ŽURNÁL KLUB Journal club

Podobné dokumenty
Botanika bezcévných rostlin 9. praktické cvičení Přehled pozorovaných objektů

Botanika bezcévných rostlin 9. praktické cvičení Přehled pozorovaných objektů

DPZ Dálkový průzkum Země. Lukáš Kamp, KAM077

RYBNÍKY POHLEDEM Z VÝŠKY

GIS ANALÝZA VLIVU DÁLNIČNÍ SÍTĚ NA OKOLNÍ KRAJINU. Veronika Berková 1

KAPITOLA 1: ÚVOD DO LICHENOLOGIE; VZTAH MYKOBIONTA A FOTOBIONTA

Současné možnosti dálkového průzkumu pro hodnocení heterogenity půd a porostů na orné půdě

II. Informační seminář FRAMEADAPT Dálkový průzkum země (DPZ) pro podporu adaptačního managementu

Ing. Jiří Fejfar, Ph.D. Dálkový průzkum Země

Botanika bezcévných rostlin 10. praktické cvičení Přehled pozorovaných objektů

Ekologie lišejníků. 1. Lekce. lišejník jako ekologická jednotka, schéma soužití, fotobionti, růst

ZAHAJOVACÍ KONFERENCE PROJEKTU

Detekce a monitoring invazních druhů pomocí dálkového průzkumu

EEA Grants Norway Grants

TRENDY ROZVOJE DPZ A JEJICH MOŽNOSTI VYUŽITÍ PRO INVENTARIZACI KONTAMINOVANÝCH MÍST

Geomorfologie vybraných skalních útvarů v okolí Bělé pod Bezdězem, Mimoně a České Lípy

Národní Inventarizace Lesů. Radim Adolt, Analyticko-metodické Centrum NIL (ACNIL), Kroměříž

Metody hodnocení sucha v lesních porostech. Kateřina N. Hellebrandová, Vít Šrámek, Martin Hais

Dálkový průzkum Země DPZ. Zdeněk Janoš JAN789

Fotobionti aneb lišejník není jen houba, ale i řasa. Ondřej Peksa

Moravské gymnázium Brno s.r.o. RNDr. Monika Jörková. Tematická oblast. Biologie 20 Lišejníky. Ročník 1. Datum tvorby

6. METODIKA EKOTOXIKOLOGIE

Mapování Země z vesmíru (úvod do metod dálkového průzkumu Země) Petr Dobrovolný Geografický ústav přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity v Brně

Nové lokality šikouška zeleného v roce 2013

Strojové učení a dolování dat. Vybrané partie dolování dat 2016/17 Jan Šimbera

Možnosti podpory plošné inventarizace kontaminovaných míst interpretací multi- a hyperspektrálního snímkování Jana Petruchová Lenka Jirásková

analýzy dat v oboru Matematická biologie

DPZ Dálkový Průzkum Země. Luděk Augusta Aug007, Vojtěch Lysoněk Lys034

Rozmnožování a rozmnožovací útvary lišejníků:

MONITORING EROZNÍHO POŠKOZENÍ PŮD POMOCÍ METOD DPZ USING REMOTE SENSING FOR MONITORING OF SOIL DEGRADATION BY EROSION

PC V ARCHEOLOGII Mgr. Richard Thér, Ph.D.

Červené bahno. kolontár, maďarsko. PŘípadová studie

Lišejníky jako bioindikátory životního prostředí

Monitoring Buxbaumia viridis v Beskydech

Přírodopis. 6. ročník. Obecná biologie a genetika

Možnosti modelování lesní vegetační stupňovitosti pomocí geoinformačních analýz

Použití radarových dat pro mapování povodní. Lena Halounová ISPRS Congress Director, České vysoké učení technické v Praze

TAJGA - MONITORING LOKALITY PONECHANÉ SAMOVOLNÉMU VÝVOJI

Soubor map V ková struktura vybraných horských smrkových porost na Šumav

Tygr Indický. Samice měří 1,5-2 m bez ocasu a 2,5-3 m s ocasem. Váží kg. V kohoutku měří zhruba 75 cm, délka hlavy je cm.

