VÝROČNÍ ZPRÁVA ÚSTAV IMUNOLOGIE A MIKROBIOLOGIE 2016

Transkript

1 VÝROČNÍ ZPRÁVA ÚSTAV IMUNOLOGIE A MIKROBIOLOGIE 2016

2 OBSAH 1. ZÁKLADNÍ INFORMACE ZÁKLADNÍ EKONOMICKÁ CHARAKTERISTIKA VÝZNAMNÉ UDÁLOSTI VÝZNAMNÁ OCENĚNÍ PRACOVNÍKŮ ÚIM PEDAGOGICKÁ ČINNOST BAKALÁŘSKÉ STUDIUM MAGISTERSKÉ STUDIUM IMUNOLOGIE MIKROBIOLOGIE NAVAZUJÍCÍ MAGISTERSKÉ STUDIUM ROZDĚLENÍ VÝUKOVÉ ČINNOSTI SYLABY VÝUKA NA JINÝCH ÚSTAVECH 1.LF UK, JINÝCH FAKULTÁCH UK A OSTATNÍCH UNIVERZITÁCH A VŠ V ČR VÝUKA NA JINÝCH ÚSTAVECH 1. LF UK VÝUKA NA JINÝCH FAKULTÁCH UK VÝUKA NA OSTATNÍCH UNIVERZITÁCH A VŠ V ČR SPECIALIZAČNÍ A CELOŽIVOTNÍ VZDĚLÁVÁNÍ PREGRADUÁLNÍ STUDIUM - DIPLOMANTI OBHÁJENÉ BAKALÁŘSKÉ PRÁCE OBHÁJENÉ DIPLOMOVÉ PRÁCE POSTGRADUÁLNÍ STUDIUM ŠKOLITELÉ V POSTGRADUÁLNÍM STUDIU OBHÁJENÉ DIZERTAČNÍ PRÁCE PŘEDATESTAČNÍ PŘÍPRAVA ZKUŠEBNÍ A HODNOTÍCÍ KOMISE SEMINÁŘE ÚIM VĚDECKO-VÝZKUMNÁ ČINNOST GRANTY GRANTOVÉ PROJEKTY VÝZKUMNÉ ZÁMĚRY SPOLUPRÁCE PUBLIKAČNÍ ČINNOST PŘEHLED PUBLIKAČNÍ ČINNOSTI V LETECH PŮVODNÍ ODBORNÉ PRÁCE PŘEHLEDOVÉ ČLÁNKY KAPITOLY V MONOGRAFII ABSTRAKTA PŘEDNÁŠEK A POSTERŮ PŘEDNÁŠKY V ZAHRANIČÍ (MEZINÁRODNÍ KONFERENCE POŘÁDANÉ V ČR) POSTERY V ZAHRANIČÍ PŘEDNÁŠKY A POSTERY V ČR VÝUKOVÉ TEXTY POPULARIZUJÍCÍ ČINNOST OPONENTSKÉ POSUDKY, PROTOKOLY A RECENZE SPOLUPRÁCE MEZI KLINIKAMI A ÚSTAVY LF UK SPOLUPRÁCE S JINÝMI PRACOVIŠTI V ČR ZAHRANIČNÍ STYKY JINÁ ODBORNÁ ČINNOST ORGANIZACE KONGRESŮ, SYMPOSIÍ STUDIJNÍ POBYTY, SJEZDY A KURZY V ZAHRANIČÍ KURZY, SJEZDY, SEMINÁŘE V ČR FUNKCE VE VĚDECKÝCH A PROFESNÍCH SPOLEČNOSTECH, KOMISÍCH A RADÁCH ČLENSTVÍ V REDAKČNÍCH RADÁCH ČLENSTVÍ V OBOROVÝCH A VĚDECKÝCH SPOLEČNOSTECH KONTAKTY ADRESA JMENOVITÝ SEZNAM PRACOVNÍKŮ

3 1. ZÁKLADNÍ INFORMACE ÚIM mělo 82 zaměstnanců, z toho 66 VŠ. Sídlo ústavu je na Albertově - Studničkova 7, Praha 2, a na Karlově náměstí Fakultní poliklinika, budova A, IV. patro, Karlovo náměstí 32, Praha 2. Přednostkou ústavu je prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc., primářem klinické části je MUDr. Josef Krupička. Organizační schéma ÚIM - 3 -

4 2. ZÁKLADNÍ EKONOMICKÁ CHARAKTERISTIKA Počet provedených klinických vyšetření Počet léčených pacientů Počet pacientů léčených alergenovou imunoterapií 168 Počet sérologických vyšetření diagnostika na NRL NRL - počet vykázaných bodů Počet zaměstnanců VFN LF VÝZNAMNÉ UDÁLOSTI 3.1. Významná ocenění pracovníků ÚIM Tuzemská HRDÝ J. 3. místo v soutěži o nejlepší poster Klinické aspekty imunopatologií na XXXIII. sjezdu českých a slovenských alergologů a klinických imunologů HANUSOVÁ Z., HOLADA K. : Příprava nových modelů pro studium prionových chorob v buněčných kulturách. 17. Studentská vědecká konference 1. LF UK, , přednáška vítězná práce Postgraduální teoretické sekce SVOBODA J. cena WALD Press AWARD udělena dne 20.prosince 2015 za příkladnou, neúnavnou pomoc pacientům s chorobou AIDS, 4. PEDAGOGICKÁ ČINNOST Pedagogická činnost Ústavu imunologie a mikrobiologie je založena na výuce dvou samostatných oborů: Imunologie a Mikrobiologie. V rámci těchto oborů jsou v pregraduálním studiu vyučovány v českém a anglickém jazyce jednotlivé předměty v rámci magisterského studia všeobecného a zubního lékařství, ale i bakalářského studia různých oborů. Pracovnící ústavu se podílejí na postgraduální výuce doktorandů zapsaných zejména do biomedicínských doktorských studijních programů, postgraduální předatestační přípravě lékařů a jiných odborných pracovníků ve zdravotnictví, celoživotním vzdělávání a výuce pro Univerzitu 3. věku. Někteří pracovníci rovněž vedou bakalářské a diplomové práce studentů jiných VŠ (zejména PřFUK) Bakalářské studium Pracoviště zajišťuje v roce 2015/2016 výuku předmětu Mikrobiologie a imunologie pro obory: Všeobecná sestra, Nutriční terapeut a Porodní asistentka (prezenční a kombinovaná forma studia VS, NT, PA). Prezenční forma studia je vyučována společně pro oba obory v rámci společného kmene. Celkem bylo v roce 2015/2016 odučeno 180 hodin přednášek, 150 hodin konzultací a soustředění pro 74 studentů a vyzkoušeno bylo 55 studentů

