Martin Walach wal073 ELP 2008

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "Martin Walach wal073 ELP 2008"

Ilona Macháčková
před 8 lety
Počet zobrazení:

1 Martin Walach wal073 ELP 2008

2 Obsah Sazba chemie Dostupné balíčky pro chemii Balíček XyMTeX Historie a vývoj Instalace Práce s balíčkem a ukázky Závěr Zdroje

3 Sazba chemie Požadavky Potřeba sazby literatury s chemickou tématikou Zjednodušení tvorby obrázků Spolupráce s nějakým známým nástrojem Chemie vs. Latex Vznik balíčku, které umožňují jednoduchý textový vstup graficky vyjádřit Dostupné balíčky: XyMTeX, PPCHTeX

4 Dostupné balíčky pro chemii XyMTeX Systém pro kreslení chemických struktůr Velké množství funkcí a možností pro sazbu chemie PPTECH Chemický balíček bývající součástí ConTeXt První verze napsána roku 1995 Umožňuje sázet chemii podobně jako XyMTeX

5 XyMTeX autor: Shinsaku Fujita Původně v japonštině ale nyní již vše přeloženo do angličtiny Systém pro kreslení chemických struktur Poslední verze 4.03 (2006/09/05 bug-fixed) Jednotlivé příkazy se zapisují pomocí textových hesel s různými parametry

6 XymTeX Historie a vývoj Table 1.1: Versions of XΥMTEX 1.00 (1993) aliphat.sty, carom.sty, lowcycle.sty, hetarom.sty, hetaromh.sty, hcycle.sty, chemstr.sty, locant.sty, xymtex.sty 1.01 (1996) ccycle.sty, polymers.sty, chemist.sty 1.02 (1998) Nested substitution by yl -function (1998) Enhanced version based on the XΥM Notation. fusering.sty,methylen.sty 2.01 (2001) Size reduction, sizeredc.sty (version 1.00) 3.00 (2002) Size reduction (sizeredc.sty, version 1.01), and reconstruction of the command system (2002) PostScript printing (xymtx-ps.sty, version 1.00 and chmst-ps.sty, version 1.00) 4.01 (2004) PostScript printing and length-variable central atoms 4.02 (2004) PostScript printing and wedges bonds for stereochemistry 4.03 (2005) PostScript printing and wavy bonds for stereochemistry

7 XyMTeX - instalace V případě některých distribucí LateXu už může být tento balíček obsažen popř jej lze jednoduše doinstalovat Např: MiKTeX Pokud balíček XyMTeX není součástí, je možno si jej z webu autora stáhnout a přidat manuálně

8 XyMTeX práce s balíčkem Jednotlivé příkazy se zapisují pomocí předepsané formy a pravidel \Sforma[BONDLIST]{SUBSLIST} pro kreslení carbocycles \Sformc[BONDLIST]{ATOMLIST}{SUBSLIST} pro kreslení heterocycles SUBSLIST argument {1==Cl;3D==O;...} n or ns nd na nb nsa nsb nsa nsb exocyclic single bond at n-atom exocyclic double bond at n-atom alpha single bond at n-atom beta single bond at n-atom alpha (not specified) single bond at n-atom beta (not specified) single bond at n-atom alpha single bond at n-atom (dotted line) beta single bond at n-atom (boldface)

9 Subslist \documentclass{article} \usepackage{xymtex} \begin{document} \cyclohexanev{ 1==1; 2D==2D; 3A==3A; 4B==4B; 5Sa==5Sa; 5Sb==5Sb; 6SA==6SA; 6SB==6SB } \end{document} viz. ukázka 1

10 Argument OPT \bzdrv[opt]{subslist} (\bzdrv = derivace benzenu)

11 Ukázka argumentu OPT nastavením požadovaného parametru OPT se zvolí jedna z možností

12 Ukázka \bzdrv{1==cl;2==f} \bzdrv[c]{1==cl;4==f;2==ch$_{3}$}\qquad \bzdrv[pa]{1d==o;4d==o;6==h$_{3}$c} \bzdrh[oa]{1d==o;2d==n--so$_{2}$ch$_{3}$;4==och$_{3}$;5==h$_{3}$c} viz. Ukázka 2

13 Alifatické sloučeniny \tetrahedral[auxlist]{subslist} Subslist: viz. ukázka3

14 Další možnosti \square[auxlist]{subslist} \rtrigonal[auxlist]{subslist} \ltrigonal[auxlist]{subslist} Posun je o 90 Posun je o 90 a 120 : \utrigonal[auxlist]{subslist} \Utrigonal[AUXLIST]{SUBSLIST} \dtrigonal[auxlist]{subslist} \Dtrigonal[AUXLIST]{SUBSLIST} viz. Ukázka 4

15 Derivace Ethylenu \ethylene[bondlist]{atomlist}{subslist} BondList: viz. ukázka5

16 Další možnosti zobrazení \ethylenev[bondlist]{atomlist}{subslist} Posun o 90 Př: \ethylenev{1==c;2==c}{1==f;2==cl;3==h;4==br} \Ethylenev[BONDLIST]{ATOMLIST}{SUBSLIST} Posun o 120 Vertikalni obdoba \ethylene Př: \Ethylenev{1==C;2==C}{1==F;2==Cl;3==H;4==Br} viz. Ukázka 6

17 Kombinování více struktur do jednoho obrázku Obrázek: \begin{picture}(lx, Ly)(Sx, Sy),... \end{picture} ukázka: \begin{picture}(1200,600)(0,0) \put(0,0){\bzdrh{4==}} \put(546,0){\bzdrh{}} \end{picture} viz. Ukázka 7

18 Chemické rovnice \begin{equation} 2H_{2} + O_{2} \rightarrow 2H_{2}O \end{equation} \begin{equation} \mathrm{2kmn^{vii}o_{4} + 16HCl = 2Mn^{II}Cl_{2} + 5Cl_{2} + 2KCl + 8H_{2}O} \end{equation} Další příklady viz. Ukázka 8

19 Další možnosti Mnoho dalších příkazů pro další obrazce a jejich kombinace a spojovaní Ohraničení Popis pro obrazce a rovnice Tabulky k obrazcům Několik druhů rámečků s různými popisky A řada dalších usnadnění a pomůcek pro sazbu chemie

20 Závěr Balíček XyMTeX umožňuje řadu možností a obsahuje velké množství funkcí Velice usnadní a urychlí sazbu chemických struktur, rovnic a dalších doplňků Postupně v dalších verzích se vylepšovaly a přidávaly některé detaily Balíček XyMTEX je silný nástroj a jistě si najde své využití a řadu příznivců (chemiků )

21 Zdroje XyMTeX (anglicke stranky autora,stažení balíčku, manuály, verze, ) (podrobny popis v1.01, dalši obsahuji spíše změny a rozšíření) PPCHTeX a ConTeXt A řada dalších..

22 Děkuji za pozornost

Podobné dokumenty

Sazba šachových partií LaTeX. Jiří Čevela CEV007 ELP 2008

Sazba šachových partií LaTeX. Jiří Čevela CEV007 ELP 2008 Sazba šachových partií LaTeX Jiří Čevela CEV007 ELP 2008 Obsah presentace Historie a vývoj Instalace chessboard Požadavky na jiné balíky Balík chessboard Základní příkazy Ukázky dalších příkazů Závěr Historie