Elektroforéza - I (v klasickém provedení)
|
|
- Radek Vacek
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Elektroforéza - I (v klasickém provedení) Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253
2 Elektroforéza B.D.Hames, D.Rickwood - Gel electrophoresis of proteins, Practical approach, IRL Press, 1981 Karger B., Snyder L.R., Horvath C. - An Introduction to Separation Sciece, John Wiley New York, 1973 Z. Deyl - Separation methods, Elsevier Science Publishing B.V., 1984 J.Zýka - Nové směry v analytické chemii, svazek 1, SNTL, 1983
3 Elektromigrační metody Elektromigrační separační metody jsou založeny na rozdílné pohyblivosti nabitých částic v stejnosměrném elektrickém poli Pohyb nabitých částic závisí na velikosti náboje, velikosti a tvaru molekul, na prostředí a síle elektrického pole. Velikost náboje ovlivňuje stupeň ionizace, iontová síla a ph prostředí. Základní principy Zásadní pojem je elektroforetická pohyblivost µ nabitého analytu Je definována jako rychlost částice v při jednotkovém potenciálovém spádu E, kde E je intenzita elektrického pole (napětí/vzdálenost, [V m -1 ]): µ = v E Pohyblivost částic je ovlivňována řadou faktorů, nejvýznamnější jsou: a) Fyzikálně chemické vlastnosti samotných částic jejich celkový náboj, velikost, tvar, disociovatelnost povrchových skupin, schopnost adsorpce iontů a polárních molekul, tvorba komplexů. Většinu těchto faktorů ovlivňuje prostředí, tj. ph, použité elektrolyty, iontová síla.
4 b) Vlastnosti prostředí elektrolyty používané v elektromigračních metodách jsou zpravidla tlumivé roztoky o dané koncentraci, iontové síle, vodivosti, ph, teplotě, viskozitě a permitivitě. Pohyblivost nabitých částic je dále ovlivňována i přítomnými neelektrolyty. Roztok elektrolytu klade při průchodu proudu určitý odpor, jeho velikost závisí na druhu, koncentraci elektrolytu a na konstrukci elektroforetického zařízení. Průchodem proudu se vyvíjí Jouleovo teplo a může dojít ke změnám vlastostí systému a dělených látek. c) Vlastnosti nosiče pohyblivost iontů je obvykle menší při použití nosiče ve srovnání s volnou elektroforézou. Migraci ovlivňují další faktory, elektroendoosmóza, prostorové vlivy nosiče, adsorpce atd. Velikost elektroendoosmózy závisí na druhu nosiče, potenciálovém spádu, iontové síle elektrolytu a ph. Nosičem bývá chromatografický papír, sorbenty, gely atd. d) Vlastnosti elektrického pole síla, homogenita, stabilita, změny ph vlivem elektrolytických dějů na elektrodách a Jouleovo teplo ovlivňují rychlost migrace a ostrost dělení.
5 Elekroforéza se dělí na volnou elektroforézu a elektroforézu na nosičích Užití nosičů má ve srovnání s volnou elektroforézou tu výhodu, že umožňuje snížení negativního vlivu zahřívání systému průchodem proudu na separaci a zmenšuje rozmývání zón, ke kterému dochází vlivem difúze Podle experimentálního uspořádání lze elektroforetické metody rozdělit následujícím způsobem: Elektroforéza s pohyblivým rozhraním Zónová elektroforéza Izoelektrická fokusace Izotachoforéza
6 Elektroforéza s pohyblivým rozhraním Směs separovaných složek (smíchaná se základním elektrolytem) je rozptýlena v tak veliké části separační kolony/prostoru, že při dané délce kolony nedojde k úplné separaci složek směsi Prvá zóna obsahuje nejpohyblivější složku vzorku, pak následuje směsná zóna dvou nejrychlejších složek, atd., na konci je čistá nejpomalejší složka Hranice mezi zónami jsou hlavně určeny koncentracemi a efektivními mobilitami složek vzorku a volbou anodického a katodického pufru Hranice na obou stranách mohou být zónově elektroforické nebo izotachoforetické podle elektroforetické mobility anodického a katodického pufru a složek vzorku Metoda je užívána jen omezeně, např. pro testování čistoty substancí Hranice zón jsou detekovány fotometrickým a vodivostním detektorem Dělení probíhá většinou v úzké trubici
7
8 Zónová elektroforéza Jednotlivé látky vzorku jednorázově nanesené do určitého místa separačního média (např. kolony) putují po vložení elektrického pole na systém podle své efektivní pohyblivosti různou rychlostí k příslušné elektrodě, současně se dělí kationty i anionty Látky vzorku se rozdělují a vytvářejí v základním elektrolytu samostatné zóny Během separace šířka zón roste a maximální koncentrace látek v nich klesá Dvojice látek o velmi blízké efektivní pohyblivosti se plně nerozdělí ani po velmi dlouhé době Jelikož je nutno zóny stabilizovat, používají se často nosiče
9 1. Papírová elektroforéza Jedna z prvních elektromigračních technik, první práce v roce 1950 Není ideální pro separace bílkovin a nukleových kyselin a dalších velkých molekul, spíše se užívá pro dělení nízkomolekulárních látek Dnes na ústupu ve srovnání s dalšími technikami Přístroje jsou konstruovány pro nízké nebo vysoké napětí, s horizontálním nebo vertikálním uspořádáním
10 Přístroje s nízkým napětím 1. Horizontální uspořádání Dvě elektrody v elektrolytu, odděleny diafragmou od separačního prostoru Systém je uzavřen pro zamezení odpařování pufrů Pruh papíru je horizontálně umístěn mezi skleněnými nebo nylonovými tyčemi, konce papíru jsou stejnoměrně ponořeny do elektrolytu, který je v obou nádobách ve stejné výšce k potlačení sifonového efektu
11 2. Vertikální uspořádání Papír je zformován do tvaru inverzního písmene V Podpůrná konstrukce je zhotovena ze skla nebo umělé hmoty odolné k pufrům Zařízení je uzavřeno k omezení odpařování
12 V obou uspořádáních: Potenciálový gradient je menší než 20 V/cm Není třeba dodatečné chlazení Elektrody obvykle platinové, případně Ag, grafit, Pd atd., podle pracovního elektrolytu Vzorek je aplikován ve formě skvrny nebo proužku Po elektroforéze je papír vyjmut, vysušen při 100 C v sušárně
13 Přístroje s vysokým napětím Potenciálový gradient 20 až 200 V/cm Výhody: Krátké doby analýz Lepší rozlišení Řada separací je nedosažitelná při nízkém napětí Nezbytné je intenzivní chlazení systému, používají se dva systémy chlazení
14 a) První systém chlazení: Proužek filtračního papíru je ponořen do nemísitelné nevodivé kapaliny (CCl 4, chlorbenzen, heptan, apod.), která je chlazena chladící smyčkou b) Druhý systém chlazení: Filtrační papír je vložen mezi dvě chlazené kovové (hliníkové) desky Chlazení je prováděno vodou Filtrační papír je izolován od chladících desek polyethylenovými destičkami
