synlab czech s.r.o. Hemokultura Pokojová teplota Chladničková teplota 15-25 C 2-8 C Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře V případě signalizace pozitivity následuje mikroskopické vyšetření. Výsledek mikroskopie ihned hlásíme a pozitivní vzorek očkujeme na pevné půdy. Negativní vzorky uzavíráme po 5 dnech. co a jak odebrat doba dodání do laboratoře a více Krev do hemokultivačních lahviček firmy BioMérieux, technika odběru krve dle metodiky pracoviště. Krev na hemokulturu - vyšetření v systému BacT/ALERT Dospělí bez ATB léčby (použít OBĚ lahvičky!): SA (aerobní, modrá) - 10 ml SN (anaerobní, fialová) - 10 ml Vyšetření prokáže množství klinicky významných bakterií a kvasinek. Výsledek Dospělí s ATB léčbou (použít OBĚ lahvičky!): může být ovlivněn způsobem odběru, ATB léčbou, dobou FA (aerobní, zelená) - 10 ml prodlevy/transportu, teplotou během preanalytické fáze apod. NEPROKÁŽE FN (anaerobní, oranžová) - 10 ml například: mykobakteria, některé kultivačně náročné bakterie, bakterie Děti: nepřítomné v krevním řečišti, protozoa, viry. PF (pediatrická, žlutá) - 5 ml Pokud se při jednom odběru odebírá krev na více vyšetření, je třeba odebrat hemokultury jako první! Viz též bod 3.7.1 této příručky. Na žádanku uvést způsob odběru (venepunkce/periferní kanyla/centrální žilní kanyla) Respirační materiál Možnosti a limity kultivační vyšetření cílené u výtěrů z krku zejména na průkaz betahemolytických streptokoků. Při nálezu beta-hemolytických streptokoků výtěr z HCD: nosu, krku, nosohltanu, dutiny ústní - provádíme identifikaci a vyšetřujeme citlivost k penicilinu, makrolidům a klasická neselektivní aerobní kultivace klindamycinu. Při nálezu S.aureus ověřujeme, zda se nejedná o MRSA. NEPROKÁŽE například: respirační mykoplasmata a chlamydie, legionely, bordetely, C.diphtheriae, mykobakteria, virová agens. dutina ústní na kvasinky prokáže kvasinky běžně nalézané v dutině ústní, souběžně zakládáme i neselektivní aerobní kultivaci sputum, aspirát z dolních dýchacích cest, BAL, bronchiální výplach - klasická neselektivní aerobní kultivace + mikroskopie vyšetření cílené na běžné komunitní respirační patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, betahemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. materiál do sterilní nádobky (sputovky) NEPROKÁŽE například: respirační mykoplasmata a chlamydie, legionely, bordetely, mykobakteria, virová agens, nemusí prokázat plísně. při předpokladu dodání za více než 2 hodiny CHLADNIČKOVÁ teplota výtěr z laryngu vyšetření cílené na běžné komunitní respirační patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, betahemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: respirační mykoplasmata a chlamydie, legionely, bordetely, mykobakteria, virová agens, nemusí prokázat plísně. tampón na drátu v Amiesově transportní půdě nebo aspirát ve stříkačce uzavřené combi zátkou 5 dní výtěr ze spodiny po odstranění pablán: tampon v Amiesově půdě; pablány samotné: ve sterilní nádobce tracheostomie - výtěr - klasická neselektivní viz sputum aerobní kultivace B.pertussis - selektivní kultivace výtěr z nosohltanu kultivační vyšetření cílené pouze na bordetely, zejména B.pertussis a nebo aspirát z nosohltanu B.parapertussis C.diphtheriae - selektivní kultivace kultivační vyšetření cílené pouze na Corynebacterium diphtheriae Antigen pneumokok, legionela viz níže sekci Přímý průkaz antigenů selektivní kultivace na mykobakteria Materiál na průkaz mykobakterií odesíláme do smluvní laboratoře (Ústav mikrobiologie, FN Plzeň). Instrukce