ANALYSIS OF CELL DEATH INDUCED BY NITRIC OXIDE AND HYDROGEN PEROXIDE IN PLANTS
|
|
- Gabriela Dušková
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 ANALYSIS OF CELL DEATH INDUCED BY NITRIC OXIDE AND HYDROGEN PEROXIDE IN PLANTS ANALÝZA BUNĚČNÉ SMRTI INDUKOVANÉ OXIDEM DUSNATÝM A PEROXIDEM VODÍKU U ROSTLIN Víteček J. 1), Babula P. 2), Petřek J. 1), Havel L. 1), Potěšil D. 3), Adam V. 3), Kizek R. 3) 1) Ústav botaniky a fyziologie rostlin, Agronomická fakulta, Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, Zemědělská 1, Brno, Česká republika 2) Ústav přírodních léčiv, FaF VFU Brno, Palackého 1/3, Brno 3) Ústav chemie a biochemie, Agronomická fakulta, Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, Zemědělská 1, Brno, Česká republika vitecek@mendelu.cz ABSTRACT In plants interplay between synthesis of nitric oxide (NO) and reactive oxygen species (ROS) is decisive for the induction of cell death in some cases. This effect was also demonstrated using donors of NO and ROS. The aim of our work was to verify the specific effect of sodium nitroprusside (SNP; NO donor) on the cell viability, morphology and biochemical characteristics, if cells are subjected to SNP and H 2 O 2 simultaneously. Cell suspensions of tobacco (BY-2) were treated by SNP, potassium ferricyanide (PFC, analogue of SNP which can not release NO) and glucose with glucose oxidase (GGO, H 2 O 2 donor), respectively, and moreover by combination of GGO with SNP or PFC. Entirely combination of SNP and GGO induced cell death. SNP possessed NO specific effect in this case, although the ferricyanide itself influenced the experimental system. Morphology of cells changed and cell nuclei exhibited features of programmed cell death. Controversially DNA was only slightly degraded. Keywords: potassium ferricyanide, sodium nitroprusside, nitric oxide, hydrogen peroxide, programmed cell death, tobacco BY-2 ABSTRAKT U rostlin je pro indukci buněčné smrti v některých případech klíčová souhra produkce oxidu dusnatého (NO) a reaktivních forem kyslíku (ROS). Tento fakt byl také prokázán pomocí donorů NO a ROS. Cílem naší práce bylo ověřit specifické působení nitroprussidu sodného (SNP, donor NO) na životaschopnost, morfologii a biochemické charakteristiky rostlinných buněk, jestliže jsou tyto buňky současně ovlivněny SNP a H 2 O 2. Buněčné suspenze tabáku
2 byly vystaveny působení SNP, ferrikyanidu draselného (PFC, analog SNP, který neuvolňuje NO) a glukosy s glukosaoxidasou (GGO, donor H 2 O 2 ) a dále kombinaci GGO s SNP nebo PFC. Pouze kombinace SNP a GGO vyvolávala buněčnou smrt. SNP působil specificky prostřednictvím NO, ačkoli ferrikyanid sám o sobě ovlivňoval experimentální sytém. Došlo ke změnám morfologie buněk a buněčná jádra jevila příznaky programované buněčné smrti, zatímco DNA byla jen slabě fragmentována. Klíčová slova: ferrikyanid draselný, nitroprussid sodný, oxid dusnatý, peroxid vodíku, programovaná buněčná smrt, tabák BY-2 Seznam zkratek AOS aktivní formy kyslíku FDA fluoresceindiacetát GGO glukosa s glukosaoxidasou IU mezinárodní jednotka MTT methylthiazolydifenyltetrazolium bromid NR neutrální červeň PFC ferrikyanid draselný PI propidium jodid SNP nitroprussid sodný ÚVOD Oxid dusnatý (NO) představuje velmi významnou signální molekulu v organizmu obratlovců. Podílí se na funkci nervového, kardiovaskulárního a imunitního systému 1. V poslední době se ukazuje, že hraje významnou roli i u rostlin. Rostliny mohou reagovat jednak na exogenní NO a dále jej jsou schopny syntetizovat. NO ovlivňuje mnoho fyziologických dějů včetně růstu a vývoje 2. Zásadní význam má jeho působení ve stresové fyziologii. Během biotického stresu NO reguluje odezvu hostitelské rostliny na přítomnost patogenního organizmu 3. Bylo prokázáno, že NO může při současném působení s aktivními formami kyslíku (AOS) vyvolat buněčnou smrt, jestliže jsou poměry stacionárních koncentrací NO a AOS v určitém rozmezí 3. Tento efekt byl potvrzen i pomocí donorového systému NO a H 2 O 4,5 2. Při těchto experimentech byl jako donor NO používán nitroprussid sodný (SNP). Jedná se o ferrikyanidový komplex a tudíž může kromě NO uvolňovat i kyanid 6.
