6) Interakce auxinů a světla ve vývoji a růstu rostlin
|
|
- Šimon Denis Rohla
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 SFZR ) Interakce auxinů a světla ve vývoji a růstu rostlin Martin Fellner Laboratoř růstových regulátorů PřF UP v Olomouci a ÚEB AVČR
2 SFZR 2 Vývoj organismu regulují signály (faktory) Vnitřní Vnější genetická info metabolismus hormony světlo teplota vlhkost plyny gravitace
3 SFZR 3 Arabidopsis coleoptile Tomato mesocotyl Corn roots
4 SFZR 4 Ve 30.letech byl izolován auxin a bylo ukázáno, že stimuluje růst. Úhel zakřivení je úměrný množství auxinu v bloku Akumulace auxinu ze špiček koleoptile do agarových bloků...a ukázal, že materiál akumulovaný v agarových blocích je látka, která stimuluje růst. Indole-3-acetic acid, IAA Tento experiment ukazující stimulaci růstu auxinem byl použit jako základ pro purifikaci auxinu American Society of Plant Biologists Redrawn from Went, F.W. (1935) Auxin, the plant growth-hormone. Bot. Rev. 1:
5 SFZR 5 Růst ve tmě (etiolizovaný růst, skotomorfogeneze) Skoto = tma
6 SFZR 6 Auxin Světlo Prodlužování buněk Růst? Růst buněk inhibován Růst
7 SFZR 7 Auxinem indukované prodlužování během fototropismu ~ 180 minut Auxinový gradient Zakřivení koleoptile Auxin stimuluje expanzi buněk na zastíněné straně koleoptile => zakřivení koleoptile
8 SFZR Úrovně interakce světla a auxinů 8 Hladina hormonů Transport hormonů Fotoreceptory Receptor Transport hormonů Jiné mechanizmy Mezičlánky Finální reakce Prodlužování
9 SFZR A. Světlem indukovaná kontrola prodlužování regulací hladiny endogenního auxinu [ IAA] (pmol.g -1 FW) D BL RL WL Změny hladiny auxinu IAA v mezokotylech kukuřice v závislosti na hybridu a světelných podmínkách léta 60. léta 90. léta Citlivost ke světlu Úhel listů
10 SFZR 10 Tabák: mutanti pew1 a pew2 defekt v syntéze chromoforu Arabidopsis: mutant red1 - defekt v enzymu CYP83B1 (P450 monooxygenáza hydroxyluje IAOX) RL Indol glukosinoláty Snížená citlivost ke světlu CYP83B1 [IAA] Kraepiel Y et al. (1995) Planta 197: Trp IAOX IAA Prodlužování Hoecker U et al. (2004) Planta (2004) 219:
11 SFZR Obecný princip: více světla => méně auxinů => menší růst 11 Normální R:FR = 1,2 Shade avoidance = reakce rostlin k zastínění R FR R:FR = 1,2 phya, phyb, CRY1 R:FR = 0,8 [Auxin] [Auxin] Prodlužování Prodlužování
12 SFZR B. Prodlužovací růst jako důsledek světlem regulovaného transportu auxinů 12 Kukuřice Prodlužování kukuřičné koleoptile je inhibováno zvyšující intenzitou RL. Red Dark RL snižuje akumulaci radiaktivního auxinu v mezokotylu kukuřice. Jones AM et al. (1991) Plant Physiol. 97: Bohn-Courseau I (2010) RL a FR redukují polární transport auxinu v mezokotylech kukuřice. Fellner M et al. (2003) Planta 216:
13 SFZR 13 Arabidopsis 1) Etiolizované hypokotyly jsou necitlivé k NPA. 2) Účinek NPA je snížen u rostlin s defektem ve vnímání světla (rostliny s mutací ve fotoreceptorech). Jensen PJ et al. (1998) Planta 116: Polární transport je důležitý pro růst rostlin na světle.
14 SFZR 14 Mutace ve phya a phyb vede k zesílené expresi PIN3 a PIN7 Overexprese phya a B vede k redukci exprese PIN3 a PIN7 phya, phyb Devlin et al. (2003) Plant Physiol 133: Exprese PIN3, PIN7 Proces de-etiolizace je spojen s redukcí polárního transportu auxinu. Tím dochází k redukci auxinemindukovaného prodlužování. Transport auxinu Redukce polárního transportu auxinu světlem je zprostředkována fytochromy. Prodlužování
15 SFZR 15 Auxinové transportéry ABCB Transport auxinů je regulován také pomocí ABCB proteinů (ABC = ATP-Binding Cassete; transmembránové glykoproteinové transportéry; dříve PGP nebo MDR proteiny) Overexprese ABCB1 => prodloužení hypokotylu Knockout ABCB1 => zkrácení hypokotylu Geissler M et al. (2005) Plant J 44: Knockout abcb1 mutanti mají silně inhibovaný růst na světle. Lin R and Wang H (2005) Plant Physiol 138: Exprese ABCB1 je redukována světlem.
