28113210.9.2 Grantová agentura České republiky Část ZA Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu Řešitel: Doc. RNDr. Milan Konečný, CSc. Registrační číslo: 205/07/1278 Příjemce (název a adresa): Masarykova univerzita - Přírodovědecká fakulta, Kotlářská 2, 611 37 Brno IČ: Tel: Fax: E-mail: 00216224 549 495 135 549 491 061 konecny@geogr.muni.cz Název projektu: Kartografická vizualizace a modelování současných trendů vývoje zdravotního stavu a zdravotní péče v České republice Prohlašuji, že údaje uvedené v přiložené zprávě o řešení grantového projektu jsou pravdivé a úplné. Datum:... Doc. RNDr. Milan Gelnar, CSc. Podpis řešitele grantu Jméno a podpis statutárního orgánu, razítko příjemce
28113210.9.2 Grantová agentura České republiky Závěrečná karta projektu Příjemce: Masarykova univerzita - Přírodovědecká fakulta Registrační číslo: 205/07/1278 Řešitel: Doc. RNDr. Milan Konečný, CSc. Na kterých pracovištích byl projekt řešen: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Geografický ústav, Laboratoř geoinformatiky a kartografie Fakultní nemocnice Brno Která zahraniční pracoviště při řešení spolupracovala (název, země): Investiční zařízení pořízená z prostředků GA ČR (v celkové ceně nad 500 tis. Kč): Udělené patenty nebo podané přihlášky vycházející z výsledků projektu: George Mason University, Department of Statistics, Northern Virginia, USA Cena v tis. Kč. Nebyla pořízena žádná zařízení. 0 0 0 Nebyly uděleny patenty. Úplné citace (knihy, články, přednášky, zprávy a pod.) shrnující výsledky projektu (uveďte i publikace přijaté do tisku nebo připravované): Uvádí se maximálně pět nejvýznačnějších citací. Prevalence nádorů v České republice 1989-2005-2015. Konečný M., Geryk E., Kubíček P., Štampach R., Kozel J., Stachoň Z., Michálek J., Odehnal J., Dítě P., Koška P., Kraus R., Holub J. 1. vyd. Brno : Přírodovědecká fakulta Masarykovy Univerzity, Brno a Občanské sdružení podpory zdraví a onkologické prevence, 2008. 69 s. ISBN 978-80-903255-2-4 Vícečetné zhoubné novotvary: Ukazatel zdraví a nákladů péče v onkologii. Geryk E., Bendová M., Kubíček P., Štampach R., Odehnal J., Koška P., Holub J., Konečný M. Zdravotnictví v ČR, Praha: Asoc. pro rozv. soc. lék. a řízení péče, 2008, 2, s. 50-55,6 s. ISSN 1213-6050 Karcinom prsu a následné primární zhoubné novotvary v České republice 1976-2005. Geryk E., Bendová, M., Kozel J. Onkologie, 2009, 3, 1, s. 54-61. ISSN 1802-4475 Vícečetné nádory gastrointestinálního traktu v ČR 1976-2005. Geryk E., Dítě P., Kozel J., Štampach R., Kubíček P. Čes. Slov. Gastroenterol. Hepatol., 2010, 64, 1, s. 131-142. ISSN 1213-323X Dynamic cartographic methods for visualisation of health statistics. Stampach R., Konecny M., Kubicek P., Geryk E. In Cartography in Central and Eastern Europe. Berlin-Heidelberg : Springer, 2010. s. 431-442, 12 s. Lecture Notes in Geoinformation and Cartography. ISBN 978-3-642-03293-6. Výsledky event. oponentního řízení: V čem vidíte uplatnění výsledku tohoto projektu: Explorační kartografická analýza a prezentace zdravotních dat a trendů jejich vývoje.
28113210.9.2 Souhrn výsledků řešení projektu a naplnění cílů projektu (max. 20 řádků) - česky: Projekt Medicarto byl zaměřen na zhodnocení možností využití a návrh konceptu nových kartografických nástrojů pro dynamickou prezentaci, publikaci a analýzu dat o zdravotním stavu a zdravotní péči v prostředí internetu. Základní podmínkou byla kartografická správnost zvolené vizualizace. Cílem bylo zlepšit podporu rozhodování řídících pracovníků a orgánů státní správy při posuzování současných kapacit a výhledových potřeb jednotlivých medicínských oborů. V souladu s návrhem projektu byly analyzovány a kartograficky prezentovány vybrané datové sady o stavu zdraví a zdravotnictví, jejichž souhrn je uveden na stránkách projektu (medicarto.geogr.muni.cz). Hlavní oblast analyzovaných dat zahrnuje především záznamy z Národního onkologického registru (NOR, 1976 2005) a DPS (vybrané diagnózy incidence, mortality a prevalence v letech 1995 2006). Datové zdroje zahrnují také data z mezinárodních databází (OECD, WHO) a interní data z pracoviště spoluřešitele (FN Brno). Uvedená data byla analyzována a vytvořeny časové řady s rozlišením na úroveň krajů, které byly kartograficky prezentovány. K prezentaci byl použit nástroj TimeSeries vytvořený na pracovišti řešitele s cílem umožnit interaktivní časoprostorovou explorační vizualizaci. Nástroj je dostupný z portálu zdravi.geogr.muni.cz. Dále byly vytvořeny a prakticky implementovány odpovídající statistické modely pro vybrané diagnózy (nádorová onemocnění). Výše zmíněné výsledky byly prezentovány ve více než 40 publikačních výstupech, a to včetně článku v zahraniční monografii a 8 článků v recenzovaných časopisech. Souhrn výsledků řešení projektu a naplnění cílů projektu (max. 20 řádků) - anglicky: Project Medicarto was focused on evaluation of possibilities of use and concept design of new cartographic tools for dynamic presentation, publication and analysis of health status and healthcare data on the Internet. The basic requirement was cartographic correctness of selected visualization. The aim was to improve information support of decision-makers and public administration bodies for evaluation of current capacities and future needs of individual medical branches. In accordance with the project proposal, selected health status and healthcare datasets that are listed in the project web pages (medicarto.geogr.muni.cz) were analyzed and cartographically presented. The main area of analyzed data is represented by data from the National Oncological Register (NOR, 1976 2005) and DPS (selected diagnoses of incidence, mortality and prevalence in 1995 2006). Analyzed resources also include data from international databases (OECD, WHO) and internal data from the workplace of co-researcher (University Hospital Brno). The above-mentioned data were analyzed and time series with differentiation to the level of regions were created and cartographically presented with the use of software tool TimeSeries created by the researcher. This tool allows interactive spatio-temporal exploratory data visualization. It is available in the portal zdravi.geogr.muni.cz. Furthermore, statistical models for selected diagnoses (cancer) were created and implemented. The above-mentioned results were presented in more than 40 publications including an article in an international monograph and 8 articles in reviewed periodicals.