15 Dvourozměrné separace Technika má několik modifikací: 1. Dvourozměrná elektroforéza ve dvou po sobě následujících krocích ve vzájemně kolmých směrech 2. Elektroforéza v jednom směru kombinovaná s následnou chromatografií v kolmém směru 3. Separace v jednom kroku za současného působení dvou sil vzájemně kolmých 1. Dvourozměrná elektroforéza by neposkytovala lepší rozlišení pokud by nebyla provedena po prvním kroku jistá chemická reakce měnící náboj určitých složek směsi. Látky modifikované reakcí pak nejsou po následujícím druhém kroku (druhé elektroforéze) na diagonále. Příklad Peptidy-redukce disulfidických vazeb, enzymatická změna některých aminokyselin 2. Elektroforéza v kombinaci s chromatografií v kolmém směru byla užita pro fingerprinting proteinů, zejména pro odlišení dvou podobných proteinů
16
17 3. Např. Kontinuální elektroforéza Curtain electrophoresis Filtrační papír je umístěn vertikálně a shora je přiváděn elektrolyt Kolmo na směr toku je vloženo napětí Vzorek je kontinuálně vnášen ve formě malé skvrny na horní část papíru Složky jsou separovány kontinuálně, vytvářejí angulární profil Metoda je dnes častěji prováděna na základě vytvoření filmu pufru bez nosiče (papíru) mezi paralelními deskami, tok je stabilizován viskozitou pufru. Použití je především spojeno s dělením buněk, mitochondrií, mikrozomů a dalších biologicky významných partikulárních částic Metoda má preparativní význam
18
19 2. Elektroforéza na membránách na bázi celulózy, acetátu celulózy a nitrocelulózy Výhodou těchto nosičů je nižší adsorpce analytů, a tím menší chvostování ve srovnání s elektroforézou na filtračních papírech Přístrojové uspořádání je obdobné jako pro papírovou elektroforézu 3. Tenkovrstvá elektroforéza Granulovaný materiál je nanesen na desku, kde vytvoří uniforně silnou vrstvu Používá se prášková celulóza, granulovaný škrob, alumina, silikagel, polyvinyl chlorid a další syntetické polymery, skleněná vlákna atd. Metoda vhodná pro preparativní dělení, po elektroforéze se obarví úzký pruh a pak se blok rozdělí a jednotlivé složky získají např. filtrací
20 4. Elektroforéza na gelech 4.1 Elektroforéza na škrobovém gelu První užití elektroforetického děje současně s uplatněním sítového efektu V současnosti většinou nahrazena elektroforézou na polyakrylamidových gelech 4.2 Elektroforéza na polyakrylamidovém gelu Tyto gely nejen omezují difúzi, ale mohou se podílet na separaci interakcí s analyty Na polyakrylamidové gely lze pohlížet jako na porézní média, ve kterých je velikost pórů srovnatelná s velikostmi dělených látek (často proteinů a jiných makromolekul) Dělení je pak uplatněním sítového efektu závislé nejen na nábojové hustotě analytu (tj. poměru náboj/hmotnost), ale i na velikosti molekul Tj. dva proteiny odlišné relativní molekulové hmotnosti se stejnou nábojovou hustotou budou pravděpodobně nepříliš dobře odděleny papírovou elektroforézou, ale mohou být dobře děleny na polyakrylamidovém gelu díky sítovému efektu, jenž zpomaluje pohyb většího proteinu vzhledem k proteinu menšímu
21 Polyakrylamidový gel je chemicky inertní, stabilní v širokém rozmezí ph (3 až 10), teploty a iontové síly Velikost pórů gelu je nastavitelná v širokém rozmezí (na rozdíl od škrobových gelů) Hustota a stupeň zesítění jsou podstatné pro výsledné vlastnosti Chemická struktura: gel se připravuje polymerací akrylamidu v přítomnosti bifunkčního síťovadla N,N -methylen bisakrylamidu. Jako polymerační iniciátor se uplatňuje persíran ammoný nebo riboflavin (iniciace světlem), pro katalýzu polymerace se užívá N,N,N,N -tetramethylethylendiamin Efektivní velikost pórů: nejčastěji používané koncentrace jsou v rozmezí 5-20% (limitně 3-30%) akrylamidu s 3-5% síťovadla. Dělit lze peptidy a bílkoviny v rozmezí od Da do ~ Da
22
23 Formát gelu: Tyčinka (rod) nebo deska (slab) Tyčinky: rozměry ~ x 5 mm Desky: rozměry ~ mm délka, mm šířka, 1-3 mm tloušťka Výhody tyčinkového formátu ve srovnání s deskovým formátem: Větší kapacita gelu Lze snadněji testovat mnoho různých separačních podmínek najednou, např. hledání nejvhodnějšího ph atd. Dvoudimenzionální dělení, první dimenze na tyčince Výhody deskového formátu ve srovnání s tyčinkovým formátem: Více vzorků (~ 25) lze dělit najednou vedle sebe, příprava gelu je jednodušší Společně se vzorky je možno separovat i standardy za totožných podmínek Teplo je snadněji odváděno Obdélníkový tvar gelu umožňuje snadné denzitometrické vyhodnocování
24 Disociující a nedisociující systémy pufrů Většina studií užívající zónovou elektroforézu bílkovin na polyakrylamidových gelech užívá pufry vedoucí k disociaci všech proteinů na jednotlivé podjednotky Nejčastěji je používán detergent SDS (dodecylsulfát sodný) Vzorek je denaturován teplotou 100 C v přítomnosti SDS a thiolového reagentu k redukci disulfidických můstků Při uvedených podmínkách většina polypeptidů váže SDS v konstantném hmotnostním poměru 1,4 g na 1 g polypeptidu Vnitřní náboj polypeptidu je nepodstatný ve srovnání s negativním nábojem SDS navázaným na polypeptid SDS-polypeptidové komplexy mají stejnou nábojovou hustotu a postupují v polyakrylamidovém gelu vhodné velikosti pórů výhradně podle molekulových hmotností SDS-PAGE Zónová elektroforéza nativních proteinů s použitím nedisociujících purfů je vhodná tehdy, když je cílem zachovat interakce podjednotek, přirozenou konformaci a biologickou aktivitu
25 Kontinuální a diskontinuální systém pufrů Kontinuální pufry Zonová elektroforéza za užití stejného pufru ve vzorku, elektrodovém prostoru a v gelu (někdy v různých koncentracích) při stejném ph je označována jako elektroforéza s kontinuálním pufrem Vzorek je dávkován přímo na gel, ve kterém dochází k dělení Póry gelu jsou vhodné velikosti, aby došlo k dělení podle velikosti Diskontinuální pufry Zonová elektroforéza za užití různých iontů a různého ph v elektrodových pufrech a v gelech se nazývá elektroforéza s diskontinuálním systémem pufrů Vzorek je nanášen do stacking zaostřujícího gelu zpolymerovaného ve vrchní části nízkoporézního dělícího gelu Nejpodstatnější výhoda diskontinuálního uspořádání je možnost dávkovat velké objemy relativně zředěných bílkovin při zachování vysokého rozlišení Důvodem tohoto faktu je skutečnost, že při postupu bílkovin zaostřovacím gelem vytvoří bílkoviny velmi úzké zóny na začátku dělicího gelu