5 Zkoušející předmětu Mikrobiologie a imunologie oborů VS, NT a PA v roce 2015/ Magisterské studium Imunologie ÚIM zajišťuje výuku předmětů Základy imunologie a Imunologie v zubním lékařství (ve spolupráci se Stomatologickou klinikou) pro obor Zubního lékařství 2. ročník, dále Základy imunologie pro obor Všeobecného lékařství (2. ročník), Klinická imunologie formou týdenního bloku přednášek a seminářů ve 4. ročníku oboru Všeobecné lékařství. Další součástí výuky imunologie je nabídka volitelných předmětů (Ekoimunologie, Základy práce v imunologické laboratoři, Laboratorní metody v imunologii, Alergologie v praxi, Imunologie v klinické praxi I medicína v souvislostech, od 2016/2017 nový volitelný předmět Novinky v imunologii). Celkem bylo v akademickém roce 2015/2016 odučeno 837 hodin v rámci 12 imunologických předmětů (celkem zapsáno 992 studentů). V roce 2015/2016 bylo vyzkoušeno 488 studentů. Pro studenty 2. ročníku Všeobecného lékařství byly připraveny zápočtové testy (přes 600 testů). Zkoušející imunologických předmětů v roce 2015/

6 Mikrobiologie ÚIM zajišťuje výuku předmětů Mikrobiologie 1 a Mikrobiologie 2 (přednášky, praktická cvičení) a Integrovaného bloku mikrobiologie a patologie posluchačů Všeobecného lékařství a Mikrobiologie (přednášky, praktická cvičení) posluchačů zubního lékařství v české a anglické paralelce. V rámci mikrobiologie bylo odpřednášeno na přednáškách a seminářích 455 hodin včetně povinně volitelných předmětů a výuka praktických cvičení činila 526 hodin. Počet zapsaných studentů na veškeré předměty mikrobiologie činil celkem Celkem bylo vyzkoušeno v rámci předmětů Mikrobiologie 498 studentů a uděleno 951 zápočtů. Zkoušející předmětu Mikrobiologie 2 a Mikrobiologie (Všeobecné i Zubní lékařství) v ČJ i AJ v roce 2015/2016 Volitelné předměty vyučované v rámci mikrobiologie jsou: Moderní diagnostické techniky v mikrobiologii a imunologii, Tropické nemoci 1,2 (oba pro českou i anglickou paralelku), Klinická mikrobiologie diagnostika a interpretace laboratorních nálezů, Klinická mikrobiologie v oblasti primární péče a Klinická mikrobiologie u hospitalizovaných pacientů Navazující magisterské studium ÚIM zajišťuje od akademického roku 2015/2016 pro výuku nutričních specialistů předmět Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie. Výuka byla rozdělena do 38 hodin pro prezenční a kombinované studium, do kterého bylo zapsáno 44 studentů (vyzkoušeno 37). Celkový počet zkoušení za celý ÚIM činí Stejně jako v předchozích letech trvá pronájem jedné učebny praktických cvičení ČVUT pro obor zubní laborant

7 4.3. Rozdělení výukové činnosti Ústav imunologie a mikrobiologie zajišťuje českou i anglickou výuku povinných i volitelných předmětů imunologie a mikrobiologie posluchačů magisterského studia oborů Všeobecné lékařství, Zubní lékařství a posluchačů bakalářského studia - Nutriční terapeut, Všeobecná sestra (presenční i kombinovaná forma studia) a navazujícího magisterského studia Nutriční specialista.. Přehled Název předmětu Ročník Semestr vyučovaných předmětů na ÚIM Kód Magisterské studium Všeobecné lékařství povinné předměty B02078 Základy imunologie 2 LS B82078 Basic Immunology 2 LS B00033 Klinická imunologie 4 ZS, LS B80033 Medical Immunology 4 ZS B80035 Microbiology 1 2 LS B00035 Mikrobiologie 1 2 LS B00382 Mikrobiologie 2 3 ZS B80382 Microbiology 2 3 ZS B00054 Integrovaný blok mikrobiologie a 3 ZS patologie B80054 Integrated Block Mikrobiology/Pathology 3 ZS Zubní lékařství povinné předměty B01144 Imunologie v zubním lékařství 2 LS B81144 Immunology in Dentistry 2 LS B01153 Základy imunologie Z 2 LS B81153 Basic Immunology Z 2 LS B01148 Mikrobiologie 2 LS B81148 Microbiology 2 LS Nutriční specialista povinné předměty B02721 B02762 Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie 1 prezenč ní 1 kombino vaná Bakalářské studium Nutriční terapeut B01718 Mikrobiologie a imunologie prezenční 2 ZS forma B02283 Mikrobiologie a imunologie 2 ZS, LS kombinovaná forma Všeobecná sestra B01841 Mikrobiologie a imunologie 2 LS kombinovaná forma B01754 Mikrobiologie a imunologie prezenční forma 2 LS Všeobecné lékařství, Zubní lékařství, Stomatologie, Bakalářské studium volitelné předměty Kód Název předmětu Ročník Studijní obory B02692 Alergologie v praxi 4,5,6 LEK ZS ZS - 7 -

8 B02708 Imunologie v klinické praxi I medicína v souvislostech 4,5,6 LEK B00134 Tropické nemoci 1,2 4,5,6 LEK,ZUB B80134 Tropical Diseases 1,2 (4),5,6 LEK,ZUB B01666 Ekoimunologie 3,4,5,6 LEK,ZUB,STOM B02182 Laboratorní metody v imunologii 4,5,6 LEK B01670 Moderní diagnostické techniky v mikrobiologii a imunologii 3,4,5,6 LEK,ZUB,STOM, BS LEK,ZUB,STOM, BS LEK B02086 Klinická mikrobiologie diagnostika a 5 LEK interpretace laboratorních nálezů B02087 Klinická mikrobiologie v oblasti primární 5 LEK péče B02088 Klinická mikrobiologie u 5 LEK hospitalizovaných pacientů B02917 Novinky v imunologii 3,4,5,6 LEK, ZUB, STOM, BS ÚIM zajišťuje jednosemestrální výuku předmětu MB140P70 Lékařská mikrobiologie pro Přírodovědeckou fakultu UK (garant Julák J.). ÚIM zajišťuje dále kromě výše uvedených předmětů i vědeckou práci pregraduálních studentů, vedení diplomových prací studentů z PřF UK, postgraduální výuku v rámci doktorského studia (vedení PGS studentů) a předatestační přípravu v rámci oborů Alergologie a klinická imunologie a Lékařská mikrobiologie a dále v rámci kurzů Celoživotního vzdělávání. Výuka imunologie také probíhá formou samostatných přednášek v rámci výuky interních a chirurgických oborů. Kromě výuky předmětu Alergologie v praxi a Imunologie v klinické praxi I medicína v souvislostech, která se koná v budově Fakultní polikliniky, Karlovo nám. 32, je veškerá další výuka zajišťována v oblasti Albertova (seminární místnost ústavu, praktikárny pro mikrobiologii, zapůjčené přednáškové či seminární místnosti). Vlastní seminární místnost ÚIM má kapacitu 36 osob Sylaby B02692 Alergologie v praxi (Humlová Z.) Určen pro studenty všeobecného lékařství od 4. ročníku. PVP Vyšetřovací metody v alergologii. Alergická rinitida, astma. Léková alergie. Atopická dermatitida. Urtika. Potravinová alergie. Alergie a autoimunita. B01666 Ekoimunologie (Petanová J.) Určen pro studenty magisterského i bakalářského studia s bazálními znalostmi imunologie, VP. Předmět zaměřený na sledování vlivů prostředí na imunitní systém, ovlivnění jeho funkcí. Ekoimunologie. Imunotoxikologie. Imunitní systém. Globální faktory prostředí, vliv emisí, dopravy