Dálkový průzkum Země (úvod, základní pojmy, historický přehled)

Gymnázium Aloise Jiráska, Litomyšl, T. G. Masaryka 590

Využití DPZ v Národní inventarizaci lesů (NIL2) - potenciál dat GMES/Copernicus

Významný příspěvek Přírodovědecké fakulty UK k zachycení stavu světové biodiverzity

VYUŽITÍ LETECKÉ TERMOGRAFIE A MULTISPEKTRÁLNÍHO SNÍMKOVÁNÍ V PRECIZNÍM ZEMĚDĚLSTVÍ JAN SOVA, ADAM ŠVESTKA, JAN KOVÁŘ

Energie mořských vln ALTERNATIVNÍ ENERGIE 6/2001 Ing. Dalibor Skácel

DPZ - Ib Interpretace snímků

fytopatogenů a modelování

Výstup: 1.1 Zvýšená kvalita dlouhodobého plánování rozvoje lesů dle zásad TUH

Zkušenosti s využíváním dat Urban Atlasu pro potřeby územního plánování v Praze

Závěrečná zpráva o projektu

Využití dálkového průzkumu pro lokálně cílenou agrotechniku polních plodin. Vojtěch Lukas a kol.

Výsledky digitalizace snímkování stavu lesních porostů NP Šumava

MINIPROJEKT - GEOLOGICKÉ POCHODY Přírodovědný klub ZŠ K.V. Raise Lázně Bělohrad

Květnice. Název ZCHÚ: Kód ZCHÚ: 204 Kategorie ZCHÚ: Zřizovací předpis: Kraj: Obec s rozš. působností 3. st. Katastrální území:

Biologie lišejníků. 8. lekce. Biogeografie Použití lišejníků Klasifikace lišejníků

Martina Bábíčková, Ph.D

Lišejník

Využití dat Urban Atlas v oblasti územního plánování v Praze

Lišejníky přednáška 1. David Svoboda

Digitální fotogrammetrie

Využití digitální stereofotogrammetrie jako podpůrných dat pro automatizovanou tvorbu lesnických tematických map

Management lesů význam pro hydrologický cyklus a klima

Ryžovna. Kategorie. Kritéria. Přehledná mapa přispívající plochy. KONEČNÁ VERZE - výstupy kompletního projektu

Statistické řízení jakosti - regulace procesu měřením a srovnáváním

KLEŤ - MONITORING LOKALITY PONECHANÉ SAMOVOLNÉMU VÝVOJI

Volitelný předmět Habituální diagnostika

Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost

Diferenciace současného stavu geobiocenóz

Biologie lišejníků. 1. Lekce. Lichenismus Historie lichenologie

Vzdělávací obsah vyučovacího předmětu

Základní škola Dr. Miroslava Tyrše

Účel a doba měření. Měřicí místa a měřené veličiny

Soubor Map: Mapa struktury porostů na 7 TVP v CHKO Orlické hory Vacek S., Vacek Z., Bulušek D., Ulbrichová I.

VY_32_INOVACE_008. VÝUKOVÝ MATERIÁL zpracovaný v rámci projektu EU peníze školám

Konzumace piva v České republice v roce 2007

Studium časového vývoje erupcí v čarách vodíku a vápníku

Obsah Úvodem Část I. Základy mykologie Část II. Praktický houbař

Babí lom. Název ZCHÚ: Kód ZCHÚ: Kategorie ZCHÚ: Zřizovací předpis: Kraj:

DLOUHODOBÉ SMĚŘOVÁNÍ KARLOVARSKÉHO KRAJE V OBLASTI ZAJIŠTĚNÍ A ROZVOJE PODPORY SENIORŮ A OSOB SE ZDRAVOTNÍM POSTIŽENÍM

Ekologie tropických lesů a jejich obyvatel

Vliv Mosteckého jezera na teplotu a vlhkost vzduchu a rychlost větru. Lukáš Pop Ústav fyziky atmosféry v. v. i. AV ČR

