7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

Podobné dokumenty
Interakce fluoroforu se solventem

12. Zhášení fluorescence

Barevné principy absorpce a fluorescence

Barevné principy absorpce a fluorescence

Barevné hry se světlem - co nám mohou říci o biomolekulách?

Fluorescence (luminiscence)

Fluorescenční rezonanční přenos energie

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

- Rayleighův rozptyl turbidimetrie, nefelometrie - Ramanův rozptyl. - fluorescence - fosforescence

Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách

Anizotropie fluorescence

6. Metody molekulové spektroskopie spektrofotometrie, luminiscenční metody

Emise vyvolaná působením fotonů nebo částic

Spektrometrické metody. Luminiscenční spektroskopie

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Elektromagnetické záření. lineárně polarizované záření. Cirkulárně polarizované záření

FLUORIMETRICKÉ STANOVENÍ FLUORESCEINU

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie. UV-vis oblast. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

Využití a princip fluorescenční mikroskopie

Otázky k předmětu Optické spektroskopie 1

Barevné hry se světlem - co nám mohou říci o biomolekulách?

KOMPLEXY EUROPIA(III) LUMINISCENČNÍ VLASTNOSTI A VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII. Pavla Pekárková

SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE)

Úvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

Fluorescenční mikroskopie

CHARAKTERIZACE MATERIÁLU II

Spektroskopické metody. převážně ve viditelné, ultrafialové a blízké infračervené oblasti

Vlastní fluorescence proteinů

Přístrojové vybavení pro detekci absorpce a fluorescence

Pokročilé cvičení z fyzikální chemie KFC/POK2 Vibrační spektroskopie

7 Fluorescence chlorofylu in vivo

F l u o r e s c e n c e

SPEKTRÁLNÍ METODY. Ing. David MILDE, Ph.D. Katedra analytické chemie Tel.: ; (c) David MILDE,

Přednáška IX: Elektronová spektroskopie II.

Vybrané spektroskopické metody

SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK

Ustálená fluorescence (Steady State Fluorescence)

Fluorescenční mikroskopie

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

Fotoelektronová spektroskopie Instrumentace. Katedra materiálů TU Liberec

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka

Dokumentace projektu. Fotoluminiscence. Autorky: Kateřina Limburská, Tereza Fleková Vedoucí projektu: Zdeněk Polák

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

4 Přenos energie ve FS

Principy a instrumentace

Výběr fluoroforu.

(Návod k praktiku) Produkty. I.typ II.typ. X 1 Σ + g nm nm. Kyslík

HPLC - Detektory A.Braithwaite and F.J.Smith; Chromatographic Methods, Fifth edition, Blackie Academic & Professional 1996 Colin F. Poole and Salwa K.

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

1. Principy fluorescenční spektroskopie

Balmerova série. F. Grepl 1, M. Benc 2, J. Stuchlý 3 Gymnázium Havlíčkův Brod 1, Gymnázium Mnichovo Hradiště 2, Gymnázium Šumperk 3

ení s chemickými látkami. l rní optiky

Metody charakterizace nanomaterálů I

ZÁKLADNÍ ČÁSTI SPEKTRÁLNÍCH PŘÍSTROJŮ

Spektroskopie subvalenčních elektronů Elektronová mikroanalýza, rentgenfluorescenční spektroskopie

13. Spektroskopie základní pojmy

Zoologická mikrotechnika - FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE

CHARAKTERIZACE MATERIÁLU II

Fluorescenční spektroskopie

Spektroskopie v UV-VIS oblasti. UV-VIS spektroskopie. Roztok KMnO 4. pracuje nejčastěji v oblasti nm

Speciální spektrometrické metody. Zpracování signálu ve spektroskopii

Časově rozlišená fluorescence

FRET FRET. FRET: schéma. Základní vztahy. Základní vztahy. Fluorescence Resonance Energy Transfer