9 Individuální faktory ovlivňující imunitní systém. Psychoneuroimunologie. Působení léků, abusus návykových látek. B02708 Imunologie v klinické praxi I medicína v souvislostech (Svoboda J.) Určen pro studenty všeobecného lékařství od 4. ročníku. VP B01144 Imunologie v zubním lékařství (Vyučující ÚIM ve spolupráci se Stomatologickou klinikou 1. LF UK) Určen pro studenty oboru zubního lékařství. Základní mechanismy imunitního systému uplatňující se v rozvoji onemocnění zubů, parodontu a ústní dutiny. Úvodní přednáška: Obranné mechanizmy orální (vztah slizniční a systémové imunity). Imunitní mechanismy onemocnění sliznic a jejich projevy. Imunitní mechanismy onemocnění parodontu. Parodontitida jako rizikový faktor systémových onemocnění. Úloha polymorfismu genů v imunitních reakcích ve vztahu k orálnímu onemocnění. Dentální materiály a imunitní reakce. Lokální projevy koroze dentálních materiálů a aktivace imunitní reakce. B81144 Immunology in Dentistry (Vyučující ÚIM ve spolupráci se Stomatologickou klinikou 1. LF UK) Určen pro studenty oboru zubního lékařství v anglickém jazyce. The role of immune system during diseases of the oral cavity with respect to mucosal immunity. Importance of the oral tolerance to keep the oral health. Reactions to dental materials used in stomatology. Oral cavity and mucosal immunology. Oral cavity diseases. Oral manifestations of systemic diseases. Dental materials and pigmentations. Galvanism and metal intolerance diagnostics. MELISA test + case studies. B02182 Laboratorní metody v imunologii B01966 Základy práce v imunologické laboratoři (Posová H.) Určen pro studenty všeobecného lékařství od 4. ročníku. VP Předměty slouží k seznámení se základními laboratorními technikami používanými v imunologické laboratoři. Větší část praktických cvičení je věnována průtokové cytometrii. B02078 Základy imunologie (Prokešová L., Městecký J., Čechová D., Petanová J., Hrdý J., testy - vyučující ÚIM) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství, 2. ročník. V přednáškách jsou studenti seznámeni se strukturou a základními mechanizmy imunitního systému, s regulacemi a kooperací jednotlivých složek obranných mechanismů za fyziologických podmínek i patologických stavů. Výuka je zaměřena na pochopení komplexních interakcí různých typů buněk, tkání a molekul imunitního systému. Imunitní systém, jeho funkce a dělení. Struktura imunitního systému. Přirozená imunita. Specifická imunita. T lymfocyty. B lymfocyty, protilátky. Prezentace antigenu. Zánětová odpověď. Protinádorová imunita. Transplantace. Imunopatologické reakce a stavy v klinické praxi

10 B82078 Basic Immunology (Prokešová L., Petanová J., Hrdý J., testy - vyučující ÚIM) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce, 2. ročník. Structure of the immune system, its regulation and cooperation between separate components in physiologic and pathologic situations. Antigen presentation. Introduction. Structure of immune system. Innate and specific immunity. T and B lymphocytes. Immunoglobulins. Antigen presentation. Inflammation. Anti-tumor immunity. Transplantations. Immunopathologic reactions and states in clinical practice. B00033 Klinická imunologie (Čechová D., Posová H., Petanová J., Adámková V.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství. Výuka v rámci týdenního bloku je sestavena z několika přednášek a dále seminářů, které jsou založeny především na rozboru kazuistik pacientů. V rámci předmětu jsou shrnuty základní poznatky o struktuře, mechanizmech a funkcích imunitního systému. Větší část je věnována imunopatologickým procesům a jejich manifestací v jednotlivých systémech organismu. Součástí výuky je i přehled používaných laboratorních vyšetření v rámci diferenciálně diagnostického procesu a možné terapeutické postupy. Volitelná návštěva ambulance. Sylabus: Struktura, mechanizmy a funkce imunitního systému. Zánět a protiinfekční imunita, imunopatologické reakce, imunodeficience, autoimunita, alergie, nádorová imunologie, regulace imunity, transplantace. Klinická mikrobiologie ve vztahu k poruchám imunitních mechanismů. Možnosti vyšetřování a způsob diagnostické rozvahy, terapeutické postupy. B80033 Clinical Immunology (Čechová D., Posová H., Petanová J., Adámková V.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce. Lectures and seminars in one-week block oriented to the summary of basic immunological knowledge, application of immunopathological mechanisms into different organs and systems. Differential diagnosis of immunopathological states, their laboratory tests and treatment. The structure, mechanisms and function of the immune system. Immunopathologic reactions, inflammation, basic immunologic diagnoses (immunodeficiency, autoimmune diseases, allergy), transplantations. Clinical microbiology in association to immune dysfunctions. Diagnostic process, laboratory tests, treatment. B01153 Základy imunologie (Stříž I., Říhová B., Tlaskalová H., Nováková M., Čechová D., Petanová J., Hrdý J.) Určen pro studenty oboru zubního lékařství. V přednáškách jsou studenti seznámeni se strukturou a základními mechanizmy imunitního systému, s regulacemi a kooperací jednotlivých složek obranných mechanizmů za fyziologických podmínek i patologických stavů. Výuka je zaměřena na pochopení komplexních interakcí různých typů buněk, tkání a molekul imunitního systému. V přednášce a seminářích jsou také probírány základní imunologické metody a jejich princip. Struktura imunitního systému, jeho dělení. Prezentace antigenu. Kooperace mezi buňkami imunitního systému. Zánět. Imunopatologické reakce. Imunodeficience. Autoimunita. Alergie. Nádorová imunologie. Transplantace

