Výsledky vědeckých skupin

Transkript

1 Výsledky vědeckých skupin STOPKA LAB Somatic mutation dynamics in MDS patients treated with azacitidine indicate clonal selection in patients-responders. Polgarova K, Vargova K, Kulvait V, Dusilkova N, Minarik L, Zemanova Z, Pesta M, Jonasova A and Stopka T. Oncotarget Dec 6. (IF 5.168) Modeling cancer driver events in vitro using barrier bypass-clonal expansion assays and massively parallel sequencing. Huskova H, Ardin M, Weninger A, Vargova K, Barrin S, Villar S, Olivier M, Stopka T, Herceg Z, Hollstein M, Zavadil J, Korenjak M. Oncogene Jul 10. (IF 7.519) MiR-155/miR-150 network regulates progression through the disease phases of chronic lymphocytic leukemia.vargova K, Pesta M, Obrtlikova P, Dusilkova N, Minarik L, Vargova J, Berkova A, Zemanova Z, Michalova K, Spacek M, Trneny M, Stopka T. Blood Cancer J Jul 21;7(7):e585. doi: /bcj (IF 6.126) The ISWI ATPase Smarca (Snf2h) Is Required for Proliferation and Differentiation of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells. Kokavec J, Zikmund T, Savvulidi F, Kulvait V, Edelmann W, Skoultchi AI, Stopka T. Stem Cells Mar 9. doi: /stem (IF 5.599) Plasma mir-155, mir-203, and mir-205 are Biomarkers for Monitoring of Primary Cutaneous T-cell Lymphomas. Dusilkova N, Basova P, Polivka J, Kodet O, Kulvait V, Pesta M, Trneny M, Stopka T. Int J Mol Sci Oct 15;18(10). pii: E2136. doi: /ijms (IF 3.226) Prediction Potential of Serum mir-155 and mir-24 for Relapsing Early Breast Cancer. Basova P, Pesta M, Sochor M, Stopka T. Int J Mol Sci Oct 10;18(10). pii: E2116. doi: /ijms (IF 3.226) Využití detekce somatických mutací pro pacienty s cytopenií nejasného významu a u myelodysplastického syndromu. Stopka T. Myelodysplastic Syndrome NEWS. Ročník 5 / Číslo 1 / květen AKUTNÍ MYELOIDNÍ LEUKEMIE NOVINKY Z KONFERENCE ENVROPSKÉ HAMATOLOGICKÉ SPOLEČNOSTI. Stopka T. Event Report z EHA 20107, Madrid. PETRÁK LAB An activating mutation of GNB1 is associated with resistance to tyrosine kinase inhibitors in ETV6-ABL1-positive leukemia. Zimmermannova O, Doktorova E, Stuchly J, Kanderova V, Kuzilkova D, Strnad H, Starkova J, Alberich-Jorda M, Falkenburg JHF, Trka J, Petrak J, Zuna J, Zaliova M. Eur J Heart Fail Apr;19(4): doi: /ejhf.640. (IF 7.519) Myocardial iron content and mitochondrial function in human heart failure: a direct tissue analysis. Melenovsky V, Petrak J, Mracek T, Benes J, Borlaug BA, Nuskova H, Pluhacek T, Spatenka J, Kovalcikova J, Drahota Z, Kautzner J, Pirk J, Houstek J. Eur J Heart Fail Apr;19(4): doi: /ejhf.640. (IF 6.968) Therapeutic potential of hepcidin - the master regulator of iron metabolism. Vyoral D, Jiri Petrak. Pharmacol Res Jan;115: doi: /j.phrs Review. PubMed PMID: (IF 4.480) Integral membrane proteins in proteomics. How to break open the black box? Vit O, Petrak J. J Proteomics Feb 5. pii: S (16)30361-X. doi: /j.jprot (IF 3.914) KOSTROUCH LAB Trichoplax adhaerens reveals an endocrine-like network sensitive to 9-cis-retinoic acid at the base of metazoan evolution. Novotný JP, Chughtai AA, Kostrouchová M, Kostrouchová V, Kostrouch D, Kaššák F, Kaňa R, Schierwater B, Kostrouchová M, Kostrouch Z. (2017). PeerJ Sep 29; 5:e3789. doi: /peerj (IF 2.177) The nematode homologue of Mediator complex subunit 28, F28F8.5, is a critical regulator of C. elegans development. Markéta Kostrouchová, David Kostrouch, Ahmed A Chughtai, Filip Kašák, Jan P. Novotný, Veronika Kostrouchová, Aleš Benda, Micheal W. Krause, Vladimír Saudek, Marta Kostrouchová. Zdeněk Kostrouch. PeerJ Jun 6;5:e3390. doi: /peerj (IF 2.177) Novel Mutation (T273R) in Thyroid Hormone Receptor ß Gene provides Firther Insight into Cryptic Negative Regulation by Thyroid Hormone. Kaššák F, Hána V, Saudek V, Kostrouchová M. Folia Biologica (Praha) 63, (2017).(IF 0.833) 1

