Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
|
|
|
- Vratislav Marek Bílek
- před 7 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
2 Investice do rozvoje vzdělávání ZTOX / Základy Toxikologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
3 Investice do rozvoje vzdělávání Biotransformace a její regulace Radim Vrzal Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
4 Investice do rozvoje vzdělávání Rozdělení biotransformace Typy reakcí v jednotlivých fázích Cytochrom P450, Fáze biotransformace Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
5 Biotransformace a její regulace
6 Základní členění Účinek působení škodliviny je dán rozsahem metabolismu. Několik rodin enzymů se širokou substrátovou specifitou. Většina metabolismu xenobiotik = játra, střevo, plíce, kůže Fáze I zpolarizování sloučeniny (oxidace, redukce, hydrolýza - cytochromy P450, flavin obsahující monooxygenasy, reduktasy, hydrolasy, atd.) Fáze II vazba s endogenním substrátem (glukuronidasy, sulfotransferasy, methyltransferasy, atd.) - Fáze I + II deaktivace i aktivace (reaktivní intermediáty) Fáze III transport ven z buňky (P-glykoprotein, OATPs, OCTs) ( Fáze 0 transport dovnitř buňky)
7 Reakce fáze I. -Zavedení / odkrytí polární skupiny -Epoxidace/hydroxylace benzo(a)pyren (produkt spalování), aflatoxin B1 (mykotoxin) -Dealkylace ethylmorphine (opiátové analgetikum), p-nitroanisol (barviva)
8 Reakce fáze I. -Oxidace chlorpromazin (neuroleptikum) -Desulfurace parathion (insekticid), sirouhlík (na výrobu kaučuku, celofánu)
9 Cytochromy P450 pigment - absorbce při 450nm ve vazbě s CO - Protein + Hem - reakce: Reakce fáze I. -Monooxygenace dříve oxidace se smíšenou funkcí -Většina tkání játra, střeva, plíce - kotvený v ER mikrosomech -Nutná komponenta - reduktasa
10 Reakce fáze I. Klasifikace P450 podobnost v AK sekvenci CYP3A4 Individuální člen Cytochrom P450 Rodina, 40% homologie Podrodina, 55% homologie, geny na stejném chromosomu
11 Reakce fáze I rodin u savců - jen rodiny 1-3 metabolizují xenobiotika c.edu/cytochromep 450.html este.it/p450
12 Rodiny CYPů v metabolismu xenobiotik Reakce fáze I. CYP1 CYP1A1/1A2/1B1-1A1/2 překrývající se substrátové specifity aktivace prokarcinogenů - 1A1 extrahepatální enzym plíce, prsa - 1A2 jaterní enzym - indukce exprese polyaromatickými aryluhlovodíky (PAH), dioxiny přes AhR
13 Rodiny CYPů v metabolismu xenobiotik Reakce fáze I. - CYP2 10 podrodin - 2A6 převážně játra (halothan inhalační anestetikum; nikotin asociace s kouřením) - 2B6 játra vysoká variabilita mezi jedinci (methadon syntetický opiát, cyclophosphamide alkylační cytostatikum) - 2C8, 2C9, 2C19 játra cca 20 % - polymorfismus PM = poor metabolizers cca 3-5 % běloši, % Asiaté (mephenytoin antikonvulsivum) - 2E1 - regulace zvýšenou stabilitou mrna a proteinu (ethanol, acetaminophen) - CYP3-3A4 cca 30%, metabolizace cca 50-60% léčiv (cyklosporin A imunosupresivum; digitoxin srdeční selhání; midazolam antikonvulsivum, anxiolytikum; tamoxifen rakovina prsu) nutnost testovat na mezi-lékové interakce
14 Flavin obsahující monooxygenasy (FMO) Reakce fáze I. - závislé na NADPH a O 2-6 isoform FMO1-6, cca 82% podobnost mezi orthology - některé ztrácí expresi v dospělosti (FMO1) - nejvíce zastoupená isoforma FMO3 nezávislá na pohlaví (na rozdíl od jiných druhů) některé polymorfismy zodpovědné za fish odor syndrome neschopnost metabolizovat trimethylamin na N-oxid - látky obsahující nukleofil vhodný substrát (chlorpromazine, tamoxifen, nicotine) - FMO jsou termolabilní možnost odlišení CYP vs. FMO aktivity
15 Reakce fáze I. Nemikrosomální oxidace - mitochondrie, cytoplasma - Alkohol dehydrogenasa (EC ) - reakce je reversibilní - játra, ledviny, plíce - dimer, může použít NAD nebo NADP (pomalejší) - inhibice heterocykly (pyrazol, imidazol)