11 B81153 Basic Immunology (Stříž I., Říhová B., Tlaskalová H., Nováková M., Hrdý J.) Určen pro studenty oboru zubního lékařství v anglickém jazyce. The structure of immune system, its regulation and cooperation between separate components in physiologic and pathologic situations. Antigen presentation, immunopathologic reactions, inflammation, basic immunologic diagnoses. Basic immunologic laboratory methods. Structure of immune system. Antigen presentation. Cooperation between cells. Inflammation. Immunopathologic reactions. Immunodeficiency. Autoimmunity. Allergy. Oncoimmunology. B02917 Novinky v imunologii (Hrdý J.) Určen pro studenty magisterského i bakalářského studia s bazálními znalostmi imunologie, VP. V rámci předmětu Novinky v imunologii se probírají témata, na která se nedostane v základních imunologických přednáškách, mapříklad méně známé či nedávno objevené buněčně subpopulace a jejich funkce ve zdraví a nemoci. B00035 Mikrobiologie 1 (Adámková V., Bobek J., Čermáková R., Doubková Z., Holada K., Chanová M., Julák J., Kolářová L., Kupidlovská L., Mělková Z., Novák J., Pavlík E., Skořepová M.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství. Poskytuje základní informace z obecné mikrobiologie, speciální lékařské mikrobiologie, virologie a parazitologie. Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky, se základy imunizace, se základy antibiotické, antivirové a antiparazitární terapie. Formou praktické výuky poskytuje základní dovednosti bakteriologického vyšetření, seznamuje s metodami odběru klinických materiálů a stanovením citlivosti bakterií na antibiotika. B80035 Microbiology 1 (Adámková V., Holada K., Chanová M., Pavlík E., Skořepová M.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce. Provides basic information on general and specialised human medical microbiology, virology, mycology and parasitology. Describes important human pathogens, their characteristic properties, pathogenicity mechanisms of the diseases they induce, and basics of the antibiotic, antifungal, antiviral and antioparasitic therapy of the diseases. In practical hands-on learning provides important skills for bacteriological investigation of selected samples. The students learn technics for clinical specimen collection, strategy of microbial identification and anti-microbial therapy. B00382 Mikrobiologie 2 (Adámková V., Čermáková R., Chanová M., Julák J., Kupidlovská L., Novák J., Stejskal F., Šemberová L., Zákoucká H.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství. Poskytuje základní informace ze speciální lékařské mikrobiologie, virologie, mykologie a parazitologie. Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky, se základy imunizace, se základy antibiotické, antimykotické, antivirové a antiparazitární terapie. Formou praktické výuky poskytne základní dovednosti bakteriologického vyšetření vybraných klinických materiálů, metodou jejich odběru, identifikace izolovaných bakterií a se strategií antibiotické terapie

12 B80382 Microbiology 2 (Adámková V., Pavlík E., Novák J.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce. Provides basic information on general and specialised human medical microbiology, virology, mycology and parasitology. Describes important human pathogens, their characteristic properties, pathogenicity mechanisms of the diseases they induce, and basics of the antibiotic, antifungal, antiviral and antioparasitic therapy of the diseases. In practical hands-on learning provides important skills for bacteriological investigation of selected samples. The student will learn technics for clinical specimen collection, strategy of microbial identification and anti-microbial therapy. B00054 Integrovaný blok mikrobiologie a patologie (Adámková V., Bártová J., Doubková Z., Dušková J., Holada K., Holub M., Matěj R., Pavlík E., Prokešová L., Rozsypal H., Rusina Z., Skálová H., Skořepová M., Stejskal F., Stříteský J., Susa Z., Zákoucká H.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství. Patomorfologie jednotlivých infekčních chorob a jejich komplikací. Systémový přístup k infekčním nemocem a jejich vyvolavatelům. Pětidenní blok přednášek mikrobiologa (patogenní agens), patologa (jimi vyvolané morfologické změny) a klinika (příznaky onemocnění, diagnostika a terapie). Cílem tohoto bloku přednášek není pouhé shrnutí nově nabytých znalostí z oborů mikrobiologie a patologie, ale i přispění ke změně myšlení budoucích lékařů k respektování souvislostí, příčin a důsledků v celé šíři diferenciálně diagnostických postupů. Rovněž chceme ukázat nutnost úzké spolupráce mezi specialisty různých lékařských oborů pro stanovení diagnózy onemocnění pacienta a jeho léčby. Studenti zároveň získají představu o roli paraklinických oborů v diagnostice a léčbě onemocnění. B80054 Integrated Block: Microbiology/Pathology (Aster V., Dušková J., Doubková Z., Holada K., Holub M., Chalupa P., Pavlík E., Rozsypal H., Smělá G., Stejskal F., Stříteský J., Zákoucká H.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce. A five day block of lectures. Systemic approach to infectious diseases and their agents. Each topic lectured by microbiologist (infectious agens), pathologist (pathological changes during infection), clinician (clinical symptoms, diagnostics and therapy). The aim of this block is to summarize acquired knowledge on microbiology and immunulogy as well as to covert thinking of future physicians to respect diagnostical consequences and make differential diagnostics for benefit of patient. To show evidence of close cooperation of different medical specialists for patient s diagnosis and treatment, and the role of paraclinical subjects in this cooperation. B01148 Mikrobiologie (Adámková V., Doubková Z., Julák J., Kolářová L., Pavlík E., Novák J., Prokešová L., Skořepová M. Šemberová L., ve spolupráci s VÚS: Broukal Z. Určen pro studenty oboru zubního lékařství. Poskytuje základní informace z obecné mikrobiologie, speciální lékařské mikrobiologie, virologie, mykologie a parazitologie. Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky, imunizace, antibiotické, antivirové, antifungální a antiparazitární terapie. Ve výuce jsou zdůrazněny aspekty mikroflóry dutiny ústní a přilehlých oblastí, jejich význam pro stomatologickou praxi a rizika infekcí vyvolaných touto mikroflórou při stomatologických zákrocích. Formou praktické výuky poskytuje základní dovednosti bakteriologického vyšetření vybraných klinických materiálů, seznamuje s metodami odběru vybraných klinických materiálů, se strategií identifikace bakterií a strategií antibiotické terapie. Seznamuje se zásadami požadavků na bakteriologické vyšetření a se základy interpretace jeho výsledků. B81148 Microbiology (Holada K., Chanová M., Pavlík E., Prokešová L. - ve spolupráci s VÚS: Broukal Z.) Určen pro studenty oboru zubního lékařství v anglickém jazyce. Course provides basic knowledge of general and medical microbiology, special dental part of microbiology, virology, mycology and parasitology, the most important human patogens, their properties, diagnostics, immunization, antibiotics, antibacterial, virostatic, antipuncal and antiparasitic therapy, vaccination

