MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková

Podobné dokumenty
Cvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ

Cvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ

Ž i v o t n o s t (= životaschopnost = vitalita = viabilita)

5. Bioreaktory. Schematicky jsou jednotlivé typy bioreaktorů znázorněny na obr Nejpoužívanějšími bioreaktory jsou míchací tanky.

Životaschopnost. (= vitalita = viabilita) počet živých buněk. 100 = [%] počet všech buněk

Praktický kurz Monitorování toxicity vybraných cytostatik pomocí MTT testu a real-time monitoringu xcelligence.

DYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU

Kultivace bun k in vitro

Metody sterilní práce. Očkování a uchovávání mikroorganismů.

STANOVENÍ CYTOTOXICITY LÉČIV IN VITRO (XTT ASSAY)

DIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE V LABORATORNÍCH PODMÍNKÁCH

Zkouška inhibice růstu řas

Protokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test

Kultivační metody stanovení mikroorganismů

OPTIMALIZACE PROCESU KULTIVACE ZELENÝCH ŘAS S VYUŽITÍM DIGESČNÍCH ZBYTKŮ ZE ZEMĚDĚLSKÝCH BIOPLYNOVÝCH STANIC. Ing. Pavla Hrychová

TEORETICKÝ ÚVOD. Počítání buněk

Přímé stanovení celkového počtu buněk kvasinek pomocí Bürkerovy komůrky Provedení vitálního testu

Izolace nukleových kyselin

Řasový test ekotoxicity na mikrotitračních destičkách

1) Pojem biotechnologický proces a jeho fázování 2) Suroviny pro fermentaci 3) Procesy sterilizace 4) Bioreaktory a fermentory 5) Procesy kultivace,

Mnohobuněčné kvasinky

Laboratorní testování na přítomnost koliformních bakterií, psychrotrofních a termorezistentních mikroorganismů a sporotvorných anaerobních bakterií

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

Úvod do mikrobiologie

KBB/BB2 Buněčná biologie II - cvičení (LS)

Tkáňové kultury rostlin. Mikropropagace

Metabolismus, taxonomie a identifikace bakterií. Karel Holada khola@lf1.cuni.cz

DETEKCE MIKROORGANISMŮ Srovnání s jinými mikrobiologickými metodami Praktické aplikace. Ladislav Čurda Ústav technologie mléka a tuků VŠCHT Praha

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

Zbytky léčiv v ŽP a jejich dopady na potravinářské technologie

Minulost, současnost a budoucnost práce v embryologické laboratoři RNDr. Kateřina Wagnerová, Mgr. Pavlína Motlová, MUDr.

Médium LymphoGrow. Informace o produktu

10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách

Studium cytotoxicity a protizánětlivých účinků zlata a stříbra

RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013)

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:

Stanovení celkového počtu mikroorganismů

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

DYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU

Diagnostické metody v lékařské mikrobiologii

Endocytóza o regulovaný transport látek v buňce

Hodnocení pekařského droždí

2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

POČÍTÁNÍ BUNĚK. Část mřížky Bürkerovy komůrky. Výška prostoru, v němž jsou buňky nad mřížkou počítány, je 0,1 µm

ANAEROBNÍ LABORATOŘ VYUŽITÍ FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE PRO STUDIUM BIOREMEDIAČNÍCH PROCESŮ ZA ANAEROBNÍCH PODMÍNEK. Fluorescenční analytika

Buněčné kultury. Buněčná kultura jako zdroj biologického materiálu.

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích

EKOTOXIKOLOGICKÉ TESTY

MIKROBIOLOGIE. Grampozitivní kokovitá bakterie STAPHYLOCOCCUS AUREUS bakteriální kmen dle ATCC 1260 (CCM 888).

