Jiřincová H., Havlíčková M., Limberková R., Táčner. J., Kynčl J., Otavová M. SZÚ Praha, NRL pro chřipku

Transkript

1 Laboratorní zkušenosti s diagnostikou pandemic H1N a zhodnocení situace v ČR, stručná charakteristika viru s akcentem na odlišnosti Jiřincová H., Havlíčková M., Limberková R., Táčner. J., Kynčl J., Otavová M. SZÚ Praha, NRL pro chřipku

2

3 Afrika (AFRO) 8352 / 42 Amerika (AMRO) / 3020 Blízký východ (EMRO) / 74 Evropa (EURO) / 176 JV Asie (SEARO) / 413 Západní Pacifik (WPRO) / 383 Celkem: / 4108

4 Pandemic (H1N1) 2009 V březnu a počátkem dubna 2009 došlo v Mexiku k epidemii respiračních onemocnění a rostl počet případů onemocnění připomínajících chřipku (influenza-like illness=ili) v několika oblastech země 12. duben - v souladu s Mezinárodním zdravotním řádem Mexiko hlásilo Panamerické zdravotnické organizaci (PAHO) epidemii chřipku připomínajících onemocnění v malé komunitě státu Veracruz 17. duben - případ atypické pneumonie ve státě Oaxaca uspíšil zvýšenou surveillance v celém Mexiku 23. duben - několik případů závažných respiračních onemocnění laboratorně potvrzeno jako virová A(H1N1) infekce a komunikováno s PAHO Sekvenční analýza odhalila, že pacienti byli infikováni stejným kmenem viru identifikovaném následně u 2 dětí žijících v Kalifornii

5 Oseltamivir rezistence ke Celkem více než 2000 izolátů ze 119 zemí (180 izolátů USA) pouze 12 oseltamivir rezistentních Kanada, Čína, Dánsko, Hong Kong, Japonsko, Singapur, USA. Celkem 340,000 laborat.konfiromovaných případů, 4100 úmrtí. antigenní a genetická podobnost A/California/7/2009-like pandemic H1N virus.

6 Chřipka typu A - zoonotická infekce H: 16 subtypů N: 9 subtypů (144 možných kombinací)

7 Pandemie chřipky v časové H2N2 chronologii H1N1 H2N2 H1N1 H3N8 H3N2 Pandemic H1N Ruská chřipka H2N Old Hongkongská chřipka H3N Španělská chřipka H1N Asijská chřipka H2N Hongkongská chřipka H3N2 Pandemic H1N Evidované případy ptačíchřipky zdroj: ECDC-Stockholm H7 H9 * H

8

9 Fig. 1 Host and lineage origins for the gene segments of the 2009 A(H1N1) virus: PB2, polymerase basic 2; PB1, polymerase basic 1; PA, polymerase acidic; HA, hemagglutinin; NP, nucleoprotein; NA, neuraminidase; M, matrix gene; NS, nonstructural gene R. J. Garten et al., Science 325, (2009) Published by AAAS

10 Původ a funkce jednotlivých segmentů H Classic swine - North American lineage N Eurasian swine lineage M Eurasian swine lineage M1 (matrix, inter. vrnp/surface glycoproteins,nuclear export, budding); M2 (membrane protein, proton channel) PB2 Avian, North American lineage PB1/ PB1-F2 Human seasonal H3N2 (endonuclease, elongation, apoptosis) PA (protease) Avian, North American lineage NP Classic swine, North American lineage (RNA synthesis, RNA nuclear export) NS1/ NS2/NEP Classic swine, North American lineage (viral interferon antagonist); (non-structural protein 2, nuclear export of vrnps)

11 Gen SW Poz. Čl. H1N H5N1 Ptačí Gen Poz. SW Čl. H1N M1 C, L 115 I V V V NP 16 G,G D D G G VV H5N1 Ptačí A 121 A A T T 61 I, I L I I I T 137 A T T T 283 L,L P P L L PB2 Y 44 S A A A 305 K, K K R R R AA MM 64 T M I M 313 V, V Y Y F F AA 199 S S A A 357 K,K K K Q Q E 271 A T T T PA 28 P,P L L P P AA LL 475 M M L L 55 DD N N D D DD 567 N N D D 57 E Q R R R RR TT 588 I A A A 100 EEE A A V V E JE DOB RA EEE 627 K!! K!! E E 225 SS C S S S SSSS AA 674 T A A A 268 LL I L L L KK 702 R R K K 337 AA S A A A NS I,I,I,I 81 M I delec e I 404 AA S A A A

12 Pandemic H1N v ČR

13 Chronologie výskytu pandemic (H1N1) 2009 v ČR od počátku laboratorního sledování od18. KT do 39. KT ( )

14 Cestovatelská anamnéza přímý přenos CELKEM KONTAKT NEVI/NECESTOVAL CESTOVAL

15 Distribuce pozitivních záchytů v krajích neurčen Praha Středočeský MSK Královéhradecký Jihočeský Ústecký JmK Plzeňský Vysočina Zlínský Karlovarský Liberecký Anglie Portugalsko Olomoucký SwA/InfA SwA/InfA

16 Hospitalizace, chronická onemocnění, těhotenství Hospitalizováno Respirační chronické onem Těhotenství (2.trimestr) (Resp. onem. 2 hosp.,gravidita 1 hosp)

17 Věková distribuce prokázaných případů pandemic (H1N1) 2009 do až 5 6 až až až a více celkem Celkem unsubtyped celkem 311 pozitivních, z toho 65 nesubtypováno no,, 246 pandemic H1N1 (1350 Praha, 238 Ostrava)

18 Věková distribuce/hospitalizace v EU

19 RT-PCR Průkaz viru ve výtěru izolace viru v buněčné kultuře MDCK Rapid testy 38% - srovnatelné výsledky se sezónní chřipkou,

20 Sérologie KFR HIT včetně Tween ether štěpených antigenů VNT (dosud připravujeme test)

21 Porovnání průkazu vzestupu protilátek v testu HIT a KFR pozit negat HIT KFR celkem vyšetřeno 31 párových sér od osob s pozitivním nálezem ve výtěru

22 Izolace viru provádí se buňkách MDCK/SIAT mikrokultivace médium s trypsinem (2μg/1 ml) po inokulaci vzorků centrifugace destiček pro zlepšení efektu adsorpce izolace snadná, ale pomnožování do vyšších titrů a příprava antigenů komplikovaná

23 1. Od září 2009 další rozšíření počtu laboratoří, které budou vyšetřovat pandemic H1N surveillance ARI dle obvyklých pravidel 3. pozornost komplikovaným a obtížně probíhajícím případům ARI