Žádost o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem. oboru. Ekologie

Transkript

1 Žádost o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem oboru Ekologie 2019

2 A-I Základní údaje o žádosti o akreditaci Název vysoké školy: Název součásti vysoké školy: Přírodovědecká fakulta Obor řízení: Ekologie Typ řízení: habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem Schvalující orgán: Vědecká rada Univerzity Palackého v Olomouci Datum schválení žádosti: Vědecká rada PřF UP schválení návrhu žádosti o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem v daném oboru: Vědecká rada UP schválení návrhu žádosti o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem v daném oboru: Odkaz na elektronickou podobu žádosti: Odkaz na relevantní vnitřní předpisy: Odkaz na údaje o zahájených a uskutečněných řízeních: verze

3 B-I Charakteristika oboru řízení Součást vysoké školy Název oboru řízení Typ oboru řízení Přírodovědecká fakulta Ekologie habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem Charakteristika a vymezení oboru řízení Ekologie je chápána jako biologický vědní obor, který se zabývá interakcemi mezi organismy a jejich prostředím, jejich strukturou a dynamikou. Tyto interakce a procesy jsou studovány na 3 základních úrovních organizace živé hmoty: na úrovní jedince, populace (populační ekologie) a společenstev (ekologie společenstev a ekosystémů). Vzhledem k diverzitě organismů a prostředí je ekologie velmi diverzifikovaným oborem, v rámci kterého lze vymezit specifické subdisciplíny. Podle úrovní organizace lze vyčlenit ekofyziologii, populační ekologii, nebo ekologii společenstev a ekosystémů. Studium ekologických procesů na širší geografické škále prostřednictvím nástrojů GIS vede ke krajinné ekologii. Podle typu organismu lze rozeznat rostlin, živočichů, nebo ekologii mikrobiální. Podle stanoviště známe ekologii terestrickou, vodní, arktickou, nebo urbánní. Podle aplikace lze odlišit agroekologii, konzervační ekologii, rekultivační či teoretickou ekologii. V každé oblasti lze najit specifickou metodologii a důrazy na jiný typ otázek, které se kladou. Proto je velmi obtížné pokrýt tuto diverzitu ve výuce a ve vědě. Na Katedře ekologie a životního prostředí se výzkum zaměřuje zhruba na 7 oblastí. Na katedře je v současnosti rozvíjeno 6 směrů: populační ekologie, demografie a dynamika savčích populací ekologie a konzervační biologie bezobratlých dopad klimatických a antropogenních změn v horských ekosystémech agroekologie a ekologie půdy, včetně eroze půd mikrobiální ekologie vod, včetně produkce skleníkových plynů krajinná ekologie, otázky fragmentace krajiny, revitalizace, biodiverzita, migrace, modelování distribuce druhů rostlinná ekologie a taxonomie tropických deštných pralesů Uvedená zaměření s sebou přináší vhledy metodologické, teoretické i aplikační. Například na úrovni populace jsou rozvíjeny metody odhadu velikosti populace a rozvíjeny teoretické aspekty regulace populací a kauzality populačních dynamik. Tyto poznatky lze později využít v aplikované sféře při ochraně plodin před škůdci, nebo v prevenci rizik onemocnění infekčními nákazami. Obor habilitačního a profesorského řízení Ekologie navazuje na výuku ekologických programů. Katedra ekologie a ŽP garantuje bakalářský program Ekologie a ochrana životního prostředí, dva magisterské navazující programy Ekologie a ochrana životního prostředí a Ochrana a tvorba krajiny. Katedra ekologie a ŽP rovněž garantuje magisterský program Hydrobiologie. Na magisterské programy navazuje 4letý doktorský program Ekologie. Všechny výzkumné skupiny své výsledky pravidelně zveřejňují v mezinárodních časopisech s impaktovým faktorem. Kromě toho byly získané zkušenosti využity k vydání vysoce hodnocených vysokoškolských učebnic pro výuku populační ekologie, agroekologie, pedologie, biofilmů nebo vědecké metodologie. Do svého výzkumu zapojují studenty jak bakalářských, tak magisterských a doktorských studijních oborů. Výzkumné skupiny rovněž spolupracují se zahraničními pracovišti. V roce 2018 vyprodukoval 16členný kolektiv autorů celkem 11 odborných impaktovaných publikací řazených na WOS v Q1. V současnosti se výzkumná témata zoologů a botaniků do určité mír vždy překrývají s tématy ekologickými. Z uvedeného výčtu směrů, které jsou rozvíjeny na Katedře ekologie a ŽP, je ale zřejmé, že se zaměření významně liší od zaměření zoologického, nebo botanického. V zoologii a botanice se řeší spíše problémy orientované na taxony a mají silnější evolučně-biologické zabarvení, v ekologii je kladen důraz na procesy probíhající v ekologickém čase na úrovni jedinců, populací a společenstev, kde taxony vystupují v podobě biologického modelu. 2

4 C-I Požadavky na uchazeče o habilitační řízení/řízení ke jmenování profesorem Součást vysoké školy Název oboru řízení Schvalující orgán Přírodovědecká fakulta Ekologie Akademický senát Univerzity Palackého v Olomouci Schváleno dne Účinnost od Požadavky kladené na uchazeče habilitačního řízení Řád habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: Kritéria, požadavky a náležitosti pro habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: Požadavky kladené na uchazeče řízení ke jmenování profesorem Řád habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: Kritéria, požadavky a náležitosti pro habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: 3

5 D-I Související vědecká nebo umělecká činnost Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Přehled řešených grantů a projektů souvisejících s oborem řízení Řešitel/spoluřešitel spoluřešitel řešitel Názvy grantů a projektů získaných pro vědeckou nebo uměleckou činnost související s oborem řízení BESTMAP, Behavioural, Ecological and Socio-econo-mic Tools for Modelling Agricultural Policy Ochrana půdy formou optimalizace prostorových a funkčních parametrů prvků krajinné struktury v pozemkových úpravách - ( ). Retenční schopnost půdy a krajiny a možnosti jejího zvyšování v podmínkách klimatické změny Od živin k rostlinnému fenotypu: role pedogeneze, fylogeneze, velikosti genomu a genové exprese Zdroj Horizon 2020 Program me, EK QJ Období řešitel QK řešitel VES INTER COST spoluřešitel Skrytá hrozba přírodních ohnisek přehlížených, klíšťaty AZV 2016 přenosných infekcí. Případ rodů Rickettsia, Anaplasma, Babesia 2020 řešitel Nové technologie vegetačních úprav svahů dálničních a TAČR 2015 silničních koridorů pro zvýšení dlouhodobé efektivity zvláštní 2019 územní ochrany přírody spoluřešitel Připravte svého psa! Psí babezióza jako model "náhle se GA524/ objevující infekční nemoci" postupující střední Evropou 9/ řešitel Biogeochemie metanu a detekce metanogenních a GA526/ metanotrofních bakterií v říčních sedimentech 9/ Přehled o nejvýznamnější publikační a další vědecké nebo umělecké činnosti s mezinárodním rozsahem Deset posledních publikací v Q1 na WOS z Katedry ekologie a ŽP PřF UP: Tkadlec E, Václavík T, Kubelová M, Široký P Negative spatial covariation in abundance of two European ticks: diverging niche preferences or biotic interaction? Ecological Entomology 43(6): Mládková P, Mládek J, Hejduk S, Hejcman M, Pakeman RJ Calcium plus magnesium indicates digestibility: the significance of the second major axis of plant chemical variation for ecological processes. Ecology Letters 21(6): Dominik C, Seppelt R, Horgan FG, Settele J, Václavík T Landscape composition, configuration, and trophic interactions shape arthropod communities in rice agroecosystems. Journal of Applied Ecology 55(5): Bednář M, Šarapatka B Relationships between physical-geographical factors and soil degradation on agricultural land. Environmental Research 164: Sullivan MJP et al Field methods for sampling tree height for tropical forest biomass estimation. Associated Data. Methods in Ecology and Evolution 9(5): Qie L et al Long-term carbon sink in Borneo's forests halted by drought and vulnerable to edges (vol 8, 2017). Nature Communications 9: art. no Bravo AG et al The interplay between total mercury, methylmercury and dissolved organic matter in fluvial systems: A latitudinal study across Europe. Water Research 144: Seppelt R, Verburg PH, Norstrom A, Cramer W, Václavík T Focus on cross-scale feedbacks in global sustainable land management. Environmental Research Letters 13(9): art. no Seppelt R, Beckmann M, Václavík T, Volk M The Art of Scientific Performance. Trends in Ecology & Evolution 33(11): Šarapatka B, Čáp L, Bilá P The varying effect of water erosion on chemical and biochemical soil properties in different parts of Chernozem slopes. Geoderma 314:

