Laboratorní příručka - Oddělení klinické mikrobiologie a antibiotická stanice (KMAS) odběr adjustace uchovávání transport čas - N čas - P stručný popis získání vzorku popis odběrového materiálu (položka uvedená kurzívou znamená alternativu optimálnímu postupu ) tampon t sterilní tampon na tyčince v transportní zkumavce tampon d sterilní tampon na drátě v transportní zkumavce tampon t-tpa sterilní tampon na tyčince ve zkumavce s transportní půdou podle Amiese tampon d-tpa sterilní tampon na drátě ve zkumavce s transportní půdou podle Amiese kontejner P sterilní kontejner z průhledné umělé hmoty se šroubovacím víčkem kontejner O sterilní kontejner z průhledné umělé hmoty s odsávací výměnnou zátkou anaer S jednorázová sterilní injekční stříkačka (5ml) s nasazenou jehlou zapíchnutou do sterilní gumové zátky lahvička FAN-a aerobní hemokutlivační lahvička (zelená) lahvička FAN-n anerobní hemokultivační lahvička (oranžová) OS-mycoplasma odběrová souprava pro vyšetření urogenitálních mykoplasmat OS-chlamydia odběrová souprava pro vyšetření Chlamydia trachomatis genetickou sondou OS-trichomonas odběrová souprava pro kultivaci Trichomonas vaginalis OS-HPV odběrová souprava pro vyšetření lidských onkogenních papilomavirů genetickou sondou způsob uchovávání vzorku před transportem (pouze pokud není možný okamžitý transport na příjem KMAS) Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: 15-30 C), cht (chladničková teplota: 2-8 C) podmínky transportu Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: 15-30 C), cht (chladničková teplota: 2-8 C) nejkratší čas pro sdělení konečného negativního výsledku od dodání do laboratoře (d - dny, h - hodiny, m - minuty) průměrný časový interval pro sdělení pozitivního výsledku od dodání do laboratoře (d - dny, h - hodiny, m - minuty)
Horní cesty dýchací výtěru z krku výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) tampon t-tpa Kultivační vyšetření výtěru z krku pro surveillance v intenzivní péči výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Arcanobacterium haemolyticum z výtěru z krku výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Neisseria gonorrhoae z výtěru z krku výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus z výtěru z krku výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus MRSA z výtěru z krku výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) tampon t-tpa Kultivační vyšetření výtěru z nosu pro surveillance v intenzivní péči hluboký výtěr z nosu tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus z výtěru z nosu výtěr z nosního vchodu tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus MRSA z výtěru z nosu výtěr z nosního vchodu tampon t-tpa tekutina získaná punkcí nebo odsátím klinického materiálu z paranazálních dutin z paranazální dutiny anaer S
Dolní cesty dýchací sputum získané vykašláním za kontroly sputa sestry nebo lékaře kontejner P endotracheální aspirát získaný odsátím endotracheálního aspirátu z intubace nebo tracheostomie kontejner O kontejner P bronchiálního aspirátu aspirát z bronchů získaný bronchoskopicky kontejner O kontejner P bronchoalveolární laváže BAL kontejner O výtěru z tracheostomie výtěr z tracheostomie tampon t-tpa kontejner P Mikroskopický průkaz acidorezistentních 2 h 2 h baktérií sekret z dolních cest dýchacích kontejner O Ucho výtěru ze zevního zvukovodu výtěr ze zevního zvukovodu tampon t-tpa tekutina ze středouší získaná punkcí nebo po paracentéze, zachycená asepticky na klinického materiálu ze středního ucha tampon tampon d-tpa