16 SFZR 16 Exprese ProDR5:GUS CRY1 phyb ABCB19 [Auxin] [IAA] [IAA] Růst hypokotylu Růst hypokotylu Wu et al. (2010) Plant Journal 62:
17 SFZR 17 Světlo zesiluje polární transport auxinů v hypokotylu Arabidopsis blokací COP1, který je negativním regulátorem auxinového transportéru PIN1. Výsledky vysvětlují stimulaci růstu kořene na světle a inhibici růstu kořene v tmě. Data jsou však v rozporu se staršími výsledky ukazujícími, že světlo inhibuje polární transport auxinu. Nutné další výzkumy mechanizmu polárního transportu auxinů Sassi M et al. (2012) Development 139:
18 SFZR 18 C. Signální elementy společné pro signální dráhy světla a auxinů 1) Společné geny regulované auxinem a světlem Primární geny pro růst a vývoj GH3 exprese stimulovaná auxinem během 5 minut; geny fungují v IAA konjugaci; exprese GH3 odráží množství endogenního auxinu Aux/IAA exprese stimulovaná auxinem během 6 60 minut; vzniklý protein žije asi 7 minut. SAUR exprese stimulovaná auxinem během 2 5 minut; exprese nevyžaduje syntézu nových proteinů; geny neobsahují introny, kódují velmi podobné peptidy neznámé funkce.
19 SFZR GH3 podobné geny 19 FIN219 rychle indukován auxinem; fin219 dlouhý hypokotyl na FR FR fenotyp FR phya WT cop1 fin219 cop1fin219 [FIN219] cop1 COP1 Dark fenotyp Hsieh H-L et al. (2000) Genes and Development 14: HY5 Světlo Tma Tma
20 SFZR 20 WES1 kóduje auxin-konjugační enzym (inaktivuje auxiny) a tím redukuje prodlužování hypokotylu regulované phyb Světlo Dominantní mutant wes1-d hypersensitivní ke světlu phyb Exprese WES1 je up-regulována ve phyb mutantu. WES1 Prodlužování Park J-E et al. (2007) Plant Cell Physiol. 48(8):
21 SFZR 21 Aux/IAA geny Exprese Aux/IAA genů je stimulována auxinem, ale inhibována světlem. Světlo Auxin OsIAA Prodlužování Aplikace 30 µm IAA. Thakur JK et al. (2001) DNA Res 8: SAUR geny Velice málo informací
22 SFZR 2) Elementy signální dráhy sdílené auxiny a světlem 22 TIR1 systém Ub UbUb 26S Proteasome A TIR1 auxin F-box podjednotka E3-ubiquitin ligázy; auxinový receptor represor transkripce auxinem-indukovaných genů A TIR1 ASK1 Ub Ub CUL1 Ub E2 RBX1 E1 Ub E1 Ub ARF transkripční faktor (aktivátor exprese genů) Auxinem-indukované geny obsahují AuxRE = auxin responsivní element Podobné mechanizmy pro F-box proteiny: TIR1 A TIR1 A A TIR1 A A A A A A COP1 CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOG. 1 COI CORONATINE INSENSITVE 1 ARF AuxRE Auxin inducible gene de-repression ARF AuxRE e.g. AUX/IAA, SAUR, GH3, etc. ZTL ZEITLUPE, etc. [Auxin] Plant development
23 SFZR 23 TIR1 systém je vysoce citlivý ke světlu, protože exprese Aux/IAA genů je regulována světlem. Nagpal P et al. (2000) Plant Physiol 123: Gain-of-function mutant axr2/iaa7 ukazuje ve tmě fenotyp rostlin, rostoucích na světle. Gain-of-function mutant = mutant se zvýšenou aktivitou mutovaného proteinu Normální degradace Aux/IAA proteinu je nutná k potlačení fotomorfogenního fenotypu rostlin rostoucích ve tmě.
24 SFZR 24 Mechanizmus kontroly aktivity Aux/IAA světlem není zcela znám. Světlo phya, phyb Transkripce SHY2/IAA3 SHY2/IAA3 + phyb Světlo phya Fosforylace Aux/IAA Fytochromy ovlivňují expresi Aux/IAA.
25 SFZR 25 Světlo Transkripční faktor HY5 phya, phyb HY5 AUX/IAA HY5 se váže k promotorům genů AUX/IAA a ARF Auxinová signalizace hy5 nízká exprese genů AUX/IAA Sellaro et al. (2011) Plant J 68: Prodlužování hypokotylu
26 SFZR 26 Transkripční faktor ATHB2 Exprese ATHB-2 je indukována nízkým R:FR prostřednictvím phyb a phye. Antisense rostliny athb-2: Carabelli M et al. (1993) Plant J 4: Rostliny OE-ATHB2 = phy mutanti: ATHB-2 Tvorba laterálních kořenů je indukovaná auxinem Exprese ATHB2 indukovaná nízkým R:FR vede k redukci polárního transportu auxinu a k redukci exprese auxinem-indukovaných genů. ATHB-2 je spojujícím elementem signální dráhy světla a auxinů
27 SFZR 27 Transkripční faktory PIF4, PIF5 Pozitivní regulátory shade-avoidance reakce => jsou exprimovány při nízkém R/FR (= zastínění) Geny YUCCA pozitivní regulátory syntézy auxinů Syntéza auxinů Promotor YUCCA8 Nízký R/FR (= stín) PIF5 PIF4 Syntéza auxinů Promotor YUCCA8 Prodlužování Hornitschek P et al. (1993) Plant J 71:
28 SFZR 28 Transkripční faktor PIF7 Li L et al. (2012) Genes Dev 26: Při nízkém R/FR (= stín) se defosforylovaný PIF7 váže na G-box genů YUCCA8 a YUCCA9 zapojených v syntéze auxinů a indukuje jejich expresi. Zvýšená syntéza auxinů pak vede k prodlužování rostliny.