16 Reakce fáze I. Nemikrosomální oxidace - Aldehyd dehydrogenasa (EC ) - aldehydy tvorba z intermediálního metabolismu (biogenní aminy, lipidy) - často toxický účinek elektrofilní sloučeniny - lidé 16 genů + 3 pseudogeny - polymorfismus aldehyd dehydrogenasy 2 flushing syndrome u Asiatů (červenání v obličeji, tlukot srdce, kocovina) - Xanthine oxidase obsahuje Mo
17 Reakce fáze I. Nemikrosomální oxidace - Amin oxidasy - Monoamin oxidasy játra, mozek, ledviny, střeva, destičky - CNS turnover neurotransmiterů - Diamin oxidasy játra, ledviny, placenta - pyridoxal fosfát obsahující proteiny s mědí
18 Reakce fáze I. Cyklooxygenasy (kooxidace) - prostaglandin H synthasa plíce, ledviny (mikrosomy) - glykoprotein obsahuje hem - 2 formy COX-1 (housekeeping) / COX-2 (inducibilní, při zánětech) - v tkáních s nízkým CYP je vysoká exprese COX karcinogenicita aromatických aminů
19 Redukční reakce Reakce fáze I. - Nitro redukce některé bakteriální mikroflórou, enzymaticky (CYP) i neenzymaticky - Azo redukce anaerobní podmínky a NADPH, bakteriální mikroflóra - Disulfidové redukce mnoho reakcí vícestupňových, poslední reakce katalyzovaná glutathion reduktasou s GSH jako kofaktorem
20 Reakce fáze II. Konjugace produktů fáze I. s endogenními látkami - cukry, aminokyseliny, glutathion, sulfát, etc. - polárnější, méně toxické, snažší urinární exkrece Glukuronidace - reakce s uridin 5 -difosfoglukuronovou kyselinou (UDPGA) - absolutní požadavek ostatní UDP-cukry nestačí - katalýza UDP-glucuronosyl transferasou (UGT) mikrosomy jater, ledvin, střeva
21 Glukuronidace Reakce fáze II. - produkty méně chemicky a biologicky aktivní - vyjímky - N-hydroxy-2-acetylaminofluorine neschopen vazby na DNA bez metabolismu po glukuronidaci hepatocarcinogen - NSAIDs, hypolipemická léčiva (clofibrate), antikonvulsanty (kys.valproová) -2 rodiny - UGT1 - enzymy vzniklé alternativním splicingem (sdílené exony 2-5) 9 isoenzymů - UGT2 produkty rozdílných genů - glukuronidace steroidů, žlučových kyselin 10 isoenzymů - pouze UGT1A1 konjuguje bilirubin nedostatek či inhibice alternativním substrátem (ethinyl estradiol) žloutenka (bilirubin > 35 mm v krvi)
22 Sulfatace Reakce fáze II. - sulfotransferasy (SULTs), sulfatasy - hormony (testosteron, T3), katecholaminy, alkoholy, arylaminy - energeticky náročné 2 ATP pro syntézu PAPS (3 - phosphoadenosine 5 phosphosulfate) -nejen inaktivace ale i vznik reaktivních produktů (1- hydroxysafrole) -4 rodiny cytosolické enzymy - phenol SULTs (SULT1) - hydroxysteroid SULTs (SULT2) - SULT4A1, SULT6B1 -Široká tkáňová distribuce
23 Methylace Reakce fáze II. - methyltransferasy dárce CH 3 - skupiny je S-adenosyl methionin (SAM) - N-methyltransferasy nikotinamid N-methyltransferasa - O-methyltransferasy katechol-o-methyltransferasy vyžaduje SAM a Mg 2+ - methylace adrenalinu a noradrenalinu játra, ledviny cytosolická, membránově vázaná forma - S-methyltransferasy thiopurine S-methyltransferasa - mikrosomální enzym - 6-merkaptopurin (imunosupressivum) Biomethylace prvků - pomocí mikroorganismů - environmentální toxikologie methylace kovů zvyšuje dostupnost v živých systémech - enzymy využívají SAM nebo B12 Pb, Sn, Tl
24 Reakce fáze II. Glutathion-S-transferasy (GSTs) - konjugace elektrofilního substrátu s glutathionem (GSH) - 3 rodiny - cytosolická (savčí dimery) - mitochondriální - mikrosomální - buněčná ochrana před oxidačním stresem - distribuce - játra, ledviny, mozek - substráty GST - epoxidy, estery, peroxidy
25 Acetylace (arylamine N-acetyltransferases ) Reakce fáze II. - 2 typy reakcí detoxifikace - pomocí koenzymu A (CoA), N- acetylace (benzidine barviva) - aktivace cizí struktury a následná acylace aminokyselinou (O-acetylace) 3-nitrobenzanthrone (výfukové plyny)
26 Fáze III. Transmembránový přenos - P-glycoprotein (MDR1) transport rozličných sloučenin vně buňku (ATPdependent) cortisol, paklitaxel, cyklosporin A, vinblastin, rifampicin - OATPs (Organic anion transporting polypeptides) transport amfipatických rozpouštědel žlučové soli, organická barviva, thyroidní hormony - BBB, plíce, srdce, střevo - OCTs (Organic cation transporters) malé organické kationty tetramethylamonium, cholin, dopamin, serotonin - játra
