Mgr. Eva Flodrová FN Brno,Oddělení lékařské genetiky Laboratoř molekulární diagnostiky.

Podobné dokumenty
Farmako -genetika/genomika. Farmakogenetika. Farmakogenetika. Metabolická aktivita

Xenobiotika a jejich analýza v klinických laboratořích

Genetický polymorfismus

Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem. Milan Bartoš. Forum veterinarium, Brno 2010

Základní pojmy obecné genetiky, kvalitativní a kvantitativní znaky, vztahy mezi geny

MUDr. Jan Strojil prof. RNDr. Pavel Anzenbacher, DrSc. Předkonferenční symposium NAD května 2012

1. ÚVOD A PROBLEMATIKA

Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin

Obecné aspekty lékových interakcí

1. Téma : Genetika shrnutí Název DUMu : VY_32_INOVACE_29_SPSOA_BIO_1_CHAM 2. Vypracovala : Hana Chamulová 3. Vytvořeno v projektu EU peníze středním

Obsah 1 Úvod 2 Variabilita lékové odpovědi 3 Klinické využití určování koncentrace léčiv

Mgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita

EDUKAČNÍ TEXTY Infopharm, a.s. v rámci INTERAKČNÍ AKADEMIE Infopharm, a.s.

Obsah LABORATOŘ MOLEKULÁRNÍ DIAGNOSTIKY

Ovlivnění biotransformace

1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně

Crossing-over. over. synaptonemální komplex

Mgr. Veronika Peňásová Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno

Návrh směrnic pro správnou laboratorní diagnostiku Friedreichovy ataxie.

Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů

MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE. 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR)

Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden ( )

Přijímací test navazující magisterské studium Molekulární a buněčná biologie

Potřebné genetické testy pro výzkum a jejich dostupnost, spolupráce s neurology Taťána Maříková. Parent projekt. Praha

Terapeutické klonování, náhrada tkání a orgánů

AUG STOP AAAA S S. eukaryontní gen v genomové DNA. promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4. kódující oblast. introny

Lékové interakce. Občan v tísni

Genetický screening predispozice k celiakii

Mutace jako změna genetické informace a zdroj genetické variability

EDUKAČNÍ MATERIÁL PŘÍRUČKA PRO PŘEDEPISUJÍCÍHO LÉKAŘE

Molekulární diagnostika pletencové svalové dystrofie typu 2A

PŘÍLOHA I SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU

cílem mnoha terapií je dostatečně zvýšit hladinu dystrofinu a změnit DMD fenotyp na BMD

Část. Molekulární biologie a imunologie. Základy dědičnosti. Struktura nukleových kyselin

FUNKČNÍ VARIANTA GENU ANXA11 SNIŽUJE RIZIKO ONEMOCNĚNÍ

Podrobný seznam vyšetření - LMD

PŘÍLOHA I SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU

2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:

Farmakogenetika. Farmakogenetika

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

Molekulární genetika IV zimní semestr 6. výukový týden ( )

Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA DNA. PCR polymerase chain reaction. Princip PCR PRINCIP METODY PCR

Seznam vyšetření. Nesrážlivá periferní krev nebo kostní dřeň

b) Jak se změní sekvence aminokyselin v polypeptidu, pokud dojde v pozici 23 k záměně bázového páru GC za TA (bodová mutace) a s jakými následky?

FARMAKOGENETIKA Léčba pomocí cíleného podávání léků Zohlednění rozdílů v odpovědi léčených Nežádoucí účinky farmakoterapie

Exprese genetické informace

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Cvičení č. 8. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek

GENETIKA A MOLEKULÁRNĚ GENETICKÁ DIAGNOSTIKA DUCHENNEOVY MUSKULÁRNÍ DYSTROFIE

Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.

Molekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA

Genotypování markerů užitkovosti a zdraví u skotu

TEST: GENETIKA, MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE

Pohled genetika na racionální vyšetřování v preventivní kardiologii

Seznam vyšetření. Detekce markerů: F2 (protrombin) G20210A, F5 Leiden (G1691A), MTHFR C677T, MTHFR A1298C, PAI-1 4G/5G, F5 Cambridge a Hong Kong

Syndrom fragilního X chromosomu (syndrom Martinův-Bellové) Antonín Bahelka, Tereza Bartošková, Josef Zemek, Patrik Gogol

Biotransformace xenobiotik. M. Balíková

Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR. Mgr. Silvie Dudová

TOXICITA ÚČINKY NOX. M. Balíková Ústav soudního lékařství a toxikologie 1. LF UK a VFN

Příloha III. Doplnění do příslušných bodů souhrnu údajů o přípravku a příbalové informace

MTHFR. MethylTetraHydroFolátReduktáza

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Podrobný seznam vyšetření - LMD

Beličková 1, J Veselá 1, E Stará 1, Z Zemanová 2, A Jonášová 2, J Čermák 1

Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce

Výskyt MHC molekul. RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. ajor istocompatibility omplex. Funkce MHC glykoproteinů

Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK

Hemofilie. Alena Štambachová, Jitka Šlechtová hematologický úsek ÚKBH FN v Plzni

DIACOMIT 250 mg prášek pro perorální suspenzi v sáčku DIACOMIT 500 mg prášek pro perorální suspenzi v sáčku Stiripentolum

ší šířen VAZEBNÁ ANALÝZA Vazba genů

Rytmonorm. Souhrn údajů o přípravku ABBOTT Rytmonorm 1. NÁZEV PŘÍPRAVKU

Molekulární biotechnologie č.9. Cílená mutageneze a proteinové inženýrství

TRITON Praha / Kroměříž

Molekulárn. rní. biologie Struktura DNA a RNA

u párů s poruchami reprodukce

Stanovení léků a návykových látek

Psychofarmaka a gravidita. MUDr. Zdeňka Vyhnánková

Diagnostika retrovirů Lentiviry - HIV. Vladislava Růžičková

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Chemické mutageny a jejich rozdělení

Příloha I. Vědecké závěry a zdůvodnění změny v registraci

Farmakogenetika metabolismu léčiv

Klonování DNA a fyzikální mapování genomu

Základy genetiky populací

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy

Duchenneova/Beckerova svalová dystrofie a Parent Project

Osud xenobiotik v organismu. M. Balíková

Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování

Vrozené trombofilní stavy

2. KVALITATIVNÍ I KVANTITATIVNÍ SLOŽENÍ Jedna potahovaná tableta obsahuje 15 mg nebo 30 mg nebo 45 mg mirtazapinum. Pomocné látky viz bod 6.1.

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

Pomocné látky se známým účinkem: MUGOTUSSOL 10 mg/5 ml obsahuje 4340 mg roztoku maltitolu E 965, 310 mg propylenglykolu a 7,5 mg methylparabenu.

Směrnice správné laboratorní praxe pro vyšetřování nejčastějších mutací v mitochondriální DNA

Molekulární hematologie a hematoonkologie

Grantové projekty řešené OT v současnosti

Transkript:

Mgr. Eva Flodrová FN Brno,Oddělení lékařské genetiky Laboratoř molekulární diagnostiky eflodrova@fnbrno.cz

enzymy katalyzující oxidativní metabolické reakce xenobiotik provádějí redukci C-, N-, S-, hydroxylaci, dealkylaci, dehalogenaci a deaminaci molekul substrátů jsou zahrnuty v oxidativním metabolismu exogenních i endogenních molekul v první fázi je oxidací přeměňují na elektrofilní meziprodukty, které jsou dále enzymy druhé fáze konjugovány na hydrofilní deriváty vylučované močí jsou zapojeny v detoxikačních procesech hlavně v játrech, ale i jiných orgánech u člověka se jich náchází více jak 57 druhů

enzym debrisoquin 4-hydroxyláza patří mezi nejvíce studované biotransformační enzymy aktivita enzymu se mezi jednotlivci liší rozdíly v aktivitě CYP2D6 vedou k individuálním rozdílům v terapeutické účinnosti léčiv zahrnut v metabolismu asi 100 léčiv antidepresiva, antipsychotika, beta blokátory, antiarytmika

