Rozpis položek pro Rozvojový projekt Rozvoj přístrojového vybavení, 2011

Rozpis položek pro Rozvojový projekt Rozvoj přístrojového vybavení, 2011 Přírodovědecká fakulta, celková částka 15 479 000,- Kč Investice: 1 x serverové zázemí - investiční celek (1 x rack 19'', 1 x UPS 3000VA, 1 x switch - jednoduchý) Garantuje katedra KMI 120 tis. Kč 1 x diskové pole NAS (6 TB) s předinstalovaným OS, s podporou Active Directory Obnova HW pro studentské domovské adresáře, kde serverové zázemí poskytuje základní infrastrukturu a speciální diskové pole neslouží jenom jako úložiště dat, ale také jako domovský server pro studentské účty a studentská data, která se týkají výuky. Garantuje katedra KMI 200 tis. Kč 2 x UPS 5000VA Obnovení a doplnění záložních zdrojů u existujících serverů využívaných ve výuce. Garantuje katedra KMI 120 tis. Kč 1 x switch - gigabitový Zvýšení výkonu sítě na jedné počítačové učebně s 18 PC a kanceláře vyučujících - stávající stav 100 Mb, cílový 1 Gb. Typ a parametry switche konzultovány s CVT. Garantuje katedra KMI 120 tis. Kč 1 x diskové pole Pro kompletní zálohy studentských a učitelských dat potřebných pro výuku. Garantuje katedra KMI 100 tis. Kč 1 x server Středně výkonný server zejména pro podporu výuky některých předmětů (Bioinformatika, Moderní webové technologie, Multimediální systémy, Bezpečnost počítačových sítí, Objektově orientované technologie, Logické programování a Správa počítačové sítě) v nově akreditovaném magisterském studiu. Garantuje katedra KMI 79 tis. Kč 13 x PC učebna 5.070 Obnova počítačové učebny - 12x studentské PC, 1x učitelské PC. Každé PC za 40.000,- Kč (kompletní sestava včetně monitoru, klávesnice a myši). Garantuje katedra KMI 520 tis. Kč

Spektrograf pro UV, CCD kamera a polarizační komponenty pro ROA spektroskopii Zařízení bude sloužit pro vědecko pedagogickou práci v nově rozvíjeném směru spektroskopie. Jedno z hlavních zaměření je hledání možností efektivnějšího sběru rozptýleného Ramanova záření inovace v oblasti Ramanovy optické aktivity, které nacházejí velké uplatnění při zkoumání struktury biologicky zajímavých látek, například nukleových kyselin a proteinů. V těchto oblastech plánujeme spolupráci s v rámci Univerzity Palackého (spolupráce s Katedrou farmakologie) i dalšími univerzitními pracovišti. Zařízení bude sloužit pro bakalářské a diplomové práce studentů a bude využíváno pro zapojení studentů v rámci specifického výzkumu. Aparatura nebo její části bude využitelná jako výuková pomůcka pro studeny magisterského kurzu Optika a optoelektronika v rámci předmětů OPT/KVTM Kvantová teorie molekul, OPT/OP Optické přístroje, OPT/OK Optika krystalů, OPT / PGSKO Krystaly v optoelektronice, OPT / OZ Optické zobrazování v nichž bude možno prakticky demonstrovat: polarizační stavy záření a možnosti jejich generace (polarizátory, retardační desky, elektro-optický modulátor, Faradayův isolátor atd.), interakce záření s hmotou, rozptyl záření, vibrační spektroskopie molekul, optická aktivita, chirální látky, využití laserů, návrh a konstrukce spektroskopických optických sestav s velkou numerickou aperturou, detekce záření pomocí CCD detektorů. Garantuje katedra OPT 1700 tis. Kč Laser pro UV oblast (laserové diody s jednofrekvenčním výstupem a generátory UV Toptica ) Zařízení bude sloužit jako zdroj pro spektroskopii v UV oblasti. Mimo vědecko pedagogické spolupráce, týkající se jak měření velmi zajímavých resonančně zesílených spekter nukleových kyselin a proteinů, tak i výstavbě spektroskopického zařízení, které bude potenciálně komerčně uplatnitelné, bude laser sloužit pro bakalářské a diplomové práce studentů a bude využíván pro zapojení studentů v rámci specifického výzkumu. Jako výuková pomůcka bude využíváno pro studeny magisterského kurzu Optika a