sekundy Femtosekundová spektroskopie, aneb

Podobné dokumenty
1- Úvod do fotosyntézy

Světlosběrné systémy fotosyntetických organismů Tomáš Polívka

Fotosyntéza Světelné reakce. Ondřej Prášil Mikrobiologický ústav AVČR Laboratoř fotosyntézy v Třeboni

4 Přenos energie ve FS

Fyziologie rostlin. 9. Fotosyntéza část 1. Primární fáze fotosyntézy. Alena Dostálová, Ph.D. Pedagogická fakulta ZČU, letní semestr 2013/2014

Vyjádření fotosyntézy základními rovnicemi

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Fotosyntéza světelná fáze. VY_32_INOVACE_Ch0214.

- Rayleighův rozptyl turbidimetrie, nefelometrie - Ramanův rozptyl. - fluorescence - fosforescence

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

FOTOSYNTÉZA I. Přednáška Fyziologie rostlin MB130P74. Katedra experimentální biologie rostlin, Z. Lhotáková

FOTOSYNTÉZA. Princip, jednotlivé fáze

Spektroskopické metody. převážně ve viditelné, ultrafialové a blízké infračervené oblasti

Úvod do laserové techniky KFE FJFI ČVUT Praha Michal Němec, Plynové lasery. Plynové lasery většinou pracují v kontinuálním režimu.

Fotosyntéza (2/34) = fotosyntetická asimilace

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

ení k tvorbě energeticky bohatých organických sloučenin

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Fotosyntéza

FYZIOLOGIE ROSTLIN VÝŽIVA ROSTLIN 1) AUTOTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN 2) HETEROTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN

Interakce fluoroforu se solventem

Každá molekula kyslíku kterou právě dýcháme vznikla někdy v nějaké rostlině. Každý atom uhlíku našeho těla byl kdysi včleněn fotosyntézou do nějaké

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Úvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv

12-Fotosyntéza FRVŠ 1647/2012

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie. UV-vis oblast. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

VIBRAČNÍ SPEKTROMETRIE

Barevné hry se světlem - co nám mohou říci o biomolekulách?

aneb Fluorescence chlorofylu jako indikátor stresu

Fluorescenční rezonanční přenos energie

FOTOSYNTÉZA. soubor chemických reakcí,, probíhaj v rostlinách a sinicích. z CO2 a vody jediný zdroj kyslíku ku pro život na Zemi

Pokročilé cvičení z fyzikální chemie KFC/POK2 Vibrační spektroskopie

Molekulová spektroskopie 1. Chemická vazba, UV/VIS

Základy Mössbauerovy spektroskopie. Libor Machala

Zdroje optického záření

VLIV SPEKTRÁLNÍHO SLOŽENÍ FOTOSYNTETICKY AKTIVNÍ RADIACE NA INDUKCI FOTOSYNTÉZY TERMOOPTICKÝ JEV

Fotosyntéza Ekofyziologie. Ondřej Prášil Mikrobiologický ústav AVČR Laboratoř fotosyntézy v Třeboni

Něco o laserech. Ústav fyzikální elektroniky Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity 13. května 2010

Identifikace barviv pomocí Ramanovy spektrometrie

Využití fotonických služeb e-infrastruktury pro přenos ultrastabilních optických frekvencí

SPEKTRÁLNÍ METODY. Ing. David MILDE, Ph.D. Katedra analytické chemie Tel.: ; (c) David MILDE,

Absorpční fotometrie

Co vás dnes čeká: Přednáška Fyziologie rostlin MB130P74. Katedra experimentální biologie rostlin, Z. Lhotáková

13. Spektroskopie základní pojmy

14. Fyziologie rostlin - fotosyntéza, respirace

Fluorescence chlorofylu

Kvantová informatika pro komunikace v budoucnosti

Umělá fotosyntéza. Michael Hagelberg. Tomáš Polívka, Ústav fyzikální biologie

KOMPLEXY EUROPIA(III) LUMINISCENČNÍ VLASTNOSTI A VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII. Pavla Pekárková

Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů. Nanoindentace. Pavel Matějka

Autor: Katka Téma: fyziologie (fotosyntéza) Ročník: 1.

Fluorescence (luminiscence)

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

FOTOSYNTÉZA. Mgr. Alena Výborná Gymnázium, SOŠ a VOŠ Ledeč nad Sázavou VY_32_INOVACE_01_1_07_BI1

Základy NIR spektrometrie a její praktické využití

ABSORPČNÍ A EMISNÍ SPEKTRÁLNÍ METODY

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Biosyntéza sacharidů 1

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

Přednáška IX: Elektronová spektroskopie II.

