DETEKCE PHYTOPHTHORA CACTORUM A P. CAMBIVORA V PLETIVECH JABLONÍ KLASICKÝMI A IMUNOCHEMICKÝMI METODAMI.
|
|
- Matěj Müller
- před 8 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 JIŘINA KRÁTKÁ, IVA KŘÍŽKOVÁ A DAVID NOVOTNÝ DETEKCE PHYTOPHTHORA CACTORUM A P. CAMBIVORA V PLETIVECH JABLONÍ KLASICKÝMI A IMUNOCHEMICKÝMI METODAMI. METODIKA PRO ÚTVARY STÁTNÍ SPRÁVY Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. 2008
2 Metodika vznikla za finanční podpory Mze ČR a je výstupem projektu č. Mze NAZV QF4074. Metodika je určena pro státní správu. O uplatnění metodiky byla se Státní rostlinolékařskou správu uzavřena smlouva podle ustanovení $269 zákona 513/1991 Sb., obchodního zákoníku. Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., 2008 ISBN:
3 JIŘINA KRÁTKÁ, IVA KŘÍŽKOVÁ A DAVID NOVOTNÝ DETEKCE PHYTOPHTHORA CACTORUM A P. CAMBIVORA V PLETIVECH JABLONÍ KLASICKÝMI A IMUNOCHEMICKÝMI METODAMI. METODIKA PRO ÚTVARY STÁTNÍ SPRÁVY Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. 2008
4 Abstrakt: Detekce Phytophthora cactorum a P. cambivora v pletivech jabloní klasickými a imunochemickými metodami. Metodika konkretizuje a optimalizuje postupy, testy a metody, které umožňují přesnou a rychlou detekci P. cactorum a P. cambivora ve větvích a kmenech jabloních. Jedná se o výběr a optimalizaci vhodných postupů při odběru vzorků, izolaci patogenů, mikrobiologických a mykologických testů a imunochemických metod tak, aby bylo možné stanovit přítomnost/absenci jmenovaných druhů hub v matečných rostlinách jabloní, hrušní a kdouloní jak to žádá certifikační schéma pro matečné rostliny jabloní, hrušní a kdouloní vydané Evropskou a středozemní organizací ochrany rostlin (EPPO). Abstract: Detection of Phytophthora cactorum and P. cambivora in apple tissue by classically and imunochemical methods This methodology concretizes and optimises procedures, tests and methods, which allows precise and quick detection of P. cactorum and P. cambivora in apple branches and stems. The methodology includes choice and optimize of the suitable procedures to sampling, pathogens isolation, microbiological and mycological tests and immunochemical methods. It gives way to determine absence or occurrence of the species in the samples. The methodology is based on requirement of the certification schemes for nuclear stock of Malus, Pyrus and Cydonia issued by European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO). Oponenti: Doc. RNDr. Michal Tomšovský, PhD. a Ing. Eva Zapletalová Metodika je pro útvary státní správy a mohou ji využívat jakékoliv další pracoviště, které jsou vybaveny pro mikrobiologický rozbor vzorků. Metodika byla schválena Ministerstvem zemědělství ČR.
5 ÚVOD Rod Phytophthora patří mezi škodlivé organismy uvedené v certifikačním schématu pro matečné rostliny Malus, Pyrus a Cydonia, ze kterých je získáván množitelský materiál těchto ovocných dřevin. Seznam byl schválen jako samostatný standard Radou EPPO v r Ve schématu jsou uvedeny konkrétní testy pro detekci virů, fytoplasem a viroidů, pro detekci bakterií a hub nejsou metody detekce konkretizovány (Anonymus 1999). Předkládaná metodika se zabývá detekcí dvou patogenních druhů r. Phytophthora na jabloni a to P. cactorum (Leb. et Cohn) Schröt 1886 (Bayerův kód PHYTCC) a P. cambivora (Petri) Buisma 1924 (Bayerův kód - není). Cíl. Předkládaná metodika konkretizuje a optimalizuje postupy, testy a metody, které umožňují přesnou a rychlou detekci P. cactorum a P. cambivora v pletivech jabloní. Jedná se o výběr a optimalizaci vhodných postupů při odběru vzorků, izolaci patogenů, mikrobiologických a mykologických testů a imunochemických metod. Vlastní metodika. 1. Vizuální zjištění příznaků onemocnění Napadení jabloní houbami rodu Phytophthora se projevuje nespecifickými příznaky. Je to celkové zpomalování růstu rostlin, žloutnutí a usychání listů, abnormálně světle zelená barva listů. Dochází ke zpomalení terminálního růstu mladých stromků a tvorba malých plodů. Tyto příznaky se po infekci jabloní r. Phytophthora nemusí projevit nebo mohou být odpovědí na přítomnost jiných škodlivých organismů. Primárně patogen Phytophthora cactorum vyvolává hnilobu plodů, na kmenech stromů krčkovou a límcovou hnilobu (crown and collar rot). Tyto symptomy onemocnění nejsou často viditelné, protože napadená pletiva jsou ukryta pod kůrou. Patogen prorůstá floémem do kambia, pletiva jsou nekrotická, zbarvená do oranžova až červenohnědě, příp. tmavohnědě. Houba vyvolává rovněž hnilobu kořenů, která je také typická červenohnědým nebo červenooranžovým zbarvením kambia a vnitřní strany kůry. Phytophthora cambivora vyvolává límcovou hnilobu kmenů (viz P. cactorum), hnilobu kořenů a nádorovitost kmenů. Podobné nespecifické primární i sekundární symptomy způsobují další druhy rodu Phytophthora, např. P. cinnamomi, P. syringae, P. megasperma. 2. Odběr vzorků Odběr vzorků pro laboratorní analýzy provádíme při prohlídce porostu nebo jednotlivých stromů jabloní v rámci fytosanitární kontroly zaměřené na kontrolu a průzkum výskytu škodlivých organismů. Z kontrolovaných stromů odebíráme vzorky pro mikrobiologické, mykologické a imunochemické stanovení. Odebrané vzorky kořenů a dřeva z báze kmene se symptomy napadení uložíme do mikrotenového sáčku, který pečlivě uzavřeme, aby nedošlo k vyschnutí a kontaminaci vzorků. Sáčky označíme a připojíme: jméno vzorkovatele, jméno a adresu pěstitele, lokalitu, druh a odrůdu dřeviny, datum sběru. Vzorky co nejdříve dopravíme do diagnostické laboratoře. Vzorky
6 odebíráme i ze stromů, kde nebyly zjištěny symptomy napadení na kořenech nebo na bázi kmenů, ale bylo pozorováno usychání listů a zakrnění plodů. Odebrané vzorky ukládáme v laboratoři do lednice. Jejich zpracování je nutné provést do 24 hodin, maximálně do 48 hodin. 3. Izolace a kultivace patogenů Patogeny se izolují po povrchové dezinfekci (5 % vodný roztok chlornanu sodného 3 minuty a následně 3 krát opláchnout sterilní destilovanou vodou) z odebraného vzorku. Po povrchové dezinfekci se odebrané pletivo sterilně přenese na agarové živné medium v Petriho miskách pomocí vysterilizovaných skalpelů a pinzet. Vhodná média jsou: Czapek-Dox agarové médium, Hohlovo agarové medium nebo bramborový agar (viz Příloha). Takto zpracované vzorky se umístí do kultivačního boxu při teplotě ºC. Po 4-5 dnech je nutné kultury prohlédnout, mycelium narostlých hub vyizolovat na nově připravené agarové medium v Petriho miskách. Tento postup je potřeba několikrát opakovat. Zároveň je nutné připravit z rostoucího mycelia jednotlivých hub mikroskopické preparáty pro identifikaci a prohlédnout pod mikroskopem při použití objektivů zvětšujících krát. Při izolaci a první fázi čištění kultur je vhodné použít Czapek Dox agarové médium, v další fázi kultivace Hohlovo agarové médium nebo bramborový agar. V případě, že nelze jednoznačně stanovit přítomnost P. cactorum nebo P. cambivora na základě morfologických znaků, především při absenci tvorby sporangií na Hohlově mediu, příp. i oospor v pěstované kultuře, je nutno použít selektivní média, Doporučujeme použít mrkvové, které se rychle a snadno připravuje a je cenově nejpřijatelnější. V případě, že není dosaženo cíle, tzn. netvoří se sporangia příp. oospory, je nutné použít další selektivní média v pořadí, jak jsou dále vyjmenovaná: ovesné, glukozo-asparaginové, V8 Juice (viz Příloha). Uvedená média se používají buď s agarem (agarové plotny) nebo tekutá (bez agaru) a kultivace je stacionární. 