DELFIA Dissociation-Enhanced Lanthanide Fluorescent ImmunoAssay


Fluorescenční sondy. Fluorescenční sondy. Indikátory pro anorganické ionty. Fluorescenční sondy pro využití v analytické chemii, medicíně a biologii

Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii

FIA fluorescenční imunoanalýza (fluorescence immuno-assay) CIA chemiluminiscenční imunoanalýza

Identifikace barviv pomocí Ramanovy spektrometrie

Průtokové metody (Kontinuální měření v proudu kapaliny)

ABSORPČNÍ A EMISNÍ SPEKTRÁLNÍ METODY

16. Franck Hertzův experiment

PŘIHLÁŠKA DO SOUTĚŽE

Molekulová spektroskopie 1. Chemická vazba, UV/VIS

ABSORPČNÍ A LUMINISCENČNÍ SPEKTROMETRIE V UV/Vis OBLASTI SPEKTRA

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

SPEKTROMETRIE. aneb co jsem se dozvěděla. autor: Zdeňka Baxová

Spektroskopické é techniky a mikroskopie. Spektroskopie. Typy spektroskopických metod. Cirkulární dichroismus. Fluorescence UV-VIS

Stručný úvod do spektroskopie

INSTRUMENTÁLNÍ METODY

Luminiscence. Luminiscence = studené světlo Inkandescence = teplé světlo

MĚŘENÍ ABSOLUTNÍ VLHKOSTI VZDUCHU NA ZÁKLADĚ SPEKTRÁLNÍ ANALÝZY Measurement of Absolute Humidity on the Basis of Spectral Analysis

Absorpční fotometrie

Rentgenová spektrální analýza Elektromagnetické záření s vlnovou délkou 10-2 až 10 nm

2. Zdroje a detektory světla

Metody analýzy povrchu

Fluorescenční mikroskopie. -fluorescenční mikroskopie -konfokální mikroskopie

Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH. VII. Spektroskopie a fotochemie

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Přístrojové vybavení pro detekci absorpce a fluorescence

Fyzikální podstata DPZ

PSI (Photon Systems Instruments), spol. s r.o. Ústav přístrojové techniky AV ČR, v.v.i.

Detektory. požadovaná informace o částici / záření. proudový puls p(t) energie. čas příletu. výstupní signál detektoru. poloha.

Transkript:

7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

Steady-state měření Excitujeme kontinuálním světlem, měříme intenzitu emise (počet emitovaných fotonů) Obvykle nedetekujeme všechny fotony intenzita se většinou udává v relativních jednotkách Pravděpodobnost, že po absorpci dojde k emisi fotonu Pravděpodobnost, že k emisi fotonu dojde na vybrané vlnové délce I F (λ ex, λ em ) = I 0 (1-10 -ε(λ ex) c l ) QY P(λ em )η(λ em ) I 0 ε(λ ex ) c l QY P(λ em )η(λ em ) Pro malé c I F závisí na vlastnostech zkoumané látky Pravděpodobnost, že dojde k pohlcení fotonu Pravděpodobnost, že vyzářený foton bude detekován I F závisí na koncentraci I F závisí na nastavení přístroje Pro přesné určení koncentrace potřebujeme srovnání se standardem

Fluorescenční parametr, který se mění v závislosti na zkoumané vlastnosti systému Určení např. vazebné konstanty z posunu spektra je v principu také možné, ale vyžaduje znalost kvantového výtěžku volné i navázané formy nebo kalibraci pomocí modelového systému Optimální použití Příklady Intenzita Měřené veličiny jsou úměrné množství fluoroforu Stanovení vazebné konstanty pro interakci dvou molekul Sledování kinetiky chemických reakcí Excitační spektrum Emisní spektrum Charakteristiky systému, které nezávisí na množství fluoroforu ph membránový potenciál polarita okolí... Pokud se posunuje spektrum, je vždy možné nalézt vlnovou délku, na které dochází ke změně intenzity, měření ale bývá náchylnější k artefaktům. Pomoci může kalibrace v isobestickém (excitace) nebo isoemisním (emise) bodě.