27 Reaktivní metabolity - Interakce s buněčnými cíli toxický účinek a 50. léta 20.století důkaz konverze reaktivní metabolity azo barviva DAB (N,N-dimethyl- 4-aminoazobenzen ) hepatokarcinogen vazba na proteiny a nukleové kyseliny = elektrofilní sloučeniny (v těle reagují s nukleofily proteiny, nukleové kyseliny, GSH), volné radikály -Cesta aktivace je většinou minoritní
28 Reaktivní metabolity II. Parentální sloučenina (prokarcinogen) Ultimátní karcinogen/toxický metabolit Aktivační enzymy - tkáňově-specifická toxicita - inducibilita
29 Reaktivní metabolity III. -S krátkou dobou života vazba na parentální enzym sebevražené substráty tienilová kyselina -Se střední dobou života zůstávají v buňce kovalentní modifikace buňky = lokalizované tkáňové poškození -S dlouhou dobou života- transport do jiných částí těla (aromatické aminy metabolisace v játrech a transport do močového měchýře kde dochází k uvolnění v důsledku kyselosti moče) Faktory ovlivňující toxicitu reaktivních metabolitů - hladina aktivačního enzymu indukce vlastního metabolitu (PAH) - hladina konjugačního enzymu - hladina kofaktorů či konjugačních sloučenin N-acetylcystein
30 Reaktivní metabolity III. Osud metabolitů - vazba na makromolekuly - peroxidace lipidů - uvěznění a odstranění rovnováha přísunu a odstranění toxikantu protektivní role GSH
31 Parathion pesticid, sebevražedný substrát Reaktivní metabolity IV. Vinyl chlorid - sebevražedný substrát, karcinogen Methanol akumulace formaldehydu vede ke slepotě, příležitostně k smrti v důsledku acidosy, protijed = etanol
32 Reaktivní metabolity V. Aflatoxin B1 hepatokarcinogen, toxicita se liší mezi druhy Chloroform způsobuje akumulaci tuků a jaterní nekrosu
33 Reaktivní metabolity VI. Acetylaminofluoren eliminace jako glukuronid, aktivace jako sulfát Benzo(a)pyren cigaretový kouř, produkt nekompletního spalování, aktivace přes CYP1A1 a epoxidasovou hydrolasu
34 Reaktivní metabolity VII. Acetaminofen (paracetamol) deplece PAPS, UDPGA při vysokých dávkách toxicita Zvýšená bioaktivace CYP2E1 u alkoholiků!!!
35 Regulace enzymů biotransformace - zvýšením transkripce (ligandem aktivované transkripční faktory) PXR (pregnane X receptor), AhR (aryluhlovodíkový receptor) CYP1A, CYP3A, UGT, GST, MDR1. Ligand Cytosol Ligand 1 hsp90 hsp90 AhR p23 XAP H 2 O 2 AhR Reaktivní metabolity O Ligand 5 ARNT Ligand AhR 2 4 CYP1A AhRR Ligand SRC-1 TAF AhR ARNT TBP RNA pol II AhRR ARNT DRE Kancerogeneze 3 Jádro
36 - polymorfismus Regulace enzymů biotransformace II. - CYP2D6 8% bělochů autosomálně recesivní znak poor metabolizers nebezpečí u podávaných léčiv; >20 mutací známo - ztráta, abnormální, normální, zvýšená enzymová aktivita - nepřítomnost proteinu či syntéza nefunkčního - kompletní delece genu či jen delece nukleotidu s následkem posunu čtecího rámce - CYP2C19, 2C9 - stabilita mrna či proteinu - CYP2E1 transkripčně (aceton, alkohol) ale i stabilizací vazba enzymu se substrátem stabilita proteinu
37 Slovo závěrem.. Biotransformace = rovnováha mezi aktivací a detoxifikací + Genetika Prostředí Vhodná kombinace vás dostane až ke hvězdám..
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Investice do rozvoje vzdělávání ZTOX / Základy Toxikologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Metabolismus xenobiotik. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus xenobiotik Vladimíra Kvasnicová XENOBIOTIKA = sloučeniny, které jsou pro tělo cizí 1. VSTUP DO ORGANISMU trávicí trakt krev JÁTRA plíce krev kůže krev Metabolismus xenobiotik probíhá nejvíce
Biotransformace xenobiotik. M. Balíková
Biotransformace xenobiotik M. Balíková BITRANSFRMACE: změna chemické struktury látky působením živého organismu, katalýza biotransformace působením enzymů Většina enzymů vázána v hepatocytech Tvorba metabolitů
Eliminace léčiv. Doc. PharmDr. František Štaud, Ph.D.