optoelektronika v rámci předmětů: OPT/P2 Fyzikální praktikum, OPT/OMM Optická měření, OPT / SO Svazková optika, OPT / LT Laserová technika, OPT/APLA Aplikace laserů. Garantuje katedra OPT 2200 tis. Kč Optický mikroskop Olympus BX51 včetně doplňků Jedná se o univerální typ mikroskopu, který umožňuje pozorování ve světlém i tmavém poli a pozorování Nomarského DIC metodou. Mikroskop je doplněn zdrojem pro fluorescenci. Díky univerzálnosti a variabilitě systému bude možné mikroskop efektivně využívat ve výuce. V předmětech oborů Optika a optoelektronika a Přístrojová optika zaměřených na optické zobrazování (OPT/OZ a OPT/OPZ) mikroskop umožní praktickou demonstraci základních technik mikroskopového pozorování. Pro praktickou činnost studentů bude mikroskop využíván také v předmětu Optické přístroje OPT/OP. Zakoupení moderního mikroskopu firmy Olympus významně rozšíří možnosti badatelské činnosti studentů při zpracování bakalářských a diplomových prací. Mikroskop bude využíván i pro testování nových zobrazovacích metod: metody spirálního fázového kontrastu a metodu Fresnelovské nekoherentní korelační holografie. Garantuje katedra OPT 1100 tis. Kč

Kapalinový chromatograf Kapalinový chromatograf. bude využíván v sestavě LC/MS, kde bude sloužit jako separátor látek analyzovaných poté v připojeném hmotnostním spektrometru LCQ Fleet Thermo Scientific. Zařízení se uplatní mimo jiné ve cvičení z hmotnostní spektrometrie v rámci předmětu Metody studia anorganických látek (AFC/MSAL) a pro chemickou analýzu látek syntetizovaných ve cvičeních z anorganické chemie. Garantuje katedra AGCH 1 045 tis. Kč Fluorimetr PC1 Fluorimetr PC1 (Photon Counting Spectrofluorimeter) bude sloužit k měření steadystate fluorescence, excitačních a emisních spekter, excitačně-emisních spekter, excitačních polarizačních spekter, polarizační (anizotropní) měření při fixních vlnových délkách, milisekundové kinetické měření v photon couting modu a měření poměru excitace nebo emise při dvou vlnových délkách. Přístroj umožní studentům prakticky se seznámit s technikami využívanými ve fluorescenční spektroskopii a přispěje tak k rozvoji praktických znalostí a dovedností v této oblasti. Vybrané aplikace budou zařazeny do výuky KFC/POK1, KFC/POK2 (Pokročilé cvičení z fyzikální chemie 1 a 2). Přístroj najde uplatnění i v semináři KFC/SVSM (Seminář z vybraných spektrálních metod). Garantuje katedra KFC 1 385 tis. Kč Modulární elektrochemický analyzátor Modulární přístroj umožňuje volbu několika režimů elektrochemických (zejména coulometrických, voltametrickcých a potenciometrických) měření. Zařízení bude používáno pro potřeby výuky studentů v laboratorních cvičeních z instrumentálních metod ve 3. roč. bakalářských studijních oborů (ACH/CHI a ACH/IMC) a v 1. ročníku navazujících magisterských programů (ACH/PAC). Tento moderní systém patří ke standardnímu vybavení průmyslových i výzkumných laboratoří a je proto žádoucí, aby se s ním studenti seznámili v praktické výuce již na škole. Zařízení výrazně přispěje k modernizaci výuky a k zvýšení uplatnitelnosti absolventů v praxi. Garantuje katedra ACH 950 tis. Kč DNA/RNA synthetiser DNA/RNA synthetiser bude využit pro syntézu DNA a RNA oligonukleotidů požadované sekvence, zejména pak oligonukleotidů modifikovaných vhodnou značkou pro identifikaci nukleových kyselin v biologickém materiálu nebo jinou nízkomolekulární látkou sloužící ke sledování biologických pochodů spojených s nukleovými kyselinami. S využitím syntetizátoru budou zavedeny nové praktické úlohy komplexního charakteru zaměřené na syntézu a studium biologických vlastností modifikovaných oligonukleotidů. Přístroj bude využíván v předmětech Cvičení z bioorganické chemie (OCH/POC) a Pokročilé laboratorní cvičení z organické chemie (OCH/POCX), kde budou studenti s tímto syntetizátorem přímo pracovat a v navazujících úlohách pak využívat připravených produktů pro další aplikace. Garantuje katedra OCH 650 tis. Kč Systém pro purifikaci proteinů