29 SFZR 29 Transkripční faktor REVEILLE 1 (RVE1) Rawat R et al. (2009) PNAS 106: Světlo RVE1 YUCCA8 [Auxin] Prodlužování
30 SFZR 30 ABP systém Jones AM et al. (1991) Plant Physiol 97: ABP1 Expanze buněk Prodlužování Růst ve tmě Růst na světle Exprese ABP1: Im KH et al. (1991) Maydica 45:
31 SFZR 31 Světlo reguluje expresi genů a/nebo proteinu ABP1 a ABP4 v kukuřici Modré světlo inhibuje expresi ABP1 v koleoptiĺe starého hybridu kukuřice 307. Modré světlo redukuje množství ABP1 proteinu v mezokotylu starého hybridu kukuřice 307. R e l a tiv n í e x p r e s e g e n u A B P 1 (1 8 S ) 1,4 1,2 1,0 0,8 0,6 0,4 0,2 0,0 D dark blue BLlight Hybrid Hybrid Dark BL Čudejková M et al. (2012) Current Topics in Plant Biology 13: Červené světlo a FR stimulují expresi ABP4 v mezokotylu starého hybridu kukuřice 307. Exprese ABP4 není indukována světlem v moderním hybridu Fellner M et al. (2006) Plant Signaling and Behavior 1:
32 SFZR 32 Bílé světlo redukuje expresi genu pro fytochrom B. Exprese je závislá na funkčnosti genů ABP1 a ABP4. Auxin inhibuje expresi PHYB v etiolizovaných rostlinách, a to prostřednictvím ABP1 a ABP4 Model - Auxin: Exprese PHYB De-etiolizace (= inhibice růstu) + Auxin: Exprese PHYB Etiolizace (= stimulace růstu) Bořucká J, Fellner M (2012) Plant Growth Regulation 68:
33 SFZR 33 Update 2013 Effendi Y et al. (2013) J Exp Botany 64: ABP1 stimuluje aktivitu phyb. Aktivní phyb potlačuje expresi genů zapojených v prodlužování.
34 SFZR 34 Bohn-Courseau I (2010) C. R. Biologies 333: Rychlá auxinem-indukovaná inhibice endocytózy membránových proteinů Plazma membrána Endozom PIN1 Auxin PIN1 Paciorek T et al. (2005) Nature 435:
35 SFZR 35 Robert S et al. (2010) Cell 143: Endocytóza PIN1 je nezávislá na TIR1, ale vyžaduje ABP1. ABP1 stimuluje endocytózu PIN1 proteinů závislou na proteinu clathrinu. Negativní účinek auxinu na internalizaci PIN1 proteinů je zprostředkován ABP1. + ABP1 Sauer M, Kleine-Vehn J (2011) Plant Cell 23: Hypotéza: Světlo může inhibovat polární transport auxinů (tedy v důsledku růst) tím, že inhibuje množství receptoru ABP1.
36 Pěkné Vánoce
4) Interakce auxinů a světla ve vývoji a růstu rostlin
SFR 1 2018 4) Interakce auxinů a světla ve vývoji a růstu rostlin Martin Fellner Laboratoř růstových regulátorů PřF UP v Olomouci a ÚEB AVČR 2 Vývoj organismu regulují signály (faktory) Vnitřní Vnější
3) Fyziologie rostlinných hormonů auxinů: receptory a signální dráhy
SFR 1 2017 3) Fyziologie rostlinných hormonů auxinů: receptory a signální dráhy a) Auxinový receptor TIR1 b) Auxinový receptor ABP1 c) Kooperace receptorů TIR1 a ABP1 Estelle M et al. (2011) Auxin Signaling:
5) Fyziologie rostlinných hormonů auxinů: receptory a signální dráhy
SFZR 1 2014 5) Fyziologie rostlinných hormonů auxinů: receptory a signální dráhy a) Auxinový receptor TIR1 b) Auxinový receptor ABP1 c) Kooperace receptorů TIR1 a ABP1 Estelle M et al. (2011) Auxin Signaling:
3) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin
2014 3) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin a) Vlastnosti a lokalizace fytochromů b) Reakce rostlin zprostředkované fytochromy 1 Briggs WR, Spudich JL (eds) (2005) Handbook of Photosensory
Auxin - nejdéle a nejlépe známý fytohormon
Auxin - nejdéle a nejlépe známý fytohormon Auxin je nejdéle známým fytohormonem s mnoha popsanými fyziologickými účinky Darwin 1880, Went 1928 pokusy s koleoptilemi trav a obilovin prokázali existenci
9) Fotomorfogeneze RVR. Schäfer E, Nagy F (eds) (2006) Photomorphogenesis in Plants and Bacteria, 3rd ed., Springer
2015 9) Fotomorfogeneze a) Vlastnosti a lokalizace fytochromů b) Reakce rostlin zprostředkované fytochromy c) Ekologické funkce fytochromů d) Buněčný a molekulární mechanismus funkce fytochromů 1 Briggs
Příběh pátý: Auxinová signalisace
Příběh pátý: Auxinová signalisace Co je auxin? Derivát tryptofanu Příbuzný serotoninu a melatoninu Všechny deriváty přítomny jak u živočichů, tak u rostlin IAA Serotonin Serotonin: antagonista auxinu Přítomen
Rostlinné hormony brasinosteroidy a jejich úloha ve vývoji a růstu rostlin
SFZR 1 2016 Rostlinné hormony brasinosteroidy a jejich úloha ve vývoji a růstu rostlin Hayat S, Ahmad A (2011) Brassinosteroids: a class of plant hormone. Springer, Berlin 2 Vývoj organismu regulují signály
7) Dormance a klíčení semen
2015 7) Dormance a klíčení semen 1 a) Dozrávání embrya a dormance b) Klíčení semen 2 a) Dozrávání embrya a dormance Geny kontrolující pozdní fázi vývoje embrya - dozrávání ABI3 (abscisic acid insensitive
4) Reakce rostlin k modrému světlu
SFZR 1 2015 4) Reakce rostlin k modrému světlu a) Fotobiologie reakcí zprostředkovaných modrým světlem Whitelam GC, Halliday KJ (eds) (2007) Light and Plant Development Blackwell Publishing Briggs WR,
1) Úloha světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin
S 2018 1) Úloha světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin a) Vlastnosti a lokalizace fytochromů b) eakce rostlin zprostředkované fytochromy c) Ekologické funkce fytochromů d) Buněčný a molekulární
Rostlinné hormony brasinosteroidy a jejich úloha ve vývoji a růstu rostlin
1 2014 Rostlinné hormony brasinosteroidy a jejich úloha ve vývoji a růstu rostlin Hayat S, Ahmad A (2011) Brassinosteroids: a class of plant hormone. Springer, Berlin 2 Vývoj organismu regulují signály
4) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin
1 2010 4) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin c) Ekologické funkce fytochromů d) Buněčný a molekulární mechanismus funkce fytochromů Briggs WR, Spudich JL (eds) (2005) Handbook of Photosensory
Úloha genu COP1 v rostlinné fotomorfogenezi a tumorogenezi u živočichů
1 Úloha genu COP1 v rostlinné fotomorfogenezi a tumorogenezi u živočichů a) Fotomorfogeneze b) Úloha COP1 ve fotomorfogenezi rostlin c) COP1 a tumorogeneze Martin Fellner 2015 2 a) Fotomorfogeneze Briggs
3) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin
1 2014 3) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin c) Ekologické funkce fytochromů d) Buněčný a molekulární mechanismus funkce fytochromů Whitelam GC, Halliday KJ (eds) (2007) Light and Plant
5) Reakce rostlin k modrému světlu
2010 5) Reakce rostlin k modrému světlu a) Fototropismus b) Rychlá inhibice prodlužovacího růstu c) Stimulace otevírání průduchů (stomat) 1 Briggs WR, Spudich JL (eds) (2005) Handbook of Photosensory Receptors,
MFPSB 1. b) Úloha COP1 ve fotomorfogenezi rostlin c) COP1 a tumorogeneze
1 Úloha genu COP1 v rostlinné fotomorfogenezi a tumorogenezi u živočichů a) Fotomorfogeneze b) Úloha COP1 ve fotomorfogenezi rostlin c) COP1 a tumorogeneze Martin Fellner Martin Fellner 2010 2 a) Fotomorfogeneze
Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor)
RNAi Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor) Místo silné pigmentace se objevily rostliny variegované a dokonce bílé Jorgensen pojmenoval tento fenomén
MBR ) Reprodukce rostlin. a) Indukce kvetení. b) Vývoj květu - stručná morfologie. c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu
2015 2) Reprodukce rostlin 1 a) Indukce kvetení b) Vývoj květu - stručná morfologie c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu Životní cyklus rostliny 2 3 a) Indukce kvetení Indukce kvetení přeprogramování
RŮST A VÝVOJ. Diferenciace rozlišování meristematických buněk na buňky specializované
RŮST A VÝVOJ Růst nevratný nárůst hmoty způsobený činností živé protoplasmy hmota a objem buněk, počet buněk, množství protoplasmy kvantitativní změny Diferenciace rozlišování meristematických buněk na
VORF Winslow Russel Briggs ( )
VORF-2 2015 Winslow Russel Briggs (29.4. 1928) 1 Department of Plant Biology Carnegie Institution for Science (dříve Carnegie Institution of Washington) 260 Panama Street Stanford, CA 94 305 USA Prof.
19. století. b) Fotoreceptory c) Přenos signálu. b) Fotoreceptory modrého světla: Kryptochromy (cryptochromes) PHR
SFR 2018 2) Reakce rostlin k modrému světlu 1 19. století Charles a Francis Darwin Studium fototropismu koleoptile 2 b) Fotoreceptory c) Přenos signálu Počátek 90. let Identifikace fotoreceptorů Identifikace
RVR e) Fotobiologie reakcí zprostředkovaných modrým světlem f) Fotoreceptory g) Přenos signálu
1 2015 9) Fotomorfogeneze e) Fotobiologie reakcí zprostředkovaných modrým světlem f) Fotoreceptory g) Přenos signálu Briggs WR, Spudich JL (eds) (2005) Handbook of Photosensory Receptors, Wiley-VCH Schäfer
2) Reakce rostlin k modrému světlu
SFR 1 2017 2) Reakce rostlin k modrému světlu b) Fotoreceptory c) Přenos signálu Whitelam GC, Halliday KJ (eds) (2007) Light and Plant Development Blackwell Publishing Briggs WR, Spudich JL (eds) (2005)
I rostliny mají hormony!... co a jak s auxinem. Eva Zažímalová Ústav experimentální botaniky AV ČR, Praha
I rostliny mají hormony!... co a jak s auxinem Eva Zažímalová Ústav experimentální botaniky AV ČR, Praha Rostliny a tvarová (a vývojová) různorodost Reakce na okolní prostředí Reakce na nepříznivé podmínky
Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78
Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78 Blok 3 Role aktinového cytoskeletu v morfogenezi rostlinných buněk - analýza fenotypu Úlohy: 1. Kvantifikace počtu zkroucených a správně tvarovaných trichomů u
Teoretický úvod: FOTOTROPISMUS. Praktikum fyziologie rostlin
Teoretický úvod: FOTOTROPISMUS Praktikum fyziologie rostlin 1 Teoretický úvod: FOTOTROPISMUS Fototropismus náleží mezi vitální ohybové pohyby rostlin. Řadí se mezi pohyby paratonické povahy, tj. je vyvolán
TUBULIN-FOLDING COFACTOR A (TFC A) u Arabidopsis
TUBULIN-FOLDING COFACTOR A (TFC A) u Arabidopsis Mikrotubuly Formace heterodimerů α/βtubulinu Translace α a β -tubulin monomerů chaperonin c-cpn správný folding α-tubulin se váže na TFC B a β na TFC
Buněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky
Buněčný cyklus Replikace DNA a dělení buňky 2 Regulace buněčného dělení buněčný cyklus: buněčné dělení buněčný růst kontrola kvality potomstva (dceřinných buněk) bránípřenosu nekompletně zreplikovaných
VORF Winslow Russel Briggs ( )
VORF-2 2018 Winslow Russel Briggs (29.4. 1928) 1 Department of Plant Biology Carnegie Institution for Science (dříve Carnegie Institution of Washington) 260 Panama Street Stanford, CA 94 305 USA http://dpb.carnegiescience.edu/labs/briggs-lab
2) Reprodukce rostlin
2010 1 2) Reprodukce rostlin a) Indukce kvetení b) Vývoj květu - stručná morfologie c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu 2 Životní cyklus rostliny 3 a) Indukce kvetení Indukce kvetení přeprogramování
Příběh šestý: Co mají společného signální dráhy?
