Metody studia historie populací. Metody studia historie populací. 1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky.

Podobné dokumenty
Metody studia historie populací. Metody studia historie populací

Genetický polymorfismus

Mgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita

Imunogenetika imunologie. imunity imunitních reakcí antigenů protilátek. imunogenetika. erytrocytárních antigenů histokompatibilitních antigenů

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

Genetická variabilita v populacích. Genetická variabilita v populacích. Populace. Populace. - je nástrojem studia popula ní (evolu ní) genetiky

Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin

Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden ( )

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Názory na bankovní úvěry

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Genetická diverzita masného skotu v ČR

Využití genetické rozmanitosti při identifikaci člověka

Paleogenetika člověka

Crossing-over. over. synaptonemální komplex

Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK

Výukový materiál zpracovaný v rámci projektu Výuka modern

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů

Mendelova genetika v příkladech. Genetické markery

Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK

Genetické markery - princip a využití

3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

polymorfní = vícetvarý, mnohotvárný

Genetické markery, markery DNA

Genetická variabilita v populacích

PRINCIPY ŠLECHTĚNÍ KONÍ

ší šířen VAZEBNÁ ANALÝZA Vazba genů

Metody studia historie populací

DUM 07 téma: P edepisování tolerancí

Genetický polymorfismus

Genotypy absolutní frekvence relativní frekvence

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

Investice a akvizice

Polymorfimus DNA, kdy se jedinci nebo druhy liší v jedné nukleotidové záměně

Genetika populací. Genetika populací. Doposud genetika na úrovni bu ky, organizmu

Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA DNA. PCR polymerase chain reaction. Princip PCR PRINCIP METODY PCR

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST

Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.

EUROSTUDENT V ZPRÁVA Z MEZINÁRODNÍHO SROVNÁNÍ PODMÍNEK STUDENTŮ VYSOKÝCH ŠKOL V ČESKÉ REPUBLICE

Genetické markery. pro masnou produkci. Mgr. Jan Říha. Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o.

HRMARKETING. Chytrý nábor Chytré firmy hledají zam stnance chyt e. v roce 20. nejlepších Chytrých rad

Genetické mapování. v přírodních populacích i v laboratoři

Náležitosti nutné k zahájení znaleckých úkonů

Genotypování markerů užitkovosti a zdraví u skotu

VLÁDA ČESKÉ REPUBLIKY. Příloha k usnesení vlády ze dne 13. února 2013 č Stanovisko

LED svítidla - nové trendy ve světelných zdrojích

Referenční lidský genom. Rozdíly v genomové DNA v lidské populaci. Odchylky od referenčního genomu. Referenční lidský genom.

Charakteristika vyučovacího předmětu Prvouka ŠVP LMP

VYHLÁŠKA ČÁST PRVNÍ STÁTNÍ ZKOUŠKY Z GRAFICKÝCH DISCIPLÍN. Předmět úpravy

Jaké možné scénáře konce světa nabízejí jeho předpovídači a jsou tyto hrozby reálné?

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

Genetika kvantitativních znaků. - principy, vlastnosti a aplikace statistiky


průřez.téma + ročník obsah předmětu školní výstupy poznámky MP vazby EVV - ekosystémy EVV odpady a hospodaření s odpady EVV - náš životní styl

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy

Centrum pro vzdělávání pracovníků ve veřejné správě Alfa eduka s.r.o.

Analýza rizik (01) Základní pojmy a definice

Člověk a příroda - Přírodopis - 9. ročník. POZNÁMKY (průřezová témata, mezipředmětové vztahy) PŘEDMĚTOVÉ KOMPETENCE OČEKÁVANÉ VÝSTUPY UČIVO

58/2016 Sb. VYHLÁKA ČÁST PRVNÍ STÁTNÍ ZKOUKY Z GRAFICKÝCH DISCIPLÍN

Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA

Souvislosti kompetencí a odměňování

Hrozí-li nesplnění termínů odevzdání práce, je třeba: Nejraději mám takového spolupracovníka, který:

Metody studia historie populací

Genotypování: Využití ve šlechtění a určení identity odrůd

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

FINAN NÍ ÍZENÍ A ROZHODOVÁNÍ PODNIKU

2. makroekonomie zabývá se chováním ekonomiky jako celku (ekonomie státu).

