S L E Z S K Á N E M O C N I C E V O P A V Ě příspěvková organizace Olomoucká 470/86 Opava L A B O R A T O R N Í P Ř Í R U Č K A Úseku L É K A Ř S K É M I K R O B I O L O G I E Centrálních laboratoří 2019 LP-CLSNO-M-2019-31-03 strana 1 (celkem 51)
Seznam zkratek Aglu ATB ATM CL Cp/ml DNA EDTA ELISA ESBL HA IAv ICH IČL IČP IP IUD IU/ml KFR LP LPř M MRSA NASKL PCR RRR RT-PCR RNA SNO TBC TP TPHA TRN VRE aglutinace antibiotika antimykotika centrální laboratoře kopie na mililitr deoxyribonukleová kyselina ethylendiamintetraoctová kyselina Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay Extended-spectrum β-lactamases (širokospektré β-laktamázy) hemaglutinace index avidity imunochromatografie identifikační číslo lékaře identifikační číslo pracoviště index pozitivity nitroděložní tělísko mezinárodní jednotky na mililitr komplement fixační reakce laboratorní příručka léčivé přípravky mikrobiologie methicilin rezistentní Staphylococcus aureus Národní autorizační středisko pro klinické laboratoře při České lékařské společnosti Jana Evangelisty Purkyně Polymerase Chain Reaction rychlá reaginová reakce Realtime Polymerase Chain Reaction ribonukleová kyselina Slezská nemocnice v Opavě tuberkulóza transfuzní přípravky Treponema pallidum hemaglutinace tuberkulóza a respirační nemoci vankomycin rezistentní enterokoky LP-CLSNO-M-2019-31-03 strana 2 (celkem 51)
1 INFORMACE O LABORATOŘI... 4 1.1 KONTAKTNÍ ÚDAJE... 4 1.2 ZAMĚŘENÍ LABORATOŘE... 4 1.3 ORGANIZACE LABORATOŘE... 4 1.4 REŽIM LABORATOŘE... 5 2 OBLAST NABÍZENÝCH SLUŽEB... 5 2.1 SPEKTRUM VYŠETŘENÍ... 5 2.2 ANTIBIOTICKÉ STŘEDISKO... 6 2.3 KONZULTACE A HLÁŠENÍ VÝSLEDKŮ... 6 3 ÚROVEŇ A STAV AKREDITACE... 6 4 ZADÁVÁNÍ POŽADAVKŮ NA VYŠETŘENÍ... 6 4.1 POŽADAVKOVÉ LISTY ŽÁDANKY... 6 4.2 ÚSTNÍ POŽADAVKY NA VYŠETŘENÍ... 7 4.3 OVÁ (URGENTNÍ) VYŠETŘENÍ... 7 4.4 KRITÉRIA VYŘAZENÍ A ODMÍTNUTÍ BIOLOGICKÉHO MATERIÁLU... 8 4.5 VYŘIZOVÁNÍ STÍŽNOSTÍ... 8 5 PRIMÁRNÍ ODBĚR VZORKŮ A TRANSPORT DO LABORATOŘE... 8 5.1 OBECNÉ ZÁSADY SPRÁVNÉHO ODBĚRU... 8 5.2 VOLBA ODBĚROVÉHO SYSTÉMU... 9 5.3 POKYNY K SPRÁVNÉMU ODBĚRU VZORKŮ... 10 Bakteriologické vyšetření respiračního traktu... 10 Bakteriologické vyšetření urogenitálního traktu... 11 Vyšetření stolice... 12 Bakteriologické vyšetření klinického materiálu (stěry, tekutý materiál )... 12 Vyšetření klinického materiálu na přítomnost mykobakterií speciální požadavky ( Vyšetření na TBC )... 13 Mykologické vyšetření... 14 Vyšetření na kontrolu sterility a mikrobiologie prostředí... 14 PCR vyšetření... 14 5.4 TRANSPORT VZORKŮ... 15 5.5 PŘÍJEM VZORKŮ... 15 5.6 ZNAČENÍ VZORKŮ... 15 6 HLÁŠENÍ VÝSLEDKŮ A PŘEDÁVÁNÍ NÁLEZŮ... 16 7 ZMĚNY VÝSLEDKŮ... 17 8 LIKVIDACE POUŽITÝCH ODBĚROVÝCH MATERIÁLŮ... 17 9 SEZNAM VYŠETŘENÍ PROVÁDĚNÝCH NA ÚSEKU LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGIE... 18 9.1 KULTIVAČNÍ VYŠETŘENÍ... 18 9.1.1 Bakteriologická vyšetření... 19 Otorhinolaryngeální oblast... 19 Respirační trakt... 20 Gastrointestinální trakt... 21 Urogenitální trakt... 22 Krev, likvor... 25 Další materiály... 26 Screeningová vyšetření... 28 Kontrola sterility a mikrobiologie prostředí... 30 9.1.2 Mykologická vyšetření... 30 9.1.3 Mykobakteriologická vyšetření ( Vyšetření na TBC )... 32 9.2 SÉROLOGICKÁ VYŠETŘENÍ... 34 9.2.1 Infekční sérologické, parazitologické a imunologické metody... 34 9.2.2 Molekulárně biologické vyšetření... 45 9.3 Parazitologická vyšetření... 50 strana 3 (celkem 51)
1 INFORMACE O LABORATOŘI 1.1 Kontaktní údaje Název pracoviště: Úsek lékařské mikrobiologie Centrálních laboratoří Vedoucí Centrálních laboratoří prim. Vladimír Kurfürst Telefon 553 766 430 E-mail vladimir.kurfurst@nemocnice.opava.cz Vedoucí laborantka Centrálních laboratoří Eva Grabcová Telefon 553 766 432 E-mail eva.grabcova@nemocnice.opava.cz Vedoucí pracovník úseku lékařské mikrobiologie RNDr. Miroslava Dvořáková Telefon 553 766 450 E-mail miroslava.dvorakova@nemocnice.opava.cz Úseková laborantka lékařské mikrobiologie Iva Hamplová Telefon 553 766 452 E-mail iva.hamplova@nemocnice.opava.cz Garanti odbornosti RNDr. Miroslava Dvořáková RNDr. Pavel Moravec RNDr. Martina Sosíková MUDr. Daniel Pařízek Mgr. Michal Beran RNDr. Alexandra Nosková http://www.nemocnice.opava.cz/index.php?menu=4&id=19 1.2 Zaměření laboratoře V laboratořích lékařské mikrobiologie jsou prováděna vyšetření bakteriologická, parazitologická, mykologická, serologická, vyšetření na mykobakteria a vyšetření molekulárně biologickými metodami. Součástí laboratoří je Antibiotické středisko. Procesy vyšetření jsou zaměřeny na účelnou diagnostiku klinického stavu pacientů v čase odpovídajícím klinickým potřebám. Vyšetření provádíme pro klinickou složku Slezské nemocnice, Sdružené zdravotnické zařízení Krnov a pro další zdravotnická zařízení včetně nestátních ambulantních pracovišť a samoplátců. 1.3 Organizace laboratoře Úsek lékařské mikrobiologie je umístěn v samostatné části budovy O v přízemí objektu a v pavilonu Y. Do vnitřních prostor objektů je vstup zakázán z důvodů biologického rizika, povolen je pouze v odůvodněných případech za doprovodu personálu pracoviště. strana 4 (celkem 51)
Úsek lékařské mikrobiologie je členěn na laboratoře: Laboratoř: Kontakty na laboratoře: Příjem materiálu 553 766 453 Laboratoř molekulární biologie 553 766 454 Bakteriologická laboratoř (moče, stolice, KLI, JIP) 553 766 457, 553 766 445 Mykologická laboratoř 553 766 455 Laboratoř pro zpracování prim. ster. materiálu 553 766 458 Mykobakteriologická laboratoř 553 766 455 Laboratoř infekční sérologie 553 766 456 Serologická parazitologie 553 766 447 Parazitologie pavilon Y 553 766 459 Konzultační telefonické linky: Antibiotické středisko 553 766 340 (primář infekčního oddělení) Hlášení výsledků a konzultace 553 766 445 nebo 553 766 446 1.4 Režim laboratoře Pracovní doba: Pondělí pátek: Sobota: Neděle: 7:00 15:30 hod. 6:00 14:30 hod. 7:00 12:30 hod. Příjem materiálu: Pondělí pátek : Sobota: Neděle: 7:00 15:00 hod. 6:00 14:00 hod. 7:00 12:00 hod. Pohotovost: Je zajištěna po celou dobu mimo běžný provoz od 17:00. V pohotovostním režimu je provoz zajišťován laborantkou a vysokoškolským pracovníkem, kteří jsou přítomni na telefonu v dostupné vzdálenosti k pracovišti a v případě potřeby jsou přivoláni na pracoviště. 2 OBLAST NABÍZENÝCH SLUŽEB Laboratoř poskytuje služby v odbornosti lékařská mikrobiologie (bakteriologie, parazitologie, virologie, infekční sérologie, mykologie a mykobakteriologie, molekulární biologie) odbornost je dle Seznamu zdravotních výkonů vydaného Ministerstvem zdravotnictví České republiky. Provádíme také vyšetření veterinárních vzorků a kontrolu sterility primárně sterilního materiálu. 2.1 Spektrum vyšetření Spektrum vyšetření viz kapitola 9 Seznam prováděných vyšetření. strana 5 (celkem 51)