Grantová agentura České republiky Část ZC Rozbor řešení grantového projektu a celkové shrnutí Jméno řešitele: Prof. RNDr. Milan Konečný, CSc. Registrační číslo projektu: 205/07/1278 Název projektu: Kartografická vizualizace a modelování současných trendů vývoje zdravotního stavu a zdravotní péče v České republice I. Postup prací při řešení grantového projektu na pracovišti řešitele a spoluřešitelů: Projekt Kartografická vizualizace a modelování současných trendů vývoje zdravotního stavu a zdravotní péče v České republice (dále jen Medicarto ) byl zaměřen na zhodnocení možností využití a návrh konceptu nových kartografických nástrojů pro dynamickou prezentaci, publikaci a analýzu dat o zdravotním stavu a zdravotní péči v prostředí internetu. Základní podmínkou byla kartografická správnost zvolené vizualizace. Cílem bylo zlepšit podporu rozhodování řídících pracovníků a orgánů státní správy při posuzování současných kapacit a výhledových potřeb jednotlivých medicínských oborů. Zejména šlo a překonání tradičního pohledu na data zdravotního stavu a zdravotní péče ve formě tabulek, ze kterého plynou četná omezení při jejich celkovém vnímání z hlediska prostorového rozložení a dále, v souladu s nejnovějšími zahraničními trendy i o znázornění resp. interpretaci dat a informací pomocí jejich vizualizace resp. kartografického vyjádření, a to jak pro potřeby lékařů a zdravotních manažerů, tak i jednotlivých pacientů. V grantové přihlášce projektu byly jako hlavní cíle projektu stanoveny zejména následující body: 1) Analyzovat data o stavu zdraví a zdravotnictví v ČR, dostupné z databází ÚZIS, ČSÚ, SÚKL a SZÚ s cílem posouzení dynamiky jejich vývoje a odhadem předpokládaného vývoje vybraných ukazatelů. Největší množství dat pro projekt bylo získáno z Úřadu zdravotnických informací a statistiky. řešitelé měli k dispozici celou databázi DPS obsahující 730 ukazatelů za období 1995-2006, zahrnující i vývoj demografie, zdravotního stavu, zdravotní péče, ekonomických nákladů, životního prostředí a nádorů. Další využívanou databází byl Národní onkologický registr (NOR) - databáze nemocných, nahlášených do registru nádorů od května 1976 se základními epidemiologickými charakteristikami, doplněnými pro mezinárodní komparaci závaznými kriterii IARC (Mezinárodní agentura pro výzkum rakoviny) v Lyonu. Hlavní zpracovávanou veličinou byl počet přežívajících s onkologickou diagnózou prevalence. Ze stejného zdroje byla získána data o počtech metachronních novotvarů za roky 1976-2005. Data byla analyzována z hlediska jejich využitelnosti a vztahu k hlavním cílům projektu a následně uložena do databáze. Část dat byla v průběhu projektu využita k publikační činnosti. Kromě toho byla získaná data použita pro testování při návrhu způsobů kartografické vizualizace a při vývoji kartografických nástrojů. Z celostátní databáze DPS byl také zpracován vývoj incidence, mortality a prevalence podle stavu dostupnosti a dílčího časového horizontu za období 1995-2006 pro skupinu nádorů, cévních nemocí mozku a diabetu, doplněný trendy hospitalizace, invalidity a lázeňské péče. Z dat NOR byly zpracovány přehledy týkající se 23 diagnostických skupin nádorů u mužů a 26 u žen ve dvou věkových kategoriích 0-85+ a 35-64 let za ČR a kraje. Dostupná epidemiologická data (incidence a mortality za roky 1989-2005) byla doplněna o dobu zjištění nemoci, klinická stadia, léčbu chirurgií, radioterapií a chemoterapií (za roky 2000-4). U každé diagnózy byl zpracován vývoj počtu žijících/léčených u mužů a žen ve věku 0-85+ let a 35-64 let za období 1989-2004 v ČR a krajích. Tabelární a kartografické přehledy absolutní a relativní prevalence byly doplněny výpočtem predikce podle diagnóz na období 2006-2015. Následně byla na základě těchto dat připravena a vytvořena publikace Prevalence nádorů v České republice 1989-2005-2015 [1].