3 Cílem naší práce bylo ověřit, zda SNP indukuje buněčnou smrt u rostlinných buněk specificky prostřednictvím NO. Dále charakterizovat průběh buněčné smrti indukované působení SNP a glukosy s glukosaoxidasou (donorový systém H 2 O 2 ). METODIKA Chemikálie Pokud není uvedeno jinak, všechny použité chemikálie byly v čistotě p. a. Kultivační media byla připravena z chemikálií dodaných firmou Duchefa Biochemie BV (Haarlem, Nizozemí). Media a roztoky byly připraveny rozpuštěním příslušných látek v deionizované vodě (18,2 MΩ, Demiwa, Watek, ČR). Přístroje Veškeré centrifugační procedury byly provedeny na centrifuze MR 22 (Jouan, USA). Pro měření fluorescence byl použit spektrifluorimetr RF 551 (Shimadzu, Japonsko). Absorbance byla měřena na spektrofotometru Anthelie (Secomam, Francie). Prparáty byly pozorovány na mikroskopu AX 70 (Olympus, Japonsko) Buněčná suspenze BY-2 Suspenzní kultura tabáku linie BY-2 byla udržována v kapalném Murashige-Skoog mediu obohaceném sacharosou (30 g.l -1 ), KH 2 PO 4 (0,2 g.l -1 ), thiaminem (1 mg.l -1 ) a kyselinou 2,4-dichlorfenoxyoctovou (0,2 mg.l -1 ) 7. Suspenze (20 ml) v 50 ml Erlenmeyerových baňkách byla umístěna na třepačce (Kühner Shaker, typ LT-W) za těchto kultivačních podmínek: tma, teplota 27±1 C, 135 ot.min -1. Subkultivace byla prováděna po 3 nebo 4 dnech přenesením 2 resp. 1 ml suspenze do čerstvého media. Pro experimenty byla použita 3 dny stará kultura založená z 1 ml inokula. Indukce buněčné smrti Do alikvotů buněčné suspenze tabáku o objemu 20 ml byl přidán donor NO SNP do výsledné koncentrace 0,5 mm a nebo donor H 2 O 2 glukosa s glukosaoxidasou (GGO) do výsledné koncentrace 0,5 mm a 0,5 IU.ml Paralelně byl namísto SNP použit ferrikyanid draselný (PFC) o stejné koncentraci, který má analogickou strukturu jako SNP, ale neuvolňuje NO. Roztoky SNP a glukosaoxidasy byly připraveny bezprostředně před
4 použitím. Všechny zde uvedené roztoky byly před pipetováním do buněčné suspenze membránově sterilizovány (Puradisc 25 AS, 0,2 µm, Whatman, USA). Test viability Pro stanovení viability bylo použito modifikované dvojité barvení fluoresceindiacetátem (FDA) a propidiumjodidem (PI) 9. Vzorek kultury byl doplněn kapalným mediem na objem 50 µl a byl inkubován 5 min při pokojové teplotě s FDA (1 µg.ml -1 ) a PI (20 µg.ml -1 ) 10. Zastoupení živých (zeleně zbarvených) a mrtvých (červeně zbarvených) buněk bylo vyhodnoceno pomocí fluorescenčního mikroskopu vybaveného pro širokopásmovou UV excitaci (kostka U-MWU). Stanovení aktivity intracelulárních esteras Intracelulární esterasy byly stanoveny fluoresceindiacetátovým testem 11. Ve stručnosti: Vzorek suspenze byl 3x promyt 50 mm fofátovým pufrem (ph 8,7). Buněčná biomasa byla 10 min homogenizována s extrakčním pufrem (250 mm fosftát, ph 8,7, 1 mm dithiotreitol) na ledové lázni. Zbytky buněk byly odstraněny centrifugací (10000 g, 4 C, 15 min.). Buněčný extrakt byl doplněn na 1 ml 1 M fosfátem (ph 8,7). Reakce byla zahájena přídavkem FDA do výsledné koncentrace 5 µm. Po 15 min. inkubace při 45 C byla reakční směs zředěna do kyvety. Koncentrace vzniklého fluoresceinu byla detekována fluorimetricky při λ excitace 490 nm a λ emise 514 nm. Aktivita esteras v IU (mezinárodní jednotka, 1 IU uvolní 1 µmol fluoresceinu za minutu při výše definovaných podmínkách) byla přepočítána na relativní hodnoty. 100% představuje nejvyšší aktivitu v daném experimentu. MTT test Do vzorku buněčné suspenze (0,5 ml) byl ihned po jeho odebrání přidán MTT do výsledné koncentrace 0,5 mg.ml -1. Směs byla inkubována 1 h. na třepačce (120 ot.min -1 ) při teplotě 25 C. Po centrifugaci (360 g, 25 C, 5 min) byl odstraněn veškerý supernatant. Formazan vzniklý redukcí MTT byl z peletu extrahován 1,5 ml isopropanolu po dobu 0,5 h za neustálého promíchávání směsi (třepačka, 120 ot.min -1 ). Po skončení extrakce byl centrifugací (10000 g, 25 C, 10 min.) získán čirý roztok formazanu. Jeho absorbance byla změřena při 570 nm 12. Výsledky MTT testu byly přepočítány na relativní hodnoty. 100% představuje nejvyšší naměřenou absorbanci v daném experimentu.
5 Izolace DNA a detekce její fragmentace DNA byla izolována modifikovanou CTAB metodou 13. Ve stručnosti: K biomase buněk ( mg) rozdrcené v kapalném dusíku byl přidán extrakční pufr (2 % cetyltrimethylamonium bromid - CTAB, 2 % polyvinylpyrrolidon, 100 mm Tris-HCl, 25 mm EDTA, 2 M NaCl, ph 8,0). Po roztátí byla směs převedena do mikrozkumavky a inkubována 40 min. při 65 C. Následně byla 3x provedena extrakce směsí chloroform:fenol (9:1). DNA byla vysrážena přídavkem propan-2-olu v poměru 1:1. Pelet DNA získaný centrifugací (500 g, 25 C, 5 min) byl promyt 70 % ethanolem a rozpuštěn v TE pufru (1 mm EDTA, 10 mm Tris, ph 8,0). Roztok byl inkubován 10 min s RNasou (výsledná koncentrace 40 µg.ml -1 ) při 65 C. Po skončení inkubace byl zopakován postup od extrakce směsí chloroform-fenol po rozpuštění DNA v TE pufru. Na 1 % agarosový gel obsahující 0,1 µg.ml -1 etidiumbromidu byl nanášen vždy 1 µg DNA v 5x ředěném dávkovacím pufru (50 % glycerol, 0,04 % bromfenolová modř). Elektroforéza probíhala 1 h při stejnosměrném napětí 70 V. DNA byla vizualizována pomocí systému GDS (UVP, USA) řízeného programem Grab-IT 1.3 (UVP, USA). Pro kalibraci byl použit délkový marker 2-Log DNA Ladder (New England BioLabs, USA). Detekce acidických kompartment Do vzorku buněčné suspenze byla ihned po jeho odebrání přidána NR do výsledné koncentrace 0,033 %. Po 5 min. inkubaci při pokojové teplotě byly buňky pozorovány pomocí fluorescenčního mikroskopu za použití širokopásmové excitace v modrém světle (kostka U-MWB). Pozorování morfologie buněčných jader Vzorek buněčné suspenze byl smíchán v poměru 1:1 s PEM pufrem (100 mm PIPES, 10 mm EGTA, 10 mm MgCl2, ph 6,9) obsahujícím 4 % formaldehydu 14. Po 30 min. byly fixované buňky 3 krát promyty PEM pufrem a resuspendovány v PEM pufru s 0,1 % Tritonu X100 a 1 µg.ml -1 Hoechst Buněčná jádra byla pozorována pomocí fluorescenčního mikroskopu při použití širokopásmové UV excitace (kostka U-MWU).