Škody zvěří na lesních porostech

KOSTELECKÉ BORY MONITORING LOKALITY PONECHANÉ SAMOVOLNÉMU VÝVOJI

Ministerstvo obrany Tychonova 221/1, Praha 6 - Dejvice, datová schránka hjyaavk

Výroční zpráva Moravskoslezské pobočky ČBS za rok 2017

Biologie lišejníků. 8. lekce. Biogeografie Použití lišejníků Klasifikace lišejníků

Hypogymnia physodes (terčovka bublinatá) - lupenitá stélka, rtovité. Xanthoria parietina (terčník zední) - lupenitá stélka, apothecia

Porovnání výsledků viditelnosti získaných z topografických map a z digitálních modelů reliéfu

Ejpovice. Základní škola Ulice Míru, Rokycany Mgr. Sylva Zemánková

POLEDNÍK MONITORING LOKALITY PONECHANÉ SAMOVOLNÉMU VÝVOJI

Výzkumný ústav geodetický, topografický a kartografický, v.v.i

Praktikum z experimentálních metod biofyziky a chemické fyziky I. Vypracoval: Jana Čurdová, Martin Kříž, Vít Marek. Dne: 2.3.

Rozvoj metodiky tvorby map znečištění. Jan Horálek Pavel Kurfürst, Nina Benešová, Roman Juras, Jana Ďoubalová

5.6.3 Přírodopis povinný předmět

Monitoring eroze zemědělské půdy

VODA S ENERGIÍ Univerzita odhalila tajemství vody Objev hexagonální vody

Další možná příčina loňského poškození smrkových sazenic v lesní školce Bílá Voda

LIŠEJNÍKY VRCHU SEDLO V ČESKÉM STŘEDOHOŘÍ (SEVERNÍ ČECHY) Lichens of the Sedlo Hill in the České středohoří Mts (North Bohemia)

Mapování urbanizovaných ploch a úrovně jejich zastavění

Transkript:

ŽURNÁL KLUB Journal club Tato nová sekce časopisu Bryonora si klade jeden hlavní cíl zvýšení povědomosti o recentních studiích v oborech bryologie a lichenologie. V současné době, kdy každoročně bývají publikovány stovky až tisíce různých prací z daných oborů, málokdo dokáže sledovat aktuální publikace a vybírat z nich ty skutečně důležité nebo zajímavé. Žurnál klub bude stručně shrnovat výsledky vybraných studií. Tímto zveme všechny čtenáře Bryonory k aktivní spolupráci. Zmínky o zajímavých článcích se budou objevovat pravidelně ve všech dalších číslech časopisu. Halucinogenní lišejník V roce 2014 popsal kolektiv autorů v čele s Michaelou Schmull zřejmě první lišejník, u něhož se předpokládají halucinogenní účinky. Bazidiolišejník Dictyonema huaorani byl v minulosti užíván kmenem Huaorani, původním obyvatelstvem Amazonského lesa ve východním Ekvádoru, k šamanistickým rituálům. Byl připravován jako nálev v kombinaci s mechorosty a způsoboval silné bolesti hlavy a pocity opilosti. Údajně měl způsobovat i neplodnost. Druh je extrémně vzácný a známý pouze z jediného sběru, který byl pořízen během etnobotanické exkurze Harvardské univerzity v roce 1981. Předpokládá se, že vzhledem k ekologii podobných druhů a jeho morfologii by mohl být častější v korunách stromů. Předběžné chemické analýzy prostřednictvím kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií (LC-MS) odhalily přítomnost psychotropních látek psilocybinu (známého např. z lysohlávek) a tryptaminu, včetně jeho derivátů. Vzhledem k absenci standardů pro potvrzení správného určení všech zaznamenaných látek jsou ale výsledky analýzy považovány pouze za předběžné. O halucinogenních účincích lišejníků se doposud jen spekulovalo v souvislosti s kouřením stélek druhů Parmelia saxatilis, Parmotrema andinum, Ramalina siliquosa a Xanthoparmelia conspersa. Jiří Malíček Schmull M., Dal-Forno M., Lücking R., Cao S., Clardy J. & Lawrey J. D. (2014): Dictyonema huaorani (Agaricales: Hygrophoraceae), a new lichenized basidiomycete from Amazonian Ecuador with presumed hallucinogenic properties. Bryologist 117: 386 394. 72

