Otázky adaptace či populační selekce

Podobné dokumenty
Opravný list k diplomové práci ERRATA

Znečištěné ovzduší a kvalita spermií. Jiří Rubeš a kol.

Vliv konzumace alkoholu na riziko vzniku rakoviny v české populaci

Xenobiotika a jejich analýza v klinických laboratořích

NOVÉ POZNATKY O VLIVU OVZDUŠÍ NA ZDRAVOTNÍ STAV POPULACE

Vliv znečištěného ovzduší na kvalitu spermií. Jiří Rubeš Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i., Brno

Vliv konzumace alkoholu na riziko vzniku rakoviny v české populaci

Farmakogenetika. Farmakogenetika

Pavel Souček Úplný výkaz pedagogické činnosti

Možná zdravotní rizika v aktivních domech. MUDr. Ivana Holcátová, CSc.

Prevence rakoviny. doc. MUDr. Jindřich Fiala, CSc. Ústav ochrany a podpory zdraví LF MU

OVZDUŠÍ Radim J. Šrám, Ústav experimentální mediciny AV ČR KŽP AV ČR, Praha,

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

FUNKČNÍ VARIANTA GENU ANXA11 SNIŽUJE RIZIKO ONEMOCNĚNÍ

Využití metody pasivního vzorkování. -pro stanovení toxicity a genotoxicity vzorků volného ovzduší

Aplikace výsledků projektu by měla vést ke zlepšení legislativy Evropské unie v oblasti regulace motorových emisí.

VARIABILITY IN H-FABP, C-MYC, GH, LEP, LEPR GENES IN LARGE WHITE, LANDRACE AND DUROC BREEDS OF PIGS


Studium genetické predispozice ke vzniku karcinomu prsu

Genotypy absolutní frekvence relativní frekvence

Molekulární příčiny hyperkinetické poruchy

Zdeňka Veselá Tel.: Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.

Prevence rakoviny. doc. MUDr. Jindřich Fiala, CSc. Ústav ochrany a podpory zdraví LF MU

Pohled genetika na racionální vyšetřování v preventivní kardiologii

Genetické markery. pro masnou produkci. Mgr. Jan Říha. Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o.

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

Patofyziologie refluxní choroby a Barrettova jícnu

,, Cesta ke zdraví mužů

Genetický polymorfizmus biotransformačních enzymů a riziko vzniku karcinomu pankreatu v České republice


Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Karcinom prostaty screening. Dalibor Pacík LF MU FN Brno

Co nás učí nádory? Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Ústav patologie FN Brno Přírodovědecká a Lékařská fakulta MU Brno

Důsledky selekce v populaci - cvičení

(GENO)TOXICITA PRACHOVÝCH ČÁSTIC

DŮSLEDKY ZNEČIŠTĚNÍ OVZDUŠÍ Z DOPRAVY NA ZDRAVOTNÍ STAV POPULACE

VĚDA A VÝZKUM V PERIOPERAČNÍ PÉČI. Mgr. Markéta Jašková Dana Svobodová Gynekologicko-porodnická klinika Fakultní nemocnice Ostrava


Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).

12. PŘÍLOHA VÝSLEDKOVÉ TABULKY

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Odhad vlivu expozice aerosolovým částicím na populační zdraví v Česku

Základy genetiky populací

GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI

ONKOGENETIKA. Spojuje: - lékařskou genetiku. - buněčnou biologii. - molekulární biologii. - cytogenetiku. - virologii

CT screening benefit vs. riziko

Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR. Mgr. Silvie Dudová

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy


Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě MU

Znečištění ovzduší důsledky pro zdraví naší populace

Adaptace lidského organismu na nepříznivé vlivy znečištěného ovzduší?

Postavení taxanů a anthracyklinů v terapii karcinomu prsu. MUDr. Tomáš Svoboda KMO, Medlov

Postup při klasifikaci karcinogenů v Mezinárodní agentuře pro výzkum rakoviny

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ

Úvod do nonhla-dq genetiky celiakie

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Selekce v populaci a její důsledky

JE PRO KOMUNÁLNÍHO POLITIKA VYUŽITELNÉ TÉMA ZDRAVÍ?

Revidované referenční hodnoty pro sledované toxické prvky v krvi a moči české populace


Koncept heritability




Genetický polymorfismus

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Grantové projekty řešené OT v současnosti

Epidemiologické metody

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/


Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky. Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně

O sinicích, epidemiologických studích a pitné vodě

Stopové prvky u seniorů v institucionalizované péči

INTERHEART. Rozsáhlá mezinárodní standardizovaná studie případů a kontrol

Epigenetika mění paradigma současné medicíny i její budoucnost

Genetika kvantitativních znaků

Není třeba mít obavu z rekombinantních faktorů. J Blatný,V Komrska, B Blažek, M Penka, P Ovesná jménem a pro centra sdružená v rámci ČNHP

SPRÁVNÁ INTERPRETACE INDIKÁTORŮ KVALITY MAMOGRAFICKÉHO SCREENINGU. Májek, O., Svobodník, A., Klimeš, D.

