Bakteriální nanočástice magnetitu. Produkce - biomineralizace, modifikace a aplikace. Zdenka Marková, Michaela Pečová a kolektiv CVN

Podobné dokumenty
Magnetotaktické bakterie

bakteriemi Magnetospirillum gryphiswaldense

Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil

MAGNETICKÉ NANOČÁSTICE

UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO - TECHNOLOGICKÁ

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta Katedra Biochemie

Nanobiotechnologie a bionanotechnologie

Eva Benešová. Dýchací řetězec

Tepelné rozklady železo obsahujících sloučenin pohledem Mössbauerovy spektroskopie

Biologické čištění odpadních vod - anaerobní procesy

Program: Institucionální program pro veřejné vysoké školy pro rok 2016 Poskytovatel: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Izolace nukleových kyselin

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:


PALEOMAGNETISMUS. Osnova. Martin Chadima Agico, Brno & Geologický ústav, AV ČR, Praha

Využití enzymů pro analytické a výzkumné účely

Nanočástice v životním prostředí J. Filip

Magnetické nanočástice, SPIO nanočástice, MATra, transfekce, DNA, účinnost transfekce

GEOCHEMICKÁ REAKTIVNÍ BARIÉRA PERSPEKTIVNÍ PRVEK IN - SITU SANAČNÍCH TECHNOLOGIÍ

Biologické čištění odpadních vod - anaerobní procesy

METABOLISMUS SLOUČENINY S MAKROERGNÍMI VAZBAMI

SYSTÉMY BIOLOGICKÉHO ODSTRAŇOVÁNÍ NUTRIENTŮ

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová

BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

Kateřina Poláková. Výzkumné centrum nanomateriálů, Univerzita Palackého, Olomouc

Ústav organické chemie a technologie. Zajímavosti z našich laboratoří

Příprava vzorků pro proteomickou analýzu

Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu)

MAGNETICKÉ NANOČÁSTICE PRO BIOMEDICÍNSKÉ APLIKACE

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ

Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková

PODPORA ŽELEZNÝCH NANOČÁSTIC ELEKTRICKÝM PROUDEM LABORATORNÍ TESTY

Struktura a funkce biomakromolekul

Úvod do biochemie. Vypracoval: RNDr. Milan Zimpl, Ph.D.

Zpráva o postupu projektu TA

Klasifikace vod podle čistoty. Jakost (kvalita) vod. Čištění vod z rybářských provozů

Kvantové tečky. a jejich využití v bioanalýze. Jiří Kudr SPOLEČNĚ PRO VÝZKUM, ROZVOJ A INOVACE CZ/FMP.17A/0436

OBORU MINERÁLNÍ BIOTECHNOLOGIE

Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií

Enterotoxiny Staphylococcus aureus. Jana Kotschwarová Andrea Koťová

VAKUOLA. membránou ohraničený váček membrána se nazývá tonoplast. běžná u rostlin, zvířata specializované funkce či její nepřítomnost

OPTIMALIZACE PROCESU KULTIVACE ZELENÝCH ŘAS S VYUŽITÍM DIGESČNÍCH ZBYTKŮ ZE ZEMĚDĚLSKÝCH BIOPLYNOVÝCH STANIC. Ing. Pavla Hrychová

DIPLOMOVÁ PRÁCE. Magnetická modifikace mikrobiálních buněk

Intermediární metabolismus CYKLUS SYTOST-HLAD. Vladimíra Kvasnicová

MAGNETICKÉ MATERIÁLY PRO BIORAFINACI POTRAVINÁŘSKÝCH ODPADŮ

Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR

Povrchově modifikované nanočástice železa pro dechloraci organických kontaminantů

Modifikace uhlíkové pastové elektrody pro stanovení stříbrných iontů

Pokročilé AFM mody Příprava nosičů a vzorků. Verze Jan Přibyl, pribyl@nanobio.cz

Kosmetika a kosmetologie Přednáška 8 Funkční látky péče o kůži II

1) Pojem biotechnologický proces a jeho fázování 2) Suroviny pro fermentaci 3) Procesy sterilizace 4) Bioreaktory a fermentory 5) Procesy kultivace,

Nanočástice, nanotechnologie a nanoprodukty a jejich vazba na BOZP

Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie

Některé poznatky z charakterizace nano železa. Marek Šváb Tereza Nováková Martina Müllerová Jan Šubrt Karel Závěta Eva Gregorová

Nutriční aspekty konzumace mléčných výrobků

SPR Povrchová Plasmonová Resonance. Zdroj: Wiki

Mesoporézní vs. ploché elektrody

Biologické odsiřování bioplynu. Ing. Dana Pokorná, CSc.