6 Informace o dalším zapojení vysoké školy do mezinárodní spolupráce související s oborem řízení Všichni pracovníci pravidelně publikují výsledky své práce v odborných časopisech a jsou zapojeni jako řešitelé či spoluřešitelé do výzkumných projektů ve spolupráci s dalšími výzkumnými institucemi v ČR. Pracovníci katedry rovněž organizují významné mezinárodní konference 1. 16th International Congress of Myriapodology v Olomouci th Annual Meeting of International Hamster Workgroup v Olomouci 2015, 3. the 15th International Conference on Rodent Biology in Olomouc 2016, 4. Pedological Days in Olomouc 2017, 5. 10th Symposium for European Freshwater Sciences in Olomouc To dokládá, že ekologický výzkum na Katedře ekologie a ŽP si vydobyl uznání i na mezinárodní scéně. Katedra ekologie organizuje rovněž významné mítinky domácí, Zoologické dny Olomouc 2020, Lepideptorologická kolokvia apod. Členové katedry jsou rovněž zapojení mezinárodního výzkumu (např. projekt Horizon 2020: BESTMAP) a také do editorské činnosti mezinárodních ekologických časopisů (např. Diversity and Distribution). Velká část publikací, celkem 39, vznikla v posledních 3 letech ve spolupráci se zahraničními odborníky, což svědčí o dobrém začlenění našich pracovníků do širší mezinárodní komunity a spolupráce. 5

7 E-I Související doktorský studijní program Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Název doktorského studijního programu odpovídajícího oboru řízení Ekologie Uskutečňován od 1994 Uskutečňován do P Akademický rok Počet zapsaných studentů Počet úspěšných absolventů Počet neúspěšných studentů Název doktorského studijního programu odpovídajícího oboru řízení Uskutečňován od Uskutečňován do Akademický rok Počet zapsaných studentů Počet úspěšných absolventů Počet neúspěšných studentů 6

8 F-I Přehled akademických pracovníků zajišťujících obor řízení Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Příjmení, jméno Akademické tituly Rok narození Martin Rulík doc. RNDr. Ph.D Ivan H. Tuf doc. RNDr. Ph.D Emil Tkadlec prof. MVDr. CSc Bořivoj Šarapatka prof. Dr. Ing. CSc F-II Přehled akademických pracovníků s perspektivou habilitace Příjmení, jméno Akademické tituly Rok narození Rok zahájení habilitačního řízení RNDr. Tomáš Václavík, Ph.D. RNDr. PhD Martin Dančák RNDr. Ph.D Tomáš Kuras RNDr. Ph.D F-III Členové vědecké/umělecké rady vysoké školy Příjmení, jméno, rok narození Akademické tituly Považován za významného odborníka v oboru Ivo Frébort, 1965 prof. RNDr. CSc., Ph.D. Biochemie (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Eva Zažímalová, 1955 prof. RNDr. CSc. Anatomie a fyziologie rostlin (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Odkaz na úplné složení vědecké/umělecké rady vysoké školy F-IV Členové vědecké/umělecké rady součásti vysoké školy Příjmení, jméno, rok narození Akademické tituly Považován za významného odborníka v oboru Emil Tkadlec, 1956 prof. MVDr. CSc. Ekologie (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Stanislav Bureš, 1958 prof. RNDr. CSc. Zoologie (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Odkaz na úplné složení vědecké/umělecké rady součásti vysoké školy 7

9 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Emil Tkadlec Tituly prof. MVDr. CSc. Rok narození 1956 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ 1982 MVDr. na VŠV v Brně; 1991 CSc. V oboru zoologie na ÚSEB ČSAV v Brně; 1999 docent v oboru ekologie na PřF UP v Olomouci; 2004 profesor v oboru ekologie na PřF UP v Olomouci Údaje o odborném působení od absolvování VŠ odborný asistent a pracovník ÚVO ČSAV v Brně odborný pracovník I na ÚSEB ČSAV v Brně 1992 vědecký pracovník na ÚBO AVČR v Brně odborný asistent na PřF UP v Olomouci docent ekologie na PřF UP v Olomouci 2004 profesor ekologie na PřF UP v Olomouci Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Ekologie 1999 UPOL WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na profesorem VŠ Ekologie 2004 UPOL Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Výuka předmětů Analýza biologických dat v R, Analýza časových řad v ekologii, Ekologie populací, Ekologie živočichů, Populační ekologie rostlin, Teorie životních historií, Management vědy a výzkumu, předseda rady programu, školitel doktorských studentů Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Tkadlec E, Václavík T, Kubelová M, Široký P Negative spatial covariation in abundance of two European ticks: diverging niche preferences or biotic interaction? Ecological Entomology. Petrová I, Petriláková M, Losík J, Gouveia A, Damugi IED, Tkadlec E Density-related pattern of variation in body growth, body size and annual productivity in the common hamster. Mammalian Biology 91: Gouveia Ana R, Bjørnstad Ottar N, Tkadlec Emil Dissecting geographic variation in population synchrony using the common vole in central Europe as a test bed. Ecology and Evolution 6(1): Pavluvčík P, Machar I, Poprach K, Gouveia A, Losík J, Tkadlec E Barn owl productivity response to variability of vole populations. PLoS One 10(12): e Gouveia A, Bejček V, Flousek J, Sedláček F, Šťastný K, Zima J, Yoccoz NG, Stenseth NChr, Tkadlec E Long-term pattern of population dynamics in the field vole from central Europe: cyclic pattern with amplitude dampening. Population Ecology 57(4): Působení v zahraničí Stáže v Norsku, Polsku, SRN v celkovém rozsahu 6 měsíců Podpis datum

