ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN

Podobné dokumenty
Listeria monocytogenes NEBEZPEČNÝ PATOGEN A JEHO DETEKCE V POTRAVINÁCH

Charakteristika Listeria monocytogenes a její výskyt v potravinách. Červinková Pavla DiS.

Polymerázová řetězová reakce. Základní technika molekulární diagnostiky.

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti NUKLEOVÉ KYSELINY

Hybridizace nukleových kyselin

STAFYLOKOKOVÉ ENTEROTOXINY. Zdravotní nezávadnost potravin. Veronika Talianová, FPBT, kruh: 346 Angelina Anufrieva, FPBT, kruh: 336

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Státní veterinární ústav Praha Zkušební laboratoř hygieny potravin a krmiv Sídlištní 136/24, Praha 6 Lysolaje

Rekombinantní protilátky, bakteriofágy, aptamery a peptidové scaffoldy pro analytické a terapeutické účely Luděk Eyer

Serologické vyšetřovací metody

Amplifikační metody umožňují detekovat. k dispozici minimálně kopií DNA,

Elektroforéza Sekvenování

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY

Enterobacter. Salmonella spp. Agro-Food Diagnostics AUSTRIA BULGARIA CROATIA CZECH REPUBLIC HUNGARY POLAND ROMANIA SERBIA SLOVAKIA SLOVENIA

J09 Průkaz nukleové kyseliny

Molekulárně biologické a cytogenetické metody

ČSN EN ISO ČSN ISO ČSN EN ISO 6579, kromě bodu

MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha

Molekulární diagnostika

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU

Kultivační metody stanovení mikroorganismů

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

Enterobacter sakazakii alias Cronobacter sakazakii

Molekulární genetika

Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014

Veronika Janů Šárka Kopelentová Petr Kučera. Oddělení alergologie a klinické imunologie FNKV Praha

ÚVOD DO KVANTITATIVNÍ REAL-TIME PCR. VI. Aplikace qrt-pcr

Enterotoxiny Staphylococcus aureus. Jana Kotschwarová Andrea Koťová

Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA

~ 10 base pairs (3.4 nm)

Diagnostika retrovirů Lentiviry - HIV. Vladislava Růžičková

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR

METODY STUDIA PROTEINŮ

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Translace, techniky práce s DNA

Z P R Á V A. Důvody sledování

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Biosyntéza nukleových kyselin. VY_32_INOVACE_Ch0219.

MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII

DY D NE N X Hana Vlastníková

LABORATORNÍ PŘÍRUČKA. Laboratoř HLA systému a PCR diagnostiky

Modul IB. Histochemie. CBO Odd. histologie a embryologie. MUDr. Martin Špaček

Mikrobiologické diagnostické metody. MUDr. Pavel Čermák, CSc.

Diagnostické metody v analýze potravin. Matej Pospiech, FVHE Brno

2 Inkompatibilita v systému Rhesus. Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia

Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 647/2014 ze dne:

Bi5130 Základy práce s lidskou adna

MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE. 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR)

Hybridizace. doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

Metody molekulární biologie

Výzkumné centrum genomiky a proteomiky. Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.

Princip Porovnání vlastností různých záření Záření Vlnová délka (nm) Účinek na mikroorganismy

Mikročipy v mikrobiologii

Vypracovaly: Martina Hejtmánková Michaela Stapajová

Vliv vnitřních a vnějších faktorů na mikroorganizmy v potravinách

Využití metody ELFA při stanovení bakterií Salmonella spp. v potravinách

Studentská vědecká konference Sekce: Technologie potravin I (přednášková) Ústav Konzervace potravin (324) Učebna B11, 9:00

HOUBY A PLÍSNĚ. Mgr. Marie Vilánková. ECC s.r.o. Všechna práva vyhrazena

Fluorescenční mikroskopie

Metody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin

Metody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin

ČSN EN ISO ČSN ISO 4832

Pokračování kultivačních metod

ČSN EN ISO ČSN ISO 4832

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

Principy úchovy potravin. Fyziologické změny. Fyziologické změny. Enzymové změny. Fyziologické změny

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Málo obvyklé nemocniční nákazy

kvasinky x plísně (mikromycety)

ČSN EN ISO ČSN ISO 4832

SYNTETICKÉ OLIGONUKLEOTIDY

Metody studia exprese mrna. jádro a genová exprese 2007

Modifikace PCR, sekvenování. Molekulární biologie v hygieně potravin Molekulárně biologická analýza potravin Přednáška 5, 2017/18, Ivo Papoušek

MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:

Modifikace PCR, sekvenování. Molekulární biologie v hygieně potravin 5, 2013/14, Ivo Papoušek

Oligobiogenní prvky bývají běžnou součástí organismů, ale v těle jich již podstatně méně (do 1%) než prvků makrobiogenních.

