Publikační činnost. 1. Vědecké monografie. 2. Kapitoly v monografiích. 3. Původní práce v časopisech a recenzovaných sbornících

Transkript

1 Publikační činnost 1. Vědecké monografie Neustupa J, Škaloud P, Peksa O, Kubátová A, Soldán Z, Černá K, Prášil K, Bukovská P, Vojta J, Pažutová M, Veselá J & Škaloudová M (2009): The biological soil crusts in Central European ecosystems, with special reference to taxonomic structure and ecology of the surface crusts at Czech ore-waste and ash-slag sedimentation basins Karolinum, Praha, ISBN Kapitoly v monografiích Eliáš M, Amaral R, Fawley KP, Fawley MW, Němcová Y, Neustupa J, Přibyl P, Santos LMA, Ševčíková T (2017): Eustigmatophyceae. In: Archibald JM et al. (eds.). Handbook of Protists. Springer, Cham, Switzerland, pp ISBN X Neustupa J. (2015): Chlorophyta (excl. Ulvophyceae). In: Frey W (ed.), Syllabus of Plant Families, Part 2/1, Photoautotrophic eukaryotic Algae. Schweizerbart Verl., Stuttgart, pp ISBN Neustupa J. (2015): Streptophyta p.p. (excl. Charophyceae). In: Frey W (ed.), Syllabus of Plant Families, Part 2/1, Photoautotrophic eukaryotic Algae. Schweizerbart Verl., Stuttgart, pp ISBN Neustupa J. (2015): Trentepohliales. In: Frey W (ed.), Syllabus of Plant Families, Part 2/1, Photoautotrophic eukaryotic Algae, Schweizerbart Verl., Stuttgart, pp ISBN Neustupa J & Škaloud P (2004): Contribution to the knowledge of soil algae of two abandoned industrial sedimentation basins in Eastern Bohemia. In: Kovář P (ed.) Natural recovery of man-made deposits in landscape (Biotic interactions and ore/ash-slag artificial ecosystems). Academia, Praha, p Němcová Y, Kalina T & Neustupa J (2001): Chrysomonády a slunivky s křemitými šupinami montánních a subalpinských rašelinišť Krkonoš. In: Štursa J et al. (eds.) Geoekologické problémy Krkonoš. KRNAP, Vrchlabí, p Němcová Y, Kalina T, Neustupa J & Nováková S (1999): Chrysomonády s křemitými šupinami v České republica II. Krkonoše. In: Řasy a prostředí. Algologická sekce ČBS, p Původní práce v časopisech a recenzovaných sbornících Procházková K, Němcová Y & Neustupa J (2018): Phyllosiphon duini sp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a species isolated from a corticolous phototrophic biofilm - Cryptogamie Algologie 39: IF = Neustupa J (2017): Asymmetry and integration of cellular morphology in Micrasterias compereana - BMC Evolutionary Biology 17: 1. IF = Štifterová A & Neustupa J (2017): Small-scale variation of corticolous microalgal covers: Effects of microhabitat, season, and space - Phycological Research 65: IF = Mutinová PT, Neustupa J, Bevilacqua S & Terlizzi A (2016): Host specificity of epiphytic diatom (Bacillariophyceae) and desmid (Desmidiales) communities - Aquatic Ecology 50: IF = Němcová Y, Pusztai M, Škaloudová M & Neustupa J (2016): Silica-scaled chrysophytes (Stramenopiles, Ochrophyta) along a salinity gradient: a case study from the Gulf of Bothnia western shore (northern Europe) - Hydrobiologia 764: IF = 2.056

2 Neustupa J (2016): Static allometry of unicellular green algae: scaling of cellular surface area and volume in the genus Micrasterias (Desmidiales) - Journal of Evolutionary Biology 29: IF = Poulíčková A, Neustupa J, Hašler P, Tomanec O & Cox EJ (2016): A new species, Navicula lothargeitleri sp. nov., within the Navicula cryptocephala complex (Bacillariophyceae) - Phytotaxa 273: IF = Procházková K, Němcová Y & Neustupa J (2016): Phyllosiphon ari sp. nov. (Watanabea clade, Trebouxiophyceae), a new parasitic species isolated from leaves