Mikrobiologie / bakteriologie Krev do hemokultivačních lahviček firmy BioMérieux, technika odběru krve dle metodiky pracoviště. Krev na hemokulturu - vyšetření v systému BacT/ALERT Vyšetření prokáže množství klinicky významných bakterií a kvasinek. Výsledek může být ovlivněn způsobem odběru, ATB léčbou, dobou prodlevy/transportu, teplotou během preanalytické fáze apod. NEPROKÁŽE například: mykobakteria, některé kultivačně náročné bakterie, bakterie nepřítomné v krevním řečišti, protozoa, viry. Dospělí bez ATB léčby (použít OBĚ lahvičky!): SA (aerobní, modrá) - 10 ml SN (anaerobní, fialová) - 10 ml Dospělí s ATB léčbou (použít OBĚ lahvičky!): FA (aerobní, zelená) - 10 ml FN (anaerobní, oranžová) - 10 ml Děti: PF (pediatrická, žlutá) - 5 ml Urgentní vyšetření, po odběru doručit do laboratoře vzorek při skladování a transportu uchovávat při teplotě 15-25 C V případě signalizace pozitivity následuje mikroskopické vyšetření. Výsledek mikroskopie ihned hlásíme a pozitivní vzorek očkujeme na pevné půdy. Negativní vzorky uzavíráme po 5 dnech. Pokud se při jednom odběru odebírá krev na více vyšetření, je třeba odebrat hemokultury jako první! Viz též bod 3.7.1 této příručky. Na žádanku uvést způsob odběru (venepunkce/periferní kanyla/centrální žilní kanyla) Likvor - neselektivní kultivace na obohacených půdách vyšetření cílené na běžné komunitní původce meningitid: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, beta-hemolytické streptokoky, listerie. Prokáže i S.aureus minimálně 1 ml likvoru a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: mykobakteria, virová agens, parazitární agens, nemusí prokázat plísně či jiná mykotická agens (kryptokoky). 15-25 C 2-4 dny Respirační materiál výtěr z HCD: nosu, krku, nosohltanu, dutiny ústní - klasická neselektivní aerobní kultivace dutina ústní na kvasinky kultivační vyšetření cílené u výtěrů z krku zejména na průkaz betahemolytických streptokoků. Při nálezu beta-hemolytických streptokoků provádíme identifikaci a vyšetřujeme citlivost k penicilinu, makrolidům a klindamycinu. Při nálezu S.aureus ověřujeme, zda se nejedná o MRSA. NEPROKÁŽE například: respirační mykoplasmata a chlamydie, legionely, bordetely, C.diphtheriae, mykobakteria, virová agens. prokáže kvasinky běžně nalézané v dutině ústní, souběžně zakládáme i neselektivní aerobní kultivaci vyšetření cílené na běžné komunitní respirační patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella sputum, aspirát z dolních dýchacích cest, catarrhalis, beta-hemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné BAL, bronchiální výplach - klasická Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: respirační neselektivní aerobní kultivace + mikroskopie mykoplasmata a chlamydie, legionely, bordetely, mykobakteria, virová agens, nemusí prokázat plísně. vyšetření cílené na běžné komunitní respirační patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, beta-hemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné výtěr z laryngu Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: respirační mykoplasmata a chlamydie, legionely, bordetely, mykobakteria, virová agens, nemusí prokázat plísně. tracheostomie - výtěr - klasická neselektivní aerobní kultivace B.pertussis - selektivní kultivace výtěr z nosohltanu nebo aspirát z nosohltanu C.diphtheriae - selektivní kultivace Antigen pneumokok, legionela materiál do sterilní nádobky (sputovky) viz sputum kultivační vyšetření cílené