k odběru dalšího typu materiálu a o možnostech vyšetření jsou k dispozici v Laboratorní příručce ÚM FNP (http://mikro.fnplzen.cz/cs/node/116), nebo na tel. čísle 377 402 222. výtěr z ucha, středoušní tekutina - klasická neselektivní aerobní kultivace vyšetření cílené na běžné patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, beta-hemolytické streptokoky. Prokáže i S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE virová agens. Nemusí prokázat plísně. vyšetření cílené na běžné patogeny: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, beta-hemolytické streptokoky. Prokáže i výtěr z oka - klasická neselektivní aerobní kultivace S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: virová agens, parazitární agens. Běžné zpracování NEPROKÁŽE Neisseria gonorrhoeae - je nutno uvést požadavek na žádance! Verze: 01, platná od 15.2.2018 Strana 1 (celkem 6)
Likvor - neselektivní kultivace na obohacených půdách vyšetření cílené na běžné komunitní původce meningitid: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, betahemolytické streptokoky, listerie. Prokáže i S.aureus a běžné Gram-negativní tyčinky. NEPROKÁŽE například: mykobakteria, virová agens, parazitární agens, nemusí prokázat plísně či jiná mykotická agens (kryptokoky). minimálně 1 ml likvoru 2-4 dny Moč Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře Minimální doba odezvy moč vymočená/cévkovaná - klasická neselektivní aerobní kultivace Uricult - klasická neselektivní aerobní kultivace vyšetření cílené na běžné uropatogeny: E.coli, ostatní Gram-negativní střevní tyčinky, P.aeruginosa, beta-hemolytické streptokoky, S.aureus, S.saprophyticus. Prokáže většinu běžných kvasinek. NEPROKÁŽE parazitární agens. NEPROKÁŽE Neisseria gonorrhoeae, kultivační průkaz z moče nemá smysl požadovat. viz moč - výše moč ze středního proudu moči ve sterilní zkumavce Uricult správný odběr: Střední proud moče odebrat do sterilní nádobky. Do této nádobky krátce namočit nosič se živnými půdami tak, aby byly obě agarové vrstvy zcela smočeny. Poté nosič vyjmout a uzavřít zpět do plastové zkumavky (uricult). Nenaplňovat uricult močí. moč na mykoplasmata / ureaplasmata viz níže "Mykoplasmata, ureaplasmata kultivačně" Antigen pneumokok, legionela viz níže sekci Přímý průkaz antigenů Genitál - muži i ženy Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře - gonokok je velmi Gonokultivace kultivační vyšetření cílené pouze na Neisseria gonorrhoeae citlivý na prudké změny teploty a na vychladnutí! PCR vyšetření viz PCR sekci Chlamydie, gonokok - sonda bez amplifikace viz PCR sekci 37 C nebo a více a více mykoplasmata, ureaplasmata kultivačně kultivační vyšetření cílené pouze na Mycoplasma hominis a Ureaplasma species (bez rozlišení U.urealyticum a U.parvum). U pozitivních vzorků je odečtena hrubá kvantifikace a citlivost k vybraným antibiotikům výtěr z uretry nebo stěr z cervixu na dacronový tampón, ihned vložit do roztoku Mycoplasma R1 5 hodin ejakulát: do sterilní zkumavky 48 hodin Genitál - muži Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře virová agens. fluor z uretry - výtěr - neselektivní kultivace streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například materiálu z genitálu trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, 2-5 dní sklo - Mikroskopické vyšetření nátěru barveného dle Grama ejakulát - neselektivní kultivace materiálu z genitálu prostatický sekret - neselektivní kultivace materiálu z genitálu Podá základní informaci o charakteru materiálu (např. zda jsou přítomny