13 Microbiological apects of oral microbiome, special dental microbiological profile. Methods of treatment. Practice: Techniques of sample collection of biological materials, methods of identification, stategy of antibacterial therapy - antibiotic centre, antibiotic policy, interpretation of results of laboratory investigation. B02721 forma Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie prezenční B02762 Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie kombinovaná forma (Holada K., Mělková Z., Chanová M., Bobek J, Nováková M., Čechová D., Hrdý J., Petanová J., Posová H.) Určen pro studenty navazujícího magisterského oboru Nutriční specialista Témata: Základy mikrobiologie, správné nutriční postupy z pohledu mikrobiologie. Běžné alimentární infekce bakteriální, virové, mykologické a parazitární, jejich prevence, diagnostika a léčba. Sterilizace, desinfekce, asepse, hygiena. Sezónnost výskytu alimentárních infekcí, možné zdroje infekcí a mikrobiálních kontaminací z pohledu behaviorálního, geografického a ontogenetického. Klinická imunologie a alergologie, imunopatologické stavy. Specializované nutriční postupy při potravinových alergiích (etiologie, klinický obraz, diagnostika, léčebné možnosti. Rozdělení dle příznaků - kožní reakce, reakce dýchacích cest, reakce zažívacího traktu. Alergie na mléko, na vejce, na mořské ryby, korýše a mušle, ovoce a zeleninu, na ořechy. Přecitlivělost na určitý druh obilniny - přechodná). Nutriční postupy u imunosuprimovaných pacientů. B01754 Mikrobiologie a imunologie prezenční forma (Bobek J., Matějů J., Doubková Z., Holada K., Chanová M., Pavlík E., Petanová J., Prokešová L., Skořepová M., Šemberová L., Čechová D.) B01841 Mikrobiologie a imunologie kombinovaná forma (Potužníková B., Chanová M.) B B01754 Mikrobiologie a imunologie (Bobek J., Čechová D., Doubková Z., Holada K., Chanová M., Julák J., Pavlík E., Petanová J., Prokešová L., Skořepová M., Šemberová L.) Určen pro studenty bakalářských oborů Nutriční terapie a Všeobecná sestra. Základní tématické okruhy: a) Obsah a zařazení předmětu lékařská mikrobiologie a imunologie. Základní vlastnosti nejvýznamnějších původců bakteriálních, virových, mykotických a parazitárních infekcí, formy přenosu infekčních agens. Komunitní, nosokomiální a oportunní infekce. Antibiotika. b) Antiinfekční imunita: Základní imunitní mechanismy a obrana proti infekcím: přirozená odolnost, navození imunitní odpovědi, buňkami zprostředkovaná imunita, protilátky, slizniční imunita, zánět. Dysfunkce imunitního systému a jejich ovlivnění: imunopatologické reakce a stavy (imunodeficience, autoimunita, alergie), imunomodulace. c) Základy bakteriologie: Nejvýznamnější původci bakteriálních komunitních a nemocničních onemocnění, jejich základní vlastnosti a klasifikace bakterií. Nástroje virulence bakterií, patogeneze bakteriálních nákaz. Význam a prevalence patogenních bakterií podle infekčních onemocnění. Formy šíření bakteriálních infekcí, prevence a profylaxe. Výběr postupu k identifikaci bakterií, klasické a speciální metody průkazu bakterií. Přirozená citlivost a stav rezistence na antibiotika v ČR, antibiotika volby pro léčbu infekcí způsobených daným bakteriálním druhem. d) Význam správného vzorku pro diagnózu infekčního onemocnění. Charakteristika validního vzorku a nezbytných údajů. Formy odběru, transportu a uchovávání biologických vzorků k mikrobiálnímu vyšetření. Zpracování vzorků. Kritéria odmítnutí vzorku k vyšetření. e) Základy virologie: Nejvýznamnější původci virových komunitních a nemocničních onemocnění. Základní vlastnosti a klasifikace virů. Replikace virů, vztah virus - buňka. Formy šíření virových infekcí, prevence a profylaxe. Patogeneze virových nákaz - lokalizované, diseminované, akutní, chronické a rekurentní infekce, pomalé virové infekce. f) Základy mykologie: Nejvýznamnější původci mykotických infekcí. Základní vlastnosti a klasifikace hub a kvasinek. Formy šíření mykotických infekcí, prevence a profylaxe. Patogeneze mykotických nákaz. Metody průkazu hub a kvasinek. Terapie mykotických infekcí. g) Základy parazitologie: Nejvýznamnější původci parazitárních infekcí. Základní vlastnosti a klasifikace parazitárních agens. Formy šíření parazitárních infekcí, prevence a profylaxe. Patogeneze parazitárních nákaz. Metody přímého a nepřímého průkazu parazitů. Terapie parazitárních onemocnění

14 B01670 Moderní diagnostické techniky v mikrobiologii a imunologii (Pavlík E.) Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (3., 4., 5., 6. roč.) Hlubší seznámení studentů s moderními technikami využitelnými v rutinní mikrobiologické a imunologické diagnostice, a to nejen v úrovni teoretické, nýbrž i formou praktického provedení vybraných technik. Předmět je doplněn exkurzí do diagnostické laboratoře. B81670 Modern Diagnostic Techniques in Medical Microbiology and Immunology (Pavlík E.) Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (3., 4., 5., 6. roč.) v anglickém jazyce. The subject serves to make students familiar with modern techniques implemented in routine diagnostics in microbiology and immunology not only in theory, but in hands-on practice with selected techniques. Excurssion in a routine diagnostic laboratory is added. B02086 Klinická mikrobiologie - diagnostika a interpretace laboratorních nálezů (Adámková V.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství (5. roč.) Praktická účast studentů na diagnostickém procesu v laboratoři s následnou interpretací nálezů. Zpracování návrhů atb terapie a profylaxe. Účast na klinických vizitách na jednotkách intenzivní péče v rámci hematoonkologie, chirurgie a ARO. Zpracování kasuistiky a její prezentace formou semináře na ÚIM. B02087 Klinická mikrobiologie v oblasti primární péče (Adámková V.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství (5. roč.) Diferenciální diagnostika infekcí v primární péči. Rozbor klinických případů interaktivní formou. Strategie ATB léčby v komunitě. Národní doporučené postupy a směrnice pro praktické lékaře. B02088 Klinická mikrobiologie u hospitalizovaných pacientů (Adámková V., Kolářová L.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství (5. roč.) Předmět se zabývá interdisciplinárním přístupem při řešení onemocnění infekčního původu, která jsou zejména spojena poskytovanou zdravotní péčí. Interaktivní formou jsou prakticky prezentovány diferenciálně diagnostické přístupy umožňující specifický průkaz agens, následnou terapii a prevenci šíření infekcí. Důraz je kladen zejména na infekce urogenitální, krevního řečiště, respiračního traktu, v místě chirurgického výkonu apod. Součástí interaktivní výuky je osvětlení principů strategie používání antibiotik a základů surveillance infekcí. B00134 Tropické nemoci 1, 2 (Stejskal F.) Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (4., 5., 6. roč.) Epidemiologie, diagnostika, klinika a terapie vybraných tropických infekčních onemocnění. Diferenciální diagnostika horečky a průjmů v tropech. HIV, AIDS v tropech. Oportunní tropické infekce. Tuberkulóza a lepra. B80034 Tropical Diseases 1,2 (Stejskal F.) Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (4., 5., 6. roč.) B00055 Lékařská parazitologie (Nohýnková E., Chanová M.)