pouze na bordetely, zejména B.pertussis a B.parapertussis kultivační vyšetření cílené pouze na Corynebacterium diphtheriae viz níže sekci Přímý průkaz antigenů tampón na drátu v Amiesově půdě nebo aspirát ve stříkačce uzavřené combi zátkou výtěr ze spodiny po odstranění pablán: tampon v Amiesově půdě; pablány samotné: ve sterilní nádobce 24 h do 2 hodin 15-25 C, 2-8 C - 24 h a více selektivní kultivace na mykobakteria Materiál na průkaz mykobakterií odesíláme do smluvní laboratoře (Ústav mikrobiologie, FN Plzeň). Instrukce k odběru dalšího typu materiálu a o možnostech vyšetření jsou k dispozici v Laboratorní příručce ÚM FNP (http://mikro.fnplzen.cz/cs/node/116), nebo na tel. čísle 377 402 222. Strana 1 (celkem7)
výtěr z ucha, středoušní tekutina - klasická neselektivní aerobní kultivace výtěr z oka - klasická neselektivní aerobní kultivace vyšetření cílené na běžné patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, beta-hemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE virová agens. Nemusí prokázat plísně. vyšetření cílené na běžné patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, beta-hemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: virová agens, parazitární agens. Běžné zpracování NEPROKÁŽE Neisseria gonorrhoeae - je nutno uvést požadavek na žádance! Moč moč vymočená/cévkovaná - klasická neselektivní aerobní kultivace vyšetření cílené na běžné uropatogeny: E.coli, ostatní Gram-negativní střevní tyčinky, P.aeruginosa, beta-hemolytické streptokoky, S.aureus, S.saprophyticus. Prokáže většinu běžných kvasinek. NEPROKÁŽE parazitární agens. NEPROKÁŽE Neisseria gonorrhoeae, kultivační průkaz z moče nemá smysl požadovat. moč ze středního proudu moči ve sterilní zkumavce, doporučeno do 4hod. 2-8 C / 24 h a více Uricult - klasická neselektivní aerobní kultivace Antigen pneumokok, legionela Genitál - muži i ženy vyšetření cílené na běžné uropatogeny: E.coli, ostatní Gram-negativní střevní tyčinky, P.aeruginosa, beta-hemolytické streptokoky, S.aureus, S.saprophyticus. Prokáže většinu běžných kvasinek. NEPROKÁŽE parazitární agens. NEPROKÁŽE Neisseria gonorrhoeae, kultivační průkaz z moče nemá smysl požadovat. viz níže sekci Přímý průkaz antigenů Uricult správný odběr: Střední proud moče odebrat do sterilní nádobky. Do této nádobky krátce namočit nosič se živnými půdami tak, aby byly obě agarové vrstvy zcela smočeny. Poté nosič vyjmout a uzavřít zpět do plastové zkumavky (uricult). Nenaplňovat uricult močí. Gonokultivace kultivační vyšetření cílené pouze na Neisseria gonorrhoeae tampón v Amiesově půdě 24 h PCR vyšetření Chlamydie, gonokok - sonda bez amplifikace mykoplasmata, ureaplasmata kultivačně viz PCR sekci viz PCR sekci kultivační vyšetření cílené pouze na Mycoplasma hominis a Ureaplasma species (bez rozlišení U.urealyticum a U.parvum). U pozitivních vzorků je odečtena hrubá kvantifikace a citlivost k vybraným antibiotikům výtěr z uretry nebo stěr z cervixu na dacronový tampón, ihned vložit a vytřepat v roztoku Mycoplasma R1 24 h 24 h 2-8 C 37 C nebo 15-25 C 15-25 C - gonokok je velmi citlivý na prudké změny teploty a na vychladnutí! a více Genitál - muži fluor z uretry - výtěr - neselektivní kultivace sklo - Mikroskopické vyšetření nátěru barveného dle Grama streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. Podá základní informaci o charakteru materiálu (např. zda jsou přítomny leukocyty). Prokáže množství bakterií, například: střevních