SMLOUVA O POSKYTNUTÍ DOTACE

Genetika populací. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Genetické rozdíly mezi populacemi aneb něco o migracích a genovém toku. Genetické rozdíly mezi populacemi

vyhodnotí bezpečnost ukládání odpadů a efektivitu využívání druhotných surovin v daném regionu;

Cvičeníč. 9: Dědičnost kvantitativních znaků; Genetika populací. KBI/GENE: Mgr. Zbyněk Houdek

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Tok GI v buňce. Genetický polymorfizmus popis struktury populací. Organizace genetického materiálu. Definice polymorfismu

VY_62_INOVACE_VK64. Datum (období), ve kterém byl VM vytvořen Červen 2012

Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

STUDNY a jejich právní náležitosti.

NADANÝ ŽÁK A JEHO MOŽNOSTI ROZVOJE VE VOLNÉM ČASE

Zajímavost -mtdna a Y v R

EXPERTNÍ POSUDEK Doc. RNDr. Martin Ouředníček, Ph.D. Stručný výtah z posudku.

Klonování gen a genové inženýrství

VENTILY PRO OTOPNÁ T LESA

Elasticita a její aplikace

Příloha č. 1 Seznam závad předkládaných výborem SV Jánského 540/7,Olomouc developerovi

Posilování sociálního dialogu v místním a regionálním správním sektoru. Diskusní dokument

Genetická variabilita. rostlinných populací

VÝHODY DESTRUKTIVNÍHO ZKOUŠENÍ: přímá metoda měření metodika měření je široce uznávána, výsledky jsou srovnatelné a srozumitelné

SOUHRNNÁ ZPRÁVA PRO ŠKOLU

MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ Agronomická fakulta

DOBA KAMENNÁ: Styl je cíl

Přijímací řízení ve školním roce 2012/ Informace pro vycházející žáky a zákonné zástupce

Obsah. Trocha právničiny

Stanovisko komise pro hodnocení dopadů regulace

Tel/fax: IČO:

DIDAKTIKA PRAKTICKÉHO VYUČOVÁNÍ I.

Transkript:

1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2)Mechanizmy evoluce mutace, p írodnívýb r, genový posun a genový tok 3) Anagenezex kladogeneze-co je vlastn druh 4)Dva p íklady studia historie populací -historie irské populace - odšt pení lov ka od lidoop 5) Rozší enízem d lstvído Evropy migrace technologie nebo zem d lc (p íklad užite nosti genetických analýz) ekneme si: - jaké genetická údaje lze získat analýzou žijících populací -co p esn znamenají -co nám íkajío genetickévariabilit (rozmanitosti) existujícíuvnit a mezi žijícími populacemi - jak m žeme vysv tlit tuto variabilitu ve vztahu k evoluci ke studiu genetické rozmanitosti a evoluce lov ka se používají geneticky podmín né znaky n které z t chto znak studujeme na - fenotypové úrovni - genotypové úrovni i dokonce na úrovni DNA sekvence zajímají nás p itom takovéznaky, které jsou tzv. polymorfní a mají stupe polymorfismu co nejvyšší

antropologovépo dlouho dobu používali práv takovéto znaky, p edevším fyzického charakteru nap. výška, barva k že, morfologie lebky apod. využití takových znak je ale zna n problematické u t chto znak neexistuje totiž jednoduchý vztah mezi fenotypem a genotypem, jsou ovlivn ny také prost edíma asto se m ní v pr b hu života jedince nap. dva lidése stejnou barvou k že - mohou být zcela odlišných genotyp -kombinace gen však dávápodobný fenotypový projev - vliv podobného prost edí zp sobí podobný fenotyp -podobný fenotyp m že být i v odlišném prost edím (tmavák že eskymák ) naopak odlišnost v barv k že vliv gen, prost edí nebo kombinace obou? jiný znak -výška postavy se m že velmi rychle m nit z generaci na generaci hlavním problémem t chto znak je, že jsou extrémn plastické avšak dlouho dobu to byly jedinéznaky, které bylo možnéanalyzovat na kosterních poz statcích Období antropometrie - další metody využívají m ení znak jako je barva k že, velikost zub nebo t eba vzor otisku prst