of Arum italicum(araceae) - Phytotaxa 283: IF = Woodard K, Kulichová J, Poláčková T & Neustupa J (2016): Morphometric allometry of representatives of three naviculoid genera throughout their life cycle - Diatom Research 31: IF = Woodard K & Neustupa J (2016): Morphometric asymmetry of frustule outlines in the pennate diatom Luticola poulickovae (Bacillariophyceae) - Symmetry 8: 150. IF = Nováková R & Neustupa J (2015): Microalgal biofilms on common yew needles in relation to anthropogenic air pollution in urban Prague, Czech Republic - Science of the Total Environment 508: IF = Procházková K, Němcová Y, Kulichová J & Neustupa J (2015): Morphology and phylogeny of parasitic and free-living members of the genus Phyllosiphon (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) - Nova Hedwigia 101: IF = Procházková K, Němcová Y & Neustupa J (2015): A new species Jenufa aeroterrestrica (Chlorophyceae incertae sedis, Viridiplantae), described from Europe - Preslia 87: IF = Štifterová A & Neustupa J (2015): Community structure of corticolous microalgae within a single forest stand: evaluating the effects of bark surface ph and tree species - Fottea 15: IF = Kulichová J, Škaloud P & Neustupa J (2014): Molecular diversity of green corticolous microalgae from two submediterranean European localities - European Journal of Phycology 49: IF = Neustupa J, Šťastný J & Škaloud P (2014): Splitting of Micrasterias fimbriata (Desmidiales, Viridiplantae) into two monophyletic species and description of Micrasterias compereana sp. nov. - Plant Ecology and Evolution 147: IF = Poulíčková A, Mazalová P, Vašut RJ, Šarhanová P, Neustupa J & Škaloud P (2014): DNA content variation and its significance in the evolution of the genus Micrasterias (Desmidiales, Streptophyta) - PLOS One 9: e IF = Varella-Valentová J, Kleisner K, Havlíček J & Neustupa J (2014): Shape differences between the faces of homosexual and heterosexual men. - Archives of Sexual Behavior 43: IF = Eliáš M, Neustupa J, Pažoutová M & Škaloud P (2013): A case of taxonomic inflation in coccoid algae: Ellipsoidion parvum and Neocystis vischeri are conspecific with Neocystis (= Nephrodiella) brevis (Chlorophyta, Trebouxiophyceae) - Phytotaxa 76: IF = Němcová Y, Kreidlová J, Pusztai M & Neustupa J (2013): Mallomonas pumilio group (Chrysophyceae/Stramenopiles) - a revision based on the scale/scale-case morphology and analysis of scale shape - Nova Hedwigia Beih 142: IF = Neustupa J (2013): Patterns of symmetric and asymmetric morphological variation in unicellular green microalgae of the genus Micrasterias (Desmidiales, Viridiplantae) - Fottea 13: IF = Neustupa J, Němcová Y, Veselá J, Steinová J & Škaloud P (2013): Parachloroidium gen. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a novel genus of coccoid green algae from subaerial corticolous biofilms - Phycologia 52: IF = Neustupa J, Němcová Y, Veselá J, Steinová J & Škaloud P (2013): Leptochlorella corticola gen. et sp. nov. and Kalinella apyrenoidosa sp. nov.: two new Chlorella-like green microalgae (Trebouxiophyceae,