15 4.5. Výuka na jiných ústavech 1.LF UK, jiných fakultách UK a ostatních univerzitách a VŠ v ČR Výuka na jiných ústavech 1.LF UK 1. LF UK - Fyziologie B00030 Prokešová L. (1 přednáška) Fyziologický ústav 1. LF UK - Imunologie v chirurgii Petanová J. (1 přednáška), 1. Chirurgická klinika Chirurgická propedeutika, 1. LF UK - Organismus, mikrobiální agens a prostředí Kolářová L., Adámková V. (1 přednáška) U3V, Ústav vědeckých informací - Obrana organismu a její mechanismy Prokešová L., Posová H. (1 přednáška) U3V, Ústav vědeckých informací - Bílé krvinky a lymfatický systém. Čechová D. (1 přednáška) U3V, Ústav vědeckých informací 2. LF UK (pro III. roč. všeobecného lékařství) - Parazitologie I. Původci protozoárních onemocnění - Kolářová L., (1 přednáška), Ústav lékařské mikrobiologie - Parazitologie II. Původci helmintárních onemocnění - Kolářová L., (1 přednáška), Ústav lékařské mikrobiologie 3. LF UK Aktuální biologická témata v medicíně: Viry a priony jako nebuněčné patogeny - Priony a prionové choroby Holada K. (přednáška), Oddělení buněčné a molekulární biologie, 3. LF UK Výuka na jiných fakultách UK PřF UK - Klinická imunologie Tlaskalová H. (2 přednášky), PřF UK - Virus vakcínie a interakce s hostitelem Mělková Z. (1 přednáška), Oddělení buněčné a molekulární biologie, PřF UK - Expandující svět prionových chorob Holada K. (1 přednáška), Katedra genetiky a mikrobiologie, PřF UK - Lékařská mikrobiologie Julák J. (praktika, zkouška), Katedra genetiky a mikrobiologie PřF UK Pedagogická fakulta UK Univerzita třetího věku - Holada K: Priony a neurodegenerace, přednáška Výuka na ostatních univerzitách a VŠ v ČR Univerzita Jana Evangelisty Purkyně, Ústí nad Labem, Přírodovědecká fakulta Katedra biologie - Genomika a proteomika (ZS) J. Bobek Katedra chemie - Mikrobiologie (LS) J. Bobek

16 Univerzita Pardubice - Expandující svět prionových chorob Holada K. (seminář), Fakulta chemicko-technologická, Katedra biologických a biochemických věd AV ČR Holada K.: Pokroky v molekulární biologii a genetice, Prions, ÚMG AV ČR Praha, přednáška ČVUT Některá pracoviště ústavu se podílejí na výuce studentů bakalářského studia Fakulty biomedicínského inženýrství Českého vysokého učení technického v Praze se sídlem v Kladně Specializační a celoživotní vzdělávání Mimo výuku pregraduální a postgraduální v rámci 1. LF UK se ústav podílí i na předatestační výuce lékařů a dalších vysokoškolsky vzdělaných pracovníků zařazených do oborů Lékařská mikrobiologie, Mikrobiologie, Alergologie a klinická imunologie formou pořádání specializačních kurzů; ústav rovněž pořádá kurzy celoživotního vzdělávání, přičemž spolupracuje s IPVZ a ČLK. Kurzy pořádané 1. LF UK Specializační: Kolářová L.: Lékařská bakteriologie - novinky, Kolářová L.: Lékařská parazitologie, Kolářová L.: Lékařská virologie, Kontinuální: Kolářová L.: Aktuality v lékařské mikrobiologii, Kolářová L.: Antibiotická rezistence bakterií. Aktuální léčba vybraných bakteriálních infekcí, Přednášky v rámci kurzů pro IPVZ (pro lékaře a VŠ nelékaře v předatestační přípravě) Adámková V.: Klinická mikrobiologie novinky, Holada K.: Metodický kurz v laboratorní imunologii Priony a imunitní systém, Chanová M.: Významné helmintární infekce. Lékařská parazitologie, Chanová M., Skála V.: Mikroskopická diagnostika vybraných tkáňových helmintóz. Kurz lékařská parazitologie, Kolářová L.: Lékařská mykologie, Posová H.: Vyšetřovací metody alergologické a imunologické pro dermatology - kurz Laboratorní metody v dermatovenerologii pro atestaci a praxi, Prokešová L.: Antiinfekční imunita předatestační kurz Pregraduální studium diplomanti, bakaláři V laboratořích ÚIM a v laboratoři KIA ÚKBLD pracuje pod vedením učitelů řada studentů lékařských fakult a přírodovědecké fakulty UK a také studenti VŠCHT a ČVUT. Studenti mají možnost vypracovávat pod vedením zkušených pedagogů diplomové a bakalářské práce, nebo si jen vyzkoušet práci v laboratoři a prezentovat své výsledky např. v rámci Studentské vědecké konference

17 Bobek J. Holada K. Hrdý J. Chanová M. Julák J. Mělková Z. Barbora Burýšková, studentka PřF UK, studentská vědecká činnost Matouš Čihák, student VŠCHT, studentská vědecká činnost Pavel Pohl, student UJEP, studentská vědecká činnost Inesa Music, studentka UJEP, studentská vědecká činnost Johanka Kučerová, studentka PřF UK, diplomová práce Bc. Miroslava Gorelová, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Lenka Súkeníková, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Kateřina Vlasáková, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Kateřina Macholdová, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Marek Jedlička, student PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Šárka Hnilicová, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Flaviancia Mouyabi, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Romana Kubrová, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Adéla Navrátilová, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Leona Ondřejíková, studentka ČVUT, bakalářská práce Bc. Nicol Bernardová, diplomová práce na PřF UK Bc. Veronika Pavlíková, diplomová práce na PřF UK Jana Kučerová, bakalářská práce na Ústavu počítačové a řídící techniky, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha Michaela Švarcová, diplomová práce na Ústavu mikrobiologie, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha Michal Kratochvíl, bakalářská práce programu Forenzní analýza, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha Bc. Dominika Mertová, diplomová práce na Ústavu fyziky a měření, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha Bc. Hana Pilná, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Obhájené bakalářské práce Hana Pilná (školitelka Mělková Z.): Experimentální a klinicky využitelné vakcíny na bázi viru vakcínie, červen Obhájené diplomové práce Kučerová J. (školitel Holada K.) : Úloha exprese buněčného prionového proteinu v diferenciaci neuronálních buněčných linií, červen Postgraduální studium Na našem ústavu pracovalo 12 studentů v rámci doktorského studia z různých biomedicínských oborů (Fyziologie a patofyziologie člověka, Imunologie, Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie, mikrobiologie, biochemie a patobiochemie). Studenti se zúčastňují SVK, jsou spolu se svými školiteli řešiteli grantů GA UK a také se různou formou podílejí na výuce ústavu Školitelé v postgraduálním studiu Seznam studentů podle svých školitelů spolu s biomedicínským oborem, v němž jsou zařazeni: Bobek J. Holada K. školitel v oboru: Mikrobiologie Ing. Klára Šmídová Ing. Dita Šetinová školitel v oboru: Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie 1. LF UK