Měření intenzity při konstantních vlnových Titrační experimenty délkách excitace i emise - O N H 2 N N O - O - O - N N P O P O P O H 2 C O O O O O O O 2 N N O 2 -ATP +ATP Fluorescenční sonda TNP-ATP je citlivá na polaritu svého okolí - po navázání do hydrofobní vazebné kapsy v molekule proteinu se její kvantový výtěžek zvýší NO 2 No protein F = [ P] + * γ 1 [ P] T + [ E] T + K ( ) T 2 2 [ P] T + [ E] T + K P 4 [ P] T [ E] T Kompetitivní experiment - v přítomnosti ATP jsou některá vazebná místa obsazená a nemůže se do nich navázat TNP-ATP P F * = [ P] T 1 + 2 ( γ 1) [ P] T + [ E] T + K + [ A] P T K P K A [ P] T + [ E] T + K + [ A] P T 2 K P 4[ P] [ E] K A T T (pro K A >>K P )

Měření intenzity při konstantních vlnových délkách excitace i emise Měření kinetiky Sledování kinetiky tvorby komplexu mezi avidinem a DNA měřením tryptofanové fluorescence fluorescence intensity (rel.u.) 1.2 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 Photobleaching of GFP 476 nm 400 nm 280 nm 0.0 0 600 1200 1800 2400 3000 3600 time of illumination (s) Pohodlné je sledování kinetiky na škále sekund (a delší) Sledování kratších časů vyžaduje náročnější vybavení pro nastartování experimentu

Chemiluminiscence Reakce katalyzovaná enzymem luciferázou luciferin + ATP luciferin adenylát + PP i luciferin adenylát + O 2 oxyluciferin + AMP + CO 2 + hν Stanovení ATP nebo O 2 Jednodušší aparatura (není potřeba zdroj světla, není nutné odfiltrovat excitující světlo)

Stopped-flow časová škála ms Malé množství dvou roztoků je před měřením pomocí stlačeného vzduchu vstříknuto do komůrky, kde dojde k jejich rychlému promíchání, čímž je nastartována měřená reakce.

Nárůst chlorofylové fluorescence fluorescence O-J-I-P fotosyntéza t (ms)

Excitační a emisní spektra Závislost intenzity na vlnové délce excitace excitační spektrum (obvykle stejné jako absorpční spektrum) Závislost na vlnové délce emise emisní spektrum Synchronní spektrum Kompletní spektrum (3D, EEM) Charakteristiky spektra I, λ max (ν max ), FWHM Vlnové délky λči vlnočty ν? Počet fotonů detekovaných na vlnové délce λ (vlnočtu ν) je úměrný šířce detekovaného spektrálního pásu (bandpass) λ (nebo ν) F λ (λ F ) λ F =F ν (ν F ) ν F ν F musí být kladné a je tedy definováno jako 1/λ F - 1/(λ F + λ F ). Potom dostáváme Při měření spekter za F λ (λ F )λ F (λ F + λ F )=F ν (ν F ) použití mřížkového monochromátoru je Protože λ F <<λ F, můžeme psát konstantní λ, pro řadu teoretických výpočtů je F λ (λ F )λ F2 =F ν (ν F ) vhodnější škála vlnočtů, neboť ν ~ E Lakowicz Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2.ed., Kluwer/Plenum, 1999

Excitační a emisní spektra SA DHSA Sledování metabolizace SA na DHSA jaterními buňkami Fluorescence intenzity (rel.u.) 1.2 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 t = 0 t = 1 h 0.0 350 400 450 500 550 600 650 Emission wavelength (nm)

Určení acidobazické rovnovážné konstanty pk A z posunů spektra 22500 těžiště emisního spektra (cm -1 ) 22000 21500 21000 20500 20000 19500 0 2 4 6 8 10 12 ph