Vyšetření, která neprovádíme, odesíláme pravidelně dvakrát denně přepravní službou do příslušných externích laboratoří (tzn. svoz Krnov 7:30 hod. a 12:45 hod., svoz Ostrava 7:30 8:00 hod. a 11:30 12:00 hod., svoz Laboratoře Agel 8:00 hod. a 11:30 hod.). 2.2 Antibiotické středisko Primář infekčního oddělení konzultuje a doporučuje antimikrobiální terapii na základě laboratorních výsledků a klinické diagnózy, spolupracuje s Lékovou komisí při výběru antimikrobiálních léků pro nemocnici a schvaluje výdej vázaných antibiotik, sleduje vývoj rezistence klinicky významných mikroorganismů. 2.3 Konzultace a hlášení výsledků Pro telefonická hlášení a konzultace jsou k dispozici odborní pracovníci mikrobiologie. V oblasti léčby a citlivostí/rezistencí kmenů na antibiotika konzultuje primář infekčního oddělení. 3 ÚROVEŇ A STAV AKREDITACE Pracoviště lékařské mikrobiologie je od roku 2011 zařazeno do registru klinických laboratoří. V roce 2016 pracoviště absolvovalo Audit II NASKLu a úspěšně prochází následujícími audity dle ISO 15189. Systém kvality je zajišťován prováděním interních kontrol kvality včetně interní auditní činnosti a pravidelnou účastí na externím hodnocení kvality organizovaným Státním zdravotním ústavem Praha. 4 ZADÁVÁNÍ POŽADAVKŮ NA VYŠETŘENÍ 4.1 Požadavkové listy žádanky Žádanky pro nemocniční zařízení jsou k dispozici v elektronické podobě v příslušných NISech. Do laboratoře je doručena tištěná forma elektronické žádanky s odebraným materiálem. Žádanky pro mimonemocniční žadatele nabízíme v papírové formě. Žádanky jsou k dispozici na příjmu materiálu mikrobiologie. Na vyžádání papírové žádanky ochotně doručíme žadatelům. Žadatel si také může žádanku vytisknout z webových stránek: http://www.nemocnice.opava.cz/index.php?menu=4&id=19 Příjem materiálu je podmíněn správně vyplněnou žádankou! Žádanka musí obsahovat tyto údaje: rodné číslo/číslo pojištěnce datum narození a pohlaví pacienta, pokud nejsou jednoznačně určeny číslem pojištěnce (např. u cizinců) jméno a příjmení kód pojišťovny diagnózu (za neplatnou považujeme diagnózu W (příčinná dg.)) IČZ/IČP žadatele (IČP je dobré doplnit konkrétním oddělením nebo pracovištěm zdravotnického zařízení) RAZÍTKO žadatele s podpisem (tato podmínka nemusí být splněna u elektronických žádanek) datum odběru druh odebraného materiálu a anatomická lokalita, případně popisem upřesnit lokalitu strana 6 (celkem 51)
druh požadovaného vyšetření (bakteriologické, mykologické, mykobakteriologické, parazitologické ) Další žádoucí údaje: adresa trvalého bydliště vedlejší diagnózy ATB terapie IČL žadatele jméno pracovníka provádějícího odběr další podstatné údaje: Návrat z ciziny; Pobyt v tropické oblasti; Předoperační vyšetření; kontakt MRSA/ESBL; implantáty; tel. spojení na pacienta v případě, že se jedná o odběr stolice na bakteriologické vyšetření je žádoucí uvést telefonní číslo pacienta Při přiřazování žádanky a materiálu se kontroluje dodaný odebraný materiál a shoda mezi žádankou a materiálem. Požadavky na odebraný materiál: musí být popsán jménem a příjmením a/nebo rodným číslem pacienta v případě dodání více odběrů na jedné žádance, musí být jednotlivé odběrové soupravy popsány typem odebraného materiálu nebo pořadím odebraného materiálu správný materiál vzhledem k požadovanému vyšetření volba správné odběrové soupravy dostatečné množství materiálu pro požadované vyšetření zkumavka nebo žádanka nesmí být v žádném případě potřísněna materiálem Minimální požadovaná shoda mezi materiálem a žádankou je shoda příjmení a jména pacienta a/nebo rodného čísla, případně materiálu uvedeného na žádance a vlastního odebraného materiálu. Při příjmu materiálu je také kontrolováno dodržení podmínek pro dodání materiálu viz kapitola 9 Seznam vyšetření prováděných na úseku lékařské mikrobiologie. V případě zjištěné neshody mezi požadavky našeho pracoviště na žádanku a materiál je pracovník příjmu oprávněn materiál vyřadit a provedení vyšetření zamítnout viz kapitola 4.4 Kritéria vyřazení a odmítnutí biologického materiálu. 4.2 Ústní požadavky na vyšetření Tato forma doobjednání vyšetření je možná jen ve výjimečných a urgentních případech. Je možné doobjednat některá vyšetření na sérologii a molekulární biologii a to nejpozději do 48 hodin od přijetí vzorku do laboratoře. Dodatečná vyšetření nejsou možná u vzorků s požadavkem na kultivaci (bakteriologickou, mykologickou, mykobakteriologickou). Žadatel je vždy povinen zaslat novou, řádně vyplněnou žádanku s doordinovanými vyšetřeními. 4.3 Statimová (urgentní) vyšetření Požadavek na urgentní vyšetření musí být výrazně označen na průvodním listu, v rámci nemocnice je nutné požadavek statimového vyšetření dodat na žádance červené barvy. Výsledky statimového vyšetření jsou ihned po zhodnocení telefonicky hlášeny lékaři nebo zdravotní sestře. Kultivační vyšetření nelze ani v režimu statim urychlit (přínos vyšetření je závislý na určité minimální době kultivace). Na pohotovostní službě musí být materiál osobně předán službukonající laborantce. strana 7 (celkem 51)