4. Mikroskopická identifikace patogenů, morfologie sledovaných patogenů Identifikace hub je prováděna na základě vyhodnocení morfologických znaků. V případě sledovaných patogenů jsou vyhodnocovány především tvar a velikost sporangií, přítomnost papily u sporangií, tvar a velikost oogonií, antheridií, přisedání antheridia k oogoniu a velikost a tvar oospor. Phytophthora cactorum Sporangia mají výraznou, terminálně položenou papilu, jejíž tvar může být zcela elipsoidní, ale také oválný až kulovitý. Sporangia mají přechodně krátké stopky (kratší než 4 µm). Sporangia mají rozměry 31,4 ± 4,8 x 26,4 ±4,0 µm. Chlamydospory se tvoří někdy, nebo jen u některých izolátů, často je jejich tvorba ovlivněna takovými podmínkami, jako je izolace z určitého hostitele použití specifického média, nebo teploty při kultivaci (např. se netvoří na bramborovém nebo hrachovém médiu). Jejich velikost je velmi variabilní (25 39,5 µm) a proto při identifikaci houby se nepoužívají. Houba je monothalická. Oogonia mají hladkou stěnu, tloušťka 2 µm, jsou hyalinní, kulovité, velikost µm. Oospory vyplňují celé oogonium (obr. č. 1). Minimální teplota pro růst je 2 ºC, optimum 25 ºC a maximum 31 ºC. Kolonie pěstované houby při 25 ºC na ovesném agaru jsou bílé, nevýrazné, radiální, kompaktní bez jednoznačného ohraničení, načechrané, ale ne husté s krátkými vzdušnými hyfami. Na ovesném agaru nebo na mrkvovém agaru se tvoří oospory nejvíce. Při stacionární kultivaci v Rouxových
7 láhvích P. cactorum na Hohlově mediu vytváří bílé až krémově-bílé kolonie. Optimální podmínky pro kultivaci je teplota 25 C a bez osvětlení. Obrázek č. 1. Phytophthora cactorum: Sporangium s papilou, klíčící oospora produkující sporangia, mycelium, oogonium s oosporou a antheridiem (kresba dle A. Vizari) Phytophthora cambivora Sporangia nemají papilu, tvar sporangií je variabilní od oválného až po elipsoidní, naspodu dobře zakulacené, rozměry jsou variabilní, ovlivněné použitým médiem a případně i hostitelem, ze kterého byla houba vyizolována: délka µm, šířka µm. Sporangiofory jsou jednoduché, nevětvené. Houba je heterothalická. Oogonia jsou kulovitá, velikost µm, stěna je na povrchu bradavičnatá (puchýřnatá), tloušťka 2 µm. Oospory vyplňují zcela, nebo částečně oogonium, velikost µm (obr. č. 2). Minimální teplota pro růst je 2 ºC, optimum ºC a maximum 32 ºC. Kolonie jsou při teplotě 25 ºC na ovesném agaru bílé, nevýrazné, nízké, mycelium je koraloidní, u staršího mycelia lze najít septa, kolonie se rozrůstají na pevném médiu hvězdicovitě až rovnoměrně, mycelium má většinou vzdušné hyfy. Na ovesném agaru nebo na mrkvovém agaru se tvoří oospory nejvíce. Při stacionární kultivaci v Rouxových lahvích P. cambivora na Hohlově mediu vytváří bílé až krémově-bílé kolonie. Optimální podmínky pro kultivaci jsou při teplotě 25 C a bez osvětlení.
8 Obrázek č. 2. Phytophthora cambivora: sporangium bez papily, produkce nového sporangia, bradavičnaté (puchýřnaté) oogonium s dvoubuněčným antheridiem. (Kresba dle A. Vaziri) 5.Příprava a zpracování odebraného vzorku pro detekci pomocí imunochemických testů Skalpelem oloupeme kůru, lýko a povrchovou vrstvu dřeva a vzorek zvážíme. Poté kousky pletiva rozdělíme na menší a vložíme do selektivního média pro předinkubaci (viz Příloha) k nasáknutí (cca na 1 hodinu). Pak slijeme (filtrujeme) a dáme do vlhké komůrky (sterilní Petriho miska se suchým filtračním papírem). Pokud odkapané selektivní médium z kousků pletiva nezvlhčí filtrační papír dostatečně, přidáme 0,5 1 ml selektivního média. Inkubujeme 3 dny při teplotě C. Poté kousky pletiva zvážíme, rozstříháme nůžkami na drobnější a drtíme ve třecí misce s pomocí tekutého dusíku nebo mořského písku. Vzorek extrahujeme v PBS (3 ml/g pletiva, ale zohledníme množství vody, které se do kůry nasáklo ze selektivního média) po 24 hod. při 4 ºC. Centrifugací (4020 g, 10 min, 0 C) oddělíme supernatant od peletu, supernatant buď ihned testujeme, anebo zamrazíme (nejlépe při -45 C nebo nižší teplotě). 6. Detekce patogenů P. cactorum a P. cambivora pomocí ELISA Nepřímá PTA-ELISA na mikrotitrační destičce 1. Aplikován antigen nebo extrakt ze vzorku - ředění: bikarbonátový pufr ph 9,6, nebo PBS, objem: 100 µl / jamku, inkubace: 25 C, 3 h nebo přes noc v lednici.
9 2. Promytí - promývací roztok (PBS s Tweenem), celkem promývání 3-krát po 5 minutách, na závěr z desky vyklepat zbylou tekutinu. 3. Blokace - blokační pufr, množství 200 µl / jamku, inkubace 30 minut při 25 C 4. Promytí - ad Primární protilátka anti-p.cactorum ředění v blokačním pufru: ředíme IgG na koncentraci 0,75 µg/ml, množství: 100 µl/jamku, inkubace: 25 C, 3 hodiny nebo přes noc v lednici. 6. Promytí - ad Konjugát - značený alkalickou fosfatázou (anti-rabbit IgG-AP), ředění v promývacím pufru, koncentrace 250 mu, množství: 100 µl / jamku, inkubace: 25 C, 3 h nebo přes noc v lednici. 8. Promytí - ad Substrát - p-nitrofenylfosfát 1 mg/1 ml substrátového pufru (smíchat těsně před použitím), množství: 100 µl / jamku, inkubace minut. 10. Zastavení reakce: 50 µl / jamku 3 mol / ln NaOH (120 g/1000 ml) tento krok není nutný. 11. Změřit absorbanci při 405 nm na ELISA-readeru. Dot-blot Všechny kroky metody provádíme v jedné vaničce za pokojové teploty a mírného třepání. Nitrocelulózová membrána musí být ve všech používaných roztocích ponořena, po každém kroku postupu se použitý roztok vylije. Ilustrační fotka nitrocelulózové membrány po provedeném testu (obr. č. 3). 1) Kapku extraktu (2 l) opatrně kápneme na membránu podle dopředu stanoveného schématu (dot-blot). 2) Do 15 ml blokačního pufru (2 % BSA v PBS), třepání 1 hod. 3) Slít, dát primární protilátku anti-p.cactorum ředěnou v blokačním pufru (IgG ředíme na koncentraci 0,75 µg/ml), třepání 1 hod. 4) 3 krát promýt v PBS (3 x 3 min.). 5) Nalít 0,01 M Tris-NaCl, ph 8,1 a 3 min. na třepačce, vylít. 6) 0,01 M Tris NaCl, ph 8,1 + konjugát anti-rabbit IgG AP (dle doporučení výrobce, 500 U/ml nebo 2000 x ředěno), třepat ½ hodiny na třepačce, vylít. 7) 3 x promýt 0,01 M Tris-NaCl, ph 8,1 (3 x 3 min. na třepačce). 8) 2 x promýt 0,1 M Tris-NaCl, ph 8,1 + MgCl2 (0,102 g MgCl2.6 H2O na 100 ml Tris = 0,5 mm ), vylít. 9) Nalít substrát, 10 ml/desku (200 l NBC/BCIP Stock Solution do 10 ml Tris+MgCl2), sledovat vývoj zabarvení (na třepačce), vylít. 10) Zastavit v H2O (několikrát promýt).