1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru

Médium MarrowGrow. Informace o produktu. Médium MarrowGrow MGM ml. Při práci dodržujte zásady práce s biohazardním materiálem

2012 STÁTNÍ ÚSTAV PRO KONTROLU LÉČIV

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop

Poměr CNP v bioremediacích

Úvod do potravinářské legislativy Lekce 7-1: mikrobiologické požadavky na potraviny

Biologické čištění odpadních vod - anaerobní procesy

Nutriční aspekty konzumace mléčných výrobků

Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie

Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin

Microbiology of food and animal feeding stuffs - General rules for microbiological examinations

Porovnání cytotoxicity organických sloučenin navázaných na vzduchové částice

BUNĚČNÝ CYKLUS. OMNIS CELLULA ET CELLULA - buňka vzniká jen z buňky. Sled akcí, ve kterých buňka zdvojí svůj obsah a pak se rozdělí

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS

Základní techniky práce s tkáňovými kulturami

Minerální výživa na extrémních půdách. Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů

COMET ASSAY (SINGLE CELL GEL ELECTROPHORESIS)

AEROBNÍ MIKROORGANISMY UMOŽŇUJÍCÍ BIOREMEDIACI PŮDNÍ MATRICE KONTAMINOVANÉ TCE, DCE

DEN OTEVŘENÝCH DVEŘÍ NA ÚMG

FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

Biologické čištění odpadních vod - anaerobní procesy

Lactobacillus brevis kazit pivo

Makrofágy a parazitární infekce

NÁVRH A PŘÍPRAVA PEPTIDŮ A LIPOPEPTIDŮ S ANTIMIKROBIÁLNÍM ÚČINKEM A STUDIUM JEJICH BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ

KATALOG PRODUKTŮ PRO FILTRACI A SEPARACI Mikrofiltrace

Rozdělení imunologických laboratorních metod

ANÉMIE CHRONICKÝCH CHOROB

Využití antibakteriálních testů v textilním průmyslu Mgr. Irena Šlamborová, Ph.D.

MASTITIDY KLINICKÉ SUBKLINICKÉ 20-40%

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KVASINEK RODU SACCHAROMYCES

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR

Nastavení metod pro imunofenotypizaci krevních. EXBIO Praha, a.s.

Základy pedologie a ochrana půdy

Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku

Buněčné kultury. Kontinuální kultury

Faktory ovlivňující úspěšnost embryologické laboratoře

Serologické vyšetřovací metody

PROLIFERACE VIABILITA DIFERENCIACE (APOPTÓZA) Změna cytokinetických parametrů odráží efekt použitých modulátorů signálních drah

Chemické výpočty II. Vladimíra Kvasnicová

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

LABORATORNÍ STUDIE ANTIMIKROBNÍ AKTIVITY CHLOROVÝCH PŘÍPRAVKŮ NA BÁZI DICHLORIZOKYANURANU SODNÉHO

Doprava, zdraví a životní prostředí Brno,

Advanced Therapies Products Produkty Moderní terapie a výrobní laboratoře. Barbara Kubešová

Funkční vzorek 4595/2018. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Streptococcus suis

ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY

DEN OTEVŘENÝCH DVEŘÍ NA ÚMG

LIDSKÁ CYTOGENETIKA Laboratorní diagnostika

Transkript:

MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk 15.11./16.11.2016 Jana Horáková

Doporučená literatura M. Vejražka: Buněčné kultury http://bioprojekty.lf1.cuni.cz/3381/sylabyprednasek/textova-verze-prednasek/bunecnekultury-vejrazka.pdf I. Freshney: Culture of Animal Cells

Buňky Primární Sekundární (buněčné kultury) Kmenové možnost diferenciace za využití růstových faktorů Tkáňově diferencované

Buněčné kultury Výhody Nevýhody Pokusy na izolovaném, dobře charakterizovaném buněčném typu Neomezené množství experimentů Chybí interakce s ostatními buněčnými populacemi ( tkáňový kontext ) Nefyziologické podmínky kultivace (umělé médium, vyšší tlak kyslíku)!!! Interpretace výsledků!!!