2 Výsledky vědeckých skupin KRÁL LAB Methinium colorimetric sensors for the determination of cholesterol sulfate in an aqueous medium. Kejik Z, Havlik M, Briza T, Kaplanek R, Dolensky B, Kralova J, Martasek P, Kral V., Sensor Actuat B-Chem 245 (2017) doi: /j.snb [Epub ahead of print] (IF 5.401) Amino-substituted Tröger s base: electrochemical polymerization and characterization of the polymer film. Tatiana V Shishkanova, Martin Havlík, Vladimír Král, Dušan Kopecký, Pavel Matějka, Marcela Dendisová, Vladimír M. Mirsky. Electrochimica Acta 224 (2017) DOI: (IF 4.798) Optical probes and sensors as perspective tools in epigenetics. Kejík Z, Kaplanek R, Havlik M, Briza T, Jakubek M, Kralova J, Mikula I, Martasek P, Kral V. Bioorg Med Chem Apr 15;25(8): doi: /j.bmc (IF 2.930) Self-assembled chitosan-alginate polyplex nanoparticles containing temoporfin. Ingrid Brezaninova, Jiri Trousil, Zulfiya Cernochova, Vladimir Kral, Martin Hruby, Petr Stepanek, Miroslav Slouf. Colloid Polym Sci. Published online 07 January (IF 1.723) Dimethinium Heteroaromatic Salts as Building Blocks for Dual-Fluorescence Intracellular Probes, Bříza T., Králová J., Rimpelová S., Havlík M., Kaplánek R., Kejík Z., Reddy B., Záruba K., Ruml T., Mikula I., Martásek P., Král V., ChemPubSoc, 2017 Oct, doi: /cptc Water soluble chromone Schiff base derivatives as fluorescence receptor for aluminium(iii). Jakubek, M.; Kejik, Z.; Parchansky, V.; Kaplanek, R.; Vasina, L.; Martasek, P.; Kral, V., Supramol. Chem. 2017, Vol. 29, No. 1, 1-7. DOI: / (IF 1.264) Patenty / Užitné vzory Přihláška patentu PV : Nesymetrický derivát Trögerovy báze s tetramethiniovou substitucí a jeho použití, podáno , Havlík M., Bříza T., Kejík Z., Dolenský B., Kaplánek R., Rak J., Králová J., Šedo A., Martásek P., Král V. Přihláška patentu PV : Symetrický derivát Trögerovy báze s tetramethiniovou substitucí a jeho použití, podáno , Havlík M., Bříza T., Kejík Z., Dolenský B., Kaplánek R., Rak J., Králová J., Šedo A., Martásek P., Král V. Přihláška patentu PV : Nesymetrický derivát Trögerovy báze s dimethiniovou substitucí a jeho použití, podáno , Havlík M., Bříza T., Kejík Z., Dolenský B., Kaplánek R., Rak J., Králová J., Šedo A., Martásek P., Král V. Přihláška patentu PV : Kumarinový derivát Trögerovy báze s cyaninovou substitucí a jeho použití, podáno , Havlík M., Bříza T., Kaplánek R., Králová J., Martásek P., Král V. Užitný vzor číslo přihlášky s názvem Sada pro spektroskopické stanovení dodecylsíranu sodného ve vodném prostředí, CZ U1, , Jakubek M., Kejík Z., Bříza T., Král V., Martásek P. Užitný vzor číslo přihlášky s názvem Epigeneticky aktivní krmná směs pro strakatý skot s optimalizovanou koncentrací železa CZ U1, , Jakubek M., Kejík Z., Kaplánek R., Král V., Martásek P., Louma M. Užitný vzor číslo přihlášky s názvem Epigeneticky aktivní krmná směs pro strakatý skot s optimalizovanou koncentrací zinku? CZ 31307, , Kejík Z., Jakubek M., Král V., Martásek P., Louma M 2