10 Obrázek č. 3. Test dot-blot provedený na nitrocelulózové membráně (jako kalibrační křivka použit immunogen). Detekce patogenů r. Phytophthora provedena v přirozeně infikovaných stromcích z komerčního sadu (vzorky s označením s byly předinkubovány v selektivním médiu). Hodnocení testů Výsledky imunotestů jsou porovnány s pozitivní kontrolou, kterou může být buď kalibrační křivka koncentrací antigenu, nebo pletivo hostitelské rostliny, které bylo úspěšně inokulováno a prokazatelně infikováno patogenem. Do každého testu je třeba zařadit negativní kontrolu (pletivo z několika prokazatelně nenapadených rostlin), která stanoví prahové hodnoty při prováděném testování. Na základě absorbance dostatečného počtu negativních kontrol (cca 10 měření) stanovíme detekční limit testu (detekční limit = průměr negativních vzorků + 3* jejich směrodatná odchylka). Hodnota detekčního limitu je nejnižší hodnota absorbance, od které je vzorek hodnocen jako pozitivní. Upozornění Připravená polyklonální protilátka pro detekci P. cactorum a P. cambivora je uložena ve Sbírce mikroorganismů a protilátek oddělení mykologie, Odbor rostlinolékařství, VÚRV, a jsou k dispozici pro referenční a diagnostické laboratoře SRS. Použitá kultivační média a pufry viz Příloha Srovnání novosti postupů oproti původní metodice, případně jejich zdůvodnění, pokud se bude jednat o novou neznámou metodiku ( 2, odst. 1, písm. a, bod 2 zákona č. 130/2002 Sb.). Předkládaná metodika obsahuje postupy vhodné pro využití klasických a imunochemických testů a metod, které umožňují detekci r. Phytophthora v hostitelských rostlinách jabloně a které jsou popisovány často jen jednotlivě v různých publikacích, knihách nebo příručkách. Použití imunochemických testů a klasických metod zvyšuje spolehlivost určení přítomných patogenů v hostiteli. V ČR nebyla doposud vypracována metodika pro detekci r. Phytophthora v ovocných dřevinách.
11 Metodika, která koresponduje s předkládanou metodikou byla vydána v r Krátká J., a kol.: Phythophthora fragariae a Colletotrichum acutatum - karanténní houbové patogeny jahodníku (identifikace a diagnostika). UZPI, Praha, zemědělské informace 9/2001, 15 p. Závěr Kombinace imunochemických a klasických metod zvyšuje spolehlivost určení přítomných patogenů r. Phytophthora v hostiteli. Pro detekci P. cactorum nebo P. cambivora je použití klasického postupu, (tzn. izolace z pletiva hostitele, kultivace na médiu a hodnocení pod mikroskopem) spolehlivé, ale časově a technicky náročné. Při izolaci v první fázi kultivace je nejlepší Czapek Dox agarové medium, pro další čištění a kultivaci Hohlovo nebo bramborové agarové médium. Hohlovo médium stimuluje u obou druhů r. Phytophthora především tvorbu sporangií, mrkvové médium tvorbu oogonií, antheridií a oospor. Pokud ke sporulaci na jmenovaných médiích nedochází, použijí se další uvedená agarová média (ovesné, glukozo-asparaginové, V8 Juice) a to agarová i tekutá. Pokud vyizolované kultury nesporulují, nelze jednoznačně detekovat přítomnost r. Phytophthora v pletivu hostitele. Je proto potřeba použít imunotesty. Nejvhodnější je ELISA a to jak na mikrotitračních destičkách tak dot blot. Použití imunochemické metody pro detekci r. Phytophthora v pletivu hostitele je rychlé a jednoznačné, ale ve srovnání s klasickým postupem je finančně náročné. Používané protilátky jsou rodově specifické, nelze rozlišit druh P.cactorum od P. cambivora. Popis uplatnění metodiky, pro koho je určena, jakým způsobem bude uplatněna. Předkládaná metodika je určena pracovníkům Státní rostlinolékařské zprávy, kteří se zabývají diagnostikou houbových patogenů v zemědělských komoditách, pracovníkům, kteří se zabývají certifikací ovocných stromů a pracovníkům vysokých škol, kteří se zabývají obdobnou problematikou. Seznam použité související literatury ANONYMUS (1999): Normes OEPP. EPPO Standards. Certification schemes. Pathogentested material of Malus, Pyrus and Cydonia. EPPO Bulletin 29(3): ERWIN D.C., RIBEIRO O. K. (1996): Phytophthora Diseases Worldwide. APS Press, St. Paul, Minnesota, 562 p. GALLEGLY M. E., Hong Ch. (2008): Phytophthora: identifying species by morphology and DNA fingerprints. - APS Press, St. Paul, 158 pp. JONES A. L., ALDWINCKLE H. S. (1990): Compendium of Apple and Pear Diseases. APS Press, St. Paul, 125 pp. HARLOW E., LANE D. (1999): Using antibodies: a laboratory manual. Cold Spring Harbor, NY, 495 pp. Seznam publikací, které předcházely metodice a byly publikovány (pokud existují), případně výstupy z určité znalosti, jestliže se jedná o originální práci.
12 KRÁTKÁ J., KYNĚROVÁ B., SÝKOROVÁ S., PODANÁ M. (1996): The diagnosis of Phytophthora sp. by polyclonal antibodies - observation of antibodies specificity. Ochrana Rostlin, 32: PEKÁROVÁ B., KRÁTKÁ J., SLOVÁČEK J. (2001): Utilization of immunochemical methods to detect Phytophthora fragariae in strawberry plants. Plant. Prot. Sci., 37: KŘÍŽKOVÁ-KUDLÍKOVÁ I., KRÁTKÁ J., PEKÁROVÁ B. (2003): Utilization of immunochemical methods for detection of Phytophthora spp. in apple trees, In: Abstracts of Offered Papers from 8th International Congress of Plant Pathology, Christchurch, New Zealand, 2-7 February 2003 Finančně hrazeno projektem NAZV QF 4074.
