Výsledky vědeckých skupin - 2017 STOPKA LAB Somatic mutation dynamics in MDS patients treated with azacitidine indicate clonal selection in patients-responders. Polgarova K, Vargova K, Kulvait V, Dusilkova N, Minarik L, Zemanova Z, Pesta M, Jonasova A and Stopka T. Oncotarget. 2017 Dec 6. (IF 5.168) Modeling cancer driver events in vitro using barrier bypass-clonal expansion assays and massively parallel sequencing. Huskova H, Ardin M, Weninger A, Vargova K, Barrin S, Villar S, Olivier M, Stopka T, Herceg Z, Hollstein M, Zavadil J, Korenjak M. Oncogene. 2017 Jul 10. (IF 7.519) MiR-155/miR-150 network regulates progression through the disease phases of chronic lymphocytic leukemia.vargova K, Pesta M, Obrtlikova P, Dusilkova N, Minarik L, Vargova J, Berkova A, Zemanova Z, Michalova K, Spacek M, Trneny M, Stopka T. Blood Cancer J. 2017 Jul 21;7(7):e585. doi: 10.1038/bcj.2017.63. (IF 6.126) The ISWI ATPase Smarca (Snf2h) Is Required for Proliferation and Differentiation of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells. Kokavec J, Zikmund T, Savvulidi F, Kulvait V, Edelmann W, Skoultchi AI, Stopka T. Stem Cells. 2017 Mar 9. doi: 10.1002/stem.2604. (IF 5.599) Plasma mir-155, mir-203, and mir-205 are Biomarkers for Monitoring of Primary Cutaneous T-cell Lymphomas. Dusilkova N, Basova P, Polivka J, Kodet O, Kulvait V, Pesta M, Trneny M, Stopka T. Int J Mol Sci. 2017 Oct 15;18(10). pii: E2136. doi: 10.3390/ijms18102136. (IF 3.226) Prediction Potential of Serum mir-155 and mir-24 for Relapsing Early Breast Cancer. Basova P, Pesta M, Sochor M, Stopka T. Int J Mol Sci. 2017 Oct 10;18(10). pii: E2116. doi: 10.3390/ijms18102116. (IF 3.226) Využití detekce somatických mutací pro pacienty s cytopenií nejasného významu a u myelodysplastického syndromu. Stopka T. Myelodysplastic Syndrome NEWS. Ročník 5 / Číslo 1 / květen 2017. AKUTNÍ MYELOIDNÍ LEUKEMIE NOVINKY Z KONFERENCE ENVROPSKÉ HAMATOLOGICKÉ SPOLEČNOSTI. Stopka T. Event Report z EHA 20107, Madrid. PETRÁK LAB An activating mutation of GNB1 is associated with resistance to tyrosine kinase inhibitors in ETV6-ABL1-positive leukemia. Zimmermannova O, Doktorova E, Stuchly J, Kanderova V, Kuzilkova D, Strnad H, Starkova J, Alberich-Jorda M, Falkenburg JHF, Trka J, Petrak J, Zuna J, Zaliova M. Eur J Heart Fail. 2017 Apr;19(4):522-530. doi: 10.1002/ejhf.640. (IF 7.519) Myocardial iron content and mitochondrial function in human heart failure: a direct tissue analysis. Melenovsky V, Petrak J, Mracek T, Benes J, Borlaug BA, Nuskova H, Pluhacek T, Spatenka J, Kovalcikova J, Drahota Z, Kautzner J, Pirk J, Houstek J. Eur J Heart Fail. 2017 Apr;19(4):522-530. doi: 10.1002/ejhf.640. (IF 6.968) Therapeutic potential of hepcidin - the master regulator of iron metabolism. Vyoral D, Jiri Petrak. Pharmacol Res. 2017 Jan;115:242-254. doi: 10.1016/j.phrs.2016.11.010. Review. PubMed PMID: 27867027. (IF 4.480) Integral membrane proteins in proteomics. How to break open the black box? Vit O, Petrak J. J Proteomics. 2017 Feb 5. pii: S1874-3919(16)30361-X. doi: 10.1016/j.jprot.2016.08.006. (IF 3.914) KOSTROUCH LAB Trichoplax adhaerens reveals an endocrine-like network sensitive to 9-cis-retinoic acid at the base of metazoan evolution. Novotný JP, Chughtai AA, Kostrouchová M, Kostrouchová V, Kostrouch D, Kaššák F, Kaňa R, Schierwater B, Kostrouchová M, Kostrouch Z. (2017). PeerJ. 