Eliminace léčiv Doc. PharmDr. František Štaud, Ph.D. Katedra farmakologie a toxikologie Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Definice Eliminace je proces, při kterém se odstraňuje
METABOLISMUS NIKOTINU U ČLOVĚKA
METABOLISMUS NIKOTINU U ČLOVĚKA Z. Zloch Ústav hygieny LF UK Plzeň Výskyt nikotinu Cigaretový tabák obs. 1 1.5 % nikotinu, tj. 95 % všech přítomných alkaloidů Minoritní alkaloidy: nornikotin, anatabin,
Biotransformace Vylučování
Biotransformace Vylučování Toxikologie Ing. Lucie Kochánková, Ph.D. Biotransformace proces chemické přeměny látek v organismu zpravidla enzymaticky katalyzované reakce vedoucí k látkám tělu vlastním nebo
Xenobiochemie. Přednáška pro mediky. Prof. Dr. Sixtus Hynie, DrSc. ÚLB, 1. LF UK v Praze
Xenobiochemie Přednáška pro mediky Prof. Dr. Sixtus Hynie, DrSc. ÚLB, 1. LF UK v Praze 2005 Definice: Xenobiotika - látky tělu cizí, které mají často škodlivý účinek Původ slova podle: J. Kábrt a J. Kábrt:
Jaderné receptory II
Jaderné receptory II JADERNÉ RECEPTORY II PXR a CAR a metabolismus xenobiotik oba tyto receptory řadíme mezi tzv. sirotčí jaderné receptory (není znám jejich přirozený endogenní ligand), přestože jsou
ENZYMY 2. FÁZE BIOTRANSFORMACE:
ENZYMY 2. FÁZE BIOTRANSFORMACE: Glutathion-S-transferázy (GST) Uridindifosfoglukuronyltransferázy (UDPGT) Sulfotransferázy (SULF) N-, O-acetyltransferázy (NAT, OAT) Methyltransferázy Enzymy syntézy kyseliny
RNDr. Klára Kobetičová, Ph.D.
ENVIRONMENTÁLNÍ TOXIKOLOGIE ÚVODNÍ PŘEDNÁŠKA RNDr. Klára Kobetičová, Ph.D. Laboratoř ekotoxikologie a LCA, Ústav chemie ochrany prostředí, Fakulta technologie ochrany prostředí, VŠCHT Praha ÚVOD Předmět
Intermediární metabolismus. Vladimíra Kvasnicová
Intermediární metabolismus Vladimíra Kvasnicová Vztahy v intermediárním metabolismu (sacharidy, lipidy, proteiny) 1. po jídle (přísun energie z vnějšku) oxidace CO 2, H 2 O, urea + ATP tvorba zásob glykogen,
Biotransformace a vylučování. Ing. Zuzana Honzajková
Biotransformace a vylučování Ing. Zuzana Honzajková XENOBIOTIKA V ORGANISMU vstup látky do organismu Dochází k absorpci a distribuci k cílovým orgánům/receptorům (srdce, plíce, CNS ) Exkrece (vyloučení
Osud léčiv v organismu, aplikace léčiv. T.Sechser
Osud léčiv v organismu, aplikace léčiv T.Sechser Institut klinické a experimentální medicíny 6R 2LK 1.3.2007 tosc@volny.cz PROGRAM PREZENTACE Transport látek mebránami Absorpce, biologická dostupnost,
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd Úvod z řeckého EN ZYME (v kvasinkách) biologický katalyzátor, protein (RNA) liší se od chemických
Toxické látky v potravinách s nebezpečím onkologické aktivace
Toxické látky v potravinách s nebezpečím onkologické aktivace Doc. MUDr. Pavel Dlouhý, Ph.D. Ústav hygieny 3. LF UK, Praha Rizikové faktory pro vznik nádorů Obezita Nadměrný příjem tuků? Nadměrná konzumace
Chemické mutageny a jejich rozdělení
Promutageny Chemické mutageny a jejich rozdělení Metabolism usually results in the inactivation of the parent compound, but some of the metabolites generated are more toxic (genotoxic) than the parent
Přednáška č. 9 Transport, toxikokinetika a degradace polutantů
Přednáška č. 9 Transport, toxikokinetika a degradace polutantů Polutanty v životním prostředí a jejich transport jedním ze základních rysů, který odlišuje environmentální toxikologii a klasické toxikologické
OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184
OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184 Základy ADME a toxického hodnocení léčiv v preklinickém vývoji OCH/ADME LS 2012/2013 Metabolismus léčiv Indukční potenciál látek a interakce s nukleárními receptory PharmDr.Lucie
Klinická fyziologie a farmakologie jater a ledvin. Eva Kieslichová KARIP, Transplantcentrum
Klinická fyziologie a farmakologie jater a ledvin Eva Kieslichová KARIP, Transplantcentrum 2 5% tělesné hmotnosti 25 30% srdečního výdeje játra obsahují 10-15% celkového krevního objemu játra hepatocyty
Osud xenobiotik v organismu Biotransformace. M. Balíková
sud xenobiotik v organismu Biotransformace M. Balíková JED-NXA-DRGA-XENBITIKUM Látka, která po vstřebání do krve vyvolá chorobné změny v organismu Toxické účinky: a) přechodné b) trvale poškozující c)
Metabolismus xenobiotik. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus xenobiotik Vladimíra Kvasnicová Zajímavá kniha (vyšla 2011 / Triton) Kniha nabízí poutavé čtení o škodlivých látkách v potravinách, nápojích, kosmetice, lécích a potravinových doplňcích a
Glykolýza Glukoneogeneze Regulace. Alice Skoumalová
Glykolýza Glukoneogeneze Regulace Alice Skoumalová Metabolismus glukózy - přehled: 1. Glykolýza Glukóza: Univerzální palivo pro buňky Zdroje: potrava (hlavní cukr v dietě) zásoby glykogenu krev (homeostáza
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Investice do rozvoje vzdělávání ZTOX / Základy Toxikologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Genetická kontrola prenatáln. lního vývoje
Genetická kontrola prenatáln lního vývoje Stádia prenatáln lního vývoje Preembryonální stádium do 6. dne po oplození zygota až blastocysta polární organizace cytoplasmatických struktur zygoty Embryonální
Propojení metabolických drah. Alice Skoumalová
Propojení metabolických drah Alice Skoumalová Metabolické stavy 1. Resorpční fáze po dobu vstřebávání živin z GIT (~ 2 h) glukóza je hlavní energetický zdroj 2. Postresorpční fáze mezi jídly (~ 2 h po
Energetický metabolizmus buňky
Energetický metabolizmus buňky Buňky vyžadují neustálý přísun energie pro tvorbu a udržování biologického pořádku (život). Tato energie pochází z energie chemických vazeb v molekulách potravy (energie
Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy v Praze (http://www.lf2.cuni.cz)
Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy v Praze (http://www.lf2.cuni.cz) Biochemie Napsal uživatel Marie Havlová dne 8. Únor 2012-0:00. Sylabus předmětu Biochemie, Všeobecné lékařství, 2.
