Seznam publikací (doc. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. )

Transkript

1 Seznam publikací (doc. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. ) 1) Monografie 1. Hudeček, J., Kalous, V.: Fyzikálně chemická podmíněnost struktury bílkovin. Metody popisu a predikce struktury. (Pokroky v chemii Academia, Praha ISBN , 120 stran 2) Kapitoly v monografiích 1. Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Secondary structure prediction for cytochromes P-450. In: Cytochrome P-450, Biochemistry, Biophysics and Induction, (Vereczkey, L., Magyar, K., Eds.), pp , Akadémiai Kiadó, Budapest Anzenbacher, P., Hudeček, J., Fidler, V., Baumruk,V.: A spectroscopic study of the active site of an enzyme: Cytochrome P-450. In: Spectroscopy of Biological Molecules - New Advances. (Schmid D., Schneider P.W., Siebert F., Eds.), pp , John Wiley, Chichester Anzenbacher, P., Hudeček, J., Hodek, P., Šebestian, J.: Structure and function of heme thiolate proteins. In: Spectroscopic and Structural Studies of Biomaterials I.Proteins. (Twardowski J., Ed.) pp , Sigma Press, Wilmslow Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Membrane proteins: structural aspects. In: Spectroscopic and Structural Studies of Biomaterials I.Proteins. (Twardowski J., Ed.) pp , Sigma Press, Wilmslow Anzenbacher, P., Hudeček, J.: Absorpcyjna spektroskopia roznicowa i rozniczkowa. In: Biospektroskopija (Twardowski J., ed.), Vol 3, pp Państwowe wydawnictwo naukowe, Warszawa 1989, ISBN Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Hydrophobicity profile analysis of P450XXIIA1 and P450CIA1 similarity. In: Cytochrome P-450. Biochemistry, Biophysics. (Schuster I, ed.) pp , Taylor & Francis, London ISBN Anzenbacher, P., Hudeček, J., Stiborová, M., Larroque, C., Lange, R., Heibel, G., Hildebrandt, P.: Comparison of the structures of different cytochromes P-450 as revealed by experimental and theoretical methods. In: Cytochrome P-450 Biochemistry and Biophysics (Archakov A.I., Bachmannova G.I., Eds.) pp. 1-8, INCO-TNC, Moscow Hudeček, J., Anzenbacher, P. Munro A.W., Hildebrandt, P.: Raman evidence for differences in heme vinyl orientation in cytochromes P-450. In: Proc. XVIIth Int. Conf. Raman Spectroscopy (ICORS 2000, August 20-25, 2000, Univ. Beijing, China), (Zhong, S.- L., Zhu, B.-F., Eds.), pp , John Wiley, Chichester, 2000 ISBN Karabec, M., Hudeček, J., Sopko, B., Šulc, M., Hodek, P.: Differences in modification of cytochrome P450 2B4 by photolabile probe caused by diamantane binding in active site. In: Cytochromes P450 - Biochemistry, Biophysics, and Bioinformatics. Proceedings of the International Conference, pp , Medimond, Bologna 2005 ISBN

2 10. Stiborová, M., Hudeček, J., Hodek, P., Lewis, D.F., Frei, E.: Ellipticine as a suitable model substrate for several cytochromes P450. In: Cytochromes P450 - Biochemistry, Biophysics, and Bioinformatics. Proceedings of the International Conference, pp , Medimond, Bologna 2005 ISBN Hudeček, J.: Physics and biochemistry: how much they can have in common. In: Nuclear Physics Methods and Accelerators in Biology and Medicine (Fourth Int. Summer School on Nuclear Physics Methods and Accelerators in Biology and Medicine, Prague, Czech Republic, 8-19 July 2007), (Granja, C. Leroy, C., Stekl I., Eds.) pp , AIP Conf. Proc. Vol. 958, American Institute of Physics, Melville, N.Y., 2007, ISBN Hodek, P., Šulc, M., Hudeček, J., Stiborová, M.: Identification of outer diamantane binding sites within the cytochrome P450 2B4 structure. In: 15th International Conference on Cytochromes P450 - Biochemistry, Biophysics, and Functional Genomics., (Bled, Slovenia, June 17-21, 2007) pp , Medimond, Bologna 2007 ISBN Stiborová, M., Arlt, V.M., Phillips, D.H., Henderson, C.J., Wolf, C.R., Hodek, P., Hudeček, J., Frei, E.: Studies with the hepatic NDPH:cytochrome P450 reductase null mouse reveal the role of hepatic cytochromes P450 in bioactivation of the anticancer drug ellipticine. In: 15th International Conference on Cytochromes P450 - Biochemistry, Biophysics, and Functional Genomics., (Bled, Slovenia, June 17-21, 2007) pp , Medimond, Bologna 2007 ISBN ) Původní vědecké práce v mezinárodních časopisech s recenzním řízením (IF) 1. Hudeček, J., Kalous, V., Anzenbacher, P.: Temperature-dependent changes of insulin derivative spectra. Stud. Biophys. 72, (1978) IF = Anzenbacher, P., Šípal, Z., Hudeček, J.: On the redox potential of cytochrome P-450. Stud. Biophys. 73, (1978) IF = Hudeček, J., Anzenbacher, P., Kalous, V.: Interaction of insulin with metal (II) ions. FEBS Lett. 100, (1979). IF = Anzenbacher, P., Hudeček, J., Stružinský, P.: Study of thermal stability of cytochrome P- 450 by differential scanning calorimetry. FEBS Lett. 149, (1982) IF = Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Secondary structure prediction of liver microsomal cytochrome P-450: proposed model of spatial arrangement in a membrane. Biochim. Biophys. Acta 955, (1988) IF = Anzenbacher, P., Hudeček, J., Mojzeš, P., Baumruk, V., Štěpánek, J.: Resonance Raman study of the reduction of catalase - Evidence for a strong electron donation to the heme. Stud. Biophys. 123, (1988) IF = Anzenbacher, P., Hudeček, J., Vajda, Š., Fidler, V.: Nanosecond fluorometry of the single tryptophan in cytochrome P-450e (P450IIB2). Biochem. Biophys. Res. Commun. 162, (1989) IF = Chmelík, J., Hudeček, J., Putyera, K., Kalous, V., Chmelíková, J.: Characterization of the hydrophobic properties of amino acids on the basis oh their partition and distribution