leukocyty). Prokáže množství bakterií, například: střevních tyčinek, stafylokoků, streptokoků, Gram-negativních diplokoků apod. Barvení dle Grama NEPROKÁŽE například trichomonády, chlamydie, mykoplasmata/ureaplasmata, treponemata, virová agens. streptokoky, S.aureus. Není určeno k vyloučení přítomnosti N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. streptokoky, S.aureus. Není určeno k vyloučení přítomnosti N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. nátěr fluoru na podložním sklíčku ejakulát ve sterilní nádobce Genitál - ženy Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře virová agens. pochva - výtěr - neselektivní kultivace materiálu z streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například genitálu trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, 2-5 dní sklo - "MOP" - Mikroskopické vyšetření nátěru barveného dle Giemsy Podá základní informaci o charakteru materiálu (např. poměr epielií a leukocytů). Prokáže množství bakterií, například laktobacilů, střevních tyčinek, stafylokoků, streptokoků, apod. Prokáže též kvasinky. Je určeno k průkazu trichomonád. NEPROKÁŽE například chlamydie, mykoplasmata/ureaplasmata, treponemata, virová agens. nátěr fluoru na podložním sklíčku. V případě zaslání dvou skel bude jedno obarveno dle Giemsy (průkaz trichomonád) a druhé dle Grama (lepší rozlišení bakterií). 2-5 dní 2-5 dní Verze: 01, platná od 15.2.2018 Strana 2 (celkem 6)
cervix - stěr - neselektivní kultivace materiálu z genitálu streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. NEPROKÁŽE například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. GBS screening kultivační vyšetření cílené pouze na S.agalactiae vaginorektální výtěr v Amiesově transportní půdě streptokoky, S.aureus, kvasinky, N.gonorrhoeae. Navíc přidáváme půdy na IUD - neselektivní kultivace materiálu z genitálu + prodlouženou anaerobní kultivaci cílenou na aktinomycety. NEPROKÁŽE prodloužená kultivace cílená na aktinomycety například trichomonády, treponemata, chlamydie, mykoplasmata, ureaplasmata, virová agens. tělísko ve sterilní nádobce bez transportní půdy, kultivace na aktinomycety 10 dní a více trichomonády kultivačně vyšetření cíleno pouze na trichomonády CAT Swab 3 dny Střevní patogeny Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře kultivace cílená na střevní patogeny: salmonely, shigely, yersinie, výtěr z rekta - bakteriální střevní patogeny Campylobacter sp. NEPROKÁŽE například C.difficile, virová agens, parazitární kultivačně agens. 2-7 dní screening patogenních sérotypů E.coli provádíme automaticky u dětí do 2 let věku, screening j zaměřen na nejběžnější sérotypy včetně O157. 2-7 dní Salmonella - cílená 2-7 dní Shigella - cílená cílenou kultivaci doporučujeme spíše v případě epidemiologického šetření 2-7 dní Yersinia - cílená kontaktů nebo ke sledování rekonvalescentů 2-7 dní Campylobacter sp. - cílená 2-7 dní Vibrio cholerae kultivace cílená pouze na V.cholerae - nutno uvědomit předem laboratoř! 2-7 dní stolice na C.difficile viz níže "C.difficile - antigen+toxin" v sekci "Přímý průkaz antigenů" Chirurgický a ostatní materiál Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře Stěr z rány, kožního ložiska, léze, defektu apod. - neselektivní kultivace Hnis, punktáty a ostatní tekutý materiál - neselektivní kultivace + mikroskopie Cévní katetr (centrální žilní, arteriální, periferní) Cizorodý materiál Tkáň - neselektivní kultivace + mikroskopie, pokud ji umožní velikost vzorku Anaerobní kultivace Mateřské mléko - neselektivní