10 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Ivo Frébort Tituly Rok narození 1965 typ vztahu k VŠ PP PP rozsah do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP PP rozsah do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ 1988 ukončení studia oboru Analytická chemie na PřF UP Olomouc, 1989 RNDr CSc. v oboru Biochemie MU Brno; 1997 Ph.D. v oboru Bioresources Science United Graduate School of Tottori University, Japonsko Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Katedra analytické a organické chemie PřF UP - vědecký pracovník Department of Biological Chemistry, Faculty of Agriculture, Yamaguchi University, Japonsko - vědecký pracovník, Ph.D. student Katedra biochemie PřF UP odborný asistent Katedra biochemie PřF UP docent od 2005 Katedra biochemie PřF UP profesor od 2010 Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum (PřF UP) - ředitel Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 1998 VŠCHT Praha WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 1842/ 1910 profesorem 1541 Biochemie 2005 UK Praha Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Předseda oborové rady, školitel a garant doktorského studijního programu Biochemie na PřF UP, člen oborové rady doktorského studijního programu Biochemie na PřF MU Brno, člen Vědecké rady UP a Vědecké rady PřF UP; garance a výuka předmětů Molekulární biologie, Struktura a funkce biomakromolekul, Molekulární genetika, Geneticky modifikované organismy, Genové inženýrství Projekt OP VK (hlavní řešitel): CZ.1.07/2.2.00/ Příprava absolventů přírodovědeckých oborů pro uplatnění v evropských biotechnologických institucích Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Pět nejvýznamnějších publikací za posledních 5 let: Hluska T, Šebela M, Lenobel R, Frébort I, Galuszka P (2017) Purification of maize nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase casts doubt on the existence of zeatin cis-trans isomerase in plants. Front. Plant Sci. 8, 1473; IF Pospíšilová H, Jiskrová E, Vojta P, Mrízová K, Kokáš F, Majeská Čudejková M, Bergougnoux V, Plíhal O, Klimešová J, Novák O, Dzurová L, Frébort I, Galuszka P (2016) Transgenic barley overexpressing a cytokinin dehydrogenase gene shows greater tolerance to drought stress. New Biotechnol 33, ; IF Frébortová J, Greplová M, Seidl MF, Heyl A, Frébort I (2015) Biochemical characterization of putative adenylate dimethylallyltransferase and cytokinin dehydrogenase from cyanobacterium Nostoc sp. PCC PLoS ONE 10, e ; IF Dzurová L, Forneris F, Savino S, Galuszka P, Vrabka J, Frébort I (2015) The three-dimensional structure of 9

11 Lonely Guy from Claviceps purpurea provides insights into the phosphoribohydrolase function of Rossmann fold-containing lysine decarboxylase-like proteins. Proteins 83; IF Mrízová K, Holásková E, Öz MT, Jiskrová E, Frébort I, Galuszka P (2014) Transgenic barley: Aprospective tool for biotechnology and agriculture. Biotechnol Adv 32, ; IF Nejvýznamnější získané výzkumné granty (hlavní řešitel) za posledních 10 let: IAA Role odbourávání cytokininů při fyziologických reakcích u zemědělsky významných rostlin - 6,792 mil. Kč ED0007/01/01 - Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum - 832,938 mil. Kč EE Podpora zapojení výzkumného týmu Centra regionu Haná do mezinárodní spolupráce - 31,659 mil. Kč GAP501/12/ Sinice Nostoc jako genetický a funkční model pro metabolismus rostlinných hormonů cytokininů - 11,000 mil. Kč LO Udržitelný rozvoj výzkumu v Centru regionu Haná - 393,155 mil. Kč EF16_019/ Rostliny jako prostředek udržitelného globálního rozvoje - 360,814 mil. Kč Působení v zahraničí : Japonsko, Yamaguchi University (4,5 r) - Ph.D. studium, vědecký pracovník 2001: Německo, University of Tübingen (6 m) - postdok 2003: Německo, Free University of Berlin (3 m) - postdok 2007: Japonsko, Osaka University (2 m) - hostující profesor Další kratší stáže: Lund, Lyngby, Groningen, Řím, Berlín, Columbia (USA), Yamaguchi, Osaka, Okinawa Podpis datum

12 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Tomáš Kuras Tituly RNDr., Ph.D. Rok narození 1972 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 08/19 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp. rozsah 40 do kdy 08/19 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah PřF Ostravské univerzity DPP Údaje o oboru vzdělání na VŠ Bc. (Systematická biologie a ekologie), Přírodovědecká fakulta UP Olomouc, 1994 Mgr. (Systematická biologie a ekologie), Přírodovědecká fakulta UP Olomouc, 1996 RNDr. (ekologie), Přírodovědecká fakulta UP Olomouc, 2001 Ph.D. (ekologie), Přírodovědecká fakulta UP Olomouc, 2001 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ asistent, katedra ekologie a životního prostředí, PřF, UP Olomouc 2000 do současnosti odborný asistent, katedra ekologie a životního prostředí, PřF, UP Olomouc Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Ekologie UPOL WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na profesorem VŠ Ekologie UPOL Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Výuka předmětů Ekologie společenstev a ekosystémů, Terestrické ekosystémy, Ekologie horských ekosystémů, Systém bezobratlých, Základy ekologie, Určovací praktikum ze zoologie bezobratlých, Exkurze k ochraně životního prostředí. Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Kasak J., Mazalova M., Sipos J., Foit J., Hucin M., Kuras T., 2019: Habitat preferences of Ceruchus chrysomelinus, an endangered relict beetle of the natural Central European montane forests. Insect Conservation and Diversity, doi: /icad Rada S., Schweiger O., Harpke A., Kuhn E., Kuras T., Settele J., Musche M., 2019: Protected areas do not mitigate biodiversity declines: A case study on butterflies. Diversity and Distributions, 25: Kuras T., Mazalová M., 2018: Distribution of the antlion Dendroleon pantherinus (Neuroptera: Myrmeleontidae) in the Czech Republic. Acta Mus. Siles. Sci. Natur., 67: 1-6. Sipos J., Hodecek J., Kuras T., Dolný A., 2017: Principal determinants of species and functional diversity of carabid beetle assemblages during succession at post-industrial sites. Bulletin fo Entomological Research, 107: Hodecek J., Kuras T., Sipos J., Dolný A., 2017: Role of reclamation in the formation of functional structure of beetle communities: A different approach to restoration. Ecological Engeneering, 94: Působení v zahraničí Stáže v Brunei: 3 x 1 měsíc Podpis datum