26
27 Objasnění zaostření zóny vzorku Ornstein a Davis Slabá kyselina, glycin, je za ph blízkého pk a hodnotě jen částečně disociována. Jen část molekul bude záporně nabita. Pokud x vyjadřuje frakci disociovaných, záporně nabitých molekul, pak efektivní pohyblivost částečně nabité látky je rovna součinu µ*x, kde µ je pohyblivost nabité částice. Rychlost migrace částečně nabité látky je pak rovna součinu E*µ*x, kde E je intenzita elektrického pole. Iont s nižší pohyblivostí se tedy může pohybovat stejnou rychlostí jako iont s vyšší pohyblivostí, za podmínky, že součiny E*µ*x jsou totožné. V Ornstein a Davis systému obsahuje vzorek a zaostřovací gel Tris- HCl pufr, zatímco horní elektrodový prostor obsahuje Tris-glycin pufr. Při ph vzorku a zaostřovacího gelu ph=6,7 je glycin málo disociován a efektivní pohyblivost je malá. Chloridové ionty mají podstatně větší pohyblivost při tomto ph a proteiny mají pohyblivost mezi pohyblivostmi glycinu a Cl - za daných podmínek. V okamžiku, kdy je vloženo napětí, migrují chloridové ionty od glycinu nechávaje za sebou zónu s nízkou vodivostí. Protože je vodivost nepřímo úměrná intenzitě elektrického pole, získá tato zadní zóna větší gradient napětí, který urychluje glycin a ten proto dostihuje chloridy. Je dosaženo stabilního stavu, kdy tyto nabité látky vytváří velmi úzké rozhraní a pohybují se stejnou rychlostí. Jak se toto rozhraní pohybuje skrz vzorek a zaostřující gel, gradient nízkého napětí postupuje před pohyblivým rozhraním a gradient vysokého napětí postupuje za pohyblivým rozhraním.
28 Každá bílkovina před pohyblivým rozhraním v oblasti gradientu nízkého napětí je předbíhána chloridový ionty, protože chloridové ionty mají vyšší pohyblivost než bílkoviny. Za pohyblivým rozhraním, v oblasti vysokého gradientu napětí mají bílkoviny vyšší pohyblivost než glycin, a proto migrují rychleji. V důsledku těchto jevů se bílkoviny koncentrují v úzké zóně silné několik mikrometrů v pořadí klesající pohyblivosti. Poslední bílkovina je následována glycinem. Koncentrace proteinu na pohyblivém rozhraní závisí pouze na koncentraci Tris-HCl pufru ve vzorku a zaostřovacím gelu. Síla vrstvy vzorku po zakoncentrování je závislá na celkovém množství proteinu aplikovanéno na gel. Zaostřovací gel je tvořen velkými póry a nedochází na něm k sítovému efektu. Jakmile pohyblivé rozhraní dosáhne rozhraní mezi zaostřovacím gelem a dělícím gelem, hodnota ph značně stoupne a glycin je výrazně disociován. Tím dojde k nárůstu efektivní pohyblivosti glycinu, glycin předběhne bílkoviny a začne migrovat těsně za chloridovými ionty. Současně velikost pórů dělicího gelu významně klesne a začne docházet k zpomalování proteinů sítovým efektem. Oba efekty vedou k vytvoření samostatných zón proteinů, které postupují na základě vnitřního náboje a molekulové hmotnosti. Vzhledem k dosahování vysokého rozlišení v případě diskontinuálních pufrů, SDS-diskontinuální systém je obvykle užíván pro dělení směsí proteinů za disociujících podmínek.
29
30 Volba ph Polyakrylamidový gel je stabilní v rozmezí ph 3 až 10 Pro SDS-PAGE SDS-polypeptidových komplexů platí, že jsou negativně nabity v širokém rozmezí ph. Hodnota ph kontinuálního SDS-fosfátového pufru proto není kritická. Pro diskontinuální SDS-fosfátový pufr je ph důležité jen k vytvoření zaostřené zóny vzorku (viz dříve). Pokud jsou děleny nativní proteiny v nedisociujících pufrech, je hodnota ph podstatná. ph ovlivňuje náboj, stabilitu a aktivitu proteinu. Musí být tedy voleno ph, které splňuje požadavky na stabilitu a aktivitu proteinu. Ve vymezené oblasti ph se dále volí kompromis mezi dvěma protichůdnými kriterii. Čím dále je ph od izoelektrického bodu (pi), tím větší je náboj proteinu a tím kratší doba elektroforézy a menší rozmytí zón, ale na druhou stranu, čím je ph blíže pi, tím je větší předpoklad zlepšeného dělení proteinů.
31 Volba koncentrace gelu Koncentrace gelu hraje velmi podstatnou úlohu pro dělení Nevhodná koncentrace gelu může vést k úplné exkluzi proteinů (nemohou vstoupit do hustého gelu) nebo naopak k migraci proteinů s čelem (neuplatní se sítový efekt). Při hledání vhodné koncentrace gelu se prakticky postupuje dvěma alternativními způsoby: 1. Analýza při 7,5% akrylamidu, pak gely v rozpětí 5% - 15%. 2. Pro SDS-PAGE je doporučováno užít vzrůstající koncentrační gradient akrylamidu ve směru migrace proteinů. Gradient má především dvě výhody: Dělí proteiny s širším rozmezím molekulových hmotností Gradient velikosti pórů zaostřuje získané zóny Při hledání optimálních podmínek pro dělení dvou proteinů se používají tzv. Fergusonovy závislosti Závislosti log R f versus %T, kde je R f relativní mobilita a %T je koncentrace gelu (celková procenta monomeru, tzn. gramy akrylamidu a bisakrylamidu/100 ml) migrační vzdálenost proteinu R f = migrační vzdálenost barviva (barvivo - bromfenolová modř)
32
33 Každá Fergusonova závislost je charakterizována sklonem K R a úsekem Y 0 K R Fergusonovy závislosti je měřítkem retardace proteinu gelem, K R je retardační koeficient, který má vztah k velikosti molekuly. Úsek Y 0 je měřítkem mobility proteinu při volné elektroforéze. Podle Rodbarda se rozlišují čtyři skupiny separačních problémů v souvislosti s Fergusonovými závislostmi: Případ A Proteiny mají identickou nábojovou hustotu a vykazují identickou mobilitu ve volném roztoku. V polyakrylamidovém gelu se pohybují výhradně podle velikosti. Platí pro většinu SDSdenaturovaných proteinů. Případ B Protein s větší mobilitou ve volném roztoku má zároveň menší molekulovou hmotnost. Efekty jsou synergické. Zvýšení separace je dosaženo zvýšením %T. Případ C Větší protein má větší mobilitu ve volném roztoku. Efekty jsou antagonistické. Toto chování bývá pozorováno u nedisociačních systémů. Případ D Proteiny mají stejnou velikost ale odlišnou mobilitu ve volném roztoku. Změna koncentrace akrylamidového gelu nemá vliv na relativní rozdělení proteinů. Pro dělení je vhodnější elektrofokusace nebo izotachoforéza.
