vyvětlivky: = 15 až 30 C t. = 4 až 8 C *) = nelze-li jinak 1. Zažívací ústrojí Oddělení klinické mikrobiologie NNB, tel. 2323 Manuál pro odběr primárních vzorků 1/8 Manuál je příloha Laboratorní příručky OKM - aktuální verze na intranetu a webu NNB Pozn.: Pro bakteriologii platí: čím kratší doba od odběru do zpracování vzorku, tím větší výtěžnost vyšetření Nedodržení optimálního intervalu od odběru do dodání však není důvodem k odmítnutí vzorku. Pozn.: - lze provést pouze během běžné pracovní doby, max. doba je doba od příjmu materiálu. Pozn.: mikroskopie - hodnotit lze pouze během pracovní doby VŠ - mikrobiologa stolice žluč klasická aerobní určení sérotypu E.coli Campylobacter - selektivní Helicobacter pylori průkaz antigenu část stolice do 3 dnů Clostridium difficile Vibrio cholerae - selektivní klasická aerobní klasická aerobní + anaerobní střevní patogeny včetně kampylobaktera, detekce enteropatogeních E.coli u dětí do 5 let průkaz enteropatogenních E.coli průkaz antigenu+toxinu A/B (pozitivy kultivujeme) aerobních bakterií + kvasinek + anaerobů tampon v transportní půdě nebo část stolice tampon v transportní půdě nebo část stolice tampon v transportní půdě z OKM část stolice do APV (alkalická peptonová voda - k vyzvednutí na OKM) do 48 hodin žluč ve zkumavce punktát v inj. stříkačce s kombi zátkou 3 dny 4 dny mikroskopie nátěr na sklíčku biopsie žaludeční sliznice průkaz Helicobacter pylori mikroskopický průkaz bioptický materiál v 20% roztoku glukózy (k vyzvednutí na OKM)
2/8 2. RESPIRAČNÍ TRAKT výtěr z nosu, tonsil, ucha, dutiny ústní, bronchů výtěr nebo výplach z nosohltanu sputum,aspirát, BAL, hrudní punktát, tekutý materiál z DCD respirační materiál na TBC klasická aerobní Bordetella pertussis - selektivní Bordetella pertussis - PCR klasická aerobní CAP- původci komunitních pneumonií - PCR viz kapitola 14. kultivačně respirační patogeny a kvasinky mikroskopie kultivačně respirační patogeny a kvasinky Streptococcus pneumoniae, Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Haemophilus influenzae, Haemophilus influenzae typ b, Moraxella catarrhalis, Bordetella pertussis, Bord. parapertussis tampon na drátu v transportní půdě sterilní sputovka, injekční stříkačka, materiál na tamponu *) kultivační plotny z OKM (po domluvě!) tampon na drátu nasucho nebo tekutina z výplachu do 3 dnů sterilní kontejner 3. UCHO výtěr ze zevního zvukovodu punktát ze středního ucha + anaerobní + záchyt anaerobů punktát v inj. stříkačce s kombi zátkou 4 dny
3/8 4.OKO výtěr ze spojivkového vaku výtěr z rohovkového vředu bakterií a kvasinek průkaz DNA bakterií a kvasinek razantní výtěr s abrazí epiteliálních buněk odběrová souprava z OKM materiál z nitroočního prostoru + anaerobní + záchyt anaerobů punktát ve zkumavce punktát v inj. stříkačce s kombi zátkou 4 dny 5. Močové ústrojí moč + vyšetření močového sedimentu (automaticky u pacientů na ATB terapii) cílená na kvasinky kvantitativní na patogeny močových cest selektivní kvasinek a vláknitých hub semikvantitativní na patogeny močových cest URICULT dodat do 24 hodin či termost. 37 C Streptococcus pneumoniae - ag imunochromatografický průkaz moč 5 ml Legionella pneumophila - ag antigenu moč 5 ml kvantitativní na patogeny močových cest + mikroskopie močového sedimentu + po pomnožení v živném médiu stanovení PCR moč do sterilní zkumavky: - první porce při infekci močové trubice - střední proud moči u susp. cystitidy, infekce ledvin - konečný proud moči při prostatitidě moč první porce po mikční pauze 7 dní