2017 Sep 29; 5:e3789. doi: 10.7717/peerj.3789. (IF 2.177) The nematode homologue of Mediator complex subunit 28, F28F8.5, is a critical regulator of C. elegans development. Markéta Kostrouchová, David Kostrouch, Ahmed A Chughtai, Filip Kašák, Jan P. Novotný, Veronika Kostrouchová, Aleš Benda, Micheal W. Krause, Vladimír Saudek, Marta Kostrouchová. Zdeněk Kostrouch. PeerJ. 2017 Jun 6;5:e3390. doi: 10.7717/peerj.3390. (IF 2.177) Novel Mutation (T273R) in Thyroid Hormone Receptor ß Gene provides Firther Insight into Cryptic Negative Regulation by Thyroid Hormone. Kaššák F, Hána V, Saudek V, Kostrouchová M. Folia Biologica (Praha) 63, 60-66 (2017).(IF 0.833) 1
Výsledky vědeckých skupin - 2017 KRÁL LAB Methinium colorimetric sensors for the determination of cholesterol sulfate in an aqueous medium. Kejik Z, Havlik M, Briza T, Kaplanek R, Dolensky B, Kralova J, Martasek P, Kral V., Sensor Actuat B-Chem 245 (2017) 1032-1038. doi: 10.1016/j.snb.2017.01.185. [Epub ahead of print] (IF 5.401) Amino-substituted Tröger s base: electrochemical polymerization and characterization of the polymer film. Tatiana V Shishkanova, Martin Havlík, Vladimír Král, Dušan Kopecký, Pavel Matějka, Marcela Dendisová, Vladimír M. Mirsky. Electrochimica Acta 224 (2017) 439-445. DOI:http://dx.doi.org/10.1016/j.electa.2016.12.061. (IF 4.798) Optical probes and sensors as perspective tools in epigenetics. Kejík Z, Kaplanek R, Havlik M, Briza T, Jakubek M, Kralova J, Mikula I, Martasek P, Kral V. Bioorg Med Chem. 2017 Apr 15;25(8):2295-2306. doi: 10.1016/j.bmc.2017.01.011. (IF 2.930) Self-assembled chitosan-alginate polyplex nanoparticles containing temoporfin. Ingrid Brezaninova, Jiri Trousil, Zulfiya Cernochova, Vladimir Kral, Martin Hruby, Petr Stepanek, Miroslav Slouf. Colloid Polym Sci. Published online 07 January 2017. (IF 1.723) Dimethinium Heteroaromatic Salts as Building Blocks for Dual-Fluorescence Intracellular Probes, Bříza T., Králová J., Rimpelová S., Havlík M., Kaplánek R., Kejík Z., Reddy B., Záruba K., Ruml T., Mikula I., Martásek P., Král V., ChemPubSoc, 2017 Oct, doi: 10.1002/cptc.201700061. Water soluble chromone Schiff base derivatives as fluorescence receptor for aluminium(iii). Jakubek, M.; Kejik, Z.; Parchansky, V.; Kaplanek, R.; Vasina, L.; Martasek, P.; Kral, V., Supramol. Chem. 2017, Vol. 29, No. 1, 1-7. DOI: 10.1080/10610278.2016.1153095. (IF 1.264) Patenty / Užitné vzory Přihláška patentu PV 2017-351: Nesymetrický derivát Trögerovy báze s tetramethiniovou substitucí a jeho použití, podáno 20.6.2017, Havlík M., Bříza T., Kejík Z., Dolenský B., Kaplánek R., Rak J., Králová J., Šedo A., Martásek P., Král V. Přihláška patentu PV 2017-352: Symetrický derivát Trögerovy báze s tetramethiniovou substitucí a jeho použití, podáno 20.6.2017, Havlík M., Bříza T., Kejík Z., Dolenský B., Kaplánek R., Rak J., Králová J., Šedo A., Martásek P., Král V. Přihláška patentu PV 2017-353: Nesymetrický derivát Trögerovy báze s dimethiniovou substitucí a jeho použití, podáno 20.6.2017, Havlík M., Bříza T., Kejík Z., Dolenský B., Kaplánek R., Rak J., Králová J., Šedo A., Martásek P., Král V. Přihláška patentu PV 2017-588: Kumarinový derivát Trögerovy báze s cyaninovou substitucí a jeho použití, podáno 26.9.2017, Havlík M., Bříza T., Kaplánek R., Králová J., Martásek P., Král V. Užitný vzor číslo přihlášky 2017-34002 s názvem Sada pro spektroskopické stanovení dodecylsíranu sodného ve vodném prostředí, CZ 31059 U1, 26.9.2017, Jakubek M., Kejík Z., Bříza T., Král V., Martásek P. Užitný vzor číslo přihlášky 2017-34000 s názvem Epigeneticky aktivní krmná směs pro strakatý skot s optimalizovanou koncentrací železa CZ 31075 U1, 3.10.2017, Jakubek M., Kejík Z., Kaplánek R., Král V., Martásek P., Louma M. Užitný vzor číslo přihlášky 2017-34001 s názvem Epigeneticky aktivní krmná směs pro strakatý skot s optimalizovanou koncentrací zinku? CZ 31307, 18.12.2017, Kejík Z., Jakubek M., Král V., Martásek P., Louma M 2