6 Pozorování morfologie buněk Vzorek suspenze byl 5 minut inkubován s FDA (1 µg.ml -1 ) a pozorován pomocí fluorescenčního mikroskopu při použití: širokopásmové UV excitace (kostka U-MWU), fázového kontrastu, a světlého pole. VÝSLEDKY A DISKUZE Při kontaktu rostlin s nevirulentními patogeny (respektive jejich elicitory) se ukázalo, že rostliny v odezvě na tuto událost syntetizují NO 4,15,16. Dále bylo poukázáno na fakt, že souhra syntézy NO a AOS může indukovat buněčnou smrt 3. Tento jev byl potvrzen i pomocí donoru NO a AOS 3,5, nicméně použitý donor NO - SNP může kromě NO uvolňovat i kyanid 6 a blokovat tak energetický metabolizmus buněk 17. Indukce buněčné smrti kombinací SNP a GGO V našich experimentech jsme buněčnou smrt indukovali SNP a GGO (donor H 2 O 2 ) viz. metodika. Paralelně byl použit i PFC, který je stejně jako SNP ferrikyanidová sloučenina, ale neuvolňuje NO. Samostatné působení SNP, PFC a GGO stejně jako spolupůsobení PFC a GGO v rámci 12 hodinového experimentu nevyvolalo buněčnou smrt. Naproti tomu současné působení SNP a GOG indukovalo vymírání buněk (Obr. 1A). Prostřednictvím MTT testu byla sledována aktivita buněčných oxidoreduktas. Veškeré aktivní složky (SNP, PFC a GGO) způsobily rychlý pokles aktivity těchto enzymů (Obr 1B). Tento jev je pravděpodobně podmíněn poškozením respiračního řetězce, který je zdrojem elektronů k redukci MTT na barevný formazan 12, působením kyanidu a H 2 O 2. Pouze kombinace SNP a GGO vyvolala úplné vymizení aktivity oxidoreduktas (Obr. 1B), což je v souladu s pozorovaným vymíráním buněk (Obr. 1A). SNP tedy indukuje při spolupůsobení s H 2 O 2 buněčnou smrt specificky prostřednictvím NO. Ferrikyanidová složka SNP ale významným způsobem poškozuje energetický metabolizmus buněk.
7 A Viabilita (%) B Aktivita oxidoreduktas (%) Doba expozice (h) Doba expozice (h) Obr. 1: Časový průběh viability (A) a relativní aktivity oxidoreduktas (B) buněk ovlivněných GGO ( ), PFC ( ), SNP ( ), PFC a GGO ( ), SNP a GGO ( ). Jako kontrolní varianta sloužila neovlivněná suspenze ( ). Dále jsme se zabývali charakterizací buněčné smrti indukované SNP (0,5 mm) a GGO (0,5 mm glukosa s 0,5 IU.ml -1 glukosaoxidasou). Esterázová aktivita jako marker V naší předchozí práci jsme zjistili, že intracelulární esterasy mohou sloužit jako marker počtu živých buněk a jejich metabolické aktivity 11,18,19. Proto jsme kromě viability sledovali aktivitu intracelulárních esteras (Obr. 2A). Ta s dobou působení SNP a GGO klesala, avšak jiným způsobem než viabilita. Rozdíl mezi časovým vývojem viability a aktivity intracelulárních esteras může být podmíněn charakterem obou metodik. Mikroskopické vyhodnocení životaschopnosti na úrovni jedné buňky představuje kvalitativní charakteristiku buňka je živá nebo mrtvá. Zatímco stanovení esteras v buněčném extraktu dokáže podchytit spojitou změnu enzymové aktivity a tak odhalit narušený metabolismus i když se buňky stále jeví jako živé.
8 A Aktivita esteras / viabilita (%) B Čas (h) kb 3.0 kb 1.0 kb 0.5 kb Doba expozice (h) 0.1 kb Obr. 2: Časový průběh viability ( ) a aktivity intracelulárních esteras ( ). 100 % aktivity esteras představuje IU (A) Analýza fragmentace DNA pomocí gelové elektroforesy (B) Vliv NO na DNA Buněčná smrt v rámci biotického stresu, též nazývaná hypersenzitivní buněčná smrt, bývá obvykle označována jako programovaná. 0,5 mm SNP a 0,5 mm glukosa s 0,5 IU.ml -1 glukosaoxidasa v buněčné suspenzi navozují podmínky podobné jako při hypersenzitivní reakci 4,20. Během programované buněčné smrti (PCD) obvykle dochází k degradaci DNA na oligonukleosomální fragmenty, deformaci buněčných jader a kondenzaci chromatinu 21. Degradace DNA se sleduje pomocí gelové elektroforézy, kde se přítomnost oligonukleosomálních fragmentů (180 párů bazí) projeví typickým žebříkovitým vzorem 21. Ve 2 h intervalech byly odebírány vzorky buněk ze suspenze ovlivněné SNP a GGO pro vyhodnocení fragmentace DNA a morfologie jader. Docházelo k velmi slabému a nespecifickému štěpení DNA (Obr. 1C). Ovlivnění morfologie buněčných jader po působení NO Morfologie buněčných jader byla sledována Pomocí fluorescenční sondy (Hoechst 22385). V kontrolní variantě měla jádra pravidelný kulovitý tvar. Chromatin byl homogenní a uvnitř bylo dobře viditelné jadérko (Obr. 3A). Působením SNP a GOG došlo k celkové deformaci jádra a intenzivní kondenzaci chromatinu. Po 8 hodinách od zahájení experimentu obsahovala prakticky všechna jádra kondenzovaný chromatin. Přítomnost jader vykazujících znaky PCD je v rozporu s velmi slabou a nespecifickou fragmentací DNA.
9 Hypersenzitivní buněčná smrt představuje velmi komplexní jev do kterého je zapojena řada signálních procesů. NO spolu s H 2 O 2 sice vyvolává vymírání buněk, ale tato kombinace nemusí nutně spustit všechny události které jsou typické pro PCD. Oxid dusnatý indukuje vznik kyselých kompartmentů V buňkách ovlivněných SNP a GGO jsme se pokusili zjistit, zda je buněčná smrt provázena vznikem acidických kompartmentů. Pro tento účel jsme použili barvení neutrální červení (NR). NR představuje slabě bazickou látku. V živých buňkách se proto hromadí v kompartmentech o nízkém vnitřním ph, kde ji lze vizualizovat pomocí fluorescenčního mikroskopu 22. Po 4 6 h od zahájení experimentu bylo možné pozorovat vznik acidických kompartmentů v buňkách ovlivněných SNP a GGO (Obr 3B). Tyto kompartmenty mohou souviset s degradací obsahu buňky během buněčné smrti. Vliv NO na morfologii BY-2 buněk Pomocí fluorescenční mikroskopie a mikroskopie ve fázovém kontrastu a světlém poli jsme sledovali změny morfologie buněk. Neovlivněné buňky v exponenciální fázi růstu měly typický obdélníkový tvar a obsahovaly několik menších vakuol. V suspenzi ovlivněné SNP a GGO, ale i SNP, GGO, PFC a PFC společně s GGO se po 4 h objevovaly deformované buňky (do 5 %) se silně zvýšeným množstvím vakuol (Obr 3C). K tomuto dochází při působení různých stresových faktorů na buňky BY-2 (Víteček nepublikované výsledky). Pouze v suspenzi, která byla vystavena působení SNP a GGO většina buněk obsahovala snížené množství vakuol a nebo jen jednu vakuolu. Kromě toho se v buňkách vyskytovaly drobné váčky: negativně obarvené FDA v perinukleání oblasti cytoplazmy a pozitivně obarvené FDA pozorovatelné i ve fázovém kontrastu a světlém poli (Obr 3C). Identita těchto útvarů je nejasná, avšak může se jednat o struktury odvozené z endoplazmatického retikula, které jsou indukovatelné stresem 23.