18 Hrdý J. Hrušková Z. Julák J. Kolářová L. Mělková Z. Pavlík E. Posová H. Mgr. Marcela Filipová Mgr. Zdeňka Hanusová Mgr. Zuzana Fremuntová Mgr. Marie Kostelanská Mgr. Jakub Soukup MUDr. Mgr. Viktor Černý školitelka v oboru: Fyziologie a patofyziologie člověka MUDr. Zdeňka Chocová MUDr. Doubravka Frausová školitel specialista v oboru: Elektrotechnika a informatika Ing. Vladyslava Fantová školitel specialista v oboru: Biochemie a patobiochemie člověka RNDr. Jan Novák školitelka v oboru: Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie, 1. LF UK Prakash Shankaran, MSc. Ing. Michaela Madleňáková školitel specialista v oboru: Experimentální chirurgie MUDr. Eva Nártová školitelka v oboru: Fyziologie a patofyziologie člověka MUDr. Michaela Šafářová (mateřská dovolená) MUDr. Lucia Skáčiková RNDr. Romana Veselá (mateřská dovolená) Obhájené dizertační práce SHANKARAN P. (školitelka Mělková Z.) : Effects of heme arginate in HIV-1 acute infection and in latency reversal Předatestační příprava Pracovníci ÚIM se podíleli na specializační průpravě klinických imunologů a alergologů, infektologů (odborné stáže v ambulancích, přednášky), laboratorních imunologů (zkušební komise), lékařů mikrobiologů (praxe v mikrobiologické laboratoři, zkušební komise). Rovněž pořádali specializační kurzy (viz. 6.1). Lékařská mikrobiologie (Kolářová L., Adámková V.) Zkušební a hodnotící komise - Akreditační komise MZČR pro Alergologii a klinickou imunologii (Posová H.) - Akreditační komise MZČR pro Lékařskou mikrobiologii (Kolářová L., předsedkyně) - Komise IGA MZ ČR (Kolářová L.). - Komise pro obhajobu habilitační práce 1. LF UK (Kolářová L. - předsedkyně). - Komise pro státní zkoušky pro obor Mikrobiologie (NMIKRO), PřF UK (Julák) - Komise pro státní závěrečné zkoušky v navazujícím magisterském studiu biologie, PřF UJEP (Bobek J.) - Komise Studentské vědecké konference VŠCHT v Praze, sekce Fyzika (Julák J.). - Oborová rada doktorského studijního programu v biomedicíně UK: Parazitologie (Kolářová L.); Imunologie (Posová H.). Mikrobiologie (Julák J.) - Oborová rada doktorského studia Infekční biologie na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (Prokešová L.) - Oborová rada doktorského studijního programu Mikrobiologie LF HK (Kolářová L.) - Oborová rada parazitologie UK - Zkušební komise IPVZ MZČR pro získání specializované způsobilosti v oborech: Lékařská mikrobiologie (Kolářová L., Adámková V.);

19 Mikrobiologie (Kolářová L., Adámková V.); Lékařská imunologie (Posová H.). - Zkušební komise MZ ČR akreditovaného kvalifikačního kurzu Odborné zdravotnické laboratorní metody (Posová H., Kolářová L., Stříž I.). - Zkušební komise pro státní závěrečné zkoušky v bakalářském a magisterském studiu FBMI ČVUT v Praze se sídlem v Kladně (Pavlík E.) 4.9. Semináře ÚIM Společné vědecko-výzkumné semináře Ústavu imunologie a mikrobiologie a III. kliniky infekčních a tropických nemocí 1. LF UK v roce 2016: , výjezdní zasedání SVV Špindlerův Mlýn: Filipová M.: Influence of Protein Corona on Toxicity of Carbon Nanotubes in vitro Hanusová Z.: Establishment of Permanently Prion Infected Cell Lines for Studies of Prion Strains in Tissue Cultures Jindrová Z.: Changes in cellular prion protein expression and localization during cell differentiation. Kostelanská M.: Photodynamic inactivation of prions by phthalocyanines Madleňáková M.: Reactivation of latent HIV-1 and study redox-modulating agents help to eliminate latent reservoir Soukup J.: Extracellular vesicles in neurodegeneration 5. VĚDECKO-VÝZKUMNÁ ČINNOST Vědecká činnost ústavu se opírala o studium otázek z mikrobiologické a imunologické oblasti. Výzkum v oblasti mikrobiologie zaměřen na studium biologie mikroorganismů se zvláštním zřetelem na jejich patogenitu, imunitní odpověď hostitelského organismu, produkci antibiotik, rozvoj moderních me-tod umožňujících detekci a identifikaci infekčních agens i na molekulární úrovni s praktickým dopadem na laboratorní diagnostiku, nových metod dezinfekce a sterilizace a v neposlední řadě i na možnosti terapie infekčních onemocnění. Ze specifických výzkumných problematik lze např. jmenovat studium vlastností Helicobacter pylori, chemických a biologických vlastností bakteriálních imunomodulátorů založených na bakteriích Propionibacterium acnes a Bacillus firmus a jejich frakcí s praktickým dopadem na vývoj, výrobu a klinické aplikace registrovaného léčiva imunomodulační vakcíny Corynebacterium parvum, instrumentálních metod chemické analýzy v mikrobiální taxonomii. Studium regulací buněčných pochodů v průběhu diferenciace a produkce antibiotik u bakterií Streptomyces spp. zejména na úrovni regulačních RNA. Virologický výzkum je dlouhodobě zaměřen na studium interakcí viru vakcínie a HIV-1 s hostitelskou buňkou a organismem. V posledních letech to je zejména studium charakteru buněčné smrti buněk infikovaných virem vakcínie a jeho významu pro imunitní odpověď, vývoj myšího modelu eczema vaccinatum a studium jeho patogeneze, a studium vlivu redox modulujících látek na růst a replikaci viru vakcínie a HIV-1. Prionová laboratoř ústavu se věnuje studiu patogeneze prionových chorob a fyziologické úlohy buněčného prionového proteinu. V návaznosti na studium toxicity amyloidových proteinových agregátů je ve spolupráci studována problematika toxicity nanomateriálů. Aplikovaný výzkum prionové