3 Chlorophyta) from subaerial habitats - International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 63: IF = Neustupa J & Štifterová A (2013): Distribution patterns of subaerial corticolous microalgae in two European regions - Plant Ecology and Evolution 146: IF = Neustupa J, Veselá J & Šťastný J (2013): Differential cell size structure of desmids and diatoms in the phytobenthos of peatlands - Hydrobiologia 709: IF = Poulíčková A, Bergová K, Hnilica R & Neustupa J (2013): Epibryic diatoms from ombrotrophic mires: diversity, gradients and indicating options - Nova Hedwigia 96: IF = Šťastný J, Škaloud P, Langenbach D, Nemjová K & Neustupa J (2013): Polyphasic evaluation of Xanthidium antilopaeum and X. cristatum (Zygnematophyceae, Streptophyta) species complex - Journal of Phycology 49: IF = Van de Vijver B, Moravcová A, Kusber WH & Neustupa J (2013): Analysis of the type material of Pinnularia divergentissima (Grunow in Van Heurck) Cleve (Bacillariophyceae) - Fottea 13: IF = Němcová Y; Kreidlová J, Kosová A & Neustupa J (2012): Lakes and pools of Aquitaine region (France) - a biodiversity hotspot of Synurales in Europe - Nova Hedwigia 95: IF = Neustupa J; Černá K & Šťastný J (2012): Spatio-temporal community structure of peat bog benthic desmids on a microscale - Aquatic Ecology 46: IF = Škaloud P, Šťastný J, Nemjová K, Mazalová P, Poulíčková A & Neustupa J (2012): Molecular phylogeny of baculiform desmid taxa (Zygnematophyceae) - Plant Systematics and Evolution 298: IF = Veselá J, Urbánková P, Černá K & Neustupa J (2012): Ecological variation within traditional diatom morphospecies; diversity of Frustulia rhomboides sensu lato (Bacillariophyceae) in European freshwater habitats - Phycologia 51: IF = Němcová Y, Eliáš M, Škaloud P, Hodač L & Neustupa J (2011): Jenufa gen. nov.: a new genus of coccoid green algae (Chlorophyceae, incertae sedis) previously recorded by environmental sequencing - Journal of Phycology 47: IF = Nemjová K, Neustupa J; Šťastný J; Škaloud P & Veselá J (2011): Species concept and morphological differentiation of strains traditionally assigned to Micrasterias truncata - Phycological Research 59: IF = Neustupa J, Černá K, & Šťastný J (2011): The effects of aperiodic desiccation on the diversity of benthic desmid assemblages in a lowland peat bog - Biodiversity and Conservation 20: IF = Neustupa J, Eliáš M, Škaloud P, Němcová Y & Šejnohová L (2011): Xylochloris irregularis gen. et sp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a novel subaerial coccoid green alga - Phycologia 50: IF = Neustupa J, Šťastný J, Nemjová K, Mazalová P, Goodyer E, Poulíčková A & Škaloud P (2011): A novel, combined approach to assessing species delimitation and biogeography within the well-known desmid species Micrasterias fimbriata and M. rotata (Desmidiales, Steptophyta) - Hydrobiologia 667: IF = Škaloud P, Nemjová K, Veselá J, Černá K & Neustupa J (2011): A multilocus phylogeny of the desmid genus Micrasterias (Streptophyta): evidence for the accelerated rate of morphological evolution in protists - Molecular Phylogenetics and Evolution 61: IF = Černá K & Neustupa J (2010): The ph-related morphological variations of two acidophilic species of Desmidiales (Viridiplantae) isolated from a lowland peat bog, Czech Republic - Aquatic Ecology 44: IF = Eliáš M, Němcová Y, Škaloud P, Neustupa J, Kaufnerová V & Šejnohová L (2010): Hylodesmus singaporensis gen. et sp. nov., a new autosporic subaerial green alga (Scenedesmaceae, Chlorophyta) from Singapore - International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60: IF = 1.930

