Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil

Podobné dokumenty
Studium vybraných buněčných linií pomocí mikroskopie atomárních sil s možným využitím v praxi

Izolace nukleových kyselin

Seminář izolačních technologií

Pokročilé AFM mody Příprava nosičů a vzorků. Verze Jan Přibyl, pribyl@nanobio.cz

Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu)

Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic

Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014

Elektrická dvojvrstva

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY

Nanostruktury a zobrazovací metody v medicíně

Chelatující makroporézní mikročástice jako potravinový doplněk pro léčbu Wilsonovy choroby

Některé poznatky z charakterizace nano železa. Marek Šváb Tereza Nováková Martina Müllerová Jan Šubrt Karel Závěta Eva Gregorová

IZOLACE DNA POMOCÍ MAGNETIZOVATELNÝCH ČÁSTIC A JEJICH VYUŽITÍ V DIAGNOSTICE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ

Potravinářské aplikace

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

Přehled pracovišť pro trainee

Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..

Nanobiotechnologie a bionanotechnologie

Klasifikace oxidů železa, strukturní formy. Tepelný rozklad jako metoda přípravy nanočástic. Příklady přípravy nanočástic oxidů železa

Mikroskop atomárních sil: základní popis instrumentace

Speciální hybridní vrstvy připravené metodou sol-gel a jejich biomedicínské aplikace

Centrum základního výzkumu v oblasti nanotoxikologie v ČR

Mikroskopie rastrující sondy

Studium chemie na PřF UPOL. Mgr. Eva Schütznerová Katedra organické chemie

Zpráva o postupu projektu TA

Mikroskopie se vzorkovací sondou. Pavel Matějka

HLADINOVÉ KOAXIÁLNÍ ZVLÁKŇOVÁNÍ PRO MASIVNÍ PRODUKCI NANOVLÁKEN DRUHÉ GENERACE

Magnetické nanočástice, SPIO nanočástice, MATra, transfekce, DNA, účinnost transfekce

10/21/2013. K. Záruba. Chování a vlastnosti nanočástic ovlivňuje. velikost a tvar (distribuce) povrchové atomy, funkční skupiny porozita stabilita

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

NANOMATERIÁLY, NANOTECHNOLOGIE, NANOMEDICÍNA

3. Vlastnosti skla za normální teploty (mechanické, tepelné, optické, chemické, elektrické).

Elektronová mikroskopie SEM, TEM, AFM

Metody charakterizace

VÝUKOVÝ MODUL MEMBRÁNOVÝCH PROCESŮ TÉMATA PŘEDNÁŠEK

MAGNETICKÉ NANOČÁSTICE

Povrchově modifikované nanočástice železa pro dechloraci organických kontaminantů

Magnetotaktické bakterie

Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková

Nanotechnologie a Nanomateriály na PřF UJEP Pavla Čapková

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Nanotransportéry pro teranostické aplikace

Techniky mikroskopie povrchů

Rozpustnost Rozpustnost neelektrolytů

Chemie povrchů verze 2013

STANOVENÍ TVARU A DISTRIBUCE VELIKOSTI ČÁSTIC MODELOVÝCH TYPŮ NANOMATERIÁLŮ. Edita BRETŠNAJDROVÁ a, Ladislav SVOBODA a Jiří ZELENKA b

Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů

GEOCHEMICKÁ REAKTIVNÍ BARIÉRA PERSPEKTIVNÍ PRVEK IN - SITU SANAČNÍCH TECHNOLOGIÍ

Nanomateriály z pohledu ochrany zdraví při práci Jaroslav Mráz Státní zdravotní ústav, Praha

MAGNETICKÉ MATERIÁLY PRO BIORAFINACI POTRAVINÁŘSKÝCH ODPADŮ

MĚŘENÍ V KONTAKTNÍM REŽIMU POMOCÍ MIKROSKOPU SOLVERNEXT

Morfologie částic Fe 2 O 3. studium pomocí AFM

MATERIÁLOVÁ PROBLEMATIKA PŘI SEPARACI PLYNŮ A PAR

Kvantové tečky. a jejich využití v bioanalýze. Jiří Kudr SPOLEČNĚ PRO VÝZKUM, ROZVOJ A INOVACE CZ/FMP.17A/0436

INTERAKCE IONTŮ S POVRCHY II.

VÝUKOVÝ MODUL MEMBRÁNOVÝCH PROCESŮ SYLABY PŘEDNÁŠEK TRANSPORT LÁTEK MEMBRÁNAMI MEMBRÁNOVÉ MATERIÁLY

Ústav organické chemie a technologie. Zajímavosti z našich laboratoří

Seznam otázek pro zkoušku z biofyziky oboru lékařství pro školní rok

Hybridizace nukleových kyselin

Aplikace nano-sorbentů pro stabilizaci Pb a Zn v kontaminované půdě

Funkční nanostruktury Pavla Čapková

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek

Prezentace navazuje na základní znalosti z biochemie (lipidy, proteiny, sacharidy) Dynamický fluidní model membrány 2008/11

Horniny a minerály II. část. Přehled nejdůležitějších minerálů

2. Srovnání postupů izolace DNA kolonky vs. paramagnetické částice

In vivo příklady biomateriálů [Ratner, 2005] Biomateriály

Vlastnosti nanoželezné suspenze modifikované řepkovým olejem

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

Zdroj: Bioceramics: Propertie s, Characterization, and applications (Biokeramika: Vlastnosti, charakterizace a aplikace) Překlad: Václav Petrák

Program: Institucionální program pro veřejné vysoké školy pro rok 2016 Poskytovatel: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Proč elektronový mikroskop?