13 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Tomáš Václavík Tituly RNDr., Ph.D. Rok narození 1980 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy 08/20 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy 08/20 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Ph.D. University of North Carolina at Charlotte, Geography, 2011 RNDr. Univerzita Palackého Olomouc, ochrana a tvorba životního prostředí, 2008 Mgr. Univerzita Palackého Olomouc, ochrana a tvorba životního prostředí, 2004 Bc. Univerzita Palackého Olomouc, ochrana a tvorba životního prostředí, 2001 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2011 dosud: odborný asistent, Katedra ekologie a ŽP, PřF, UP Olomouc : scientist, Helmholtz Centre for Environmental Research UFZ, Leipzig, Germany : výzkumný asistent, University of North Carolina, Department of Geography and Earth Sciences, Center for Applied Geographic Information Science, Charlotte, NC, USA : referent, AOPK ČR, Správa CHKO Litovelské Pomoraví Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Obor řízení k jmenování profesorem Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Krajinná ekologie - přednášející, cvičící, garant Exkurze z krajinné ekologie garant Environmental Modeling in GIS - přednášející, cvičící, garant Letní škola Archetype Analysis in Sustainability Research organizátor, vyučující Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Seppelt, R., Verburg, P.H., Norström, A., Cramer, W., Václavík, T Focus on cross-scale feedbacks in global sustainable land management. Environmental Research Letters 13(9): Dominik, C., Seppelt, R., Horgan, F.G., Settele, J., Václavík, T Landscape composition, configuration, and trophic interactions shape arthropod communities in rice agroecosystems. Journal of Applied Ecology 55(5): Seppelt, R., Beckmann, M., Václavík, T Searching for win win archetypes in the food biodiversity challenge: A response to Fischer et al. Trends in Ecology & Evolution 32(9): Václavík, T., Beckmann, M., Cord, A.F., Bindewald, A.M Effects of UV-B radiation on leaf hair traits of invasive plants Combining historical herbarium records with novel remote sensing data. PLoS ONE 12(4): e Delzeit, R., Zabel, F., Meyer, C., Václavík, T Addressing future trade-offs between biodiversity and cropland expansion to improve food security. Regional Environmental Change 17(5):

14 Působení v zahraničí , vědecký pracovník, Helmholtz Centre for Environmental Research UFZ, Department of Computational Landscape Ecology, Leipzig, SRN , výzkumný asistent, University of North Carolina Charlotte, Department of Geography and Earth Sciences, Center for Applied Geographic Information Science, Charlotte, NC, USA , Fulbright fellow, Clark University, Department of International Development, Community and Environment, Worcester, MA, USA. Podpis datum

15 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Ivan Hadrián Tuf Tituly doc. RNDr. Mgr. Ph.D. Rok narození 1974 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ 1997 Mgr. Systematická biologie a ekologie, PřF UP v Olomouci 2002 Ph.D. Ekologie a ochrana prostředí, PřF UP v Olomouci 2005 Mgr. Psychologie, FF UP v Olomouci 2008 RNDr. Učitelství biologie v ochraně životního prostředí pro SŠ, PřF UP v Olomouci 2018 doc. Ekologie Údaje o odborném působení od absolvování VŠ vědecký pracovník, Katedra ekologie & ŽP, PřF UP odborný asistent, Katedra ekologie & ŽP, PřF UP 2018-dosud docent, Katedra ekologie & ŽP, PřF UP Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Ekologie 2018 UPOL WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování prof. Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ >500 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Vedoucí celkem 73 diplomových a bakalářských prací obhájených v letech Zvané přednášky na jiných univerzitách (16), či pro veřejnost (15). Učební text: Tuf, I.H. (2013): Praktika z půdní zoologie. Vydavatelství Univerzity Palackého v Olomouci, Olomouc, 92 pp. Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Cekem 36 článků v časopisech s IF, 52 původních článků v recenzovaných časopisech a sbornících, 11 kapitol v monografiích, 3 editované sborníky z konferencí. Spoluúčast ve 27 financovaných projektech. Celkem 126 posudků na rukopisy vědeckých článků (z toho 82 v časopisech s IF). Organizátor odborných 2 seminářů a 1 mezinárodní konference. Působení v zahraničí dohromady přes 1,5 roku, např.: Rusko, Московский государственный университет имени Ломоносова & Алтайский государственный университет 10 týdnů; 2014 Litva, Gamtos tyrimų centro 4 týdny; 2015 Papua Nová Guinea, The New Guinea Binatang Research Center 4 týdny; 2016 Mongolsko, Монгол Улсын Их Сургууль 4 týdny; Maďarsko, Magyar Természettudományi Múzeum & Szent István Egyetem dohromady 40 týdnů Podpis datum

16 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Martin Rulík Tituly doc. RNDr., Ph.D. Rok narození 1968 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Vzdělání: ( ) PřF UP v Olomouci, Mgr. v oboru Systematická biologie a ekologie se zaměřením na hydrobiologii, ( ) PhD. v Ekologii, PřF UP v Olomouci Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Praxe: vědecký pracovník Katedry ekologie PřF UP v Olomouci odborný asistent Katedry ekologie a živ. prostředí (KEŽP) PřF UP v Olomouci 2005-dosud docent hydrobiologie KEŽP Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ doc. - Hydrobiologie 2005 MU Brno WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na nesledu profesorem VŠ ji Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Výuka předmětů: EKO/AHDO Aplikovaná hydrobiologie EKO/VOEK Vodní ekosystémy EKO/EKOMO Ekologie mořských ekosystémů EKO/MEM Molekulární ekologie mikroorganizmů EKO/MMEM Molekulární metody v ekologii mikroorganizmů EKO/ZHMON Zoologický a hydrobiologický monitoring EKO/VHKR - Vodní hospodářství krajiny Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Matoušů A, Rulík M, Tušer M, Bednařík A, Šimek K, Bussmann I (2019): Methane dynamics in a large river a case study of the Elbe River. Aquatic Sciences 81: 12. ttps://doi.org/ /s Bednařík A, Blaser M, Matoušů A, Hekera P, Rulík M (2017): Effect of weir impoundments on the methane dynamics in a river. Science of the Total Environment : Brablcová L, Buriánková I, Badurová P, Chaudhary PP, Rulík M (2015): Methanogenic archaea diversity in hyporheic sediments of a small lowland stream. Anaerobe 32: Mach V, Blaser MB, Claus P, Chaudhary PP, Rulík M (2015): Methane production potentials, pathways, and communities of methanogens in vertical sediments profiles of river Sitka. Front Microbiol 6: 506. doi: /fmicb Rulík M, Buriánková I, Brablcová L (2015): Vybrané kapitoly z molekulární ekologie mikroorganizmů. Učební texty PřF UP v Olomouci, 146 pp., ISBN Adámek Z, Helešic J, Maršálek B, Rulík M (2014): Applied hydrobiology. University of South Bohemia in 15

17 České Budějovice, 376 pp., ISBN Buriánková I, Brablcová L, Mach V, Dvořák P, Chaudhary PP, Rulík M (2013): Identification of methanogenic archaea in the hyporheic sediment of Sitka stream. PLOS ONE 8, 11: e80804 DOI: /journal.pone Chaudhary PP, Brablcová L, Buriánková I, Rulík M (2013): Molecular diversity and tools for deciphering the methanogen community structure and diversity in freshwater sediments. Appl Microbiol Biotechnol 97,15: Rulík M, Baudišová D, Růžička J, Šimek K (2013): Mikrobiální ekologie vod. Učební texty PřF UP v Olomouci,, 292 pp. Rulík, M., Holá,V., Růžička F., Votava, M. (2011)(eds.): Mikrobiální biofilmy. UP v Olomouci, 430 pp. Působení v zahraničí : Hankuk University of Foreign Studies, Korea visiting scholar - Dept. of Environmental Science Podpis datum