Výsledky vědeckých skupin - 2017 MIKULA LAB Optical probes and sensors as perspective tools in epigenetics. Kejík Z, Kaplanek R, Havlik M, Briza T, Jakubek M, Kralova J, Mikula I, Martasek P, Kral V. Bioorg Med Chem. 2017 Apr 15;25(8):2295-2306. doi: 10.1016/j.bmc.2017.01.011. (IF 2.930) KMOCH/ZIKÁNOVÁ LAB Autosomal Dominant Tubulointerstitial Kidney Disease. Bleyer AJ, Kidd K, Zivna M, Kmoch S. Adv Chronic Kidney Dis. 2017 Mar;24(2):86-93. doi: 10.1053/j.ackd.2016.11.012. (IF 2.703) Segregation of a novel p. (Ser270Tyr) MAF mutation and p.(tyr56*) CRYGD variant in a family with dominantly inherited congenital cataracts. Lubica Dudakova, Viktor Stranecky, Olga Ulmanova, Eva Hlavova, Marie Trkova, Andrea L. Vincent, Petra Liskova. Mol Biol Rep (2017) 44:435-440; doi: 10.1007/s11033-017-4121-4. (IF 1.828) Elevated urinary CRELD2 is associated with endoplasmic reticulum stress-mediated kidney disease. Yeawon Kim, Sun-Ji Park, Scott R. Manson, Carlos A.F. Molina, Kendrah Kidd, Heather Thiessen-Philbrook, Rebecca J. Perry, Helen Liapis, Stanislav Kmoch, Chirag R. Parikh, Anthony J. Bleyer and Ying Maggie Chen, Journal of Clinical Investigation, Dec 2017; 2(23): e92896. (IF 12.784) Autosomal Dominant Tubulointerstitial Kidney Disease Due to MUC1 Mutation. Samuel Mon-Wei Yu, Anthony J. Bleyer, Kisra Anis, Leal Herlitz, Martina Živná, Helena Hůlková, Glen S. Markowitz, and Belinda Jim, American Journal od Kidney Diseases 2017, doi: 10.1053/j.ajkd.2017.08.024 (IF 7.623) Thymidine kinase 2 and alanyl-trna synthetase 2 deficiencies cause lethal mitochondrial cardiomyopathy: case reports and review of the literature Mazurova S, Magner M, Kucerova-Vidrova V, Vondrackova A, Stranecky V, Pristoupilova A, Zamecnik J, Hansikova H, Zeman J, Tesarova M, Honzik T. Cardiol Young. 2017 Jul;27(5):936-944. doi: 10.1017/S1047951116001876. (IF 0,905) 01.03.18 3
Výsledky vědeckých skupin - 2017 SMETANA LAB How Signaling Molecules Regulate Tumor Microenvironment: Parallels to Wound Repair. Gál P, Varinská L, Fáber L, Novák Š, Szabo P, Mitrengová P, Mirossay A, Mučaji P, Smetana K. Molecules. 2017 Oct 26;22(11). pii: E1818. doi: 10.3390/molecules22111818. Review. (IF 2.861) Analysis of dermal fibroblasts isolated from neonatal and child cleft lip and adult skin: Developmental implications on reconstructive surgery. Zivicova V, Lacina L, Mateu R, Smetana K Jr., Kavkova R, Krejci Drobna E, Grim M, Kvasilova A, Borsky J, Strnad H, Hradilova M, Sachova J, Kolar M and Dvorankova B. Int. J. Mol. Med. 40: IJMM-2439-187533-Dvorankova OA, Aug 2017. (IF 2.341) Ecology of melanoma cell. Lacina L, Kodet O, Dvorankova B, Szabo P, Smetana K Jr. Histol Histopathol. 