10 A kontrola SNP/ GGO B kontrola SNP/ GGO 10 µm 10 µm C Kontrola Nespecifické změny Specifické změny barvení FDA C V J 10 µm Fázový kontrast C V J Světlé pole Obr. 3: Mikroskopické pozorování změn morfologie buněčných jader barvení Hoechst 22385(A), vzniku acidických kompartment barvení neutrání červení (B) a morfologie buněk; C cytoplazma, J jádro, V vakuola, žlutá šipka označuje negativnně obarvené váčky, bílá pozitivně obarvené (C) v buňkách ovlivněných SNP a GGO. Jendotlivé snímky ukazují typické příklady. ZÁVĚR SNP při spolupůsobení s GGO indukuje buněčnou smrt specificky prostřednictvím NO, ale ferrikyanidová složka SNP ovlivňuje experimentální systém. Buněčná smrt je provázena kondenzací chromatinu jádra ale nedochází degradaci DNA na oligonukleosomální fragmenty typické pro PCD. Uvnitř buněk se objevují acidické kompartmenty, které mohou souviset s destrukcí buněčného obsahu. Změna morfologie buněk zahrnuje jak nespecifickou odezvu na stres tak i specifický projev SNP a GGO, kdy se snižuje počet vakuol a v cytoplazmě se objevují drobné váčky. Poděkování Příspěvek vznikl za podpory FRVŠ 180/2004, IGA MZLU 3/2004, IGA FaF VFU IG342012, GAČR č. 525/04/P132 a Národního výzkumného centra LN00A081
11 SEZNAM POUŽITÉ LITERATURY Mayer, B. & Hemmens, B. Biosynthesis and action of nitric oxide in mammalian cells. Trends Biochem. Sci. 22, (1997). Leshem, Y. Y. Nitric Oxide in Plants Occurence, Function and Use (Kluwer Academic Publisehrs, Dortrecht, 2000). Delledonne, M. et al. Reactive oxygen intermediates modulate nitric oxide signaling in the plant hypersensitive disease-resistance response. Plant Physiol. Biochem. 40, (2002). Delledonne, M., Xia, Y., Dixon, R. A. & Lamb, C. Nitric oxide functions as a signal in plant disease resistance. Nature 394, (1998). de Pinto, M. C., Tommasi, F. & De Gara, L. Changes in antioxidan systems as part of the signaling pathway responsible for the programmed cell death activated by nitric oxide and reactive oxygen species in tabacco Bright-Yellow 2 cells. Plant Physiol. 130, (2002). Wang, P. G. et al. Nitric oxidede donors: chemical ctivities and biological applications. Chem. Rev. 102, (2002). Nagata, T., Nemoto, Y. & Hasezawa, S. Tobacco BY-2 cell line as the "HeLa" cell line in the cell biology of higher plants. Int Rev Cytol 132, 1-30 (1992). Pinto, M. C., Tommasi, F. & Gara, L. Changes in antioxidan systems as part of the signaling pathway responsible for the programmed cell death activated by nitric oxide and reactive oxygen species in tabacco Bright-Yellow 2 cells. Plant Physiol. 130, (2002). Jones, K. H. & Senft, J. A. An improved method to determine cell viability by simultaneous staining with fluorescein diacetate propidium iodide. J. Histochem. Cytochem. 33, (1985). Mlejnek, P. & Prochazka, S. Activation of caspase-like proteases and induction of apoptosis by isopentenyladenosine in tobacco BY-2 cells. Planta 215, (2002). Víteček, J. et al. Single cell fluorimetric assay: attomole level detection of esterases. V přípravě. (2004). Murray, M. G. & Thompson, W. F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Res. 8, (1980).
12 Callard, D., Aselos, M. & Mazzolini, L. Novel Molecular Markers for Late Phases of the Growth Cycle of Arabidopsis thaliana Cell-Suspension Cultures Are Expressed during Organ Senescence. Plant Physiol. 112, 705 (1996). Durner, J., Wendehenne, D. & Klessig, D. F. Defense gene induction in tobacco by nitric oxide, cyclic GMP, and cyclic ADP-ribose. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, (1998). Foissner, I., Wendehenne, D., Langebartels, C. & Durner, J. In vivo imaging of an elicitorinduced nitric oxide burst i tobacco. Plant J. 23, (2000). Stryer, L. Biochemitry (W. H. Freeman and Company, New York, 1998). Víteček, J. et al. Esterases as a marker for growth of BY-2 tobacco cells and early somatic embryos of the Norway spruce. Plant Cell Tissue Organ Cult. In press (2004). Víteček, J., Kizek, R., Petřek, J., Vacek, J. & Havel, L. in VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (eds. Wimmerová, M., Beneš, P., Trnková, L. & Zbořil, P.) (Masarykova univerzita v Brně, Brno, 2004). Víteček, J., Kizek, R. & Havel, L. in Cell biology of nitric oxide and cell death in plants (ed. Blume, Y. B.) 49 (Institute of Cell Biology and Genetic Engineering (Kyiv), Natl Academy of Sciences, Institute of Semiconductor Physics (Kyiv), Natl Academy of Sciences, Natl Sci. Center Of Medical and Biotechnical Problems (Kyiv), Natl Academy of Sciences, Yalta, Ukraine, 2004). Havel, L. & Durzan, D. J. Apoptosis in plants. Bot. Acta 109, (1996). (2004). Matsushima, R. et al. An endoplasmic reticulum-derived structure that is induced under stress conditions in Arabidopsis. Plant. Physiol. 130, (2002).