Vyšetření prováděná v režimu Statim: Zhotovení a zhodnocení mikroskopického preparátu z likvoru Kultivační zpracování likvoru Latexová aglutinace z likvoru průkaz antigenů původců bakteriální meningitidy Zhotovení a zhodnocení mikroskopického preparátu a kultivační zpracování u klinického materiálu z akutních operací (hnisy, stěry ) nebo u vitálních indikací (krevní nátěr, sputum, moč z ARO a JIP) Kultivační a mikroskopické zpracování moče z dětského oddělení Mikroskopické zpracování pozitivní hemokultury Mikroskopické zhodnocení krevního nátěru. PCR vyšetření na chřipky, metody vyšetřované z likvoru provádí se mimo víkendy. V pátek doručit nejpozději do 11 hodin. 4.4 Kritéria vyřazení a odmítnutí biologického materiálu Vzniknou-li na příjmu materiálu pochybnosti o validitě odebraného materiálu nebo nejsou-li přítomny všechny požadované informace na žádance, materiál může být vyřazen. Možné nedostatky vedoucí k vyřazení materiálu: Chybějící, neúplné nebo nesprávné údaje na žádance Chybějící, neúplné nebo nesprávné údaje na odběrové soupravě Neshoda údajů na žádance a odebraném materiálu Žádaná metoda neodpovídá dodanému materiálu Odběr provedený do nevhodné odběrové soupravy Potřísnění zkumavky nebo žádanky materiálem Preanalytické nedostatky dodaného materiálu např.: chylózní, hemolytické sérum; nedostatek materiálu na požadované vyšetření; dlouhá doba transportu V případě vyřazení je vzorek zaevidován a nevyšetřen. O vyřazení je žadatel informován, žadateli je zaslán výsledkový list s uvedeným odůvodněním vyřazení. 4.5 Vyřizování stížností Stížností se rozumí ústní nebo písemná výtka ze strany klienta nebo dodavatele, která upozorňuje na rozpor se závaznými předpisy týkající se činnosti laboratoře. Připomínka má charakter podnětu, který by pro daného klienta měl zajistit zlepšení úrovně služeb. Stížnosti lze podat do 30 dnů po obdržení výsledků vyšetření. Pokud není stížnost určena nebo adresována vedení laboratoře, přijímá ji kterýkoli pracovník laboratoře. V případě písemně podané stížnosti nebo závažné stížnosti je vždy vypracována písemná odpověď na stížnost. Písemná odpověď není vypracovaná pokud klient nebo dodavatel písemné vyjádření nevyžaduje. 5 PRIMÁRNÍ ODBĚR VZORKŮ A TRANSPORT DO LABORATOŘE 5.1 Obecné zásady správného odběru Při přípravě pacienta k odběru je nutné dodržovat zásady stanovené vyhláškou Ministerstva zdravotnictví České republiky č. 195/2005 Sb. O hygienických požadavcích na provoz zdravotnických zařízení. Příprava pacienta před vyšetřením může výrazným způsobem ovlivnit výsledek. strana 8 (celkem 51)
Každý vzorek by měl být odebrán z místa, kde lze předpokládat přítomnost patogenů, a to co nejdříve a před nasazením ATB terapie. Odběr musí být proveden správným způsobem (asepticky, lege artis). Vzorek musí být odebrán do správných odběrových souprav. Vzorek i žádanka musí být jednoznačně a nezaměnitelně identifikovány. Vzorek musí být dopraven do laboratoře co nejrychleji, v odpovídajícím transportním médiu a za správné teploty. 5.2 Volba odběrového systému Odběrové systémy: Tampon s transportním médiem Tampon na drátku s transportním médiem Tampon s transportním médiem (bez aktivního uhlí) Sterilní zkumavka Zkumavka Urin- Monovette Komerční odběrová souprava pro srážlivou krev Vacutainer zkumavka s Li - heparinem Kontejner s lopatičkou Kontejner 30 ml Kontejner 120 ml Laryngeální sonda Součástí soupravy je sterilní tampon na plastové tyčince a odběrová zkumavka s transportním médiem. Vhodné pro odběr stěrů na bakteriologická a mykologická vyšetření. Součástí soupravy je sterilní tampon na drátku a odběrová zkumavka s transportním médiem. Vhodné pro odběr stěrů (z uší, nosohltanu) na bakteriologická a mykologická vyšetření. Součástí soupravy je sterilní tampon na plastové tyčince a odběrová zkumavka s transportním médiem. Vhodné pro odběr stěrů z prostředí (vyšetření sterilit) Sterilní zkumavka 10 ml. Vhodná pro odběr moče, aspirátu bronchu, jiného tekutého materiálu, kanyl event. tkáně na bakteriologické a mykologické vyšetření. Dále pro některé odběry na molekulárně biologické metody. Sterilní zkumavka 10 ml. Vhodná pro odběr moče na bakteriologické vyšetření. Vhodná pro odběry krve na serologická vyšetření a vyšetření metodami molekulární biologie. Sterilní odběrová zkumavka s lithium - heparinem. Vhodná pro odběry krve na vyšetření QuantiFERON -TB test. Odběrovou soupravu i s žádankou vydá laborantka na příjmu mikrobiologie. Tento druh odběru je nutné dodat do laboratoře před 8 hodinou ráno nebo do 11:30 hod., materiál musí být odeslán do smluvní laboratoře již v den odběru. V opačném případě může být materiál odmítnut. Sterilní odběrová zkumavka s lopatičkou Vhodná pro odběry stolice na parazitologická vyšetření a průkazy antigenu patogenů ze stolice. Sterilní odběrová zkumavka 30 ml se šroubovacím uzávěrem. Vhodná pro odběr sputa a jiných tekutých materiálů. Dále pro některé odběry na molekulárně biologické metody. Odběrová nádobka s červeným šroubovým uzávěrem, sterilní. Vhodná pro odběr moče na přítomnost mykobakterií (TBC). Sterilní skleněná zkumavka s laryngeální sondou z chrommolybdenového drátu bez transportního média. Vhodné pro provedení laryngálního výtěru vyšetření na přítomnost strana 9 (celkem 51)
mykobakterií. Mikroskopické podložní sklo Hemokultura Perianální otisk Uricult E-Swab Zkumavka na helikobaktera Kultivační média Vhodné pro odběry materiálu na přímou mikroskopii. Hemokultivační lahvička obsahující tekuté kultivační médium. Aerobní; anaerobní; Pedi (dětská); mykotická. Vhodné pro odběr krve případně jiných tekutých materiálů. Sklíčko s nalepenou průhlednou páskou. Vhodné pro odběr vajíček roupů. Kombinované kultivační médium v plastové Petriho misce nebo v kontejneru se šroubovacím uzávěrem určené ke kultivaci mikrobů z odebrané moče. Určeno k okamžité kultivaci moče ihned po odběru na klinickém oddělení. Souprava obsahuje speciální odběrový tampon a transportní médium v odběrové zkumavce. Určené pro odběry na molekulárně biologické metody. Sterilní zkumavka obsahující médium pro odběr bioptického materiálu ze stěny žaludeční sliznice. Dodává na vyžádání laboratoř lékařské mikrobiologie. Určeno pro průkaz Helicobacter pylori v bioptickém materiálu získaném gastroskopií. Zpravidla pevné agarové médium v Petriho misce. Druh vybírá laboratoř podle typu požadovaného vyšetření a na vyžádání dodá žadateli. Určeno pro přímé nanesení odebraného biologického vzorku nebo otisk. Vhodné např.: k vyšetření na Neisseria gonorrhoeae; otisky z prostředí, spad. Konkrétní informace ke správné volbě odběrové soupravy pro konkrétní vyšetření je součástí tabulkové části. Upozornění: Odběrový materiál s překročenou dobou exspirace nelze používat! 5.3 Pokyny k správnému odběru vzorků Bakteriologické vyšetření respiračního traktu Výtěr z krku (tonsil): Odběr provádět nejlépe ráno nalačno, pacient by neměl před odběrem jíst, pít, kouřit nebo si vyplachovat ústa. Provede se pomocí špachtle, kterou se stlačí kořen jazyka, provede se stěr z tonsil a tampon se zasune do transportního média. Při podezření na záškrt a jiné vzácné nákazy dle možností konzultovat s laboratoří předem. Výtěr z nosu: Tampon se zavede do obou nosních průduchů asi 1 2 cm hluboko a rotačním pohybem se setře nosní sliznice, pak se tampon zasune do transportního média. strana 10 (celkem 51)