INSTRUMENTÁLNÍ METODY

Spektrometr pro měření Ramanovy optické aktivity: proč a jak. Optická sestava a využití motorizovaných jednotek.

Vybrané spektroskopické metody

Zhášení tripletních stavů chlorofylů karotenoidy v tylakoidních membránách

FOTOSYNTÉZA. CO 2 a vody. - soubor chemických reakcí. - probíhá v rostlinách a sinicích. - zachycení a využití světelné energie

Využití fluorescence sinic a řas při hodnocení kvality vod. RNDr. Štěpán Zezulka, PhD.

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Stručný úvod do spektroskopie

(Návod k praktiku) Produkty. I.typ II.typ. X 1 Σ + g nm nm. Kyslík

Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH. VII. Spektroskopie a fotochemie

FOTOBIOLOGICKÉ POCHODY

EKOTECH Fluorescence chlorofylu in vivo 1

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

Fotosyntéza a Calvinův cyklus. Eva Benešová

Měření fluorescence chlorofylu hedery helix

SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE)

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Optoelektronika. elektro-optické převodníky - LED, laserové diody, LCD. Elektronické součástky pro FAV (KET/ESCA)

Speciální spektrometrické metody. Zpracování signálu ve spektroskopii

Struktura atomů a molekul

KBF/FOSY Fotosyntéza a stres LRR/FOSY Fotosyntéza

Optika. Nobelovy ceny za fyziku 2005 a Petr Malý Katedra chemické fyziky a optiky Matematicko fyzikální fakulta UK

Lasery. Biofyzikální ústav LF MU. Projekt FRVŠ 911/2013

Ing. Pavel Hrzina, Ph.D. - Laboratoř diagnostiky fotovoltaických systémů Katedra elektrotechnologie K13113

Spektroskopie v UV-VIS oblasti. UV-VIS spektroskopie. Roztok KMnO 4. pracuje nejčastěji v oblasti nm

Fyzika IV Dynamika jader v molekulách

Biologie. Pracovní list č. 4 žákovská verze Téma: Fotosyntéza a faktory, které ji ovlivňují. Lektor: Mgr. Naděžda Kurowská

7 Fluorescence chlorofylu in vivo

Fotosyntézu lze schematicky vyjádřit: hv CO H 2 O (CH 2 O)+ O 2 + H 2 O. Rozčlenění pochodů v chloroplastu na membránové a enzymové:

Energie fotonů je předávána molekulám chlorofylu A, který se zachyceným fotonem excituje (uvolní se energeticky bohatý elektron).

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

Charakteristiky laseru vytvářejícího světelné impulsy o délce několika pikosekund

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

Nepředstavitelně krátké laserové impulsy

Spektrální analyzátor Ocean optics

Přístrojové vybavení pro detekci absorpce a fluorescence

ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ

Struktura bílkovin očima elektronové mikroskopie

Základy NIR spektrometrie a její praktické využití

Transkript:

Femtosekundová spektroskopie, aneb co všechno se může stát za biliontinu sekundy Tomáš Polívka Laboratoř optické spektroskopie

Časový vývoj Časové rozlišení ( ) = interval mezi dvěma následujícími obrázky

Některé objekty se pohybují... rychle ( = 0.01-1s) ještě rychleji = 0.001-0.01s

Sekvence obrázků = časový vývoj

Historicky první experiment (1878) = 1 ms = 0.001s = 10-3 s

Zastavování času = 1 s = 10-6 s

Můžeme sledovat chemické reakce? Vstupní látky (reaktanty) Produkty

Příklad - štěpení vody 2H 2 O 2H 2 + O 2

Jak rychlou kameru potřebujeme ke sledování chemických reakcí? rychlost: 1000 ms -1 vzdálenost: 10-10 m 0.000 000 000 000 100 s 100 fs = 10-13 s Femtochemie Nobelova cena za chemii 1999 Ahmed Zewail

Nejkratší pulsy v naší laboratoři 10 fs (10-14 s)

Jak to funguje (jednoduché schéma ) Excitace sonda Detektor Zpoždění 1 ps = 0.3 mm 0 fs 500 fs 3 000 fs 50 000 fs 300 400 500 600 700 800 300 400 500 600 700 800 300 400 500 600 700 800 300 400 500 600 700 800

poněkud složitější ve skutečnosti Department of Chemical Physics, Lund University