13 Příloha Kultivační média a pufry. Bramborový agar V 1 litru destilované vody vaříme 20 minut 250 g. oloupaných na kostičky nakrájených brambor. Uvařené brambory přefiltrujeme přes gázu a filtrát doplníme destilovanou vodou na 1000 ml, přidáme 10 g glukózy a 20 g agaru, upravíme ph na 4,5-5,2 (10 % Na2CO3, resp. 1M HCl). Sterilizujeme 30 min. při 105 0C a po 24 hod. sterilizaci opakujeme. Ještě teplou půdu rozlijeme do Petriho misek nebo zkumavek, po zatuhnutí uchováváme v lednici. Před použitím vytemperujeme na laboratorní teplotu. Abychom zabránili zbakterizování půdy v prvních fázích izolace houby ze vzorku, přidáváme těsně před rozlitím na misky do půdy antibiotika ( U.I. jednotek penicilinu nebo 200 mg streptomycinu /1000 ml média, nebo před poslední sterilizací média přidáme bengálskou červeň (10 ml / 1000 ml média). Příprava roztoku bengálské červeně: 0,5 g. práškové bengálské červeně rozpustit v malém množství lihu a nalít do 150 ml destilované vody. Czapek Dox agar destilovaná voda 1000 ml sacharóza 30 g KH2PO4 1g MgSO4.7H2O 0,5 g FeSO4. 7H2O 0,01 g KCl 0,5 g NaNO3. 2,0 g ph upravíme na 6,0-6,2 (1M HCl resp 1M NaOH) agar 20 g Sterilizujeme 2 krát a to pokaždé 20 minut při 105 0C Hohlovo médium V 1000 ml destilované vody postupně rozpustíme Na2CO3 3,0 g K2HPO4 1,0 g MgSO4.7H2O 0,5 g KCl 0,5 g CaCl2.H2O 0,2 g FeSO4.7H2O 0,01 g FeCl3.6H2O 0,0016 g ZnCl2 0,001 g EDTA 0,001 g thiamine HCl 0,0003 g guanin 0,05 g asparagin.h2o 0,13 g histidin HCl 0,19 g serin 0,05 g leucin 0,065 g cystein 0,065 g sacharosa 30 g
14 k připravenému roztoku se následně přidá lecitin a sterol rozpuštěné v horkém Tween 20 (asi ve 2 ml) lecitin 0,2 g sterol (β-sistosterol) 0,05 g ph se upraví na cca ph 6,5 agar 20 g 0 Sterilizace 2 krát při 100 C 45 minut. Ovesný agar ovesné vločky agar destilovaná voda 30 g 20 g 1000 ml Vločky vaříme 20 min., přefiltrujeme, doplníme do 1000 ml, autoklávujeme při 121 C 15 min. Mrkvový agar V 500 ml destilované vody se vaří 40 minut 200 g nastrouhané mrkve, poté se přefiltruje přes gázu (několik vrstev) a v případě, že nebyly odstraněny zbytky vařené mrkve, se ještě odstředí při 4000 rpm. Získaná šťáva se doplní do 1000 ml destilovanou vodou, přidá se 20 g agaru a sterilizuje se při 121 0C 20 min 2 krát po 24 hodinách. Glukozo-asparaginový agar glukosa 5g asparagin 0,1 g KH2PO4 0,5 g MgSO4.7H2O 0,0005 g Fe(NO3)3..9H2O 0,0001 g ZnNO3.7H2O 0,0002 g CaCl2.2H2O 0,01 g CuSO4.5H2O 0,00002 g MnSO4.H2O 0,00005 g thiamin HCl 0,001 g destilovaná voda 1000 ml β-sistosterol (rozpustit v etheru a přidat k roztoku) 10 g. ph upravit na ph 6,0 (1N KOH resp. 1M H2SO4) před přidáním agaru (20 g). sterilizace 2-krát při 111 0C 25 minut. V8 Juice agar V8 Juice (354 ml) pufrovat pomocí 5 g CaCO3,míchat několik minut na míchačce, odstředit při 4000 rpm a supernatant smíchat v poměru 1:4 s destilovanou vodou. Přidat β-sistosterol (rozpuštěný v etheru) 0,2 g/ 1000 ml vody, upravit ph na 7,0 (1 N KOH), přidat agar - 20 g/ 1000 ml vody. Sterilizace 2 x při 121 0C, 20 minut Selektivní médium pro předinkubaci vzorků podezřelých z napadení r. Phytophthora:
15 benomyl 100 mg/l lecitin 0,2 g/l β-sitosterol 50 mg/l thiamin HCl 3 mg/l sacharoza 10 g/l ampicillin 100 mg/l V destilované vodě rozpustíme benomyl, thiamin HCl a sacharózu. Steroly (lecitin a βsistosterol) rozpustíme v horkém Tweenu 20 (ne více než 2 ml na litr média). Tween se přivede k varu a pak se přidají steroly a rozmíchají. Doplníme objem do jednoho litru. Ampicillin přidáváme až po autoklávování (20 min, 120 C) a těsně před použitím (po rozpuštění po více než 24 hod. výrazně klesá účinnost). Pokud chceme pevné médium (např. pro reizolace), přidáváme 40 g agaru/l (takto tuhý agar by měl eliminovat růst kolonií bakterií). PBS pufrovaný fyziologický roztok NaCl 8,0 g KH2PO4 0,2 g Na2HPO4.12H2O 2,9 g KCl 0,2 g Doplnit do 1 litru destilovanou vodou, adjustovat na ph 7,2-7,4 Blokační pufr 1 % BSA (bovine serum albumin )v PBS Bikarbonátový pufr Na2CO3 1,59 g NaHCO3 2,93 g NaN3 0,2 g Doplnit do 1000 ml destilovanou vodou, upravit ph = 9,6 Promývací pufr PBS s přídavkem Tween 20, 0,5 ml v 1000 ml Substrátový pufr diethanolaminu (C4H11NO2) 97 ml MgCl2 x 6 H2O 100 mg NaN3 0,2 g destilovaná voda 800 ml ph nastavíme pomocí HCl 36-37% na ph 9,8 a doplníme do 1000 ml destilovanou vodou nebo použít hotový pufr od Loewe Biochemica, katalog. č. D-82054
16 Autoři: RNDr. Jiřina Krátká DrSc., Mgr. Iva Křížková Ph.D, RNDr. David Novotný Ph.D. Název: Detekce Phytophthora cactorum a P. cambivora v pletivech jabloní klasickými a imunochemickými metodami. Vydal: Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Drnovská 507, Praha 6 Ruzyně ve Výzkumném ústavu zemědělské techniky, v.v.i., Drnovská 507, Praha 6 - Ruzyně Sazba a tisk: Výzkumný ústav zemědělské techniky, v.v.i., Drnovská 507, Praha 6 - Ruzyně Náklad: 20 ks Metodika je veřejně přístupná na adrese Vyšlo v roce 2008 Vydáno bez jazykové úpravy Kontakt na autora: novotny@vurv.cz Autor titulní fotografie: RNDr. David Novotný Ph.D. Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., 2008 ISBN: Vydal Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. ve Výzkumném ústavu zemědělské techniky, v.v.i., 2008
OPTIMALIZOVANÝ POSTUP PRO DETEKCI GLOMERELLA CINGULATA VE VĚTVÍCH A KMENECH JABLONÍ POMOCÍ MIKROBIOLOGICKÝCH METOD.
DAVID NOVOTNÝ, IVA KŘÍŽKOVÁ A JIŘINA KRÁTKÁ OPTIMALIZOVANÝ POSTUP PRO DETEKCI GLOMERELLA CINGULATA VE VĚTVÍCH A KMENECH JABLONÍ POMOCÍ MIKROBIOLOGICKÝCH METOD. METODIKA PRO ÚTVARY STÁTNÍ SPRÁVY Výzkumný
VíceOPTIMALIZOVANÉ POSTUPY PRO DETEKCI PEZICULA ALBA A P. MALICORTICIS V PLETIVECH JABLONÍ POMOCÍ IMUNOCHEMICKÝCH METOD.