Příběh šestý: Co mají společného signální dráhy? Paralelismus v recepci auxinů a jasmonátů SCF-komplex Receptor = F-box protein Struktura SCF komplexu SCF komplex = RING-BOX1 + Skp1 + Cullin + F-box protein
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Mária Čudejková 2. Transkripce genu a její regulace Transkripce genetické informace z DNA na RNA Transkripce dvou genů zachycená na snímku z elektronového mikroskopu.
IV117: Úvod do systémové biologie
IV117: Úvod do systémové biologie David Šafránek 3.12.2008 Obsah Obsah Robustnost chemotaxe opakování model chemotaxe bakterií nerozliseny stavy aktivity represoru aktivita = ligandy a konc. represoru
Exprese genetického kódu Centrální dogma molekulární biologie DNA RNA proteinu transkripce DNA mrna translace proteosyntéza
Exprese genetického kódu Centrální dogma molekulární biologie - genetická informace v DNA -> RNA -> primárního řetězce proteinu 1) transkripce - přepis z DNA do mrna 2) translace - přeložení z kódu nukleových
Životní cyklus rostliny. a) Indukce kvetení. b) Vývoj květu - stručná morfologie. c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu. a) Indukce kvetení
MBRO 208 4) Reprodukce rostlin Životní cyklus rostliny 2 a) Indukce b) Vývoj květu - stručná morfologie c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu Martin Fellner Laboratoř růstových regulátorů PřF
Úloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce)
Úloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce) Úkol: Sepište krátký rukopis vědeckého původního článku na téma "Směrovaný transport auxinu přes plazmatickou membránu hraje úlohu
Signalizace a komunikace. Rostlinná cytologie - signalizace, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Signalizace a komunikace Annu. Rev. Plant Biol. 2008.59:67-88 Development, 117 (1993), pp. 149 162 Meristémy trvale dělivá pletiva Periklinální dělení Antiklinální dělení http://www.mun.ca/biology/desmid/brian/biol3530/devo_07/ch07f05.jpg
P1 AA BB CC DD ee ff gg hh x P2 aa bb cc dd EE FF GG HH Aa Bb Cc Dd Ee Ff Gg Hh
Heteroze jev, kdy v F1 po křížení geneticky rozdílných genotypů lze pozorovat zvětšení a mohutnost orgánů, zvýšení výnosu, životnosti, ranosti, odolnosti ve srovnání s lepším rodičem = heterózní efekt
Úloha kanálu kyseliny borité, NIP5;1, v růstových reakcích Arabidopsis thaliana k auxinu 2,4-D
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI Přírodovědecká fakulta Laboratoř růstových regulátorů Úloha kanálu kyseliny borité, NIP5;1, v růstových reakcích Arabidopsis thaliana k auxinu 2,4-D BAKALÁŘSKÁ PRÁCE Autor:
MBR ) Reprodukce rostlin. a) Indukce kvetení. b) Vývoj květu - stručná morfologie. c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu
MBR1 2016 4) Reprodukce rostlin 1 a) Indukce kvetení b) Vývoj květu - stručná morfologie c) Genetická a molekulární analýza vývoje květu Životní cyklus rostliny 2 3 a) Indukce kvetení Indukce kvetení přeprogramování
Dusík. - nejdůležitější minerální živina (2-5% SH)
Dusík - nejdůležitější minerální živina (2-5% SH) - dostupnost dusíku ovlivňuje: - produkci biomasy a její distribuci - ontogenetický vývoj - hormonální rovnováhu (cytokininy, ABA) - rychlost fotosyntézy
Genová etiologie nemocí
Genová etiologie nemocí 1. Obecná etiologie nemocí 1. Obecná etiologie nemocí 2. Mutace genů v germinativních a somatických buňkách 3. Molekulární fyziologie genu 4. Regulace aktivity genu (genové exprese)
INTERAKCE ROSTLINNÉHO HORMONU AUXINU A SVĚTLA V RŮSTU ROSTLIN
Středoškolská technika 2018 Setkání a prezentace prací středoškolských studentů na ČVUT INTERAKCE ROSTLINNÉHO HORMONU AUXINU A SVĚTLA V RŮSTU ROSTLIN Anna Hýsková Gymnázium J. A. Komenského a Jazyková
VLIV SPEKTRÁLNÍHO SLOŽENÍ FOTOSYNTETICKY AKTIVNÍ RADIACE NA INDUKCI FOTOSYNTÉZY TERMOOPTICKÝ JEV
VLIV SPEKTRÁLNÍHO SLOŽENÍ FOTOSYNTETICKY AKTIVNÍ RADIACE NA INDUKCI FOTOSYNTÉZY TERMOOPTICKÝ JEV 1 Vladimír Špunda, 2 Otmar Urban, 1 Martin Navrátil 1 Přírodovědecká fakulta, Ostravská univerzita v Ostravě,
ABSTRAKT: Prezentace poskytuje informaci o aktuálních doporučeních z roku 2011 k hodnocení hladin 25 OH vitaminu, indikací k měření 25 OH vitaminu D a doporučených hodnotách denního příjmu dle věkových