18 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Martin Dančák Tituly Mgr, Ph.D. Rok narození 1974 typ vztahu k VŠ pp rozsah 40 do kdy 08/20 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp rozsah 40 do kdy 08/20 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Ochrana a tvorba životního prostředí, PřF UP Olomouc (1997), Mgr. Botanika, PřF UP Olomouc (2004), Ph.D. Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Katedra botaniky PřF UP, odborný asistent ( ) Katedra ekologie a ŽP, PřF UP, odborný asistent (od r. 2011) Botanický ústav AV ČR, vědecký pracovník, jpp ( ) Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Obor řízení k jmenování profesorem Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Cvičení ze systému vyšších rostlin (BOT/SVCVU) 2004/ /11 Exkurze botanická (BOT/EXP) 2007/ /11 Fylogeneze a systém vyšších rostlin (EKO/FSVR) 2011/ /19 Ochrana fytogenofondu (BOT/OFGSB); 2003/ /11 Ochrana genofondu (BOT/OGFOP); 2003/ /07 Terénní botanická praxe (BOT/TBPO, EKO/TBP) 2009/ /19 Fytogeografie tropů (EKO/FYTR) 2012/ /19 Metody terénní botaniky (EKO/MTBOT) 2012/ /19 Tropická botanika (BOT/TRBOT, EKO/TRBOT ) 2005/ /19 Tropická exkurze (EKO/TREX) 2012/ /15 Tropické ekosystémy a ekologické koncepty (EKO/TREKO) 2012/ /15 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Dančák M., Hroneš M., Sochor M. & Sochorová Z. (2018): Thismia kelabitiana (Thismiaceae), a new unique Fairy Lantern from Borneo potentially threatened by commercial logging. - PLoS ONE 13(10): e Hroneš M., Rejžek M., Sochor M., Svátek M., Kvasnica J., Egertová Z., Pereira J. T., Nilus R. & Dančák M. (2018): Two new species of Thismia subsect. Odoardoa (Thismiaceae) from Borneo. - Plant Ecology and Evolution 151(1): Sochor M., Hroneš M., & Dančák M. (2018): New insights into variation, evolution and taxonomy of fairy lanterns (Thismia, Thismiaceae) with four new species from Borneo. Plant Systematics and Evolution 304(5), Sullivan, M. J., Lewis, S. L., Hubau, W., Qie, L., Baker, T. R., Banin, L. F., Chave J., Cuni-Sanchez A., Feldpausch T. R., Lopez-Gonzalez G., Arets E., Ashton P., Bastin J.-F., Berry N. J., Bogaert J., Boot R., Brearley F. Q., Brienen R., Burslem D. F. R. P., de Canniere Ch., Chudomelová M., Dančák M., Ewango C., Hédl R., Lloyd J., Makana J.-R., Malhi Y., Marimon B. S., Marimon B. H. Jr, Metali F., Moore S., Nagy L., Nuñez Vargas P., Pendry C. A., Ramírez-Angulo H., Reitsma J., Rutishauser E., Abu Salim K., Sonké B., Sukri R. S., Sunderland T., Svátek M., Umunay P. M., Vasquez Martinez R., Vernimmen R. R. E., Vilanova Torre E., Vleminckx J., Vos V. & Phillips O. L. (2018): Field methods for sampling tree height for tropical forest biomass 17

19 estimation. Methods in Ecology and Evolution 9(5): Qie L., Lewis S. L., Sullivan M. J. P., Lopez-Gonzalez G., Pickavance G. C., Sunderland T., Ashton P., Hubau W., Abu Salim K., Aiba S-I., Banin L. F., Berry N., Brearley F. Q., Burslem D. F. R. P., Dančák M., Davies S. J., Fredriksson G., Hamer K. C., Hédl R., Kho L. K., Kitayama K., Krisnawati H., Lhota S., Malhi Y., Maycock C., Metali F., Mirmanto E., Nagy L., Nilus R., Ong R., Pendry C. A., Poulsen A. D., Primack R. B., Rutishauser E., Samsoedin I., Saragih B., Sist P., Slik J. W. F., Sukri R. S., Svátek M., Tan S., Tjoa, A., van Nieuwstadt M., Vernimmen R. R. E., Yassir I., Kidd. P. S., Fitriadi M., Ideris N. K. H., Serudin R. M., Abdullah Lim L. S., Saparudin M. S. & Phillips O. L. (2017): Long-term carbon sink in Borneo s forests halted by drought and vulnerable to edge effects. Nature communications 8, DOI: /s Působení v zahraničí Universiti Brunei Darussalam, visiting researcher, 2007, 2009, , přibližně 1 měsíc v každém uvedeném roce Podpis datum

20 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Bořivoj Šarapatka Tituly prof., Dr., Ing., CSc. Rok narození 1959 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. PP rozsah 40 do N program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ SPU Nitra (SK) - profesorské řízení v oboru Krajinné inženýrství Akreditace MZe - akreditovaný poradce Filozofická fakulta Univerzity Palackého v Olomouci zkouška z pedagogiky Švédská zemědělská univerzita v Uppsale Doktorské studium - Dr habilitační řízení v oboru Ekologie doc Ministerstvo životního prostředí zkouška na posuzování vlivu staveb a činností na životní prostředí Mendelova zemědělská a lesnická univerzita (nyní Mendelova univerzita) - CSc Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci - 2 leté postgraduální studium Ekologie zemědělská v Brně (nyní Mendelova univerzita) - Ing. Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 1990 dosud - Katedra ekologie a životního prostředí Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci proděkan fakulty, vedoucí katedry ekologie a životního prostředí, od roku 2015 předseda Vědeckopedagogické rady oboru biologie a ekologie) Agroplan Praha - projektant - optimalizace využití krajiny a půdy. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Ekologie 1996 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 350 Cca Krajinné inženýrství 2005 SPU Nitra 400 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení - Výuka v Bc., Mgr. a doktorských programech na UP souvisejících s ekologií a ŽP, - vedení bakalářských, diplomových a doktorských prací a jejich oponentura, - členství v oborových radách doktorských programů (PřF UP Olomouc, PřF OSU Ostrava, MENDELU Lednice, PřF UK Bratislava, PřF UKF Nitra), - členství ve vědeckých radách 4 výzkumných ústavů, - členství v habilitačních komisích PřF UP, PřF UK Bratislava, PřF JčU Č. Budějovice, ČZU Praha, MENDELU Brno. Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k zabezpečovaným předmětům Příklady publikací od roku 2015: Bednar, M., Šarapatka, B. (2018): Relationships between physical-geographical factors and soil degradation on agricultural land, Environmental Research 164: Sarapatka, B., Cap, L., Bila, P. (2018): The varying effect of water erosion on chemical and biochemical soil properties in different parts of Chernozem slopes. Geoderma 314: Bilosova, H., Sarapatka, B., Stybnarova, M., Micova, P., Svozilova, M. (2017): Nitrogen leaching from grassland ecosystems managed with organic fertilizers at different stocking rates. Archives of Agronomy and Soil Science 63/11: Dytrtová, K., Šarapatka, B. Opršal, Z. (2016): Does organic farming influence landscape composition? Two cases from the Czech Republic. Agroecology and sustainable food systems 40/7:

21 Dumbrovský, M., Sobotková, V., Šarapatka, B., Váchalová, R., Pavelková, R., Váchal J. (2015): Long-Term Improvement in Surface Water Quality after Land Consolidation in a Drinking Water Reservoir Catchment. Soil and water research 10/1: Šarapatka, B., Bednář, M. (2015): Assessment of Potential Soil Degradation on Agricultural Land in the Czech Republic. Journal of environmental quality 44/1: Působení v zahraničí Swedish University of Agricultural Sciences Uppsala, Wageningen University, The Netherlands, University of Nebraska, Lincoln, USA, Bioforschung Austria, ZALF Müncheberg, Germany, a další univerzity a výzkumné organizace - Aktivní účast na řadě mezinárodních konferencí s tématem kvalita a ochrana půdy, krajinné plánování a agroekologie. Podpis datum

22 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Stanislav Bureš Tituly prof. Ing. CSc. Rok narození 1958 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Vysoká škole zemědělská, Brno, Lesnická fakulta, vědecká aspirantura (CSc.) 1990 zemědělská, Brno, Lesnická fakulta, lesní inženýrství (Ing.) 1982 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ SOUL Šternberk, pedagogický pracovník 1991-Zoolog, Správa CHKO Litovelské Pomoraví odborný asistent Katedra zoologie PřF UPOL docent, vedoucí katedry zoologie PřF UPOL dosud Profesor, vedoucí katedry PřF UPOL Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Zoologie 1996 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na 1805 profesorem VŠ Zoologie 2002 UP Olomouc Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Výuka: Ekologie chování, Ornitologie, Experimentální metody terénního výzkumu Podíl na výuce Evoluční biologie a Aplikované zoologie Školitel Bc., Mgr., PhD (8 úspěšných absolventů Ph.D.) Předseda komisí pro státní magisterské zkoušky, obhajobu rigorózních a doktorských prací, habilitačních a profesorských řízení Člen vědecké rady PřF UPOL Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Bureš S, Pavel V. 1997: The effect of nestling condition on risk-taking in meadow pipits. Anim. Behav. 54: Saetre G., Moum T., Bureš S., Král M., Adamjan M., Moreno J. 1997: A sexually selected character displacement in flycatchers reinforces premating isolation. Nature 387: Veen T. et all. 2001: Hybridization and adaptive mate choice in flycatchers. Nature 411: Saether A. et all. 2007: Sex Chromosome-Linked Species Recognition and Evolution of Reproductive Isolation in Flycatchers. Science 318: Bureš S. 2002: Ptactvo a hmyzí škůdci lesů a zahrad. TOMPRES 87 s. Bureš S., Weidinger K. 2003: Sources and timing of calcium intake during reproduction in flycatchers. Oecologia 442: Smeds L. et all. 2015: Evolutionary analysis of the female-specific avian W chromosome. Nature Communication 6, 7330 (open). Voeten D. et all. 2018: Wing bone geometry reveals active flight in Archaeopteryx. Nature Communication 9, 923 (open). 21

23 Působení v zahraničí Studijní pobyt USA Srpen 1992 Výzkumný pobyt Norsko červenec 1993, 1996, 1998, 2000, 2018 Podpis datum

24 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Ekologie Jméno a příjmení Eva Zažímalová Tituly prof. RNDr. CSc. Rok narození 1955 typ vztahu k VŠ pracovněprávní žádný rozsah do kdy Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pracovněprávní žádný rozsah do kdy Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. rozsah vztahu Členka vědecké rady UPOL žádný Údaje o oboru vzdělání na VŠ Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Praha - obor chemie odborná, specializace biochemie; ukončeno (prom. chem.) , RNDr. - obhájení práce a titul udělen Údaje o odborném působení od absolvování VŠ : postgraduální studium (aspirantura) v oboru biologie, specializace fyziologie rostlin; Československá akademie věd; obhájeno 1982 (prosinec), titul CSc. udělen v únoru ( a : Narození dcery a syna, mateřské dovolené) : Vědecká pracovnice ÚEB ČSAV. Odborné zaměření: auxin a receptory pro auxin ve vztahu k vývoji rostlinných orgánů (koleoptile a primární listy pšenice) a k vývoji rostlinné buňky (buněčné kultury tabáku). Od r. 1989: Vědecká pracovnice Ústavu experimentální botaniky AV ČR (ÚEB AVČR). Odborné zaměření: spolupůsobení rostlinných signálních látek (fytohormonů) auxinů a cytokininů při regulaci vývoje rostlinné buňky; molekulární mechanismy působení auxinů, přenašeče pro auxiny : Samostatná vědecká pracovnice, od 2005 docentka, Katedra fyziologie/experimentální biologie rostlin Př. f. UK, částečný pracovní úvazek (0,1-0,25) : Zástupkyně ředitelky ÚEB AVČR : Vedoucí Laboratoře hormonálních regulací u rostlin ÚEB AVČR : Ředitelka ÚEB AVČR, v. v. i : Vedoucí vědecká pracovnice, Biologické centrum AV ČR, částečný pracovní úvazek. 2013: Jmenována profesorkou pro obor anatomie a fyziologie rostlin na návrh UniverzityKarlovy : Členka Akademické rady AV ČR (na ÚEB AV ČR částečný pracovní úvazek). Od 2017: Předsedkyně AV ČR (na ÚEB AV ČR částečný pracovní úvazek). Od 2018: Vedoucí vědecká pracovnice, Mikrobiologický ústav AV ČR, částečný pracovní úvazek. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Anatomie a fyziologie rostlin 2004 Univerzita Karlova Přírodovědecká fakulta WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení Řízení konáno na VŠ nesleduji profesorem Anatomie a fyziologie rostlin hodnosti 2013 Univerzita Karlova (bez autocitací) Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Pravidelné semestrální přednášky na Př. f. UK: Fytohormony- MB130P15 (od 1994, garant přednášky ). Vybrané kapitoly z biochemie rostlin - MB130P53 (od 2002, garant přednášky ). Vedení (školitel) studentů magisterského (8, všechny práce obhájeny) a doktorského studia (12, dosud obhájených 10) v oborech Anatomie a fyziologie rostlin" a Biochemie" na Př. f. UK. 23