IVA KŘÍŽKOVÁ, DAVID NOVOTNÝ A JIŘINA KRÁTKÁ OPTIMALIZOVANÉ POSTUPY PRO DETEKCI PEZICULA ALBA A P. MALICORTICIS V PLETIVECH JABLONÍ POMOCÍ IMUNOCHEMICKÝCH METOD. METODIKA PRO ÚTVARY STÁTNÍ SPRÁVY Výzkumný
VícePlísně rodu Phytophthora ve školkách v ČR a doporučené postupy pro pěstování a produkci zdravého sadebního materiálu
Plísně rodu Phytophthora ve školkách v ČR a doporučené postupy pro pěstování a produkci zdravého sadebního materiálu Phytophthora spp Phytophthora (Eukaryota: SAR supergroup: Oomycetes), Druhy monofágní
Více1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru
Protokol č.: F1-4 Datum: 20.12.2010 Metodika: analýza efektivity přípravy výběr z výsledků ze zkušebních provozů výroby antigenů. Vypracoval: Ing. Václav Filištein, Mgr. Tereza Chrudimská, Spolupracující
VíceS filtračními papíry a membránou je nutno manipulovat pinzetou s tupým koncem.
Western Blotting Příprava blotovacího sendviče... 1 Blotování... 2 Kontrola přenesení proteinů na membránu... 2 Blokování membrány... 2 Aplikace protilátek... 2 Vizualizace... 3 Vyvolání filmu... 4 Chemikálie
VíceANALÝZA MARKERŮ OXIDAČNÍHO POŠKOZENÍ DNA, PROTEINŮ A LIPIDŮ PO IN VITRO APLIKACI LÁTEK NA BUNĚČNÉ KULTURY HEL a A549
ANALÝZA MARKERŮ OXIDAČNÍHO POŠKOZENÍ DNA, PROTEINŮ A LIPIDŮ PO IN VITRO APLIKACI LÁTEK NA BUNĚČNÉ KULTURY HEL a A549 O B S A H 1. Aplikace testovaných látek na buněčné kultury 2. Oxidační poškození DNA
VíceNávod a protokol k praktickým cvičením z lékařské biochemie
Datum... Jméno... Kroužek... Návod a protokol k praktickým cvičením z lékařské biochemie Téma: Vybrané imunochemické metody 1. Úloha Imunoprecipitační křivka lidského albuminu a stanovení Princip: koncentrace
VíceVšechna agarová média se sterilizují v autoklávu při 121 C po dobu 15 minut (při tlaku 1,2.10 5 Pa).
Média pro identifikaci mikroskopických hub Všechna ová média se sterilizují v autoklávu při 121 C po dobu 15 minut (při tlaku 1,2.10 5 Pa). AFPA Aspergillus flavus/parasiticus médium (Aspergillus flavus
VíceNÁVRH METODIKY PRO TESTOVÁNÍ ODOLNOSTI STAVEBNÍCH HMOT PROTI NAPADENÍ PLÍSNĚMI
NÁVRH METODIKY PRO TESTOVÁNÍ ODOLNOSTI STAVEBNÍCH HMOT PROTI NAPADENÍ PLÍSNĚMI PROPOSAL OF METHODOLOGY FOR TESTING RESISTANCE OF BUILDING MATERIALS AGAINST MOLD INFESTATION Ilona Kukletová, Ivana Chromková
VíceProtokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze
1 Popis vzorku Podle protokolu č. 04 lze vyšetřit vzorky různých druhů masných výrobků na přítomnost pšeničné bílkoviny. 2 Detekční limit vyšetření Přítomnost pšeničné bílkoviny lze spolehlivě prokázat,
VíceIZOLACE A IDENTIFIKACE PLÍSNÍ
IZOLACE A IDENTIFIKACE PLÍSNÍ MARCELA PEJCHALOVÁ Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra biologických a biochemických věd Centralizovaný rozvojový projekt MŠMT č. C29: Integrovaný systém
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KVASINEK RODU SACCHAROMYCES
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU KVASINEK RODU SACCHAROMYCES 1 Rozsah a účel Metodika slouží ke stanovení počtu probiotických kvasinek v doplňkových látkách, premixech a krmivech.
VíceWestern blotting. 10% APS 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl
Western blotting 1. Příprava gelu složení aparatury hustotu gelu volit podle velikosti proteinů příprava rozdělovacího gelu: 10% 12% počet gelů 1 2 4 1 2 4 objem 6 ml 12 ml 24 ml 6 ml 12 ml 24 ml 40% akrylamid
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS 1 Rozsah a účel Postup slouží ke stanovení počtu probiotických bakterií v doplňkových látkách, premixech
VíceFytopatologická praktika
Fytopatologická praktika 1 Náplň předmětu Metody diagnostiky původců chorob dřevin Ing. Dagmar Palovčíková Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018
Více1) Název SOP-CCT-CYANOTOX-ELISA Stanovení microcystinů s využitím ELISA
1) Název SOP-CCT-CYANOTOX-ELISA Stanovení microcystinů s využitím ELISA 2) Autor Lucie Bláhová, Luděk Bláha a kol. (Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny, Botanický ústav AVČR a VC RECETOX PřF MU,
VíceQH71273. Výzkum nekrotrofních patogenů z r. Phytophthora na ekonomicky významných listnatých dřevinách
QH71273 Výzkum nekrotrofních patogenů z r. Phytophthora na ekonomicky významných listnatých dřevinách Podprogram 1 Efektivní postupy v agrárním sektoru Výzkumný směr 12 - Ochrana zdraví rostlin a zvířat
VíceTkáňové kultury rostlin. Mikropropagace
Tkáňové kultury rostlin Mikropropagace IN VITRO KULTURY (EXPLANTÁTOVÉ KUTLURY, ROSTLINNÉ EXPLANTÁTY) Izolované rostliny, jejich orgány, pletiva či buňky pěstované in vitro ve sterilních podmínkách Na kultivačních
VíceN217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie
ÚSTAV TECHNOLOGIE VODY A PROSTŘEDÍ N217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie Název úlohy: Hydrobiologie: Stanovení koncentrace chlorofylu-a Vypracováno v rámci projektu: Inovace a restrukturalizace
Více167 ml Folinova činidla doplníme do 500 ml destilovanou vodou. Toto činidlo je nestabilní, je nutné připravit vždy čerstvé a uložit při 4 C.
ROZTOKY 1. Činidlo A 12,5 g (NH 4 ) 6 MO 7 O 4. 4H 2 O rozpustíme ve 125 ml bidestilované vody; 0,5 g K(SbO)C 4 H 4 O 6. 0,5 H 2 O rozpustíme ve 20 ml bidestilované vody; Oba tyto roztoky důkladně promícháme
VíceOvěřená technologie 4782/2017
Ověřená technologie 4782/2017 Výroba setu ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Enterococcus spp. Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního
VíceHodnocení pekařského droždí
Hodnocení pekařského droždí Čistá mikrobiální kultura kvasinek Saccharomyces Cerevisiae Hanzen Vyrábí se aerobní fermentací melasové zápary Díky kvasným schopnostem zajišťují kvasinky nakynutí těsta ovlivňují
VíceIMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE CYTOMEGALOVIROVÉ INFEKCE
INFEKČNÍ SÉROLOGIE Virologie IMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE CYTOMEGALOVIROVÉ INFEKCE Cytomegalovirus ELISA soupravy jsou určeny ke stanovení specifických protilátek třídy IgA, IgG a IgM v lidském
VíceSDS-PAGE elektroforéza
SDS-PAGE elektroforéza Příprava gelu... 1 Recept na 0.75 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Recept na 1.5 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Příprava vzorku... 3 Elektroforéza... 3 Barvení gelů Blue Silver... 4 Chemikálie
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení ochratoxinu A v krmivech. 1 Ochratoxin A patří mezi
VíceMagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B
MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B Kat. č. ZP02012 Doba zpracování: 45-60 minut pro MagPurix 12S 45-65 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction
VíceOPTIMALIZACE PROCESU KULTIVACE ZELENÝCH ŘAS S VYUŽITÍM DIGESČNÍCH ZBYTKŮ ZE ZEMĚDĚLSKÝCH BIOPLYNOVÝCH STANIC. Ing. Pavla Hrychová
OPTIMALIZACE PROCESU KULTIVACE ZELENÝCH ŘAS S VYUŽITÍM DIGESČNÍCH ZBYTKŮ ZE ZEMĚDĚLSKÝCH BIOPLYNOVÝCH STANIC Ing. Pavla Hrychová Cíl Optimalizace růstu zelené řasy Scenedesmus cf. acutus v připravených
VíceFunkční vzorek 5456/2017. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Enterococcus spp.
