3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Podobné dokumenty
3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Zajímavost -mtdna a Y v R

3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Mgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Genetický polymorfismus

Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací

Projekt Genetika a příjmení a zapojení Klusáčků do něj

Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Paleogenetika člověka

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací. 1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky.

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

FYLOGEOGRAFIE A KOALESCENCE

Genetická diverzita masného skotu v ČR

Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden ( )

Coalesce spojit se, splynout, sloučit se. Didaktická simulace Coalescence = splynutí linií

Jak to, že máme spole ného p edka?

Osud jednotlivých kopií genů v populaci genové stromy

Testování lidské identity

Populační genetika II

Genetické markery. pro masnou produkci. Mgr. Jan Říha. Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o.

Crossing-over. over. synaptonemální komplex

Analýza archaické DNA

geneticko-genealogický projekt

Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK

Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.

Genetické mapování. v přírodních populacích i v laboratoři

Populační genetika a fylogeneze jedle bělokoré analyzována pomocí izoenzymových genových markerů a variability mtdna

Kolik jsme měli předků?

Genetické rozdíly mezi populacemi aneb něco o migracích a genovém toku. Genetické rozdíly mezi populacemi

Populační genetika III. Radka Reifová

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Co víme o původu psa na základě analýzy DNA

1) Velikost populace a demografická historie. 1) Velikost populace a demografická historie. 1) Velikost populace a demografická historie

Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů

Aplikace DNA profilování na adna

Mutace genu pro Connexin 26 jako významná příčina nedoslýchavosti

Co víme o původu psa na základě analýzy DNA

Genetické metody v zoologii

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

IMUNOGENETIKA I. Imunologie. nauka o obraných schopnostech organismu. imunitní systém heterogenní populace buněk lymfatické tkáně lymfatické orgány

Jak jsme osídlili svět podle mtdna a chromozomu Y

Jak jsme osídlili svět podle mtdna a chromozomu Y

Výsledky projektu Genetika a příjmení a zapojení Klusáčků do něj (4. upravená verze)

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

Pes. Moje oblíbené zvíře

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Příklady z populační genetiky volně žijících živočichů

Charakterizace hybridních trav pomocí cytogenetických a molekulárních metod

Genetická variabilita v populacích

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZEMĚDĚLSKÁ FAKULTA

Základní pojmy obecné genetiky, kvalitativní a kvantitativní znaky, vztahy mezi geny

KIT GENE POLYMORPHISM IN ASSOCIATION WITH HORSE COAT COLOUR TOBIANO POLYMORFIZMUS GENU KIT VE VZTAHU KE ZBARVENÍ U KONÍ TOBIANO

polymorfní = vícetvarý, mnohotvárný


Genotypování: Využití ve šlechtění a určení identity odrůd

Genetický polymorfismus

Metody studia historie populací

Genové knihovny a analýza genomu

Tok GI v buňce. Genetický polymorfizmus popis struktury populací. Organizace genetického materiálu. Definice polymorfismu

PhD. České Budějovice

Sekvenování nové generace. Radka Reifová

Chromozomální aberace nalezené u párů s poruchou reprodukce v letech

2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:

II. ročník, zimní semestr 1. týden OPAKOVÁNÍ. Úvod do POPULAČNÍ GENETIKY

Mutace jako změna genetické informace a zdroj genetické variability

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová

Mikroevoluce = vznik a osud genetické variability na druhové a nižší úrovni děje a mechanismy v populacích

NÁBYTKOVÉ ROLETY VEDENÍ FLEXIBILNÍ

NÁBYTKOVÉ ROLETY VEDENÍ ŠROUBOVANÉ

TEST: GENETIKA, MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE

Zesouladení ( sjednocení ) poznatků genetiky a evolucionistických teorií

Výsledky studie genetické variability plemene český fousek a dalších plemen ohařů

Počet chromosomů v buňkách. Genom

Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno

Mikrosatelity (STR, SSR, VNTR)

Výsledky letní praxe

Projekt MGUS V.Sandecká, R.Hájek, J.Radocha, V.Maisnar. Velké Bílovice

Referenční lidský genom. Rozdíly v genomové DNA v lidské populaci. Odchylky od referenčního genomu. Referenční lidský genom.