kultivace apod.). Anaerobní kultivaci provede laboratoř automaticky u materiálů k tomu vhodných a správně odebraných - viz níže. apod.). Anaerobní kultivaci provede laboratoř automaticky u materiálů k tomu vhodných a správně odebraných - viz níže. Vyšetříme kultivační metodou podle Makiho s kvantifikací kultivačního nálezu. Orientační hranice významnosti nálezu je 15 kolonií. Nález kvasinek či S.aureus je významný při jakékoli kvantitě. apod.). Budete-li ze vzorku tkáně požadovat anaerobní kultivaci, kontaktujte prosím laboratoř. apod.). Budete-li ze vzorku tkáně požadovat anaerobní kultivaci, kontaktujte prosím laboratoř. Anaerobní kultivaci provede laboratoř automaticky u materiálů k tomu vhodných a správně odebraných - ve stříkačce bez vzduchové bubliny uzavřené combi zátkou. Lze ji také provést z výtěrů v Amiesově transportní půdě, ale nutno očekávat nižší výtěžnost! výčet přítomných bakteriálních kmenů, při nálezu S.aureus ověřujeme, zda se nejedná o MRSA. tekutý materiál ve stříkačce bez vzduchové bubliny uzavřené combi zátkou NEBO pokud nebude požadována anaerobní kultivace, materiál ve sterilní nádobce konec cévního katetru o délce 5 cm ve sterilní nádobce vzorek ve sterilní nádobce vzorek tkáně ve sterilní nádobce V závislosti na kvalitě odběru a doby transportu lze prokázat množství anaerobních bakterií. Při podezření na dlouho rostoucí agens - např. aktinomycety - je nutno toto sdělit laboratoři. materiál ve sterilní nádobce Helicobacter pylori - selektivní kultivace + v případě průkazu H.pylori vyšetříme citlivost k ATB vzorek tkáně v 1 ml fyziologického roztoku 5 dní a více mikroskopie Ostatní materiál Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře výčet přítomných bakterií a kvasinek, u S.aureus ověření, zda se nejedná o nebo tampon v stěry z prostředí 3 dny a více tampon v Amies, 5 dní a více odběrové medium MRSA odběrovém mediu 2-5 dní, kultivace na aktinomycety 10 dní a více 1- Verze: 01, platná od 15.2.2018 Strana 3 (celkem 6)
Přímý průkaz antigenů Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře S.pneumoniae moč ve sterilní zkumavce likvor Legionella pneumophila prokáže antigen L.pneumophila séroskupiny 1, sensitivita okolo 60%, vysoká specificita. Neprokáže ostatní legionely! moč ve sterilní zkumavce RS virus výtěr z nosu/krku/výplach/aspirát adenovirus - respirační výtěr z nosu/krku/výplach/aspirát 8 h C.difficile - antigen+toxin Stolice na H. pylori Stolice na rotaviry/adenoviry/noroviry Chlamydia trachomatis Při transportu trvajícím déle než 2 hodiny může dojít k rozpadu toxinu, antigen (GDH) zůstává po dobu odin stabilní. Při pozitivitě GDH zakládáme kultivaci s cílem ověřit citlivost k metronidazolu a vankomycinu. průkaz Ag H.pylori ve stolici průkaz RV, AV, NV ve stolici průkaz antigenu C.trachomatis. Test je validován pouze pro výtěry z genitálu a moč od muže. vzorek plné stolice o objemu alespoň 1 ml (velikost lískového oříšku) šroubovacím uzávěrem šroubovacím uzávěrem nebo 3 5ml tekuté stolice 12 h 12 h 12 h výtěr z urogenitálního traktu Odezva laboratoře a dostupnost výsledkového PCR Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře listu v elektronické podobě a Detekce DNA Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila/micdadei, Bordetella pertussis, Burkholderia spp., Moraxella catarrhalis, Nocardia spp., Corynebacterium spp. V zásadě lze odebrat jakýkoli materiál, avšak některé typy požadavků - například pandetekce z primárně kontaminovaných materiálů typu sputa či výtěrů z dýchacích - jsou neúčelné. Doporučené