Jak se můžete vy a vaši blízcí chránit před rakovinou děložního čípku?

5 hodin praktických cvičení

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Základní škola a Mateřská škola G.A.Lindnera Rožďalovice. Za vše mohou geny

CHOPN příčiny, epidemiologie, sociální a ekonomický dopad

INHALAČNÍ A DERMÁLNÍ EXPOZICE TOLUENDIISOKYANÁTU (TDI) Kučera Ivan, KHS Královéhradeckého kraje


Inovativní metody monitorování emisí naftových motorů v reálném městském provozu LIFE10-ENV-CZ-651. Trvání projektu: 01/09/ /08/2016

Lékařská biofyzika, výpočetní technika I. Biostatistika Josef Tvrdík (doc. Ing. CSc.)

1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Počet pravděpodobnosti

Vztah mezi genetickými polymorfismy DNA reparačních genů a jejich expresí u zdravé populace (s výhledem na stanovení u onkologických pacientů).

asné trendy rizikových faktorů KVO

CITI-SENSE. Výzkumný projekt veřejného monitorování kvality ovzduší a životního prostředí pomocí senzorových technologií

Přehled výzkumných aktivit

Prevalence HPV infekce v ČR

ZEMNÍ PLYN A ZDRAVÍ. Radim J. Šrám, Ústav experimentální mediciny AV ČR Jesenná konferencia SPNZ, Horný Smokovec,

KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Transkript:

Otázky adaptace či populační selekce MUDr. Ludmila Vodičková, CSc Státní zdravotní ústav Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i,

Není jasné, nakolik přispívají dědičné faktory ke vzniku nádoru. Studie na párech dvojčat měla objasnit celkový příspěvek genů ke vzniku a rozvoji nádorů Kombinované údaje od 44 788 párů dvojčat s nádory (hodnotilo se 28 orgánů) Statistický model, který umožnil odhadnout relativní důležitost dědičných faktorů a faktorů životního prostředí ve vzniku nádorů u 11 vybraných orgánů Závěr: Vrozené faktory přispívají jenom malou mírou k vnímavosti vůči většině typů nádorů. Zásadní roli hraje životní prostředí. Lichtenstein et al, 2000, NEJM

Cancer in Sweden, Denmark and Finland: Percentage of variance Genetic Shared environmental Nonshared environmental % 80 100 60 40 20 0 Stomach Colorectum Pancreas Lung Breast (female) Cervix uteri Corpus uteri Ovary Prostate Bladder Leukemia Lichtenstein et al, 2000, NEJM

Lze proto očekávat, že lidé pracující v chemickém průmyslu jsou vystaveni zvýšenému riziku vzniku rakoviny. Předchozí přednáška: zvýšená koncentrace noxy vyvolává obrannou reakci organizmu indukci jak metabolizujícich enzymů tak pravděpodobně i enzýmů zodpovědných za opravu poškozené DNA. - pro tento fakt svědčí i rozporuplné epidemiologické studie u většiny látek se nedaří jednoznačně dokázat kauzální vztah se vznikem rakoviny Proč tento mechanizmus nefunguje i v obecné populaci? Jaké další mechanizmy ovlivňují/určují vznik rakoviny?

Vyšetřili jsme naši populaci lidí exponovaných chemickým karcinogenům na distribuci variantních alel varianta znamená spíš nevýhodu ale může přinést i výhodu. Počet lidí: 1160 (500 neexponovaných, 660 exponovaných) Látky: styrén, 1,3 butadien, formaldehyd a epichlorhydrín Vybrané, klíčové genotypy u hlavních drah: 1. metabolizujícich enzymů 2. enzymů různých drah opravy DNA 3. enzymů regulace buněčného cyklu

Distribuce variantních alel u exponovaných a kontrolních osob (vyjádřeno jako OR s CI 95% a chi-kvadrát test) Biotransformační enzymy: 1 Polymorphism Genotype OR CI 95% P χ 2 P CYP1B1 Asn453Ser 39.1 <0.001 AsnAsn 1 - - AsnSer 0.27 0.17-0.44 0.001 SerSer 0.16 0.06-0.41 <0.001 CYP1B1 Leu432Val 21.8 <0.001 LeuLeu 1 - - LeuVal 1.66 1.07-2.59 0.006 ValVal 3.99 2.18-7.33 <0.001 CYP2E1 Ile462Val 0.12 0.73 IleIle 1 - - IleVal 1.18 0.45-3.08 ns CYP2E1 T6235C 3 -UTR 2.12 0.35 TT 1 - - TC 0.65 0.34-1.24 ns EPHX1 activity * 2.24 0.32 Low 1 - - Medium 0.84 0.63-1.12 ns High 0.77 0.51-1.16 ns * Deduced from combinations of EPHX1 Tyr113His and His139Arg genotypes