Data z Českého statistického úřadu byla použita hlavně jako doplňková a pomocná data při prováděných analýzách; šlo zejména o počty obyvatel a jiné demografické údaje v různých letech a různých regionech. Využity byly také údaje o výdajích zdravotního pojištění. Další národní data byla získána od spoluřešitele projektu Fakultní nemocnice Bohunice (FNB). Šlo o databáze nemocničního informačního systému Hospital Cost, zahrnující roční údaje o 1 mil. ambulantně ošetřených a přes 40 tis. hospitalizovaných pacientů. I tato data byla analyzována, homogenizována a následně použita částečně pro testovací a částečně pro publikační činnost. 2) Prezentovat údaje o demografii, nákladech zdravotní péče, zdravotním stavu obyvatel ČR v kontextu 32 zemí čtyř regionů Evropy, dostupné z databází IARC, OECD a WHO. V rámci projektu byla získána a analyzována data z několika mezinárodních databází WHO, WHO Europe, OECD, IARC a Eurostat, a to z hlediska podmínek jejich dostupnosti a míry možností vzájemné komplementarity (doplňování), ale také konfliktnosti (v jakých případech jsou jejich data se stejnými tematikami ve vzájemném konfliktu). Na základě zjištěných rozdílů mezi jednotlivými databázemi byla zvolena množina dat z různých databází, která byla následně použita pro testování různých typů kartografické vizualizace a variantních typů prostorových analýz viz Obr. 1 a Obr. 8. Výsledky byly umístěny na webové stránky projektu (medicarto.geogr.muni.cz). Daná data byla rovněž použita při výuce studentů pregraduálního studia. Výsledkem jejich aktivit byly tematické mapy, které byly rovněž umístěny na webových stránkách projektu. Uvedená data byla použita také při zpracování studentských závěrečných bakalářských a magisterských prací (viz seznam literatury [39]-[44]). Obr. 1: Ukázka analýzy hlavních komponent na mezinárodních datech. 3) Vypracovat vhodné kartografické reprezentace prostorové distribuce sledovaných jevů, jejich dynamiku v čase, prostřednictvím exploratorní kartografie usnadnit sledování závislosti jevů. Sestavit odpovídající kartografické modely predikce vývoje sledovaných parametrů. V oblasti kartografické vizualizace vybraných dat zdravotního stavu byla provedena rozsáhlá literární rešerše historického vývoje mapování zdravotních dat, jednotlivých metodik a současného stavu poznání. Souběžně byly analyzovány dostupné nástroje sloužící pro vizualizaci změn a explorační analýzy, zkoumány jejích možnosti, technologické postupy a využitelnost v rámci projektu. Jmenovitě šlo o programy CCmaps, Geoda, ESTAT, Geoviz, Improvise, Mapresso a další. Výsledky
analýzy včetně popisu současných metod byly prezentovány na konferencích v Plzni, Vídni, Washingtonu a dalších [13], [33] a [37]. V průběhu projektu byla vytvořena řada mapových výstupů všech typů zdravotních dat, která se pro projekt podařilo shromáždit (viz bod 1). Cílem uvedeného kartografického zpracování bylo navržení vhodné kartografické vizualizace zdravotních dat, která by splňovala požadavky projektu kartografickou správnost a čitelnost pro uživatele. Ze zmíněných návrhů lze zmínit následující: a) Z dat NOR ÚZIS bylo vytvořeno mezi jinými: - 60 map vybraných onkologických diagnóz v anglické a české jazykové verzi - viz Obr. 2-31 map vybraných cévních diagnóz b) Z dat o pacientech FNB byly vytvořeny mapy ambulantně ošetřených a hospitalizovaných nejpočetnějších diagnóz ve FN v roce 2006 viz Obr. 3. Tyto mapy byly nabídnuty vedení FNB k informativním a propagačním účelům. c) Další série map byla zpracována na základě Výroční zprávy Fakultní nemocnice Brno za rok 2007 viz Obr. 4. Obr. 2: Ukázka návrhu mapového výstupu pro vybranou onkologickou diagnózu v ČR.
Obr. 3: Ukázka kartografického výstupu ambulantně ošetřených a hospitalizovaných ve FNB. Obr. 4: Příklad prostorového rozmístění pacientů vybrané kliniky FNB. Kartograficky bylo provedeno zpracování dat prevalence (přežívajících pacientů) u 23 nádorových diagnóz pro muže a 26 dg. pro ženy v období 1989-2005 ve věku 0-85+ let a 35-64 let
(viz bod 1). Byly vytvořeny návrhy kartografických výstupů, po konzultacích s kartografy a lékaři byla zhodnocena jejich čitelnost a následně byl vybrán a vyladěn nejvhodnější návrh. Na jeho základě byla vytvořena série map pro výše zmíněné diagnózy viz Obr. 5. Tabelární a kartografické přehledy absolutní a relativní prevalence byly doplněny výpočtem predikce podle diagnóz na období 2006-2015. Metoda této predikce je popsána v bodě 7). Následně byla na základě těchto map a materiálů připravena a vytvořena publikace Prevalence nádorů v České republice 1989-2005-2015 [1]. Obr. 5: Ukázka kartografických výstupů z publikace Prevalence nádorů v České republice 1989-2005-2015 [1]. Kromě tradičních map reprezentujících prostorové rozmístění a vývojové trendy vybraných diagnóz byly vyvíjeny návrhy kartografických vizualizací pro elektronické prostředí interaktivních map. V rámci řešení projektu byl vyvinut kartografický analyticko-vizualizační nástroj. Na základě analýzy dat získaných pro projekt (bod 1), rešerše dostupné (zejména zahraniční) literatury o způsobech zobrazování a analýzách zdravotních dat provedených na zahraničních vědeckých pracovištích a také na základě konzultací se zdravotníky, vyhodnotil řešitelský tým jako nejúčelnější implementovat nástroj pro vizualizaci časových řad. Data zobrazovaná v popisovaném nástroji jsou uložena v databázi, k načtení nových dat do nástroje dojde automaticky po jejich nahrání do databáze. Nástroj umožňuje zobrazovat data kartogramem i kartodiagramem s využitím sloupcových grafů (viz Obr. 6 a 7), při použití různých typů barevných stupnic. To umožňuje kartograficky správně zobrazovat různé typy dat absolutní i relativní, přepočítané na počet obyvatel. Hodnoty v jednotlivých regionech je možno zobrazit na požádání v mapě nebo v tabulce. Pro umožnění lepší analýzy dat v čase byla doplněna možnost jejich animace, která umožňuje implementaci dat zejména při použití sloupcových grafů a podává dobrý přehled o trendu vývoje zkoumaných hodnot v čase. Uživatel má možnost animaci průběžně ovlivňovat změnou rychlosti,