Katedra biochemie PřF UP se věnuje již řadu let studiu vlastností enzymů. Enzymy se z biologického materiálu získávají převážně chromatografickou purifikací. V současné době jsou na pracovišti k dispozici tři přístroje, jeden je umístěn na Oddělení molekulární biologie (stáří 13 let), další dva na kmenovém pracovišti byly sestaveny stavebnicově z dílů, jejichž stáří je zhruba 15-20 let. Jeden z těchto přístrojů bychom rádi nahradili novou, počítačem řízenou sestavou. Využití ve výuce bude následující: výuka laboratorního cvičení KBC/EMB v 1. ročníku navazujícího studia, dále bakalářské, diplomové a disertační práce studentů. Garantuje katedra KBC Systém se skládá z následujících částí: Nízkotlaký kapalinový chromatograf pro purifikaci proteinů 350 tis. Kč Stolní centrifuga 250 tis. Kč Spektrofotometr Lightwave II, UV/Vis 150 tis. Kč Hmotnostní spektrometr upgrade 140 tis. Kč Krystalizační box pro proteiny Krystalizační box pro proteiny bude využíván studenty magisterského a doktorského studia biochemie pro krystalizaci proteinů za účelem analýzy prostorové struktury metodou rentgenové difrakce (spolupráce se zahraničními pracovišti ve Versailles a Grenoble, Francie). Centrifuga je standardním a nezbytným pomocným zařízením při purifikaci proteinů. Spektrofotometr a upgrade hmotnostního spektrometru pomohou zlepšit možnosti analýzy sledovaných proteinů. Garantuje katedra KBC 80 tis. Kč Kyveta Tray cell Helma Kyveta je účelný upgrade současného přístroje Biophotometer 6131. Kyveta usnadní měření koncentrací a čistoty DNA, RNA a proteinů v malých objemech (μl) a zrychlí práci. Kyveta bude využita nejen pro výzkumné aktivity ale výrazně přispěje k řešení bakalářských, diplomových a doktorandských prací řešených na Katedře botaniky. Rovněž bude práce s kyvetou zahrnuta v předmětu Molekulární markery ve šlechtění rostlin (BOT/MMSR). Garantuje katedra BOT 90 tis. Kč XP Thermal Cycler Přístroj bude využíván na PCR amplifikaci specifických úseků DNA v rámci výzkumných aktivit pracoviště a v rámci bakalářských, diplomových a doktorandských prací. Práce s přístrojem bude nedílnou součástí předmětu Molekulární markery ve šlechtění rostlin (BOT/MMSR). Garantuje katedra BOT 108 tis. Kč Bench Top Steam Autoclave, horizontal, 40l Autokláv bude využíván pro sterilizaci roztoků, kultivačních médií a nástrojů pro výuku Molekulární markery ve šlechtění rostlin (BOT/MMSR), Molekulární biosystematika (BOT/MBS) a Explantátové kultury (BOT/TEKSB), pro studentské práce a výzkum. Garantuje katedra BOT 128 tis. Kč

Laminární flow-box pro práci s buněčnými kulturami V rámci inovace praktických cvičení z Buněčné biologie II byly zavedeny nové úlohy a plánujeme zavedení nových úloh. Tyto dnes zahrnují hodnocení cytotoxicity in vitro v nádorových buněčných liniích a do budoucna budou zahrnovat techniky transfekce nádorových linií vektory DNA. Pro práci s buněčnými kulturami je třeba sterilních podmínek laminární flow box, a inkubace buněčných kultur inkubátor. Doposud tyto činnosti byly realizovány na přístrojích pracovní skupiny prof. Dvořáka, což se ukazuje jako organizačně kolizní řešení. Z tohoto důvodu požadujeme zakoupení přístrojů, umožňujících práci s buněčnými kulturami in vitro. Garantuje katedra KBBG 250 tis. Kč Inkubátor CO 2 na buněčné kultury. Přístroj slouží k inkubaci buněčných kultur v rámci praktických cvičení z Buněčné biologie II. Garantuje katedra KBBG 145 tis. Kč Mikrovlnné mineralizační zařízení SW-2 fy Berghof Zařízení bude použito jako náhrada dříve užívaného obdobného zařízení Plazmatronika, které je již mimo