Naše laboratoř

Laboratoř optické spektroskopie 2 aneb Čeho všeho jsme schopni Marcel Fuciman

Naše výzbroj Optické parametické zesilovače TOPAS (Light Conversion) 240 2000 nm TOPAS White 20 fs => široké spektrum cca 90 nm Laserový systém Integra-i (Quantronix) Ti:S zesilovač, 796 nm, 120 fs, 8 mm 2 mj v pulsu, 1 khz oscilátor(45 MHz, 12 mw) čerpání NdYAG (523 nm)

Transientní absorpce, pump-probe metoda Excitace 1 ps = 0.3 mm Probe Detektor Zpožďovací linka

Na co máme zaměřeno S N lykopen -karoten 3A - g 1B - u S 2 (1B u + ) violaxanthin S*,S S 1 (2A g - ) ICT zeaxanthin S 0 (1A g - ) 350 400 450 500 550 Wavelength peridinin (nm) Polívka et al. PNAS 1999, J. Phys. Chem. B 2001 J. Phys. Chem. B 2002, Biochemistry 2002, Chem,. Rev. 2004; Chem. Phys. Lett. 2009

bílé kontinuum Měřící (probe) svazek laserový svazek (krátké pulsy) Laserový zdroj safírová destička spjná čočka S n S 2 S 1 S 2 S 0 S 0 E blue

A log Wavelength I probe I ref Detektor (Probe) Absorption Detektor (Reference)

A log Detektor (Probe) Wavelength probe I ref Absorption zpoždění mezi excitací a probem (WLC) PUMP puls Detektor (Reference) I bleaching ESA

Transientní absorpce měřící technika Reference 1 khz Probe 1 khz S D1 D2 Chopper 0,5 khz I probe I probe A log 10 log 10 I I ref bez excitace ref s excitací Detektory 1. diody (Si, Ge, ZnSe), diodová pole 2. fotonásobiče 3. CCD

Přenos energie 20 15 10 5 0-5 0.2 0.5 1 4 10-10 -15-20 500 550 600 650 700 750 500 550 600 650 700 750 Wavelength (nm) Time A (mod) Vlnová délka (nm) 15 10 5 0-5 488 630 672 A (mod) Globální fitování Současné fitování všech kinetik na všech vlnových délkách -10-15 -20 0 5 10 15 20 Čas (ps)

Když máme infravidění S 2 (1B + u ) S 1 (2A - g ) 0.06 0.05 0.04 0.03 0.02 0.01 0.00 EADS Renierapurpurinu v n-hexane (blízké IR) 210 fs (S 2 -S N ) 6.5 ps (S 1 -S 2 ) A / a.u. 900 1000 1100 1200 1300 1400 Vlnová délka / nm Určení energie S 1 stavu S 0 (1A g - ) 1 8182 21368 Steady-state spektrum S 1 -S 2 EADS 1 E = 13186 cm -1 A a A Polívka et al. PNAS 1999 0 5000 10000 15000 20000 25000 30000 35000 0 10000 15000 20000 25000 30000 35000 Energie / cm -1 Energie / cm -1 safír 430 900 nm, CaF 2 UV, YAP - IR

2 Pump-dump-probe Nekoherentní interakce tří pulsů Umožňuje manipulovat s populacemi excitovaných stavů 3 1 I probe I probe A 1 log 10 log 10 I ref I bez excitace ref s excitací I probe I probe A 2 log 10 log 10 I ref I bez excitace ref s excitací A A A 1 2 Diodové pole 1 pump (Topas) 2 dump (TopasW) 3 probe (bílé kontinuum) sdumpem bez dumpu

Použití P-D-P spektroskopie Pump-repump (dump) Pump-dump Prepump-Pump S N rp S 2 S 2 1B - D u? P S 1 S 0 D 1 P P 1 > 2 2 S 0 S 0 S 1 IC ET IC pp Car Chl-a Larsen et al. Chem. Phys. Lett., 2003; Papagiannakis et al. Biochemistry 2004 Q y

Nový laserový systém, nové možnosti - fluorescence upconversion F P S, h F h P h S n F n P n S k F k P k S, F F P S

Karotenoidy Václav Šlouf Laboratoř optické spektroskopie

β-karoten

Vitamín A

Lykopen

Zeaxanthin, lutein

Astaxanthin

Tunaxanthin

Méně viditelné karotenoidy peridinin fucoxanthin

Společné znaky karotenoidů protáhlé molekuly (~ 30 Å) prvkové složení: C, H bez kyslíku: karoteny s kyslíkem: xantofyly systém konjugovaných vazeb symetrie dávají nositelům většinou barvy od červené po žlutou (= většinou absorbují modré a zelené fotony) syntetizovány pouze rostlinami a mikroorganismy X Moran & Jarvik, Science 2010 mšice syntetizující karotenoidy!