Distribuce variantních alel u exponovaných a kontrolních osob (vyjádřeno jako OR s CI 95% a chi-kvadrát test) Biotransformační enzymy: 2 Polymorphism Genotype OR CI 95% P χ 2 P GSTM1 deletion 0.73 0.39 Positive 1 - - Null 1.13 0.85-1.49 ns GSTT1 deletion 3.35 0.067 Positive 1 - - Null 0.71 0.49-1.03 ns GSTP1 Ile105Val 2.13 0.34 IleIle 1 - - IleVal 0.88 0.65-1.20 ns ValVal 1.27 0.74-2.17 ns NQO1 Pro187Ser 1.47 0.23 ProPro 1 - - ProSer 1.26 0.87-1.82 ns SerSer 1.14 0.51-2.52 ns

Distribuce variantních alel u exponovaných a kontrolních osob (vyjádřeno jako OR s CI 95% a chi-kvadrát test) Oprava DNA 1: dráha nukleotidní excizní opravy (NER) Polymorphism Genotype OR CI 95% P χ 2 P XPD Lys751Gln 2.42 0.29 LysLys 1 - - LysGln 1.07 0,82-1.39 0.65 GlnGln 0.80 0.55-1.17 0.25 XPG Asn1104His 3.52 0.17 AsnAsn 1 - - AsnHis 1.12 0.87-1.45 0.38 HisHis 0.63 0.34-1.15 0.13 XPC Lys939Gln 6.21 0.045 LysLys 1 - - LysGln 1.33 1.02-1.75 0.04 GlnGln 1.48 1.03-2.13 0.03

Distribuce variantních alel u exponovaných a kontrolních osob (vyjádřeno jako OR s CI 95% a chi-kvadrát test) Oprava DNA 2: dráha bazově excizní opravy (BER) Polymorphism Genotype OR CI 95% P χ 2 P hogg1 Ser326Cys 16.38 <0.001 SerSer 1 - - SerCys 0.88 0.68-1.14 0.33 CysCys 0.18 0.07-0.45 <0.001 APE1 Asn148Glu 0.06 0.97 AsnAsn 1 - - AsnGlu 0.99 0.74-1.33 0.99 GluGlu 1.03 0.72-1.47 0.86 XRCC1 Arg399Gln 10.04 0.006 ArgArg 1 - - ArgGln 1.00 0.77-1.29 1.00 GlnGln 0.52 0.34-0.80 0.003 XRCC1 Arg194Trp 2.69 0.26 ArgArg 1 - - ArgTrp 1.18 0.78-1.78 0.45 TrpTrp 3.57 0.59-21.52 0.26 XRCC1 Arg280His 1.73 0.42 ArgArg 1 - - ArgHis 1.51 0.53-4.35 0.44 HisHis 4.86 0.27-86.1 nd

Distribuce variantních alel u exponovaných a kontrolních osob (vyjádřeno jako OR s CI 95% a chi-kvadrát test) Oprava DNA 3: dráha opravy dvouřetězcových zlomů (DSB repair pathway) Polymorphism Genotype OR CI 95% P χ 2 P XRCC3 Thr241Met 3.65 0.16 ThrThr 1 - - ThrMet 0.94 0.72-1.24 0.68 MetMet 0.65 0.41-1.02 0.06 NBS1 Glu185Gln 0.14 0.93 GluGlu 1 - - GluGln 0.95 0.73-1.24 0.71 GlnGln 0.98 0.64-1.49 0.92

Distribuce variantních alel u exponovaných a kontrolních osob (vyjádřeno jako OR s CI 95% a chi-kvadrát test) Geny v kontrole buněčného cyklu Polymorphism Genotype OR CI 95% P χ 2 P CCND1 G870A 1.34 0.56 GG 1 - - GA 0.82 0.59-1.15 0.25 AA 0.87 0.59-1.30 0.51 TP53 Arg72Pro 0.14 0.93 ArgArg 1 - - ArgPro 2.12 1.34-3.34 0.001 ProPro 1.07 0.45-2.51 0.89

Kombinace polymorfizmů bázově excizní opravy v souvislosti s efektivitou (rychlosti) opravy DNA. (Vodicka et al., Carcinogenesis 2007) XRCC1 Arg399Gln, Arg280His, Arg194Trp and APE1 Asn148Glu 2,5 2 SSB/10 9 dalton 1,5 1 0,5 0 0 (n=29) 1 (n=52) 2(n=71) 3 (n=34) 4 (n=7) 5 (n=2) number of variant alleles in combination

Hypothetical factors affecting genotoxicity in case of exposure near to MAC Tentative kinetics of DNA damage vs. Biotransformation/DNA repair capacities Max. % of job quitting Induction of enzymatic/re pair systems Disease Steady-state equilibrium between biomarkers formation/removal Duration of exposure (years), ageing (?)

Závěr Existuje selekční tlak, který umožní, že lidé špatně vybavení pro chemickou zátěž v chem.průmyslu obvykle nepracují? V životním prostředí se nelze příliš vyhnout nekuřáci citlivější než kuřáci pasivní kouření dramatičtější efekt

Děkuji za pozornost

The levels of DNA damage (left) and NER capacity (right) in relation to XP polymorphisms XPA G23A genotypes