Betablokátory: Trimepranol, Karvedilol, Timolol.. Antidepresiva: Paroxetin, Citalopram, Amitriptylin, Sertralin.. Antipsychotika: Haloperidol, Zotepin, Risperidon.. Inhibitory protonové pumpy: Omeprazol,Lansoprazol.. Antiepileptika: Fenobarbital, Fenytoin.. Cytostatika: Tamoxifen, Paklitaxel, Vinblastin, Cyklofosfamid.. Antihypertenziva: Chinidin, Propafenon, Kaptopril.. Ostatní: Indometacin, Kodein, Tramadol, Lidokain, Oxykodon..

45 kb u člověka na dlouhém raménku chromozomu 22 (22q13.1) skládá se ze tří homologních genů - CYP2D8P, CYP2D7P, CYP2D6 CYP2D8P - pravý pseudogen delece, inzerce, terminační kodony, nemá otevřený čtecí rámec CYP2D7P - sekvenční homologie je 97% s CYP2D6, obsahuje pouze jednu inaktivující mutaci, inzerci T138 v exonu 1 mění čtecí rámec předčasnou terminaci translace 9 exonů a 8 intronů 4 378 bp mrna 1655 bp

Zanger, Raimundo a Eichelbaum, 4 hlavní skupiny - PM- pomalí metabolizátoři žádná enzymová aktivita - IM- intermedierní metabolizátoři - snížená enzymová aktivita - EM - efektivní metabolizátoři - normální enzymová aktivita - UM - ultrarychlí metabolizátoři -extrémně zvýšená enzymová aktivita UM 3-5%, EM 70-80%, IM 10-15%, PM 7-10%

rozdílná metabolická aktivita enzymu mezi jedinci je dána polymorfismem v genu cyp2d6 doposud popsáno více jak 100 alel alely se stejnou klíčovou mutací se označují číslem (např. *6) písmeny se rozlišují další varianty alel se stejnou klíčovou mutací, ale různými doplňkovými mutacemi s minoritním funkčním významem (např. *6A, *6B, *6C, *6D) nejčastější jsou alely *1, *2, *4, *5, *10, *17 a *41 CYP2D6*1 je alela se standardní sekvencí genu stejně jako další alely (*2, *33, *35) kóduje protein s normální enzymatickou funkcí gen CYP2D6 má značnou interetnickou variabilitu

Nulové alely CYP2D6*0 - kódují nefunkční protein - v homozygotním stavu způsobují fenotyp pomalého metabolizátora bodové mutace (alely *3, *4, *6, *8, *11, *15, *19, *20, *38, *40, *42) velké chromozomové delece (alely *5, *13, *16) mutace vedoucí ke ztrátě f-ce proteinu, ale délka zachována (alely *7, *12, *14, *18) - alela *4 (12-21%) v kavkazské populaci nejčastější nulová alela - 1846G>A - alela *5 (2-7%) dochází ke ztrátě celého genu CYP2D6 - alely *13 a *16-5 -CYP2D7P/CYP2D6-3 hybridní geny, vznik delecí různých částí lokusu CYP2D

Nulové alely Alely spojené se sníženou enzymovou funkcí kódují enzym s redukovanou aktivitou v homozygotním stavu nebo spolu s nulovou alelou v heterozygotním stavu způsobují fenotyp IM např. CYP2D6*9, *10, *17, *36, *41 *10 (50-70% asiaté, 1-5% kavkazská populace) 100C>T (naruší místo nezbytné pro sbalení proteinu enzym je velmi nestabilní a má sníženou afinitu k substrátu) Alely spojené se zvýšenou enzymovou funkcí