3 coefficients in the 1-octanol/water system. Coll. Czech. Chem. Commun. 56, (1991) IF = Anzenbacher, P., Hudeček, J., Vajda, Š., Fidler, V., Larroque, C., Lange, R.: Nanosecond fluorescence of tryptophans in cytochrome P-450scc (CYP11A1). Effect of substrate binding. Biochem. Biophys. Res. Commun. 181, (1991). IF = Hudeček, J., Baumruk, V., Anzenbacher, P., Munro, A.W.: Catalytically self-sufficient P450 CYP102 (cytochrome P-450 BM-3): resonance Raman spectral characterization of the heme domain and of the holoenzyme. Biochem.Biophys. Res. Commun. 243, (1998) IF = Anzenbacher, P., Bec, N., Hudeček, J., Lange, R., Anzenbacherová, E.: High conformational stability of cytochrome P-450 1A2. Evidence from UV absorption spectra. Coll. Czech. Chem. Commun. 63, (1998) IF = Anzenbacher, P., Hudeček, J., Lange, R., Bancel, F.: Accessibility of tyrosine residues in cytochrome P-450scc (CYP11A1). Coll. Czech. Chem. Commun. 63, (1998) IF = Anzenbacherová, E., Bec, N., Anzenbacher, P., Hudeček, J., Souček, P., Jung, C., Munro, A.W., Lange, R.: Flexibility and stability of cytochromes P450 3A4 and BM-3. Eur. J. Biochem. 267, (2000) IF = Döpner, S., Hudeček, J., Ludwig, B., Witt, H., Hildebrandt, P.: Structural changes in cytochrome c oxidase induced by cytochrome c binding. A resonance Raman study. Biochim. Biophys. Acta 1480, (2000) IF = Hudeček, J., Anzenbacherová, E., Anzenbacher, P., Munro, A.W., Hildebrandt, P.: Structural similarities and differences of the heme pockets of various P450 isoforms as revealed by resonance Raman spectroscopy. Arch. Biochem. Biophys., 383, (2000) IF = Mikšanová, M., Hudeček, J., Páca, J., Stiborová, M.: To the mechanism of horseradish peroxidase-mediated degradation of a recaciltrant dye Remazol Brilliant Blue R. Coll. Czech. Chem. Commun.66, (2001) IF = Beneš, M., Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hof M.: Coumarine 6, Resorufin, Hypericine, and Flavins: Suitable Chromophores for Fluorescence Correlation Spectroscopy of Biological Molecules. Coll. Czech. Chem.Commum., 66, (2001) IF = Anzenbacher, P., Hudeček, J.: Differences in flexibility of active sites of cytochromes P- 450 probed by resonance Raman and UV-Vis absorption spectroscopy. J Inorg. Biochem 87, (2001) IF = Moré, S.D., Hudeček, J., Urisu, T.: Hydrophobic/hydrophilic interactions of cytochrome c with functionalized self-assembled monolayers on silicon. Surf Sci, 532, (2003) IF = Stiborová, M., Sejbal, J., Bořek-Dohalská, L., Aimová, D., Poljaková, J., Forsterová, K., Rupertová, M., Wiesner, J., Hudeček, J., Wiessler, M., Frei, E.: The anticancer drug ellipticine forms covalent DNA adducts, mediated by human cytochromes P450, through

4 metabolism to 13-hydroxyellipticine and ellipticine N-2-oxide. Cancer Res. 64, (2004) IF = Hodek, P., Koblas, T., Rýdlová, H., Kubíčková, B., Šulc, M., Hudeček, J., Stiborová, M.,: Chicken egg yolk as an excellent source of highly specific antibodies against cytochromes P450. Coll. Czech. Chem. Commun. 69, (2004) IF = Hodek, P., Bořek-Dohalská, L., Sopko, B., Šulc, M., Smrček, S., Hudeček J., Janků, J., Stiborová, M.: Structural requirements for inhibitors of cytochromes P450 2B: assessment of the enzyme interaction with diamondoids. J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 20, (2005) IF = Stiborová, M, Sopko, B., Hodek, P., Frei, E., Schmeisser, H.H., Hudeček, J.: The binding of aristolochic acid I to the active site of human cytochromes P450 1A1 and 1A2 explains their potential toreductively activate this human carcinogen. Cancer Lett. 229, (2005) IF = Anzenbacherová, E., Hudeček, J., Murgida, D., Hildebrandt, P., Marchal, S., Lange, R., Anzenbacher, P.. Active sites of two orthologous cytochromes P4502E1: Differences revealed by spectroscopic methods. Biochem. Biophys. Res. Commun. 338, (2005) IF = Poljaková, J., Dračínský, M., Frei, E., Hudeček, J., Stiborová, M.: The efect of ph on peroxidase-mediated oxidation of and DNA adduct formation by ellipticine. Coll. Czech. Chem. Commun.71, (2006) IF = Stiborová, M., Bořek-Dohalská, L., Aimová, D., Kotrbová, V., Kukačková, K., Janouchová, K., Rupertová, M., Ryšlavá, H., Hudeček, J., Frei, E.: Oxidation pattern of the anticancer drug ellipticine by hepatic microsomes - Similarity between human and rat systems. Gen. Physiol. Biophys. 25, (2006) IF = Hudeček, J., Hodek, P., Anzenbacherová, E., Anzenbacher, P.: Structural analysis of cytochromes P450 shows differences in flexibility of heme 2- and 4-vinyls. Biochim. Biophys. Acta 1770, (2007) IF 2006 = Aimová, D., Svobodová, L., Kotrbová, V., Mrázová, B., Hodek, P., Hudeček, J., Václavíková, R., Frei, E., Stiborová, M.: The anticancer drug ellipticine is a potent inducer of rat cytochromes P450 1A1 and 1A2, thereby modulating its own metabolism. Drug Metabol. Disposition 35, (2007) IF 2006 = Stiborová, M., Dračínská, H., Aimová, D., Hodek, P., Hudeček, J., Ryšlavá, H., Schmeiser, H.H., Frei, E.: The The anticancer drug ellipticine is an inducer of rat NAD(P)H:quinone oxidoreductase. Coll. Czech.Chem. Commun.72, (2007) IF 2006 = Hodek, P., Karabec., M., Šulc, M., Sopko, B., Smrček, S., Martínek, V., Hudeček, J., Stiborová, M.: Mapping of cytochrome P450 2B4 substrate binding sites by photolabile probe 3-azadiamantane: Identification of putative substarte access regions. Arch. Biochem. Biophys. 468, (2007) IF 2006 = Stiborová, M., Arlt V.M., Henderson, C.J., Wolf, C. R., Kotrbová, V., Moserová, M., Hudeček, J., Phillips, D.H., Frei, E: Role of hepatic cytochromes P450 in bioactivation of the