Kosmetika a kosmetologie Přednáška 8 Funkční látky péče o kůži II

MAGNETICKÉ NANOČÁSTICE PRO BIOMEDICÍNSKÉ APLIKACE

Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D. Brno, 20. března 2014

Bakteriální nanočástice magnetitu. Produkce - biomineralizace, modifikace a aplikace. Zdenka Marková, Michaela Pečová a kolektiv CVN

16:30 17:00 příchod hostů 17:00 18:00 představení jednotlivých firem v rozsahu 120 vteřin 18:00 22:00 neformální část akce

Návrhování experimentů pro biomedicínský výzkum pomocí metod DOE

Chemie životního prostředí III Hydrosféra (03) Sedimenty

Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň

Chemické metody přípravy tenkých vrstev

MODELOVÁNÍ MIGRAČNÍCH SCHOPNOSTÍ ŽELEZNÝCH NANOČÁSTIC A OVĚŘENÍ MODELU PŘI PILOTNÍ APLIKACI

RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie PřF UP Olomouc 2008/11. *Ivana FELLNEROVÁ, PřF UP Olomouc*

Funkční a biomechanické vlastnosti pojivových tkání (sval, vazy, chrupavka, kost, kloub)

Sklo chemické složení, vlastnosti, druhy skel a jejich použití

Determinanty lokalizace nukleosomů

Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

Základy analýzy potravin Přednáška 1

Chromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost

Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy ( LF2 > Biofyzika

Studentská tvůrčí a odborná činnost STOČ 2012

Složení látek a chemická vazba Číslo variace: 1

UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ KATEDRA BIOLOGICKÝCH A BIOCHEMICKÝCH VĚD

VYUŽITÍ BEZKONTAKTNÍ VODIVOSTNÍ DETEKCE PRO HPLC SEPARACI POLYKARBOXYLÁTOVÝCH DERIVÁTŮ CYKLENU. Anna Hamplová

Vysoká škola chemicko-technologická v Praze. Ústav organické technologie. Václav Matoušek

strojů umožň lní vstupní infiltraci Mgr. Silvie Dudová, RNDr. Iva Burešová, Drahomíra Kyjovská

Skenovací tunelová mikroskopie a mikroskopie atomárních sil

Transkript:

Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil Zapletalová 1 H., Tvrdíková 2 J., Kolářová 1 H. 1 Ústav lékařské biofyziky, LF UP Olomouc 2 Ústav chemie potravin a biotechnologií, CHF VUT Brno XXXVI. Dny lékařské biofyziky Lázně Bělohrad

Magnetické částice (MP) Magnetické nosiče Nanočástice (do 500nm) Mikročástice (0,5-10µm)

Magnetické částice (MP) Superparamagnetické (nulový zbytkový magnetismus) X feromagnetické (velmi rychlá separace i ve viskózním prostředí) - Snadná resuspendovatelnost - Pomalá sedimentace - Velká povrchová plocha (cca 100 m 2 /g částic, dle velikosti) - Uniformní distribuce velikosti částic (pro zachování fyzikálních a chemických vlastností) - Biokompatibilita

Aplikace magnetických částic (MP) In vivo In vitro - terapeutické využití (nosiče léčiv) - magnetofekce (magneticky řízená transfekce genu) - hyperthermie (uvolňování tepla v cílové tkáni prostřednictvím hysterezních ztrát MP ve vnějším proměnném magnetickém poli) - MRI - kontrastní agens - diagnostika / separace / značení povrchově modifikované polymerní magnetické mikročástice usnadňují separace buněk, proteinů či buněk ze složitých směsí pomocí externího magnetického pole

Aplikace magnetických mikročástic - izolace NK (1) Lyze buněčného materiálu (2) adsorpce NK (3) promývací krok (4) eluce NK (převzato z chemagen, Biopolymer-Technolgy AG, Germany)

Stavba magnetických částic magnetické jádro Magnetické vlastnosti (nanočástice oxidů železa: magnetit Fe 3 O 4, maghemit γ- Fe 2 O 3, hematit α-fe 2 O 3 ) biokompatibilní obal - ochrana jádra + modifikace vhodnými funkčními skupinami syntetický polymer (polystyren, polyakrylamid, porézní sklo, křemičitanová vrstva, silanová vrstva, ) biopolymer (agarosa, celulóza, chitosan, ) lipidová membrána Velikost a tvar magnetických mikročástic závisí na způsobu přípravy, reakční teplotě, ph, použité iontové síle apod.

