CZ.1.07/2.4.00/

Transkript

1 BiochemNet - Vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi CZ.1.07/2.4.00/

2 Univerzita Palackého Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie

3 Univerzita Palackého Založena již v 16. století Nejstarší vysoká škola na Moravě Druhá nejstarší vysoká škola v České republice Osm fakult Studuje přes studentů = celá pětina obyvatel města Olomouce.

4 Přírodovědecká fakulta Hlavní budova PřF Třída 17. listopadu Katedra biochemie Biologické centrum PřF Šlechtitelů 11 Olomouc Holice

5 Katedra biochemie Založení katedry - rok 1996 Vedoucí Katedry biochemie Prof.RNDr. Pavel Peč, CSc. zakladatel Katedry Biochemie Prof. Mgr. Marek Šebela Akreditace výuky oboru Biochemie rok 2001

6 Výzkumné zaměření katedry biochemie Cytokininy mechanismus biosyntézy a odbourávání (cytokininoxidasa/dehydrogenasa) Genetické manipulace u rostlin a hub Proteomika hmotnostní spektrometrie biomolekul Obranné mechanismy rostlin úloha reaktivních forem kyslíku a dusíku Metabolismus polyaminů u rostlin Studium a charakterizace enzymů aminoaldehydehydrogenasa Nanotechnologie - imobilizace enzymů na nanočástice Modifikace proteinů - trypsin

7 Oddělení tkáňových kultur a rostlinných biotechnologií (Katedra botaniky) mikropropagace (meristémové kultury) prašníkové kultury embryokultury (izolace a kultivace nezralých zygotických hybridních embryí) izolace a fúze protoplastů karyologie, cytologické metody anatomie rostlin studium stresu na úrovni rostlinné buňky L-Arg NHCH 3 NHCH 3 NOS CH 3 N N NH 2 NH 2 N O esterasa COO - NO COO - F O F F F O 2 F F AcO O DAF-FM DA bez fluorescence OAc O - buněčná membrána O DAF-FM O O - O DAF-FM T fluorescence O

8 Oddělení fytopatologie a mikrobiologie (Katedra Botaniky) fytopatogenní houbové organismy mikroskopické metody konfokální mikroskopie fenolické látky v rezistenci rostlin oxidativní stres v průběhu patogeneze vliv růstových regulátorů na rezistenci rostlin a vývoj patogenů

9 Chromatografické metody izolace malých molekul (Katedra Biochemie) izolace proteinů

10 Nanotechnologie imobilizace enzymů (Katedra Biochemie)

11 Studium obranných mechanismů rostlin (Katedra Biochemie) Studium vývoje patogenů Detekce, kvantifikace - ROS, RNS, GSNO Detekce nitrovaných proteinů Studium enzymů podílejících se na produkci RNS - GSNOR, NR, NO syntasa produkci ROS NADPHoxidasa, SOD, POX, Kat Studium tvorby biofotonů Western blot, nativní elfo, stanovení aktivity, histochemie, RT PCR,

12 Metody vypracované v rámci projektu AescuLab Skupina Moduly Biochemie 39 Biologie 36 Imunologie 35 Celkem videí

13 Č. Název modulu AE-301 AE-302 AE-303 AE-304 AE-305 AE-306 AE-307 AE-308 AE-309 AE-310 AE-311 AE-312 AE-313 AE-314 AE-315 První pomoc GMO - geneticky modifikované organismy Manipulace s laboratorními zvířaty ELISA analýza specifické protilátkové odpovědi experimentálních zvířat Inhibiční ELISA Stanovení specifických protilátek ve vaginálním sekretu myší Analýza antigen specifické odpovědi T lymfocytů a jejich subpopulací pomocí ELISPOT Analýza antigen specifické odpovědi T lymfocytů pomocí Flow Cytometry Test proliferační odpovědi subpopulací T lymfocytů po stimulaci antigenem barvení propidium jodid Indukce tvorby cystyckých forem B. burgdorferi za různých kultivačních podmínek Analýza životnosti kvasinek pomocí flow cytometry. Indukce morfologických změn Candida albicans. Metody odstranění a průkazu endotoxinů (LPS) Analýza subpopulací splenocytů pomocí Flow Cytometry Analýza N-glykosylace gp120 proteinu pomocí lektinových blotů

