdek
Cvičeníč. 9: Dědičnost kvantitativních znaků; Genetika populací KBI/GENE: Mgr. Zbyněk Houdek Kvantitativní znak Tyto znaky vykazují plynulou proměnlivost (variabilitu) svého fenotypového projevu. Jsou
VíceGenetická diverzita masného skotu v ČR
Genetická diverzita masného skotu v ČR Mgr. Jan Říha Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o. Ing. Irena Vrtková 26. listopadu 2009 Genetická diverzita skotu pojem diverzity Genom skotu 30 chromozomu, genetická
VíceTomáš Kuras 1 & Adéla Lepková 2
Tomáš Kuras 1 & Adéla Lepková 2 1 PřF UP v Olomouci a 2 HBH Projekt s. s.r.o., Brno Seminář 6. 10. 2017, KÚ v Pardubicích Nové technologie vegetačních úprav svahů dálničních a silničních koridorů pro zvýšení
VíceMetody studia historie populací
1) Metody studia genetické rozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2) Mechanizmy evoluce jak lze studovat evoluci a jak funguje mutace, přírodní výběr, genový posun a genový tok 3)
VíceVyužití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 12. Shrnutí, Přehled molekulárních markerů 1. proteiny isozymy 2. DNA markery RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) založené
VíceTeorie neutrální evoluce a molekulární hodiny
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny Teorie neutrální evoluce Konec 60. a začátek 70. let 20. stol. Ukazuje jak bude vypadat genetická variabilita v populaci a jaká bude rychlost evoluce v případě,
VíceIntrodukce a vymírání organismů
Introdukce a vymírání organismů Introdukce - zavlékání Terminologie Expanze invaze Antropogenní podmíněnost Zavlečený druh (introdukovaný, cizí, adventivní) Synantropní (eusynantropní druh) Naturalizovaný
VíceEKOLOGIE LESA Pracovní sešit do cvičení č. 8:
EKOLOGIE LESA Pracovní sešit do cvičení č. 8: Ekologická stabilita v lesních ekosystémech Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018
VíceTrocha teorie ( snad nikoho nezabije)
Trocha teorie ( snad nikoho nezabije) 1 Biodiverzita Biodiverzita rozmanitost života. 2 Druhové bohatství 3/19/2015 Biodiverzita Lze studovat mnoho úrovní biologických prvků (alely, komplexy genů, druhy,
VícePotravní síť Společenstvo
Potravní síť Společenstvo Potravní řetězec Predátor 2 Predátor 1 Predátor 3 Herbivor 2 Herbivor 3 Herbivor 4 Herbivor 5 Herbivor 1 Producent 1 Producent 2 Potravní síť potravní síť Topografická potravní
VíceVýukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám
Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/21.3149 Šablona: V/2 Jméno autora: Třída/ročník: Datum vytvoření: č. materiálu: VY_52_INOVACE_007
VícePŘÍLOHA NAŘÍZENÍ KOMISE V PŘENESENÉ PRAVOMOCI (EU) /...
EVROPSKÁ KOMISE V Bruselu dne 30.4.2018 C(2018) 2526 final ANNEX 1 PŘÍLOHA NAŘÍZENÍ KOMISE V PŘENESENÉ PRAVOMOCI (EU) /... kterým se doplňuje nařízení Evropského parlamentu a Rady (EU) č. 1143/2014, pokud
VícePropojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 KBB/KOGEN Konzervační genetika Dana Šafářová, Petr Smýkal Milan Navrátil Konzervační
VíceÚvod do populační genetiky
Úvod do populační genetiky 1 Termíny Gene Locus (loci) Allele alternative forms of a gene Genome single copy of all of the genes Diploid - 2 alely pro každý gen (výjimka Chr Y, cpdna a mtdna) 2 genomy
VíceNika důvod biodiverzity navzdory kompetici
Brno, 2015 Dana Veiserová Nika důvod biodiverzity navzdory kompetici Co je to nika? Souhrn ekologických nároků daného druhu na prostředí, umožňující organismu žít a rozmnožovat se Fundamentální nika potencionální,
VíceEkologie tropických lesů a jejich obyvatel
Ekologie tropických lesů a jejich obyvatel Vojtěch Novotný Biologické centrum AV ČR a Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity Ekologický problém č. 1: Jaký je mechanismus koexistence tisíců druhů