4) Reprodukce rostlin
MBR1 2016 4) Reprodukce rostlin g) Tvorba semen h) Dozrávání embrya i) Vývoj endospermu 1 2 g) Tvorba semen Semeno krytosemenných: - embryo - endosperm - testa (obal) Vývoj embrya Globulární stádium 1
Kontrola genové exprese
Základy biochemie KBC/BC Kontrola genové exprese Inovace studia biochemie prostřednictvím e-learningu CZ.04.1.03/3.2.15.3/0407 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem
Respirace. (buněčné dýchání) O 2. Fotosyntéza Dýchání. Energie záření teplo BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3
Respirace (buněčné dýchání) Fotosyntéza Dýchání Energie záření teplo chem. energie CO 2 (ATP, NAD(P)H) O 2 Redukce za spotřeby NADPH BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3 oxidace produkující
RVR ) Vývoj květu a kontrola kvetení. d) Vznik gamet e) Mutace ve vývoji gametofytu f) Opylení, oplodnění
2015 6) Vývoj květu a kontrola kvetení 1 d) Vznik gamet e) Mutace ve vývoji gametofytu f) Opylení, oplodnění 2 d) Vznik gamet Životní cyklus rostliny Mikrosporogeneze Megasporogeneze Vývoj samčího gametofytu
Struktura a funkce biomakromolekul
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 10. Struktury signálních komplexů Ivo Frébort Typy hormonů Steroidní hormony deriváty cholesterolu, regulují metabolismus, osmotickou rovnováhu, sexuální funkce
Regulace metabolických drah na úrovni buňky
Regulace metabolických drah na úrovni buňky EB Obsah přednášky Obecné principy regulace metabolických drah na úrovni buňky regulace zajištěná kompartmentací metabolických dějů změna absolutní koncentrace
Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.
Toxikodynamika toxikodynamika (řec. δίνευω = pohánět, točit) interakce xenobiotika s cílovým místem (buňkou, receptorem) biologická odpověď jak xenobiotikum působí na organismus toxický účinek nespecifický
5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku. 5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku
5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku Zdroje dusíku dostupné v půdě: Amonné ionty + Dusičnany = největší zdroj dusíku v půdě Organický dusík (aminokyseliny, aminy, ureidy) zpracování
2) Reprodukce rostlin
1 2010 2) Reprodukce rostlin g) Tvorba semen h) Dozrávání embrya i) Klíčení semen Speciální číslo Plant Cell, vol. 216 (June 2004) Supplement, pp. S1 S245, zaměřené na Plant Reproduction (Reprodukce rostlin)
VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ
REGULACE APOPTÓZY 1 VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ Příklad: Regulace apoptózy: protein p53 je klíčová molekula regulace buněčného cyklu a regulace apoptózy Onemocnění: více než polovina (70-75%) nádorů
hormony a) Auxiny b) Brasinosteroidy c) Ethylen d) Kyselina abscisová (ABA) e) Kyselina salicylová (SA) f) Kyselina jasmonová (JA)
2015 3) Regulace růstu a vývoje rostlin hormony 1 a) Auxiny b) Brasinosteroidy c) Ethylen d) Kyselina abscisová (ABA) e) Kyselina salicylová (SA) f) Kyselina jasmonová (JA) 2 Vývoj organismu regulují signály
Regulace růstu a vývoje
Regulace růstu a vývoje REGULACE RŮSTU A VÝVOJE ROSTLINNÉHO ORGANISMU a) Regulace na vnitrobuněčné úrovni závislost na rychlosti a kvalitě metabolických drah, resp. enzymů a genů = regulace aktivity enzymů
Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození
Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození bunka - stejná genetická výbava - funkce (proliferace, produkce látek atd.) závisí na diferenciaci diferenciace tkán - specializovaná produkce
BUŇEČNÝ CYKLUS A JEHO KONTROLA
BUŇEČNÝ CYKLUS A JEHO KONTROLA MITOSA - fáze: Profáze - kondensace chromosomů - 30 nm chromatine fibres vázané na matrix Rozpad Metafáze - párové ( sesterské ) chromatidy - vázané centromerou, seřazené
Auxin univerzální vývojový signál v životě rostlin
Auxin univerzální vývojový signál v životě rostlin Jiří Friml Buchlovské preludium Na okraji Chřibských hor se nad úrodným údolím řeky Moravy tyčí středověký hrad Buchlov. Místní legenda vypráví, že r.