34 Určení molekulové hmotnosti Nativní proteiny Dělení probíhá současně na základě nábojové hustoty a velikosti molekul Ve Fergusovných závislostech je vliv náboje eliminován tak, že K R je měřítkem pouze velikosti molekuly Mezi K R a molekulovou hmotností existuje lineární vztah Použití série proteinů o známé molekulové hmotnosti vede ke zjištění příslušných hodnot K R a ke konstrukci závislosti K R na molekulové hmotnosti V případě nativních proteinů je problémem ta skutečnost, že uvedená jednoduchá závislost platí pouze pokud jsou standardy užité ke kalibraci podobného tvaru, přibližně stejné hydratace a parciálního specifického objemu Denaturované proteiny Elektroforéza v přítomnosti SDS po redukci proteinů (2-merkaptoethanol) je v současnosti preferovanou metodou Detergent SDS eliminuje konformační a nábojové rozdíly mezi proteiny a snižuje vliv hydratace Proteiny migrují jen podle molekulových hmotností
35 Vztah logaritmu molekulových hmotností proteinů na jejich vzdálenosti migrace nebo R f je lineární Molekulová hmotnost daného proteinu se získá pomocí kalibrační křivky Linearita je platná jen v jistém rozmezí molekulových hmotností Lineární závislostí s užitím SDS-diskontinuálního systému pufrů platí v následujících mezích: 15% akrylamid, molekulová hmotnost % akrylamid, molekulová hmotnost % akrylamid, molekulová hmotnost Mnohé glykoproteiny vykazují anomální chování, pravděpodobně se SDS váže jen k proteinové části molekuly, získají se zkreslené-vyšší molekulové hmotnosti Ovšem molekulové hmotnosti obdržené SDS-PAGE metodou poskytují molekulové hmotnosti podjednotek proteinu a ne nativního proteinu, pokud je oligomerní
36
37
38 Koncentračně gradientové gely Polyakrylamidové gely s rostoucí koncentrací akrylamidu, tzn. klesající velikostí porů Použití velmi často jak pro analýzu směsí proteinů tak pro stanovení molekulové hmotnosti metodou SDS-PAGE Gradienty jsou lineární nebo konkávní, limit je ~ 3-30% akrylamidu Při gradientovém dělení protein postupuje až do místa, kde velikost póru zabrání dalšímu pohybu, poloha pásu je pak dále téměř nezávislá na čase, migrace tedy neustane zcela, ale je velmi omezena Možnost měřit molekulové hmotnosti v širokém rozmezí Velmi ostré zóny Nedisociující pufry jsou používány na gradientových gelech při dělení nativních proteinů v menší míře Pro lineárně koncentrační gradienty platí lineární vztah mezi logaritmem molekulových hmotností a logaritmem koncentrací polyakylamidu %T, případně R f
39 Pro gradientové gely existují rozsahy molekulových hmotností, pro které platí lineární závislosti mezi logaritmem molekulových hmotností a log %T: 7-25 %T(C Bis =1%), rel. mol. hm. ~ %T(C Bis =2.6%), rel. mol. hm. ~ %T(C Bis =8.4%), rel. mol. hm. ~ Všechny gradienty mají výrazně širší rozsah molekulových hmotností ve srovnání s negradientovými systémy Glykoproteiny nevykazují žádné anomálie při použití SDS- PAGE s gradientovým gelem
40
41
42
43
44
45
46 Nehledě na výhody gradentového gelu, je třeba zdůraznit, že pokud je třeba dělit dva proteiny s podobnou molekulovou hmotností, dosahuje se lepšího rozlišení na uniformních (negradientových) gelech s optimální porozitou. 4.3 Elektroforéza na agarózovém gelu Póry agarózového gelu jsou velké, většina proteinů se dělí na základě nábojové hustoty, sítový efekt se neuplatňuje Rozlišení je většinou nižší než na polyakrylamidovém gelu Agarózové gely se používají především pro dělení velkých molekul a komplexů, které se nedají separovat na polyakryamidových gelech, tzn. například enzymových komplexů, virů, buněčných komponent, vybraných nukleových kyselin Agarózové gely mají využití v imunoelektroforéze, kde je spojena zónová elektroforéza s imunologickou detekcí a kvantifikací
47 4.4 Elektroforéza na kompozitním gelu agaróza-polyakrylamid Užití polyakrylamidových gelů je omezeno velikostí molekul, horní limit je kolem 10 6 rel. molekulové hmotnosti Polyakrylamidové gely s celkovou koncentrací monomerů pod 2.2% nemohou být vůbec připraveny (nedojde ke gelaci polymeru) Gely do 3% jsou obtížně použitelné a téměř viskózní Přídavek agarózy 0.5% zvyšuje mechanickou stabilitu při dělení např. ribozómů, polyribozómů a vybraných virů Kompozitní gely mohou být kalibrovány vhodnými standardy a užity pro určování molekulových hmotností velmi velkých molekul
48 Detekční techniky Detekce s využitím UV záření Monomerní akrylamid má UV absorpční pík na 280 nm, který se snižuje polymerací Polyakrylamidový gel má relativně nízký absorpční koeficient při 270 nm, v gelu tedy nesmí být přítomen monomer Nukleové kyseliny mají vysoké absorpční koeficienty, které nezávisí na složení bází, mohou být snadno detekovány jak v agaru, tak v polyakrylamidovém gelu při 260 nm Proteiny mají při 280 nm podstatně nižší absorpční koeficienty než nukleové kyseliny při 260 nm, kromě toho je absorpční koeficient pro každý protein závislý na jeho složení (na absorpčních koeficientech aminokyselin) Ke skenování gelů se používají speciální densitometry
49 Detekce s využitím fluorescence Lze použít dva přístupy: 1. Separované látky jsou označeny fluorescenční značkou 2. UV absorbující látka je vizualizována jako tmavý pás v matrici, ke které byl přidán fluorescenční chromofor, tj. fluorescenční zhášení Polyakrylamidový gel je sám o sobě fluorescenční materiál, fluorescence se objevuje při excitaci pomocí vlnové délky 280 nm nebo 340 nm, tyto vlnové délky jsou velmi blízké excitačním vlnovým délkám nativních a dansyl chloridem značených proteinů Na druhou stanu polyakrylamidový gel vykazuje největší fluorescenční emisi při 340 nm a nm, to jsou oblasti dostatečně mimo emisní maxima nativních i dansyl chloridem značených proteinů Kromě toho byly vyvinuty postupy přípravy polyakrylamidových gelů vedoucí k nefluoreskujícím gelům
50 Detekce barvením Barvení makromolekul vhodným barvivem je nejpoužívanější metoda detekce v gelové elektroforéze Barvivo musí být pevně vázáno na separovanou makromolekulu, a přitom slabě interagovat se stabilizačním médiem Barvivo může být selektivní, tj. obarvuje pouze danou skupinu makromolekul, nebo může obarvovat několik skupin látek současně Postup detekce je relativně jednoduchý: elektroforeogram je ponořen do barvící látky na jistou dobu, pak je nadbytek barviva nenavázaného na separované látky vymyt. Protože difúze se začne projevovat ihned po proběhnutí elektroforézy, doporučuje se buď vysrážet proteiny na gelu nebo gel vysušit. Lze užít i přídavku fixujícího činidla do barvící lázně. Odbarvování, vymývání nadbytečného, nenavázaného barviva je obvykle nejdéle trvající krok Nejužívanější barviva: Coomassie Brilliant Blue, Amido Black Barvení stříbrem je metoda ultrasenzitivní