5 anticancer drug ellipticine: Studies with the hepatic NADPH: Cytochrome P450 reductase null mouse, Toxicol. Appl. Pharmacol. 226, (2008) IF 2006 = Stiborová, M., Dračínská, H., Mizerovská, J., Frei, E., Schmeiser, H.H., Hudeček, J., Hodek, P., Phillips, D.H., Arlt, V.M.: The environmental pollutant and carcinogen 3- nitrobenzanthrone induces cytochrome P450 1A1 and NAD(P)H:quinone oxidoreductase in rat lung and kidney, thereby enhancing its own genotoxicity. Toxicology, 247, (2008) IF 2006 = Stiborová, M., Hudeček, J., Frei, E., Schmeiser, H.H.: Contribution of biotransformation enzymes to the development of renal injury and urothelial cancer caused by aristolochic acid: urgent questions, difficult answers. Interdisc. Toxicol., 1, 8-12 (2008). 34. Stiborová, M., Vostalova, J., Zdarilova, A., Ulrichova, J., Hudecek, J., Tschimer, K., Simanek, V.: Macleaya cordata extract and Sangrovit genotoxicity: assesment in vivo. Biomed. Papers, (2008), in press. 35. Naiman, K., Dračínská, H., Martínková, M., Šulc, M., Dračínský, M., Kejíková, L., Hodek, P., Hudeček, J., Liberda, J., Schmeiser, H.H., Frei, E., Stiborová, M.: Redox cycling in the metabolism of the environmental pollutant and suspected human carcinogen o-anisidine by rat and rabbit hepatic microsomes. Chem. Res. Toxicol., in press. IF 2006 = Bezouska, K., Vanek, O., Nalezkova, M., Kavan, D., Borovickova, I., Pompach, P.., Novak, P., Kumar, V., Hudecek, J., Brynda, J.: Soluble recombinant human CD69 receptors optimized to have an exceptional physical and chemical stability are effective in animal tumor therapies. Submitted to FEBS J. IF 2006 = Beneš, M. Hudeček, J., Van der Putten, R. F.M., Speijer, H., Jirka, I., Hof, M. and Hermens, W. Th. Loss of trans-membrane protein asymmetry during formation of supported phospholipid membranes. Submitted to Langmuir IF 2006 = ) Vědecké práce v národních časopisech s recenzním řízením (IF) 1. Anzenbacher, P., Hudeček, J.: Diferenční a derivační spektrofotometrie, použití ke studiu proteinů. Chem. Listy 75, (1981) IF = Kubičková B., Šulc M, Hodek P., Hudeček, J.: Cytochrome P-450 and monooxygenase activity in the hepatopancreas of the freshwater crayfish, Orconectes limosus RAFFINESQUE - Evidence for induction by phenobarbital. Chem. Listy 90, (1996) IF = Hodek P., Krausová M., Šulc M., Sopko B., Turek M., Hudeček J., Stiborová M.: Use of photoaffinity labeling for study of cytochromes P450, toxicologically important enzymes. Chem. Listy, 100, s104-s106 (2007) IF 2006 = Martínková E., Hodek P., Hudeček J., Frei E., Dontenwill M., Stiborová M.: Oxidation of ellipticine by human and rat cytochromes P450 correlates with its binding to DNA. Chem. Listy, 100, s222-s224 (2007) IF 2006 =