provoz. Mineralizační zařízení je určeno pro předúpravu vzorků při stanovení makroprvků i mikroprvků. Hlavní využití je při výuce předmětů Monitoring, Pedologie, Toxikologie a při analýzách vzorků studenty pro bakalářská a diplomové práce. Garantuje katedra EKO 350 tis. Kč Kamera Sony Kamera bude využita pro dokumentaci výzkumu, přípravu přednášek a seminářů ve výuce a prezentačních snímků na konferencích. Garantuje katedra ZOO 120 tis. Kč Modulární set voliér s automatickým krmicím a napájecím zařízením Voliéry slouží pro experimentální chovy ptáků zvláště pro výuku předmětů garantovaných katedrou zoologie. Garantuje katedra ZOO 140 tis. Kč Thermomixer comfort-10-09-025-mr (EPPENDORF) Programovatelný termomixer s vestavěným Peltier chlazením. Dvoustupňové programy teploty od cca 13 C pod teplotou okolí do 99 C. Výměnné pracovní bloky pro nádobky 0,5 ml-50 ml, pro mikrotitrační destičky a PCR destičky ( 8x12 jamek 0,2ml). Velmi důležitý ve všech biologicky orientovaných cvičeních využívající PCR. Garantuje LRR 80 tis. Kč Analytické váhy XP26/M (Mettler) s výstupem Analytické váhy jsou základním vybavením každé laboratoře. LRR vybudovala novou laboratoř pro cvičení nově akreditovaného oboru Experimentální biologie, která není zatím vybavena základním zařízením pro realizaci cvičení. Garantuje LRR 320 tis. Kč

Barevná tiskárna A3 Pro potřeby podpory doktorandského studia a dovybavení společné počítačové laboratoře kvalitní síťovou tiskárnou. Tiskárna bude splňovat nároky barevného síťového tisku, síťového skenování dokumentů a kopírovacího stroje do velikosti A3. Výběr značky bude podléhat standardnímu výběrovému řízení. Garantuje katedra MRS 90 tis. Kč 11 ks mobilní dokovatelná počítačová sestava notebook (včetně externího monitoru, klávesnice a myši) Pro realizaci praktických výzkumů na katedře rozvojových studií a katedře geografie je nezbytné vybavení mobilní počítačové techniky s dostatečnou kapacitou baterií a také reprografické/xerografické zařízení pro tvorbu výzkumných a didaktických materiálů (dotazníky) využívajících během terénního šetření. Z prostředků projektu bude financován nákup 11 pracovních sestav složených z notebooků, doků na připojení v laboratoři včetně externího příslušenství (monitor, klávesnice a myš). Tento způsob je ideální pro výuku v interiéru (souprava notebook v doku, monitor, klávesnice a myš) i v exteriérech (realizace terénních šetření notebook). Garantují katedry MRS a KGG 440 tis. Kč Sestava mobilní videokonference Polycom řady HDX7000 Videokonferenční set v mobilním provedení rozšíří možnosti videokonferenčních přenosů pro potřeby podpory externí výuky i výuky pro více studentů najednou (dvě učebny). Mobilita zajišťuje možnost výběru výukové místnosti včetně externích pracovišť a přenosu vybraných aktivit z praxe do výuky. Garantuje katedra KGG 250 tis. Kč Čelisťový drtič hornin RETSCH BB51 Přístroj bude sloužit pro hrubé dělení pevných hornin v přípravně vzorků na katedře geologie pro účely geochemických, spektrofotometrických a gamaspektrometrických analýz práškových vzorků. Přístroj bude využit v kombinaci se stávajícím kulovým mlýnem pro účely řešení závěrečných prací studentů a přípravu studijních vzorků do specializovaných předmětů (metody laboratorního výzkumu KGE/MLV). Garantuje katedra KGE 340 tis. Kč 4 sekce multielektrodového kabelu s 32 inteligentními elektrodami pro geoelektricky system ARES (GF Instruments) Přístroj bude sloužit k rozšíření možnosti měření geoelektrickým systémem ARES, který studenti již využívají k řešení závěrečných prací a ve výuce specializovaných předmětů a umožní efektivnější a přesnější geofyzikální měření a větší hloubkový dosah metody. Garantuje katedra KGE 160 tis. Kč Zařízení RED

