Základy spektroskopie molekul Úterý 8:10 9:40 v CH3, Středa 15:40-17:10 v CH1 NMR spektroskopie 5 týdnů RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D. Hmotnostní spektrometrie 4.5 týdne IČ spektroskopie 3.5 týdne RNDr. Martin Štícha, Ph.D. Doc. RNDr. Ivan Němec, Ph.D. po kazdem useku zapoctovy test (>50% z kazdeho) opravne testy na konci semestru
NMR spektroskopie Hlavova 8, místnost 020 tel. 22195 1323 tosner@natur.cuni.cz www.natur.cuni.cz/nmr/vyuka.html
Sylabus Základní principy NMR Spektrální parametry Vztah mezi spektrem a strukturou Chemický posun Jemné štěpení a J interakce Experimentální zařízení Metody dvojí rezonance Dvoudimenzionální spektroskopie Dynamické jevy Pokročilejší aplikace
Literatura Böhm, Smrčková-Voltrová: Strukturní analýza organických sloučenin S. Voltrová: Příklady pro cvičení ze strukturní analýzy organických sloučenin Buděšínský, Pelnář: UOCHB: Fyzikálně chemické metody 3: Nukleární magnetická rezonance R.M. Silverstein, F.X. Webster, D.J. Kiemle: Spectrometric identification of organic compounds (2005) P.J. Hore: Nuclear magnetic resonance P.J. Hore, J.A. Jones, S. Wimperis: NMR: the toolkit Friebolin: Basic One- and Two-Dimensional NMR Spectroscopy Günter: NMR Spectroscopy Claridge: High-resolution NMR techniques in organic chemistry...
Další zdroje M. Tomanová: Podpůrný materiál pro výuku zaměřenou na NMR spektroskopii na středních školách (diplomová práce, 2013, školitel Z. Tošner) Spectral Database for Organic Compounds: http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/cre_index.cgi?lang=eng Řešení NMR spekter: http://www.chem.ucla.edu/~webspectra/
Využití NMR
Využití NMR určování chemické struktury přírodní látky, organická syntéza konstituce, konformace, konfigurace ověření čistoty studium dynamických procesů reakční kinetika chemické a strukturní rovnováhy určení prostorové struktury peptidy a proteiny oligonukleotidy a DNA, RNA komplexy polysacharidy navrhování léčiv drug design Structure-Activity-Relationship metabolomika lékařství zobrazování měkkých tkání anatomie, patologie funkční zobrazování in vivo spektroskopie fyzika struktura materiálů potravinářství quality control spektroskopie, zobrazování falšované potraviny (alkohol, džusy, med,...)
Nobelovy ceny a NMR 1943 1944 1952 Otto Stern magnetický moment protonu 1991 Isidor Rabi první měření magnetického momentu atomového jádra Felix Bloch Edward Purcell rozvoj metod měření precese magnetického momentu a objevů s tím spojených 2002 Richard Ernst metodologie NMR vysokého rozlišení (2D experimety) Kurt Wüthrich NMR metodika určování prostorové struktury biomolekul 2003 zobrazování magnetickou rezonancí (MRI) Peter Mansfield Paul Lauterbur
NMR Purcell 1951 Varian 60 MHz spektrometr 1958
NMR Bruker Jeol Varian / Agilent
Rozkvět NMR První aplikace měření magnetických momentů jader Finding the magnetic moment of a nucleus was difficult because different electronic environments around each equivalent magnetic nuclei shifted the peak from its true value. Annoyed physicists dubbed the phenomenon the "chemical shift," not realizing the analytical potential of their discovery. Rychle převzato chemiky... the "annoying" features of an NMR spectrum, from a physicist's point of view, gave an ideal combination of "enough information to be useful and not so much to be an embarrassment of riches" http://archive.is/kypn
Rozkvět NMR
Pulsní metoda měření R. Ernst, Nobel Prize poster
Vícerozměrná spektra R. Ernst, Nobel Prize poster
Vícerozměrná spektra 1 H spektrum 2D HSQC korelační spektrum HO O O H O HO O H H OH H H OH OH H 3 C CH 3
NMR biomolekul Prostorová struktura molekul Pohyblivost a lokální flexibilita struktury Vzájemné interakce biomolekul zředění informace
Metabolomika analýza změn složení metabolitů v reakci na tepelný stres Drosophila melanogaster C kontrola H malý tepelný stres S velký tepelný stres (20% mortalita) HS postupný tepelný stres multikomponentní statistická analýza Malmendal et al, Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol, 2006, 291,205-212
MRI
dnes MRI
MRI Angiografie Funkční MRI Vliv drog pravdy na paměť při učení různá mozková aktivita (zhoršují paměť)
MRI Sledování uspořádání neuronových vláken Healthy control patient with tuberous sclerosis patient with TS and autism A view of autism: altered brain pathways, disordered white matter J.M. Peters et al., Academic Radiology 2012, 19 (1), 17-25.
in vivo MR spektroskopie 1H Cho NAA Cho Cr Cr NAA 31P Wilson s disease
domácí slivovice Cvičení z NMR biomolekul voda + OH ethanolu + OH methanolu CH 2 ethanolu CH 3 ethanolu CH 3 methanolu