Cytogenetika. chromosom jádro. telomera. centomera. telomera. buňka. histony. páry bazí. dvoušroubovice DNA

Bi5130 Základy práce s lidskou adna

2 Inkompatibilita v systému Rhesus. Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia

Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat

Varianty lidského chromosomu 9 z klinického i evolučního hlediska


MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ Agronomická fakulta

Migrace. 1) Jednosměrná migrace. 2) Obousměrná migrace. 3) Genový tok a historie populací. 4) Migrace a genetická odlišnost mezi populacemi


Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

OSTRAVA - POMATURITNÍ STUDIUM - ŠKOLNÍ ROK 2016/17 balíček BASIC obsahuje: balíček STANDARD obsahuje: balíček ALL INCLUSIVE obsahuje:

Využití genetické rozmanitosti při identifikaci člověka

P1 AA BB CC DD ee ff gg hh x P2 aa bb cc dd EE FF GG HH Aa Bb Cc Dd Ee Ff Gg Hh

Mendelova genetika v příkladech. Genetické markery

Základy genetiky 2a. Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra

Jak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST

Transkript:

p 1) Jak to, že máme společného předka 2) Metodika výzkumu mtdna 3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila 4) Problémy a názory proti 5) Analýza chromozomu Y 6) Jak jsme osídlili svět podle mtdna a chromozomu Y 7) Další analýzy a co z toho vyplývá 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Analýza chromozomu Y závěry o původu moderního člověka na základě mtdna jsou sice přesvědčivé, avšak je potřeba jejich potvrzení použitím jiných zdrojových dat zmiňovali jsme již například práci Ingmana et al. (2000) - analýza sekvence chromozomu X (Xq13.3) dalším vhodným kandidátem pro rekonstrukci je chromozom Y historie mužské linie nehomologický úsek chromozomu Y nerekombinuje (NRPY, nonrecombining portion of the Y chromosome) variabilita se analyzuje pomocí RFLP, mikrosatelitů, SNP, přímým sekvencováním podobně jako u mtdna se pomocí variability konstruují genealogické stromy

Michael Hammer (1995) 2,6 kpb dlouhý fragment, 16 mužů, 4 šimpanzi pozoroval mnohem menší variabilitu než je například v sekvencích chromozomu X odhadl stáří společného předka na 188 000 let (na 95 % hladině významnosti v intervalu 51 000 až 411 000 let) Hammer et al. (1998) 1 544 mužů z celého světa získali 10 odlišných haplotypů ancestrální africký haplotyp omezen pouze na Afriku stáří společného předka je 147 000 (68 000 až 258 000)

Peter Underhill et al. (1997) 22 polymorfizmů, 22 haplotypů (M1 až M22) stáří společného předka je 162 000 let (69 000 až 316 000) v případě první sady vzorků 186 000 (77 000 až 372 000) pro druhou sadu vzorků

Russell Thomson et al. (2000) analyzovali 3 geny na chr. Y (SMCY, DBY a DFFRY) nejbližší společný předek žil před 59 000 lety (40 000 až 140 000) získané údaje jsou pravděpodobně přesnější, protože byla započítána postupně rostoucí velikost populace avšak odhad stáří je nižší protože jde o kódující oblasti

Underhill et al. (2000) analyzovali lokus NRY, 167 mutací 116 haplotypů seřazených do 10 haploskupin předek moderních lidí žil v Africe před 62 000 lety (35 000 až 89 000)

Underhill et al. (2001) rozšířili počet zkoumaných markerů 131 jedinečných haplotypů, 10 haploskupin

Underhill et al. (2001) rozšířili počet zkoumaných markerů 131 jedinečných haplotypů, 10 haploskupin

dnes se podrobně zkoumají jednotlivé haploskupiny v rámci celého světa nebo jen jednotlivých regionů například studium haploskupiny R Rozšíření R1a (fialová) a R1b (červená). - R1b je nejčastější v Západní Evropě - podskupiny R1b1a (M18), R1b1b (M73) a R1b1d (M335) http://cs.wikipedia.org/wiki/haploskupina_r1b_(y-dna)

Shrnutí mtdna a Y Přehled výsledků výpočtů stáří společného předka moderního člověka mtdna Cann et al. 1987 214 000 let (teorie koalescence 290 000 let) Vigilantová et al. 1991 208 000 let (tk 225 000) Ingmann et al. 2000 171 500 let (kódující oblast mtdna) Behar et al. 2012 177 000 let Chromozom Y Dorit et al. 1995 270 000 let (intronová sekvence) Hammer 1995 188 000 let (nekódující fragment) Hammer et al. 1998 147 000 let (široký polymorfizmus) Underhill et al. 1997 162 000 let (široký polymorfizmus) 186 000 let (široký polymorfizmus) Thomson et al. 2000 59 000 let (3 geny) Underhill et al. 2000 62 000 let (NRY) kódující sekvence - mají nižší variabilitu