Výtěr z nosohltanu: Odběr provádět ráno nalačno. Drátek ohnout o okraj zkumavky, špátlí stlačit kořen jazyka, provést stěr zadní klenby nosohltanu (vyhnout se tonsilám), drátek narovnat a zasunout do transportního média. Při podezření na pertuse dle možností konzultovat s laboratoří předem. Sputum: Odběr provádět ráno nalačno po provedení hygieny ústní dutiny nebo vypláchnutí úst vodou. Pacient vykašle sputum do sterilního kontejneru. Bronchoalveolární laváž (BAL), aspirát z bronchoskopie, aspirát z tracheostomické kanyly: Odběr provádět podle metodického návodu pro obor TRN. Bakteriologické vyšetření urogenitálního traktu Moč: Odebrat střední proud ranní moče, u infekcí prostaty poslední porci moče, u infekcí močové trubice první porci moče. Střední proud u muže: Po přetažení předkožky si pacient omyje glans vlažnou mýdlovou vodou a otře sterilní gázou. První porci moče močí pacient do WC, pak do odběrové nádobky. Střední proud u ženy: Po důkladné hygieně genitálií (žena si jednou rukou oddálí labia a druhou rukou si gázovým tamponem namočeným ve vlažné vodě očistí genitál směrem zepředu dozadu) močí žena první porci do WC, pak do odběrové nádobky. Cévkovaná moč: Po aseptickém zavedení sterilní cévky se prvních několik ml moče odstraní a k vyšetření se posílá až vzorek z následující porce. Dostatečné množství na vyšetření moče je asi 5 ml. Uricult: Vzorkem moči (střední proud nebo cévkovaná) je přelita nanášecí plocha Uricultu, která je poté kryta víčkem. Inokulovaný Uricult je možné ponechat na klinickém oddělení a inkubovat při pokojové teplotě po dobu 1-3 dní. Nebo může být transportována do laboratoře k inkubaci. V případě pozitivního nárůstu na klinickém oddělení by měl být Uricult transportován do laboratoře, doba přepravy či uchovávání plotny s pozitivním nárůstem by neměla překročit 24 hodin. Stěr z uretry: Výtěr se provádí nejlépe v ranních hodinách, pokud pacient ještě nemočil nebo 3 6 hodin po posledním močení. Před odběrem se otře ústí močové trubice sterilním tamponem zavede se odběrový tampon do ústí uretry u muže asi 2 3 cm, u ženy několik mm hluboko, pak zasunout tampon do transportního média. Výtěr z vaginy a cervixu: Výtěr z cervixu provádí lékař za použití zrcadel. Po odstranění hlenové zátky sterilním tamponem zavede lékař odběrový tampon do cervikálního kanálu 2 3 cm hluboko, pak tampon vloží do média. Výtěr z vaginy provádí lékař za použití zrcadel, tampon se nechá nasáknout materiálem v zadní klenbě poševní, pak se zasune do transportního média. Odběr z vaginy se provádí až po odběru z cervixu. strana 11 (celkem 51)
Pro zhotovení mikroskopického preparátu se odebere samostatný vzorek na tampon a zasune se do odběrové soupravy bez transportního média. Odběr na vyšetření Streptococcus agalactiae se provádí z bočních stěn dolní třetiny vaginy bez použití zrcadel. Ejakulát: Ejakulát odebrat po 3 4 denní sexuální abstinenci do sterilního kontejneru, event. prezervativu a poté přelít do sterilního kontejneru. Vyšetření stolice Při pobytu pacienta v rizikových oblastech zřetelně označit na žádance NÁVRAT Z CIZINY. Bakteriologické vyšetření stolice: Tampon zavést 1 2 cm do konečníku, po odběru zasunout do transportního média. Cílené vyšetření na Clostridium difficile toxin A/B a antigen, rotaviry a adenoviry, noroviry, Helicobacter pylori: Odebrat stolici velikosti hrášku nebo asi 0,5 ml tekuté stolice. V případě, že je požadováno více metod, je nutné dodat větší množství stolice. Parazitologické vyšetření stolice: Odebrat kusovou stolici (5 g) nebo tekutou stolici (1 ml). Odběr stolice opakovat 3x v rozmezí 3-7 dní. Možnost existence negativní fáze infekce, při níž nejsou ve stolici ani v perianálním otisku vajíčka ani cysty, ale klinické příznaky přetrvávají. Perianální otisk: Pacient si provádí odběr po probuzení, konečník se před odběrem neumývá ani neutírá. Lepící páska se odlepí od sklíčka, důkladně přitlačí do intergluteální rýhy, po odlepení se zpět přilepí na podložní sklíčko. Bakteriologické vyšetření klinického materiálu (stěry, tekutý materiál ) Stěr, výtěr z rány: Provést stěr nebo výtěr z postiženého místa, nejlépe z hloubky i okraje rány, nedotknout se okolí léze, zasunout do transportního média. Je-li to možné, lépe provést odběr tekutého materiálu pro možnost mikroskopického vyšetření. Stěr ze spojivek: Po oddálení očního víčka setřít sekret ze spojivkového vaku směrem od vnitřního k zevnímu koutku oka, zasunout tampon do transportního média. Výtěr ze zevního zvukovodu: Tahem za boltec se vyrovná zevní zvukovod a za použití světelného zdroje se provede odběr z ložiska, pak tampon zasunout do transportního média. Hnis ze středního ucha při paracentéze: Provádí lékař specialista. Tekutý materiál: Odběr z postiženého místa provádí lékař sterilními nástroji za sterilních podmínek. Pro záchyt anaerobů je vhodné zabránit přístupu vzduchu použitím gumové zátky. Při požadavku také na anaerobní vyšetření není nutné dodávat dvě zkumavky s odebraným materiálem. V případě, že je požadováno více metod (např. bakteriologie, mykologie, sérologie) je nutné dodat dostatečný počet odběrových zkumavek. strana 12 (celkem 51)
Likvor: Odběr provádí lékař za sterilních podmínek punkční jehlou. První porce vytékajícího likvoru se pro bakteriologické vyšetření nehodí. Je vhodné odebrat asi 2 ml likvoru v závislosti na požadovaném druhu vyšetření. Katetr, kanyla, cévka, drén apod.: Pomocí sterilních nůžek a sterilní pinzety odstřihnout asi 2 5 cm materiálu a asepticky vložit do zkumavky nebo kontejneru. V případě zájmu jsme ochotni dodat sterilní zkumavky s glukózovým bujónem. Sekční materiál: Odběr provádí lékař sterilními nástroji se snahou o co nejmenší kontaminaci mikrobiotou z okolních lokalit. Tampon se po odběru zasune do odběrového média. Žaludeční biopsie pro průkaz Helicobacter pylori: Odběr provádí lékař pomocí endoskopu na specializovaném pracovišti. Hemokultura: Odběr provádět za aseptických podmínek. S použitím sterilních rukavic se provede dezinfekce místa vpichu a dezinfekce gumové zátky lahvičky. Po zaschnutí dezinfekčního přípravku se doporučuje provést stěr z kůže v místě