Stavba magnetických nanočástic (převzato z Veiseh et al, 2010, Design and fabrication of magnetic nanoparticles for targeted drug delivery and imaging)

Mikroskopie atomárních sil Bioscope Catalyst, Bruker Zobrazovací režim: Scan asyst mode F-d křivka v každém bodu rastru = precizní kontrola silové interakce mezi měřícím hrotem a zobrazovaným vzorkem zabrání posunu vzorku během skenování Skenující sonda: hrot scan asyst, k~0,7 N/m Imobilizace MP 0,5% agarózový gel nanesen na krycím sklíčku,neodymový magnet (převzato z Bruker corp. NY, USA; www.bruker.com) OM snímek MP a AFM hrotu, 600x

Typy zobrazovaných MP MPG uncoated MPG STV-coated Fcoll P(HEMA) Snímky MP: Optický mikroskop OLYMPUS XI 81, BF, zvětšení 600x.

MPG uncoated MPG uncoated, 3D topografie, výškový profil, 17μm 2 MPG uncoated, 2D struktura, 17μm 2 MPG uncoated, 3D topografie, ZOOM 2μm 2 MPG uncoated, 2D topografie, ZOOM 2μm 2

MPG STV-coated MPG-STV-coated, 3D topografie, výškový profil, 10μm 2 MPG STV-coated, 2D struktura, 10μm 2 MPG STV-coated, 3D topografie, ZOOM 2μm 2 MPG STV-coated, 2D topografie, ZOOM 2μm 2

Fcoll Fcoll - 3D topografie, výškový profil, 8μm 2 Fcoll, 2D struktura, PF error mode, 8μm 2 Fcoll - 3D topografie, ZOOM 0,5μm 2 Fcoll, 2D topografie, ZOOM 0,5μm 2

P(HEMA) P(HEMA), 3D topografie, výškový profil; 3,3µm 2 P(HEMA), 2D struktura, PF error mode; 3,3μm 2 P(HEMA), 3D topografie, scan 0,76μm 2 P(HEMA), 2D topografie, scan 0,76μm 2

Distribuce velikosti MP µm µm µm µm

Detailní výškový profil MP MPG- uncoated výškový profil 33nm, MPG- STV výškový profil 27m, scan 300nm 2, RMS (18,4 ± 6,2) nm scan 600nm 2, RMS (17,2 ± 8,1) nm F coll výškový profil 14nm, scan 600nm 2, RMS (7,2 ± 4,1) nm P(HEMA) výškový profil 28nm, Scan 760nm 2, RMS (13,2 ± 6,1) nm

Charakterizace zobrazovaných MP Úzká distribuce velikostí: PHEMA, následuje F koll, nejširší distribuci velikosti částic má komerční MP MPG. Povrchové modifikace: MPG porézní sklo (SiO 2, OH funkční skupiny na povrchu) MPG-STV streptavidin Fcoll COOH funkční skupiny P(HEMA) NH 2 funkční skupiny Povrchová topografie: MPG RMS (18,4 ± 6,2) nm MPG-STV RMS (17,2 ± 8,1) nm Fcoll RMS (7,2 ± 4,1) nm P(HEMA) RMS (13,2 ± 6,1) nm

Efektivita MP při izolaci bakteriální DNA z komplexních vzorků Princip reversibilní adsopce DNA na magnetický nosič: - Za přítomnosti PEG a NaCl 2 dochází k dehydrataci DNA. Při nízké koncentraci NaCl 2 se DNA vyskytuje v relaxované formě, při vysoké koncentraci NaCl 2 dochází ke srážení makromolekul DNA a vzniku jejich kondenzátů, které snadno adsorbují na povrch MP. - Selektivní adsorpce DNA na magnetický nosič může být zvýšena modifikací povrchu např. kladně nabitými funkčními skupinami - NH 2 (elektrostatická interakce) - Vliv na efektivitu selektivní adsorpce DNA má: ph, iontová síla a teplota roztoku + funkční skupiny na povrchu MP

Efektivita MP při izolaci bakteriální DNA z komplexních vzorků Všechny AFM analyzované částice byly úspěšně použity k magnetické separaci a izolaci bakteriální DNA z reálných vzorků (hrubý lyzát) v kvalitě vhodné pro PCR. Odlišná topografie i distribuce velikosti použitých magnetických nosičů neprokázala vliv na kvalitu a množství izolované bakteriální DNA. Větší výtěžek izolované DNA byl získán izolací DNA prostřednictvím MP - Fcoll (povrch modifikován funkční skupinou COOH), méně izolací P(HEMA) magnetickým nosičem (povrch modifikován funkční skupinou NH2). Čistota izolované DNA byla u všech čtyř analyzovaných MP v kvalitě vhodné pro PCR.

PODĚKOVÁNÍ Projektu: LF_2013_006 CZ.1.05/2.1.00/01.0030 Ústavu molekulární a translační medicíny Vám všem za pozornost