Kultivace buněk in vitro Sterilní podmínky (jednorázový spotřební materiál, speciální chemikálie) Praktická cvičení: kultivace fibroblastů

Podmínky kultivace Přísun cukrů, solí, aminokyselin, vitaminů, mastných kyselin, proteinů bikarbonátový pufrovací systém udržující ph v rozmezí 7,2-7,4 5% CO 2, 37 C ph indikátor: fenolová červeň růžová barva při optimálním ph žlutá-kyselé ph, fialová- zásadité ph Médium s obsahem 10% FBS (proteiny, růstové faktory) Přídavek směsi antibiotik/antimykotik

Pasážování buněk Při dosažení 70-80% konfluence (souvislé vrstvy buněk) naředění buněk Uvolnění adherentních buněk od kultivačního povrchu i od sebe navzájem, přenesení do nové kultivační nádoby s čerstvým médiem Způsob: působení proteáz (trypsin), odstranění dvojmocných iontů (EDTAchelatačně váže Ca 2+, Mg 2+ )

Buňky v suspenzi po trypsinizaci 80% konfluence vhodné k pasážování

Růst buněk Růstová křivka: A - statická fáze (lag fáze): příprava na buněčné dělení B - exponenciální (log) fáze: intenzivní množení buněk do vyčerpání živin C - stacionární fáze (plató): počet buněk se nemění, počátek akumulace toxických produktů D - fáze odumírání

T (osa x)=čas L (osa y)=počet buněk Růstová křivka

Růst buněk při kultivaci in vitro Snaha o udržení log fáze (exponenciální nárůst počtu buněk) Kontaktní inhibice při dosažení konfluence Před dosažením plató fáze pasážování (naředění na takové množství, aby kultura opět rostla exponenciálně)

Laboratoř TI 3T3 mouse fibroblasts HHDF - Normal human dermal fibrobalsts (Lonza) MG-63 bone cells (ATCC) HUVEC - Human Umbilical Vein Endothelial Cells (Lonza)

Sterilizace Odstranění mikroorganismů z prostředí, ve kterém se pracuje s buněčnými kulturami Zásadní krok při kontaminaci buněčných kultur: destrukce buněk, pomalý růst, změna chování, přenos kontaminace na další buněčné kultury, Dodržování GLP-přesné a opakovatelné výsledky, minimalizuje biohazard risk

Kontaminace buněčných kultur Bakterie (přidávání antibiotik do kultivačních médií) viditelné v mikroskopu Mykoplasmata intracelulární parazité (nezjistitelné při mikroskopické kontrole), testování na přítomnost mykoplasmat Plísně, kvasinky (přídavek antimykotik) mikroskopie Viry vzácně, obtížná detekce

Opatření při kontaminaci Zpomalení proliferace, změna vlastností buněk Likvidace kultury Asanace laboratoře a inkubátoru Příprava nových kultivačních médií Obnovení kultury ze zmražené zálohy

Uchovávání buněk (kryoprezervace) Možnost dlouhodobého uchovávání v hlubokomrazícím boxu (-80 C) nebo v parách kapalného dusíku (-196 C) Přidání kryoprotektiv (DMSO, glycerol) zabrání poškození krystaly vody při zmražování buněk Záloha při kontaminaci, načasování pokusů

Metabolické testy MTT, MTS, XTT, WST Nepřímá kvantifikace buněk měření jejich metabolické aktivity

Praktické cvičení Práce v čistých prostorech laboratoře TI dodržování striktních pravidel sterilní práce 1. Stanovení počtu buněk pomocí Burkerovy komůrky 2. Pasážování 3T3 fibroblastů 3. Nativní preparát buněk bukální sliznice 4. Kalibrační křivka MTT tesu

Počítání buněk

Čtverec A rozměry 1 mm x 1 mm x 0,1 mm V=0,1 mm 3 Výsledek uváděn jako počet buněk v 1 ml 1 mm 3 =0,001 ml 0,1 mm 3 = 0,0001 ml

Výpočet Průměrný počet buněk ve čtverci A 10,4 buněk 0,0001 ml x buněk 1 ml X= 104000 Výsledek se uvádí jako 1,04x10 5 buněk/1ml!!! Ředění buněčné suspenze!!!

Trypan blue