VíceUniverzita Palackého v Olomouci. Demografická charakteristika populace saranče německé (Oedipoda germanica) na lokalitě Košťálov (České středohoří)
Univerzita Palackého v Olomouci Přírodovědecká fakulta, Katedra ekologie a životního prostředí Demografická charakteristika populace saranče německé (Oedipoda germanica) na lokalitě Košťálov (České středohoří)
VíceVY_32_INOVACE_10_17_PŘ. Téma. Anotace Autor. Očekávaný výstup. Speciální vzdělávací potřeby - žádné - Klíčová slova
VY_32_INOVACE_10_17_PŘ Téma Anotace Autor Jazyk Očekávaný výstup Člověk jako ochránce i kazisvět Seznámení s vymíráním živočichů, ničení lesů, těžbou nerostných surovin, Mgr. Martina Mašterová čeština
VíceZ D E Ň K A V E S E L Á, V E S E L A. Z D E N K V U Z V. C Z
HYBRIDIZACE ZD E Ň K A V E S E LÁ, V E S E LA. ZD E N K A @ V U Z V. C Z DVĚ METODY DOCÍLENÍ ŠLECHTITELSKÉHO POKROKU 1. Využití genetické proměnlivosti mezi jedinci uvnitř populace Selekce Záměrné připařování
VíceZÁCHRANNÉ PROGRAMY A ZÁCHRANNÉ STANICE
ZÁCHRANNÉ PROGRAMY A ZÁCHRANNÉ STANICE Záchranné programy zvláště chráněných druhů Problematika záchranných programů je upravena v Zákoně o ochraně přírody a krajiny č. 114/1992 Sb. K ochraně zvláště chráněných
VíceVážení přátelé přírody,
RNDr. Lukáš Spitzer Muzeum regionu Valašsko, p.o. entomolog, vedoucí Přírodovědného oddělení Vsetín http://www.muzeumvalassko.cz/kontakt/adresar/lukas-spitzer/ Vážení přátelé přírody, při Vašich terénních
VíceVytvořen. ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR ití pro udržitelný rozvoj dopravy. Tomáš. Libosvár
Vytvořen ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR k využit ití pro udržitelný rozvoj dopravy Tomáš Libosvár TA02031259 Vytvořen ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR k využit ití pro
VíceDRUHOVĚ NEJBOHATŠÍ LOKALITY NA ZEMI. David Zelený Masarykova univerzita Brno
DRUHOVĚ NEJBOHATŠÍ LOKALITY NA ZEMI David Zelený Masarykova univerzita Brno HLAVNÍ OTÁZKY: Co je to diverzita, biodiverzita a druhová bohatost? alfa, beta a gama diverzita endemismus Kde na Zemi je největší
VíceEkologie živočichů, téma 24 : Parasitismus
Ekologie živočichů, téma 24 : Parasitismus Parazitismus: jedna z forem predace v širším pojetí parazit je na hostitele vázán jeho existence závisí na živém hostiteli Když hostitel uhyne: parazité se musí
VíceOsnova přednášky volitelného předmětu Evoluční vývoj a rozmanitost lidských populací, letní semestr
Osnova přednášky volitelného předmětu Evoluční vývoj a rozmanitost lidských populací, letní semestr Evoluční teorie Základy evoluce, adaptace na životní podmínky - poskytuje řadu unifikujících principů
VíceObecné principy KE v praxi
Obecné principy KE v praxi BIOLOGICKÉ PRINCIPY OCHRANY HABITATU NA ÚROVNI KRAJINY Princip 1 Princip 2 Princip 3 Princip 4 Princip 5 Princip 6 Princip 7 Udržování velkých, nedotčených ploch (plošek) původní
Vícedemekologie autekologie,. synekologie (fytocenologie), krajinná ekologie Vladimír Láznička, ZF MZLU v Brně, Ústav biotechniky zeleně
demekologie autekologie,. synekologie (fytocenologie), krajinná ekologie Vladimír Láznička, ZF MZLU v Brně, Ústav biotechniky zeleně demekologie population ecology demekologie populační ekologie Srovnej:
VícePříklady z populační genetiky lesních dřevin
Obecná genetika Příklady z populační genetiky lesních dřevin Ing. Roman LONGAUER, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním
VíceVzájemné vazby mezi rostlinami a ţivočichy existují ve všech ekosystémech. Jsou v tomto směru mokřady něčím výjimečné?
Ekologie mokřadů (9) Vodní a mokřadní rostlinstvo a ţivočichové Vzájemné vazby mezi rostlinami a ţivočichy existují ve všech ekosystémech. Jsou v tomto směru mokřady něčím výjimečné? Rostliny primární
VícePopulace 2. = soubor jedinců téhož druhu vyskytující se v určitém prostoru, má atributy jednotlivců i speciální skupinové.