4/8 OKM_LP_PRIL_1 (verze 101/2014) 6. Pohlavní ústrojí - žena výtěr z pochvy výtěr z pochvy, uretry, cervixu vaginorektální výtěr IUD tekutina z adnex, punkce Bartholinské žlázy mikroskopie na GO PCR - Neisseria gonorrhoeae PCR - Mycoplasma genitalium PCR - HPV na trichomonády průkaz urogenitálních mykoplasmat + anaeroby PCR - Neisseria gonorrhoeae PCR - Mycoplasma genitalium 1 sklo - preparát barvení GRAM 2 skla - stanovení MOP běžné patogeny urogenitálu + záchyt růstově náročných mikr. poševní sekret zachycený na sterilní tampon a valivým pohybem nanesený na sklo běžné patogeny urogenitálu tampon (NEDOPORUČUJEME!) selektivní Neisseria gonorrhoeae stanovení PCR - možno z 1 odběru HPV selektivní Trichomonas vaginalis Mycoplasma hominis a Ureaplasma urealyticum mikroskopie, zaměřená na běžné patogeny urogenitálu + záchyt růstově náročných mikr. mikroskopie, kult. zaměřená na běžné patogeny urogenitálu + růstově náročné a anaer.mikr. tampon v transportní půdě inokulace na půdy z OKM sterilní tampón bílý nevatový (syntetický, např. Dacron) stěr z cervixu - nevatový tampon nebo kartáček (abraze buněk) do 48 hodin 7 dní 14 dní výtěr z pochvy do speciální tekuté půdy z OKM do 12 hodin 5 dnů do speciální tekuté transportní do 8 hodin půdy z OKM do 48 hodin sterilní zkumavka stříkačka s KOMBI zátkou (vytlačit vzduch!) GBS selektivní kult. streptokoka sk. B GBS kultivační vyšetření nitroděložního tělíska selektivní kult. streptokoka sk. B běžné patogeny urogenitálu + růstově náročné + actinomycety stanovení PCR - možno z 1 odběru sterilní kontejner sterilní tampón bílý nevatový (syntetický, např. Dacron) *) nelze-li - 10 dnů 4 dny 7 dnů -
5/8 7. Pohlavní ústrojí - muž nátěr na sklíčku mikroskopie preparát - barvení GRAM výtěr nebo sekret na sterilním tamponu - valivým pohybem nanesený na sklo do 48 hodin výtěr z uretry, prostatický sekret PCR - Neisseria gonorrhoeae PCR - Mycoplasma genitalium PCR - HPV na trichomonády 8. HNIS, OBSAH PATOLOGICKÝCH DUTIN, TKÁŇ hnis, tekutina, tkáň na GO průkaz urogenitálních mykoplasmat klasická aerobní klasická aerobní + anaeroby aktinomycety běžné patogeny urogenitálu + záchyt růstově náročných mikrobů běžné patogeny urogenitálu tampon (NEDOPORUČUJEME!) selektivní Neisseria gonorrhoeae stanovení PCR - možno z 1 odběru HPV selektivní Trichomonas vaginalis Mycoplasma hominis a Ureaplasma urealyticum + záchyt anaerobů selektivní na aktinomycety tampon v transportní půdě inokulace na půdy z OKM sterilní tampón bílý nevatový (syntetický, např. Dacron) stěr nevatový tamponem (abraze buněk) výtěr z uretry do speciální tekuté půdy z OKM do speciální tekuté transportní půdy z OKM 7 dní 14 dní do 12 hodin 3 dny do 8 hodin do 48 hodin punktát abscesu nebo patologické dutiny ve zkumavce, část tkáně, optimální objem vzorku 1 cm 3 punktát abscesu nebo patologické dutiny v injekční stříkačce s kombi zátkou (optimální objem vzorku 1 cm 3 ), část tkáně, hnis na tamponu v transportní půdě! max do 24 h! max do 24 h 4 dny 10 dnů kožní biopsie PCR - Borrelia sp. průkaz DNA část tkáně
6/8 9. STĚRY Z KŮŽE, SLIZNIC A RAN stěr kultivační bakteriologické vyšetření otisk na sklíčku mikroskopický průkaz klostridií otisk na podložní sklíčko (rána, stehno, rectum) 10. CNS mikroskopie + standardní mikrobiologická preparát - barvení Gram kultivační vyšetření bakterií a kvasinek mozkomíšní mok ve zkumavce nebo inj. stříkačce nelze-li - () () mozkomíšní mok vyšetření v automatickém systému BACTEC Streptococcus pneumoniae - antigen BACTEC signalizuje pozitivní nárůst - v tom případě vyšetření pokračuje na OKM (mikroskopie, ) nesignalizující lahvička je po 5 dnech vyřazena jako negativní odběr do nádobky BACTEC (nejlépe typu PEDS) odeslat na infekční kliniku (4.patro) k založení do přístroje () () imunochromatografický průkaz mok 1 ml PCR - Borrelia sp. průkaz DNA mok 1 ml 11. KREV hemokultura vyšetření v automatickém systému BACTEC BACTEC signalizuje pozitivní nárůst - v tom případě vyšetření pokračuje na OKM (mikroskopie, ) nesignalizující lahvička je po 5 dnech vyřazena jako negativní odběr viz Standard NNB O22 "Hemokultury BACTEC" krví inokulovat 2ks BACTEC nádobek z OKM: AE (8-10ml) + LYTIC (8-10ml) event. PEDS (1-2ml) odeslat na infekční kliniku (4.patro) k založení do přístroje, při signalizaci pozitivity odtud přebírá OKM na žádanku uvést lokalizaci odběru (perif. x centrál.) POZIT: do 1 hod do 2.dne NEG: do 5 dnů