Magnetismus Země. 3. Paleomagnetismus

STANOVENÍ TVARU A DISTRIBUCE VELIKOSTI ČÁSTIC MODELOVÝCH TYPŮ NANOMATERIÁLŮ. Edita BRETŠNAJDROVÁ a, Ladislav SVOBODA a Jiří ZELENKA b

Elektrická dvojvrstva

Využití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém

Seznam řešených projektů včetně informací o délce trvání projektu, objemu a poskytovateli finančních prostředků

UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ KATEDRA BIOLOGICKÝCH A BIOCHEMICKÝCH VĚD

Teorie: Trávení: proces rozkladu molekul na menší molekuly za pomoci enzymů trávícího traktu

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku)

Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat

Enzymologie. Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů.

STRUKTURA A FUNKCE MIKROBIÁLNÍ BUŇKY

Pevné lékové formy. Vlastnosti pevných látek. Charakterizace pevných látek ke zlepšení vlastností je vhodné využít materiálové inženýrství

FIA fluorescenční imunoanalýza (fluorescence immuno-assay) CIA chemiluminiscenční imunoanalýza

Obecná biologie Fyziologie živočichů. Oddělení fyziologie a imunologie živočichů

Metody práce s proteinovými komplexy

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

STAFYLOKOKOVÉ ENTEROTOXINY. Zdravotní nezávadnost potravin. Veronika Talianová, FPBT, kruh: 346 Angelina Anufrieva, FPBT, kruh: 336

V001 Dokončení a kalibrace experimentálních zařízení v laboratoři urychlovače Tandetron

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

Výzkumný ústav veterinárního lékařství v Brně

Hlavní parametry přírodního prostředí ph a Eh

Průmyslová mikrobiologie a genové inženýrství

NÁVRH A PŘÍPRAVA PEPTIDŮ A LIPOPEPTIDŮ S ANTIMIKROBIÁLNÍM ÚČINKEM A STUDIUM JEJICH BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ

10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách

CALCIUM CARBONATE PARTICLES AND THEIR APPLICATIONS VÁPENATÉHO A JEJICH APLIKACE

Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY

FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ

Mnohobuněčné kvasinky

Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako perspektivní biomarkery kumulativní expozice reaktivním chemickým látkám

16a. Makroergické sloučeniny

Toxikologické vlastnosti nanotrubiček a nanovláken

Minerální výživa na extrémních půdách. Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů

Seminář projektu Rozvoj řešitelských týmů projektů VaV na Technické univerzitě v Liberci. Registrační číslo projektu: CZ.1.07/2.3.00/30.

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

5. Bioreaktory. Schematicky jsou jednotlivé typy bioreaktorů znázorněny na obr Nejpoužívanějšími bioreaktory jsou míchací tanky.

Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů

10/21/2013. K. Záruba. Chování a vlastnosti nanočástic ovlivňuje. velikost a tvar (distribuce) povrchové atomy, funkční skupiny porozita stabilita

Transkript:

Bakteriální nanočástice magnetitu Produkce - biomineralizace, modifikace a aplikace. Zdenka Marková, Michaela Pečová a kolektiv CVN

Bakteriální nanočástice magnetitu 1. Biomineralizace a produkce magnetických nanočástic bakteriemi - Magnetospirillum gryphiswaldense MSR- 1, magnetozomy 2. Modifikace povrchu biogenního magnetitu - Vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps - charakterizace: SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauerova mikroskopie 3. Aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

1. Biomineralizace BIM : biologicky indukovaná mineralizace - minerály vznikají jako produkty metabolismu organismů (tvorba sulfidů železa) - obecně žádná biologická kontrola vůči velikosti, struktuře, krystalografii dáno ph, pco2, konc. produktů jiných metabolických cest - prokaryoty výjimkou je mineralizace v magnetotaktických bakteriích (MTB) BCM : biologicky kontrolovaná mineralizace - vzniklé minerály plní určitou biologickou funkci v organismu jsou tvořeny proto, aby ji plnily - mechanické funkce: obrana (schránky), podpora (kosti), pohyb - vnímaní gravitace (kalcit v uších), optické vnímání (kalcitové čočky u trilobitů) - uchovávání (ferritin) - magnetické vnímání (magnetit, greigit; navigace holubů, tučňáků, netopýrů, včel) - přísná biologická kontrola typu minerálů, velikosti (uniformní), přesně definované morfologie, přísně kontrolované složení a struktura, kontrolovaná krystalografická orientace - eukaryoty (a magnetotaktické bakterie) Biomineralizace a produkce magnetických nanočástic bakteriemi - Magnetospirillum gryphiswaldense MSR- 1, magnetozomy