Stanovení kvantového výtěžku QY = N N em A I F (λ ex, λ em ) = I 0 (1-10 -ε(λ ex) c l ) QY P(λ em )η(λ em ) I 0 ε(λ ex ) c l QY P(λ em )η(λ em ) Pro určení kvantového výtěžku musíme proměřit celé emisní spektrum Jelikož nedetekujeme všechny fotony (η), musíme provést srovnání se standardem o známém QY QY = QY S I I S A S A I... integrální intenzita A... absorbance n... index lomu rozpouštědla n n 2 2 S n n 0 DET QY < 1, pro fosforescenci QY << 1 Měření pomocí srovnání se standardem (integrace přes celé emisní spektrum!) nebo pomocí určení příspěvku nezářivých přechodů v mikrokalorimetru. Intenzita z bodového zdroje v prostředí o indexu lomu n pozorovaná v prostředí o indexu lomu n 0 je modifikovaná faktorem (n/n 0 ) 2.

Poměrové měření Poměr intenzit fluorescence na dvou vlnových délkách nese informace o tvaru spektra, ale nevyžaduje změření celého spektra S výhodou využíváno ve fluorescenční mikroskopii Absorpční a emisní spektra fluoresceinu

3D spektra Kompletní informace o fluorescenčních charakteristikách látky Měření je časově náročné a bývá prováděno s nižším rozlišením Snazší identifikace většího množství peaků emise (nm) 650 600 550 500 450 benz-cdse 0 20.00 40.00 60.00 80.00 100.0 120.0 140.0 160.0 180.0 200.0 220.0 240.0 260.0 280.0 300.0 320.0 340.0 360.0 380.0 400.0 400 350 300 200 250 300 350 400 450 500 550 600 excitace (nm)

Artefakty ve steady-state spektrech Excitace kontinuálním světlem I při měření spektra 1 fluoroforu pozorujeme více peaků. Jsou to především: Rayleighův rozptyl a jeho druhá harmonická Ramanův rozptyl Signál pozadí vlnová délka emise 800 750 700 650 600 550 500 450 400 350 300 350 400 450 500 550 600 650 700 vlnová délka excitace 0 100.0 200.0 300.0 400.0 500.0 600.0 700.0 800.0 900.0 1000 1100 1200 1300 1400 1500 1600 1700 1800 1900 2000 S 1 S 0 v 2 v 1 v 0 Lakowicz Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2.ed., Kluwer/Plenum, 1999

1.řád Rayleighův rozptyl 1.řád Ramanův rozptyl 2.řád 2.řád 3.řád

Je třeba provést spektrální korekce na emisní spektrum zdroje (v excitačním spektru), na spektrální citlivost detektoru, popř. použitý filtr (v emisním spektru), na signál pozadí (nečistoty, Ramanův rozptyl) Efekt vnitřního filtru Lakowicz Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2.ed., Kluwer/Plenum, 1999

Zobrazování Možnost zobrazovat objekty v měřítcích od nm po tisíce km Selektivní zvýraznění určité části objektu Funkční zobrazování Treumer F et al., Br J Ophthalmol 2010;94:48-53 Zobrazení cévního řečiště na sítnici pomocí fluoresceinu Měření ph pomocí poměrového měření

Zobrazování Monitorování fluorescence chlorofylu v planktonu v Arabském moři (modrá - vysoká intenzita fluorescence planktonu ve stresových podmínkách) fluorescence www.ioccg.org/gallery/terra/asia.html fotosyntéza

Shrnutí Steady-state - buzení kontinuálním světlem Intenzita při pevných vlnových délkách excitace a emise - titrační experimenty, kinetika Spektrální závislosti - excitační, emisní, synchronní, kompletní (3D, EEM) spektrum Artefakty ve steady-state spektrech (Rayleighův rozptyl a jeho druhá harmonická, Ramanův rozptyl, signál pozadí) Zobrazování (selektivní zvýraznění, funkční zobr.)