6 5. Mizerovská J., Dračínská H., Martínková M., Hudeček J., Hodek P., Schmeiser H.H., Arlt V.M., Frei E., Stiborová M.: Kinetics of 3-aminobenzanthrone oxidation by rat hepatic microsomes. Chem. Listy, 100, s227-s229 (2007) IF 2006 = Mrázová B., Kotrbová V., Kořínková M., Svobodová L., Hudeček J., Hodek P., Kizek R., Frei E., Stiborová M.: Kinetics of ellipticine oxidation by cytochromes P450 1A1 and 1A2 reconstituted with NADPH: cytochrrome P450 reductase. Chem. Listy, 100, s237-s239 (2007) IF 2006 = Poljaková J., Frei E., Eckschlager T., Hraběta J., Figová K., Kizek R., Hudeček J., Hodek P., Stiborová M.: Comparison of the cytotoxicity of and DNA adduct formation by the anticancer drug ellipticine in human brest adenocarcinoma, leukemia and neuroblastoma cells. Chem. Listy, 100, s253-s255 (2007) IF 2006 = Semanská M., Martínek V, Hudeček J., Hodek P., Dračínský M., Frei E., Stiborová M.: Study of peroxidase-mediated oxidation of carcinogenic azo dye Sudan I. Chem. Listy, 100, s266-s268 (2007) IF 2006 = Svobodová M, Šístková J., Dračínská H., Hudeček J., Hodek P., Schmeiser H.H., Arlt V.M., Frei E., Stiborová M.: Reductive activation of environmental pollutants 3- nitrobenzanthrone and 2-nitrobenzanthrone. Chem. Listy, 100, s277-s279 (2007) IF 2006 = ) Učebnice a učební texty 1. Krajhanzl, A., Hladík, J. a kol.: Biochemické metody. Návody k pokročilým praktickým cvičením. Universita Karlova, Praha 1991, ISBN Hudeček, J., (Ed.), Koláčná, L., Kučera, T., Suchomel, P.: Biochemical Techniques (Practical Course II), Faculty of Science, Charles University Praha, 1993 (2nd Edition, revised 1994, 3rd Edition 1995). 3. Biochemie. Základní kurs. Karolinum, nakl. Univerzity Karlovy, Praha 1993, ISBN , 2. přeprac. vydání 1995, dotisk 1998, ISBN , 3. přeprac. vydání 1999 ISBN , dotisk 2005 ISBN Chemie ze školy do života, Doplněk k učebnicím pro střední školy. Státní pedagogické nakladatelství, Praha 1993 ISBN Fraiberk, M. (Ed.) Soubor modelových otázek k přijímací zkoušce z chemie. Nakl. Peres, Praha 2000 ISBN Čtrnáctová, H., Halbych, J., Hudeček, J., Klímová, H.: Chemické pokusy pro školu a zájmovou činnost. Prospektrum, Praha ISBN Hudeček J.: Separace proteinů - MALDI. In. Vysokoúčinné analytické separace biologicky aktivních látek (Štulík, K. ed.) skripta kursu v rámci PACI, VŠCHT Praha ISBN ) Vědecké práce ve sbornících včetně sborníků z konferencí s plným otištěným textem

7 a) vydané v zahraničí 1. Anzenbacher, P., Hudeček, J.: Two membrane proteins, cytochrome P-450 and bacteriorhodopsin. Implications from secondary structure prediction. Abstr. 13th Int. Congress Biochem (IUB), str. 746, Amsterdam Hudeček, J., Kitagawa, T.: Structural predictions on cytochrome P-450. Seibutsu Butsuri 29S, 197 (1989). 5. Stiborová, M, Hansíková, H., Hodek, P., Hudeček, J.: N-nitrosamines and azo dye 1- phenylazo-2-hydroxynaphthalene. In: Book of Abstr., 9th Int. Conf. Cytochrome P-450 Biochemistry, Physics and Molecular Biology, str. 282, Zürich, Stiborová, M, Hansíková, H., Šulc, M., Hodek, P., Hudeček, J.: Study of the mechanism of N-demethylation and denitrosation of N-nitrosamines catalyzed by rat liver cytochrome P-450b. In: Book of Abstr., 9th Int. Conf. Cytochrome P450 Biochemistry, Physics and Molecular Biology, str. 249, Zürich, Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Munro, A.W.: Resonance Raman spectral analysis of CYP102 and CYP1A2. Chem. Papers 52, 519 (1998) IF= 0, Kubíčková, B., Hodek, P., Šulc, M., Hudeček, J.: Crustacean microsomal P450 monooxygenase enzyme system. A comparison with mammalian liver microsomes. Chem. Papers 52, 517 (1998) IF= 0, Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Hudeček, J., Munro, A.W., Hildebrandt, P.: Differences nad similarities in P450 1A2 and BM-3 active centers revealed by spectroscopic methods. 12th International Symposium on Microsomes and Drug Oxidations. Montpellier - France, July 1998, abstr Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Hudeček, J., Lange, R., Munro, A.W., Hildebrandt, P.: Conformational flexibility and stability of active sites of cytochromes P A4, 1A2 and 102 (BM-3). ISSX Proc.14, 75 (1999). 11. Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Lange, R., Munro, A.W.: Spectroscopic evidence for differences in flexibility and stability of P450 isoforms. Abstr. 11th Int. Conf. Cytochrome P-450. Sendai (Japan) Aug. 29-Sept. 2., 1999, str Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Munro, A.W.: Differences in vinyl orientation in P450 enzymes. A resonance Raman study. Drug Metab. Rev. 32, Suppl.1, 63 (2000) IF = Hudeček, J., Anzenbacher, P., Shimizu, T., Munro, A.W., Kitagawa, T.: Resonance Raman spectroscopy indication of differences in active site structure of cytochrome P-450 isoforms. In : 14th Int. Symp. Microsomes Drug Oxidations (MDO2002), Sapporo, Japan (July 22-26, 2002), (Kamataki, T., Ed.), str Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Hudeček, J., Marchal, S., Lange, R.: Human and minipig cytochromes P450 2E1 although having similar substrate specificity differ in compressibility of their heme pockets. In: 14th Int. Conf. Cytochromes P450: Biochemistry,