Funkční vzorek 5456/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Enterococcus spp. Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního lékařství,
VíceVybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Vybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka 2018/19 Obsah 1.
VíceOBOROVÁ SPECIFIKACE Březen 2010
OBOROVÁ SPECIFIKACE Březen 2010 Praní Hygienicko-epidemiologické kontroly v prádelně OS 80-05 Předmluva Vydávání oborových specifikací Textilním zkušebním ústavem (Centrum technické normalizace) bylo odsouhlaseno
VíceProtokoly Transformace plasmidu do elektrokompetentních buněk BL21 Pracovní postup:
Protokoly Pracovní potřeby, pufry a chemikálie jsou uvedeny na konci protokolu. Pracovní postupy jsou odvozeny od těchto kitů: Champion pet160 Directional TOPO Expression Kit with Lumio Technology (Invitrogen)
VíceInkubace enzymů se substráty
Inkubace enzymů se substráty Inkubace redukčních enzymů... 1 Inkubace oxidačních enzymů... 2 Extrakce látek z inkubační směsi... 2 Příprava vzorků k HPLC/UHPLC detekci... 3 Chemikálie a roztoky... 4 Substráty...
VíceMYKOLOGICKÁ ANALÝZA POTRAVIN
MYKOLOGICKÁ ANALÝZA POTRAVIN a. Souhrn V roce 2011 byl ukončen druhý dvouletý cyklus nově uspořádaného Monitoringu dietární expozice člověka a tím i pozměněného projektu "MYKOMON". Vzhledem k detailnějšímu
VíceSTANOVENÍ MYKOTOXINŮ V OBILOVINÁCH METODOU ELISA
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ MYKOTOXINŮ V OBILOVINÁCH METODOU ELISA 1 Účel a rozsah Metoda specifikuje podmínky pro stanovení přítomnosti, případně obsahu jednotlivých mykotoxinů metodou
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - ZEARALENON
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - ZEARALENON 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení zearalenonu v krmivech. 1 Zearalenon (ZON) je charakterizován
VíceZkouška inhibice růstu řas
Zkouška inhibice růstu řas VYPRACOVALI: TEREZA DVOŘÁKOVÁ JINDŘICH ŠMÍD Porovnáváme : Zkouška inhibice růstu sladkovodních řas Scenedesmus subspicatus a Senastrum capricornutum : sekce C.3. Zkouška inhibice
Víceing. Petr Komínek, Ph.D. Metodika stanovení rozšíření virů révy vinné ve výsadbách v ČR METODIKA PRO ÚTVARY STÁTNÍ SPRÁVY
ing. Petr Komínek, Ph.D. Metodika stanovení rozšíření virů révy vinné ve výsadbách v ČR METODIKA PRO ÚTVARY STÁTNÍ SPRÁVY Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. 2012 Metodika pro útvary státní správy
VícePoužití v laboratorních podmínkách
Použití v laboratorních podmínkách Obsah Velcorin použití v laboratorních podmínkách Strana 3 5 Úvod Strana 3 Bezpečnostní opatření Strana 3 Pracovní postup (senzoricky) Strana 4 Pracovní postup (mikrobiologicky)
VíceNárodní ozdravovací program pro ozdravení rozmnožovacího materiálu (dále jen NOPRM )
Ministerstvo zemědělství Čj.: 74248/2014-MZE-17221 V Praze, dne 9. prosince 2014 Národní ozdravovací program pro ozdravení rozmnožovacího materiálu (dále jen NOPRM ) ovocných rostlin, révy a chmele v České
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv
Národní referenční laboratoř Strana KVANTITATIVNÍ STANOVENÍ GENETICKÝCH MODIFIKACÍ METODOU qpcr POMOCÍ ROTOR-GENE PROBE PCR KITU Účel a rozsah Postup slouží ke kvantitativnímu stanovení genetických modifikací
VíceMIKROBIOLOGIE. Grampozitivní kokovitá bakterie STAPHYLOCOCCUS AUREUS bakteriální kmen dle ATCC 1260 (CCM 888).
MIKROBIOLOGIE Veškeré testy jsou prováděny s těmito bakteriálními kmeny: Gramnegativní tyčinkovitá bakterie ESCHERICHIA COLI bakteriální kmen dle ATCC 9637 (CCM 2024). Grampozitivní kokovitá bakterie STAPHYLOCOCCUS
VíceSbírka houbových endofytických izolátů
Sbírka houbových endofytických izolátů Založená v Botanickém ústavu AVČR, v.v.i. pod pracovními identifikačními kódy RNDr. Libor Mrnka, Ph.D. kurátor sbírky RNDr. Miroslav Vosátka, CSc. ředitel ústavu
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS 1 Rozsah a účel Postup je určen pro stanovení obsahu melaminu a kyseliny kyanurové v krmivech. 2 Princip
VíceFunkční vzorek 5474/2017
Funkční vzorek 5474/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D. 1 MVDr.
