MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ Aktuality v nabídce kontrolních kmenů CCM RNDr. Jitka Černohlávková, Ph.D. Brno, 11. října 2012
Program přednášky 1. Nabídka kontrolních kmenů 2. Novinky v nabídce 3. Jak pracovat s kontrolními kmeny uchovávání, oživování, kultivace 4. Objednávání kmenů z CCM 2
Oblast použití kontrolních kmenů: kontrola diagnostických souprav a testů kontrola kvality kultivačních médií stanovení citlivosti k antimikrobním látkám biologická kontrola účinnosti germicidních zářivek testování inhibičních látek v potravinách detekce genotoxických látek (Amesův test) zkoušky dle Českého lékopisu včetně doplňků stanovení baktericidního, sporicidního a fungicidního účinku chemických dezinfekčních prostředků a antiseptik 3
Nabídka kontrolních kmenů Nabídkové listy na www.sci.muni.cz/ccm - sekce kontrolní kmeny Kontrolní kmeny CCM nabídkový list kompletní seznam kmenů (přes 190 kmenů) Kmeny pro kontrolu kvality identifikačních testů v klinické bakteriologii - seznam testů a výsledky Kmeny pro kontrolu kvality kultivačních médií v klinické bakteriologii - seznam kmenů, kultivačních médií a výsledků Kmeny pro kontrolu kvality kultivačních médií v klinické mykologii - seznam kmenů, kultivačních médií a výsledků Kmeny pro kontrolu kvality kultivačních médií pro mikrobiologická zkoušení poživatin a vod - seznam kmenů, kultivačních médií a výsledků Kontrolní kmeny dle ČSN P ENV ISO 11133-2: 2005 (příprava a zkoušení kultivačních médií) - seznam kmenů a příslušných kultivačních médií 4
Klinická mikrobiologie nabídka rozšířena v roce 2010 - kontrolní kmeny pro testování médií mykologie - kontrolní kmeny pro testování médií bakteriologie - kontrola kvality diagnostických a identifikačních testů - výsledky testování na CCM uvedeny v letácích Kontrolní kmeny pro testování antibiotické rezistence CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute (USA) www.clsi.org M2-A9 Performance Standards for Antimicrobial Disk Susceptibility Tests; Approved Standard Ninth Edition - disková difúzní metoda M7-A7 Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically; Approved Standard Seventh Edition mikrodiluční metoda M100-S16 Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Sixteenth Informational Supplement (2006) interpretační tabulky, limity 5
CLSI referenční kmeny pro kontrolu kvality kmen CCM číslo Disková metoda Diluční metoda Žel. disky Enterococcus faecalis ATCC 29212 4224 ANO Enterococcus faecalis ATCC 51299 4647 ANO Enterococcus faecalis ATCC 51299 3954 ANO Escherichia coli ATCC 35218 4225 ANO Haemophilus influenzae ATCC 49247 4456 ANO Haemophilus influenzae ATCC 49766 4457 ANO Helicobacter pylori ATCC 43504 není -- Klebsiella pneumoniae ATCC 700603 4985 ANO Neisseria gonorrhoeae ATCC 49226 4500 NE Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 3955 ANO Staphylococcus aureus ATCC 29213 4223 ANO Staphylococcus aureus ATCC 43300 4750 ANO Streptococcus pneumoniae ATCC 49619 4501 ANO 6
EUCAST The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing http://www.eucast.org - harmonizace antibiotického testování v Evropě - metodika, kontrola kvality, interpretace výsledků, tabulky MIC zóny, ke stažení na www stránkách - antimikrobiální a antifugální resistence CCM 3954 CCM 3955 CCM 4223 želatinové disky CCM 4224 CCM 4501 CCM 8432 - od září 2012 - lyofilizát 7
Rozšíření nabídky kmenů na želatinových discích: od října 2012 Campylobacter jejuni CCM 6214 (ATCC 33560) ČSN ISO EN 10272-1,3, Campylobacter coli CCM 7376 (ATCC 33559) - ČSN ISO EN 10272-1,3, ČSN ISO 17995 - průkaz hydrolýzy hippurátu Campylobacter coli CCM 7227 (ATCC 43478) - ČSN P CEN ISO/TS 11133-2 Campylobacter jejuni CCM 7212 (ATCC 29428) - ČSN P CEN ISO/TS 11133-2 Kontrola kvality médií, stanovení výskytu ve vodách a potravinách. Stanovení bakterií rodu Legionella ve vodách (ČSN ISO 11731, ČSN ISO 11731-2) Legionella pneumophila CCM 7799 (ATCC 33152) Legionella pneumophila CCM 7170 (ATCC 33153) Exspirace 12 měsíců, skladovací teplota -20±2 C 8