8 Biophysics and Bioinformatics (May 31 - June 5, 2005, Dallas, USA) (Peteson J.B., Graham, S., Eds.) ASBMB Dallas 2005, str Hudeček, J., Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Murgida, D., Hildebrandt, P.: Differences in active site structure of P450 forms - spectroscopic evidence. In: 14th Int. Conf. Cytochromes P450: Biochemistry, Biophysics and Bioinformatics (May 31 - June 5, 2005, Dallas, USA) (Peteson J.B., Graham, S., Eds.) ASBMB Dallas 2005, str Stiborová, M., Hudeček, J., Hodek, P., Lewis, D.F., Frei, E.: Ellipticine as a suitable model substrate for several cytochromes P450. In: 14th Int. Conf. Cytochromes P450: Biochemistry, Biophysics and Bioinformatics (May 31 - June 5, 2005, Dallas, USA) (Peteson J.B., Graham, S., Eds.) ASBMB Dallas 2005, str Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Otyepka M., Skopalík, J, Hudeček, J., Seliškar M., Lange, R., Hildebrandt, P.: Flexibility of cytochrome P450 active sites. In: 15th Int. Conf. Cytochromes P450. Biochemistry, Biophsyics, Functional Genomics (Bled - Slovenia, June 17 - June 21, 2007) (Seliškar., M., Rozman, D., Eds.) University of Ljubljana, str. 15. ISBN Hodek, P., Šulc, M., Karabec., M., Sopko, B., Smrček, S., Hudeček, J., Stiborová, M.: Identification of putative substrate access regions of CYB2B4 with diamantane photoaffinity probe. In: 15th Int. Conf. Cytochromes P450. Biochemistry, Biophsyics, Functional Genomics (Bled - Slovenia, June 17 - June 21, 2007) (Seliškar., M., Rozman, D., Eds.) University of Ljubljana, str ISBN b) vydané v ČR, SR a Československu 1. Anzenbacher, P., Hudeček, J., Kalous, V.: Konformační změny insulinu při interakci s ionty kovů. Bull. ČSSB 6, 11 (1978). 2. Hudeček, J., Kalous, V.., Anzenbacher, P.: Structure-determined interactions of insulin. In: 1st Conf. Organ. Bio-organ. Chem Young Scientists, Bechyně Sept., 21-28, Book of Abstr. (Kočovský P., Drašar P., eds.,) Hudeček, J., Kalous, V.: Predikce sekundární struktury membránových bílkovin Bull. ČSSB 12, 134 (1984). 4. Putyera, K., Hudeček, J., Kalous, V.: Hydrofobicita aminokyselin a struktura bílkovin. Bull. ČSSB 12, 137 (1984). 5. Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Význam lokálních interakcí v řetězci pro tvorbu sekundární struktury membránových bílkovin - závěry z predikce struktury. In: Letní škola Biofyzika membrán a ich modelov (Košice-Poproč ) Zborník prednášok str Engl, J., Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Labelling of rat liver microsomal cytochrome P- 450 by fluorescein isothiocyanate. In: Abstr. 14th Int. Congress Biochem. (IUB), Prague 1988, abstr. Th-106.

9 7. Fidler, V., Vajda, Š., Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Fluorescence indication of the structure of cytochrome P-450 substrate-binding site. In: Abstr. 14th Int. Congress Biochem. (IUB), Prague 1988, abstr. Th Uller, J., Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Differences in predicted secondary structures of lectins from leguminous plants - evidence for the role of postranslational modifications in folding? In: Abstr. 14th Int. Congress Biochem. (IUB), Prague 1988, Fr Davidová, L., Hudeček, J.: Význam volby báze dat pro výsledné hodnoty preferenčních parametrů pro predikci sekundární struktury bílkovin metodou podle Choua a Fasmana. In: XIII. celost. biochem. dny (České Budějovice, ). 10. Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hodek, P. Stiborová, M.: Cytochromy P-450: Shody a rozdíly ve struktuře. XVIII. xenobiochemické symposium (Brno, ) In: Sborník abstraktů, str Hudeček, J., Stuchlík, E.: Možnosti biochemického sledování kontaminace vod. In: Zborník abstraktov str.130. XIV. biochemických dní (Bratislava ) 12. Stiborová, M, Hansíková, H., Šulc, M., Hodek, P., Hudeček, J.: Srovnání metabolismu karcinogenních N-nitrosaminů cytochromy P4509 a peroxidasami in vitro. In: XIX. xenobiochemické symposium (Brno, ) Sborník abstraktů, str Hudeček, J., Anzenbacher, P., Baumruk, V., Hildebrandt, P., Munro, A.W.: Resonanční Ramanova spektroskopie cytochromu P-450 BM3 Projevy intramolekulárního přenosu elektronu. In: XIX. xenobiochemické symposium (Brno, ) Sborník abstraktů, str Kubíčková, B., Šulc, M., Hodek, P., Hudeček, J.: Indukce cytochromu P-450 v hepatopankreatu raka rodu Orconectes fenobarbitalem. In: XIX. xenobiochemické symposium (Brno, ) Sborník abstraktů, str Ryjáček, F., Hudeček, J.: Modelování interakce cytochromů P450 s karcinogenními substráty. In: XX. Xenobiochemické sympózium Smolenice ( ). Zborník súhrnov str Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Lange, R., Munro, A.W.: Stabilita a flexibilita cytochromů P450 - závěry ze spektrálních studií. In: XX. Xenobiochemické sympózium Smolenice ( ). Zborník súhrnov, str Hudeček, J., Hodek, P., Šulc, M., Stiborová, M.: Enzymy, biodegradace a biomonitoring. In: Biodegradace IV (8.-9. března 2000, Seč, ČR) (Halousková O., Ed.), str , Vyd. VŠCHT Praha, Stiborová, M., Šulc, M., Hodek, P., Hudeček, J.: Biodegradace polutantů životního prostředí enzymovými systémy rostlin. In: Biodegradace IV (8.-9. března 2000, Seč, ČR) (Halousková O., Ed.), str , Vyd. VŠCHT Praha, Hudeček, J., Anzenbacher, P., Shimizu, T., Munro, A.W., Kitagawa, T.: Resonance Raman spectra reveal subtle differences in heme structure of P450 enzymes. Chem. Listy 97, s81-s82 (2003).