UTILISATION OF INTRACELLULAR ESTERASES FOR STUDY OF EXPLANT CULTURES VYUŽITÍ INTRACELULÁRNÍCH ESTERAS PRO STUDIUM EXPLANTÁTOVÝCH KULTUR
UTILISATION OF INTRACELLULAR ESTERASES FOR STUDY OF EXPLANT CULTURES VYUŽITÍ INTRACELULÁRNÍCH ESTERAS PRO STUDIUM EXPLANTÁTOVÝCH KULTUR Víteček J. 1, Kizek R. 2, Petřek J. 1, Vacek J. 2, Havel L. 1 1 Ústav
EFFECT OF CADMIUM ON TOBACCO CELL SUSPENSION BY-2
EFFECT OF CADMIUM ON TOBACCO CELL SUSPENSION BY-2 Štěpán Z., Klemš M., Zítka O., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 613 00 Brno, Czech Republic
APLIKACE SPEKTROFLUORI- METRICKÉHO STANOVENÍ ESTERAS V ROSTLINNÉM MATERIÁLU
Chem. Listy 99, 496 51 (25) APLIKACE SPEKTRFLURI- METRICKÉH STANVENÍ ESTERAS V RSTLINNÉM MATERIÁLU JAN VÍTEČEK a, VJTĚCH ADAM b, JIŘÍ PETŘEK a, PETR BABULA c, PAVLA NVTNÁ d, RENÉ KIZEK b a LADISLAV HAVEL
EFFECT OF PLANT DEFENSE ELICITORS ON THE LEVEL OF PHYTOHORMONES VLIV ELICITORŮ OBRANNÉ REAKCE NA HLADINU FYTOHORMONŮ
EFFECT OF PLANT DEFENSE ELICITORS ON THE LEVEL OF PHYTOHORMONES VLIV ELICITORŮ OBRANNÉ REAKCE NA HLADINU FYTOHORMONŮ Marečková M., Havel L. Ústav botaniky, Agronomická fakulta, Mendelova zemědělská a lesnická
1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru
Protokol č.: F1-4 Datum: 20.12.2010 Metodika: analýza efektivity přípravy výběr z výsledků ze zkušebních provozů výroby antigenů. Vypracoval: Ing. Václav Filištein, Mgr. Tereza Chrudimská, Spolupracující
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie IZOLACE GENOMOVÉ DNA Deoxyribonukleová kyselina (DNA) představuje základní genetický materiál většiny
RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013)
RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013) Upozornění: RNA Blue obsahuje fenol a další toxické komponenty. Při kontaktu s kůží je nutné omytí velkým
MagPurix Blood DNA Extraction Kit 200
MagPurix Blood DNA Extraction Kit 200 Kat. č. ZP02001-48 Doba zpracování: 50-60 minut pro MagPurix 12S 50-70 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Blood DNA Extraction Kit 200 je určena pro izolátor
LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK
LRR/BUBCV CVIČEÍ Z BUĚČÉ BILGIE 3. TESTY ŽIVTASCHPSTI A PČÍTÁÍ BUĚK TERETICKÝ ÚVD: Při práci s buňkami je jedním ze základních sledovaných parametrů stanovení jejich životaschopnosti (viability). Tímto
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
Seminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
Column DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202)
Column DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202) Popis Column DNA Lego Kit je základ moderní stavebnicové (Lego) soupravy pro izolaci čisté DNA různého
Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk
LRR/BUBV vičení z buněčné biologie Úloha č. 3 Téma: Testy životaschopnosti a Počítání Úvod: Při práci s buňkami je jedním ze základních sledovaných parametrů stanovení jejich životaschopnosti (viability).
2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.
CVIČENÍ Z ENZYMOLOGIE 1) Stanovení Michaelisovy konstanty trypsinu pomocí chromogenního substrátu. Aktivita trypsinu se určí změřením rychlosti hydrolýzy chromogenního substrátu BAPNA (Nα-benzoyl-L-arginin-p-nitroanilid)
MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková
MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk 15.11./16.11.2016 Jana Horáková Doporučená literatura M. Vejražka: Buněčné kultury http://bioprojekty.lf1.cuni.cz/3381/sylabyprednasek/textova-verze-prednasek/bunecnekultury-vejrazka.pdf
Inkubace enzymů se substráty
Inkubace enzymů se substráty Inkubace redukčních enzymů... 1 Inkubace oxidačních enzymů... 2 Extrakce látek z inkubační směsi... 2 Příprava vzorků k HPLC/UHPLC detekci... 3 Chemikálie a roztoky... 4 Substráty...
PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE - PERSPEKTIVNÍ ALTERNATIVA V ANALÝZE MIKROBIOLOGICKÝCH UKAZATELŮ KVALITY VOD
PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE - PERSPEKTIVNÍ ALTERNATIVA V ANALÝZE MIKROBIOLOGICKÝCH UKAZATELŮ KVALITY VOD 1* P. Mikula, 1 B. Maršálek 1 Botanický ústav Akademie věd ČR, Oddělení experimentální fykologie a ekotoxikologie,
2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.
CVIČENÍ Z ENZYMOLOGIE 1) Stanovení Michaelisovy konstanty trypsinu pomocí chromogenního substrátu. Aktivita trypsinu se určí změřením rychlosti hydrolýzy chromogenního substrátu BAPNA (Nα-benzoyl-L-arginin-p-nitroanilid)
Izolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI
GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI INDUKOVANÉ PŮSOBENÍM ORGANICKÝCH LÁTEK Z PRACHOVÝCH ČÁSTIC V OVZDUŠÍ Kateřina Hanzalová Oddělení genetické ekotoxikologie Ústav experimentální medicíny AV ČR v.v.i.
ISOLATION OF PHOSPHOPROTEOM AND ITS APPLICATION IN STUDY OF THE EFFECT OF CYTOKININ ON PLANTS
ISOLATION OF PHOSPHOPROTEOM AND ITS APPLICATION IN STUDY OF THE EFFECT OF CYTOKININ ON PLANTS IZOLACE FOSFOPROTEOMU A JEHO VYUŽITÍ PŘI STUDIU ÚČINKU CYTOKININŮ NA ROSTLINU Černý M., Brzobohatý B. Department
Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách
Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách Teorie Stanovení celkových proteinů Celkové množství proteinů lze stanovit pomocí několika metod; například: Hartree-Lowryho
F l u o r e s c e n c e
F l u o r e s c e n c e Fluorescenční mikroskopie Luminiscence jev, kdy látka vysílá do prostoru světlo chemická reakce chemiluminiscence světlo fotoluminiscence Vyvolávající záření exitační fluorescence
Úloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce)
Úloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce) Úkol: Sepište krátký rukopis vědeckého původního článku na téma "Směrovaný transport auxinu přes plazmatickou membránu hraje úlohu
In vitro testování scaffoldů pro tkáňové inženýrství. Mgr. Jana Horáková
In vitro testování scaffoldů pro tkáňové inženýrství Mgr. Jana Horáková 9.12.2015 Proces tkáňového inženýrství 1. Návrh nosiče Seznámení se s problematikou dané tkáně/orgánu Návrh nosiče pro danou aplikaci
ORGANIZATION OF EMBRYOS IN CLUSTERS OF EARLY SOMATIC EMBRYOS OF NORWAY SPRUCE (PICEA ABIES /L./ KARST.)