51 Detekce měřením radioaktivity Pokud jsou separované látky radioaktivně značeny, lze využít k jejich detekci registrování aktivity Autoradiografie: Suchý gel, acetát celulózy, filtrační papír je překryt filmem citlivým na záření, po jisté době je vyvolán a oblasti radioaktivního materiálu jsou vizualizovány Kromě autoradiografie jsou užívány také citlivější postupy (100 až x), založené na pozičně citlivých počítačích při detekci např. 32 P, 14 C, Dále se užívají kapalinové scintilační počítače - především pro měření měkkých beta zářičů 3 H, 14 C, 35 S
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
VíceElektromigrační metody
Elektromigrační metody Princip: molekuly nesoucí náboj se pohybují ve stejnosměrném elektrickém Arne Tiselius rozdělil proteiny krevního séra na základě jejich rozdílných rychlostí pohybu v elektrickém
Vícelaktoferin BSA α S2 -CN α S1 -CN Popis: BSA bovinní sérový albumin, CN kasein, LG- laktoglobulin, LA- laktalbumin
Aktivita KA 2340/4-8up Stanovení bílkovin v mléce pomocí SDS PAGE (elektroforéza na polyakrylamidovém gelu s přídavkem dodecyl sulfátu sodného) vypracovala: MVDr. Michaela Králová, Ph.D. Princip: Metoda
VíceVizualizace DNA ETHIDIUM BROMID. fluorescenční barva interkalační činidlo. do gelu do pufru barvení po elfu SYBR GREEN
ETHIDIUM BROMID fluorescenční barva interkalační činidlo do gelu do pufru barvení po elfu Vizualizace DNA SYBR GREEN Barvení proteinů Coommassie Brilliant Blue Coomassie Blue x barvení stříbrem Porovnání
VíceIMUNOANALÝZA elektroforetické separační metody. 3. ročník Klinická biologie a chemie
IMUNOANALÝZA elektroforetické separační metody 3. ročník Klinická biologie a chemie Princip elektroforézy I. Separační metoda využívající různé pohyblivosti různých iontů (složek směsi) ve stejnosměrném
VíceSDS polyakrylamidová gelová elektroforéza (SDS PAGE)
SDS polyakrylamidová gelová elektroforéza (SDS PAGE) Princip SDS polyakrylamidová gelová elektroforéza slouží k separaci proteinů na základě jejich velikosti (molekulové hmotnosti). Zahřátím vzorku za
VíceAPLIKOVANÉ ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
APLIKOVANÉ ELEKTROMIGRAČNÍ METODY Princip: migrace elektricky nabitých částic v elektrickém poli Druhy iontů: +, -, obojaký (zwitterion), vícenásobný Typy migrace: a) přímá migrují ionty analytů b) nepřímá
VíceELEKTROFORETICKÁ SEPARACE NUKLEOVÝCH KYSELIN
ELEKTROFORETICKÁ SEPARACE NUKLEOVÝCH KYSELIN Fragmenty nukleových kyselin lze dle jejich velikosti rozdělit elektroforézou. Elektroforéza využívá rozdílné pohyblivosti jednotlivých fragmentů, danou právě
VícePříprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253
Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Část 16 Iontová chromatografie Iontová chromatografie je speciální technika vyvinutá pro separaci anorganických iontů a organických
VíceELEKTROFORETICKÉ METODY
ELEKTROFORETICKÉ METODY ELEKTROFORETICKÁ SEPARACE AMINOKYSELIN NA PAPÍROVÉM NOSIČI Aminokyseliny lze rozdělit elektroforézou na papíře. Protože molekulová hmotnost jednotlivých aminokyselin není příliš
VíceElektroforéza - II (v klasickém provedení) Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253
Elektroforéza - II (v klasickém provedení) Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Imunoelektroforéza Obvykle dvourozměrná elektroforéza na agarózových gelech V prvním rozměru
VíceInovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie CZ.1.07/2.2.00/
Dělení bílkovin pomocí diskontinuální elektroforézy v polyakrylamidovém gelu (PAGE) Při elektroforéze dochází k pohybu (migraci) iontů v elektrickém poli. Elektroforetické metody se tedy používají k separaci
VíceElektroforéza v přítomnosti SDS SDS PAGE
Elektroforéza v přítomnosti SDS SDS PAGE Elektroforéza v přítomnosti SDS SDS PAGE je jednoduchá, rychlá a reprodukovatelná metoda pro kvalifikovanou charakterizaci a srovnání bílkovin.tato metoda separuje
VíceIZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
VíceDETEKTORY pro kapalinovou chromatografii. Izolační a separační metody, 2018
DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii Izolační a separační metody, 2018 Detektory v kapalinové chromatografii Typ detektoru Zkratka Měřená veličina Refraktometrický detektor RID index lomu Spektrofotometrický
VíceAnalýza aniontových tenzidů v čisticích prostředcích kapilární elektroforézou
Analýza aniontových tenzidů v čisticích prostředcích kapilární elektroforézou Úkol: Pomocí kapilární elektroforézy v nevodném prostředí semikvantitativně stanovte vybrané aniontové tenzidy v čisticím prostředku.
VíceCHROMATOGRAFIE ÚVOD Společný rys působením nemísících fází: jedna fáze je nepohyblivá (stacionární), druhá pohyblivá (mobilní).
CHROMATOGRAFIE ÚOD Existují různé chromatografické metody, viz rozdělení metod níže. Společný rys chromatografických dělení: vzorek jako směs látek - složek se dělí na jednotlivé složky působením dvou
VícePři reálném chromatografickém ději nikdy nedojde k ustavení rovnováhy mezi oběma fázemi První ucelená teorie respektující uvedenou skutečnost byla
Teorie chromatografie - III Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 4.3.3 Teorie dynamická Při reálném chromatografickém ději nikdy nedojde k ustavení rovnováhy mezi oběma
VíceImunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky
Imunochemické metody na principu vazby antigenu a protilátky ANTIGEN (Ag) specifická látka (struktura) vyvolávající imunitní reakci a schopná vazby na protilátku PROTILÁTKA (Ab antibody) molekula bílkoviny
VíceStanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,
VíceTECHNICKÁ SPECIFIKACE Vybavení genetické laboratoře pro projekt EXTEMIT-K část B
TECHNICKÁ SPECIFIKACE Vybavení genetické laboratoře pro projekt EXTEMIT-K část B OBSAH Sestava pro vertikální elektroforézu... 2 Jednotka pro elektroforézu... 3 Termocykler... 4 Elektrický zdroj pro elektroforézu...