tyčinek, stafylokoků, streptokoků, Gram-negativních diplokoků apod. Barvení dle nátěr fluoru na podložním sklíčku Grama NEPROKÁŽE například trichomonády, chlamydie, mykoplasmata/ureaplasmata, treponemata, virová agens. ejakulát - neselektivní kultivace materiálu z genitálu prostatický sekret - neselektivní kultivace streptokoky, S.aureus. Není určeno k vyloučení přítomnosti ejakulát ve sterilní nádobce N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. streptokoky, S.aureus. Není určeno k vyloučení přítomnosti tampón v Amiesově půdě N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. Strana 2 (celkem7)
Genitál - ženy pochva - výtěr - neselektivní kultivace sklo - "MOP" - Mikroskopické vyšetření nátěru barveného dle Giemsy cervix - stěr - neselektivní kultivace GBS screening IUD - neselektivní kultivace materiálu z genitálu + prodloužená kultivace cílená na aktinomycety streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. Podá základní informaci o charakteru materiálu (např. poměr epielií a leukocytů). Prokáže množství bakterií, například laktobacilů, střevních tyčinek, stafylokoků, streptokoků, apod. Prokáže též kvasinky. Je určeno k průkazu trichomonád. NEPROKÁŽE například chlamydie, mykoplasmata/ureaplasmata, treponemata, virová agens. streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. kultivační vyšetření cílené pouze na S.agalactiae streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. Navíc přidáváme půdy na prodlouženou anaerobní kultivaci cílenou na aktinomycety. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. nátěr fluoru na podložním sklíčku. V případě zaslání dvou skel bude jedno obarveno dle Giemsy (průkaz trichomonád) a druhé dle Grama (lepší rozlišení bakterií). vaginorektální výtěr v Amiesově půdě tělísko ve sterilní nádobce bez půdy trichomonády kultivačně vyšetření cíleno pouze na trichomonády CAT Swab Střevní patogeny kultivace cílená na střevní patogeny: salmonely, shigely, yersinie, výtěr z rekta - bakteriální střevní patogeny Campylobacter sp. NEPROKÁŽE například C.difficile, virová agens, kultivačně parazitární agens. screening patogenních sérotypů E.coli provádíme automaticky u dětí do 2 let věku, screening j zaměřen na nejběžnější sérotypy včetně O157. Salmonella - cílená Shigella - cílená cílenou kultivaci doporučujeme spíše v případě epidemiologického Yersinia - cílená šetření kontaktů nebo ke sledování rekonvalescentů Campylobacter sp. - cílená Vibrio cholerae kultivace cílená pouze na V.cholerae tampón v Amiesově půdě - nutno uvědomit předem laboratoř! stolice na C.difficile Chirurgický a ostatní materiál Stěr z rány, kožního ložiska, léze, defektu apod. - neselektivní kultivace Hnis, punktáty a ostatní tekutý materiál - neselektivní kultivace + mikroskopie Cévní katetr (centrální žilní, arteriální, periferní) viz níže "C.difficile - antigen+toxin" v sekci "Přímý průkaz antigenů" (mykobakteria, francisely apod.). Anaerobní kultivaci provede laboratoř automaticky u materiálů k tomu vhodných a správně odebraných - viz níže. (mykobakteria, francisely apod.). Anaerobní kultivaci provede laboratoř automaticky u materiálů k tomu vhodných a správně odebraných - viz níže. Vyšetříme kultivační metodou podle Makiho s kvantifikací kultivačního nálezu. Orientační hranice významnosti nálezu je 15 kolonií. Nález kvasinek či S.aureus je významný při jakékoli kvantitě. tekutý materiál ve stříkačce bez vzduchové bubliny uzavřené combi zátkou NEBO pokud nebude požadována anaerobní kultivace, materiál ve sterilní nádobce konec cévního katetru o délce 5 cm ve sterilní nádobce 15-25 C, kultivace na aktinomycety 10 dní a více 3 dny Cizorodý materiál (mykobakteria, francisely apod.). Budete-li ze tkáně požadovat anaerobní kultivaci, kontaktujte prosím laboratoř. vzorek ve sterilní nádobce Strana 3 (celkem7)