Kvantitativní detekce houbových patogenů v rostlinných pletivech s využitím metod molekulární biologie

Tematické okruhy k SZZ v bakalářském studijním oboru Zdravotní laborant bakalářského studijního programu B5345 Specializace ve zdravotnictví

Příloha č.: 1 ze dne: je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 416/2007 ze dne:

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

KVANTIFIKACE ZMĚN GENOVÉ EXPRESE

Moderní metody stanovení mikroorganismů

PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE - PERSPEKTIVNÍ ALTERNATIVA V ANALÝZE MIKROBIOLOGICKÝCH UKAZATELŮ KVALITY VOD

Pavla Hájková Barbora Soukupová

Co zjišťujeme u DNA ACGGTCGACTGCGATGAACTCCC ACGGTCGACTGCGATCAACTCCC ACGGTCGACTGCGATTTGAACTCCC

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE. Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha

Izolace, klonování a analýza DNA

Metody detekce a identifikace MO se zaměřením na PCR a její variace. Kamila Zdeňková

Detekce geneticky modifikovaných organizmů v potravinách a potravinářských surovinách

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ

Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA DNA. PCR polymerase chain reaction. Princip PCR PRINCIP METODY PCR

DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod.

IMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY A AGLUTINAČNÍ KOMPONENTY K DIAGNOSTICE PERTUSE A PARAPERTUSE

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

- na rozhraní mezi živou a neživou přírodou- živé jsou tehdy, když napadnou živou buňku a parazitují v ní nitrobuněční parazité

Ústav konzervace potravin

Transkript:

ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN Možnosti stanovení Listeria monocytogenes popis metod a jejich princip Mária Strážiková Aleš Holfeld

Obsah Charakteristika Listeria monocytogenes Listerióza Metody detekce L. monocytogenes v potravinách Kultivační metody Imunochemické metody Molekulárně-genetické metody Další metody Prevence Literatura

Doména : Bacteria Kmen: Firmicutes Třída : Bacilli Řád : Bacillales Čeled: Listeriaceae Rod: Listeria Listeria monocytogenes - G+, fakultativně anaerobní, nesporulující bakterie - patogenní MO, jednotlivé nebo v krátkých řetízcích - saprofyt a epifyt v travicím traktu člověka a živočichů - výskyt: voda, bahno, rostliny, trávicí trakt volně žijích zvířat - produkují katalasu, fermentují glukózu, hydrolyzují eskulin

Listerióza infekční onemocnění, bezpříznakové záněty mozkových blan, infekce CNS (menigitidy, septikémie, potraty) rizikové skupiny: těhotné ženy, osoby se slabou imunitou kontaminace masa při porážce zvířat primární kontaminace: v mléce, syrových výrobcích, syrová zelenina (hnojení fekáliemi) přenos na člověka: konzumace kontaminovaného potravin zdroje: maso a tepelně neopracované mastné výrobky, syrové mléko a mléčné výrobky (měkké a plísňové sýry), zelenina

Přenos infekce

Metody detekce Základní a moderní kultivační techniky Imunochemické techniky ELISA, IMS Molekulárně-genetické postupy PCR, qpcr Komerční soupravy Další techniky

Základní kultivační metoda ČSN EN ISO 11290-1:1999 Mikrobiologie potravin a krmiv - Horizontální metoda průkazu a stanovení počtu Listeria monocytogenes - Část 1: Metoda průkazu časově náročná metoda (5-8 dnů)

Moderní kultivační metody - založené na biochemických vlastnostech (důkaz enzymu) API Listeria test 10 mikrozkumavek s dehydratovaným chromogenním substrátem princip: testovaní enzymových reakcí nebo fermentace sacharidů, charakteristické pro jednotlivé druhy listerií přítomnost enzymů (arylamidasa, mannosidasa, glukosidasa) fermentace sacharidů (D-arabitol, D-xylosa, rhamnosa, α-methyl-d-glukosid) vyhodnocení: vizualizace dle interpretační tabulky nebo identifikačním softwarem

RAPID L. mono test princip: průkaz aktivity enzymu fosfolipasy - modré zbarvení kolonií, a na schopnosti využívat xylosu - vytvoření patrné žluté zóny vyhodnocení: L. monocytogenes vykazuje fosfolipasovou aktivitu a není schopná využívat xylosu - čistě modrá barva bez doprovodné halo zóny.