ORGANIZATION OF EMBRYOS IN CLUSTERS OF EARLY SOMATIC EMBRYOS OF NORWAY SPRUCE (PICEA ABIES /L./ KARST.) ORGANIZACE EMBRYÍ VE SHLUCÍCH RANÝCH SOMATICKÝCH EMBRYÍ SMRKU ZTEPILÉHO (PICEA ABIES /L./ KARST.)
Fluorescenční mikroskopie
Luminiscence jev, kdy látka vysílá do prostoru světlo chemická reakce chemiluminiscence (např. světluška) světlo fotoluminiscence fluorescence (emisní záření jen krátkou dobu po skončení exitačního záření)
Nanotransportéry pro teranostické aplikace
Název: Nanotransportéry pro teranostické aplikace Školitel: Simona Dostálová, Markéta Vaculovičová Datum: 21. 3. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce v oblasti
BOVINE BLOOD NEUTROPHILS: INFLUENCE OF ISOLATION TECHNIQUES TO SURVIVAL KREVNÍ NEUTROFILY SKOTU: VLIV IZOLAČNÍCH TECHNIK NA ŽIVOTNOST
BOVINE BLOOD NEUTROPHILS: INFLUENCE OF ISOLATION TECHNIQUES TO SURVIVAL KREVNÍ NEUTROFILY SKOTU: VLIV IZOLAČNÍCH TECHNIK NA ŽIVOTNOST Sláma P. Ústav morfologie, fyziologie a veterinářství, Agronomická
IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)
17.1 Izolace DNA (kit DNeasy Plant Mini) Strana 1 IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini) 1 Účel a rozsah Postup slouží k získání deoxyribonukleové kyseliny (DNA) ze vzorku pomocí komerčního kitu DNeasy Plant
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení dekochinátu metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie
Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie Nastavení průtokového cytometru a jeho
STANOVENÍ CYTOTOXICITY LÉČIV IN VITRO (XTT ASSAY)
STANOVENÍ CYTOTOXICITY LÉČIV IN VITRO (XTT ASSAY) LENKA BRŮČKOVÁ Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra biologických a biochemických věd Centralizovaný rozvojový projekt MŠMT č. C29:
1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I
1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I Vazba bromfenolové modři na sérový albumin Princip úlohy Albumin má unikátní vlastnost vázat menší molekuly mnoha typů. Díky struktuře, tvořené
Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce
Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce 1. Máte pufr připravený smísením 150 ml CH3COOH o c = 0,2 mol/l a 100 ml CH3COONa o c = 0,25 mol/l. Jaké bude ph pufru, pokud přidáme 10 ml
Western blotting. 10% APS 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl
Western blotting 1. Příprava gelu složení aparatury hustotu gelu volit podle velikosti proteinů příprava rozdělovacího gelu: 10% 12% počet gelů 1 2 4 1 2 4 objem 6 ml 12 ml 24 ml 6 ml 12 ml 24 ml 40% akrylamid
Stanovení antioxidační aktivity a redukční síly na ječmeni jarním (Hordeum vulgare, L. cv. Bonus)
Stanovení antioxidační aktivity a redukční síly na ječmeni jarním (Hordeum vulgare, L. cv. Bonus) Autor: Bc. Ursula Ferretti Spoluautor: Mgr. Jakub Nezval Ostravská Univerzita v Ostravě Přírodovědecká
Ž i v o t n o s t (= životaschopnost = vitalita = viabilita)
Ž i v o t n o s t (= životaschopnost = vitalita = viabilita) počet živých buněk. 100 = ---------------------------------------- [%] počet všech buněk V y u ž i t í : při kultivaci buněk pro různé účely
CONTRIBUTION TO UNDERSTANDING OF CORRELATIVE ROLE OF COTYLEDON IN PEA (Pisum sativum L.)
CONTRIBUTION TO UNDERSTANDING OF CORRELATIVE ROLE OF COTYLEDON IN PEA (Pisum sativum L.) PŘÍSPĚVEK K POZNÁNÍ KORLAČNÍ FUNKCE DĚLOHY U HRACHU (Pisum sativum L.) Mikušová Z., Hradilík J. Ústav Biologie rostlin,
Polymorfismus délky restrikčních fragmentů (RFLP)
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Polymorfismus délky restrikčních fragmentů (RFLP) Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka 2017/18 Obsah POLYMORFISMUS
CS Úřední věstník Evropské unie L 54/89
26.2.2009 CS Úřední věstník Evropské unie L 54/89 c) při vlnové délce mezi 230 a 320 nm se nesmí spektrum vzestupné části, vrcholu a sestupné části píku zkoušeného vzorku lišit od ostatních částí spektra
Tomáš Roušar, Pavla Žáková, Roman Kanďár, Vladimíra Mužáková, Jana Křenková
STUDIE VITAMINY Tomáš Roušar, Pavla Žáková, Roman Kanďár, Vladimíra Mužáková, Jana Křenková Katedra biologických a biochemických věd, Fakulta chemicko-technologická, Univerzita Pardubice, Štrossova 239,
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,
Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche
Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche Charakteristika testu: Set AMPLICOR HPV vyráběný firmou Roche je určený pro detekci vysoko-rizikových typů lidských
FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP
FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP na gymnáziu Pierra de Coubertina v Táboře Pavla Trčková, kabinet Biologie, GPdC Tábor Co je fluorescence Fluorescence je jev spočívající v tom, že některé látky (fluorofory) po
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální
EFFECT OF DIFFERENT HOUSING SYSTEMS ON INTERNAL ENVIRONMENT PARAMETERS IN LAYING HENS
EFFECT OF DIFFERENT HOUSING SYSTEMS ON INTERNAL ENVIRONMENT PARAMETERS IN LAYING HENS VLIV RŮZNÝCH TECHNOLOGICKÝCH SYSTÉMŮ CHOVU NA VYBRANÉ UKAZATELE VNITŘNÍHO PROSTŘEDÍ NOSNIC Pavlík A. Ústav morfologie,
Magnetické částice pro detekci nádorových onemocnění, založené na protilátkách Vojtěch Adam
Název: Školitel: Magnetické částice pro detekci nádorových onemocnění, založené na protilátkách Vojtěch Adam Datum: 7..203 Reg.č.projektu: CZ..07/2.4.00/3.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního
ZÁKLADNÍ CHEMICKÉ POJMY A ZÁKONY
ZÁKLADNÍ CHEMICKÉ POJMY A ZÁKONY Klíčová slova: relativní atomová hmotnost (A r ), relativní molekulová hmotnost (M r ), Avogadrova konstanta (N A ), látkové množství (n, mol), molární hmotnost (M, g/mol),
Vliv selenu, zinku a kadmia na růstový vývoj česneku kuchyňského (Allium sativum L.)