animační nástroj umožňuje i lineární interpolaci pro případ chybějících dat v libovolném časovém období. Pro lepší analýzu v prostoru pak slouží možnost rychlého přechodu do menších i větších územních jednotek nebo změna úrovně administrativních jednotek zobrazených v mapě. To mimo jiné umožní uživateli eliminovat problém zakrytí jevu při použití administrativních hranic. Tato možnost je použitelná tehdy, pokud jsou data dostupná pro větší počet administrativních úrovní. Nástroj byl vyvíjen s důrazem na čitelnost, ovladatelnost a kartografickou správnost. Celý nástroj se stal součástí webového portálu zdravi.geogr.muni.cz, kde je využíván pro zobrazování reálných zdravotních dat. Připravujeme uplatnění tohoto nástroje coby autorizovaného softwaru na rok 2010. Obr. 6: Ukázky nástroje pro interaktivní kartografickou vizualizaci časových řad při použití sloupcových grafů v mapě, plynulá barevná škála.
Obr. 7: Ukázky nástroje pro interaktivní kartografickou vizualizaci časových řad při použití intervalové škály s vizualizací hodnot v mapě. 4) Teoreticky, empiricky a prakticky ohodnotit výše zmíněné postupy s ohledem na existující prostorové a časoprostorové statistické metody a posoudit jejich vhodnost pro zhodnocení analýzy a predikce zdravotního stavu a zdravotní péče. Veškeré navržené typy vizualizací byly konzultovány s odborníky na kartografii i s lékaři, kdy byla hodnocena jejich kartografická správnost, čitelnost pro odborníky lékařských i nelékařských oborů a využitelnost z hlediska dostupných zdravotních dat. Ty typy vizualizace které byly označeny za vhodné, byly následně použity s reálnými zdravotními daty, jak v tištěných publikacích tak ve webovém prostředí. Tyto mapy byly doplňkem většiny publikací zmíněných v seznamu literatury. I nadále bude pokračovat výzkum vhodnosti jednotlivých typů vizualizace, především na základě zpětné vazby uživatelů webového portálu zdravi.geogr.muni.cz. Tímto způsobem by mělo být zjištěno, které vizualizace uživatele nejvíce zaujmou a které jsou pro ně nejlépe srozumitelné a čitelné. V rámci výzkumu byly dále provedeny pokusy s cílem zjistit, jak využitelné jsou v oblasti zpracování zdravotních dat existující volně dostupné nástroje pro prostorové explorační analýzy, např. CCmaps, Geoda, ESTAT a další. Byly zkoumány jejich možnosti, ovladatelnost, originalita a další faktory. Popis jednotlivých typů nástrojů byl součástí článků prezentovaných na konferencích v Plzni [13], ve Vídni [33] apod. Zvoleným kritériím nejlépe vyhověl nástroj CCmaps viz Obr. 8. Možnosti využití a úprav nástroje a datových sad byly konzultovány s jeho autorem na pracovišti George Mason University v USA. CCmaps jako nástroj pro vizuální posouzení vícerozměrné korelace prostorových dat byl použit na ukázkovou analýzu mezinárodních evropských dat (Eurostat a OECD, viz bod 2). Její výsledky jsou uvedeny na stránkách medicarto.geogr.muni.cz. Zároveň byla pro vzájemné srovnání a ověření výsledků stejná data analyzována i pomocí analýzy hlavních komponent (viz Obr. 1). I tyto výsledky jsou dostupné na výše zmíněné stránce.
Obr. 8: Ukázka mezinárodních dat v nástroji CCmaps. 5) Vytvořit webovou prezentaci a obsah reprezentující funkcionalitu kartografických metod a interpretaci výsledků. Popis projektu, návrhy vizualizací (viz bod 3), ukázky analýz mezinárodních dat (viz bod 4) a přehled publikací byly umístěny na stránky projektu medicarto.geogr.muni.cz. Některé z vytvořených statických map a interaktivní nástroj na prezentaci časových řad byly použity pro portál zdravi.geogr.muni.cz prezentující reálná zdravotní data pro veřejnost. 6) Otestovat přístupy a nástroje na specifických aplikačních případech dat zdravotního stavu a zdravotní péče. Jak již bylo výše uvedeno v bodech 4) a 5) ty navržené typy vizualizace pro zdravotní data, které byly po konzultacích s kartografy a zdravotníky označeny za vhodné, byly využity pro zobrazení reálných zdravotních dat, jak v tištěných publikacích, tak ve webovém prostředí (pomocí vyvinutého interaktivního nástroje). Tyto vizualizace jsou umístěny na webech medicarto.geogr.muni.cz a zdravi.geogr.muni.cz. V publikovaných článcích a monografiích byla většinou zachycena česká zdravotní data. Mezinárodní data byla použita pro otestování interaktivních kartograficko-statistických nástrojů, např. již zmíněného CCmaps a pro testování využitelnosti analýzy hlavních komponent. Na portálu zdravi.geogr.muni.cz jsou vytvořené typy vizualizace porovnávány i s jinými metodami kartografického zobrazení zdravotních dat vyvinutých v rámci jiných projektů při těchto alternativních metodách byly např. použity technologie GoogleEarth, SVG atd. 7) Provést statistickou analýzu časových řad, které jsou prostorově vázané, využít k jejich analýze metody kointegrace, které umožňují odhalit jednak trendy kointegrovaných řad s ohledem na vnitřní korelace mezi jednotlivými řadami. Byly posuzovány možné statistické přístupy k analýze získaných časových řad a vytvořena metodika kointegrace, která byla následně implementována v prostředí MatLab.