vpichu k vyloučení případné kožní kontaminace. Odebraná krev dospělí 3 10 ml, děti 1 3 ml se vstříkne ihned do hemokultivačních lahviček. Gumovou zátku není nutné přelepovat. Každá hemokultura je označená odlepitelným kódem, který je nutno nalepit na žádanku v daném pořadí, jak byly hemokultury odebírány (v případě odběru více sad hemokultur to zajistí správné zařazení). Vyšetření klinického materiálu na přítomnost mykobakterií speciální požadavky ( Vyšetření na TBC ) Sputum: 2-5 ml do sterilního kontejneru, doporučeny 3 odběry (3 dny po sobě). Moč: Ranní moč, střední proud do nádobek na 120 ml. Doporučujeme 6 odběrů po sobě (6 dní). Laryngeální výtěry: 1 vzorek = 3 laryngeální výtěry na drátku, odběr proveden tamponem zvlhčeným sterilním fyziologickým roztokem nad epiglotis, pacient musí zakašlat (odběrové tampony dodá mikrobiologie). Likvor: Minimálně 3 ml likvoru do sterilní zkumavky. Punktát, aspirát, tkáň: Odběr do sterilní zkumavky. Hnis: Odběr do sterilní zkumavky, případně stěry na tři tampony na drátku (odběrové tampony na požádání na oddělené mikrobiologie). Pro odběry TBC nejsou vhodné soupravy s transportním médiem nebo umělohmotnou tyčinkou! strana 13 (celkem 51)
Mykologické vyšetření K vyšetření je vhodný veškerý klinický materiál (sputum, moč, hnis, šupiny, nehty, vlasy, stěry, výtěry..), odběry viz Vyšetření na bakteriologii. Nutnou podmínkou je dostatek materiálu k požadovanému vyšetření. Vyšetření na kontrolu sterility primárně sterilního materiálu a mikrobiologie prostředí Laboratoř sterilit kontroluje sterilitu transfuzních přípravků transfuzních oddělení, dále kontroluje sterilitu přípravků vyráběných nemocniční lékárnou (infuzní roztoky, oční kapky), provádí kontrolu mikrobiálního osídlení ze stěrů a otisků u personálu na klinických odděleních dle požadavků zadávaných nemocničním hygienikem či epidemiologickou sestrou. PCR vyšetření Výtěr z faryngu - sterilním tampónem krouživým pohybem důkladně vytřeme zadní stěnu faryngu, je nutné se vyhnout mandlím. Tampón vytřepeme do zkumavky s odběrovým médiem a zalomíme ve zkumavce. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. Výtěr z nosu - sterilní tampón šroubovitým pohybem zavedeme pod nosní skořepu a provedeme výtěr, tímto jedním tampónem provedeme výtěr i z druhé nosní dírky. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. Výtěr z nosohltanu - sterilním tampónem krouživým pohybem důkladně vytřeme zadní stěnu faryngu, je nutné se vyhnout mandlím. Tampón vytřepeme do zkumavky s odběrovým médiem a zalomíme ve zkumavce. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. BAL, tekutina z výplachu bronchů - vlastní odběr se provádí na specializovaném pracovišti. Materiál se odsává z míst s probíhajícím zánětem po vpravení vhodného objemu sterilního fyziologického roztoku do příslušné partie plic. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. Výtěr z uretry, děložního hrdla, pochvy, puchýřků, spojivek Výtěr z postižených míst provedeme sterilním tampónem, odběr ze sliznic musí být dostatečně razantní, tak aby došlo k setření epitelií. U výtěru z urogenitálního traktu platí nejprve setření slizničního hlenu a teprve druhým tampónem, nebo odběrovým kartáčkem se provede vlastní odběr Srážlivá krev množství krve 2 5 ml (nebo 1ml odděleného séra) Zkumavka s aktivátorem hemokoagulace (odběrový systém BD Vacutainer červené víčko) množství krve 2 5 ml Zkumavka s dělícím gelem (odběrový systém BD Vacutainer žluté víčko). Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. Nesrážlivá krev Zkumavka s EDTA. Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. Likvor - odběr likvoru provádí lékař za sterilních podmínek punkční jehlou (lumbální nebo komorová punkce). Je vhodné odebrat min. 0,2 1,5 ml likvoru. Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. Moč - 5 10 ml moči ze středního proudu, při podezření na chlamýdiovou etiologii se zasílá první porce ranní moči. Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. strana 14 (celkem 51)
Tkáně, bioptické materiály Odběry se provádí z postižené tkáně sterilními nástroji. Odebraná tkáň nebo bioptický vzorek se vloží do sterilní zkumavky na sucho nebo jen do minimálního množství sterilní vody. Okamžitě dodat do laboratoře nebo zamrazit při teplotě - 70 C, event. při - 20 C. 5.4 Transport vzorků Transport vzorků do laboratoře je zajištěn svozovou službou nebo ošetřovatelským personálem. Vzorky jsou dopravovány v transportních uzavřených boxech. Obecné podmínky transportu Transport musí být dostatečně rychlý, aby nedošlo k znehodnocení odebraného materiálu. Při plánování času odběru pacienta je nutné počítat s rezervou pro dopravu a příjem vzorku do laboratoře. Při extrémních vnějších teplotách je nutné zajistit ochranu vzorku transportem v boxech zamezujících znehodnocení vzorku mrazem nebo horkem (chladicí vložka v létě, vytemperování boxu na laboratorní pokojovou teplotu v zimě). Vzorky musí být transportovány zároveň se žádankami nebo průvodkami k elektronickým žádankám. Vzorky biologického materiálu musí být transportovány v kolmé poloze, uzavřené a odběrová nádobka ani žádanka nesmí být v žádném případě zvenčí potřísněna biologickým materiálem. Během transportu musí být odběrové nádoby umístěny v pevné a nepropustné nádobě nebo stojánku odděleně od žádanek. Při odběru srážlivé krve je vhodné, aby se krev srazila v místě odběru (cca 20 minut při pokojové teplotě), čímž se zabrání možné hemolýze. Při odběru nesrážlivé krve je vhodné před transportem ponechat krev vytemperovat na pokojovou teplotu. Krev nesmí být vystavena přímému světlu, vede to k odbourávání bilirubinu. Speciální podmínky transportu U citlivých analýz je nutné dodržet časové nároky na transport v souladu se stabilitou analytu (např. Quantiferon). Vyšetření, která mají speciální požadavky na preanalytickou fázi jsou přijaté do laboratoře pouze za předpokladu splnění těchto požadavků. Podmínky pro transport a uchovávání jsou uvedeny v tabulkové části kapitola 9 Seznam prováděných vyšetření. 5.5 Příjem vzorků Materiál a žádanky jsou vkládaný do posuvného šuplíku, odkud si je přebírá pracovník příjmu lékařské mikrobiologie. Povinností pracovníka příjmu je zkontrolovat, zda jsou splněny požadavky na žádanku a odebraný materiál (viz kapitola 4.1). 5.6 Značení vzorků Po přijetí a fyzickém přezkoumání vzorků jsou žádanky ihned zaevidovány do LIS, průvodka a materiál získává unikátní číselné označení. Pod tímto číslem prochází vzorek laboratoří. strana 15 (celkem 51)