7/8 12. CIZORODÉ MATERIÁLY cévní katetr chirurgický drén drén z CNS kloubní náhrady 13. PRIMÁRNĚ STERILNÍ TĚLESNÉ TEKUTINY bakterií a kvasinek bakterií a kvasinek po sonifikaci náhrady odstřihnout cca 5 cm z koncové části, dodat ve zkumavce nasucho odběr nutno avizovat laboratoři a vyzvednout si předem odběrovou nádobu! 3 dny nutno dodat do 13:00 8 dnů pleurální tek. peritoneální tek. ascites perikardiální tek. kloubní tek. tek.z Douglasova p. peritoneální dialyzát + anaerobní vyšetření v automatickém systému BACTEC mikroskopie, bakterií a kvasinek mikroskopie, bakterií a kvasinek + záchyt anaerobů pozitivní BACTEC signalizuje negativní je vyřazen po 5 dnech punkce 1-5 ml (peritoneální dialyzát 5 ml) ve zkumavce punkce 1-5 ml (peritoneální dialyzát 5 ml) v inj. stříkačce s kombi zátkou inokulovat BACTEC nádobky z OKM, nejlépe LYTIC (perikard-, déle-chlad.) 4 dny () () synoviální tekutina PCR - Borrelia sp. průkaz DNA tekutina ve zkumavce 14. VYŠETŘENÍ NA TBC sputum, punktát, ostatní tekuté materiály jakýkoli materiál mikroskopie PCR - průkaz DNA PCR - sonda pro komplex M.tuberculosis (M.tuberculosis, M.bovis, M.BCG, M.microti, M.africanum, M. pinnipedii ) kontejner (sputovka s červeným uzávěrem) lze provést z jednoho odběru zároveň s kultivací odeslat na infekční kliniku (4.patro) k založení do přístroje nelze-li : chladnička 3-9 týdnů zrychlená MGIT 1-42 dnů moč sterilní zkumavka nelze-li : chladnička 3-9 týdnů sterilní tampón na drátě nebo 3-9 týdnů stěry a laryngeální plastu, ne na dřevě, ne s výtěr zrychlená MGIT nelze-li : chladnička aktivním uhlím 1-42 dnů 1-4 dny
8/8 15. SEROLOGIE Pozn. ASLO Brucelóza Borelióza Helicobacter pylori 2 hodiny Legionella sp. protilátky mikroaglutinací Listerióza protilátky proti L.monocytogenes a L.ivanovii - srážlivá krev 5 ml Luetické testy TPPA + RPR (stačí na 3 vyšetření) RPR 1 hod. PCT prokalcitonin kvantitativně (metoda ELFA, MiniVIDAS) do 72 hodin - 2 hodiny Revmatoidní faktor Tetanus Toxoplasmóza Tularémie TBC QuantiFERON-TB Yersinia sp. Cryptococcus sp. protilátky proti streptolyzinu O protilátky proti B.abortus, B.suis, B.melitensis (aglutinace) VCA Ig, VCA/EA IgG, EBNA IgG - specifické protilátky Infekční mononukleosa IM test vyš. heterofilních protilátek (imunochromatografický průkaz) Pertuse, parapertuse Widalova reakce (protilátky proti salmonelám) Candida sp. Aspergillus sp. protilátky třídy IgG a IgM proti Borrelia burgdorferi s.lato (ELISA) u pozitivních konfirmace westernblotem protilátky proti H. pylori metodou westernblotu specifické protil. proti Bordetella pertussis a B.parapertussis) IgG, IgM, IgA (ELISA) u pozitivních konfirmace westernblotem semikvantitativní latexaglutinační test protilátky proti toxoidu (postvakcinační protilátky) celk. proti. (KFR), IgG, IgM, IgA, IgE (ELISA) celk. protilátky (aglutinace) celk. protilátky (imunochromatografický průkaz) test buněčné imunity TBC, diagnóza latentní TBC základní panel rozšířený panel (návrat ze zahraničí) Vi antigen (susp. na tyfus) celkové protilátky proti Y.enterocolitica O3, O9, Y.pseudotuberculosis (aglutinace) antigenémie (ELISA) protilátky (hemaglutinace) antigenémie (ELISA) protilátky (hemaglutinace) protilátky (aglutinace) Doba je modifikována tím, že některých vyšetření čekáme na daný počet vzorků. Pro upřesnění informace doporučujeme tel.kontakt lze provést pouze během pracovní doby! 3 spec.odběrovky z OKM, po odběru protřepat, srážlivá krev 5 ml (stačí na 3 vyšetření) 3-14 dnů 3-21 dnů 3-14 dnů 1-7 dnů 3-14 dnů do 18 hodin - do 72 hodin - 2 hodiny