Samotné časové řady, které byly k dispozici, zahrnovaly vesměs roční hodnoty za období 1989 2005, tedy sledované časové řady obsahovaly pouze 16 členů a proto jejich délka neumožňovala důsledně využít metody kointegrace, nicméně bylo možné pro zpracování těchto řad použít metodiku založenou na analýze hlavních komponent. Kromě toho byly jednotlivé řady analyzované pomocí regresních modelů, jejich výsledky, predikce a grafické znázornění jsou popsány samostatně v následujících bodech. 8) Provést časoprostorové modelování, vybrat kanonické korelace bloků jednotlivých typů proměnných z různých studovaných oblastí a zaměřit se na jejich časovou dynamiku. Tu použít k predikaci budoucího vývoje a konstrukci predikčních map. Použít při tom techniky prostorové a exploratorní statistiky. Metodika byla založena na faktorové analýze a shlukové analýze (viz [39]), které dávaly o struktuře bloků proměnných lepší představu než metoda založená na kanonických korelacích. Dále byly bloky proměnných analyzovány pomocí metody hlavních komponent. Časová dynamika byla popsána pomocí trendů s využitím regresních modelů a dále pomocí diferenciálních rovnic. Byl vytvořen dynamický model, který umožňuje ve vzájemné provázanosti modelovat prevalenci a mortalitu. Model vycházející z diferenciálních rovnic dává kvalitnější dlouhodobější predikce proti modelu založenému na regresní analýze. Regresní modely bylo možné použít pouze pro krátkodobé predikce a za situace, že variabilita analyzované řady byla malá. Rozhodování o klasifikaci daného bloku proměnných na základě diskriminační funkce je možné též provést pomocí ROC křivek. Byla zpracována metodika posouzení optimálního odhadu ROC křivky pomocí simulací (viz [3]). 9) Provést statistickou analýzu rizikových jevů s ohledem na predikce budoucího vývoje Pozornost byla soustředěna na metody predikce a na hypotézy o budoucím vývoji časových řad obsahujících prevalenci jednotlivých typů nádorových onemocnění. Na základě grafického znázornění jednotlivých časových řad bylo rozhodnuto použít k modelování a predikci lineární regresní model s lineárním nebo kvadratickým trendem. Byly ověřeny hypotézy linearity trendu a podle výsledků testů zvolen příslušný model. Použití regresního modelu bylo odůvodněno též velmi nízkou variabilitou analyzovaných řad kolem trendové funkce. Obr. 9: Ukázka zpracování trendu vývoje vybrané onkologické diagnózy Vzhledem k tomu, že se při analýze časových řad prevalence potvrdily stanovené hypotézy lineárního respektive kvadratického trendu, byly ke statistickému zpracování vybraných zdravotních dat použity metody regresní analýzy. Pomocí bodových i intervalových odhadů byly stanoveny
predikce budoucího vývoje sledovaných řad. Tato metodika byla použita pro většinu časových řad, které byly zpracovávány viz Obr. 9. V oblasti formulování vstupních hypotéz byla pozornost i nadále soustředěna na metody predikce a na hypotézy o budoucím vývoji časových řad obsahujících prevalenci jednotlivých typů nádorových onemocnění. Ve spolupráci s prof. A. G. Nekonečným z Kyjevské státní univerzity byly formulovány nové stochastické modely pro popis dynamiky nádorových onemocnění založené na diferenciálních rovnicích. Pro tyto modely byly zpracovány numerické algoritmy s využitím dostupného software OCTAVE a NOMAD pro řešení diferenciálních rovnic a nalezení optimálního numerického řešení. Příslušný článek byl zaslán do mezinárodního časopisu Волинцький математичний вiсник. Co se týká statistických modelů, byly ke statistickému zpracování vybraných zdravotních dat podle zkušeností z výše uvedené metodiky, použity metody regresní analýzy. Byla dokončena statistická analýza časových řad prevalence nádorů v České republice - viz publikace [1] a [25]. Dále bylo provedeno a graficky interpretováno srovnání mortality, incidence a prevalence u pacientů s vybranými nádorovými onemocněními v ČR. Výsledky byly předneseny na konferenci v zahraničí a publikovány ve sborníku konference [28]. Dále byl rozpracován algoritmus pro konstrukci předpovědí založený a dynamických modelech. Vzhledem k délce použitých časových řad se použití markovských modelů ani autoregresních modelů pro popis a predikci těchto řad neosvědčilo. Bylo provedeno srovnání výše uvedených algoritmů se stávajícími algoritmy založenými na regresní analýze a bylo zkoumáno jejich využití k modelování a prognóze vybraných ukazatelů zdravotního stavu a zdravotní péče. 10) Popularizovat mezinárodně dostupná data s modelovým využitím v pregraduální výuce a přípravě diplomních prací studentů Geografického ústavu Přírodovědecké fakulty MU Brno. Téma využití kartografie pro zdravotnictví, tvorbu map zdravotního stavu a interpretaci zdravotních dat byla využita na Geografickém ústavu Přírodovědecké fakulty MU při zadání a vyhotovení studentských závěrečných prací. V době uzávěrky této zprávy jde o 2 diplomové práce a 4 bakalářské práce, další práce jsou připravovány k obhajobě. Přehled již obhájených prací je v seznamu literatury [39] [44]. Zadání těchto prací zahrnovala jak rešeršní činnost současného stavu, tak