2017 Aug 29: 11926. doi: 10.14670/HH-11-926. (IF 2.025) Genome-wide Expression Profiling (with Focus on the Galectin Network) in Tumor, Transition Zone and Normal Tissue of Head and Neck Cancer: Marked Differences Between Individual Patients and the Site of Specimen Origin. Zivicova V, Broz P, Fik Z, Mifkova A, Plzak J, Cada Z, Kaltner H, Kucerova JF, Gabius HJ, Smetana K Jr. Anticancer Res. 2017 May;37(5):2275-2288. (IF 1.895) Phenotypic characterization of oral mucosa: what is normal? Valach J, Foltán R, Vlk M, Szabo P, Smetana K Jr. J Oral Pathol Med. 2017 Jan 31. doi: 10.1111/jop.12556. (IF 1.859) MĚLKOVÁ LAB Current views on HIV-1 latency, persistence, and cure. Melkova Z, Shankaran P, Madlenakova M, Bodor J. Folia Microbiol (Praha). 2017 Jan;62(1):73-87. doi: 10.1007/s12223-016-0474-7. (IF 1.335) (D) Shankaran P, Madlenakova M, Hajkova V, Jilich D, Svobodova I, Horinek A, Fujikura Y, Melkova Z. Effects of Heme degradation products on reactivation of latent HIV-1. Acta Virol. 2017 Feb 6;61(1). doi: 10.4149/av_2017_01_86. (IF 1.222) Patenty / Užitné vzory Přihláška patentu PV 2017-839: Použití hem arginátu pro výrobu léčiva pro snížení velikosti latentního rezervoáru HIV-1 in vivo, podáno 22.12.2017, Mělková Z., Jilich D., Madleňáková M., Martásek P. 4
Publikace 2016/2017 podle IF interní skupiny 30,86 22,89 19,48 16,12 10,39 9,40 5,19 4,06 2,93 01.03.18 5
Publikace 2016/2017 podle IF externí skupiny 63,72 25,84 13,74 10,95 2,56 3,40 01.03.18 6
Indikátory - Summary 2016 2017 2018 2019 2020 Ʃ AVG Stopka Lab 4 19,48 6 30,86 10 25,2 Petrák Lab 3 10,39 4 22,88 7 16,6 Král Lab 4 9,40 2/0 5 16,12 4/3 9 12,8 Kostrouch Lab 0 0 3 5,19 5 2,6 Mikula Lab 1 4,01 1 2,93 2 3,5 Kmoch/ Zikánová Lab 9 63,72 5 25,84 14 44,8 Smetana Lab 6 13,74 5 10,95 11 12,6 Mělková Lab 1 0,83 2 2,56 1/0 3 1,7 Nečas Lab 1 3,40 0 0 1 1,7 N IF - počet impaktovaných publikací Ʃ IF - suma IF 01.03.18 PT / počet podaných patentových přihlášek / počet podaných užitných vzorů 7
Granty vedené pod Biocevem a jejich režie v roce 2017 NS Grant Číslo grantu Částka celkem za grant Z toho režie 110 GAČR 201467 16-05534S Smetana 838 000,00 Kč 167 000,00 Kč 110 UNCE 6204013-1 Smetana 2 131 000,00 Kč 355 000,00 Kč 110 AZV 2015002 15-28933A Smetana 1 276 000,00 Kč 255 000,00 Kč 131 Mze 240017 QJ1610515 Král 1 958 688,00 Kč 334 720,00 Kč 131 GAČR 201601 17-07822S Král 1 480 000,00 Kč 296 000,00 Kč 131 GAČR 17-02448S - Král 1 281 000,00 Kč 256 000,00 Kč 131 MPO FV20572 Král 1 075 992,00 Kč 157 488,00 Kč 131 GAČR 201468 16-05649S Stopka 2 368 000,00 Kč 473 000,00 Kč 131 UNCE 204021-1 Stopka 3 900 000,00 Kč 650 000,00 Kč 131 AZV 219315 16-27790A Stopka 2 246 000,00 Kč 449 000,00 Kč 131 Kontakt 209185 LH15170 Stopka 770 000,00 Kč 128 000,00 Kč 131 GAUK 250052 Paszeková 236 000,00 Kč 30 000,00 Kč 131 GAUK 250225 Kokavec 258 000,00 Kč 33 000,00 Kč 131 GAČR 201365 15-14200S Petrák 1 395 000,00 Kč 279 000,00 Kč 131 SVV 260374 Petrák 602 000,00 Kč 120 000,00 Kč 131 Interexcellence 234005 Petrák 599 318,00 Kč 119 863,00 Kč 131 SVV 260377 Kostrouch 727 000,00 Kč 143 000,00 Kč 650 GAČR 2014002 14-36804G Kmoch 5 265 000,00 Kč 1 053 000,00 Kč 650 AZV 219283 15-28979A Zikánová 907 000,00 Kč 181 000,00 Kč 650 AZV 219287 15-28208A Kmoch 3 757 000,00 Kč 751 000,00 Kč 650 AZV 2015006 15-27682A Kmoch 1 556 000,00 Kč 311 000,00 Kč 650 AZV 219341 Živná 2 057 000,00 Kč 411 000,00 Kč 131 NPU II 2016001 LQ1604 8 100 000,00 Kč 1 100 000,00 Kč CELKEM 44 783 998,00 Kč 8 053 071,00 Kč 01.03.18 8
Celkové provozní náklady Biocev (plyn, el. energie, servis vzduchotechniky, úklidové služby, ostraha, mzdy provozního týmu Biocev) za rok 2017 celkem: Kč 6 654 879,13 Vratka režií: Kč 624 300,- 01.03.18 9