10 20. Beneš, M., Pekárek, J., Hof M., Anzenbacher, P., Hudeček, J.: Fluorescence correlation spectroscopy study of interaction between CYP 3A4 and coumarin 6. Chem Listy 97, s82- s83 (2003). 21. Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Raman spectroscopy as a tool for study of structure of P450 active site. In: XXII. Xenobiochemické sympózium Smolenice ( ) Zborník príspevkov str SSBMB, ÚMFG SAV, FCHPT STU. 22. Hudeček, J., Anzenbacher, P.:Jaké jsou možnosti "nepřímých"spektrálních metod ve věku rentgenové krystalografie? In: XXIII. Xenobiochemické symposium Valtice, , str Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Otyepka M., Hudeček, J.: Aktivní místa cytochromu P450: Mýty a skutečnost. In: XXIII. Xenobiochemické symposium Valtice, , str Hudeček, J.: What role may side chains of the heme play in cytochromes P450? In: Zborník príspevkov, XXIV. xenobiochemické sympózium, , Liptovský Ján (Boháčová, V., Breier, A. Zbyňovská D., Eds.). SSBMB, ÚMFG SAV, FCHPT STU. ISBN Hudeček, J., Hodek, P., Stiborová, M.: Cytochromes P450: From structure to function. In: XX. Biochemický zjazd, Piešťany sept Proceedings (Boháčová, V., Breier, A. Zbyňovská D., Zliechovec, J., Eds.). L 5,15, str ÚMFG SAV Bratislava ISBN Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Can resonance Raman spectroscopy tell still something more? Cytochrome P450 as an example. In: Structure and stability of biomacromolecules. SSB 2007 (Sept. 5-8, 2007, Košice). Book of contributions (Antalík, M., Fedunová, D, Gažová, Z., Eds.), str Prír. fak. UPJŠ Košice, ISBN Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Otyepka M., Hudeček, J., Hildebrandt, P., Lange, R.: Flexibility of cytochrome P450 active sites as necessary condition of their function. Interdisc. Toxicol., 1, 55 (2008). 28. Bořek-Dohalská L., Hodek, P., Hudeček, J., Stiborová, M.: Experimental approaches to evaluate activities of cytochromes P450 3A. Interdisc. Toxicol., 1, 60 (2008). 29. Hodek, P., Burdová, K, Křížková, J., Kizek, R., Hudeček, J., Stiborová, M.: Dark side of chemopreventive compounds. Interdisc. Toxicol., 1, (2008). 30. Hudeček, J., Šulc, M., Karabec., M., Stiborová, M., Hodek, P.: Access routes to buried active sites of cytochromes P450. Interdisc. Toxicol., 1, (2008). 7) Referátové a přehledové články 1. Stiborová, M., Hudeček, J., Hodek, P., Frei, E.: Cytochromy P-450 a lidské zdraví. Chem. Listy 93, (1999) IF =

11 2. Stiborová, M., Hudeček, J., Páca, J.: Enzymové systémy biotransformující cizorodé látky. Bull. Čes. Spol. Biochem. Mol. Biol. 28, (2000) 3. Stiborová, M., Hudeček, J., Páca, J, Jr. Martínek, V., Páca, J.:Study of enzymes metabolizing environmental pollutants as a means of modulating their biodegradation. Chem. Listy 98, (2004) IF = ) Přednášky typu "invited speaker" 1. Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Membrane proteins: structural aspects. Zvaná přednáška na škole: Spectroscopic and Structural Studies of Biomaterials (Ustroň, Polsko, 1987). 2. Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Can resonance Raman spectroscopy tell still something more? Cytochrome P450 as an example. Zvaná plenární přednáška na konferenci: Structure and stability of biomacromolecules (SSB , Košice). 3. Hudeček, J.,: Physics and biochemistry: how much they can have in common? Zvaná plenární přednáška (3 h) na letní škole: Nuclear Physics Methods and Accelerators in Biology and Medicine (Fourth Int. Summer School on Nuclear Physics Methods and Accelerators in Biology and Medicine, Prague, Czech Republic, 8-19 July 2007). 9) Patenty národní a zahraniční, objevy 10) Přednášky a postery na mezinárodních konferencích, sympoziích a odborných setkáních (kromě přednášek uvedených pod bodem 8) a) Přednášky (jako prezentující autor, dalších cca 10 jako spoluautor): 1. Hudeček, J., Kalous, V.., Anzenbacher, P.: Structure-determined interactions of insulin. 1st Conf. Organ. Bio-organ. Chem Young Scientists, Bechyně Sept., 21-28, Hudeček, J., Kitagawa, T.: Structural predictions on cytochrome P-450. Meeting of Biophysical Soc. Japan, Tokyo, Nov Hudeček, J., Šulc, M., Karabec., M., Stiborová, M., Hodek, P.: Access routes to buried active sites of cytochromes P450. TOXCON 2008, 13th Interdisciplinary Toxicol. Conf. Trenč. Teplice, b) postery (jako prezentující autor): 1. Hudeček, J.,. Anzenbacher, P.: Hydrophobicity profile analysis of P450XXIIA1 and P450CIA1 similarity. Int. Conf. Cytochrome P450, Wien Engl, J., Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Labelling of rat liver microsomal cytochrome P- 450 by fluorescein isothiocyanate. 14th Int. Congress Biochem. (IUB), Prague Fidler, V., Vajda, Š., Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Fluorescence indication of the structure of cytochrome P-450 substrate-binding site. 14th Int. Congress Biochem. (IUB), Prague 1988