6 HLÁŠENÍ VÝSLEDKŮ A PŘEDÁVÁNÍ NÁLEZŮ Výsledky laboratorních vyšetření jsou postupně uvolňovány na klinická pracoviště po autorizaci garantem odbornosti pro mikrobiologii nebo oprávněným vysokoškolským pracovníkem CL pro vydávání výsledků a to v elektronické a/nebo papírové podobě. Podle naléhavosti požadavku (statim, rutina) a charakteru vyšetření je výsledek klinickému pracovišti k dispozici v odpovídajícím časovém intervalu. Laboratoř okamžitě informuje lékaře (nebo jiného klinického pracovníka zodpovědného za péči o pacienta), jsou-li výsledky v kritických intervalech viz tabulka Hlášení kritických (varovných) výsledků. Výsledky lze sdělovat ošetřujícím lékařům a těm zdravotnickým pracovníkům, kteří se podílejí na ošetřování příslušného pacienta. Výsledky se nesdělují pacientům, rodinným příslušníkům, zaměstnavatelům pacienta a dalším nezdravotnickým orgánům a organizacím. Je zakázáno telefonické sdělování výsledků vyšetření rodinným příslušníkům. Volající je informován, že informace poskytuje ošetřující lékař a budou sděleny jemu. Pacientovi nebo jeho rodinnému příslušníkovi se vydá kopie jeho nálezu v uzavřené obálce po předložení průkazu totožnost. Současně jsou výsledky vyšetření odeslány standardním způsobem žadateli. Telefonicky laboratoř sděluje výsledky vyšetření na základě žádosti žadatele, aktivně hlásí kritické (varovné) výsledky a epidemiologicky významné nálezy. Výsledky sdělují pouze pracovníci mikrobiologie k tomu oprávnění a tito pracovníci osobně odpovídají za správnost nahlášených údajů. O všech provedených hlášeních je pořízen záznam. Orgánům činným v trestním řízení (policie, soudy) se výsledky nebo nálezy poskytují pouze na základě písemné žádosti, kterou statutární zástupce předá jako nařízení vedoucímu klinické laboratoře, v tomto případě se výsledky nebo nálezy poskytují v písemné formě prostřednictvím statutárního zástupce. Hlášení kritických (varovných) výsledků Výsledky v kritických hodnotách jsou hlášeny aktivně. Hlášení musí obsahovat přesnou identifikaci pacienta (jména, rodné číslo). Osoba, která hlášení přijala, musí tento údaj potvrdit. Mikroskopické* vyšetření Pozitivní kultivace Pozitivní průkaz antigenu Bakteriologie likvor pozitivní hemokultury krevní nátěr nátěr z uretry a pochvy (při podezřením na gonorrhoeau) nátěr z nitroděložního tělíska kmen Staphylococcus aureus MRSA kmen Enterococcus faecium a faecalis VRE kmen s fenotypem ESBL, AmpC, KPC kmen rodu Campylobacter, Salmonella, Yersinia, Shigella, Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus; Escherichia coli - enteropatogenní, enterohemoragické, enterotoxinogenní izoláty z rektálních výtěrů kmen rodu Listeria, Corynebacterium difteriae, Bordetella pertussis, Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae první záchyt Streptococcus agalactiae u novorozenců bakterie latexovou aglutinací z likvoru strana 16 (celkem 51)
Pozitivní průkaz antigenu Protilátky Pozitivní průkaz Pozitivní průkaz Pozitivní průkaz antigenu Infekční sérologie rotavirus, adenovirus, norovirus, toxin Clostridium difficile A/B, pneumokok, Legionella pneumophila typ 1 EBV ELISA v parametrech IgM, IgA s hodnotou nad 1,1 IP u vyšetření požadovaných terénními lékaři VKE ELISA v parametrech IgM, IgA s hodnotou nad 1,1 IP u vyšetření požadovaných terénními lékaři pozitivní test TPHA, RRR - pouze první pozitivní nález pozitivní test na lékovou přecitlivělost Mykobakteriologie pozitivní mikroskopický nález pouze první pozitivní nález pozitivní kultivační nález pouze první pozitivní nález Parazitologie Malárie Trypanosomy Leishmania Tropické parazitozy Amébová dysenterie Pozitivní nález zákožky svrabové Myázy Toxoplazmoza pozitivní KFR, IgG, M, A, E Molekulární biologie Neisseria gonorrhoeae první záchyt Mycobacterium tuberculosis komplex HEV Influenza A/B * V případě hlášení mikroskopických nálezů je obsahem informace o barvitelnosti dle Grama a morfologii nalezených elementů. 7 ZMĚNY VÝSLEDKŮ V případě zjištění neshody na výsledkovém listu, je vyšetření vedoucím pracoviště nebo pověřených vysokoškolským pracovníkem znovu otevřeno. Výsledky jsou změněny a výsledkový list v podobě revidovaného protokolu znovu vydán v papírové a elektronické podobě. Při zjištění závažných neshod je telefonicky informován žadatel. O neshodě případně reklamaci je pořízen záznam. 8 LIKVIDACE POUŽITÝCH ODBĚROVÝCH MATERIÁLŮ Po zpracování vzorku je biologický materiál uchováván týden v chladničce k tomu vyčleněné. U serologických vyšetření je sérum zpracováno ihned nebo rozděleno na alikvoty, které jsou očíslovány a označeny druhem vyšetření a uloženy do mrazničky s teplotou -20 C do doby zpracování. Primární vzorek je uchováván při chladničkové teplotě 1 týden, zpracovaný alikvot také. Poté je materiál bezpečně zabalen a odvezen dopravní službou SNO k likvidaci do spalovny (viz Provozní řád Úseku lékařské mikrobiologie). strana 17 (celkem 51)
9 SEZNAM VYŠETŘENÍ PROVÁDĚNÝCH NA ÚSEKU LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGIE 9.1 Kultivační vyšetření U kultivačních vyšetřovacích metod nelze provést vyšetření v režimu statim. Statimové vyšetření lze provést jen u mikroskopického vyšetření viz kapitola 3.4 Statimová (urgentní) vyšetření. Předpokladem pro správnost výsledku je dodržení preanalytické fáze (správný odběr, podmínky transportu ). Po telefonické konzultaci žadatele vyšetření s laboratoří mikrobiologie je možné standardní kultivační vyšetření doplnit o další kultivační média zaměřená na detekci požadovaných agens. Po zpracování vzorku již není možné doobjednat další metody. Vysvětlivky k použitým zkratkám: A ACT AN aerobní kultivace cílená kultivace na Actinomyces sp. anaerobní kultivace CAMP cílená kultivace na Campylobacter sp. CIN cílená kultivace na Yersinia sp. (CIN) CLO cílená kultivace na Clostridium sp. (CLO) CPE ESBL GBS cílená kultivace na producenta karbapenemázy cílená kultivace na kmeny s produkcí ESBL cílená kultivace na Streptococcus agalactiae HS cílená kultivace na Haemophilus sp. (HS) MRSA cílená kultivace na Staphylococcus aureus MRSA (MRSA ) MYK základní mykologická kultivace (MYK) NG NM SORB STAU cílená kultivace na Neisseria gonorrhoeae cílená kultivace na Neisseria meningitidis cílená kultivace na enteropatogenní Escherichia coli cílená kultivace na Staphylococcus aureus (NG) (SORB) (STAU) VI cílená kultivace na Vibrio sp. (VI) cíleně se kultivace zakládá u pacientů infekčního oddělení, dětské oddělení cíleně se kultivace zakládá u materiálů, které mohli být kontaminované střevním obsahem cíleně se kultivace zakládá u materiálu z oblasti ORL cílená kultivace se zakládá u pacientů z ARO a JIP cíleně se kultivace zakládá při mikroskopickém nálezu kvasinek cíleně se kultivace zakládá u materiálu z urogenitální oblasti cíleně se kultivace zakládá u dětí do 2 let cílená kultivace na Staphylococcus aureus se zakládá na žádost žadatele cílená kultivace na Vibrio sp. se zakládá na žádost žadatele strana 18 (celkem 51)