Regulace metabolizmu lipidů
Regulace metabolizmu lipidů Principy regulace A) krátkodobé (odpověď s - min): Dostupnost substrátu Alosterické interakce Kovalentní modifikace (fosforylace/defosforylace) B) Dlouhodobé (odpověď hod -
2) Reprodukce rostlin
1 2015 2) Reprodukce rostlin g) Tvorba semen h) Dozrávání embrya i) Klíčení semen MBR 2 g) Tvorba semen Semeno krytosemenných: - embryo - endosperm - testa (obal) Vývoj embrya Globulární stádium 1 buňka
AUG STOP AAAA S S. eukaryontní gen v genomové DNA. promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4. kódující oblast. introny
eukaryontní gen v genomové DNA promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4 kódující oblast introny primární transkript (hnrna, pre-mrna) postranskripční úpravy (vznik maturované mrna) syntéza čepičky AUG vyštěpení
AMPK AMP) Tomáš Kuc era. Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze
AMPK (KINASA AKTIVOVANÁ AMP) Tomáš Kuc era Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze 2013 AMPK PROTEINKINASA AKTIVOVANÁ AMP přítomna ve všech eukaryotních
Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78
Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78 Blok I Hormonální regulace vývoje rostlin Cvičení MB130C78: Růst a vývoj rostlin. Katedra experimentální biologie rostlin, PřF UK, Jan Petrášek Úlohy: 1. Pozitivní
VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ
FUNKCE PROTEINŮ 1 VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ Příklad: protein: dystrofin onemocnění: Duchenneova svalová dystrofie 2 3 4 FUNKCE PROTEINŮ: 1. Vztah struktury a funkce proteinů 2. Rodiny proteinů
IV117: Úvod do systémové biologie
IV117: Úvod do systémové biologie David Šafránek 29.10.2008 Obsah Spojitý deterministický model transkripční regulace Obsah Spojitý deterministický model transkripční regulace Schema transkripční regulace
PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY
PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY 1 VÝZNAM MEMBRÁNOVÝCH RECEPTORŮ V MEDICÍNĚ Příklad: Membránové receptory: adrenergní receptory (receptory pro adrenalin a noradrenalin) Funkce: zprostředkování
2) Reprodukce rostlin
1 2) Reprodukce rostlin 2015 2 d) Vznik gamet d) Vznik gamet e) Mutace ve vývoji gametofytu f) Opylení, oplodnění Životní cyklus rostliny Mikrosporogeneze Megasporogeneze 3 Vývoj samčího gametofytu - mikrosporogeneze
Bi8240 GENETIKA ROSTLIN
Bi8240 GENETIKA ROSTLIN Prezentace 02 Reprodukční vývoj Indukce kvetení doc. RNDr. Jana Řepková, CSc. repkova@sci.muni.cz 1. Indukce kvetení a tvorba květů 2. Tvorba reprodukčních orgánů a gamet 3. Opylení,
Laboratoř růstových regulátorů Miroslav Strnad. ové kultury. Olomouc. Univerzita Palackého & Ústav experimentální botaniky AV CR
Laboratoř růstových regulátorů Miroslav Strnad Tkáňov ové kultury Olomouc Univerzita Palackého & Ústav experimentální botaniky AV CR DEFINICE - růst a vývoj rostlinných buněk, pletiv a orgánů lze účinně
Mechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová
Mechanismy hormonální regulace metabolismu Vladimíra Kvasnicová Osnova semináře 1. Obecný mechanismus působení hormonů (opakování) 2. Příklady mechanismů účinku vybraných hormonů na energetický metabolismus
7. Regulace genové exprese, diferenciace buněk a epigenetika
7. Regulace genové exprese, diferenciace buněk a epigenetika Aby mohl mnohobuněčný organismus efektivně fungovat, je třeba, aby se jednotlivé buňky specializovaly na určité funkce. Nový jedinec přitom
Obecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 Obecný metabolismus. Regulace glykolýzy a glukoneogeneze (5). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie,
Genetická kontrola prenatáln. lního vývoje
Genetická kontrola prenatáln lního vývoje Stádia prenatáln lního vývoje Preembryonální stádium do 6. dne po oplození zygota až blastocysta polární organizace cytoplasmatických struktur zygoty Embryonální
INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II
INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II 1 VÝZNAM INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE V MEDICÍNĚ Příklad: Intracelulární signalizace: aktivace Ras proteinu (aktivace receptorové kinázy aktivace Ras aktivace kinázové kaskády
Apoptóza Onkogeny. Srbová Martina
Apoptóza Onkogeny Srbová Martina Buněčný cyklus Regulace buněčného cyklu 1. Cyklin-dependentní kináza (Cdk) cyclin Regulace buněčného cyklu 2. Retinoblastomový protein (prb) E2F Regulace buněčného cyklu
OBNOVA APIKÁLNÍ DOMINANCE NA KLÍČNÍCH ROSTLINÁCH HRACHU (Pisum sativum L.)