Tkáň - neselektivní kultivace + mikroskopie, pokud ji umožní velikost (mykobakteria, francisely apod.). Budete-li ze tkáně požadovat anaerobní kultivaci, kontaktujte prosím laboratoř. vzorek tkáně ve sterilní nádobce Anaerobní kultivace Mateřské mléko - neselektivní kultivace Helicobacter pylori - selektivní kultivace + mikroskopie Ostatní materiál stěry z prostředí Přímý průkaz antigenů Anaerobní kultivaci provede laboratoř automaticky u materiálů k tomu vhodných a správně odebraných - ve stříkačce bez vzduchové bubliny uzavřené combi zátkou. Lze ji také provést z výtěrů v Amiesově půdě, ale nutno očekávat nižší výtěžnost! výčet přítomných bakteriálních kmenů, při nálezu S.aureus ověřujeme, zda se nejedná o MRSA. V závislosti na kvalitě odběru a doby transportu lze prokázat množství anaerobních bakterií. Při podezření na dlouho rostoucí agens - např. aktinomycety - je nutno toto sdělit laboratoři. materiál ve sterilní nádobce v případě průkazu H.pylori vyšetříme citlivost k ATB vzorek tkáně v 1 ml fyziologického roztoku výčet přítomných bakterií a kvasinek, u S.aureus ověření, zda se nejedná o MRSA tampón v Amiesově půdě nebo tampon v odběrovém mediu Amies 24 h / odběrové médium - v den odběru 15-25 C, kultivace na aktinomycety 10 dní a více 1- a více 3 dny a více tampon v Amies, a více odběrové medium S.pneumoniae moč ve sterilní zkumavce 2-8 C / 24 h likvor Legionella pneumophila prokáže antigen L.pneumophila séroskupiny 1, sensitivita okolo 60%, moč ve sterilní zkumavce vysoká specificita. Neprokáže ostatní legionely! 15-25 C / 24 h RS virus výtěr z nosu/krku/výplach/aspirát 24 h 2-8 C adenovirus - respirační výtěr z nosu/krku/výplach/aspirát 2-8 C / 8h C.difficile - antigen+toxin Při transportu trvajícím déle než 2 hodiny může dojít k rozpadu toxinu, antigen (GDH) zůstává po dobu 24 hodin stabilní. Při pozitivitě GDH vzorek plné stolice o objemu alespoň 1 ml zakládáme kultivaci s cílem ověřit citlivost k metronidazolu a (velikost lískového oříšku) 12 h 2-8 C / 24 h vankomycinu. Stolice na H. pylori průkaz Ag H.pylori ve stolici šroubovacím uzávěrem 12 h 2-8 C / 24 h Stolice na rotaviry/adenoviry/noroviry průkaz RV, AV, NV ve stolici šroubovacím uzávěrem nebo 3 5ml tekuté 12 h 2-8 C / 24 h stolice Chlamydia trachomatis průkaz antigenu C.trachomatis. Test je validován pouze pro výtěry z genitálu a moč od muže. výtěr z urogenitálního traktu 24 h 2-8 C / 24 h Molekulární detekce patogenů prokáže pneumokokový antigen v moči, sensitivita max. 80%, u dospělých vysoká specificita. Očkování pneumokokovou vakcínou může způsobit pozitivitu testu v moči - výrobce udává až 48 hodin. Metoda PCR má vysokou citlivost - obecně prokáže DNA i v množství 10^1 kopií/ml, prokáže ovšem i DNA pocházející z rozpadlých bakteriálních buněk! Zvláště nálezy v nízké kvantitě je třeba hodnotit obezřetně! V zásadě lze odebrat jakýkoli materiál, avšak některé typy požadavků - například pandetekce z primárně kontaminovaných materiálů typu sputa či výtěrů z dýchacích - jsou neúčelné. Doporučené materiály jsou zvýrazněny tučně. Odběry je nutné provést do sterilních odběrových nádob a zkumavek! 2-8 C / ; biopsie 2-8 C / 24 h 7 dnů ) výsledky ch vyšetření hlásíme telefonicky na uvedené telefonní číslo Pneumoplex Detekce DNA Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila/micdadei, Bordetella pertussis, Burkholderia spp., Moraxella catarrhalis, Nocardia spp., Corynebacterium spp. Sputum, BAL, aspirát, pleurální punktát, výtěr, stěr, nesrážlivá krev (EDTA), biopsie 2-8 C / ; biopsie 2-8 C / 24 h 2-5 pracovních dnů Strana 4 (celkem7)