VícePrůtokové metody (Kontinuální měření v proudu kapaliny)
Průtokové metody (Kontinuální měření v proudu kapaliny) 1. Přímé měření: analyzovaná kapalina většinou odvětvena + vhodný detektor 2. Kapalinová chromatografie (HPLC) Stanovení po předchozí separaci 3.
VíceSeparační metody v analytické chemii. Plynová chromatografie (GC) - princip
Plynová chromatografie (GC) - princip Plynová chromatografie (Gas chromatography, zkratka GC) je typ separační metody, kdy se od sebe oddělují složky obsažené ve vzorku a které mohou být převedeny do plynné
VíceHPLC - Detektory A.Braithwaite and F.J.Smith; Chromatographic Methods, Fifth edition, Blackie Academic & Professional 1996 Colin F. Poole and Salwa K.
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie - Detektory - I Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 HPLC - Detektory A.Braithwaite and F.J.Smith; Chromatographic Methods, Fifth
VíceTypy molekul, látek a jejich vazeb v organismech
Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Organismy se skládají z molekul rozličných látek Jednotlivé látky si organismus vytváří sám z jiných látek,
VíceHmotnostní spektrometrie
Hmotnostní spektrometrie Princip: 1. Ze vzorku jsou tvořeny ionty na úrovni molekul, nebo jejich zlomků (fragmentů), nebo až volných atomů dodáváním energie, např. uvolnění atomů ze vzorku nebo přímo rozštěpení
VíceStanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou
Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou Úkol Stanovte obsah cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce pomocí kapilární elektroforézy. Teoretická část Cholesterol je steroidní
VíceSPE je metoda vhodná pro rychlou přípravu vzorků, která užívá
Extrakce na pevné fázi (SPE) Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Extrakce na pevné fázi (SPE) (Solid Phase Extraction) SPE je metoda vhodná pro rychlou přípravu vzorků,
VíceSeparační metody Historie: Rozvoj separačních metod od minulého století Postavení separačních metod v rámci analytické chemie Význam chromatografie a
Úvod do separačních metod pro analýzu léčiv Příprava předmětu byla podpořena projektem OPP č. CZ..7/3..00/3353 Separační metody Historie: Rozvoj separačních metod od minulého století Postavení separačních
VícePROTEINOVÁ DENATURUJÍCÍ ELEKTROFORÉZA (SDS PAGE)
PROTEINOVÁ DENATURUJÍCÍ ELEKTROFORÉZA (SDS PAGE) Denaturující proteinová elektroforéza (SDS PAGE - SDS Protein Acrylamide Gel Electrophoresis) je metoda, která se používá k separaci proteinů podle velikosti,
VíceNetkané textilie. Materiály 2
Materiály 2 1 Pojiva pro výrobu netkaných textilií Pojivo je jednou ze dvou základních složek pojených textilií. Forma pojiva a jeho vlastnosti předurčují technologii a podmínky procesu pojení způsob rozmístění
VíceElektroforéza. Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli
Elektroforéza Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli K realizaci je nutné mít: Stejnosměrný el. proud Speciální elektroforetické vany Vhodný pufr a nosič (dříve papír, acetátcelulóza, agar)
VíceObsah Protein Gel Electrophoresis Kitu a jeho skladování
Obsah Protein Gel Electrophoresis Kitu a jeho skladování Protein Gel Electrophoresis Kit obsahuje veškerý potřebný materiál provádění vertikální polyakrilamidové gelové elektroforézy. Experiment provádějí
VíceTeorie chromatografie - I
Teorie chromatografie - I Veronika R. Meyer Practical High-Performance Liquid Chromatography, Wiley, 2010 http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/9780470688427 Příprava předmětu byla podpořena projektem
VíceElektroforéza. Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli
Elektroforéza Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli K realizaci je nutné mít: Stejnosměrný el. proud Speciální elektroforetické vany Vhodný pufr a nosič (dříve papír, acetátcelulóza, agar)
VíceAnalýza kofeinu v kávě pomocí kapalinové chromatografie
Analýza kofeinu v kávě pomocí kapalinové chromatografie Kofein (obr.1) se jako přírodní alkaloid vyskytuje v mnoha rostlinách (např. fazolích, kakaových bobech, černém čaji apod.) avšak nejvíce je spojován
VíceIzolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení dekochinátu metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie
VíceSLEDOVÁNÍ VZTAHU MEZI OBSAHEM ENZYMU RUBISCO A KONCENTRACÍ CO 2 V CHLOROPLASTU
SLEDOVÁNÍ VZTAHU MEZI OBSAHEM ENZYMU RUBISCO A KONCENTRACÍ CO 2 V CHLOROPLASTU Nikola Burianová Experimentální biologie 2.ročník navazujícího studia Katedra Fyziky Ostravská univerzita v Ostravě OBSAH
VícePLYNOVÁ CHROMATOGRAFIE (GC)
PLYNOVÁ CHROMATOGRAFIE (GC) Dělení látek mezi stacionární a mobilní fázi na základě rozdílů v těkavosti a struktuře (separované látky vykazují rozdílnou chromatografickou afinitu) Metoda vhodná pro látky:
Více12. Elektrochemie základní pojmy
Důležité veličiny Elektroda, článek Potenciometrie Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Důležité veličiny proud I (ampér - A) náboj Q (coulomb - C) Q t 0 I dt napětí, potenciál
VíceU = E a - E k + IR Znamená to, že vložené napětí je vyrovnáváno
Voltametrie a polarografie Princip. Do roztoku vzorku (elektrolytu) jsou ponořeny dvě elektrody (na rozdíl od potenciometrie prochází obvodem el. proud) - je vytvořen elektrochemický článek. Na elektrody
VíceSDS-PAGE elektroforéza
SDS-PAGE elektroforéza Příprava gelu... 1 Recept na 0.75 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Recept na 1.5 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Příprava vzorku... 3 Elektroforéza... 3 Barvení gelů Blue Silver... 4 Chemikálie
VíceKurz 1 Úvod k biochemickému praktiku
Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku Pavla Balínová http://vyuka.lf3.cuni.cz/ Důležité informace Kroužkový asistent: RNDr. Pavla Balínová e-mailová adresa: pavla.balinova@lf3.cuni.cz místnost: 410 studijní