25 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Celkem 51 prací v časopisech s impaktním faktorem, kapitol v monografiích (zde uveden pouze seznam nejdůležitějších), h-index = 29 (dle WoS), počet citací 4103 (k , dle WoS, bez autocitací), průměrná citovanost práce 78x. Petrášek J, Černá A, Schwarzerová K, Elčkner M, Morris DA, Zažímalová E: Do Phytotropins Inhi bit Auxin Effiux by lmpairing Vesicle Traffic? - PLANT PHYSIOLOGY 131: , Paciorek T, Zažímalová E, Ruthardt N, Petrášek J, Stierhof Y.-D, Kleine-Vehn J, Morris DA, Emans N, Jtirgens G, Geldner N, and Friml J: Auxin inhibits endocytosis and promotes its own efflux from cells. - NATURE 435: , Petrášek J, Mravec J, Bouchard R, Blakeslee JJ, Abas M, Seifertová D, Wisniewska J, Tadele Z, Kubeš M, Čovanová M, Dhonukshe P, Skůpa P, Benková E, Perry L, Křeček P, Lee OR, Fink GR, Geisler M, Murphy AS, Luschnig C, Zažímalová E, Friml J: PIN proteins perforrn a rate-limiting function in cellula r auxin efflux. - SCIENCE 312: , Hoyerová K, Perry L, Hand P, Laňková M, Kocábek T, May S, Kottová J, Pačes J, Napier R, Zažímalová E: Functional characterization of PaLAX l, a putative auxin permease, in heterologous plant systems. - PLANT PHYSIOLOGY 146: , Mravec J, Kubeš M, Bielach A, Gaykova V, Petrášek J, Skupa P, Chand S, Benková E, Zažímalová E, and Friml J: Interaction of PIN and PGP transport mechanisms in auxin distribution-dependent development. - DEVELOPMENT 135: , Pemisová M, Klíma P, Horák J, Válková M, Malbeck J, Souček P, Reichman P, Hoyerová K, Dubová J, Friml J, Zažímalová E, Hejátko J: Cytokinins modulate auxin-induced organogenes is in plants via regulation ofthe auxinefflux. - PROC. NATL. ACAD. SCI. U. S. A. 106: , Růžička K, Šimášková M, Duclercq J, Petrášek J, Zažímalová E, Simon S, Friml J, Van Montagu M, Benková E: Cytokinin regulates roo t meristem activity via modulationofthe polar auxin transport. - PROC. NATL. ACAD. SCI. U.S. A. 106: , Mravec J, Skůpa P, Bailly A, Hoyerová K, Křeček P, Bielach A, Petrášek J, Zhang J, Gaykova V, StierhofY-D, Dobrev PI, Schwarzerová K, Rolčík J, Seifertová D, Luschnig Ch, Benková E, Zažímalová E, Geisler M & Friml J: Subcellular homeostasis of phytohormone auxin is mediated by the ER-localized PIN5 transporter.- NATURE 459: , Jelínková A, Malínská K, Simon S, Kleine-Vehn J, Pejchar P, Kubeš M, Martinec J, Friml J, Zažímalová E, Petrášek J: Probing plant membranes with FM dyes: tracking, dragging or blocking? - PLANT JOURNAL 61: , Robert S, Kleine-Vehn J, Barbez E, Sauer M, Paciorek T, Baster P, Yanneste S, Zhang J, Simon S, Čovanová M, Hayashi K, Dhonukshe P, Yang Z, Bednarek SY, Jones AM, Luschnig C, Aniento F, Zažímalová E, Friml J: ABPl Mediates Auxin Inhibition of Clathrin-Dependent Endocytosis in Arabidopsis. - CELL 143: , Zažímalová E, Murphy AS, Yang H, Hoyerová K, Hošek P: Auxin Transporters- Why So Many? COLD SPRING HARB PERSPECT BIOL 2010;2: a Křeček P, Skůpa P, Libus J, Naramoto S, Tejos R, Friml J, Zažímalová E: Protein family review: The PIN- FORMED (PIN) protein family ofauxin transporters. - GENOME BIOLOGY 2009, 10:249. Kubeš M, Yang H, Richter G, Cheng Y, Mlodzióska E, Wang X, Blakeslee J, Carra ro N, Petrášek J, Zažímalová E, Hoyerová K, Peer W, Murphy A: The Arabidopsis concentration-dependent influx/efflux transporter ABCB4 regulates cellular auxin levels in the root epidermis. - PLAN T JOURNAL 69: , Hošek P, Kubeš M, Laňková M, Dobrev PI, Klíma P, Kohoutová M, Petrášek J, Hoyerová K, Jiřina M, Zažímalová E: Auxin transport on cellular level: New insights supported by mathematical-modelling. - JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 63: , Barbez E, Kubeš M, Rolčík J, Beziat C, Pěnčík A, Wang B, Ruiz Rosquete M, Zhu J, Dobrev PI, Lee Y, Zažímalová E, Petrášek J, Geisler M, Friml J, Kleine-Vehn J: A novel putative auxin carrier family regulates intracellular auxin homeostasis in plants. - NATURE 485: , Leitner J, Petrášek J, Tomanov K, Retzer K, Pařezová M, Korbei B, Bachmair A, Zažímalová E, and Luschnig Ch: Lysine63-linked ubiquitylat ion of PIN2 auxin carrier protein gove rns horrnonally controlled adaptation 24

26 of Arabidopsis root growth. - PROC. NATL. ACAD. SCI. U. S. A. 109: , Simon S, Kubeš M, Baster P, Robert S, Dobrev PI, Friml J, Petrášek J, Zažímalová E: Defining the selectivity ofprocesses along the auxin response chain: a study using auxin analogues. - NEW PHYTOLOGIST 200: , Čovanová M, Sauer M, Rychtář J, Friml J, Petrášek J, Zažímalová E (2013) Overexpression of the AUXIN BINDING PROTEIN1 Modulates PIN-Dependent Auxin Transport in Tobacco Cells. - PLOS ONE 8(7): e doi: /jou rnal.pone ). Yin R, Han K, Heller W, Albert A, Dobrev PI, Zažímalová E, Schil.ffner AR: Kaempferol 3-O-rhamnoside-7-Orhamnoside is an endogenous flavonol inhibito r ofpolar auxin transport in Arabidopssi shoots. - NEW PHYTOLOGIST 201: , Zažímalová E, Petrášek J, Benková E (eds): Auxin and Its Role in Plant Development, pp. 444, DOI / _1, Springer-Verlag Wien Bouguyon E, Brun F, Meynard D, Kubeš M Pervent M, Leran S, Lacombe B, Krouk G, Guiderdoni E, Zažímalová E, Hoyerová K, Nacry P and Gojon A: Multiple mechanisms of nitrate sensing by Arabidopsis nitrate transceptor NRT NATURE PLANTS 1, 2015, DOI: /NPLANTS Kuhn BM, Errafi S, Bucher R, Dobrev P, Geisler M, Bigler L, Zažímalová E, Ringli Ch: 7-Rhamnosylated Flavonols Modulate Homeostasis of the Plant Hormone Auxin and Affect Plan t Development. - JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 291: , Steenackers W, Cesarino I, Klíma P, Quareshy M, Vanholme R, Comeillie S, Kumpf RP, Van de Wouwer D, Ljung,K GoeminneG, Novak O, Zažímalová E, Napier R, Boerjan W, Vanholme B: The allelochemical 3,4- (methylenedioxy)cinnamic acid (MDCA) inhibits lignificatio n and affects auxin homeostasis in Arabidopsis. - PLANT PHYSIOLOGY 172: , Simon S, Skůpa P, Viaene T, Zwievka M, Tejos R, Klíma P, Čarná M, Rolčík J, De Rycke R, Moreno I, Do brev PI, Orellana A, Zažímalová E, Friml J: PIN6 auxin transporter at endoplasmic reticulum and plasma membrane mediates auxin homeostasis and organogenesis in Arabidops is. - NEW PHVTOLOGIST 211 (1): 65-74, Steenackers W, Klíma P, Quareshy M, Cesarino I, Kumpf RP, Corneillie S, Araújo P, Viaene T, Goeminne G, Nowack MK, Ljung K, Friml J, Blakeslee JJ, Novak O, Zažímalová E, Napier R, Boerjan W, Vanholme 8: cis-cinnamic acid is a novel, natu ral auxin efflux inhibitor that promotes lateraj root formation. - PLANT PHYSIOLOGY 173: , Lacek J,R etzer K, Luschnig Ch, Zažímalová E (2017) Polar Auxin Transport. - In: els. John Wiley & Sons Ltd: Chichester. DOI: 1O.1002/ l5902.a pub2 Retzer K, Lacek J, Skokan R, del Genio Chi, Vosolsobě S, Laňková M, Malfnská K, Konstantinova N, Zažímalová E, Napier RM, Petrášek J, Luschnig Ch: Evolutionary Conserved Cysteines Function as cis- Acting Regulators of Arabidopsis PIN-FORMED 2 Distribution - INTERNATIONAL JO URNAL OF MOLECULAR SCIENCES 2017, 18, 2274; doi: /ijms Působení v zahraničí Žádné stáže delší než 3 týdny (vzhledem k onemocnění syna - od jeho čtyř let diabetes typu I - jsem nemohla mimo domov na delší dobu vycestovat) Podpis Eva Zažímalová, v. r. datum