3 Výsledky vědeckých skupin MIKULA LAB Optical probes and sensors as perspective tools in epigenetics. Kejík Z, Kaplanek R, Havlik M, Briza T, Jakubek M, Kralova J, Mikula I, Martasek P, Kral V. Bioorg Med Chem Apr 15;25(8): doi: /j.bmc (IF 2.930) KMOCH/ZIKÁNOVÁ LAB Autosomal Dominant Tubulointerstitial Kidney Disease. Bleyer AJ, Kidd K, Zivna M, Kmoch S. Adv Chronic Kidney Dis Mar;24(2): doi: /j.ackd (IF 2.703) Segregation of a novel p. (Ser270Tyr) MAF mutation and p.(tyr56*) CRYGD variant in a family with dominantly inherited congenital cataracts. Lubica Dudakova, Viktor Stranecky, Olga Ulmanova, Eva Hlavova, Marie Trkova, Andrea L. Vincent, Petra Liskova. Mol Biol Rep (2017) 44: ; doi: /s (IF 1.828) Elevated urinary CRELD2 is associated with endoplasmic reticulum stress-mediated kidney disease. Yeawon Kim, Sun-Ji Park, Scott R. Manson, Carlos A.F. Molina, Kendrah Kidd, Heather Thiessen-Philbrook, Rebecca J. Perry, Helen Liapis, Stanislav Kmoch, Chirag R. Parikh, Anthony J. Bleyer and Ying Maggie Chen, Journal of Clinical Investigation, Dec 2017; 2(23): e (IF ) Autosomal Dominant Tubulointerstitial Kidney Disease Due to MUC1 Mutation. Samuel Mon-Wei Yu, Anthony J. Bleyer, Kisra Anis, Leal Herlitz, Martina Živná, Helena Hůlková, Glen S. Markowitz, and Belinda Jim, American Journal od Kidney Diseases 2017, doi: /j.ajkd (IF 7.623) Thymidine kinase 2 and alanyl-trna synthetase 2 deficiencies cause lethal mitochondrial cardiomyopathy: case reports and review of the literature Mazurova S, Magner M, Kucerova-Vidrova V, Vondrackova A, Stranecky V, Pristoupilova A, Zamecnik J, Hansikova H, Zeman J, Tesarova M, Honzik T. Cardiol Young Jul;27(5): doi: /S (IF 0,905)