4 Němcová Y, Neustupa J, Kvíderová J & Řezáčová-Škaloudová M (2010): Morphological plasticity of silica scales of Synura echinulata (Synurophyceae) in crossed gradients of light and temperature - a geometric morphometric approach - Nova Hedwigia Beih. 136: IF = Neustupa J, Řezáčová-Škaloudová M & Němcová Y (2010): Shape variation of the silica-scales of Mallomonas kalinae (Mallomonadales, Synurophyceae) in relation to their position on the cell body - Nova Hedwigia Beih. 136: IF = Neustupa J & Škaloud P (2010): Diversity of subaerial algae and cyanobacteria growing on bark and wood in the lowland tropical forests of Singapore - Plant Ecology and Evolution 143: IF = Neustupa J, Škaloud P & Šťastný J (2010): The molecular phylogenetic and geometric morphometric evaluation of Micrasterias crux-melitensis / M. radians species complex Journal of Phycology 46: IF = Poulíčková A, Veselá J, Neustupa J & Škaloud P (2010): Pseudocryptic diversity versus cosmopolitanism in diatoms: a case study on Navicula cryptocephala Kütz. (Bacillariophyceae) and morphologically similar taxa - Protist 161: IF = Řezáčová-Škaloudová M, Neustupa J & Němcová Y (2010): Effect of temperature on the variability of silicate structures in Mallomonas kalinae and Synura curtispina (Synurophyceae) - Nova Hedwigia Beih 136: IF = Savriama Y, Neustupa J & Klingenberg CP (2010): Geometric morphometrics of symmetry and allometry in Micrasterias rotata (Zygnemophyceae, Viridiplantae) - Nova Hedwigia Beih. 136: IF = Eliáš M & Neustupa J (2009): Pseudomarvania gen. nov. (Chlorophyta, Trebouxiophyceae), a new genus for budding subaerial green algae Marvania aerophytica Neustupa & Šejnohová and Stichococcus ampulliformis Handa - Fottea 9: IF = Fránková M, Poulíčková A, Neustupa J, Pichrtová M & Marvan P (2009): Geometric morphometrics a sensitive method for diatom morphospecies distinguishing: a case study on the sympatric populations of Reimeria sinuata and Gomphonema tergestinum (Bacillariophyceae) from the River Bečva, Czech Republic - Nova Hedwigia 88: IF = Machová-Černá K & Neustupa J (2009): Spatial patterns of algal assemblages in a peatbog ditch - International Review of Hydrobiology 94: IF = Neustupa J, Černá K & Šťastný J (2009): Diversity and morphological disparity of desmid assemblages in Central European peatlands - Hydrobiologia 630: IF = Neustupa J, Němcová Y, Eliáš M & Škaloud P (2009): Kalinella bambusicola gen. et sp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a novel coccoid Chlorella-like subaerial alga from Southeast Asia - Phycological Research 57: IF = Poulíčková A, Neustupa J, Špačková J & Škaloud P (2009): Distribution of epipelic diatoms in artificial fishponds along environmental and spatial gradients - Hydrobiologia 624: IF = Veselá J, Neustupa J, Pichrtová M & Poulíčková A (2009): Morphometric study of Navicula morphospecies (Baccilariophyta) with respect to diatom life cycle - Fottea 9: IF = Eliáš M, Neustupa J & Škaloud P (2008): Elliptochloris bilobata var. corticola var. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a novel subaerial coccal green alga - Biologia 63: IF = Hašler P, Štěpánková J, Špačková J, Neustupa J, Kitner M, Hekera P, Veselá J, Burian J & Poulíčková A (2008): Epipelic cyanobacteria and algae: a case study from Czech ponds - Fottea 8: IF = Neustupa J & Škaloud P (2008): Diversity of subaerial algae and cyanobacteria on tree bark in tropical mountain habitats - Biologia 63: IF = Neustupa J, Šťastný J & Hodač J (2008): Temperature-related phenotypic plasticity in the green microalga Micrasterias rotata - Aquatic Microbial Ecology 51: IF = 2.190