Eye tracking je technologie založená na využití oční kamery pro uživatelské testování vizualizací (map, obrázků, grafiky, apod.). Zařízení je určeno pro sledování pohybu očí na předloze analogové mapě, monitoru, výstupu dataprojektoru, apod. Hlavní výhoda je, že zařízení nejen zachycuje pohyb pohledu uživatele, ale zaznamenává také posloupnost prohlížení předloh, délku pohledu na určitý bod nebo i kliknutí myši (např. v interaktivní mapě), které jsou podrobně zobrazeny na výstupu. Výstupní data lze kategorizovat podle jednotlivých profilů a tím například zjistit, co upoutalo muže a co ženy, jaké jsou rozdíly mezi věkovými kategoriemi nebo mezi různě zkušenými uživateli. Zařízení bude využito jak pro výuku klíčových předmětů Katedry geoinformatiky (Geografická kartografie, Počítačová kartografie, Geoinformatika, GIS), tak i pro řešení bakalářských, diplomových a disertačních prácí studentů Katedry geoinformatiky. Zařízení má obrovský potenciál v další vědecko-výzkumné činnosti a v získávání potenciálních projektů či grantů. Zařízení je v současné době provozováno na univerzitách v západní Evropě a USA, na území ČR se bude jednat o unikátní zařízení. Garantuje katedra KGI 500 tis. Kč Investice - software 1x LISPWORKS - multilicence Multilicence (1 investiční celek) software pro výuku programovacích předmětů: Programování v Common Lispu, Paradigmata programování 2, Paradigmata programování 3, Evoluční výpočetní techniky a Paralelní programování. Nyní používané bezplatné verze LISPWORKS jsou pro studenty i vyučují velmi omezující v srovnání s komerční verzi. Garantuje katedra KMI 220 tis. Kč Software Sequencher for Windows Software je užitečným nástrojem pro analýzu a zpracování DNA sekvencí, které jsou získávány v rámci výzkumných aktivit pracoviště a v rámci bakalářských, diplomových a doktorandských prací. Práce se softwarem bude zahrnuta v předmětech Molekulární markery ve šlechtění rostlin (BOT/MMSR) a Molekulární biosystematika (BOT/MBS). Garantuje katedra BOT 68 tis. Kč Sigma-plot, grafický software Software slouží pro zpracování dat pracovníků a studentů magisterských a doktorských studijních oborů. Garantuje katedra ZOO 140 tis. Kč STATA Statistický software cíleně vybraný s ohledem na spolupráci se zahraničními pracovišti a na využívání dat a specifických aplikací Světové banky (World Bank). Software je řešen formou licencí pro potřeby výuky v počítačové učebně. Garantuje katedra MRS 80 tis. Kč

Multilicence ArcGIS ArcInfo s extenzemi Akademická multilicence softwaru ArcGIS pro potřeby výuky z důvodu ukončení celouniverzitní akademické licence. Licence v sobě zahrnuje základní modul ArcInfo a vybrané extenze potřebné pro specifické analytické funkce ArcGIS. Multilicence je limitovaná počtem 31 aktivních připojení. Licence budou v následujících letech udržovány formou placené maintenance služby z provozu katedry geografie. Přehled extenzí: Plná licence (31) ArcGIS 3D Analyst, Spatial Analyst, Network Analyst, Ostatní licence (1) ArcGIS Publisher, Data Interoperability, Schematics, Survey Analyst, Tracking Analyst, ArcScan, Maplex, Workflow Manager Garantuje katedra KGG 140 tis. Kč Neinvestice Laserový dálkoměr DISTO D8 Přístroj umožňuje rychlé zjišťování vzdáleností v terénu a bude využit studenty bakalářských, magisterských a doktorských programů v terénní výuce (cvičeních z populační ekologie EKO/EKPOP a EKO/TEPO). Garantuje katedra EKO 18 tis. Kč Dalekohled Bushnell Noční vidění Power Plus 1.5 x 54 Dalekohled umožňuje noční vidění. Bude využit studenty doktorských programů pro pozorování savců s noční aktivitou. Garantuje katedra EKO 30 tis. Kč Garmin Oregon 550t Pro Přístroj pro terénní navigaci. Bude sloužit ve výuce bakalářských a magisterských programů (cvičeních z populační ekologie EKO/EKPOP, EKO/TEPO). Garantuje katedra EKO 13 tis. Kč