9.1.1 Bakteriologická vyšetření Otorhinolaryngeální oblast Stěr/výtěr krk (tonsily), nosohltan, hltan tampon s transportním médiem pokojová teplota, do 24 hodin kultivace Kultivace zaměřená na: - standard: A, HS, (MRSA) - cílená kultivace na Corynebacterium diphhteriae - cílená kultivace na Neisseria meningitidis 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr nos Uchování vzorku Kultivace zaměřená na: tampon s transportním médiem pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr nosohltan a hrtan Uchování vzorku Kultivace zaměřená na: tampón na drátě s transportním médiem pokojová teplota, do 24 hodin kultivace Cílená kultivace na Bordetella sp. 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr dutina ústní tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace strana 19 (celkem 51)
Předběžný/ konečný výsledek: standard: A, AN, MYK, (MRSA) 24 hodin/ dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr ucho tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, HS, MYK, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Respirační trakt Sputum, 2 ml sterilní kontejner 30 ml 2-8 C, dodat do 2 hodin od odběru Uchování vzorku 2-8ºC, do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, MYK, NM, (MRSA) Předběžný/ konečný výsledek: 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku kvalitativně, kvantitativně (ředěný materiál 10-3, 10-5, 10-7 ; neředěný materiál hodnocen na kříže) Aspirát tracheální, tekutý materiál z TSK, 2 ml 2-8 C, dodat do 2 hodin od odběru 2-8 C, do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, AN, MYK, NM, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku strana 20 (celkem 51)
Aspirát z bronchoskopie, 2 ml 2-8 C, dodat do 2 hodin od odběru 2-8ºC, do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, AN, MYK, NM, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr z okolí tracheostomie tampon s transportním médiem 2-8ºC, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Gastrointestinální trakt Bioptický materiál z žaludeční sliznice speciální odběrové medium 2-8ºC, do 24 hodin mikroskopie, biochemie denně () 24 hodin/2 dny - mikroskopie: kvalitativně ureázový test: pozitivní, negativní Žaludeční šťáva, 2 ml Pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru 2-8ºC, do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku strana 21 (celkem 51)
Anální výtěr - kvalitativně tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace - standard: A, CAMP, (CIN), (SORB), (VI), (STAU) - standard pro ARO, JIP: A, AN, CAMP, CIN, CLO, (SORB) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů Urogenitální trakt Moč - střední proud, cévka, permanentní katétr, ureterální katétr, nefrotický drén, 5 ml 2-8 C, dodat do 2 hodin od odběru 2-8 ºC, do 24 hodin mikroskopie, kultivace A, (MYK), (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku kvalitativně, kvantitativně ( 10e 4 v ml) Uricult Uchování vzorku speciální odběrová souprava Pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru 7-25 C max. 48 hodin, poté inkubace 36± 1 C 16 až 24 hodin kultivace A, (MYK) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku kvalitativně, kvantitativně ( 10e 4 v ml) strana 22 (celkem 51)
Stěr/výtěr pochva - tampon s transportním médiem - nebo 2 tampony 1 s médiem (kultivace) a 2. bez média (mikroskopie) Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace, (mikroskopie) standard: A, AN, GBS, NG, MYK, (LIST) kultivace 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů, (mikroskopie 24 hodin) přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr pochva na kultivačním médiu speciální odběrová souprava pokojová teplota, dodat co nejdříve v den odběru Nedoporučuje se kultivace Neisseria gonorrhoeae 48 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - kvalitativně Pochva nátěr na sklíčku mikroskopické podložní sklíčko pokojová teplota, dodat do 2 hodin Nedoporučuje se mikroskopie 1 hodina/1 hodina - Stěr/výtěr vulva tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK, NG, (GBS, LIST) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku strana 23 (celkem 51)
Stěr/výtěr uretra tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK, NG 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - Stěr/výtěr uretra na kultivačním médiu speciální odběrová souprava pokojová teplota, dodat do 2 hodin Nedoporučuje se kultivace Neisseria gonorrhoeae 48 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - kvalitativně Uretra nátěr na sklíčku mikroskopické podložní sklíčko pokojová teplota, dodat do 2 hodin Nedoporučuje se mikroskopie 1 hodina/1 hodina - IUD, nitroděložní tělísko Nedoporučuje se mikroskopie, kultivace standard: A, AN, ACT, MYK, NG mikroskopie 1 hodina, kultivace 24 hodin/dle nálezu až 11 dnů přítomnost ATB ve vzorku strana 24 (celkem 51)
Krev, likvor Hemokultivační lahvička aerobní (3-10 ml), anaerobní (3-10 ml), dětská (1-3 ml) hemokultura aerobní PLUS AEROBIC/F anaerobní LYTIC ANAEROBIC/F dětská PEDS PLUS/F Pokojová teplota, do 24 hodin hemokultivace A, AN, NM, (MRSA), další kultivační média jsou doplněny dle mikroskopie hemokultivační lahvička je vložena do přístroje po dobu 5 dnů mikroskopie z pozitivní hemokultivace je hlášena ihned/dle nálezu 2 až 7 dnů negativní hemokultivace 5 dnů přítomnost ATB ve vzorku kvalitativně Hemokultivační lahvička - mykotická (3-10 ml) hemokultura MYCOSIS IC/F Pokojová teplota, do 24 hodin hemokultivace kvasinky a plísně hemokultivační lahvička je vložena do přístroje po dobu 14 dnů mikroskopie z pozitivní hemokultivace je hlášena ihned/dle nálezu 2 až 7 dnů negativní hemokultivace 15 dnů přítomnost ATM ve vzorku kvalitativně Stěr z kůže před hemokulturou tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - strana 25 (celkem 51)