20 laboratoře je zaměřen na vývoj nových laboratorních metod pro diagnostiku neurodegenerativních onemocnění, včetně roztroušené sklerózy a vývoj nových metod inaktivace prionů. V neposlední řadě se ke specifickým výzkumným cílům nově řadí i studie v oblasti biologie helmintárních agens, vedoucí např. k charakterizaci biologických vlastností parazitů a jejich migračních drah v hostitelském organismu. V současné době se ústav zaměřuje i na řešení otázek z oblasti antibiotické rezistence a hledání nových bioaktivních látek. Ve spolupráci s VŠCHT a ČVUT probíhá výzkum dezinfekčního a sterilizačního působení nízkoteplotního plazmatu generovaného elektrickými výboji na různé mikroorganismy. V oblasti imunologie jsou výzkumné cíle zaměřeny na studium vlivu infekčních agens v patogenezi alergií a autoimunit. Ze specifických cílů lze jmenovat např. sledování vlivu farmak na imunologické parametry a možností ovlivnění imunitního systému bakteriemi a jejich složkami. Aplikovaný výzkum vychází z klinické základny ústavu a zaměřuje se na studium vlivu střevní mikroflóry a kolostra na imunitní systém dětí alergických matek a na prevenci alergických chorob molekulárně biologické charakterizace buněk u vybraných autoimunit, klinicky závažných stavů, možností diagnostické prevence (autoprotilátky). Výzkum probíhá v úzké spolupráci s dalšími lékařskými obory (řešení problematiky recidivujících infekcí u pacientů s roztroušenou sklerózou, sledování změn imunitních funkcí vyvolaných vlivy prostředí) Granty Grantové projekty AZV A (Hrdý J. řešitel), Vliv časného postnatálního osídlení novorozenců E. coli na výskyt alergie, vybraných imunologických charakteristik a složení střevní mikrobioty. členky týmu: Prokešová L., Novotná O., Petrásková P. AZV MZ ČR A (Petanová J. hlavní řešitel), Změny imunologické reaktivity u pacientů s recidivujícími aftami. GA UK (Šmídová K. hlavní řešitel), Analýza a mapování vazebných míst transkripčních regulátorů u streptomycet. garant: Bobek J. GA UK (Šetinová D. hlavní řešitel), Identifikace regulačních RNA kontrolujících produkci antibiotik u rodu Streptomyces. garant: Bobek J. GA UK (Novák J. hlavní řešitel), Imunitní odpověď myší při infekcích CNS larvami Toxocara canis. garant: Horák P. GA UK (Kostelanská M. hlavní řešitel), Fotodynamická inaktivace prionů. garant: Holada K. GA UK (Fremuntová Z. hlavní řešitel) Studium funkce buněčného prionového proteinu (PrPC) v 3D in vitro modelu s využitím systému CRISPR/Cas9 garant: Holada K. GA UK (Soukup J. hlavní řešitel) Úloha extracelulárních váčků v přenosu prionové infekce garant: Holada K

21 GA ČR P303/12/1791 (Holada K. hlavní řešitel), Úloha proteázami aktivovaných receptorů v patogenezi prionových chorob. členové týmu: Janoušková O., Moško T., Filipová M., Hanusová Z., Jindrová Z., Hudáková A., Pšeničková A.,Tahtahová B., Kostelanská M., Šafaříková E. UNCE (spoluřešitel Holada K., hlavní řešitel Raška I.), 2016 Struktura, organizace a dynamika chromatinu. členové týmu: Holada K., Moško T., Šafaříková E. SVV (Mělková Z. řešitel), 2016 Studium infekčních chorob a jejich příčinných agens. členové týmu: Holada K., Kolářová L., Posová H., Julák J., Bobek J., Nohýnková E., Chanová M., Hrdý J. AZV A (Holada K. hlavní řešitel), Buněčné mikrovesikuly v diagnostice roztroušené sklerózy. členové týmu: Holada K., Moško T., Pšeničková A., Tahtahová B., Soukup J., Kostelanská M., Jindrová Z. AZV A ( Moško T. spoluřešitel, hl řeš. doc. MUDr. Zbyněk Straňák, CSc. Ústav pro péči o matku a dítě), Diagnostický potenciál buněčných mikropartikulí v patogenezi systémové zánětlivé odpovědi plodu členové týmu: Hujacová A., Pšeničková A., Tahtahová B Výzkumné záměry spolupráce PRVOUK P24 (spoluřešitel Holada K., hlavní řešitel Vokurka M.), Molekulová, buněčná a patofyziologická podstata nemocí. členové týmu: Mělková Z., Bobek J., Hájková V., Shankaran P., Kaplanová M., Filipová M., Hanusová Z., Pšeničková A., Tahtahová B., Šetinová D., Kučerová J., Jindrová Z., Moško T., Kostelanská M., Hujacová A., Fujikura Y., Soukup J., Madleňáková M. PRVOUK P25/LF1/2 (spoluřešitel Kolářová L., hlavní řešitel Škrha J.), Komplikace metabolických chorob. členové týmu: Kolářová L., Prokešová L., Novotná O., Čechová D., Petanová J., Petrásková P., Chanová M., Skáčiková L., Posová H. BIOCEV 0109 BCV (Mělková Z. řešitel), 2016 Studium interakcí viru vakcinie s hostitelem a reaktivace latentního HIV -1. členové týmu: Hájková V., Shankaran P., Fujikura Y., Kaplanová M., Madleňáková M. UNCE (spoluřešitel Kolářová L., hlavní řešitel Tachezy J., PřFUK) Molekulární interakce mezi parazity a hostiteli a nové strategie boje proti parazitálním infekcím Členové týmu: Posová H., Chanová M., Hrdý J., Hrušková Z

22 6. PUBLIKAČNÍ ČINNOST 6.1. Přehled publikační činnosti v letech Články v časopise s IF Články v časopise bez IF Monografie jako celek Kapitoly v monografiích Učebnice jako celek Kapitoly v učebnicích Příručky, manuály, slovníky, encyklopedie, překlady Patenty a užitné vzory Citační ohlasy dle WoS * 250* 228* 243* *Přehled obsahuje pouze citační ohlasy prací dedikovaných 1. lékařské fakultě UK v Praze a publikace s uvedenou adresou Ústavu imunologie a mikrobiologie 1. LF UK a VFN 6.2. Původní odborné práce ADÁMKOVÁ V.: Tigecyklin v otázkách a odpovědích. Antiinfectives News, 7, 1, 5-9. ISSN FUJIKURA Y., KRIJT J., POVÝŠIL C., MĚLKOVÁ Z., PŘIKRYL P, VOKURKA M, NEČAS E: Iron overload causes alterations of E-Cadherin in the liver. Folia Biol (Praha). 2016;62(3): HANUSOVÁ Z., HOLADA K.: Charakterizace úlohy exprese proteinu PAR-2 v myším modelu prionové infekce. Sborník 17. SVK 1.LF UK, 2016 ISBN , nakladatelství Galén., s. 45, stať HANUSOVÁ Z., HOLADA K.: Establishment of Permanetly Prion Infected Cell Lines for Studies of prion Strains in Tissue Cultures. Sborník 13th International Medical Postgraduate Conference, 2016, ISBN , UK, Lékařská fakulta v Hradci Králové, s , stať