12 4. Uller, J., Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Differences in predicted secondary structures of lectins from leguminous plants - evidence for the role of postranslational modifications in folding? 14th Int. Congress Biochem. (IUB), Prague Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Lange, R., Munro, A.W.: Spectroscopic evidence for differences in flexibility and stability of P450 isoforms. 11th Int. Conf. Cytochrome P-450. Sendai (Japan) Aug. 29- Sept. 2., Hudeček, J., Anzenbacher, P. Munro A.W., Hildebrandt, P.: Raman evidence for differences in heme vinyl orientation in cytochromes P-450. XVIIth Int. Conf. Raman Spectroscopy (ICORS 2000) August 20-25, 2000, Beijing, China 7. Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Munro, A.W.: Differences in vinyl orientation in P450 enzymes. A resonance Raman study. 13th Int. Symp. Microsomes Drug Oxidations (MDO2000) S. Andrews, UK Hudeček, J., Anzenbacher, P., Shimizu, T., Munro, A.W., Kitagawa, T.: Resonance Raman spectroscopy indication of differences in active site structure of cytochrome P-450 isoforms. 14th Int. Symp. Microsomes Drug Oxidations (MDO2002), Sapporo, Japan (July 22-26, 2002) 9. Hudeček, J., Anzenbacher, P., Shimizu, T., Munro, A.W., Kitagawa, T.: Resonance Raman spectra reveal subtle differences in heme structure of P450 enzymes. 13th Int. Conf. Cytochrome P-450 Praha Beneš, M., Pekárek, J., Hof M., Anzenbacher, P., Hudeček, J.: Fluorescence correlation spectroscopy study of interaction between CYP 3A4 and coumarin 6. 13th Int. Conf. Cytochrome P-450 Praha Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Munro, A.W.: Resonance Raman spectral analysis of CYP102 and CYP1A2. MDO Sapporo 12. Hudeček, J., Anzenbacher, P., Anzenbacherová, E., Murgida, D., Hildebrandt, P.: Differences in active site structure of P450 forms - spectroscopic evidence. 14th Int. Conf. Cytochromes P450 (May 31 - June 5, 2005, Dallas, USA). 11) Přednášky a postery na národních (a společných česko - slovenských) konferencích, sympoziích a odborných setkáních a) přednášky (jako prezentující autor) 1. Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hodek, P. Stiborová, M.: Cytochromy P-450: Shody a rozdíly ve struktuře. XVIII. xenobiochemické symposium Brno, Hudeček, J., Stuchlík, E.: Možnosti biochemického sledování kontaminace vod. XIV. biochemické dni Bratislava Hudeček, J., Anzenbacher, P., Baumruk, V., Hildebrandt, P., Munro, A.W.: Resonanční Ramanova spektroskopie cytochromu P-450 BM3 Projevy intramolekulárního přenosu elektronu. XIX. xenobiochemické symposium, Brno,

13 4. Ryjáček, F., Hudeček, J.: Modelování interakce cytochromů P450 s karcinogenními substráty. XX. Xenobiochemické sympózium Smolenice, Hudeček, J., Hodek, P., Šulc, M., Stiborová, M.: Enzymy, biodegradace a biomonitoring. Biodegradace IV (8.-9. března 2000, Seč, ČR) 6. Hudeček, J., Anzenbacher, P.: Raman spectroscopy as a tool for study of structure of P450 active site. XXII. Xenobiochemické sympózium Smolenice ( ) 7. Hudeček, J., Anzenbacher, P.:Jaké jsou možnosti "nepřímých"spektrálních metod ve věku rentgenové krystalografie?xxiii. Xenobiochemické symposium Valtice, Hudeček, J.: What role may side chains of the heme play in cytochromes P450?XXIV. xenobiochemické sympózium, , Liptovský Ján 9. Hudeček, J., Hodek, P., Stiborová, M.: Cytochromes P450: From structure to function. XX. Biochemický zjazd, Piešťany sept b) postery (jako prezentující autor) 1. Anzenbacher, P., Hudeček, J., Kalous, V.: Konformační změny insulinu při interakci s ionty kovů. VIII. celost. biochem. sjezd Špindlerův Mlýn- Bedřichov Hudeček, J., Kalous, V.: Predikce sekundární struktury membránových bílkovin X. celošt. biochem. zjazd, Martin Putyera, K., Hudeček, J., Kalous, V.: Hydrofobicita aminokyselin a struktura bílkovin. X. celošt. biochem. zjazd, Martin Davidová, L., Hudeček, J.: Význam volby báze dat pro výsledné hodnoty preferenčních parametrů pro predikci sekundární struktury bílkovin metodou podle Choua a Fasmana. In: XIII. celost. biochem. dny, České Budějovice, Kubíčková, B., Šulc, M., Hodek, P., Hudeček, J.: Indukce cytochromu P-450 v hepatopankreatu raka rodu Orconectes fenobarbitalem. XIX. xenobiochemické symposium, Brno, Hudeček, J., Anzenbacher, P., Hildebrandt, P., Lange, R., Munro, A.W.: Stabilita a flexibilita cytochromů P450 - závěry ze spektrálních studií. XX. Xenobiochemické sympózium Smolenice, ) Udělené granty a) jako řešitel 1. GAUK 87/PřF/95/B-CH Složky biochemických detoxikačních systémů bezobratlých jako možné biomarkery kontaminace.