materiály jsou zvýrazněny tučně. Odběry je nutné provést do sterilních odběrových nádob a zkumavek! Sputum, BAL, aspirát, pleurální punktát, výtěr, stěr, nesrážlivá krev (EDTA), biopsie Pneumoplex Výtěr z horních cest dýchacích, tělní tekutiny: BAL, Prokáže B.pertussis a B.parapertussis Bordetella pertussis/b.parapertussis aspirát, sputum Chlamydia pneumoniae BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret Influenza A, B, subtypizace H1N1 BAL, výtěr (nos, krk) Vhodný materiál dle povahy onemocnění (sputum, 2-5 pracovních dnů, v případě sekvenačního V případě pozitivity sekvenační dourčení druhu mykobakteria Mycobacterium spp. se sekvenačním dourčením BAL, hnis, moč, jiný materiál) dourčení déle, max. 2 týdny Mycoplasma pneumoniae BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret RSV (Respirační syncitiální virus) BAL, výtěr (nos, krk) Detekce DNA Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma Výtěr z genitálu, moč, případně výtěr z rekta, oka, hominis, Ureaplasma urealyticum, Morganella morganii, Corynebacterium faryngu, případně jiný materiál dle povahy Uroplex spp. onemocnění Detekce DNA Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Ureaplasma parvum, Výtěr z genitálu, moč, případně výtěr z rekta, oka, faryngu, případně jiný materiál dle povahy STDplex Ureaplasma urealyticum onemocnění HPV high risk stěr z cervixu, stěr z lézí 2-3 týdny HPV low risk stěr z cervixu, stěr z lézí 2-3 týdny Chlamydia trachomatis Touto technikou provádíme i vyšetření vzorků dárců tkání a buněk Výtěr z genitálu, moč, případně výtěr z rekta, oka, Mycoplasma hominis faryngu, případně jiný materiál dle povahy Mycoplasma genitalium onemocnění Neisseria gonorrhoeae Treponema pallidum Stěr z lézí Trichomonas vaginalis Moč, výtěr (uretra, pochva) Ureaplasma urealyticum Moč, výtěr (uretra, pochva) Meningoplex Borrelia burgdorferi sensu lato (B. burgdorferi, B. afzelii, B. garinii) Enterovirus spp. (Poliovirus, Coxsackie A a B virus, Echovirus, Enterovirus 68-71) Herpesviry (HSV-1, 2, HHV-6, 7, 8, CMV, EBV, VZV) prokáže pneumokokový antigen v moči, sensitivita max. 80%, u dospělých vysoká specificita. Očkování pneumokokovou vakcínou může způsobit pozitivitu testu v moči - výrobce udává až 48 hodin. Metoda PCR má vysokou citlivost - obecně prokáže DNA i v množství 10^1 kopií/ml, prokáže ovšem i DNA pocházející z rozpadlých bakteriálních buněk! Zvláště nálezy v nízké kvantitě je třeba hodnotit obezřetně! Detekce DNA Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Neisseria meningitidis, Fusobacterium nucleatum spp., Porphyromonas gingivalis/endodontalis Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Nesrážlivá krev (EDTA), likvor, punktát, biopsie, moč Likvor Diagnostika neuroinfekcí - HSV-1, 2, HHV-6, 7, 8, CMV, VZV, EBV Likvor Diagnostika kožních a očních infekcí - HSV-1, 2, CMV, VZV, EBV Stěr z léze nebo ze spojivky (sterilním suchým tamponem, vložit do sterilní zkumavky s 1 ml sterilního fyziologického roztoku) 12 - od 12 - od 12 - od 12 - od 12 - od 12 - od 7 dnů 12 - od 12 - od urgentní materiál (do odin od příjmu vzorku) výsledky urgentních vyšetření hlásíme telefonicky na uvedené telefonní číslo Verze: 01, platná od 15.2.2018 Strana 4 (celkem 6)