5 Neustupa J & Nemjová K (2008): Quantitative assessment of morphological variation of six Pseudococcomyxa strains by geometric morphometric descriptors - Fottea 8: IF = Šťastný J & Neustupa J (2008): Cosmarium gauthierae sp. nov. (Conjugatophyceae, Desmidiales) from an ephemeral pool in South-West Macedonia. - Cryptogamie Algologie 29: IF = Neustupa J, Eliáš M & Šejnohová L (2007): A taxonomic study of two Stichococcus species (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) with a starch-enveloped pyrenoid - Nova Hedwigia 84: IF = Neustupa J & Němcová Y (2007): A geometric morphometric study of the variation in scales of Mallomonas striata (Synurophyceae, Heterokontophyta) - Phycologia 46: IF = Neustupa J & Řezáčová M (2007): The genus Mallomonas (Mallomonadales, Synurophyceae) in several Southeast Asian urban water bodies - the biogeographic implications - Nova Hedwigia 84: IF = Neustupa J & Škaloud P (2007): Geometric morphometrics and qualitative patterns in the morphological variation of five species of Micrasterias (Zygnemophyceae, Viridiplantae) - Preslia 79: IF = Řezáčová M & Neustupa J (2007): Distribution of the genus Mallomonas (Synurophyceae) - ubiquitous dispersal in microorganisms evaluated. - Protist 158: IF = Neustupa J & Šťastný J (2006): The geometric morphometric study of Central European species of the genus Micrasterias (Zygnematophyceae, Viridiplantae) - Preslia 78: IF = Neustupa J (2005): Phenotypic plasticity of microalgal cultures in culture collections: a geometric morphometric appproach - Oceanol. Hydrobiol. Stud. 34: Neustupa J (2005): Investigations on the genus Phycopeltis (Trentepohliaceae, Chlorophyta) from South- East Asia, including the description of two new species - Cryptogamie Algologie 26: IF = Neustupa J & Hodač L (2005): Changes in shape of the coenobial cells of an experimental strain of Pediastrum duplex var.duplex (Chlorophyta) reared at different phs - Preslia 77: IF = Škaloud P, Neustupa J, Radochová B & Kubínová L (2005): Confocal microscopy of chloroplast morphology and ontogeny in three strains of Dictyochloropsis (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) - Phycologia 44: IF = Neustupa J (2004): Two new aerophytic species of the genus Podohedra DÜRINGER (Chlorophyceae) Arch. Hydrobiol./Algological Studies 112: Nováková S, Němcová Y, Neustupa J, Řezáčová M & Šejnohová L (2004): Silica-scaled chrysophytes in acid peat bogs of Bohemian Switzerland (Czech Republic) and Saxonian Switzerland (Germany) - Nova Hedwigia 78: IF = Nováková S, Řezáčová M, Němcová Y, Neustupa J & Kalina T (2004): Mallomonas actinoloma var. maramuresensis (Synurophyceae) - a new species in algal flora of the Czech Republic - Novit. Bot. Univ. Carol. 17: Řezáčová M, Neustupa J & Šejnohová L (2004): Five species of Mallomonas (Synurophyceae) new to the algal flora of the Czech Republic - Preslia 76: IF = Stibral K, Komárek S, & Neustupa J (2004): Přírodní estetika Josefa Velenovského Estetika 40: Němcová Y, Neustupa J, Nováková S & Kalina T (2003): Silica scaled chrysophytes of the Czech Republic Acta Univ. Carol. 47: Neustupa J (2003): The genus Phycopeltis (Trentepohliales, Chlorophyta) in tropical Southeast Asia Nova Hedwigia 76: IF = Neustupa J & Albrechtová J (2003): Aerial algae on spruce needles in the Krušné Hory Mts., Czech Republic - Czech Phycol. 3:

6 Neustupa J & Šejnohová L (2003): Marvania aerophytica sp. nov. a new aerial tropical green alga Biologia 58: IF = Šejnohová L, Škaloud P, Neustupa J, Nováková S, Řezáčová M, & Ošlejšková L (2003): Algae and cyanoprokaryotic species from peat bog, streams, ponds and aerial biotopes in the region of South Šumava Mts Czech Phycol. 3: Němcová Y, Neustupa J, Kalina T & Nováková S (2002): Silica-scaled chrysophytes of the Šumava National Park and the Třeboňsko UNESCO Biosphere Reserve (Southern Bohemia, Czech Republic) Nordic Journal of Botany 22: IF = Neustupa J (2002): An easy method for light microscopic distinguishing of xanthophycean and eustigmatophycean strains Czech Phycol. 2: Neustupa J, Nováková S, Šejnohová L, Škaloud P & Řezáčová M (2002): Algae from aquatic, peat bog and aerial biotopes in the catchment area of the River Křemelná in Šumava National Park Czech Phycol. 2: Němcová Y, Kalina T. & Neustupa J (2001): Chrysomonády a slunivky s křemitými šupinami alpinských a subalpinských rašelinišť Krkonoš - Opera Corcontica 37: Němcová Y, Kalina T, Neustupa J & Nováková S (2001): Silica-scaled chrysophytes of the Krkonoše Mountains (Czech Republic) - Algological Studies 101: Neustupa J (2001): Soil algae from marlstone-substratum based biotopes in the Nature park Džbán (Central Bohemia, Czech Republic) with special attention to the natural treeless localities Arch. Hydrobiol./Algological Studies 101: Neustupa J & Němcová Y (2001): Morphological and taxonomic study of three terrestrial eustigmatophycean species - Nova Hedwigia Beih. 123: Neustupa J, Němcová Y & Kalina T (2001): Silica-scaled Chrysophytes of Southern Bohemia and Českomoravská vrchovina (Czech-Moravian Highlands, Czech Republic) - Algological Studies 102: Neustupa J, Němcová Y & Kalina T (2001): Mallomonas pumilio var. pumilio a new species in algal flora of Czech Republic Novit. Bot. Univ. Carol. 13: Kalina T, Němcová Y & Neustupa J (2000): Silica-scaled chrysophytes of the Czech Republic 1. District Česká Lípa (Northern Bohemia) and part of the Central Bohemia Arch. Hydrobiol./Algological Studies 96: Němcová Y, Kalina T, Neustupa J & Nováková S (2000): Scale-bearing chrysophyte Mallomonas calceolus Bradley a new record from Czech Republic - Novit. Bot. Univ. Carol. 13: Neustupa J (1998): Prasiola crispa (Lightfoot) Meneghini in King`s preserve in Prague - Novit. Bot. Univ. Carol. 12: Učebnice a učební texty Prášil K, Nováková S, Neustupa J, Kubátová A, Peksa O & Soldán Z (2004): Praktická cvičení z kryptogamologie. Multimediální výukový materiál. UK v Praze, PřF. 5. Různé závažné práce Neustupa J, Kristiansen J & Němcová Y (2013): Chrysophytes and related organisms: new insights into diversity and evolution (eds.), Proceedings of the 8 th International Chrysophyte Symposium Schweizerbart Verl., Stuttgart, ISBN

7 posudky vědeckých manuskriptů pro následující odborná periodika s impakt faktorem: Annals of Botany; American Journal of Botany; Hydrobiologia; Protist; Journal of Phycology; Planta; Phycological Research; Phycologia; Preslia; Nova Hedwigia; BMC Evolutionary Biology; Diatom Research; Biologia; European Journal of Phycology; Cryptogamie Algologie; Algological Studies; Fottea; Plant Ecology and Evolution; Limnologica; Applied Sciences; Biological Journal of the Linnean Society; Geobiology; Geomicrobiology; Plos ONE; AIMS Environmental Science; Brazilian Journal of Botany; Nordic Journal of Botany; New Zealand Journal of Botany; Phytotaxa celkem dosud 146 vypracovaných posudků 6. Přednášky typu "invited speaker" Variation and asymmetry of segment shapes in marine green algae Halimeda tuna (Chlorophyta, Ulvophyceae). 5 th Biological Shape Analysis Symposium, Graduate School of Agriculture and Life Science, University of Tokyo, 2017 Growth and shape; morphospaces and allometric spaces. Faculty of Science, University of Ostrava, Complex symmetric patterns of the desmids (Desmidiales, Streptophyta): Quantitative morphometrics at the cellular level. EuroEvoDevo, 5 th Meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology, University of Vienna, Adolf Pascher's correspondence. Introduction of the web project. 