14 Č. Název modulu AE-101 AE-102 AE-103 AE-104 AE-105 AE-106 AE-107 AE-108 AE-109 AE-111 AE-112 AE-113 AE-114 Precipitační metody purifikace peptidů a proteinů Štěpení proteinů v roztoku a v gelu SDS-PAGE a následná detekce proteinů v gelech Dvojdimenzionální gelová elektroforéza rostlinných proteinů v malém formátu Identifikace proteinů pomocí MALDI-TOF-MS Western blot detekce a kvantifikace Hsp70 Slot blot a rychlá imunodetekce proteinů na přístroji SNAP id. Isoelektrická fokusace Nativní elektroforéza a detekce enzymů v gelu Gelová chromatografie, gelová permeační chromatografie, gelová filtrace Kovalentní modifikace proteinů Stanovení aktivity xanthinoxidoreduktasy a detekce inhibitorů tohoto enzymu autografickou metodou na tenké vrstvě Stanovení produkce oxidu dusnatého a reaktivních forem dusíku AE-115 Analýza metabolitů reaktivních forem dusíku dusitany/dusičnany, nitrosothioly AE-116a Stanovení aktivity enzymů metabolismu reaktivních forem dusíku - NO-synthasy

15 Č. Název modulu AE-101 AE-102 AE-103 AE-104 AE-105 AE-106 AE-107 AE-108 AE-109 AE-111 AE-112 AE-113 AE-114 Precipitační metody purifikace peptidů a proteinů Štěpení proteinů v roztoku a v gelu SDS-PAGE a následná detekce proteinů v gelech Dvojdimenzionální gelová elektroforéza rostlinných proteinů v malém formátu Identifikace proteinů pomocí MALDI-TOF-MS Western blot detekce a kvantifikace Hsp70 Slot blot a rychlá imunodetekce proteinů na přístroji SNAP id. Isoelektrická fokusace Nativní elektroforéza a detekce enzymů v gelu Gelová chromatografie, gelová permeační chromatografie, gelová filtrace Kovalentní modifikace proteinů Stanovení aktivity xanthinoxidoreduktasy a detekce inhibitorů tohoto enzymu autografickou metodou na tenké vrstvě Stanovení produkce oxidu dusnatého a reaktivních forem dusíku AE-115 Analýza metabolitů reaktivních forem dusíku dusitany/dusičnany, nitrosothioly AE-116a Stanovení aktivity enzymů metabolismu reaktivních forem dusíku - NO-synthasy

16 Č. Název modulu AE-201 AE-202 AE-203 AE-204 AE-205 AE-206 AE-207 AE-208 AE-209 AE-210 AE-211 AE-212 AE-213 AE-214 AE-215 Průkaz apoptózy elektroforeticky (DNA fragmenty) Testování mutagenicity v mikrodestičkovém uspořádání (Amesův test) Práce v aseptickém prostředí Morfologie živočišné buňky Kultivace savčích buněčných linií Sledování viability a proliferace Transfekce buněk, selekce a detekce Analýza schopnosti živočišných buněk tvořit kolonie Synchronizace živočišných buněčných kultur Modely angiogeneze in vitro Příprava buněk pro mikroskopickou analýzu Vizualizace jednotlivých molekul DNA Annexin V: Detekce apoptózy Průtoková cytometrie: Analýza buněčného cyklu Průtoková cytometrie: Analýza intracelulárních proteinů

17 Ubytování, stravování Koleje Ubytování v areálu v Holici Menza

18 Jak se k nám dostanete AUTOBUSEM z Hlavního vlakového nádraží Olomouc (via náměstí Hrdinů): Linka číslo 13 (z Hlavního vlakového nádraží) nebo 22 (centrum zastávky Tržnice, náměstí Hrdinů): Jízdní řád Dopravního podniku města Olomouce. a.s.. U vstupu do areálu je orientační tabule s vyznačením budovy VTP UP. Zastávka: Šlechtitelů nebo Technologická (spoje s "t"). AUTEM Ze směru od Ostravy, Brna, Prostějova: Směr Olomouc-Holice sjezd z dálnice exitč. 276, dále silnice č.46. Na kruhovém objezdu jeďte rovně směr Holice, projeďte Holicí stále po hlavní cestě. Silnice pokračuje mírným stoupáním přes železniční nadjezd a dále přibližně 300 metrů. Poté odbočte na první křižovatce doprava a cca po 500 metrech se po pravé straně nachází areál PřF UP, jeďte však dál. Fialová navigační cedule po cca 100 metrech Vás poté nasměruje doprava do průmyslové zóny.

19 Děkuji za pozornost