Oko výtěru ze spojivkového vaku výtěr ze spojivkového vaku tampon t-tpa Průkaz Chlamydia trachomatis ve výtěru ze razantní výtěr ze spojivkového vaku se spojivkového vaku genetickou sondou zachycením buněk epitelu OS-chlamydia / pt výtěru z rohovkového vředu výtěr z rohovkového vředu tampon t-tpa anaer S tekutina z nitroočního prostoru získaná klinického materiálu z nitroočního prostoru punkcí nebo peroperačně tampon t-tpa Zažívací ústrojí Základní kultivační vyšetření stolice výtěr z rekta tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Campylobacter spp. 3 d 3-5 d ze stolice výtěr z rekta tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Escherichia coli O157 ze stolice výtěr z rekta tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz patogenních vibrií ze stolice výtěr z rekta tampon t-tpa Cílený kultivační průkaz Yersinia spp. ze stolice výtěr z rekta tampon t-tpa 3-4 h 3-4 h Průkaz toxinu Clostridium difficile ve stolici stolice kontejner P Kultivační vyšetření stolice pro surveillance v intenzivní péči výtěr z rekta tampon t-tpa Základní kultivační vyšetření obsahu žlučových cest obsah žlučových cest získaný punkcí či aspirací, peroperačně, při ERCP, případně z drenáže anaer S statim statim
Močové ústrojí střední proud moči, cévkovaná moč, moč 1 d 2-4 d moči z permanentního katétru kontejner P střední proud moči, cévkovaná moč, moč Průkaz urogenitálních mykoplasmat z moči z permanentního katétru kontejner P Základní kultivační vyšetření výtěru z uretry hluboký výtěr z uretry tampon d-tpa Č :48 h T:pt Č : 2 h Průkaz urogenitálních mykoplasmat z výtěru z uretry hluboký výtěr z uretry OS-mycoplasma nebo 72h cht Průkaz Chlamydia trachomatis z výtěru 1 d 1-4 d z uretry genetickou sondou hluboký výtěr z uretry s abrazí buněk epitelu OS-chlamydia /pt Průkaz Neisseria gonorrhoae z výtěru 1 d 1-4 d z uretry genetickou sondou hluboký výtěr z uretry s abrazí buněk epitelu OS-chlamydia / pt Cílený kultivační průkaz Trichomonas 2 d 2 d vaginalis z výtěru z uretry hluboký výtěr z uretry OS-trichomonas
Pohlavní ústrojí muže sekretu prostaty výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum tampon t-tpa Č :48 h T:pt Č : 2 h Průkaz urogenitálních mykoplasmat v sekretu prostaty výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum OS mycoplasma nebo 72h cht Průkaz Chlamydia trachomatis v sekretu prostaty genetickou sondou výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum OS chlamydia / pt Průkaz Neisseria gonorrhoae v sektretu prostaty genetickou sondou výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum OS chlamydia / pt ejakulátu ejakulát získaný masturbací kontejner P Č :48 h T:pt Č : 2 h Průkaz urogenitálních mykoplasmat v ejakulátu ejakulát získaný masturbací OS mycoplasma nebo 72h cht Průkaz Chlamydia trachomatis v ejakulátu genetickou sondou ejakulát získaný masturbací OS chlamydia / pt Průkaz Neisseria gonorrhoae v ejakulátu genetickou sondou ejakulát získaný masturbací OS chlamydia / pt
Pohlavní ústrojí ženy poševní sekret zachycený na sterilní tampon Č : 48 h Č : 2 h a válivým pohybem rozetřený na podložní podložní sklo v krabici pro mikroskopické Mikroskopický obraz poševní sklo preparáty výtěru z pochvy výtěr z pochvy tampon t-tpa Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z pochvy výtěr z pochvy OS mycoplasma Cílený kultivační průkaz Trichomonas vaginalis ve výtěru z pochvy výtěr z pochvy OS trichomonas výtěru z děložního hrdla výtěr z děložního hrdla tampon t-tpa Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z děložního hrdla Průkaz Chlamydia trachomatis ve výtěru z děložního hrdla genetickou sondou Průkaz Neisseria gonorrhoae ve výtěru z děložního hrdla genetickou sondou sekretu z Bartholinské žlázy tekutiny z adnex Průkaz urogenitálních mykoplasmat z tekutiny z adnex Průkaz Chlamydia trachomatis z tekutiny z adnex genetickou sondou Průkaz Neisseria gonorrhoae z tekutiny z adnex genetickou sondou výtěr z děložního hrdla s abrazí buněk epitelu výtěr z děložního hrdla s abrazí buněk epitelu výtěr z děložního hrdla s abrazí buněk epitelu tekutina z Bartholinské žlázy získaná punkcí anaer S tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi OS mycoplasma OS chlamydia OS chlamydia anaer S OS mycoplasma OS chlamydia OS chlamydia intauterinního tělíska intrauterinní tělísko kontejner P nevhodné statim statim Č :48 h T:pt Č : 2 h nebo 72h cht Č :48 h T:pt Č : 2 h nebo 72h cht / pt / pt Č :48 h T:pt Č : 2 h nebo Č:72h T: cht / pt / pt Č : 2 h 7 d 7-10 d