Diagnostika aktivní infekce - HSV-1, 2, HHV-6, 7, 8, CMV, VZV, EBV Nesrážlivá krev (EDTA) Diagnostika aktivní infekce v dolních dýchacích cestách BAL, aspirát (odsátí do sterilní zkumavky) Prenatální diagnostika kongenitální infekce CMV u žen s primoinfekcí v Plodová voda (alikvot do sterilní zkumavky) těhotenství Průkaz viru v biopsii při orgánovém postižení Biopsie (vložit do vhodné sterilní transportní na ledu 2-5 pracovních dnů nádobky) Neisseria meningitidis Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Streptococcus pneumoniae Nesrážlivá krev (EDTA), likvor TBEV (virus klíšťové encefalitidy) Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Detekce DNA Clostridium spp. (C. difficile, C. histolyticum, C. novyi, C. perfringens, C. sordellii), Citrobacter spp. (C. freundii, C. koseri), Helicobacter pylori, Yersinia spp. (Y. enterocolitica subsp. Enterocolitica, Yersinia pestis, Y. Nesrážlivá krev (EDTA), tělní tekutiny Gastroenteroplex I pseudotuberculosis) Detekce DNA Cryptosporidium parvum, Dientamoeba fragilis, Entamoeba Nesrážlivá krev (EDTA), tělní tekutiny Gastroenteroplex II histolytica, Giardia intestinalis Adenoviry typy A-F Nesrážlivá krev (EDTA), likvor, stěr Hepatitis A Krev srážlivá, stolice, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis B Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis C Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis C genotypizace Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) max. 3 týdny Hepatitis D Krev srážlivá, krev nesrážlivá (EDTA) Hepatitis E Krev srážlivá, stolice, krev nesrážlivá (EDTA) G(-): Acinetobacter baumannii, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa/putida, Serratia marcescens, Stenotrophomonas maltophilia; G(+): Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Koaguláza-negativní stafylokoky (S. epidermidis, S. haemolyticus, S. hominis, S. intermedius, S. Nesrážlivá krev (EDTA), stěry, tělní tekutiny, xylosus), Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus bioptický materiál spp. (S. agalactiae, S. anginosus, S. constellatus, S. dysgalactiae, S. infantarius, S. intermedius, S. minor, S. mitis, S. mutans, S. oligofermentans, S. oralis, S. parasanguinis, S. perosis, S. pseudopneumoniae, S. pyogenes, S. Bactoplex salivarius, S. sanguinis, S. thermophilus, S. viridans,...) Detekce DNA Aspergillus fumigatus, Aspergillus spp. (A. caelatus, A. campestris, A. candidus, A. carneus, A. cervinus, A. fasciculatus, A. flavus, A. fumigatiaffinis, A. fumigatus, A. hennebergii, A. heteromorphus, A. kambarensis, A. kanagawaensis, A. nidulans, A. niger, A. nutans, A. ochraceus, A. oryzae, A. parasiticus, A. parvulus, A. protuberus, A pseudotamarii, A. striatus, A. sydowii, A. taichungensis, A. tamarii, A. terreus, A. terricola, A. thomii, A. toxicarius, A. tritici, A. unguis, A. ustus, A. versicolor, A. Nesrážlivá krev (EDTA), stěry, tělní tekutiny, viridinutans, Rhizopus oryzae), Candida albicans, Candida dubliniensis, bioptický materiál Candida glabrata, Candida krusei, Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Candida spp. (C. albicans, C. dubliniensis, C. (Pichia) fabianii, C. (Pichia) guilliermondii, C. inconspicua, C. krusei, C. lusitaniae, C. (Pichia) norvegensis, C. orthopsilosis, C. parapsilosis, C. tropicalis), Cryptococcus neoformans, Cryptococcus spp. (C. aureus, C. carnescens, C. flavescens), Fusarium spp., Mucoraceae (Mucor indicus, M. plumbeus, Rhizopus microsporus, R. oryzae), Fungiplex Pneumocystis jiroveci Detekce DNA Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Porphyromonas gingivalis/endodontalis, Prevotella intermedia, Tannerella forsythia, Stěr Dentoplex Treponema denticola Detekce DNA Escherichia coli, Streptokoky sk. B/S. agalactiae, CMV, Staphylococcus aureus, Chlamydia trachomatis, Ureaplasma Nesrážlivá krev (EDTA, citrát), likvor