ŽURNÁL KLUB Nový systém lišejníků V prvních dnech roku 2017 vyšla nová klasifikace lichenizovaných hub a ještě téhož roku byly publikovány doplňky a korekce k tomuto rozsáhlému dílu. To zahrnuje řadu zajímavých čísel. Počet doposud známých lišejníků dosahuje čísla 19 409, počet rodů 1 002, čeledí 119 a řádů 40. Bazidiolišejníky se svými 172 druhy a patnácti rody tvoří 0,9 % všech lichenizovaných druhů. V rámci vřeckovýtrusných hub je 27 % lichenizovaných. Mezi nejbohatší rody patří Xanthoparmelia s 820 popsanými druhy, Lecanora s 550 druhy, Arthonia, Cladonia a Pertusaria (všechny s 500 druhy). Nejbohatší čeledí jsou Parmeliaceae s 2 765 druhy a Graphidaceae s 2 161 druhy. Molekulární data jsou známa ze 76 % všech rodů a 59 rodů zůstává jako incertae sedis. Současné fylogenetické analýzy předpokládají 20 30 lichenizačních událostí a jednu delichenizační, avšak nejsou počítány lichenikolní houby, kde kompletní ztrátu lichenizace autoři považují za spekulativní. Jako další zajímavost lze zmínit, že rod Chaenothecopsis byl kompletně vyjmut ze seznamu lichenizovaných druhů. Jiří Malíček Originální zdroje: Lücking R., Hodkinson B. P. & Leavitt S. D. (2017): The 2016 classification of lichenized fungi in the Ascomycota and Basidiomycota Approaching one thousand genera. Bryologist 119: 361 416. Lücking R., Hodkinson B. P. & Leavitt S. D. (2017): Corrections and amendments to the 2016 classification of lichenized fungi in the Ascomycota and Basidiomycota. Bryologist 120: 58 69. Stopkovýtrusné kvasinky v kůře vřeckovýtrusných makrolišejníků velký objev s nepravým příběhem Kolektiv autorů v čele s mykoložkou Anou Millanes objevil a popsal v roce 2015 rod Cyphobasidium, nový rod lichenikolní stopkovýtrusné houby, která vytváří pohlavní stádium (teleomorfu) a nádorové útvary na stélkách terčovek a provazovek. Tito autoři zřejmě netušili, že jejich houba má zajímavé nepohlavní stádium (anamorfu) a že na stejných houbách současně probíhá poněkud více vzrušující výzkum. Skupina vědců kolem lichenologa Tobyho Spribilleho přišla s objevem, že kvasinkové nepohlavní stádium této houby je třetím partnerem lišejníkové symbiózy. Ačkoliv význam kvasinek rodu Cyphobasidium v lišejníkové symbióze je nadále spekulativní, Spribilleho skupina poskytla mimořádně zajímavé výsledky. Předně zjistili, že tyto houby jsou v lišejnících široce rozšířeny. Velmi často se vyskytují ve stélkách velkých parmelioidních lišejníků a méně často byly detekovány i v lišejnících jiných skupin. 73