Krevní nátěr na skle mikroskopické podložní sklíčko Nedoporučuje se mikroskopie 1 hodina/1 hodina - Likvor, 2 ml pokojová teplota, dodat co nejdříve od odběru Pokojová teplota, do 24 hodin mikroskopie, kultivace, hemokultivace (viz str. 23) standard: A, AN, HS, NM, (MRSA), další kultivační média jsou doplněny dle mikroskopie mikroskopie do 1 hodiny, kultivace 24 hodin/ dle nálezu 2 až 7 dnů Doobjednání dalšího požadavku: do 48 hodin od přijetí do laboratoře (dle požadované metody a objemu vzorku) příměs krve ve vzorku Další materiály Stěr/výtěr oko tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, HS, MYK, NG, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr rána, defekt, dekubit tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin strana 26 (celkem 51)
kultivace standard: A, AN, MYK (MRSA); další kultivační média jsou doplněny dle lokality odběru 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Kanyla, katétr, drén Pokojová teplota, 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - Implantační materiál - tampon s transportním médiem - sterilní nádoba Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA) lze založit prodlouženou kultivaci (10 dnů) 24 hodin/dle nálezu 2 až 10 dnů přítomnost ATB ve vzorku Stěr/výtěr z jiné lokality tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA); další kultivační média jsou doplněny dle lokality 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku strana 27 (celkem 51)
Punktát, 3 ml Pokojová teplota do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA); další kultivační média jsou doplněny dle lokality odběru 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Hnis, 3 ml Pokojová teplota, do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA); další kultivační média jsou doplněny dle lokality odběru 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Jiný materiál - tampon s transportním médiem - Pokojová teplota, do 24 hodin mikroskopie, kultivace standard: A, AN, MYK, (MRSA); další kultivační média jsou doplněny dle lokality odběru 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů přítomnost ATB ve vzorku Screeningová vyšetření MRSA screening: Stěr/výtěr krk, nos, perineum; jiný klinický materiál - tampon s transportním médiem - Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace MRSA strana 28 (celkem 51)
24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů nevhodně provedený odběr kvalitativně ESBL screening: klinický materiál - tampon s transportním médiem - Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace - producenti ESBL s vyšetřením ATB citlivosti - producenti ESBL bez vyšetření ATB citlivosti 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - GBS screenig: Stěr/výtěr pochva; stěr/výtěr axila a ucho novorozenců tampon s transportním médiem Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace GBS (Streptococcus agalactiae) 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - CPE screening: klinický materiál - tampon s transportním médiem - Pokojová teplota, do 24 hodin kultivace producenti CPE 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů - strana 29 (celkem 51)
Kontrola sterility primárně sterilního materiálu a mikrobiologie prostředí TP, LPř, roztoky - originální balení 2-8ºC do 15 minut Uchování vzorku 2-8ºC, do 24 hodin Kultivace na: A, AN, MYK jednou týdně 12 dnů/14 dnů - kvalitativně Otisky, stěry z různých lokalit - tampon s transportním médiem bez aktivního uhlí - otisky: kultivační médium s otiskem Uchování vzorku Nedoporučuje se Kultivace na: A, MYK jednou týdně 12 dnů/14 dnů - Kvalitativně, kvantitativně 9.1.2 Mykologická vyšetření Sputum, 5 ml Uchování materiálu: sterilní kontejner 30 ml 2 8 C, dodat do 24 hodin od odběru 2 8 C, do 24 hodin od odběru mikroskopie, kultivace kvasinky a plísně denně () mikroskopie 24 hodin/kultivace dle nálezu 5 7 dní přítomnost ATM ve vzorku strana 30 (celkem 51)
Moč, 5 ml Uchování materiálu: 2 8 C, dodat do 24 hodin od odběru 2 8 C, do 24 hodin od odběru mikroskopie, kultivace kvasinky a plísně denně () mikroskopie 24 hodin/kultivace dle nálezu 5 7 dní přítomnost ATM ve vzorku Hnis, 5 ml Uchování materiálu: 2 8 C, dodat do 24 hodin od odběru 2 8 C, do 24 hodin od odběru mikroskopie, kultivace kvasinky a plísně denně () mikroskopie 24 hodin/kultivace dle nálezu 5 7 dní přítomnost ATM ve vzorku Stěr, výtěr z různých lokalit Uchování materiálu: tampon s transportním médiem pokojová teplota, dodat do 24 hodin od odběru pokojová teplota, do 24 hodin od odběru kultivace kvasinky a plísně denně () mikroskopie 24 hodin/kultivace dle nálezu 5 7 dní přítomnost ATM ve vzorku Kožní adnexy (šupiny, kůže, vlasy, vousy, nehty), sterilní Petriho miska Pokojová teplota, dodat do 72 hodin od odběru Uchování materiálu: pokojová teplota, do 72 hodin od odběru mikroskopie, kultivace Staphylococcus aureus, kvasinky, plísně, dermatofyta denně () 48 hodin/dle kultivačního nálezu 28 dní a více málo materiálu, přítomnost ATM ve vzorku strana 31 (celkem 51)
9.1.3 Mykobakteriologická vyšetření Sputum, 2 až 5 ml Uchování materiálu: sterilní kontejner 30 ml 2 8 C, dodat do 72 hodin od odběru 2 8 C, do 72 hodin od odběru mikroskopie, kultivace Mycobacterium sp. denně () mikroskopie 24 48 hodin, kultivace 14 dnů/ dle kultivačního nálezu 63 dnů a více velké množství kontaminující mikrobioty Aspirát, 3 ml Uchování materiálu: 2 8 C, dodat do 72 hodin od odběru 2 8 C, do 72 hodin od odběru mikroskopie, kultivace Mycobacterium sp. denně () mikroskopie 24 48 hodin, kultivace 14 dnů/ dle kultivačního nálezu 63 dnů a více velké množství kontaminující mikrobioty Likvor, 3 ml Uchování materiálu: 2 8 C, dodat do 24 hodin od odběru 2 8 C, do 24 hodin od odběru mikroskopie, kultivace Mycobacterium sp. denně () mikroskopie 24 48 hodin, kultivace 14 dnů/ dle kultivačního nálezu 63 dnů a více velké množství kontaminující mikrobioty Punktát, 3 ml Uchování materiálu: 2 8 C, dodat do 24 hodin od odběru 2 8 C, do 24 hodin od odběru mikroskopie, kultivace Mycobacterium sp. strana 32 (celkem 51)