Nulové alely CYP2D6*0 Alely spojené se sníženou enzymovou funkcí Alely spojené se zvýšenou enzymovou funkcí - zvýšený počet aktivních genových kopií - alely *1, 2*,35* - frekvence genové duplikace je v kavkazské populaci 1-5%

in vivo - metabolické schopnosti jedince se zjišťují po podání testovací látky (substráty pro CYP2D6 dextrometorfan, spartein) na základě tzv. metabolického poměru (MR) - v ČR se MR definuje jako poměr koncentrace podaného léku (dextrometorfan) ke koncentraci jeho metabolitů (dextrorfan), které se objeví v moči během určité doby od podání testovací látky - koncentrace se stanovuje pomocí chromatografických metod

molekulárně genetická detekce alel cyp2d6 - metody analýzy délky restrikčních fragmentů (Skoda, 1988) - vyhledávací metody jednovláknového konformačního polymorfismu (Broly, 1995) - alelově specifická polymerázová řetězová reakce (Daly, 1995) - syntéza dlouhých úseků - long-pcr (Sachse, Daly,Løvlie, Panserat ) - real-time PCR (Stamer, 2002) - kvantitativní metody s TaqManovými sondami (Bodin, Beaune, Loriot ) -přímá sekvenace (James, 2004) - SNaPshot (Sistonen, 2005) - AmpliChip CYP450 (Roche, Affymetrix, 2004)

variabilita v aktivitě CYP2D6 vede k individuálním rozdílům v terapeutické účinnosti léčiv PM nejsou schopni metabolizovat substráty CYP2D6 při běžně podávané dávce mají ve srovnání s EM vyšší koncentrace léku vplasmě zvýšené riziko předávkování výskyt vedlejších efektů. UM je koncentrace léku v plasmě mnohem nižší než je terapeuticky účinná koncentrace nedochází k žádné terapeutické odpovědi klinický význam polymorfismu pro konkrétní léky není vždy jasný a závisí na několika faktorech

Psychiatrie - 50% běžně užívaných antipsychotik - 50% antidepresiv vedlejší účinky u PM - schizofrenie Léčba rakoviny - tamoxifen N-desmethyltamoxifen endoxifen (antiestrogenní aktivita) Molekulární epidemiologie - PM jsou delší dobu vystaveni toxickým efektům přijatých sloučenin než EM náchylnější ke vzniku rakoviny - naopak při metabolické aktivaci prokarcinogenů jsou většímu riziku vystaveni EM a UM Kardiovaskulární onemocnění

dlouhodobá mezioborová spolupráce optimalizace stávajících metod detekce mutací - zavedení metody Real-Time PCR pro rychlou detekci PM - kvantifikace CYP2D6 genu detekce delecí a duplikací (Müller, Zöpf, 2003) výzkumné účely vyšetření při neadekvátní odpovědi na léčbu (nedostatečná odpověď UM, špatná snášenlivost PM) => individuální dávkování léčiv??

Frekvence 7-10% v kavkazské populaci Žádná nebo velmi nízká aktivita enzymu p450 zvýšené riziko předávkování výskyt vedlejších efektů *3, *4, *6, *8, *11, *15, *19, *20, *38, *40, *42, *44, *5, *13, *16, *7, *12, *14, *18

Frekvence 7-10% v kavkazské populaci Žádná nebo velmi nízká aktivita enzymu p450 zvýšené riziko předávkování výskyt vedlejších efektů *3, *4, *6, *8, *11, *15, *19, *20, *38, *40, *42, *44, *5, *13, *16, *7, *12, *14, *18 4*1846 A>G 6*T1707del 8*1758G>T 3* A2549del 7*2935 A>C

T1707del 1758G>T 1846 A>G

*6 *4 *8

Filtr F2 4*wt Tm=52.0 C 6*wt Tm=71.5 C 4*1846G>A Tm=61.2 C 6*T1707de Tm=65.4 C

Filtr F3 8*wt Tm=55.0 C 8*1875G>T Tm=63.0 C