návrhy vizualizací zdravotních dat. Kromě toho byla veřejně dostupná zdravotní data použita pro účely tvorby map během výuky a pro samostatné práce studentů. II. Využití technického a přístrojového vybavení pořízeného z grantu Žádné přístrojové vybavení nebylo v průběhu projektu pořízeno. III. Zpráva o průběhu a výsledcích zahraničních cest V roce 2007 byly uskutečněny zahraniční cesty na konference v Německu (Muenster), Rusku (Moskva) a Ukrajinu (Kijev). Na všech konferencích byly předneseny a diskutovány referáty související s problematikou grantového úkolu, a to konkrétně oblast rozvoje kartografických exploračních nástrojů, možnosti mezinárodní spolupráce na problematice mapování dat zdravotního stavu v rámci Mezinárodní kartografické asociace (ICA) a problematika modelování dynamiky nádorových onemocnění pomocí markovských modelů. V roce 2008 byla uskutečněna cesta na konferenci 2008 ESRI Health GIS Conference do Washingtonu, D. C. Účastníkem byl R. Štampach. Prezentovány byly dosavadní výsledky projektu, zejména v oblasti interaktivních prezentačních nástrojů. Zároveň byly zkoumány možnosti vzájemné spolupráce s institucemi USA, například v oblasti poskytnutí a mezinárodního srovnání dat. V programu konference byla přednesena prezentace [37], v níž byly představeny dosavadní výsledky projektu, zejména v oblasti interaktivních prezentačních nástrojů. Dále byly uskutečněny 2 zahraniční cesty na XVIII. letní školu biometriky do Ráčkovy doliny na Slovensku. Cesty se zúčastnil J. Michálek a J. Odehnal. Na služební cestě přednesli společný referát a jeho verzi publikovali v recenzovaném sborníku - viz [28]. J. Michálek též pracoval v programovém výboru této mezinárodní konference. Kromě toho J. Michálek byl na konferenci spoluautorem dalších dvou příspěvků, které byly rovněž publikovány ve sborníku. Velmi užitečný byl
pro oba účastníky konference kontakt se specialisty na modelování dynamiky biologických procesů (V. Witkovský, P. Fľak, S. Mejza) a jejich posouzení dynamiky v rámci grantu studovaných datových souborů. V rámci kongresu AGILE v Gironě se P. Kubíček zúčastnil workshopu zaměřeného na interaktivní kartografickou vizualizaci a v rámci diskuze prezentoval stávající výsledky projektu. M. Konečný dále propagoval výsledky projektu na konferenci o evropské geoinformační infrastruktuře Inspire (Slovinsko) a za využití publikací [1] a [37] také v rámci přednáškových pobytů v Rakousku. V roce 2009 se R. Štampach společně s M. Konečným zúčastnili ICA Symposium on Cartography for Central and Eastern Europe ve Vídni. Byly zde prezentovány výsledky projektu, příspěvek byl publikován jednak v rámci konferenčních materiálů a následně po úpravě jako kapitola v recenzované monografii [2]. M. Konečný dále prezentoval vytvořené metodické postupy a nástroje v rámci služebních cest v Nizozemí (GSDI 2009, Rotterdam), Maďarsku (Eotvos University, Budapešť a na Slovensku (Komenského univerzita, Bratislava). J. Michálek se v roce 2009 zúčastnil mezinárodní konference: Problems of decision making under uncertainties PDMU 2009, pořadatel Taras Shevchenko National University of Kyiv v Skhidnytsia, Ukrajina v době 27. 30. 4. 2009. Byl členem organizačního výboru a přednesl příspěvek [38]. V příspěvku [38] byla užita v grantu rozvíjená vizualizační mapová technika ke konstrukci map popisujících konkurenceschopnost regionů EU. Při tom vizualizované proměnné byly počítány faktorovou analýzou na základě klasifikace provedené pomocí shlukové analýzy. IV. Seznam publikací, sdělení, přednášek, zpráv a dalších dílčích výsledků řešení grantového projektu monografie nebo kapitoly v monografiích: 1) Prevalence nádorů v České republice 1989-2005-2015. Konečný M., Geryk E., Kubíček P., Štampach R., Kozel J., Stachoň Z., Michálek J., Odehnal J., Dítě P., Koška P., Kraus R., Holub J. 1. vyd. Brno : Přírodovědecká fakulta Masarykovy Univerzity, Brno a Občanské sdružení podpory zdraví a onkologické prevence, 2008. 69 s. ISBN 978-80-903255-2-4 2) Dynamic cartographic methods for visualisation of health statistics Stampach R., Konecny M., Kubicek P., Geryk E. In Cartography in Central and Eastern Europe. Berlin-Heidelberg : Springer, 2010. s. 431-442, 12 s. Lecture Notes in Geoinformation and Cartography. ISBN 978-3-642-03293-6. impaktované časopisy: 3) A Comparison of the ROC Curve Estimators by Simulations Michálek J., Veselý V. Přijato do časopisu Cybernetics and System Analysis N. 2, 2010, ISSN: 1060-0396 recenzované časopisy: 4) Prevalence nádorů v České republice - časové a prostorové rozložení. Geryk E., Kubíček P., Konečný M., Koška P., Holub J., Odehnal J., Štampach R. Zdravotnictví v ČR, 2007, 3, 10, s. 94-100. ISSN 1213-6050 5) Vícečetné zhoubné novotvary: Ukazatel zdraví a nákladů péče v onkologii. Geryk E., Bendová M., Kubíček P., Štampach R., Odehnal J., Koška P., Holub J., Konečný M. Zdravotnictví v ČR, Praha: Asoc. pro rozv. soc. lék. a řízení péče, 2008, 2, s. 50-55,6 s. ISSN 1213-6050. 6) Karcinom prsu a následné primární zhoubné novotvary v České republice 1976-2005. Geryk E., Bendová, M., Kozel J.