Vliv selenu, zinku a kadmia na růstový vývoj česneku kuchyňského (Allium sativum L.) Botanická charakteristika: ČESNEK KUCHYŇSKÝ (ALLIUM SATIVUM L.) Pravlastí je Džungarsko (severní Čína) v Střední Asii,
Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy,
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy, vyhodnocení výsledků, diskuse Anotace
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2 1 Rozsah a účel Metoda je vhodná pro stanovení fumonisinů B 1 a B 2 v krmivech. 2 Princip Fumonisiny
MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B
MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B Kat. č. ZP02012 Doba zpracování: 45-60 minut pro MagPurix 12S 45-65 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction
Protokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze
1 Popis vzorku Podle protokolu č. 04 lze vyšetřit vzorky různých druhů masných výrobků na přítomnost pšeničné bílkoviny. 2 Detekční limit vyšetření Přítomnost pšeničné bílkoviny lze spolehlivě prokázat,
Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce
Bakalářské práce Magisterské práce PhD práce Témata bakalářských prací na školní rok 2015-2016 1 Název Funkční analýza jaderných proteinů fosforylovaných pomocí mitogenaktivovaných proteinkináz. Školitel
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální choroby
Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku
Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku Pavla Balínová http://vyuka.lf3.cuni.cz/ Důležité informace Kroužkový asistent: RNDr. Pavla Balínová e-mailová adresa: pavla.balinova@lf3.cuni.cz místnost: 410 studijní
Tkáňový homogenizátor MagNA Lyser od společnosti Roche
Izolace RNA Pracovní postup Homogenizace: Pozn. Postup homogenizace platí pouze pro izolaci RNA z nativní tkáně, v případě izolace z buněčné suspenze je tento krok vynechán a začíná se přídavkem homogenizačního
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS 1 Rozsah a účel Postup je určen pro stanovení obsahu melaminu a kyseliny kyanurové v krmivech. 2 Princip
PROLIFERACE VIABILITA DIFERENCIACE (APOPTÓZA) Změna cytokinetických parametrů odráží efekt použitých modulátorů signálních drah
CYTOKINETICKÉ PARAMETRY PROLIFERACE VIABILITA DIFERENCIACE (APOPTÓZA) Změna cytokinetických parametrů odráží efekt použitých modulátorů signálních drah PROLIFERACE Množení buněk mitózou Dostatek živin,
Protokoly Transformace plasmidu do elektrokompetentních buněk BL21 Pracovní postup:
Protokoly Pracovní potřeby, pufry a chemikálie jsou uvedeny na konci protokolu. Pracovní postupy jsou odvozeny od těchto kitů: Champion pet160 Directional TOPO Expression Kit with Lumio Technology (Invitrogen)
Životaschopnost. (= vitalita = viabilita) počet živých buněk. 100 = [%] počet všech buněk
Životaschopnost (= vitalita = viabilita) počet živých buněk. 100 = ---------------------------------------- [%] počet všech buněk Využití: při kultivaci buněk pro různé účely (hodnocení cytotoxického účinku,
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Postup specifikuje podmínky pro stanovení obsahu semduramicinu v krmivech metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie (HPLC) v koncentračním
Zkouška inhibice růstu řas
Zkouška inhibice růstu řas VYPRACOVALI: TEREZA DVOŘÁKOVÁ JINDŘICH ŠMÍD Porovnáváme : Zkouška inhibice růstu sladkovodních řas Scenedesmus subspicatus a Senastrum capricornutum : sekce C.3. Zkouška inhibice
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU Projekt Název projektu: Stanovení biomarkerů oxidativního stresu u kapra obecného (Cyprinus carpio L.) po
Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014
Molekulárně biologické metody v mikrobiologii Mgr. Martina Sittová Jaro 2014 Harmonogram 1. den Izolace DNA 2. den Měření koncentrace DNA spektrofotometricky, real-time PCR 3. den Elektroforéza Molekulární
Jednotné pracovní postupy testování odrůd STANOVENÍ OBSAHU TANINŮ V ČIROKU SPEKTROFOTOMETRICKY
5321.1 Stanovení obsahu taninů v čiroku Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU TANINŮ V ČIROKU SPEKTROFOTOMETRICKY 1 Účel a rozsah Postup je určen pro stanovení obsahu taninů v zrnech čiroku. 2 Princip Taniny se ze
Bakteriální bioluminiscenční test. Stanovení účinnosti čištění odpadních vod pomocí bakteriálního bioluminiscenčního testu
Bakteriální bioluminiscenční test Stanovení účinnosti čištění odpadních vod pomocí bakteriálního bioluminiscenčního testu BBTT Cíl: Stanovit účinek odpadních vod na bakterie Vibrio fischeri. Principem
SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE)
SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE) Elektromagnetické vlnění SVĚTLO Charakterizace záření Vlnová délka - (λ) : jednotky: m (obvykle nm) λ Souvisí s povahou fotonu Charakterizace záření
RESEARCH OF ANAEROBIC FERMENTATION OF ORGANIC MATERIALS IN SMALL VOLUME BIOREACTORS
RESEARCH OF ANAEROBIC FERMENTATION OF ORGANIC MATERIALS IN SMALL VOLUME BIOREACTORS Trávníček P., Vítěz T., Dundálková P., Karafiát Z. Department of Agriculture, Food and Environmental Engineering, Faculty
Koloidní zlato. Tradiční rekvizita alchymistů v minulosti sofistikovaný (nano)nástroj budoucnosti?