Želatinové disky s definovanou hodnotou CFU - v nabídce od roku 2011 - definované množství mikroorganismů v rozpustné matrici 10 2 10 3 CFU/disk - exspirace 6-12 měsíců - skladování v -20 C! - 1 lahvička = 10 disků (cena 990,- Kč) - interní kontrola kvality práce mikrobiologických laboratoří - kontrola kvality kultivačních médií zkoušení produktivity - vybraná skupina kontrolních kmenů 9
Želatinové disky s definovanou hodnotou CFU nabídka Bacillus subtilis subsp. spizizenii CCM 1999 Candida albicans CCM 8215 Enterococcus faecalis CCM 4224 Escherichia coli CCM 3954 Lactobacillus rhamnosus CCM 1828 Listeria monocytogenes CCM 4699 Pseudomonas aeruginosa CCM 1961 Staphylococcus aureus subsp. aureus CCM 3953 10
Jak pracovat s kontrolními kmeny - uchovávání, oživování, kultivace 11
Uchovávání a oživování kultur Kontrola CCM čísla, oživovat na doporučeném médiu (živném, neselektivním), kultivovat za optimálních podmínek - uvedeno v příloze dodacího listu, katalog kultur CCM Lyofilizáty neotevřené ampule skladovat v temnu a chladu. otevírat opatrně (pod vakuem) naříznout pilníkem nebo nožem na řezání skleněných trubic odlomit horní konec desinfekce dolní část uzavřít původní molitanovou zátkou Želatinové disky uchovávat podle informací na lahvičce, v temnu lednice +4 C, některé kmeny v -20 C lahvičku nechat stát 10 min při laboratorní teplotě (zamezení vzniku kondenzní vody) oživení na šikmém agaru, Petriho misce, tekutém médiu manipulace s diskem - vyžíhaná, lehce teplá očkovací jehla 12
Práce s referenčními kmeny Referenční kmeny (reference strains) : Mikroorganismy definované minimálně do úrovně rodu a druhu, katalogované a popsané v souladu s jejich charakteristikami a nejlépe s uvedením původu. Běžně se získávají z uznávaných národním a mezinárodních sbírek. Referenční kultura/zásobní referenční kultura (reference stock) : série jednotlivých identických kultur získaných jako jediná subkultura z referenčního kmene buď v laboratoři nebo od dodavatele Zásobní kultura (stock culture) : primární subkultura ze zásobní referenční kultury Pracovní kultura (working culture) : subkultura ze zásobní referenční kultury, zásobní kultury nebo z referenčního materiálu, který je certifikovaný nebo není Pracovní kultury by neměly být subkultivovány, pokud tak nepožaduje standardní metoda a nesmí být subkultivována k nahrazování referenčních kultur. KOMERČNÍ DERIVÁTY REFERENČNÍCH KMENŮ MOHOU BÝT POUŽITY POUZE JAKO PRACOVNÍ KULTURY. EA 4/10 (Akreditace mikrobiologických laboratoří (doplněk k ISO/IEC 17025), ČSI ČSN P CEN ISO/TS 11133-1 13
Použití referenčních kultur (EA-4/10, Příloha C) Referenční kmen z uznaného zdroje jednou subkultivován * referenční kultury * Želatinový disk Uchování za specifických podmínek Lyofilizát CCM Rozmrazení/rekonstituce * jednou subkultivován Pracovní kultura spec. podmínky a doba skladování Rutinní použití * Kontroly čistoty a biochemické zkoušky dle potřeby 14
Objednávání kultur E-mail : order@sci.muni.cz Fax: + 420 549 498 289 (změna od 1.4.2012) Adresa: Česká sbírka mikroorganismů Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta Tvrdého 14 602 00 Brno 15
Objednávání kultur - objednávka Do objednávky uvést: jméno a CCM číslo kmene!! počet kusů formu dodání želatinové disky, lyofilizát, želatinové disky s definovanou hodnotou CFU adresu dodání a fakturace (zákaznické číslo) kontaktní osobu 16
Obsah zásilky: obálka s označením > plechovka s kulturami a dodacím listem zásilku otevírat v laboratoři balení a označení (pravidla IATA biologická substance typu B, UN3373) dodací list jméno, označení kmene, datum exspirace příloha k dodacímu listu informace ke kmeni, doporučená kultivační média, jejich složení a příprava návod na otevírání a oživování kultury (LYO, disky) osvědčení o výstupní kontrole číslo šarže (ddmmrrrrxxxxx), datum výroby a exspirace certifikát CCM bezpečnostní informace, postup dezinfekce dohoda o nakládání s materiálem 17
www.sci.muni.cz/ccm 18
Katalog kultur - bakterie a archea - kvasinky a vláknité houby seznam kultivačních médií 19
www.sci.muni.cz/ccm 20
Dotazy a informace: želatinové disky: lyofilizáty: objednávky: informace: RNDr. Jitka Černohlávková, Ph.D. jitkac@sci.muni.cz, tel. 549 49 6418 Mgr. Tereza Gelbíčová, Ph.D terezag@sci.muni.cz, tel. 549 49 6254 order@sci.muni.cz ccm@sci.muni.cz bacteria@sci.muni.cz fungi@sci.muni.cz 21
Děkuji za pozornost! 22