Populace 2 = soubor jedinců téhož druhu vyskytující se v určitém prostoru, má atributy jednotlivců i speciální skupinové. = homotypický soubor jedinců všech vývojových stádií v určitém prostoru, ten lze
VíceEvoluční (populační) genetika Radka Reifová
Evoluční (populační) genetika Radka Reifová Prezentace ke stažení: http://web.natur.cuni.cz/~radkas v záložce Courses Evoluční genetika Obor zabývající se genetickou variabilitou v populacích a procesy,
VíceGenetika pro začínající chovatele
21.4.2012 Praha - Smíchov Genetika pro začínající chovatele včetně několika odboček k obecným základům chovu Obrázky použité v prezentaci byly postahovány z různých zdrojů na internetu z důvodů ilustračních
VícePredace - její konsekvence pro dynamiku a evoluci společenstev
Predace - její konsekvence pro dynamiku a evoluci společenstev Jak utéci predátorovi: stát se nepoživatelným stát se podobným nepoživatelnému stát se odlišným od majoritní kořisti (nerozlišitelným) jít
VíceDlouhodobý monitoring rysa ostrovida a vlka obecného v CHKO Beskydy a Kysuce
Dolní Lomná, Návstěvnické centrum URSUS - 4.12.2018 Dlouhodobý monitoring rysa ostrovida a vlka obecného v CHKO Beskydy a Kysuce Miroslav Kutal 1,2, Martin Duľa 1,2 & Michal Bojda 2 1 Ústav ekologie lesa,
VíceGenetika kvantitativních znaků
Genetika kvantitativních znaků Kvantitavní znaky Plynulá variabilita Metrické znaky Hmotnost, výška Dojivost Srstnatost Počet vajíček Velikost vrhu Biochemické parametry (aktivita enzymů) Imunologie Prahové
VíceGENETIKA POPULACÍ ŘEŠENÉ PŘÍKLADY
GENETIKA POPULACÍ ŘEŠENÉ PŘÍKLADY 5. Speciální případy náhodného oplození PŘÍKLAD 5.1 Testováním krevních skupin systému AB0 v určité populaci 6 188 bělochů bylo zjištěno, že 2 500 osob s krevní skupinou
VíceEkologická stabilita lesních ekosystémů v krajině
Ekologická stabilita lesních ekosystémů v krajině Ústav pro hospodářskou úpravu lesa Brandýs nad Labem, Mgr. Martin Polívka DiS. MZe Územní systém ekologické stability (ÚSES) a jeho prvky jsou typem území
VícePropojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Definice Současný stav Úrovně Indikátory Ochrana Druhová ochrana Genová centra
VíceSSOS_ZE_1.14 Jedinec, druh, populace
Číslo projektu Číslo a název šablony klíčové aktivity DUM číslo a název CZ.1.07/1.5.00/34.0378 Zefektivnění výuky prostřednictvím ICT technologií III/2- Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT
VíceTechnická univerzita v Liberci fakulta přírodovědně-humanitní a pedagogická. Doc. RNDr. Petr Anděl, CSc. ZÁKLADY EKOLOGIE.
Technická univerzita v Liberci fakulta přírodovědně-humanitní a pedagogická Doc. RNDr. Petr Anděl, CSc. ZÁKLADY EKOLOGIE Studijní texty 2010 Struktura předmětu 1. ÚVOD 2. EKOSYSTÉM MODELOVÁ JEDNOTKA 3.
VíceAnalýza rozptylu. PSY117/454 Statistická analýza dat v psychologii Přednáška 12. Srovnávání více než dvou průměrů
PSY117/454 Statistická analýza dat v psychologii Přednáška 12 Analýza rozptylu Srovnávání více než dvou průměrů If your experiment needs statistics, you ought to have done a better experiment. Ernest Rutherford
VíceBudoucnost chovu chladnokrevných koní v ČR
Budoucnost chovu chladnokrevných koní v ČR Změna v chovu koní za posledních 23 let 1989-28 000 koní 1995-18 000 koní 2011-77 000 koní Nárůst počtů Nárůst kvality??? Cesty ke zlepšení Plemenitba V chovu
VíceHeritabilita. Heritabilita = dědivost Podíl aditivního rozptylu na celkovém fenotypovém rozptylu Výpočet heritability
Heritabilita Heritabilita = dědivost Podíl aditivního rozptylu na celkovém fenotypovém rozptylu Výpočet heritability h 2 = V A / V P Výpočet genetické determinance znaku h 2 = V G / V P Heritabilita závisí
Více