8 th International Chrysophyte Symposium, Prague, Patterns of morphological integration in scales of Synura macracantha and S. petersenii concur with their different evolutionary age. 8 th International Chrysophyte Symposium, Prague, Species concepts and biogeography of Micrasterias (Desmidiales). How old drawings corroborate the molecular data. 5 th European Phycological Congress, Rhodes, Greece, 2011 What is and what is not Ettlia KOMÁREK? On the taxonomy of several trebouxiophycean algae. Seminar on the occasion of Prof. Jiří Komárek's 80 th birthday. Institute of Botany, Academy of Science, Třeboň, Morphological disparity of protistan assemblages the case study of benthic desmids in temperate peatlands. 6 th National Symposium on Morphometry and Shape Evolution, CNRS, Montpellier, How many subaerial algae are there in the rainforest? Singapore Botanical Gardens, Size and shape relation in algal morphometrics the environmental correlates and the patterns of allometry. 8 th International Chrysophyte Symposium, New London, Connecticut, Geometrics morphometrics new perspectives in algal form analysis. Albrecht-von-Haller Institute of Plant Sciences, University of Göttingen, The development of algal cultivation and culture collections tracing of the living legacy in Central European culture collections. BALTDER The Fifth Framework Programme Centre of Excellence for Baltic Development, Education and Research, Institute of Oceanography, University of Gdańsk, Collection of Algae of Charles University of Prague (CAUP) - recent activities. BALTDER The Fifth Framework Programme Centre of Excellence for Baltic Development, Education and Research, Institute of Oceanography, University of Gdańsk, Geometric morphometrics. Center of Machine Perception (CMP), ČVUT, Praha, Algae on living leaves - a microcosmos of biodiversity. Institute of Plant Sciences, Karl-Franzens University of Graz, 2003.

8 7. Přehledy a souborné referáty 8. Patenty národní a zahraniční, objevy 9. Disertační, rigorózní práce, habilitační práce disertační práce - Studies on taxonomy of aero-terrestrial algae, studijní program Botanika, PřF UK, 2003 habilitační práce - Form and shape in phycology from morphology to geometric morphometrics, PřF UK, Účast na řešení grantů , OP VVV, Zvýšení kvality vzdělávání na UK a jeho relevance pro potřeby trhu práce, odborní pracovník, garant připravovaného SP Evoluční biologie , GAČR, Integrated taxonomic and diversity research of subaerial epiphytic green algae in the Mediterranean ecosystems, hlavní řešitel , EU 7th Framework Programme, Development of an innovative, completely automated antifouling test system for professional examinations of marine coatings, spoluřešitel projektu, odborný pracovník , GAČR, Cryptic and pseudocryptic species differentiation in desmids (Desmidiales, Viridiplantae), hlavní řešitel , GAAV, Morphological disparity and temperature-related plasticity of desmids (Desmidiales), hlavní řešitel , GAČR, Diversity, ecological preferences and reproductive biology of freshwater epipelic diatoms, spoluřešitel , GAČR, Integrovaný výzkum biodiverzity a taxonomie aerofytických zelených řas v ekosystémech tropického deštného lesa, hlavní řešitel , GAUK, Ekologie krásivek v NPR Břehyně Pecopala, spoluřešitel , GAUK, Prostorová heterogenita