Produkce magnetických nanočástic bakteriemi - MTB gram negativní bakterie (koky, spirila, tyčinky) - MTB produkují spec. organely pro vnímání a orientaci (magnetozomy) vůči geomagnetickému poli Diverzita krystalů magnetitu a uspořádání v různých magnetotaktických bakteriích (D. Schuler et al. 2008) - magnetozomy - nanokrystaly magnetických minerálů (Fe) v jedno- nebo několikařetízkových strukturách umožňující buňce vnímat a orientovat se podél externího magnetického pole magnetotaxe - magnetotaxe spolu s chemotaxí, aerotaxií a možná i fototaxií určují směr pohybu buňky do preferující mikrooxické zóny - magnetozomy - druhově specifická morfologie, velikost, uspořádání a chemické složení krystalů - BCM formace krystalů magnetozomů je fascinujícím příkladem jak jednoduchý organismus může vytvářet přesné a často jedinečné inorganické struktury na základě informací kódovaných v genomu Biomineralizace a produkce magnetických nanočástic bakteriemi - Magnetospirillum gryphiswaldense MSR- 1, magnetozomy

A 565 nm Magnetospirillum gryphiswaldense MSR- 1, magnetozomy - pro laboratorní kultivace: Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1, M. magnetotacticum MS-1, M. magneticum AMB-1 (Německo Dirk Schuler, Japonsko - Tadashi Matsunaga, USA Dennis A. Bazylinski, Čína) Kultivace ve fermentoru - Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 - OD ~ 1 - C mag ~ 1,5 - exponenciální fáze do 28 h 1,2 1 0,8 0,6 0,4 0,2 2 1,8 1,6 1,4 1,2 1 0,8 0,6 0,4 0,2 A 565 nm c mag MSR- 1 Izolované magnetozomy Distribuce velikostí magnetozomů Han L. et.al. 2007 0 0 0 5 10 15 20 25 30 35 t [h] Záznam kultivace Biomineralizace a produkce magnetických nanočástic bakteriemi - Magnetospirillum gryphiswaldense MSR- 1, magnetozomy

Magnetozomy - Vykazují velmi nízkou toxicitu - Hlavními možnými toxicitními faktory jsou - proteiny magnetozomální membrány (MM) - malé množství endotoxinu lipopolysacharidu asociovaného s membránou - nanočásticový charakter (povrchový náboj) Separation of MM-associated protein by SDS- PAGE Grunberg et al. 2004 Biomineralizace a produkce magnetických nanočástic bakteriemi - Magnetospirillum gryphiswaldense MSR- 1, magnetozomy

2. Modifikace povrchu biogenního magnetitu - vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps - charakterizace: SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauerova mikroskopie Důvody - odstranění MM spolu s možnými toxicitními faktory stabilizace nanočástic proti agregaci, příprava prekurzoru pro další aplikace Podmínky - ionické surfaktanty kladný CTAC, záporný SDS - neionické surfaktanty TRITON X100 - NaOH - extrakce lipidů chloroform/ethanol/hexan - sonikace (2h), inkubace 98 C (1h) Modifikace povrchu biogenního magnetitu, vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps, SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauer. M.

Stanovení proteinů magnetozomální membrány po aplikaci detergentů za využití SDS - 12%PAGE Inkubace 98 C 1 h Sonikace 2 h magnetosomes SDS - CTAC + Triton X100 NaOH magnetosomes SDS - CTAC + Triton X100 NaOH Lipid extrakce Modifikace povrchu biogenního magnetitu, vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps, SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauer. M.

TEM zobrazení membrány a uspořádání bmnps Magnetozomy Magnetozomy SDS SDS 98 C 1 h CTAC CTAC Sonikace 2 h Triton X100 Triton X100 NaOH NaOH Modifikace povrchu biogenního magnetitu, vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps, SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauer. M.

Určení povrchového náboje bmnps po účinku ionických detergentů - zeta potential measurements Sample Treatment Zeta potential [mv] magnetosomes - -23 ± 6 msds t 98 C, 1 hour -50 ± 9 mctac t 98 C, 1 hour 51 ± 5 Modifikace povrchu biogenního magnetitu, vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps, SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauer. M.

Stanovení velikosti částic / agregátů pomocí DLS where d - average particle diameter; h.w. - half-width of peak from distribution curve, Int.- percentage representation of particles size in the peak. Modifikace povrchu biogenního magnetitu, vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps, SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauer. M.

Mössbauerova analýza oxidace povrchu bmnps vlivem teploty Zero-field Mössbauer spectrum při pokojové teplotě (a) magnetozomy (b) bmnps inkubovány při 98 C Mössbauer spectrum při pokojové teplotě ve vnějším magnetickém poli 5T pro bmnps po jejich inkubaci při 98 C core@shell struktura magnetit@maghemit 68@32 ± 5 % Modifikace povrchu biogenního magnetitu, vliv detergentů na MM a charakterizace bmnps, SDS-Page, TEM, DLS, zeta-potenciál, Mössbauer. M.