Sekvenováním transkriptomů vybraných zástupců rodu vousatec (Bryoria) zaznamenali autoři aktivitu mnoha genů pocházejících pravděpodobně ze stopkovýtrusých hub, což pouze dokazuje, že ve stélkách vousatců žijí kvasinky rodu Cyphobasidium a něco tam dělají. Zajímavějším zjištěním je rozdílné chování této houby u různých stélek vousatců druhu Bryoria fremontii. Kvasinka je o dost hojnější u vousatce B. tortuosa, tvořícího žlutý pigment kyselinu vulpinovou, než ve stélkách druhu B. fremontii bez tohoto pigmentu. Autoři spekulují, že tvorba pigmentu je důsledek přítomnosti této houby. To ovšem prozatím dokázáno není. Pro mne nejzajímavějším výsledkem je lokalizace kvasinek ve stélce lišejníku. Ta byla zkoumána pomocí specifického barvení stopkovýtrusých hub metodou fluorescenční in-situ hybridizace. Z obrazové dokumentace (a rovněž z přiložených videozáznamů) je zřejmé, že kvasinka žije na povrchu a nikoliv uvnitř lišejníku. Tento významný fakt není v textu explicitně zmíněn, a to patrně záměrně, neboť uvedení takového faktu by tuto studii snížilo na výzkum další z řady lichenikolních hub. Domnívám se, že dobře napsaný článek a velké množství informací v přílohách poskytne mnohým lichenologům inspiraci pro další výzkum kvasinkového tématu. Sám jsem si už objednal primery pro sekvenaci těchto hub a mám silný dojem, že slavné kvasinky jsou obyvateli mrtvé houbové tkáně na povrchu lišejníků (tzv. epinekrální vrstvy), kterou se coby saprofyté živí. Jan Vondrák Originální zdroje: Millanes A. M., Diederich P. & Wedin M. (2016): Cyphobasidium gen. nov., a new licheninhabiting lineage in the Cystobasidiomycetes (Pucciniomycotina, Basidiomycota, Fungi). Fungal Biology 120: 1468 1477. Spribille T., Tuovinen V., Resl P., Vanderpool D., Wolinski H., Aime M. C., Schneider K., Stabentheiner E., Toome-Heller M., Thor G., Mayrhofer H., Johannesson H. & McCutcheon J. P. (2016): Basidiomycete yeasts in the cortex of ascomycete macrolichens. Science 353: 488 492. Lišajníky ako súčasť potravinových reťazcov Johan Asplund sa dlhodobo zaoberá predátormi lišajníkov, vplyvom sekundárnych metabolitov na intenzitu ich aktivity a dôsledkami týchto interakcií. V roku 2015 s kolektívom autorov publikovali výsledky jednoduchého, elegantného pokusu, ktorý nám celú problematiku zasadzuje do širšieho ekologického kontextu. Ukázali v ňom, že umelé zníženie obsahu sekundárnych metabolitov v stielkach Hypogymnia physodes, Pseudevernia furfuracea a Evernia prunastri spôsobí nárast spoločenstva pavúkov. Žeby tak lišajníky pavúkom viac chutili? Pavúky sa lišajníkmi samozrejme neživia, ale chvostoskoky áno. Odstránenie odpudivých látok pozitívne zapôsobí na populáciu chvostoskokov a pavúkom, ich predátorom, sa teda 74

ŽURNÁL KLUB tiež lepšie darí. Tento efekt však neplatil u Cladonia rangiferina a C. stellaris, ktoré si počas trvania pokusu (4 mesiace) niektoré z odstránených látok čiastočne dosyntetizovali. Vďaka tejto práci sa dozvedáme, že aj lišajníky môžu stáť na počiatku dynamického potravinového reťazca. Ivana Černajová Asplund J., Bokhorst S., Kardol P. & Wardle D. A. (2015): Removal of secondary compounds increases invertebrate abundance in lichens. Fungal Ecology 18: 18 25. Predikční model odhalil nové lokality výskytu Buxbaumia viridis v tyrolských Alpách Predikční modelování výskytu mechorostů má potenciál pomoci bryologům nacházet nové lokality vzácných druhů. Příliš se zatím v Evropě nevyužívá nebo se o tom málo píše. Jednou z evropských vlaštovek predikčního modelování u mechorostů je studie provedená v Jižním Tyrolsku (Italské Alpy) pracovníky tamního přírodovědeckého muzea, Danielem Spitalem a Petrou Mair, v roce 2014. Před začátkem jejich práce byl druh B. viridis známý pouze ze čtyř lokalit v tyrolských Alpách. Pro potřeby studie si autoři v regionu náhodně vytipovali 87 ploch v rámci několika kategorií nadmořské výšky, kde provedli bryologický průzkum v kruzích o průměru 13 m. Výskyt B. viridis doložili pouze na dalších čtyřech lokalitách mimo ty již známé. Jednoduchým překryvem tří podkladových map, (1) výskyt smrkového lesa CORINE, (2) vzdálenost od vodních toků, (3) orientace svahu v kombinaci se znalostí environmentálních podmínek, které druh upřednostňuje, získali oblasti s vyšší pravděpodobností jeho výskytu. Díky tomu detekovali dalších 14 nových lokalit výskytu B. viridis. Nashromážděná výskytová data následně použili pro sestavení zobecněného lineárního modelu (GLM), pomocí něhož znovu predikovali lokality s vysokou pravděpodobností nalezení druhu s použitím dalších proměnných prostředí. Návštěvou lokalit předpovězených matematickým modelem pak potvrdili výskyt druhu na dalších dvanácti lokalitách. Celkem tedy autoři odhalili výskyt B. viridis na 26 nových lokalitách v tyrolských Alpách, k čemuž výrazně přispělo použití predikčního modelování. Domnívám se, že predikční modelování má v obecné rovině velký potenciál i na našem území. Nebo je to s mechorosty prostě jen tak, že druh, co se více hledá, se více nachází bez ohledu na nějaké predikční modely? Matěj Man Spitale D. & Mair P. (2015): Predicting the distribution of a rare species of moss: The case of Buxbaumia viridis (Bryopsida, Buxbaumiaceae). Plant Biosystems An International Journal Dealing with all Aspects of Plant Biology 151: 1 11. 75