27 G-I Hodnocení nezbytného personálního a dalšího zabezpečení a jeho rozvoje Součást vysoké školy Název oboru řízení Přírodovědecká fakulta Ekologie Hodnocení nezbytného personálního a dalšího zabezpečení a jeho rozvoje V oboru Ekologie probíhají habilitační a profesorská řízení již od 90. let. Během tohoto období se habilitovalo 6 docentů. Obor je personálně zabezpečen 2 profesory, 2 docenty a 6 odbornými asistenty. V nebližších letech se připravují další habilitace 3 odborných asistentů. Dr. T. Václavík má v současnosti 35 impaktovaných publikací, h-index 15 a 752 citací na WOS. Dr. Dančák má 30 publikací, h-index 11, 442 citací na WOS. Dr. Kuras má 23 publikací, h-index 7, 232 citací. O úrovni vědecké činnosti svědčí kvalita publikací. Za poslední 3 roky bylo v kvartilu Q1 publikováno 17 publikací a lze konstatovat, že úroveň publikací má vzestupný trend. Za posledních 5 let jsme měli 1 publikaci v časopise Science a 1 v Nature Communications. V dalším období chceme dále klást velký důraz na kvalitu vědecké práce tak, aby úspěšné publikace vznikaly především na domácím pracovišti a naši pracovníci byli v pozici garanta práce. Předpokládáme, že se obor bude rozvíjet v následujících směrech: (1) populační ekologie, demografie a dynamika savčích populací, (2) ekologie a konzervační biologie bezobratlých, (3) dopad klimatických a antropogenních změn v horských ekosystémech, (4) agroekologie a ekologie půdy, (5) mikrobiální ekologie vod, (6) krajinná ekologie, otázky fragmentace krajiny, revitalizace, biodiverzita, migrace, modelování distribuce druhů, a (7) rostlinná ekologie a taxonomie tropických deštných pralesů. 26

28 G-II Popis systému zajišťování kvality vzdělávací a tvůrčí činnosti Součást vysoké školy Název oboru řízení Odkaz na poslední zprávu o vnitřním hodnocení Přírodovědecká fakulta Ekologie Stručný popis systému zajišťování kvality vzdělávací a tvůrčí činnosti BFF-FF01-4C10-B925-8F9722D29332}&file=zprava_hodnoceni_kvality- 13_12_2018.pdf&action=default Systém zajišťování a vnitřního hodnocení kvality je v souladu se zákonem č. 111/1998 Sb., o vysokých školách a o změně a doplnění dalších zákonů, ve znění pozdějších předpisů, a příslušným nařízením vlády č. 274/2016 Sb., o standardech ve vysokém školství. Výsledkem hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností UP je zavedení systému zajišťování kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností a postupné aplikace standardů a postupů vnitřního hodnocení kvality na Univerzitě Palackého v Olomouci. Celý systém včetně způsobu přijímání nápravných opatření a následné podoby kontrolování jejich naplňování je definován vnitřním předpisem Pravidla systému zajišťování kvality vzdělávací, tvůrčí činnosti a s nimi souvisejících činností a vnitřního hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí činnosti a s nimi souvisejících činností Univerzity Palackého v Olomouci a na něj navazující vnitřní normou Postupy a metody zjišťování kvality na Univerzitě Palackého v Olomouci. Procesy vzniku a schvalování změn studijních programů upravuje vnitřní norma Akreditace studijních programů, udělování oprávnění uskutečňovat studijní programy a akreditace habilitačních řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP. Vnitřní požadavky na studijní programy stanovuje vnitřní norma Standardy pro institucionální akreditaci a standardy studijních programů. Veškeré požadavky na studijní programy jsou plně v souladu se standardy akreditací. Za kvalitu a řádné uskutečňování studijního programu ručí garant programu, který ve spolupráci s orgány příslušné fakulty dbá o obsahovou a metodickou kvalitu studijního programu, o řádné uskutečňování jeho výuky, jakož i o jeho rozvíjení a pravidelné hodnocení. Kvalita studijního programu jakožto kvalita příslušných pracovišť, na nichž je studijní program realizován, stejně jako kvalita akademických a dalších pracovníků podílejících se na jeho zajišťování je pravidelně sledována. Tyto výsledky hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností se zohledňují nejen při procesech akreditace, ale jsou na všech úrovních stěžejním nástrojem pro řízení univerzity. Systém zajišťování a vnitřního hodnocení kvality je z velké části ponechán ve správě jednotlivým fakultám a součástem s metodickým vedením a podporou příslušných útvarů rektorátu univerzity. Vedle komplexních analýz si jednotlivé fakulty či univerzitní zařízení zpracovávají například zprávy o studentském hodnocení výuky (každoročně), provádí šetření mezi absolventy (delší časový horizont) či se zajímají o hodnocení svých služeb v rámci jejich zlepšení a rozšiřování. Garantem systému zajišťování a hodnocení kvality je Rada pro vnitřní hodnocení, jež dohlíží, zda jsou naplňovány požadavky univerzity na kvalitu vzdělávací činnosti ve vzdělávacích programech a provádí její hodnocení. Výsledky hodnocení kvality slouží k monitorování současného stavu a jako podklad pro plánování, další řízení pracoviště a směřování studijního programu. Zveřejňování výsledků hodnocení kvality bylo doposud v gesci jednotlivých fakult, kdy fakulty nejčastěji zpracovávaly a na webových stránkách zveřejňovaly výsledky studentských evaluací. Kompletní Zpráva o vnitřním hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností UP je dostupná na webových stránkách univerzity. Celý systém je neustále se rozvíjejícím nástrojem, který umožňuje pravidelně monitorovat a usměrňovat probíhající činnosti a zároveň zohledňovat specifika jednotlivých fakult a studijních programů. Podrobný popis systému zajišťování kvality na UP je k dispozici na webových stránkách UP: 27

29 Příloha: Podepsané a naskenované osobní listy (část F-V) akademických pracovníků, kteří nemají k Univerzitě Palackého v Olomouci žádný pracovně-právní vztah.

30

31