VíceKultivační metody stanovení mikroorganismů
Kultivační metody stanovení mikroorganismů Základní rozdělení půd Syntetická, definovaná media, jednoduché sloučeniny, známé sloţení Komplexní media, vycházejí z ţivočišných nebo rostlinných tkání a pletiv,
VíceCvičení z mykologie (pro učitele) 8. praktické cvičení Houby stopkovýtrusné - Basidiomycota
Cvičení z mykologie (pro učitele) 8. praktické cvičení Houby stopkovýtrusné - Basidiomycota přezky teliospory hymenofor - rourky Program 1) Vyhodnocení plesnivých obrázků 2) Inokulace půdy a potravin na
VíceModerní metody stanovení mikroorganismů
Moderní metody stanovení mikroorganismů Mgr. Martin Polách NOACK ČR, spol. s r.o. Legislativní požadavky EU na mikrobiologické parametry potravin Závazným předpisem je nařízení 1441 / 2007 / ES, pozměňující
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU HYDROXYPROLINU SPEKTROFOTOMETRICKY
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU HYDROXYPROLINU SPEKTROFOTOMETRICKY 1 Rozsah a účel Postup specifikuje podmínky pro stanovení obsahu hydroxyprolinu v živočišných tkáních spektrofotometrickou metodou. 2 Princip
VíceIzolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie IZOLACE GENOMOVÉ DNA Deoxyribonukleová kyselina (DNA) představuje základní genetický materiál většiny
VíceFunkční vzorek 4595/2018. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Streptococcus suis
Funkční vzorek 4595/2018 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Streptococcus suis Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního lékařství,
VícePenicillium podrod Biverticillium. - konidiofor větvený na konci - fialidy štíhlé, protáhlé (acerozní)
Penicillium podrod Biverticillium - konidiofor větvený na konci - fialidy štíhlé, protáhlé (acerozní) Penicillium islandicum Kolonie: Dosti pomalu rostoucí, sametové až flokozní, tmavozelené, s oranžovým
VíceVýběr a výroba krabic. Přístroje a pomůcky : vyřezávací plotr Kasemake KM 503 archy nekyselé lepenky (140 cm x 100 cm) Postup :
Indikace znečišťujících látek a plísňové kontaminace v ovzduší jako významný faktor pro zlepšení stavu knihovních fondů v Národní knihovně ČR (výzkumný záměr-zpráva za rok 2006) Výběr a výroba krabic vyřezávací
VíceÚvod... 2. 1 Teoretická část... 3
Obsah Úvod... 2 1 Teoretická část... 3 1.1 Historie... 3 1.2 Systematické zařazení... 3 1.3 Rozmnožování... 4 1.3.1 Princip rozmnožování... 4 1.3.2 Životní cyklus... 4 1.4 Laboratorní metody při určování
VíceMTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková
MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk 15.11./16.11.2016 Jana Horáková Doporučená literatura M. Vejražka: Buněčné kultury http://bioprojekty.lf1.cuni.cz/3381/sylabyprednasek/textova-verze-prednasek/bunecnekultury-vejrazka.pdf
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení dekochinátu metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie
VíceBakteriální bioluminiscenční test. Stanovení účinnosti čištění odpadních vod pomocí bakteriálního bioluminiscenčního testu
Bakteriální bioluminiscenční test Stanovení účinnosti čištění odpadních vod pomocí bakteriálního bioluminiscenčního testu BBTT Cíl: Stanovit účinek odpadních vod na bakterie Vibrio fischeri. Principem
VíceFunkční vzorek 5454/2017. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Pseudomonas spp.
Funkční vzorek 5454/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Pseudomonas spp. Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního lékařství,
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv Stanovení obsahu celkového a volného tryptofanu metodou HPLC
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU CELKOVÉHO A VOLNÉHO TRYPTOFANU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení obsahu celkového a volného tryptofanu v krmivech metodou vysokoúčinné kapalinové
VíceŘasový test ekotoxicity na mikrotitračních destičkách
Řasový test ekotoxicity na mikrotitračních destičkách 1 Účel Řasové testy toxicity slouží k testování možných toxických účinků látek a vzorků na vodní producenty. Zelené řasy patří do skupiny necévnatých
VíceN217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie
ÚSTAV TECHNOLOGIE VODY A PROSTŘEDÍ N217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie Název úlohy: Kultivační stanovení: Stanovení kultivovatelných mikroorganismů při 22 C a 36 C Vypracováno v rámci projektu:
Více2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.
CVIČENÍ Z ENZYMOLOGIE 1) Stanovení Michaelisovy konstanty trypsinu pomocí chromogenního substrátu. Aktivita trypsinu se určí změřením rychlosti hydrolýzy chromogenního substrátu BAPNA (Nα-benzoyl-L-arginin-p-nitroanilid)
VíceNovinky VIDIA v di agnost ce Lymeské borreliózy
Novinky VIDIA v diagnostice i Lymeské borreliózy Marie Šteinbachová ELISA testy VIDIA pro diagnostiku LB testy III. generace vysoce specifické rekombinantní antigeny (IgG verze obsahuje VlsE) vysoká specifita
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2 1 Rozsah a účel Metoda je vhodná pro stanovení fumonisinů B 1 a B 2 v krmivech. 2 Princip Fumonisiny
Vícečerných plodnic perithecia Graphium, Leptographium, Sporothrix identifikační znaky Doporučená média: Literatura
Ophiostomatales Houby charakteristické tvorbou černých plodnic (typu perithecia) s dlouhým krčkem a ústím a nepohlavního stadia v rodech Graphium, Leptographium, Sporothrix aj. Někteří zástupci mají 2
VíceMykologická analýza potravin
Mykologická analýza potravin a. Souhrn V roce 2010 byl zahájen druhý dvouletý cyklus nově uspořádaného Monitoringu dietární expozice člověka a tím i pozměněného projektu "MYKOMON". Vzhledem k detailnějšímu
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ AKTIVITY FYTÁZY
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ AKTIVITY FYTÁZY 1 Rozsah a účel Postup specifikuje stanovení fytázové aktivity ve vzorcích krmiva. Tímto postupem se nestanoví rozdíl mezi fytázou přidanou
VíceMakrofágy a parazitární infekce
Makrofágy a parazitární infekce Funkce makrofágů Profesionální fagocyty https://www.youtube.com/watch?v=w0-0bqoge2e Antigen-prezentující buňky (asociace s MHC II glykoproteiny) Producenti cytokinů (IL-12,
VíceI N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í
I N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁN EVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM ROZPOČTEM ČESKÉ REPUBLIKY Laboratorní práce č. 8 Sacharidy Pro potřeby projektu
VíceIZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)
17.1 Izolace DNA (kit DNeasy Plant Mini) Strana 1 IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini) 1 Účel a rozsah Postup slouží k získání deoxyribonukleové kyseliny (DNA) ze vzorku pomocí komerčního kitu DNeasy Plant
VíceSněti rodu Tilletia spp. Ing. Barbora Dobiášová ÚKZÚZ Odbor osiv a sadby
Sněti rodu Tilletia spp. Ing. Barbora Dobiášová ÚKZÚZ Odbor osiv a sadby Tilletia spp. V ČR se vyskytují nejčastějidva druhy tohoto rodu: Sněť zakrslá - Tilletia controversa Sněť mazlavá pšeničná Tilletia
VíceFunkční vzorek 5452/2017. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u gramnegativních bakterií II.
Funkční vzorek 5452/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u gramnegativních bakterií II. řada Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního
VíceCvičení ke kurzu Obecná ekotoxikologie. Úloha A - Stanovení ekotoxicity v testu klíčení rostlin
Cvičení ke kurzu Obecná ekotoxikologie Nutné potřeby, které studenti přinesou s sebou do cvičení: - Tento návod - Poznámkový sešit, psací potřeby - Nůžky - Pravítko (s milimetrovým rozlišením) - Přezůvky
VíceDiagnostické metody v lékařské mikrobiologii
Diagnostické metody v lékařské mikrobiologii Výuková prezentace z: Lékařské mikrobiologie Jan Smíšek ÚLM 3. LF UK 2009 Princip identifikace Soubor znaků s rozdílnou diskriminační hodnotou Základní problémy
VíceKonečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche
Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche Charakteristika testu: Set AMPLICOR HPV vyráběný firmou Roche je určený pro detekci vysoko-rizikových typů lidských
VíceN217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie
ÚSTAV TECHNOLOGIE VODY A PROSTŘEDÍ N217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie Název úlohy: Kultivační stanovení: Stanovení mikromycet (plísní a kvasinek) Vypracováno v rámci projektu: Inovace a
VíceÚSTŘEDNÍ KONTROLNÍ A ZKUŠEBNÍ ÚSTAV ZEMĚDĚLSKÝ
ÚSTŘEDNÍ KONTROLNÍ A ZKUŠEBNÍ ÚSTAV ZEMĚDĚLSKÝ Rostlinolékařská diagnostika pověřování externích laboratoří Václav Čermák Odbor diagnostiky Pověřování rostlinolékařskou diagnostikou Pověřování v rámci
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KOBALTU METODOU ICP-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU KOBALTU METODOU ICP-MS 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení celkového obsahu kobaltu v krmivech metodou hmotnostní spektrometrie
VíceLP č. 5 - SACHARIDY. Autor: Mgr. Stanislava Bubíková. Datum (období) tvorby: 28. 2. 2013. Ročník: devátý
LP č. 5 - SACHARIDY Autor: Mgr. Stanislava Bubíková Datum (období) tvorby: 28. 2. 2013 Ročník: devátý Vzdělávací oblast: Člověk a příroda / Chemie / Organické sloučeniny 1 Anotace: Žáci si prakticky vyzkouší
VíceColumn DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202)
Column DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202) Popis Column DNA Lego Kit je základ moderní stavebnicové (Lego) soupravy pro izolaci čisté DNA různého
VíceI N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í
I N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁN EVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM ROZPOČTEM ČESKÉ REPUBLIKY Laboratorní práce č. 10 Bílkoviny Pro potřeby projektu
VíceVyšetřování vody před 100 lety a dnes. RNDr. Jaroslav Šašek Státní zdravotní ústav
Vyšetřování vody před 100 lety a dnes RNDr. Jaroslav Šašek Státní zdravotní ústav Milníky mikrobiologie vody dávno před objevem mikroskopu je předpokládán výskyt mikrobů v prostředí podezření na vznik
VíceN Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie
ÚSTAV TECHNOLOGIE VODY A PROSTŘEDÍ N217019 - Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie Název úlohy: Kultivační stanovení: Stanovení intestinálních enterokoků Vypracováno v rámci projektu: Inovace a restrukturalizace
VíceLaboratorní testování na přítomnost koliformních bakterií, psychrotrofních a termorezistentních mikroorganismů a sporotvorných anaerobních bakterií
Laboratorní testování na přítomnost koliformních bakterií, psychrotrofních a termorezistentních mikroorganismů a sporotvorných anaerobních bakterií Ing. Pavel Kopunecz, ČMSCH a.s. Přehled metod hodnocení
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU 5-VINYL - 2-THIOOXAZOLIDONU (GOITRINU) METODOU GC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU 5-VINYL - 2-THIOOXAZOLIDONU (GOITRINU) METODOU GC 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení vinylthiooxazolidonu (dále VOT) v krmivech.