3. Aplikace - bmnps - specifické vlastnosti: rel. monodisperzita, velikost nanočástic, magnetické vlastnosti ferromagnetikum (odezva na vnější magnetické pole) - separace biomolekul pro bioanalytické účely - magnetická separace buněk - lokální (chemo)terapie pomocí funkčních látek či buněk (kmenové) značených magnetickými nanočásticemi s využitím magnetické navigace - magnetická hypertermie Vlastní aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů Chitosan obalení nanočástic magnetitu a zavedení -NH2 skupiny - precipitace Chitosan glutaraldehyd funkcionalizace a aktivace povrchu pro navázání biologických molekul - enzymů Aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů

Biotinylace a imobilizace proteolytické enzymy Hovězí trypsin - Ec 3.4.21.4 - serinová endopeptidasa - 23,3 kda, 223 AMK - Arginyl-X, Lysyl-X - nízká termostabilita - autolýza Ovlivnění vlastností enzymu: - Chemická modifikace - imobilizace na pevné nosiče Výhody modifikace a imobilizace trypsinu -vyšší teplotní stabilita - zkrácení doby štěpení - vysoká koncentrace - magnetická separace - opakované použití - redukce autolýzy - čistota produktu R-N=C=N-R Enzym COOH Fe 3 O 4 NH 2 -R-NH-C-NH-R O O Enzym C NH-R O C O + NH-R Fe 3 O 4 C NH Enzym Biotinylované činidlo Aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů

Imobilizace biotinylovaného trypsinu na avidinové nanočástice a jeho využití v proteomice Kovalentní imobilizace avidinu: - glutaraldehydová metoda - Avidin 0,2 mg.ml-1 - magnetická separace Squid snížení magnetizace Fe 3 O 4 -chitosan-avidin Aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů

Zbytková aktivita (%) Relative intensity Zbytková aktivita (%) Zbytková aktivita (%) Biotinylace hovězího trypsinu Termostabilita 20-75 C, 0.1 % HCOOH ph optimum 4.36-10.38 ph optimum volného trypsinu 110 100 90 80 Teplotní stabilita volného a imobilizovaného trypsinu BT BT-B BT-B-IMOB 110 100 90 80 BT BT-B BT-B-IMOB. 70 60 50 40 30 20 10 70 60 50 40 30 20 0 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 75 80 Teplota ( C) 10 0 4 5 6 7 8 9 10 11 ph Operační stabilita 12 cyklů PMF-křenová peroxidasa 2 h při 37 C 105 100 Operační stabilita imobilizovaného trypsinu BT-B-IMOB 1.1 1.0 0.9 1351.7 95 0.8 90 85 80 75 70 65 60 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 *1039.5 1062.5 876.9 * 1586.7 2072.9 2397.1 2620.0 3114.3 3671.7 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000 Počet cyklů Mass (m/z) Aplikace - Modifikace bmnps chitosanem využití pro imobilizaci enzymů

Magnetické značení buněk bmnps a jejich modifikace - bmnps + PEI - bmnps + TWEEN - podmínky výběru: netoxicita a stabilizace, funkční skupiny povrchový náboj Buňky: -testováno na mesenchymálních potkaních buňkách fixovaných (glutaraldehyd) - vývoj absorpce nanočástic v čase mtween 20, 72 h Aplikace - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Diam. [nm] Magnetické značení buněk - PEI Částice biogenního magnetitu s kladně nabitým povrchem - DLS: velikost částic ~ 60 nm - Zeta potenciál: potvrdil kladně nabitý povrch: + 45 mv DLS - velikost castis - obaleni PEI 900 800 700 600 500 400 300 200 100 0 0,001 0,0025 0,005 0,01 0,05 0,1 0,25 1 5 koncentrace PEI Aplikace - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Diam. [nm] Magnetické značení buněk TWEEN 20 biogenní magnetit stabilizovaný Tween 20 - DLS: velikost částic ~ 55 nm - Zeta potenciál: ±0 - vizuálně se chová jako PEI - magnetit DLS - velikost castis - obaleni Tw een 20 1400 1200 1000 800 600 400 200 0 0,001 0,0025 0,005 0,01 0,05 0,1 0,25 1 5 koncentrace PEI Aplikace - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Magnetické značení buněk PEI - ukázka 1 hod 72 hod 48 hod Aplikace - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Magnetické značení buněk TWEEN 20 - ukázka 1 hod 72 hod 48 hod Aplikace - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Magnetické značení buněk TWEEN 20, absorpce lokalizace??? biokompatibilita, vliv bmnps na diferenciaci buněk??? vliv vnějšího mag. pole na značené buňky Aplikace - Modifikace PEI, TWEEN 20 magnetické značení buněk

Děkuji Vám za pozornost