Bordetella pertussis/b.parapertussis Chlamydia pneumoniae Prokáže B.pertussis a B.parapertussis Výtěr z horních cest dýchacích, tělní tekutiny: BAL, aspirát, sputum BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret Influenza A, B, subtypizace H1N1 BAL, výtěr (nos, krk) Mycobacterium spp. se sekvenačním Vhodný materiál dle povahy onemocnění 2-5 pracovních dnů, v případě V případě pozitivity sekvenační dourčení druhu mykobakteria 2-8 C / dourčením (sputum, BAL, hnis, moč, jiný materiál) sekvenačního dourčení 2 týdny Mycoplasma pneumoniae BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret RSV (Respirační syncitiální virus) BAL, výtěr (nos, krk) Uroplex Detekce DNA Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Morganella morganii, Výtěr z genitálu, moč, případně výtěr z rekta, oka, faryngu, případně jiný materiál dle Corynebacterium spp. povahy onemocnění STDplex Detekce DNA Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealyticum Výtěr z genitálu, moč, případně výtěr z rekta, oka, faryngu, případně jiný materiál dle povahy onemocnění HPV high risk stěr z cervixu, stěr z lézí 2-8 C / 2-3 týdny HPV low risk stěr z cervixu, stěr z lézí 2-8 C / 2-3 týdny Chlamydia trachomatis Touto technikou provádíme i vyšetření vzorků dárců tkání a buněk Výtěr z genitálu, moč, případně výtěr z rekta, Mycoplasma hominis oka, faryngu, případně jiný materiál dle povahy Mycoplasma genitalium onemocnění Neisseria gonorrhoeae Treponema pallidum Stěr z lézí Trichomonas vaginalis Moč, výtěr (uretra, pochva) Ureaplasma urealyticum Moč, výtěr (uretra, pochva) Meningoplex Detekce DNA Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Neisseria meningitidis, Fusobacterium nucleatum spp., Porphyromonas Nesrážlivá krev (EDTA), likvor gingivalis/endodontalis Borrelia burgdorferi sensu lato (B. burgdorferi, B. afzelii, B. garinii) Enterovirus spp. (Poliovirus, Coxsackie A a B virus, Echovirus, Enterovirus 68-71) Herpesviry (HSV-1, 2, HHV-6, 7, 8, CMV, EBV, VZV) Nesrážlivá krev (EDTA), likvor, punktát, biopsie, moč 2-8 C / ; biopsie 2-8 C / 24 h 2-5 pracovních dnů Likvor Diagnostika neuroinfekcí - HSV-1, 2, HHV-6, 7, 8, CMV, VZV, EBV Likvor Diagnostika kožních a očních infekcí - HSV-1, 2, CMV, VZV, EBV Stěr z léze nebo ze spojivky (sterilním suchým tamponem, vložit do sterilní zkumavky s 1 ml sterilního fyziologického roztoku) Diagnostika aktivní infekce - HSV-1, 2, HHV-6, 7, 8, CMV, VZV, EBV Nesrážlivá krev (EDTA) Diagnostika aktivní infekce v dolních dýchacích cestách BAL, aspirát (odsátí do sterilní zkumavky) Prenatální diagnostika kongenitální infekce CMV u žen s primoinfekcí v Plodová voda (alikvot do sterilní zkumavky) těhotenství Průkaz viru v biopsii při orgánovém postižení Biopsie (vložit do vhodné sterilní 2-8 C / 24 h 2-5 pracovních dnů nádobky) Neisseria meningitidis Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Streptococcus pneumoniae Nesrážlivá krev (EDTA), likvor TBEV (virus