Spektroskopie karotenoidů I 1 S 2 A [rel. jed.] 0 350 400 450 500 550 [nm] S 0

1 0 Spektroskopie karotenoidů I S 2 S 1 350 400 450 500 550 [nm] S 0 Zakázaný excitovaný stav ležící níže než absorbující energetický stav Schulten & Karplus, Chem. Phys. Lett. 1972, 14, 305. A [rel. jed.]

Spektroskopie karotenoidů II aneb k čemu je dobrá časově rozlišená spektroskopie S 2 S 1 S 0 1 0 550 500 450 400 350 [nm] A [rel. jed.]

Polívka et al., PNAS 1999 1 0 550 500 450 400 350 Spektroskopie karotenoidů II aneb k čemu je dobrá časově rozlišená spektroskopie S 2 S 1 S 0 [nm] A [rel. jed.]

Spektroskopie karotenoidů II aneb k čemu je dobrá časově rozlišená spektroskopie S 2 S 1 E (S 0 -S 2 ) E (S 1 -S 2 ) = E (S 0 -S 1 ) S 0

Děkuji za pozornost!

Světlosběrnékomplexy Milan Durchan Laboratoř optické spektroskopie

Fotosyntéza 4 multiproteinové komplexy 3 mobilní přenašeče Fotosystém II Cytochrom b 6 /f Fotosystém I ATP-syntáza Plastochinon Plastocyanin Ferredoxin Oba fotosystémy dvě funkční části (reakční centrum + anténa)

K čemu je dobrá anténa? 0.2-2 me m -2 s -1 = 10 20-10 21 fotonů m -2 s -1 Aktivní profil jedné molekuly chlorofylu = ~ 1 Å 2 1-10 fotonů Chl -1 s -1 Efekt čočky 10 2-10 6 x může zvýšit intenz

Přirozený světlosběrný Titulní foto z dizertace M. Vissera

Mechanismy přenosu excitační energie Förster D * A D A * Rychlost přenosu: k av 2 Θ D * Dexter A D A * R 3 D A V F c Střední vzdálenosti Střední dipóly Beze změny spinu Spektrální překryv: ( ) A ( d F D A ) Excitonová interakce: V V D e R 2 L Krátké vzdálenosti Malé dipóly Změna spinu E 1 = E 2 2V E 1 E 2 Krátké vzdálenosti, velké dipóly

Prokaryota bez chloroplastů vysoce konzervovaná molekulární struktura RC vysoká variabilita světlosběrných komplexů

Eukaryota s chloroplasty FCP = fukoxantin-chlorofyl a/c protein PCP = peridinin-chlorofyl a protein

Peridinin chlorophyll-a protein (obrněnky) Vnější antén. protein, rozpustný ve vodě, přichycený na stromatální straně thylakoidní membrány

PCP spectrum Chl-a Car 2 Chl-a 8 karotenoidů Chl/Car = 1:4 Chl-a Chl-a 400 500 600 700 Vlnová délka (nm) Za 5 pikosekund je energie na pasti! Absorbance

Fykobilizómy u sinic

Využití slunečního záření 300 400 500 600 700 800 900 1000 1100 1200 Antény s chl Karotenoidy Fykobilizómy Zelené sirné baktérie Purpurové baktérie Intenzita slunečního záření

Světlo ve velkých hloubkách ve vodě Při povrchu: ~10 fotonů Chl -1 s -1 40 m pod hladinou: ~1 foton Chl -1 s -1 110 m pod hladinou: ~0.1 fotonu Chl -1 s -1 210 m pod hladinou: ~3.5 fotonů Chl -1 h -1 Jak tam mohou přežít fotosynt. organismy??

Ferreira et al. Science 2004

l Soret Chl Q y Car S 2 Chl Q x /vib. 450 500 550 600 650 700 750 Wavelength (nm) 500 550 600 650 700 Chromera ve

Děkuji za pozornost!