Koloidní zlato Tradiční rekvizita alchymistů v minulosti sofistikovaný (nano)nástroj budoucnosti? Dominika Jurdová Gymnázium Velké Meziříčí, D.Jurdova@seznam.cz Tereza Bautkinová Gymnázium Botičská, tereza.bautkinova@gybot.cz
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER Trojan V., Hanáček P., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Zemedelska
Abiotický stres - sucho
FYZIOLOGIE STRESU Typy stresů Abiotický (vliv vnějších podmínek) sucho, zamokření, zasolení půd, kontaminace prostředí toxickými látkami, chlad, mráz, vysoké teploty... Biotický (způsobený jiným druhem
Název školy: Střední odborná škola stavební Karlovy Vary Sabinovo náměstí 16, 360 09 Karlovy Vary Autor: Hana Turoňová Název materiálu:
Název školy: Střední odborná škola stavební Karlovy Vary Sabinovo náměstí 16, 360 09 Karlovy Vary Autor: Hana Turoňová Název materiálu: VY_32_INOVACE_05_BUŇKA 2_P1-2 Číslo projektu: CZ 1.07/1.5.00/34.1077
Mendělejevova tabulka prvků
Mendělejevova tabulka prvků V sušině rostlin je obsaženo přibližně 45% uhlíku, 42% kyslíku, 6,5% vodíku, 1,5% dusíku a 5% minerálních prvků. Tzv. organogenní prvky (C, O, H, N) představují tedy 95% veškerých
Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi
Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi Co je to vlastně ta fluorescence? Některé látky (fluorofory)
MagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit
MagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit Kat. č. ZP02003 Doba zpracování: 40-55 minut pro MagPurix 12S 40-60 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit je určena
Ceník izolačních kitů STRATEC v mikrodestičkách
Izolace plasmidové DNA ST7010300200 Invisorb Plasmid HTS 96 Kit for 2 x 96 preps 9 229 ST7010300300 isolation of pdna from up to 2.0 ml 4 x 96 preps 15 120 bacteria suspension in a 96-well format ST7010300400
1 Základní chemické výpočty. Koncentrace roztoků
1 Záklní chemické výpočty. Koncentrace roztoků Množství látky (Doplňte tabulku) Veličina Symbol Jednotka SI Jednotky v biochemii Veličina se zjišťuje Počet částic N výpočtem Látkové množství n.. Hmotnost
Porovnání cytotoxicity organických sloučenin navázaných na vzduchové částice
20. 5. 2019 Drážďany EU projekt OdCom - závěrečná vědecká konference Porovnání cytotoxicity organických sloučenin navázaných na vzduchové částice Táňa Závodná 1, Alena Milcová 1, Zuzana Nováková 1, Ivan
CZ.1.07/2.4.00/31.0133
BiochemNet - Vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi CZ.1.07/2.4.00/31.0133 Univerzita Palackého Přírodovědecká
Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM
Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM Životní prostředí Obranné mechanismy Rostlinná buňka Živočišná buňka 2GS - M M GSH VAKUOLA GSH GSH *Aktivace* PC -
NÁVRH A PŘÍPRAVA PEPTIDŮ A LIPOPEPTIDŮ S ANTIMIKROBIÁLNÍM ÚČINKEM A STUDIUM JEJICH BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ
NÁVRH A PŘÍPRAVA PEPTIDŮ A LIPOPEPTIDŮ S ANTIMIKROBIÁLNÍM ÚČINKEM A STUDIUM JEJICH BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ A. Macůrková R. Ježek P. Lovecká V. Spiwok P. Ulbrich T. Macek Antimikrobiální peptidy přírodní
VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ
REGULACE APOPTÓZY 1 VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ Příklad: Regulace apoptózy: protein p53 je klíčová molekula regulace buněčného cyklu a regulace apoptózy Onemocnění: více než polovina (70-75%) nádorů
STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ
STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ Ing. Vratislav Bártek e-mail: vratislav.bartek.st@vsb.cz doc. Ing. Jitka Podjuklová, CSc. e-mail: jitka.podjuklova@vsb.cz Ing. Tomáš Laník e-mail:
růstu a buněčného dělění
Buněčný cyklus - principy regulace buněčného Buněčný cyklus - principy regulace buněčného růstu a buněčného dělění Mitóza Průběh mitózy v buněčné kultuře fibroblastů Buněčný cyklus Kinázy závislé na cyklinech
STANOVENÍ, CHARAKTERIZACE A IDENTIFIKACE BIOREMEDIAČNÍCH MIKROORGANISMŮ
Abstrakt STANOVENÍ, CHARAKTERIZACE A IDENTIFIKACE BIOREMEDIAČNÍCH MIKROORGANISMŮ Jana Chumchalová, Eva Podholová, Jiří Mikeš, Vlastimil Píštěk EPS, s.r.o., V Pastouškách 205, 686 04 Kunovice, e-mail: eps@epssro.cz
5. Bioreaktory. Schematicky jsou jednotlivé typy bioreaktorů znázorněny na obr. 5.1. Nejpoužívanějšími bioreaktory jsou míchací tanky.
5. Bioreaktory Bioreaktor (fermentor) je nejdůležitější částí výrobní linky biotechnologického procesu. Jde o nádobu různého objemu, ve které probíhá biologický proces. Dochází zde k růstu buněk a tvorbě
Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, Zemědělská 1, 613 00 Brno, Česká republika. E-mail: j.petrek@email.cz
COMPUTER PROCESSING FOR IMAGE ANALYSIS OF EARLY SOMATIC EMBRYOS GROWTH OF NORWAY SPRUCE (PICEA ABIES /L./ KARST.) POČÍTAČOVÉ ZPRACOVÁNÍ PRO ANALÝZU OBRAZU RANÝCH SOMATICKÝCH EMBRYÍ SMRKU ZTEPILÉHO (PICEA
Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin Ing. Kateřina Tmejová, Ph. D.,
Sarkosin jako jednoduchý test na rakovinu prostaty analytická studie přednášky Natalia Cernei
Název: Školitel: Sarkosin jako jednoduchý test na rakovinu prostaty analytická studie přednášky Natalia Cernei Datum: 20.1.2011 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce
Mendelova univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav biologie rostlin
Mendelova univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav biologie rostlin Inovace laboratorních úloh genetických předmětů metodikami pracujícími s ribonukleovými kyselinami pšenice Metodické návody pro laboratorní
Inhibitory ATR kinasy v terapii nádorů
Inhibitory ATR kinasy v terapii nádorů J.Vávrová, M Řezáčová Katedra radiobiologie FVZ Hradec Králové UO Brno Ústav lékařské chemie LF Hradec Králové UK Praha Cíl léčby: zničení nádorových buněk zachování
ODSTRAŇOVÁNÍ KYANIDŮ Z MODELOVÝCH VOD
ODSTRAŇOVÁNÍ KYANIDŮ Z MODELOVÝCH VOD Jana Muselíková 1, Jiří Palarčík 1, Eva Slehová 1, Zuzana Blažková 1, Vojtěch Trousil 1, Sylva Janovská 2 1 Ústav environmentálního a chemického inženýrství, Fakulta
SDS-PAGE elektroforéza
SDS-PAGE elektroforéza Příprava gelu... 1 Recept na 0.75 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Recept na 1.5 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Příprava vzorku... 3 Elektroforéza... 3 Barvení gelů Blue Silver... 4 Chemikálie
Vybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Vybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka 2018/19 Obsah 1.
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU LC/MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU LC/MS 1 Účel a rozsah Tento postup specifikuje podmínky pro stanovení vitamínu D3 v krmivech metodou LC/MS. 2 Princip Zkušební
Parametry metod automatické fotometrické analýzy
Parametry metod automatické fotometrické analýzy Každá metoda prováděná automatickým biochemickým analyzátorem má v softwaru řídícího počítače nadefinované parametry: číslo (aplikační kód) metody název