společenstev sladkovodních nárostových sinic a řas, spoluřešitel , MŽP, Ekologická rozhraní: interakce živého a neživého v povrchových mikroekosystémech půd a antropogenních substrátů, spoluřešitel , GAČR, Metody geometrické morfometriky při studiu ekologie zelených řas ve sladkovodních a terestrických ekosystémech, hlavní řešitel , EU 5th Framework Programme, project BALTDER (The Fifth EC Framework Programme Centre of Excellence for Baltic Development, Education and Research), work package Culture collection of Baltic algae CCBA, odborný konzultant 2003, FRVŠ, Aplikace multimediálních prostředků v bakalářské výuce botaniky, spoluřešitel 2003, FRVŠ, Aplikace konfokální mikroskopie ve výzkumu chloroplastu zelených řas, hlavní řešitel 2002, FRVŠ, Inovace praktické výuky algologických předmětů, hlavní řešitel 2002, FRVŠ, Taxonomické a ekologické studie zajímavých řas aluviálních tůní Vltavského luhu, hlavní řešitel

9 , GAUK, Aerofytické epifylní řasy v ekosystémech tropického deštného lesa JV Asie, hlavní řešitel , GAUK, Eustigmatophyceae a Xanthophyceae na terestrických biotopech, hlavní řešitel , GAČR, Silica-scaled chrysophytes of Czech Republic, člen týmu projekty GAUK v roli garanta: , Hostitelská specifita, ekologické strategie a druhová diverzita řas rodu Phyllosiphon (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) , Autotrofní mikrobiální nárosty na jehlicích nahosemenných dřevin ve vztahu ke znečištění ovzduší , Struktura společenstev kortikolních řas v mikroměřítku , Fenotypová a genotypová variabilita vybraných zástupců penátních rozsivek (Bacillariophyceae) 11. Ostatní publikace Stibral K & Neustupa J (2007): Krajina dvakrát ničená - Ekolist 17(2): 8. Neustupa J (2006): Co je to geometrická morfometrika aneb morfologie znovu na scéně - Živa 54(2): Neustupa J (2006): Nové informace o kvalitě české přírodovědy - Živa 54(1): 14. Neustupa J. (2006): Strana zelených jako noví lidovci české politiky - Britské Listy, Neustupa J. (2006): Zelení po volbách - Britské Listy, Neustupa J. (2005): Expedice Titiwangsa - Lidé a Země 55(6): Neustupa J. (2005): Palmový olej není ekologickou alternativou fosilním palivům - Ekolist 15(8-9): Neustupa J. (2004): Oprava, správa a ochrana přírody - Ekolist 14(8-9): Neustupa J. (2004): Mlžné tropické lesy - Lidé a Země 53(8): Neustupa J. (2004): Evoluce podle Margulisové - Ekolist 14(7): Neustupa J. (2004): Krásivky - mikroskopické skvosty našich vod - Živa 52(1): Neustupa J & Stejskal L (2004): Lesy z Pána prstenů - Ekolist 14(3): 6-7. Stibral K & Neustupa J (2004): Kosmopolitní Melaka - Lidé a Země 53(1): Neustupa J. (2003): Šupinaté zlativky bičíkovci ve skleněném brnění - Živa 51(2): Neustupa J. (2003): Soumrak indonéských pralesů - Ekolist 13(6): 4-5. Neustupa J. (2003): Severní Celebes - Ekolist 13(12): Neustupa J. (2003): Warugy - uctívané hrobky - Lidé a Země 52(8): Stibral K & Neustupa J. (2003): Recenze - Westbroek, P. Život jako geologická síla - Ekolist 13(8-9): Neustupa J. (2002): Recenze - Primack, J. et al. Biologické principy ochrany přírody - Ekolist 12(11): 15. Neustupa J. (2001): Stěhujte se banka to platí - Ekolist 11(1): 6-7. Neustupa J & Stibral K (2001): V tropických pralesech Malajského poloostrova - Lidé a Země 50(10): Neustupa J. (2000): Jihovýchodní Afrika pod vodou - Ekolist 10(4): 9. Neustupa J. (2000): Zvítězí prales, nebo dálnice? - Ekolist 10(5): 5. Neustupa J. (2000): Tropické pralesy v ohrožení - Ekolist 10(11): Neustupa J. (1998): Zbaví se Malajsie svých pralesů? - Ekolist 8(10): 8-9.