Onkologie, 2009, 3, 1, s. 54-61. ISSN 1802-4475 7) Následné primární novotvary u 125 262 onkologicky nemocných v ČR 1976-2005. Geryk E., Dítě P., Pešek M., Kozel J. Onkologie, 2009, 3, 3, s. 181-189. ISSN 1802-4475 8) Nádory jako (ne)snesitelná lehkost bytí. Geryk E., Dítě P., Odehnal J. Zdravotnictví v ČR, 2009, 12, 4, s. 134-137. ISSN 1213-6050 9) Trend vícečetných nemelanomových nádorů kůže z pohledu jejich epidemiologie. Geryk E., Dítě P., Sedláková L.., Kozel J., Koška P. Dermatogie pro praxi, 1, 2010 v tisku. ISSN 1802-2960 10) Vícečetné nádory gastrointestinálního traktu v ČR 1976-2005. Geryk E., Dítě P., Kozel J., Štampach R., Kubíček P. Čes. Slov. Gastroenterol. Hepatol., 2010, 64, 1, s. 131-142.. ISSN 1213-323X 11) Trend vícečetných zhoubných melanomů kůže u české populace. Geryk E., Dítě P., Sedláková L., Kozel J., Krajsová I., Kubíček P., Štampach R. Česko-slovenská dermatologie, 4, 2010 v tisku. ISSN 0009-0514 další časopisy: 12) Epidemiologie maligních lymfomů v ČR. Geryk E., Odehnal J., Kubíček P., Holub J., Michálek J. Farmakoterapie, Praha : Farmakon Press, spol. s.r.o., 2007, 2, (Supplementum) od s. 6-11, 6 s. ISSN 1801-7509. 13) Metody kartografické vizualizace dat zdravotního stavu obyvatelstva. Kubíček P. Štampach R. Geryk E. Miscellanea Geographica, Plzeň : Západočeská univerzita v Plzni, 14, 1, od s. 91-98, 174 s. ISSN 1213-7901. 2008. 14) Časoprostorová distribuce vývoje karcinomů kolorekta v ČR. Geryk E., Dítě P., Koška P. Odehnal J. Štampach R. Kubíček P., Holub J. Onkologie, Olomouc : Solen s.r.o., 2008, 1, od s. 29-32, 4 s. ISSN 1802-4475.. sborníky, přednášky, postery a ostatní: 15) Snad dožijeme do jari. Geryk, E., Dostál J., Vízek J. Medicína a umění, 2009, 5, 8, s. 28-29. 16) Epidemiologie non-hodgkinského lymfomu v ČR. Geryk E., Odehnal J., Kubíček P., Holub J. Přednáška. XIV. Jihočeské onkologické dny, Č. Krumlov 11.-13.10. 2007 17) Časové a prostorové rozložení nemocných s maligními lymfomy v ČR v letech 1989-2004. Geryk E., Odehnal J., Štampach R., Kozel J., Kubíček P., Michálek J., Holub J. Poster XIV. Jihočeské onkologické dny, Č. Krumlov 11.-13.10. 2007 18) Časoprostorová distribuce žijících s nádory respiračního traktu v ČR v letech 1989-2015 Geryk E., Koška P., Odehnal J., Štampach R., Kubíček P., Konečný M., Michálek J., Holub J. In Sborník XV. Západočeské pneumoonkologické dny, 8.-9.11. 2007, s. 25, ISBN 987-80-7177-003-9.