14 b) jako spoluřešitel: 1. GAČR 203/95/0604 Studium biotransformace karcinogenních N-nitrosaminů (řešitelka Stiborová, M.). 2. FRVŠ 1995/0492 Poznání enzymů rostlin metabolisujících cizorodé látky (řešitelka Stiborová, M.). 3. FRVŠ 1996/0275 Studium metabolismu cizorodých látek u rostlin jako modelového interdisciplinárního problému (řešitelka Stiborová, M.). 4. GAČR 203/96/0177 Studium aktivního místa cytochromů P450 spektroskopickými technikami (řešitel Anzenbacher, P.). 5. FRVŠ 1997/2121 Studium enzymů prvé fáze biotransformace xenobiotik u rostlin. (řešitelka Stiborová, M.). 6. MPO ČR 97/2450/312 FD-K/032 Nová léčiva pro terapii nádorových onemocnění (řešitel LACHEMA a.s., Brno). 7. GAČR 203/99/1003 Poznání mechanismu karcinogenního působení o-nitroanisolu a o- anisidinu jako karcinogenů s dosud nepoznanými principy účinku (řešitelka Stiborová, M.). 8. GAČR 203/99/0277 Cytochrom P-4503A - klíčový enzym metabolismu léčiv. Srovnání lidského enzymu a modelových systémů (řešitel Anzenbacher, P.). 9. GAČR 303/99/0893 Individuální rozdíly v metabolismu aristolochových kyselin a jejich význam pro vývoj onemocnění "Chinese herbs nephropathy" (řešitelka Stiborová, M.). 10. GAČR 203/02/1152 Struktura a funkce cytochromů P450 lidského a (mini)prasečího původu (řešitel Anzenbacher, P.). 11. GAČR 203/01/0996 Studium molekulárního mechanismu působení elipticinu jako protinádorového léčiva (řešitelka Stiborová, M.). 12. MŠMT ČR. MSM Studium vztahu mezi strukturou, dynamikou a funkcí molekulárních a supramolekulárních systémů z hlediska technických a biomedicinálních aplikací. Výzkumný záměr. (řešitel Procházka, K.). 13. GAČR 203/02/1152 Struktura a funkce cytochromů P-450 lidského a (mini)prasečího původu (řešitel Anzenbacher, P.). 14. GAČR 203/03/0283 Studium karcinogenního potenciálu o-nitroanisolu a o-anisidinu pro lidský organismus (řešitelka Stiborová, M.). 13) Disertační a habilitační práce 1. Hudeček, J.: Predikce struktury membránových bílkovin. Kandidátská disertační práce, Přírodovědecká fakulta UK, Praha 1986.

15 2. Hudeček, J.: Biofyzikální přístupy ke studiu hemových proteinů. Habilitační práce, Přírodovědecká fakulta UK, Praha ) Popularizační práce 1. Hudeček, J.: Barevný svět kolem nás (1), Biologie-Chemie-Zeměpis 3, (1994) 2. Hudeček, J.: Bílkoviny jako polyelektrolyty v experimentech. Biologie-Chemie-Zeměpis 5, (1996) 3. Hudeček, J.: K pravopisu v biochemických a biologických textech. Biologie-Chemie- Zeměpis 14, (2005) 4. Hudeček, J.: Poznatky z biochemie v učivu SŠ i ZŠ a šlehání vaječného bílku. Biologie- Chemie-Zeměpis 14, (2005) 15) Další práce a) editor monografie 1. Anzenbacher, P., Hudeček, J., (Eds.).Cytochromes P450, Biochemistry, Biophysics and Drug Metabolism, Monduzzi Editore, Bologna 2003 ISBN b) editor sborníku 2. Hudeček, J.: Chem. Listy 97. s th International Conference on Cytochromes P450, Program/Book of Abstracts (Guest issue editor) c) publikované recenze 1. Hudeček, J.: Biological Effects and Physics of Solar and Galactic Cosmic Radiation (NATO ASI Ser., Ser.A, Vol. 243A, 243B) (Swenberg C.E., Horneck G., Stassinopoulos, E.G., eds,) Bull. Čes. Spol. Biochem. Mol. Biol. 22, (1994) 2. Hudeček, J.: Annual Reviews of Biophysics and Biomolecular Structure. Bull. Čes. Spol. Biochem. Mol. Biol. 24, (1997) 3. Hudeček, J..: Channelling in Intermediary Metabolism (Agius, l., Sherat, H.S.A,, eds,). Bull. Čes. Spol. Biochem. Mol. Biol. 25, (1997) d) různé články 1. Hudeček, J.: 11. mezinárodní konference o cytochromu P450. Bull. Čes. Spol. Biochem. Mol. Biol.27, (1999) e) překlady z angličtiny 1. Velká obrazová encyklopedie rybaření. Nakl. Cesty, Praha (kapitoly Voda, Slovníček) 2. Encyklopedie vědy. Slovart Praha (kapitoly: Hmota, Reakce, Materiály (str ), Přehledy-část, str , Slovníček)

16 3. Člověk a vesmír. Ilustrovaná historie kosmických letů. Nakl. Cesty, Praha 1996 (kapitola Kosmické stanice na oběžné dráze) zajímavostí o světě kolem nás. Velká školní encyklopedie.ottovo nakladatelství Praha 1998, 191 str. 5. Malá encyklopedie rybaření Ottovo nakladatelství, Praha 1998 (kapitola Slovníček). 6. Svět divočiny. Boj o přežití v africké savaně (M. a Ch. Denis-Huotovi) Cesty, Praha str. 7. Encyklopedie do kapsy (J. Farndon) Ottovo nakladatelství Praha (kapitoly Vesmír, Země, Živá příroda, Lidské tělo, Věda a technika, Doprava (str ), Dějiny (str )