ALOA a COMPASS L. mono Agar princip: průkaz β-glukosidasy vyhodnocení: modré až modrozelené zabarvení kolónii L. monocytogenes - působením fosfolipasy C - specifické pro fosfatidylinositol (PI-PLC) - vytváří kolem kolonií žlutou halo zónu

Imunochemické metody rychlé metody jednoduché provedení detekce složitých matric relativně nízká cena princip: interakce protilátek s antigenem používány in vitro polyklonální, monoklonální nebo rekombinantní protilátky vytvořené proti antigenním strukturám, které jsou charakteristické pouze pro bakterie rodu Listeria

Imunochromatografická technika na membráně nejčastěji sendvičové uspořádání první typ protilátky je imobilizován na povrch membrány, druhá protilátka je konjugována s barevnými latexovými částicemi a je nanesena spolu se vzorkem na počátek membrány - pohyb pomocí kapilárních síl přítomnost antigenu interakce s protilátkou detekce : imunokomplex se váže na imibilizovanou protilátku - barevná linka v testovací oblasti

Enzymová imunoanalýza ELISA = Enzyme linked immunosorbent assay jeden z imunoreaktantů vázan na tuhou fázi a druhý je značený enzymem tzv. nekompetitivní (sendvičový) postup: na tuhu fázy imobilizované protilátky poté přidán vzorek - buňky interagují s protilátkou po odstranění nenavázaných složek protilátka značená enzymem detekce: enzymová reakce - přeměna bezbarvého substrátu na barevný produkt

Molekulárně-genetické metody určení MO na základně genetické informace princip : specifické komplementace (hybridizace) mezi hledaným úsekem jednovláknové nukleové kyseliny z lyzovaných buněk bakterie a sondou sonda - synteticky připravená krátká sekvence nukleotidů komplementární k hledanému úseku vysoce citlivé metody PCR, qpcr, hybridizace, amplifikace specifických úseků RNA, LCR

Polymerásová řetězová reakce PCR = polymerase chain reaction enzymová metoda namnožení definovaného úseku DNA in vitro postup: denaturace při teplotě ~95 C hybridizace primeru při teplotě ~68 C, vazba DNA polymerasy extense při teplotě 72 C detekce: agarosová elektroforéza s ethidiumbromidem - elektroforeogram pod UV světlem další možnost: radioaktivně nebo fluorescenčně značené primery

Elektroforeogram

Kvantitativní PCR real-time PCR, qpcr založena na principu klasické PCR dvě možnosti: měření fluorescence v průběhu zvýšení fluorescence interkalačního barviva (SYBR Green) v UV světle po navázání na dsdna TaqMan - schopnost DNA-polymerasy odbourávat oligonukleotidy od 5 - konce sonda modifikována fluorescenční značkou na 5 -konci a zhášečem na 3 -konci

Hybridizace hybridizace mezi hledaným úsekem jednovláknové nukleové kyseliny a sondou sonda - komplementární k hledanému úseku značena např. chemiluminiscenční značkou po hybridizaci přidáno selekční činidlo - slouží k rozlišení hybridizované a volné sondy

Amplifikace specifických úseků RNA úsek bakterialní RNA přepsán do komplementární DNA (cdna) reverzní transkriptasou ribonukleasa H z Escherichia coli (RNAasa H) uvolní cdna z hybridu DNA-RNA po syntéze komplementárního řetězce je cdna DNA-dependentní-RNA polymerasou přepsána zpět do molekul RNA opakovaním tohoto kroku - namnožení cílového úseku sondy - krátké oligonukleotidové sekvence komplementární ke specifickým sekvencím bakteriální RNA 2 druhy primerů detekce : agarosová elektroforéza, kvantitativní PCR

Ligasová řetězová reakce (LCR) obdobné jako PCR využití dvou párů primerů páry jsou komplementární ke dvěma sousedním oblastem stejného vlákna DNA dvojice primerů nepřekrývá celý hledaný úsek DNA - ponechána mezera, která je doplněna termostabilní polymerasou DNA následuje spojení obou úseků termostabilní ligasou mnohonásobným opakováním se zvětšuje množství hledaného úseku DNA ve vzorku

Komerční soupravy na principu molekularně-genetických a imunochemických metod

Další metody DNA čipy Biosenzory Spektrometrické metody FT-IR, Raman

Prevence všeobecné pokyny jako při nákaze jako např. salmonelózou syrovou potravinu živočišného původu jako hovězí, vepřové nebo drůbež důkladně vařte syrovou zeleninu před tím, než ji sníte, důkladně omývejte neuvařené maso dávejte odděleně od zeleniny, uvařených potravin a zakoupených hotových potravin vyhněte se konzumaci syrového (nepasterizovaného) mléka nebo potravin ze syrového mléka po manipulaci s neuvařenými potravinami si umyjte ruce, omyjte nože a prkénko

Literatura Blažková M., Karamonová L., Fukal L., Rauch P. Listeria monocytogenes nebezpečný patogen a jeho detekce v potravinách Chemické listy 99, 2005, 467-473 s S. Jadhav et al., Journal of Microbiological Methods 88, 2012, 327-341 s Charakteristika Listeria monocytogenes a její výskyt v potravinách, Červinková Pavla, Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně Helen H. Lee, Ligase chain reaction, Department of Haematology, University of Cambridge, Cambridge, U.K., 1996 http://www.bio-rad.com/en-jp/product/rapidl-mono-medium http://cit.vfu.cz/alimentarni-onemocneni/lm/index.html http://www.efsa.europa.eu/ http://cs.wikipedia.org/wiki/listeri%c3%b3za

Děkujeme za pozornost!