Metody dálkového průzkumu Země (DPZ) použité při mapování invazního druhu Campylopus introflexus Používání multispektrálních leteckých snímků vegetace pro potřeby mapování invazních druhů je už dnes běžnou praxí i na našem území. Aplikace u mechorostů je však o něco obtížněji představitelná. Třeba kvůli malé velikosti mechorostů, menší hustotě populací či špatné rozlišitelnosti odrazu specifických vlnových délek pro jednotlivé druhy. Vžitou představu problematického využití DPZ u mechorostů prolomila letos studie z německého ostrova Sylt, kde skupina badatelů pořídila hyperspektrální snímky pobřežních pískových dun s cílem zmapovat dálkově rozšíření invazního druhu Campylopus introflexus. Pořízeny byly letecké snímky s obdivuhodným počtem 285 spektrálních pásů. V terénu byl proveden průzkum na 57 lokalitách s přesným zaměřením ověřeného výskytu C. introflexus a 150 dalších lokalit se snímkováním veškeré vegetace včetně mechorostů. Data z terénního průzkumu byla využita pro trénování predikčního modelu výskytu C. introflexus s použitím vybraných 146 spektrálních pásů jako prediktorů a metody MaxEnt ve dvou modelovacích fázích. To je z modelářského pohledu tak trochu útok hrubou silou, nicméně se dostavily poměrně přesné a přesvědčivé výsledky. Po terénním ověření výsledného modelu dospěli výzkumníci k závěru, že jsou schopní na pískových dunách ostrova Sylt výskyt C. introflexus mapovat s přesností na 75 %. To není v porovnání s úspěšností při dálkovém mapování cévnatých rostlin až tolik (u cévnatých invazních rostlin dosahuje úspěšnost 80 98 %), nicméně pořád je to v porovnání s cenou a organizační náročností terénního průzkumu na dané ploše velmi slušný výsledek. U nás by podobná metoda byla využitelné snad na vrcholcích a okrajích skalních měst či na disturbovaných rašelinných půdách, kde může C. introflexus tvořit souvislé porosty nezastíněné okolní vegetací. Autoři německé studie definovali tři spektrální pásy, ve kterých bylo možné nejlépe detekovat cílový druh (1 736, 1 988 a 1 996 nm). Bohužel pro nás ani jeden z těchto pásů není snímán v tak úzkém rozpětí družicemi s volně dostupnými daty jako SENTINEL či Landsat. Matěj Man Skowronek S., Ewald M., Isermann M., Van De Kerchove R., Lenoir J., Aerts R., Warrie J., Hattab T., Honnay O., Schmidtlein S., Rocchini D., Somers B. & Feilhauer H. (2017): Mapping an invasive bryophyte species using hyperspectral remote sensing data. Biological Invasions 19: 239 254. 76