Kůže klinického materiálu z kožní léze stěr z kožní léze tampon t-tpa Rány a hluboké defekty klinického materiálu z rány výtěr z rány tampon t-tpa klinického materiálu z hlubokého defektu výtěr z hlubokého defektu tampon t-tpa Centrální nervový systém 2-5 d 2-4 d mozkomíšního moku lumbální punkce kontejner P lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku v kultivačním analyzátoru lumbální punkce lahvička FAN n Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku při monitorování zevních drenáží CNS likvor z drenáže tampon t-tpa Krev (hemokultura) Hemokultivační vyšetření aseptická venepunkce (standardní odběr) lahvička FAN a (odebírají se vždy nejméně dvě hemokultury odběr z cévního katétru (pouze při podezření po 10ml krve!!!) na katétrovou infekci) (5ml krve) (nebo 37 OC) lahvička FAN b (5ml krve)
Hnis a obsah patologických dutin hnisu 2-7 d 2-10 d nebo obsahu patologické dutiny tkáně punkce abscesu nebo patologické dutiny anaer S Č : 2 h 2-7 d 2-10 d z patologické dutiny excize pyogenní membrány, atp. kontejner P nevhodné
Primární tělesné sterilní tekutiny pleurální 5 d 2-7 d tekutiny punkce pleurálního prostoru (1-5ml) anaer S lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření pleurální tekutiny v kultivačním analyzátoru punkce pleurálního prostoru (1-5 ml) lahvička FAN n 5 d 2-7 d peritoneální tekutiny punkce peritoneálního prostoru (1-5ml) anaer S lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření peritoneální tekutiny v kultivačním analyzátoru punkce peritoneálního prostoru (1-5ml) lahvička FAN n 5 d 2-7 d ascitu punkce ascitu (1-5ml) anaer S lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření ascitu v kultivačním analyzátoru punkce ascitu (1-5ml) lahvička FAN n 5 d 2-7 d perikardiální tekutiny punkce perikardiálního prostoru (1-5ml) anaer S lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření perikardiální tekutiny v kultivačním analyzátoru punkce perikardiálního prostoru (1-5ml) lahvička FAN n kloubní 5 d 2-7 d tekutiny punkce kloubu (1-5ml) anaer S lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření kloubní tekutiny v kultivačním analyzátoru punkce kloubu (1-5ml) lahvička FAN n tekutiny 5 d 2-7 d z Douglasova prostoru punkce Douglasova prostoru (1-5ml) anaer S Mikrobiologické vyšetření tekutiny lahvička FAN a z Douglasova prostoru v kultivačním analyzátoru punkce Douglasova prostoru (1-5ml) lahvička FAN n 5 d 2-7d peritoneálního dialyzátu aspirát peritoneálního dialyzátu (5ml) anaer S lahvička FAN a Mikrobiologické vyšetření peritoneálního 5-7 d 2-10d dialyzátu v kultivačním analyzátoru aspirát peritoneálního dialyzátu (5ml) lahvička FAN n
Tkáně 2-5 d 2-7 d tkáně tampon t-tpa srdeční 10 d 2-14 d chlopně tampon t-tpa Cizorodý materiál (cévní katétry, elektrody, drény, implantáty) Mikrobiologické vyšetření cévních katétrů odstřižení 5cm špičky vyjmutého katétru kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření kardiostimulačních 5 d 5-7 d elektrod odstřižení 5cm koncové části elektrody kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření elektrod 5 d 5-7 d z centrálního nervového sytému odstřižení 5cm koncové části elektrody kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření chirurgických drénů odstřižení 5cm koncové části drenu kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření drénů z centrálního nervového systému odstřižení 5cm koncové části drenu kontejner P - nasucho!!! odstřižení jedné nebo více částí shuntu 5 d 5-7 d Mikrobiologické vyšetření likvorových shuntů podle lokalizace infekce kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření umělých 10 d 2-14 d chlopenních náhrad operační vyjmutí náhrady kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření biologických 10 d 2-14 d chlopenních náhrad operační vyjmutí náhrady kontejner P - nasucho!!! 10 d 2-14 d Mikrobiologické vyšetření cévních protéz odstřižení části protézy kontejner P - nasucho!!! Mikrobiologické vyšetření čidel pro měření nitrolebního tlaku vyjmutí intrakraniální části čidla kontejner P - nasucho!!!
Speciální vyšetření 3-5 h 3-5 h Průkaz antigenu Legionella pneumophila střední proud moči, cévkovaná moč, moč v moči enzymovou imunoanalýzou z permanentního katétru kontejner P Průkaz lidských onkogenních papilomavirů genetickou sondou abraze buněk děložního hrdla OS papilomaviry statim statim Č : 14 d Č : 2 h 1 d 1-14 d