Úloha č. 18 Obnova apikální dominance na klíčních rostlinách hrachu - 1 - OBNOVA APIKÁLNÍ DOMINANCE NA KLÍČNÍCH ROSTLINÁCH HRACHU (Pisum sativum L.) OBECNÁ CHARAKTERISTIKA RŮSTOVÝCH KORELACÍ Jednotlivé
Regulace aktivity přenašečů auxinu z buňky
Regulace aktivity přenašečů auxinu z buňky Bakalářská práce Marie Martincová Katedra fyziologie rostlin PřFUK 2008 OBSAH 1. Úvod 2 2. Abstrakt a klíčová slova 3 3. Abstract and key words 4 4. Auxiny ve
Buněčný cyklus a molekulární mechanismy onkogeneze
Buněčný cyklus a molekulární mechanismy onkogeneze Imunofluorescence DAPI Přehled regulace buněčného cyklu Základní terminologie: Cycliny evolučně konzervované proteiny s homologními oblastmi; jejich
Bílkoviny a rostlinná buňka
Bílkoviny a rostlinná buňka Bílkoviny Rostliny --- kontinuální diferenciace vytváření orgánů: - mitotická dělení -zvětšování buněk a tvorba buněčné stěny syntéza bílkovin --- fotosyntéza syntéza bílkovin
Výskyt MHC molekul. RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. ajor istocompatibility omplex. Funkce MHC glykoproteinů
RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie, PřF UP Olomouc = ajor istocompatibility omplex Skupina genů na 6. chromozomu (u člověka) Kódují membránové glykoproteiny, tzv. MHC molekuly, MHC molekuly
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 LRR/OBBC LRR/OBB Obecná biologie Cíl přednášky Popis základních principů hormonální regulace růstu a vývoje živočichů a rostlin,
Detlef Weigel ( )
VORF-8 2015 Detlef Weigel (15. 12. 1961) 1 Max Planck Institute for Developmental Biology Department of Molecular Biology Spemannstrasse 37-39 D-72076 Tübingen Germany http://www.weigelworld.org/ Max Planck
Bakteriální transpozony
Bakteriální transpozony Transpozon = sekvence DNA schopná transpozice, tj. přemístění z jednoho místa v genomu do jiného místa Transpozice = proces přemístění transpozonu Transponáza (transpozáza) = enzym
PREZENTACE ANTIGENU A REGULACE NA ÚROVNI Th (A DALŠÍCH) LYMFOCYTŮ PREZENTACE ANTIGENU
PREZENTACE ANTIGENU A REGULACE NA ÚROVNI Th (A DALŠÍCH) LYMFOCYTŮ PREZENTACE ANTIGENU Podstata prezentace antigenu (MHC restrikce) byla objevena v roce 1974 V současnosti je zřejmé, že to je jeden z klíčových
ONKOGENETIKA. Spojuje: - lékařskou genetiku. - buněčnou biologii. - molekulární biologii. - cytogenetiku. - virologii
ONKOGENETIKA Spojuje: - lékařskou genetiku - buněčnou biologii - molekulární biologii - cytogenetiku - virologii Důležitost spolupráce různých specialistů při detekci hereditárních forem nádorů - (onkologů,internistů,chirurgů,kožních
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Bakalářská práce
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI Bakalářská práce Olomouc 2010 Martina Bednářová UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI Přírodovědecká fakulta Katedra buněčné biologie a genetiky Exprese auxin-binding proteinů
MBR ) Reprodukce rostlin. d) Vznik gamet e) Mutace ve vývoji gametofytu f) Opylení, oplodnění
MBR1 2015 4) Reprodukce rostlin 1 d) Vznik gamet e) Mutace ve vývoji gametofytu f) Opylení, oplodnění d) Vznik gamet Životní cyklus rostliny 2 Mikrosporogeneze Megasporogeneze Vývoj samčího gametofytu
Genetické mapování. v přírodních populacích i v laboratoři
Genetické mapování v přírodních populacích i v laboratoři Funkční genetika Cílem je propojit konkrétní mutace/geny s fenotypem Vzniklý v laboratoři pomocí mutageneze či vyskytující se v přírodě. Forward
Síra. Deficience síry: řepka. - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH
Síra řepka - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH - toxicita není příliščastá (nad 4000 mg SO 4 2- l -1 ), poškození může vyvolat SO 2 (nad 1-1,5 mg m 3 1 ) fazol Deficience síry:
7) Senescence a programová smrt buňky (PCD)
MBRO2 1 2018 7) Senescence a programová smrt buňky (PCD) c) Senescence a rostlinné hormony d) Vývojová PCD e) PCD a reakce rostlin ke stresu Nejnovější review: Obecné: Kast DJ, Dominguez R (2017) Current
6) Reakce rostlin k abiotickým stresům
MBRO2 1 2018 6) Reakce rostlin k abiotickým stresům f) Tepelný stres a tepelný šok g) Kyslíkový deficit Nejnovější review: Obecné: Flood PJ, Hancock AM (2017) Current Opinion in Plant Biology 36: 88-94
Průduchy regulace příjmu CO 2
Průduchy regulace příjmu CO 2 Průduchy: regulace transpiračního proudu / výměny plynů transpiration photosynthesis eartamerica.com Průduchy svěrací buňky - zavírání při ztrátě vody (poklesu turgoru) -
4) Reprodukce rostlin
MBR 1 2015 4) Reprodukce rostlin g) Tvorba semen h) Dozrávání embrya 2 g) Tvorba semen Semeno krytosemenných: - embryo - endosperm - testa (obal) Vývoj embrya Globulární stádium 1 buňka 2 buňky Meristém
Signalizace u rostlin I Signály, signální dráhy, auxiny a cytokininy
Fyziologie rostlin, LS 2013 Přednáška 5 Signalizace u rostlin I Signály, signální dráhy, auxiny a cytokininy Jan Petrášek, PřFUK Signalizace - dráždivost Bohumil Němec: Vztahy rostlin k vnějšímu světu,
Systém HLA a prezentace antigenu. Ústav imunologie UK 2.LF a FN Motol
Systém HLA a prezentace antigenu Ústav imunologie UK 2.LF a FN Motol Struktura a funkce HLA historie struktura HLA genů a molekul funkce HLA molekul nomenklatura HLA systému HLA asociace s nemocemi prezentace
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku)
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku) B I O L O G I E 1. Definice a obory biologie. Obecné vlastnosti organismů. Základní klasifikace organismů.
3) Senescence a programová smrt buňky (PCD)
1 2010 3) Senescence a programová smrt buňky (PCD) c) Senescence a rostlinné hormony d) Vývojová PCD e) PCD a reakce rostlin ke stresu Gray J (2003) Programmed Cell Death in Plants. University of Toledo,