klíšťové encefalitidy) Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Gastroenteroplex I Detekce DNA Clostridium spp. (C. difficile, C. histolyticum, C. novyi, C. perfringens, C. sordellii), Citrobacter spp. (C. freundii, C. koseri), Helicobacter pylori, Yersinia spp. (Y. enterocolitica subsp. Nesrážlivá krev (EDTA), tělní tekutiny Enterocolitica, Yersinia pestis, Y. pseudotuberculosis) Gastroenteroplex II Adenoviry typy A-F Hepatitis A Detekce DNA Cryptosporidium parvum, Dientamoeba fragilis, Entamoeba histolytica, Giardia intestinalis Nesrážlivá krev (EDTA), tělní tekutiny Nesrážlivá krev (EDTA), likvor, stěr Krev srážlivá, stolice, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis B Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis C Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) ) Strana 5 (celkem7)
Hepatitis C genotypizace Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) 2-8 C / 3 týdny Hepatitis D Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis E Bactoplex G(-): Acinetobacter baumannii, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa/putida, Serratia marcescens, Stenotrophomonas maltophilia; G(+): Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Koaguláza-negativní stafylokoky (S. epidermidis, S. haemolyticus, S. hominis, S. intermedius, S. xylosus), Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus spp. (S. agalactiae, S. anginosus, S. constellatus, S. dysgalactiae, S. infantarius, S. intermedius, S. minor, S. mitis, S. mutans, S. oligofermentans, S. oralis, S. parasanguinis, S. perosis, S. pseudopneumoniae, S. pyogenes, S. salivarius, S. sanguinis, S. thermophilus, S. viridans,...) Krev srážlivá, stolice, krev nesrážlivá (EDTA) Nesrážlivá krev (EDTA), stěry, tělní tekutiny, bioptický materiál Fungiplex Detekce DNA Aspergillus fumigatus, Aspergillus spp. (A. caelatus, A. campestris, A. candidus, A. carneus, A. cervinus, A. fasciculatus, A. flavus, A. fumigatiaffinis, A. fumigatus, A. hennebergii, A. heteromorphus, A. kambarensis, A. kanagawaensis, A. nidulans, A. niger, A. nutans, A. ochraceus, A. oryzae, A. parasiticus, A. parvulus, A. protuberus, A pseudotamarii, A. striatus, A. sydowii, A. taichungensis, A. tamarii, A. terreus, A. terricola, A. thomii, A. toxicarius, A. tritici, A. unguis, A. ustus, A. versicolor, A. viridinutans, Rhizopus oryzae), Nesrážlivá krev (EDTA), stěry, tělní tekutiny, Candida albicans, Candida dubliniensis, Candida glabrata, Candida bioptický materiál krusei, Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Candida spp. (C. albicans, C. dubliniensis, C. (Pichia) fabianii, C. (Pichia) guilliermondii, C. inconspicua, C. krusei, C. lusitaniae, C. (Pichia) norvegensis, C. orthopsilosis, C. parapsilosis, C. tropicalis), Cryptococcus neoformans, Cryptococcus spp. (C. aureus, C. carnescens, C. flavescens), Fusarium spp., Mucoraceae (Mucor indicus, M. plumbeus, Rhizopus microsporus, R. oryzae), Pneumocystis jiroveci Dentoplex Detekce DNA Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Porphyromonas gingivalis/endodontalis, Prevotella intermedia, Stěr Tannerella forsythia, Treponema denticola Neonatální sepse Detekce DNA Escherichia coli, Streptokoky sk. B/S. agalactiae, CMV, Staphylococcus aureus, Chlamydia trachomatis, Ureaplasma Nesrážlivá krev (EDTA, citrát), likvor urealyticum/parvum, Listeria monocytogenes Pandetekce hub (18S rrna) Vhodné pro primárně sterilní klinický materiál. Likvor, srdeční