- další metody využívají m ení znak jako je barva k že, velikost zub nebo t eba vzor otisku prst nevýhoda: vliv prost edí d kazy upravuje = nep esné záv ry fyzická antropologie nutn pot ebovala soubor prom nlivých znak polymorfizm s jednoduchým mendelovským typem d di nosti lidská morfologie je sice závislá na genotypu, ale její variabilitu kontrolují desítky a možná stovky jednotlivých gen, což je druhý problém t chto znak fyzická antropologie nutn pot ebovala soubor prom nlivých znak polymorfizm s jednoduchým mendelovským typem d di nosti antropologovép i rekonstrukci historie populacípostupem asu za ali využívat variabilitu dalších znak (klasické markery), nap.: - krevní skupiny - krevní proteiny a enzymy nejpoužívan jší jsou asi skupiny AB0 systému 3 alely, jedna recesivní a dv kodominantní dalšími jsou nap. RH systém alela D = pozitivita, d = negativita další skupiny jako MN, Diego, Duffy, Lutheran, P, Lewisa další u krevních skupin s kodominantními alelami fenotyp = genotyp sledujeme variabilitu na genotypové úrovni -od roku 1960 hlavníroli p ebírajíkrevníproteiny a enzymy identifikace polymorfizm pomocí metodiky elektroforézy sledovánígenotypu jedince bylo mnohem snazší Nelze však použít p i studiu vym elých populací, jen u sou asných.

antropologovép i rekonstrukci historie populacípostupem asu za ali využívat variabilitu dalších znak (klasické markery), nap.: - krevní skupiny - krevní proteiny a enzymy výhoda: není vliv prost edí na projev znaku nevýhoda: nízký polymorfizmus, omezené množství t chto znak -RFLP (Restriction Fragment LenghtPolymorphism) - polymorfizmus délky restrik ních fragment - vzniká v d sledku mutace ve št pném míst restrik ního enzymu Mikrosatelity-krátká n kolikanukleotidová opakování, polymorfizmus spo ívávpo tu opakování, která se d dí jako mendelistický znak zviditeln ní pomocí techniky PCR Št pení restrik ními enzymy Zviditeln ní pomocí sondy nevýhoda: metoda je pracná a asov náro ná Namnožení pomocí PCR Zviditeln ní pomocí elektroforézy nevýhoda: rozmanitost jen v nekódujících opakujících se sekvencích

Alu inzerce - polymorfizmus v Alu inzercích -asi 300 pár bazí dlouháopakování, vyskytují se po celém genomu -u lov ka je jich více než milion (asi 10 % genomu) -n které z nich jsou typickéjen pro lov ka (nevyskytují se u blízkých žijících p íbuzných jako t eba u afrických opic) SNP- Single Nucleotide Polymorphism- jednonukleotidový polymorfizmus - pravd podobn nejvariabiln jší znak -vsou asnosti nejpoužívan jšítyp genetického znaku pro studium variability -v lidském genomu existuje jižvíce než 200 000 SNP v genech a 10x více v nekódujících oblastech (potencionáln p es 10 milion v genomu lov ka; v NCBI v roce 2011 p es 60 milion záznam ) Výhodou DNA marker je možnost analyzovat rozmanitost nejen u sou asné DNA, ale i u adna. všechny tyto markery umož ují hledat malé rozdíly v sekvenci jednotlivých jedinc Budoucnost? dnes je snaha charakterizovat t chto sekvencí co možnánejvíce v budoucnu p i studiu rozmanitosti analyzovat rozsáhlésekvence až nakonec analyzovat celé genomy(maximální popis rozmanitosti)