VíceLaboratorní práce č. 8: Elektrochemické metody stanovení korozní rychlosti
Laboratorní práce č. 8: Elektrochemické metody stanovení korozní rychlosti Cíl práce: Cílem laboratorní úlohy Elektrochemické metody stanovení korozní rychlosti je stanovení korozní rychlosti oceli v prostředí
VíceZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE
ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE 2004 Technologie kvantitativních metod Petr Štern kapitola ve skriptech - 4.2.2 Optické zdroje U V V I S I R Spektrální distribuční křivky W žárovky b.t. W ~ 3600 C
VíceMolekulová spektroskopie 1. Chemická vazba, UV/VIS
Molekulová spektroskopie 1 Chemická vazba, UV/VIS 1 Chemická vazba Silová interakce mezi dvěma atomy. Chemické vazby jsou soudržné síly působící mezi jednotlivými atomy nebo ionty v molekulách. Chemická
VíceOdměrná analýza, volumetrie
Odměrná analýza, volumetrie metoda založená na měření objemu metoda absolutní: stanovení analytu ze změřeného objemu roztoku činidla o přesně známé koncentraci, který je zapotřebí k úplné a stechiometricky
VíceStanovení biochemicky významných flavinů pomocí kapilární elektroforézy s fluorescenční detekcí
Teoretická část Stanovení biochemicky významných flavinů pomocí kapilární elektroforézy s fluorescenční detekcí Mezi biochemicky významné flaviny patří kofaktory flavinmononukleotid (FMN) a flavinadenindinukleotid
VíceVÝUKOVÝ MODUL MEMBRÁNOVÝCH PROCESŮ TÉMATA PŘEDNÁŠEK
VÝUKOVÝ MODUL MEMBRÁNOVÝCH PROCESŮ TÉMATA PŘEDNÁŠEK TRANSPORT LÁTEK MEMBRÁNAMI Transport látek porézními membránami - Plouživý tok nestlačitelných tekutin vrstvou částic - Plouživý tok stlačitelných tekutin
VíceMetody separace. přírodních látek
Metody separace přírodních látek (5) Chromatografie; základní definice a klasifikace ruzných metod; kapalinová chromatografie, plynová chromatografie, přístrojová technika. Chromatografie «F(+)d» 1897
VíceAutokláv reaktor pro promíchávané vícefázové reakce
Vysoká škola chemicko technologická v Praze Ústav organické technologie (111) Autokláv reaktor pro promíchávané vícefázové reakce Vypracoval : Bc. Tomáš Sommer Předmět: Vícefázové reaktory (prof. Ing.
VícePREKONCENTRAČNÍ TECHNIKY V KAPILÁRNÍ ELEKTROFORÉZE
MASARYKOVA UNIVERZITA Přírodovědecká fakulta Ústav biochemie Návod do cvičení PREKONCENTRAČNÍ TECHNIKY V KAPILÁRNÍ ELEKTROFORÉZE LABORATORNÍ CVIČENÍ Mgr. Aleš Mádr 2012 Vzniklo díky finanční podpoře Ministerstva
VícePROTOKOL WESTERN BLOT
WESTERN BLOT 1. PŘÍPRAVA ELEKTROFORETICKÉ APARATURY Saponátem a vodou se důkladně umyjí skla, plastové vložky a hřebínek, poté se důkladně opláchnou deionizovanou/destilovanou vodou a etanolem a nechají
VíceModerní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek
Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví René Kizek 12.04.2013 Fluorescence je fyzikálně chemický děj, který je typem luminiscence. Luminiscence se dále dělí
VíceInovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie CZ.1.07/2.2.00/15.0247
Papírová a tenkovrstvá chromatografie Jednou z nejrozšířenějších analytických metod je bezesporu chromatografie, umožňující účinnou separaci látek nutnou pro spolehlivou identifikaci a kvantifikaci složek
Více3. NEROVNOVÁŽNÉ ELEKTRODOVÉ DĚJE
3. NEROVNOVÁŽNÉ ELEKTRODOVÉ DĚJE (Elektrochemické články kinetické aspekty) Nerovnovážné elektrodové děje = děje probíhající na elektrodách při průchodu proudu. 3.1. Polarizace Pojem polarizace se používá
VíceInhibitory koroze kovů
Inhibitory koroze kovů Úvod Korozní rychlost kovových materiálů lze ovlivnit úpravou prostředí, ve kterém korozní děj probíhá. Mezi tyto úpravy patří i použití inhibitorů koroze kovů. Inhibitor je látka,
VíceVícefázové reaktory. Probublávaný reaktor plyn kapalina katalyzátor. Zuzana Tomešová
Vícefázové reaktory Probublávaný reaktor plyn kapalina katalyzátor Zuzana Tomešová 2008 Probublávaný reaktor plyn - kapalina - katalyzátor Hydrogenace méně těkavých látek za vyššího tlaku Kolony naplněné
VícePražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR
Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ.04.3.07/4.2.01.1/0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR SEPARACE PROTEINŮ Preparativní x analytická /měřítko, účel/ Zvláštnosti dané povahou materiálu
VíceOPTIMALIZACE METODY ANODICKÉ ROZPOUŠTĚCÍ VOLTAMETRIE PRO ANALÝZU BIOLOGICKÝCH VZORKŮ S OBSAHEM RTUTI
Středoškolská technika 212 Setkání a prezentace prací středoškolských studentů na ČVUT OPTIMALIZACE METODY ANODICKÉ ROZPOUŠTĚCÍ VOLTAMETRIE PRO ANALÝZU BIOLOGICKÝCH VZORKŮ S OBSAHEM RTUTI Eliška Marková
VíceLABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) Použití GC-MS spektrometrie
LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) C Použití GC-MS spektrometrie Vedoucí práce: Doc. Ing. Petr Kačer, Ph.D., Ing. Kamila Syslová Umístění práce: laboratoř 79 Použití GC-MS spektrometrie
VícePokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1/1 Proč biofyzikální metody? Biofyzikální metody využívají fyzikální principy ke studiu biologických systémů Poskytují kvantitativní
VíceIdentifikace a stanovení chininu v toniku pomocí CE-MS
Identifikace a stanovení chininu v toniku pomocí CE-MS Úkol: Stanovte množství chininu v nealkoholickém nápoji (tonik) pomocí kapilární zónové elektroforézy ve spojení s hmotnostní spektrometrií Teoretická
VíceSpektroskopické é techniky a mikroskopie. Spektroskopie. Typy spektroskopických metod. Cirkulární dichroismus. Fluorescence UV-VIS
Spektroskopické é techniky a mikroskopie Spektroskopie metody zahrnující interakce mezi světlem (fotony) a hmotou (elektrony a protony v atomech a molekulách Typy spektroskopických metod IR NMR Elektron-spinová
VíceIonizační manometry. Při ionizaci plynu o koncentraci n nejsou ionizovány všechny molekuly, ale jenom část z nich n i = γn ; γ < 1.