chlopeň, jiný primárně sterilní materiál 2-8 C / 2 týdny Pandetekce bakterií (16S rrna) Vhodné pro primárně sterilní klinický materiál. Likvor, srdeční chlopeň, jiný primárně sterilní materiál 2-8 C / 2 týdny Atopobium vaginae Moč, výtěr (uretra, cervix) Campylobacter jejuni Stolice Candidatus neohrlichia mikurensis Nesrážlivá krev (EDTA) Clostridium difficile/toxin Prokáže DNA C.difficile, případně gen kódující toxin Stolice - alespoň 1 ml Cryptosporidium hominis/parvum Nesrážlivá krev (EDTA) Gardnerella vaginalis Moč, výtěr (uretra, cervix) Haemophilus influenzae skupiny B Nesrážlivá krev (EDTA), likvor, výtěr Helicobacter pylori Biopsie Legionella micdadei BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotek Legionella pneumophila BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotek Leptospira spp. Nesrážlivá krev (EDTA), moč Listeria monocytogenes Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Parvovirus B19 Nesrážlivá krev (EDTA), plodová voda Pneumocystis jiroveci BAL, sputum, stěr Polyomavirus BKV Nesrážlivá krev (EDTA), moč Polyomavirus JCV Likvor Salmonella enterica Stolice Shigella spp. Stolice ) Strana 6 (celkem7)
Toxoplasma gondii Nesrážlivá krev (EDTA), plodová voda, likvor Tropheryma whipplei Nesrážlivá krev (EDTA) Zika virus Průkaz vhodný pouze u případů akutního onemocnění v období virémie, Nesrážlivá krev (EDTA), srážlivá krev (sérum), tedy v období max. 7 dní od prvních příznaků (horečka, kožní vyrážka, moč bolest kloubů a svalů, zarudnutí očí) Parazitologie ) Vyšetření Možnosti a limity co a jak odebrat Základní parazitologické vyšetření průkaz cyst prvoků, vajíček a larev červů šroubovacím uzávěrem, řídká stolice 3-5 ml 2-8 C / Speciální parazitologické vyšetření při podezření na amoébózu viz. zakladní parazitologické vyšetření se zvláštním zřetelem na dg. E. histolytica a D. fragilis. NUTNÉ SE DOHODNOUT S LABORATOŘÍ. šroubovacím uzávěrem, řídká stolice 3-5 ml do 2 hodin po defekaci 15-25 C nebo zahřívat na 37 C / Perianální otisk na enterobiózu průkaz vajíček Enterobius vermicularis Ráno před ranní hygienou se na okolí řitního otvoru nalepí proužek průhledné lepicí pásky velikosti podložního skla. Proužek se k análním řasám dobře přitlačí, Poté se odlepí a lepivou částí nalepí na čisté a označené podložní sklo. Odebrat 1 nebo lépe 3 sklíčka. Průkaz kryptosporidií průkaz oocyst šroubovacím uzávěrem, řídká stolice 3-5ml Leptospiry - serologie průkaz protilátek srážlivá krev - sérum (1ml) nebo likvor (0,5ml) 12 h Malárie průkaz přítomnosti plasmodií nesrážlivá krev (EDTA) 3ml ihned 2-8 C / krev: 2-8 C 12 hodin, sérum, likvor: 2-8 C až 1 týden, (poté -20 C několik měsíců) 15-25 C / 12 hod NECHLADIT 3 dny Schistosoma haematobium průkaz vajíček S. haematobium v moči odběr posledního moči po fyzické zátěži (NE ranní moč!!!) 10ml a více, popř. osolit, doba dodání se prodlužuje 2-8 C / 12 hod oční seškrab na akantaméby průkaz trofozoitů a cyst v kontaktní čočce, v uchovávacích roztocích nebo seškrabu z rohovky čočku a uchovávací roztoky zaslat v uzavíratelné nádobě, seškrab po dohodě s klinickým pracovištěm (dodáme kultivační půdy pro okamžitou inokulaci) 12 hod pozitivita ihned, negativita za 1 týden Svrab průkaz Zákožky hloubkový seškrab z kůže z postižených míst (optimálně z 5 různých míst) určení ektoparazitů a dospělých červů identifikace parazita organismy v uzavřené nádobě, eventuelně v alkoholu, zabránit úplnému vyschnutí Strana 7 (celkem7)