Neonatální sepse urealyticum/parvum, Listeria monocytogenes Likvor, srdeční chlopeň, jiný primárně sterilní Vhodné pro primárně sterilní klinický materiál. Pandetekce hub (18S rrna) materiál max. 2 týdny Likvor, srdeční chlopeň, jiný primárně sterilní Vhodné pro primárně sterilní klinický materiál. Pandetekce bakterií (16S rrna) materiál max. 2 týdny Atopobium vaginae Moč, výtěr (uretra, cervix) Campylobacter jejuni Stolice Candidatus neohrlichia mikurensis Nesrážlivá krev (EDTA) Clostridium difficile/toxin Prokáže DNA C.difficile, případně gen kódující toxin Stolice - alespoň 1 ml Cryptosporidium hominis/parvum Nesrážlivá krev (EDTA) Gardnerella vaginalis Moč, výtěr (uretra, cervix) Haemophilus influenzae skupiny B Nesrážlivá krev (EDTA), likvor, výtěr Helicobacter pylori Biopsie BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret, pleurální Legionella micdadei výpotek Verze: 01, platná od 15.2.2018 Strana 5 (celkem 6)
BAL, sputum, aspirát, bronchiální sekret, pleurální Legionella pneumophila výpotek Leptospira spp. Nesrážlivá krev (EDTA), moč Listeria monocytogenes Nesrážlivá krev (EDTA), likvor Parvovirus B19 Nesrážlivá krev (EDTA), plodová voda Pneumocystis jiroveci BAL, sputum, stěr Polyomavirus BKV Nesrážlivá krev (EDTA), moč Polyomavirus JCV Likvor Salmonella enterica Stolice Shigella spp. Stolice Toxoplasma gondii Nesrážlivá krev (EDTA), plodová voda, likvor Tropheryma whipplei Nesrážlivá krev (EDTA) Průkaz vhodný pouze u případů akutního onemocnění v období virémie, tedy v období max. 7 dní od prvních příznaků (horečka, kožní vyrážka, bolest Nesrážlivá krev (EDTA), srážlivá krev (sérum), moč Zika virus kloubů a svalů, zarudnutí očí) Parazitologie Možnosti a limity co a jak odebrat doba dodání do laboratoře Základní parazitologické vyšetření průkaz cyst prvoků, vajíček a larev červů šroubovacím uzávěrem, řídká stolice 3-5 ml Speciální parazitologické vyšetření při podezření na amoébózu viz. zakladní parazitologické vyšetření se zvláštním zřetelem na dg. E. histolytica a D. fragilis. NUTNÉ SE DOHODNOUT S LABORATOŘÍ. šroubovacím uzávěrem, řídká stolice 3-5 ml do 2 hodin po defekaci nebo zahřívat na 37 C Perianální otisk na enterobiózu průkaz vajíček Enterobius vermicularis Ráno před ranní hygienou se na okolí řitního otvoru nalepí proužek průhledné lepicí pásky velikosti podložního skla. Proužek se k análním řasám dobře přitlačí, Poté se odlepí a lepivou částí nalepí na čisté a označené podložní sklo. Odebrat 1 nebo lépe 3 sklíčka. i Průkaz kryptosporidií průkaz oocyst šroubovacím uzávěrem, řídká stolice 3-5ml Leptospiry - serologie průkaz protilátek srážlivá krev - sérum (1ml) nebo likvor (0,5ml) 12 h Malárie průkaz přítomnosti plasmodií nesrážlivá krev (EDTA) 3ml ihned - NECHLADIT 3 dny Schistosoma haematobium průkaz vajíček S. haematobium v moči odběr posledního vzorku moči po fyzické zátěži (NE ranní moč!!!) 10ml a více, popř. osolit, doba dodání se prodlužuje oční seškrab na akantaméby průkaz trofozoitů a cyst v kontaktní čočce, v uchovávacích roztocích nebo seškrabu z rohovky čočku a uchovávací roztoky zaslat v uzavíratelné nádobě, seškrab po dohodě s klinickým pracovištěm (dodáme kultivační půdy pro okamžitou inokulaci) i pozitivita ihned, negativita za 1 týden Svrab průkaz Zákožky hloubkový seškrab z kůže z postižených míst (optimálně z 5 různých míst) i určení ektoparazitů a dospělých červů identifikace parazita organismy v uzavřené nádobě, eventuelně v alkoholu, zabránit úplnému vyschnutí i Verze: 01, platná od 15.2.2018 Strana 6 (celkem 6)