CHEMICKÉ ZNAKY ŽIVÝCH SOUSTAV
CHEMICKÉ ZNAKY ŽIVÝCH SOUSTAV a) Chemické složení a. biogenní prvky makrobiogenní nad 0,OO5% (C, O, N, H, S, P, Ca.) - mikrobiogenní pod 0,005%(Fe,Zn, Cu, Si ) b. voda 60 90% každého organismu - 90% příjem
Biochemie jater. Eva Samcová
Biochemie jater Eva Samcová Orgánová specializace Hlavní metabolické dráhy pro glukosu, mastné kyseliny a aminokyseliny jsou soustředěné okolo pyruvátu a acetyl-coa. Glukosa je primárním palivem pro mozek
Biotransformace a vylučování. Ing. Zuzana Honzajková, Ph.D.
Biotransformace a vylučování. XENOBIOTIKA V ORGANISMU vstup látky do organismu Dochází k absorpci a distribuci k cílovým orgánům/receptorům (srdce, plíce, CNS ) Exkrece (vyloučení z organismu) (moč, stolice,
Metabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus aminokyselin Vladimíra Kvasnicová Aminokyseliny aminokyseliny přijímáme v potravě ve formě proteinů: důležitá forma organicky vázaného dusíku, který tak může být v těle využit k syntéze dalších
Obecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 Obecný metabolismus. Regulace glykolýzy a glukoneogeneze (5). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie,
Osud xenobiotik v organismu. M. Balíková
Osud xenobiotik v organismu M. Balíková JED-NOXA-DROGA-XENOBIOTIKUM Látka, která po vstřebání do krve vyvolá chorobné změny v organismu Toxické účinky: a) přechodné b) trvale poškozující c) fatální Vzájemné
Eva Benešová. Dýchací řetězec
Eva Benešová Dýchací řetězec Dýchací řetězec Během oxidace látek vstupujících do různých metabolických cyklů (glykolýza, CC, beta-oxidace MK) vznikají NADH a FADH 2, které následně vstupují do DŘ. V DŘ
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze dvou) Forenzní biologická Biochemie, pathobiochemie a Toxikologie a bioterorismus analýza genové inženýrství Kriminalistické
Mgr. Eva Flodrová FN Brno,Oddělení lékařské genetiky Laboratoř molekulární diagnostiky.
Mgr. Eva Flodrová FN Brno,Oddělení lékařské genetiky Laboratoř molekulární diagnostiky eflodrova@fnbrno.cz enzymy katalyzující oxidativní metabolické reakce xenobiotik provádějí redukci C-, N-, S-, hydroxylaci,
Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech
Citrátový cyklus Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech 1. stupeň: OXIDACE cukrů, tuků a některých aminokyselin tvorba Acetyl-CoA a akumulace elektronů v NADH a FADH 2 2.
ENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY
ENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY Autor: Mgr. Stanislava Bubíková Datum (období) tvorby: 28. 3. 2013 Ročník: devátý Vzdělávací oblast: Člověk a příroda / Chemie / Organické sloučeniny 1 Anotace: Žáci se seznámí
1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2019 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
Metabolismus pentóz, glykogenu, fruktózy a galaktózy. Alice Skoumalová
Metabolismus pentóz, glykogenu, fruktózy a galaktózy Alice Skoumalová 1. Pentóza fosfátová dráha Přehledné schéma: Pentóza fosfátová dráha (PPP): Probíhá v cytozolu Všechny buňky Dvě části: 1) Oxidační
Intermediární metabolismus - SOUHRN - Vladimíra Kvasnicová
Intermediární metabolismus - SOUHRN - Vladimíra Kvasnicová Vztahy v intermediárním metabolismu (sacharidy, lipidy, proteiny) 1. po jídle (přísun energie z vnějšku) oxidace CO 2, H 2 O, urea + ATP tvorba
Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno:
Bruno Sopko Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno: Z předchozí rovnice vyplývá: Pokud katalýza při 25
1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2018 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
Regulace metabolických drah na úrovni buňky
Regulace metabolických drah na úrovni buňky EB Obsah přednášky Obecné principy regulace metabolických drah na úrovni buňky regulace zajištěná kompartmentací metabolických dějů změna absolutní koncentrace
Bílkoviny a rostlinná buňka
Bílkoviny a rostlinná buňka Bílkoviny Rostliny --- kontinuální diferenciace vytváření orgánů: - mitotická dělení -zvětšování buněk a tvorba buněčné stěny syntéza bílkovin --- fotosyntéza syntéza bílkovin
Regulace enzymové aktivity
Regulace enzymové aktivity MUDR. MARTIN VEJRAŽKA, PHD. Regulace enzymové aktivity Organismus NENÍ rovnovážná soustava Rovnováha = smrt Život: homeostáza, ustálený stav Katalýza v uzavřené soustavě bez
FARMAKOGENETIKA Léčba pomocí cíleného podávání léků Zohlednění rozdílů v odpovědi léčených Nežádoucí účinky farmakoterapie
FARMAKOGENETIKA FARMAKOGENETIKA Léčba pomocí cíleného podávání léků Zohlednění rozdílů v odpovědi léčených stejná dávka u srovnatelných jedinců (pohlaví, věk, hmotnost, diagnóza): (a) různá míra léčebného
Biotransformace Vylučování
Biotransformace Vylučování Toxikologie Ing. Lucie Kochánková, Ph.D. Biotransformace proces chemické přeměny látek v organismu zpravidla enzymaticky katalyzované reakce vedoucí k látkám tělu vlastním nebo
Xenobiotika a jejich analýza v klinických laboratořích
Xenobiotika a jejich analýza v klinických laboratořích BERÁNEK M., BORSKÁ L., KREMLÁČEK J., FIALA Z., MÁLKOVÁ A., VOŘÍŠEK V., PALIČKA V. Lékařská fakulta UK a FN Hradec Králové Finančně podporováno programy
Oligobiogenní prvky bývají běžnou součástí organismů, ale v těle jich již podstatně méně (do 1%) než prvků makrobiogenních.
1 (3) CHEMICKÉ SLOŢENÍ ORGANISMŮ Prvky Stejné prvky a sloučeniny se opakují ve všech formách života, protože mají shodné principy stavby těla i metabolismu. Např. chemické děje při dýchání jsou stejné
METABOLISMUS SACHARIDŮ
METABOLISMUS SACHARIDŮ PRINCIP Rozštěpené sacharidy vstřebávání střevní sliznicí do krevního oběhu dopraveny vrátnicovou žílou do jater. V játrech enzymaticky hexózy štěpeny na GLUKÓZU vyplavována do krve
Enzymologie. Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů.
ENZYMOLOGIE 1 Enzymologie Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů. Jak je možné, že buňka dokáže utřídit hrozivou změť chemických procesů, které v ní v každém okamžiku
ZTOX / Základy Toxikologie. Radim Vrzal
ZTOX / Základy Toxikologie Radim Vrzal I. Autobrewery syndrome (Gut fermentation syndrome, Endogennous ethanol fermentation) Bylo nebylo 23.9.2013 Muž měl unikátní chorobu, jeho tělo si samo vyrábělo alkohol
Abiotický stres - sucho
FYZIOLOGIE STRESU Typy stresů Abiotický (vliv vnějších podmínek) sucho, zamokření, zasolení půd, kontaminace prostředí toxickými látkami, chlad, mráz, vysoké teploty... Biotický (způsobený jiným druhem
AMPK AMP) Tomáš Kuc era. Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze
AMPK (KINASA AKTIVOVANÁ AMP) Tomáš Kuc era Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze 2013 AMPK PROTEINKINASA AKTIVOVANÁ AMP přítomna ve všech eukaryotních
Poděkování: Práce byla vypracována jako součást řešení grantů GAČR (P301/10/0356) a MŠMT ČR (MSM a 1M0505).
Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Studijní program: Biochemie Studijní obor: Biochemie Petra Škodová Enzymy metabolizující léčiva Enzymes metabolizing drugs Bakalářská práce Školitelka:
Regulace metabolizmu lipidů
Regulace metabolizmu lipidů Principy regulace A) krátkodobé (odpověď s - min): Dostupnost substrátu Alosterické interakce Kovalentní modifikace (fosforylace/defosforylace) B) Dlouhodobé (odpověď hod -
BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ
BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ SPOLEČNÉ ZNAKY ŽIVÉHO - schopnost získávat energii z živin pro své životní potřeby - síla aktivně odpovídat na změny prostředí - možnost růstu, diferenciace a reprodukce
19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza
19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza Proteosyntéza vyžaduje především zajištění primární struktury. Informace je uložena v DNA (ev. RNA u některých virů) trvalá forma. Forma uskladnění
BUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY
BUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY 1 VÝZNAM BUNĚČNÉ TRANSFORMACE V MEDICÍNĚ Příklad: Buněčná transformace: postupná kumulace genetických změn Nádorové onemocnění: kolorektální karcinom 2 3 BUNĚČNÁ TRANSFORMACE
Biotransformace xenobiotik
xenobiotika (zejména s log D 7,4 > 0) podléhají biochemickým reakcím biotransformace cílem zrychlení vylučování xenobiotik prostřednictvím zvýšení hydrofility (rozpustnosti ve vodě) výsledek biotransformace
živé organismy získávají energii ze základních živin přeměnou látek v živinách si syntetizují potřebné sloučeniny, dochází k uvolňování energie některé látky organismy nedovedou syntetizovat, proto musí
Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět -
Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět - Vladimíra Kvasnicová pracovna: 411, tel. 267 102 411, vladimira.kvasnicova@lf3.cuni.cz informace, studijní materiály: http://vyuka.lf3.cuni.cz Sylabus
Respirace. (buněčné dýchání) O 2. Fotosyntéza Dýchání. Energie záření teplo BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3
Respirace (buněčné dýchání) Fotosyntéza Dýchání Energie záření teplo chem. energie CO 2 (ATP, NAD(P)H) O 2 Redukce za spotřeby NADPH BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3 oxidace produkující
MATURITNÍ TÉMATA - CHEMIE. Školní rok 2012 / 2013 Třídy 4. a oktáva
MATURITNÍ TÉMATA - CHEMIE Školní rok 2012 / 2013 Třídy 4. a oktáva 1. Stavba atomu Modely atomu. Stavba atomového jádra, protonové a nukleonové číslo, izotop, izobar, nuklid, stabilita atomového jádra,
Heterocyklické sloučeniny, puriny a pyrimidiny
Heterocyklické sloučeniny, puriny a pyrimidiny Heterocyklické sloučeniny jsou organické látky, které obsahují v cyklickém řetězci mimo atomů uhlíku také atomy jiných prvků (N, O, P, S), kterým říkáme heteroatomy.
Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.
Toxikodynamika toxikodynamika (řec. δίνευω = pohánět, točit) interakce xenobiotika s cílovým místem (buňkou, receptorem) biologická odpověď jak xenobiotikum působí na organismus toxický účinek nespecifický
Biochemie kosti. Anatomie kosti. Kostní buňky. Podpůrná funkce. Udržování homeostasy minerálů. Sídlo krvetvorného systému
Biochemie kosti Podpůrná funkce Udržování homeostasy minerálů Sídlo krvetvorného systému Anatomie kosti Haversovy kanálky okostice lamely oddělené lakunami Kostní buňky Osteoblasty Osteocyty Osteoklasty
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie Studijní program: Biochemie Studijní obor: Biochemie
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie Studijní program: Biochemie Studijní obor: Biochemie MOŽNÁ ÚLOHA FLAVINOVÝCH MONOOXYGENAS V METABOLISMU CIZORODÝCH LÁTEK Potencial role
Toxikokinetika. Luděk Bláha, PřF MU
Toxikokinetika Luděk Bláha, PřF MU Co by si student(ka) měl(a) odnést? Jaké procesy chemická látka prodělává uvnitř ORGANISMU? Co je to TOXIKOKINETIKA a jaké popisuje procesy. Znát vstupy Přeměny Vylučování
METABOLISMUS SACHARIDŮ
METABOLISMUS SAHARIDŮ A. Odbourávání sacharidů - nejdůležitější zdroj energie pro heterotrofy - oxidací sacharidů až na. získávají aerobní organismy energii ve formě. - úplná oxidace glukosy: složitý proces
Charakteristika analýzy: Identifikace: APOLIPOPROTEIN A-I (APO-AI) Využití: negativní rizikový faktor aterosklerózy Referenční mez : g/l
Charakteristika analýzy: Identifikace: APOLIPOPROTEIN A-I (APO-AI) Využití: negativní rizikový faktor aterosklerózy Referenční mez : g/l Pohlaví Věk od Mez spodní Mez horní M 4 let 1,110 1,900 Z 50 let
Terminologie I. Jaká věda se zabývá interakcemi léčiv? Transport a distribuce léčiv v organismu
Transport a distribuce léčiv v organismu Tomáš Pruša Rev. 1.2 Jaká věda se zabývá interakcemi léčiv? Terminologie I Farmacie Zdravotnické odvětví, které se zabývá léčivy a zahrnuje jejich výzkum, vývoj,
Charakteristika složky 3) cytochrom-c NADH-Q-reduktasa cytochrom-c- oxidasa ubichinon cytochromreduktasa
8. Dýchací řetězec a fotosyntéza Obtížnost A Pomocí následující tabulky charakterizujte jednotlivé složky mitochondriálního dýchacího řetězce. SLOŽKA Pořadí v dýchacím řetězci 1) Molekulový typ 2) Charakteristika
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Mária Čudejková 2. Transkripce genu a její regulace Transkripce genetické informace z DNA na RNA Transkripce dvou genů zachycená na snímku z elektronového mikroskopu.
Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat
Biologie buňky 1665 - Robert Hook (korek, cellulae = buňka) Cytologie - věda zabývající se studiem buňek Buňka ozákladní funkční a stavební jednotka živých organismů onejmenší známý uspořádaný dynamický
Základní chemické pojmy
MZ CHEMIE 2015 MO 1 Základní chemické pojmy Atom, molekula, prvek, protonové číslo. Sloučenina, chemicky čistá látka, směs, dělení směsí. Relativní atomová hmotnost, molekulová hmotnost, atomová hmotnostní
Molekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA
Molekulární základy dědičnosti Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulární genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace DNA RNA
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. OBVSB/Obecná virologie Tento projekt je spolufinancován Evropským
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku)
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku) B I O L O G I E 1. Definice a obory biologie. Obecné vlastnosti organismů. Základní klasifikace organismů.