19) Vývoj prevalence karcinomů plic a hrtanu v krajích ČR Geryk E., Odehnal J,, Štampach R., Kubíček P., Konečný M., Michálek J., Holub J. In Sborník XV. Západočeské pneumoonkologické dny, 8.-9.11. 2007, s. 38-40, ISBN 987-80-7177-003-9. 20) Support of cancer analysis by the time and space modeling in the Czech Republic. Odehnal J., Michálek J., Ivanov T., Geryk E. In Book of Abstracts, TIES 2007. Mikulov. ISBN 978-80-210-4333-6, s. 87. 16. 20. 8. 2007 Mikulov 21) Vývoj prevalence a incidence cévní mozkové příhody dg. I60-I69 v letech 2000-2003. Rozbor pro Odbor zdravotnictví KÚ Brno, 2.7. 2007. 22) Vývoj prevalence nádorů prsu a rodidel v ČR. Geryk E., Kubíček P., Koška P., Konečný M., Odehnal J., Štampach R., Doležal V., Holub J. In Sborník XIII. konfer. Onkologie v gynekologii a mammologii, Brno, 17.-19.1. 2008, s. 9, ISBN 978-80-87086-00-1. 23) Vícečetné zhoubné novotvary. Geryk E., Štampach R., Odehnal J., Bendová M., Kubíček P., Holub J., Koška P. In Sborník XIII. dny prof. Vl. Staška Praha, 28.-29.3. 2008, s. 90-92, ISBN 978-80-254-1284-8. 24) Epidemiology of gastrointestinal cancers. Geryk E., Dítě P., Konečný M. Přednáška na Gastrosymposium Tallinn, May 9-10, 2008 25) Epidemiologický vývoj nádorů ledvin a močového měchýře v ČR. Geryk E., Kubíček P., Štampach R., Konečný M., Michálek J., Odehnal J., Holub J. In Sborník XV. Jihočeské onkologické dny, Č. Krumlov, 9-11.10. 2008, s. 55-59, ISBN 978-80-254-2729-3. 26) Co vypovídají údaje o zhoubných onemocněních. Geryk E. Přednáška na Mezinár. onkol. konference, Znojmo, 21.-22.11. 2008 27) Nádory plic a další malignity. Geryk E., Kozel J., Kubíček P., Štampach R., Konečný M., Odehnal J. In Sborník XVI. Západočeské pneumoonkol. dny, Břasy 13,-14.11. 2008, s. 68, ISBN 978-80-7177-010-7. 28) Srovnáni mortality, incidence a prevalence pacientů s vybranými nádorovými onemocněními v ČR. Geryk E., Odehnal J., Michálek J. In Zborník referátov XVIII. Letná škola biometriky. Biometrické metódy a modely v podohodspodarskej vede, výskume a výučbe. Editor Pavel Fľak. Ráčkova Dolina, 23.-27. 6. 2008, str. 111 118. ISBN 978-80-89162-31-4, EAN 9788089162314 29) Vícečetné primární nádory prsů. Geryk E., Bendová M. In Sborník 14. konference Onkologie v gynekologii a mammologii, 9.1. 2009 Brno, s. 59, ISBN 978-80-87086-10-0. 30) Primární nádory následující po prvních zhoubných novotvarech. Geryk E., Dítě P., Bendová M., Kozel J., Štampach R., Kubíček P., Holub J.
In Sborník konference 14. dny prof. V. Staška, 27.- 28.3. 2009 Praha s. 68. ISBN 978-80-87339-00-8. 31) Podpora kartografie časového a prostorového rozložení vícečetných novotvarů. Geryk E., Kubíček P., Kozel J., Štampach R., Konečný M., Dítě P., Koška P., Pešek M., Holub J. In Sborník II. kongresu Geoinformační infrastruktury pro praxi 27.- 28. 5. 2009 Brno 32) Časové a prostorové zastoupení vícečetných nádorů gastrointestina v ČR 1976-2005. Geryk E., Dítě P., Kozel J., Štampach R., Kubíček P. In Sborník XXXI. Slovensko-český gastroenterologický kongres 11.-13.6. 2009 Ružomberok 33) Dynamic Cartographic Methods for Visualization of Health Statistics Stampach R., Konecny M., Kubicek P., Geryk E. In ICA Symposium on Cartography for Central and Eastern Europe Proceedings. Vienna : Vienna University of Technology, 2009. od s. 867-878, 12 s. 34) Využití kartografie pro prezentaci dat o zdravotním stavu obyvatelstva. Štampach R., Kubíček P., Kozel J., Geryk, E. In Geomatika v projektech 2009. první. Brno : Tribun EU s. r. o., 2009. od s. 42-44, 3 s. ISBN 978-80- 7399-842-4. 35) Návrh portálu pro vizualizaci dat zdravotního stavu obyvatelstva Stachoň Z., Kubíček P., Konečný M., Pavelka J., Geryk E. In Geomatika v projektech 2009. první. Brno : Tribun EU s. r. o., 2009. od s. 45-47, 3 s. ISBN 978-80- 7399-842-4. 36) Epidemiologie karcinomů GIT v ČR. Geryk E., Dítě P. Přednáška. Mezinárodní seminář gastroonkologů, Kaprun, Rakousko, 29.3.-1.4. 2007 37) Dynamic Cartographic Methods for Visualization of Health Statistics Stampach R., Konecny M., Kubicek P., Geryk E. Přednáška. ESRI Health GIS Conference Proceedings 2008, Washington D. C., September 28 - October 1 2008 [on-line] URL: http://gis.esri.com/library/userconf/health08/docs/monday/dynamic_carto.pdf 38) Application of Multivariate Classification Techniques to Assessment of Competitiveness of Chosen European Union Regions. Odehnal J., Michálek J. In Problems of decision making under uncertainties. 2009. vyd. Kyjev : Taras Schevchenko National University, 2009. 1 s. Abstrakt str.32 Závěrečné práce studentů napojené na projekt Medicarto: 39) Koncepce vybraných tematických map zdravotního stavu a zdravotní péče v ČR: výhledové trendy a jejich interpretace Souček J. Brno, 2009, 117 s., Magisterská práce na Geografickém ústavu PřF MU 40) Koncepce vybraných tematických map zdravotního stavu a zdravotní péče v ČR: analýza a interpretace současného stavu Hrejsemnou O. Brno, 2009. 75 s., Magisterská práce na Geografickém ústavu PřF MU 41) Mapy pro zdravotnictví: analýza, klasifikace, koncepce. Nováček J.
MU, Brno, 2007, 54 s., Bakalářská práce na Geografickém ústavu PřF MU 42) Možnosti geovizualizace dat zdravotního stavu obyvatelstva. Totůšek M. MU, Brno, 2008, 51 s., Bakalářská práce na Geografickém ústavu PřF MU 43) Specifika vizualizace zdravotnických dat. Horáčková L. MU, Brno, 2009, 55 s., Bakalářská práce na Geografickém ústavu PřF MU 44) Kartografická vizualizace zdravotního stavu obyvatelstva pomocí interaktivních map. Svoboda, J. MU, Brno, 2009, 46 s., Bakalářská práce na Geografickém ústavu PřF MU