Ionizační manometry Princip: ionizace molekul a měření počtu nabitých částic Rozdělení podle způsobu ionizace: Manometry se žhavenou katodou Manometry se studenou katodou Manometry s radioaktivním zářičem
VíceDNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit
VíceElektroforéza nukleových kyselin
Elektroforéza nukleových kyselin Elektroforéza nukleových kyselin je založena na tom, že NK jsou v neutrálním nebo zásaditém prostředí polyanionty. Protože se zvyšujícím se počtem nukleotidů v molekule
VíceObr. 1. Struktura glukosaminu.
3. Stanovení glukosaminu ve výživových doplňcích pomocí kapilární elektroforézy Glukosamin (2-amino-2-deoxyglukózamonosacharid je široce distribuován ve tkáních lidského organismu jako složka je klíčovou
VíceSTANOVENÍ SIŘIČITANŮ VE VÍNĚ
STANOVENÍ SIŘIČITANŮ VE VÍNĚ CÍLE ÚLOHY: seznámit se s principy izotachoforézy a jodometrické titrace kvantitativně stanovit siřičitany v bílém víně oběma metodami POUŽITÉ VYBAVENÍ: Chemikálie: ITP 10mM
VíceObr. 1. Stuktura glukózy, fruktózy a sacharózy.
1. Analýza sacharidů v medu pomocí kapilární elektroforézy Med je přírodní produkt, který vyrábí včely z nektaru různých rostlin. Jedná se o vodný přesycený roztok sacharidů, který obsahuje také komplexní
VíceMetody práce s proteinovými komplexy
Metody práce s proteinovými komplexy Zora Nováková, Zdeněk Hodný Proteinové komplexy tvořeny dvěma a více proteiny spojenými nekovalentními vazbami Van der Waalsovy síly vodíkové můstky hydrofobní interakce
VíceOpakování
Slabé vazebné interakce Opakování Co je to atom? Opakování Opakování Co je to atom? Atom je nejmenší částice hmoty, chemicky dále nedělitelná. Skládá se z atomového jádra obsahujícího protony a neutrony
VíceÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE 1.LF UK. Elektroforesa. v biochemii. Jan Pláteník. (grafická úprava obrázků Richard Buchal)
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE 1.LF UK Elektroforesa v biochemii Jan Pláteník (grafická úprava obrázků Richard Buchal) 2007/2008 Pojem elektroforesa znamená jakoukoliv experimentální techniku, založenou na pohybu
VíceStruktura. Velikost ionexových perliček Katex. Iontová výměna. Ionex (ion exchanger) Iontoměnič Měnič iontů. Katex (cation exchanger) Měnič kationtů
Ionex (ion exchanger) Iontoměnič Měnič iontů gelová Struktura makroporézní Katex (cation exchanger) Měnič kationtů Anex (anion exchanger) Měnič aniontů Velikost ionexových perliček Katex Silně kyselý katex
VíceSeminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
VíceVÝUKOVÝ MODUL MEMBRÁNOVÝCH PROCESŮ SYLABY PŘEDNÁŠEK TRANSPORT LÁTEK MEMBRÁNAMI MEMBRÁNOVÉ MATERIÁLY
VÝUKOVÝ MODUL MEMBRÁNOVÝCH PROCESŮ SYLABY PŘEDNÁŠEK TRANSPORT LÁTEK MEMBRÁNAMI zodpovědni: P. Mikulášek, H. Jiránková, M. Šípek, K. Friess, K. Bouzek Transport látek porézními membránami (P. Mikulášek)
Vícenano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL
Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL nano.tul.cz Tyto materiály byly vytvořeny v rámci projektu ESF OP VK: Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na Technické univerzitě v Liberci Experimentální
VíceAplikace elektromigračních technik Laboratorní úlohy
Laboratorní úlohy Výukový materiál vznikl za finanční podpory Fondu rozvoje vysokých škol v rámci řešení projektu č. 1377/2013 Vytvoření demonstračních úloh sloužících k inovaci předmětu Aplikace elektromigračních
VíceIZOTACHOFORÉZA. Teoretická část
IZOTACHOFORÉZA Teoretická část Izotachoforéza se liší od ostatních elektroforetických metod tím, že vzorek je vnášen mezi dva různé elektrolyty - vedoucí (leading L) a koncový (terminating T). Ty musí
VíceKlinická a farmaceutická analýza. Petr Kozlík Katedra analytické chemie
Klinická a farmaceutická analýza Petr Kozlík Katedra analytické chemie e-mail: kozlik@natur.cuni.cz http://web.natur.cuni.cz/~kozlik/ 1 Spojení separačních technik s hmotnostní spektrometrem Separační
VíceUltrastopová laboratoř České geologické služby
Ultrastopová laboratoř České geologické služby Jitka Míková Česká geologická služba Praha - Barrandov Laboratorní koloběh Zadavatel TIMS Analýza vzorku Vojtěch Erban Jakub Trubač Lukáš Ackerman Jitka Míková
VíceAfinitní kapilární elektroforéza
Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ.04.3.07/4.2.01.1/0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR Afinitní kapilární elektroforéza Věra Pacáková a Tereza Vařilová PřF UK Praha Obsah 1. Úvod
VíceNázev: Vypracovala: Datum: 7. 2. 2014. Zuzana Lacková
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace,
VíceTeorie transportu plynů a par polymerními membránami. Doc. Ing. Milan Šípek, CSc. Ústav fyzikální chemie VŠCHT Praha
Teorie transportu plynů a par polymerními membránami Doc. Ing. Milan Šípek, CSc. Ústav fyzikální chemie VŠCHT Praha Úvod Teorie transportu Difuze v polymerních membránách Propustnost polymerních membrán
VíceElektrická dvojvrstva
1 Elektrická dvojvrstva o povrchový náboj (především hydrofobních) částic vyrovnáván ekvivalentním množstvím opačně nabitých iontů (protiiontů) o náboj koloidní částice + obal protiiontů = tzv. elektrická
VíceStanovení paracetamolu, kofeinu a propyfenazonu v tabletách Valetol
Úkol: Stanovení paracetamolu, kofeinu a propyfenazonu v tabletách Valetol pomocí CE-LIF Proveďte separaci a následné stanovení účinných látek (paracetamol, propyfenazon, kofein) v přípravku Valetol pomocí
VíceChromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost
Chromatofokusace separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost Polypufry - amfolyty Stacionární fáze Polybuffer 96 - ph 9-6
VíceÚvod k biochemickému. mu praktiku. Vladimíra Kvasnicová
Úvod k biochemickému mu praktiku Vladimíra Kvasnicová organizace praktik pravidla bezpečné práce v laboratoři laboratorní vybavení práce s automatickou pipetou návody: viz. aplikace Výuka automatická pipeta
VíceVEDENÍ ELEKTRICKÉHO PROUDU V LÁTKÁCH
VEDENÍ ELEKTRICKÉHO PROUDU V LÁTKÁCH Jan Hruška TV-FYZ Ahoj, tak jsme tady znovu a pokusíme se Vám vysvětlit problematiku vedení elektrického proudu v látkách. Co je to vlastně elektrický proud? Na to
Více