Automatizace v klinické mikrobiologii

HTML
DOWNLOAD

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "Automatizace v klinické mikrobiologii"

Vendula Janečková
před 6 lety
Počet zobrazení:

1 Automatizace v klinické mikrobiologii 1Jaroslav Hrabák, 2Pavel Dřevínek 1Ústav mikrobiologie, Biomedicínské centrum, Lékařská fakulta a Fakultní nemocnice v Plzni, Univerzita Karlova 2Ústav lékařské mikrobiologie, 2. lékařská fakulta a Fakultní nemocnice Motol, Univerzita Karlova CHARLES UNIVERSITY

2 Klinická mikrobiologie a její vývoj Pravěk První pozorování mikrobů Antoni van Leeuwenhoek ( ) Souvislost mikrobů a nemocí - období lovců mikrobů Louis Pasteur ( ) Robert Koch ( ) Joseph Lister ( )

Klinická mikrobiologie a její vývoj Klasické kultivační a identifikační techniky Molekulární přístup NGS, hmotnostní spektrometrie Objev

3 Klinická mikrobiologie a její vývoj Klasické kultivační a identifikační techniky Molekulární přístup NGS, hmotnostní spektrometrie Objev a zavedení antibiotik Imunologie, serologie Klinická mikrobiologie Alexander Fleming ( ) Virologie a mykologie Rozvoj nových metod

4 Mikrobiologická diagnostika Virologie Sérologie Molekulární genetika Kultivace Elektronová mikroskopie Parazitologie Mikroskopie Sérologie Molekulární genetika Bakteriologie a mykologie Kultivace Mikroskopie Molekulární genetika Sérologie Hostitel Mikrob Prostředí Infekce

5 Nové diagnostické metody v mikrobiologii Kultivační metody Automatické systémy Analýza obrazu Molekulárně genetické metody Amplifikační techniky Mikročipy Celogenomová sekvenace Funkční metody Hmotnostní spektrometrie Další spektroskopické metody Speciální mikroskopické techniky Průtoková cytometrie

6 AUTOMATIZACE V KLINICKÉ MIKROBIOLOGII IN PRAGUE

7 Automaty a automatizace v klinické mikrobiologii 1. Sérologie Plně automatizovatelné, zajištění standardizace 2. Molekulární genetika Plně automatizovatelné, zajištění standardizace 3. Kultivace včetně testování citlivosti na ATB Automatizovatelné, stále požadavek na odečítajícího pracovníka 4. Mikroskopie Analýzy obrazu?

8 Koncepce mikrobiologie - Marseilles Velká laboratoř - univerzitní nemocnice Důraz na konzultační službu Priority při zpracování vzorků

9 Koncepce mikrobiologie - Marseilles Satelitní POCT laboratoře

10 Jde to dělat i jinak?

11 Upravený koncept mikrobiologie? Mikrobiologie založená na detekci syndromů onemocnění patogenezi (syndrome/disease based microbiology) Současné technické možnosti umožňují změnit koncept klinické mikrobiologie Klinický vzorek Funkční vyšetření vzorku Identifikace patogena Stanovení citlivosti

12 Upravený koncept mikrobiologie? Funkční metody Založené na detekci faktorů patogenity pomocí klasických metod Metody sekvenace DNA / RNA

13 Příklady funkční diagnostiky Průkaz botulotoxinu

14 Příklady funkční diagnostiky Detekce karbapenemáz

15 Sekvenování nové generace Aplikace ve virologii Uplatnění v molekulární epidemiologii Dosud poměrně drahé Pomalé (2-5 dní) Naděje v případě sekvenace třetí generace (několik hodin) Zásadní je interpretace dat potřeba BIOINFORMATIKA, případně speciálních bioinformatických nástrojů

16 Sekvenování nové generace a vyšetření citlivosti Staphylococcus aureus Mycobacterium tuberculosis

17 Sekvenování nové generace ve virologii RNA DNA viry Odběr materiálu intracelulární paraziti

18 Závěr

19 Mikrobiologie budoucnosti? Automatizace je možná v řadě mikrobiologických metodik Kultivační techniky stále zaujímají významnou roli v bakteriologii, ale Koncepce mikrobiologie se bude měnit v souvislosti s rozvojem nových technik, ale především sekvenace DNA/RNA Umožnění detekce faktorů patogenity Identifikace markerů vnímavosti hostitele

20 Výzkumná laboratoř Klinický mikrobiolog

Podobné dokumenty

Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku

B I O M E D I C AL Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku Jaroslav Hrabák CHARLES UNIVERSITY Obsah prezentace Historie, vývoj a trendy