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 2. Posttranslační modifikace a skládání proteinů Ivo Frébort Biosyntéza proteinů Kovalentní modifikace proteinů Modifikace proteinu může nastat předtím než je
Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození
Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození bunka - stejná genetická výbava - funkce (proliferace, produkce látek atd.) závisí na diferenciaci diferenciace tkán - specializovaná produkce
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Transport elektronů a oxidativní fosforylace
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Transport elektronů a oxidativní fosforylace Oxidativní fosforylace vs. fotofosforylace vyvrcholení katabolismu Všechny oxidační degradace
ALKOHOL A JÁTRA. Metabolismus etylalkoholu. Petr Schneiderka ÚLD LF OU a FN Ostrava 1
ALKOHOL A JÁTRA Metabolismus etylalkoholu Petr Schneiderka ÚLD LF OU a FN Ostrava 1 Glukóza glykolýza anaerobně 2 Pyruvát anaerobně 2 Etanol + 2 CO 2 Alkoholové kvašení aerobně 2 Acetyl-CoA 2 Laktát Mléčné
Chemická reaktivita NK.
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Bi7015 Chemická reaktivita NK. Hydrolýza NK, redukce, oxidace, nukleofily, elektrofily, alkylační činidla. Mutageny, karcinogeny, protinádorově
Gymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora
Předmět: Náplň: Třída: Počet hodin: Pomůcky: Chemie (CHE) Organická chemie, biochemie 3. ročník a septima 2 hodiny týdně Školní tabule, interaktivní tabule, tyčinkové a kalotové modely molekul, zpětný
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 2. Posttranslační modifikace a skládání proteinů Ivo Frébort Biosyntéza proteinů Kovalentní modifikace proteinů Modifikace proteinu může nastat předtím než je
Chemie nukleotidů a nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky)
Chemie nukleotidů a nukleových kyselin Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky) NH 2 N N báze O N N -O P O - O H 2 C H H O H H cukr OH OH nukleosid nukleotid Nukleosidy vznikají buď syntézou
Bp1252 Biochemie. #2 Biologicky významné organické sloučeniny
Bp1252 Biochemie #2 Biologicky významné organické sloučeniny Uhlovodíky Sloučeniny uhlíku a vodíku Alkany Methan C 4 hlavní složka zemního plynu 2,2,4-Trimethylpentan tzv. isooktan v benzínech 3 C 3 C
Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Metabolismus lipidů - odbourávání. VY_32_INOVACE_Ch0212
Vzdělávací materiál vytvořený v projektu P VK Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí svobození 20 Číslo projektu: Název projektu: Číslo a název klíčové aktivity: CZ.1.07/1.5.00/34.0211 Zlepšení podmínek
Biotransformace cizorodých látekl. Eva Samcová
Biotransformace cizorodých látekl Eva Samcová Jed je látka způsobující otravu i v jednorázových malých dávkách, nebo poškozuje organismus v nepatrných opakovaných dávkách, jejichž účinek se sčítá. Účinek
Genetika člověka GCPSB
Inovace předmětu Genetika člověka GCPSB Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Genetika člověka / GCPSB 7. Genetika
Příloha č. 3 k rozhodnutí o převodu registrace sp. zn. sukls198549/2010 SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU
Příloha č. 3 k rozhodnutí o převodu registrace sp. zn. sukls198549/2010 1. NÁZEV PŘÍPRAVKU LANBICA 50 mg Potahované tablety SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU 2. KVALITATIVNÍ A KVANTITATIVNÍ SLOŽENÍ 1 potahovaná
Pentosový cyklus. osudy glykogenu. Eva Benešová
Pentosový cyklus a osudy glykogenu Eva Benešová Pentosový cyklus pentosafosfátová cesta, fosfoglukonátová cesta nebo hexosamonofosfátový zkrat Funkce: 1) výroba NADPH 2) výroba ribosa 5-fosfátu 3) zpracování
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie Napište vzorce aminokyselin Q a K
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2017 1. Napište vzorce aminokyselin Q a K Dále zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná odpověď) 2. Enzym tyrozinkinasu řadíme do třídy
1. ročník Počet hodin
SOUSTAVY LÁTEK A JEJICH SLOŽENÍ rozdělení přírodních látek a vlastnosti chemických látek soustavy látek a jejich složení STAVBA ATOMU historie pohledu na atom složení a struktura atomu stavba atomu VELIČINY
vysoká schopnost regenerace (ze zachovalých buněk)
JÁTRA Jaterní buňky vysoká schopnost regenerace (ze zachovalých buněk) po resekci 50 60 % jaterní tkáně dorostou lidská játra do předoperační velikosti během několika měsíců (přesný mechanismus neznáme)
Metabolismus hemu a železa. Alice Skoumalová
Metabolismus hemu a železa Alice Skoumalová Struktura hemu: Porfyrin koordinovaný s atomem železa Postranní řetězce: methyl, vinyl, propionyl Hem tvoří komplex s proteiny: Hemoglobin, myoglobin a cytochromy
Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin Ing. Kateřina Tmejová, Ph. D.,