4 Výsledky vědeckých skupin SMETANA LAB How Signaling Molecules Regulate Tumor Microenvironment: Parallels to Wound Repair. Gál P, Varinská L, Fáber L, Novák Š, Szabo P, Mitrengová P, Mirossay A, Mučaji P, Smetana K. Molecules Oct 26;22(11). pii: E1818. doi: /molecules Review. (IF 2.861) Analysis of dermal fibroblasts isolated from neonatal and child cleft lip and adult skin: Developmental implications on reconstructive surgery. Zivicova V, Lacina L, Mateu R, Smetana K Jr., Kavkova R, Krejci Drobna E, Grim M, Kvasilova A, Borsky J, Strnad H, Hradilova M, Sachova J, Kolar M and Dvorankova B. Int. J. Mol. Med. 40: IJMM Dvorankova OA, Aug (IF 2.341) Ecology of melanoma cell. Lacina L, Kodet O, Dvorankova B, Szabo P, Smetana K Jr. Histol Histopathol Aug 29: doi: /HH (IF 2.025) Genome-wide Expression Profiling (with Focus on the Galectin Network) in Tumor, Transition Zone and Normal Tissue of Head and Neck Cancer: Marked Differences Between Individual Patients and the Site of Specimen Origin. Zivicova V, Broz P, Fik Z, Mifkova A, Plzak J, Cada Z, Kaltner H, Kucerova JF, Gabius HJ, Smetana K Jr. Anticancer Res May;37(5): (IF 1.895) Phenotypic characterization of oral mucosa: what is normal? Valach J, Foltán R, Vlk M, Szabo P, Smetana K Jr. J Oral Pathol Med Jan 31. doi: /jop (IF 1.859) MĚLKOVÁ LAB Current views on HIV-1 latency, persistence, and cure. Melkova Z, Shankaran P, Madlenakova M, Bodor J. Folia Microbiol (Praha) Jan;62(1): doi: /s (IF 1.335) (D) Shankaran P, Madlenakova M, Hajkova V, Jilich D, Svobodova I, Horinek A, Fujikura Y, Melkova Z. Effects of Heme degradation products on reactivation of latent HIV-1. Acta Virol Feb 6;61(1). doi: /av_2017_01_86. (IF 1.222) Patenty / Užitné vzory Přihláška patentu PV : Použití hem arginátu pro výrobu léčiva pro snížení velikosti latentního rezervoáru HIV-1 in vivo, podáno , Mělková Z., Jilich D., Madleňáková M., Martásek P. 4

5 Publikace 2016/2017 podle IF interní skupiny 30,86 22,89 19,48 16,12 10,39 9,40 5,19 4,06 2,

6 Publikace 2016/2017 podle IF externí skupiny 63,72 25,84 13,74 10,95 2,56 3,

7 Indikátory - Summary Ʃ AVG Stopka Lab 4 19, , ,2 Petrák Lab 3 10, , ,6 Král Lab 4 9,40 2/0 5 16,12 4/3 9 12,8 Kostrouch Lab ,19 5 2,6 Mikula Lab 1 4,01 1 2,93 2 3,5 Kmoch/ Zikánová Lab 9 63, , ,8 Smetana Lab 6 13, , ,6 Mělková Lab 1 0,83 2 2,56 1/0 3 1,7 Nečas Lab 1 3, ,7 N IF - počet impaktovaných publikací Ʃ IF - suma IF PT / počet podaných patentových přihlášek / počet podaných užitných vzorů 7

8 Granty vedené pod Biocevem a jejich režie v roce 2017 NS Grant Číslo grantu Částka celkem za grant Z toho režie 110 GAČR S Smetana ,00 Kč ,00 Kč 110 UNCE Smetana ,00 Kč ,00 Kč 110 AZV A Smetana ,00 Kč ,00 Kč 131 Mze QJ Král ,00 Kč ,00 Kč 131 GAČR S Král ,00 Kč ,00 Kč 131 GAČR S - Král ,00 Kč ,00 Kč 131 MPO FV20572 Král ,00 Kč ,00 Kč 131 GAČR S Stopka ,00 Kč ,00 Kč 131 UNCE Stopka ,00 Kč ,00 Kč 131 AZV A Stopka ,00 Kč ,00 Kč 131 Kontakt LH15170 Stopka ,00 Kč ,00 Kč 131 GAUK Paszeková ,00 Kč ,00 Kč 131 GAUK Kokavec ,00 Kč ,00 Kč 131 GAČR S Petrák ,00 Kč ,00 Kč 131 SVV Petrák ,00 Kč ,00 Kč 131 Interexcellence Petrák ,00 Kč ,00 Kč 131 SVV Kostrouch ,00 Kč ,00 Kč 650 GAČR G Kmoch ,00 Kč ,00 Kč 650 AZV A Zikánová ,00 Kč ,00 Kč 650 AZV A Kmoch ,00 Kč ,00 Kč 650 AZV A Kmoch ,00 Kč ,00 Kč 650 AZV Živná ,00 Kč ,00 Kč 131 NPU II LQ ,00 Kč ,00 Kč CELKEM ,00 Kč ,00 Kč

9 Celkové provozní náklady Biocev (plyn, el. energie, servis vzduchotechniky, úklidové služby, ostraha, mzdy provozního týmu Biocev) za rok 2017 celkem: Kč ,13 Vratka režií: Kč ,