VíceCOMET ASSAY (SINGLE CELL GEL ELECTROPHORESIS)
COMET ASSAY (SINGLE CELL GEL ELECTROPHORESIS) OBSAH 1. Princip metody 2. Přístroje a zařízení 3. Příprava vzorků 3.1 Kultivace a sklízení buněk A549 3.2 Výpočet koncentrace buněk 3.3 Hodnocení viability
VíceImunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky
Imunochemické metody na principu vazby antigenu a protilátky ANTIGEN (Ag) specifická látka (struktura) vyvolávající imunitní reakci a schopná vazby na protilátku PROTILÁTKA (Ab antibody) molekula bílkoviny
VíceChemické výpočty II. Vladimíra Kvasnicová
Chemické výpočty II Vladimíra Kvasnicová Převod jednotek pmol/l nmol/l µmol/l mmol/l mol/l 10-12 10-9 10-6 10-3 mol/l µg mg g 10-6 10-3 g µl ml dl L 10-6 10-3 10-1 L Cvičení 12) cholesterol (MW=386,7g/mol):
VíceOdběry vzorků u pacientů s podezřením na infekci krevního řečiště
Odběry vzorků u pacientů s podezřením na infekci krevního řečiště Eva Krejčí Centrum klinických laboratoří, Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě Lékařská fakulta Ostravské univerzity Infekce krevního řečiště
VíceANALYTICKÝ SYSTÉM PHOTOCHEM
ANALYTICKÝ SYSTÉM PHOTOCHEM Analytický systém Photochem (firmy Analytik Jena, Německo) je vhodný pro stanovení celkové antioxidační kapacity (tj. celkové schopnosti vzorku vychytávat volné radikály) různých
VícePenicillium podrod Penicillium. - asymetricky vyrůstající větve - terverticilátní, příp. quaterverticilátní konidiofory
Penicillium podrod Penicillium - asymetricky vyrůstající větve - terverticilátní, příp. quaterverticilátní konidiofory Penicillium fyziologické znaky využití CSA CSA agar s kreatinem a indikátorem ph (bromkresolový
VíceIMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE INFEKČNÍ MONONUKLEÓZY
INFEKČNÍ SÉROLOGIE Virologie IMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE INFEKČNÍ MONONUKLEÓZY EBV VCA EBV EBNA-1 EBV EA-D ELISA soupravy jsou určeny ke stanovení specifických protilátek třídy IgA, IgG a IgM
VíceHelicobacter pylori. Imunoenzymatické soupravy k diagnostice infekce Helicobacter pylori
Helicobacter pylori Imunoenzymatické soupravy k diagnostice infekce Helicobacter pylori ELISA a IMUNOBLOT soupravy jsou určeny ke stanovení specifických protilátek třídy IgA, IgG a IgM v lidském séru nebo
VícePříprava půd pro diskovou difuzní metodu EUCAST a pro vyšetření hodnot MIC bujonovou mikrodiluční metodou. Změny proti předchozí verzi (v. 4.
Version 5.0 January 2017 Příprava půd pro diskovou difuzní metodu EUCAST a pro vyšetření hodnot MIC bujonovou mikrodiluční metodou. Změny proti předchozí verzi (v. 4.0) A. Půdy pro diskovou difuzní metodu
VíceIng. Václav Krejzar, Ph.D Ing. Iveta Pánková, Ph.D. Ing. Radka Krejzarová prof. Ing. Václav Kůdela, DrSc.
Ing. Václav Krejzar, Ph.D Ing. Iveta Pánková, Ph.D. Ing. Radka Krejzarová prof. Ing. Václav Kůdela, DrSc. Zefektivnění postupu při stanovení přítomnosti karanténního organismu, bakterie Clavibacter michiganensis
VíceIMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE INFEKCE HELICOBACTER PYLORI
INFEKČNÍ SÉROLOGIE Bakteriologie IMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE INFEKCE HELICOBACTER PYLORI Helicobacter pylori ELISA a IMUNOBLOT soupravy jsou určeny ke stanovení specifických protilátek třídy
VíceProtokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test
Protokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test Cíl cvičení: Bude se jednat o přímé nebo nepřímé stanovení počtu buněk? Stanovujeme počet živých nebo mrtvých buněk? Jak odlišíme živé
VíceLABORATOŘ OBORU I. Příprava diagnostického testu na bázi lateral flow immunoassay ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111)
LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) C Příprava diagnostického testu na bázi lateral flow immunoassay Vedoucí práce: Ing. Aram Zolal Ing. Lukáš Filip Umístění práce: laboratoř S58 1. Úvod
VíceMykologická analýza potravin
Mykologická analýza potravin a. Souhrn Rok 2009 byl druhým rokem dvouletého monitorovacího období (2008-2009) nově uspořádaného Monitoringu dietární expozice člověka a tím i pozměněného projektu "MYKOMON".
VíceCvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ
Cvičení č. 2: Pasážování buněk 1) Teoretický základ Kultivace buněk in vitro (ve zkumavce) - Snaha o napodobení podmínek v organismu - Používání jednorázového spotřebního materiálu a speciálních chemikálií
VíceNÁVOD PRO STANOVENÍ ŽIVOTASCHOPNÝCH MIKROORGANISMŮ V BIOAEROSOLECH MONITORING VNITŘNÍHO PROSTŘEDÍ V MATEŘSKÝCH ŠKOLKÁCH 2016
NÁVOD PRO STANOVENÍ ŽIVOTASCHOPNÝCH MIKROORGANISMŮ V BIOAEROSOLECH MONITORING VNITŘNÍHO PROSTŘEDÍ V MATEŘSKÝCH ŠKOLKÁCH 016 1 Úvod 1.1 Předmět a vymezení působnosti Tento postup je určen pouze pro projekt
Více