Regulace enzymové aktivity

Podobné dokumenty
Regulace enzymové aktivity

Regulace metabolických drah na úrovni buňky

Glykolýza Glukoneogeneze Regulace. Alice Skoumalová

Intermediární metabolismus. Vladimíra Kvasnicová

ENZYMY. RNDr. Lucie Koláčná, Ph.D.

Redoxní děj v neživých a živých soustavách

Enzymy faktory ovlivňující jejich účinek

REGULACE ENZYMOVÉ AKTIVITY

Text zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY

Mechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová

Monitorování léků. RNDr. Bohuslava Trnková, ÚKBLD 1. LF UK. ls 1

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/

Reakční kinetika enzymových reakcí

VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ

Intermediární metabolismus - SOUHRN - Vladimíra Kvasnicová

Enzymologie. Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů.

Obecný metabolismus.

Propojení metabolických drah. Alice Skoumalová

Enzymy. aneb. Není umění dělat co tě baví, ale najít zalíbení v tom, co udělati musíš. Luboš Paznocht

ENZYMY. Charakteristika enzymaticky katalyzovaných reakcí:

Metabolismus pentóz, glykogenu, fruktózy a galaktózy. Alice Skoumalová

Regulace metabolizmu lipidů

Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.

Enzymologie. Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar. akad. rok 2017/2018

Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno:

Jana Fauknerová Matějčková

BUŇEČNÝ CYKLUS A JEHO KONTROLA

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd

Historie. Pozor! né vždy jen bílkovinná část

Trombóza - Hemostáza - Krvácení

BIOKATALYZÁTORY I. ENZYMY

Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech

Kinetika enzymově katalysovaných reakcí

Enzymy. Vladimíra Kvasnicová

Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku

Respirace. (buněčné dýchání) O 2. Fotosyntéza Dýchání. Energie záření teplo BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3

Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku

Biologie buňky. proteiny, nukleové kyseliny, procesy genom, architekura (membrána), funkce mitoza, buněčná smrt, kmenové buňky, diferenciace

Enzymy (katalýza biochemických reakcí)

Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození

Struktura a funkce biomakromolekul

METABOLISMUS SLOUČENINY S MAKROERGNÍMI VAZBAMI

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Důležité termíny enzymologie Kurz 2 / 210. Vladimíra Kvasnicová

>>> E A1 + E A2. . aktivační energie potřebná k reakci bez přítomnosti katalyzátoru E A E A1. energie potřebná ke vzniku enzym-substrátového komplexu

ENZYMY. Klasifikace enzymů

Metabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová

Intracelulární Ca 2+ signalizace

Buněčný cyklus a molekulární mechanismy onkogeneze

Regulace metabolických drah na úrovni buňky. SBT 116 Josef Fontana

CHEMICKÉ ZNAKY ŽIVÝCH SOUSTAV

5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku. 5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku

AMPK AMP) Tomáš Kuc era. Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze

Odbourávání a syntéza glukózy

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ

Metabolismus aminokyselin 2. Vladimíra Kvasnicová

Vrozené trombofilní stavy

7. Regulace genové exprese, diferenciace buněk a epigenetika

ENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY

HISTORIE ENZYMOLOGIE

Enzymy charakteristika a katalytický účinek

Univerzita Karlova v Praze - 1. lékařská fakulta. Buňka. Ústav pro histologii a embryologii

1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu

Molekulárn. rní. biologie Struktura DNA a RNA

Enzymy. Vladimíra Kvasnicová

vysoká schopnost regenerace (ze zachovalých buněk)

Biotransformace Vylučování

Sacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus)

Buněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky

Iniciální fáze fáze hemostázy IIa

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Glykolýza a neoglukogenese

Farmakologie. -věda o lécích používaných v medicíně -studium účinku látek na fyziologické procesy -biochemie s jasným cílem

Enzymy biologické katalyzátory. regulovatelnost účinnosti (aktivity) Platí o nich totéž co o chemických katalyzátorech, ale mají něco navíc:

Metabolismus bílkovin. Václav Pelouch

19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza

03a-Chemické reakce v živých organizmech FRVŠ 1647/2012

Hemostáza Definice Vybalancovaná rovnováha udržující krev cirkulující v krevním oběhu v tekutém stavu a lokalizující proces krevního srážení na místo

Aminokyseliny, proteiny, enzymologie

INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II

Regulace enzymových aktivit

Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová

Chemie - 5. ročník. přesahy, vazby, mezipředmětové vztahy průřezová témata. očekávané výstupy RVP. témata / učivo. očekávané výstupy ŠVP.

Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět -

Hemokoagulační faktory a Hemostatická kaskáda (MADE IT EASY) Dalibor Zimek, Všeobecné lékařství, Skupina 3

fce jater: (chem. továrna, jako 1. dostává všechny látky vstřebané GIT) METABOLICKÁ (jsou metabolicky nejaktivnější tkání v těle)

Biotransformace xenobiotik. M. Balíková

Metabolismus xenobiotik. Vladimíra Kvasnicová

Vitaminy. Autorem přednášky je Mgr. Lucie Mandelová, Ph.D. Přednáška se prochází klikáním nebo klávesou Enter.

Bp1252 Biochemie. #11 Biochemie svalů

Klinický detektivní příběh Glykémie

DYNAMICKÁ BIOCHEMIE. Daniel Nechvátal ::

Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..


Metabolismus lipidů. (pozn. o nerozpustnosti)

Biosyntéza a degradace proteinů. Bruno Sopko

Lipidy a biologické membrány

Fyziologie svalové činnosti. MUDr. Jiří Vrána

Fyziologie srdce I. (excitace, vedení, kontrakce ) Milan Chovanec Ústav fyziologie 2.LF UK

Transkript:

Regulace enzymové aktivity MUDr. Martin Vejražka, PhD. Tato prezentace je přístupnp stupná on-line CHE1.LF1.CUNI.CZ Prezentace

Regulace enzymové aktivity Organismus NENÍ rovnovážná soustava Rovnováha = smrt Život: homeostáza, ustálený stav

Katalýza v uzavřen ené soustavě bez katalyzátoru toru rovnováha se ustavuje pomalu (ale ustaví se)

Katalýza v uzavřen ené soustavě s katalyzátorem torem ustaví se stejná rovnováha jako bez katalyzátoru, toru, ale mnohem rychleji

Otevřen ená soustava Veličiny iny jsou konstantní, ale nejde o rovnováhu ustálený stav (steady-state) state) homeostáza regulace měním hodnotu (nejen čas, za nějžn se jíj dosáhne)

Regulace enzymů Mění koncentraci látekl Reaguje na spotřebu na dodávku

Regulace enzymů Porucha regulace je příčinou p onemocnění kinázy a fosfatázy: nádorovn dorová onemocnění nadbytek nějakn jaké látky (cholesterol ateroskleróza, kys. močov ová dna )

Parametry používan vané v klinice či konc. nějakn jaké látky způsobeno / tvorby / odstraňov ování nebo měří se aktivita nějakn jakého enzymu

Léky Velkáčást lékůl působí prostřednictv ednictvím změny aktivity (většinou inhibice) nějakého enzymu kys. acetylosalicylová simvastatin allopurinol omeprazol sildenafil vinkristin tetracyklin sulbaktam atorvastatin enalapril kotrimoxazol

Enzymy a lékyl Aktivita některých n enzymů dramaticky měním účinnost lékůl cytochrom P450 konjugace acetylace

Člověk k a bakterie Jednobuněč ěčné organismy Mnohobuněč ěčné organismy regulace na buněč ěčné úrovni regulace na buněč ěčné úrovni hormonáln lní regulace nervová regulace

Ovlivnění aktivity enzymu Koncentrace enzymu Nabídka substrátu, tu, dostupnost koenzymů, množstv ství produktu Katalytická účinnost

Regulace enzymu regulace genové exprese regulace konverze proenzymu regulace katalytické účinnosti regulace degradace enzymu proenzym ENZYM substrát produkt nabídka substrátu tu dostupnost koenzymů odčerp erpávání produktu Martin Vejražka, 2007

Koncentrace enzymu

Koncentrace enzymu Tvorba exprese genu konverze proenzym enzym sestavení podjednotek Degradace

Indukce a represe regulace genové exprese regulace konverze proenzymu regulace katalytické účinnosti regulace degradace enzymu proenzym ENZYM substrát produkt nabídka substrátu tu dostupnost koenzymů odčerp erpávání produktu Martin Vejražka, 2007

Indukce indukovatelný enzym konstitutivní enzym indukce bazální aktivita

Indukce enzymu Odbourávání ethanolu OH O O H 3 C CH 2 H 3 C C H 3 C C ethanol acetaldehyd H acetát O 1. alkoholdehydrogenáza a aldehyddehydrogenáza - konstitutivní enzymy 2. MEOS - inducibilní systém

Represe represe produktem represe katabolitem

Konverze proenzymu regulace genové exprese regulace konverze proenzymu regulace katalytické účinnosti regulace degradace enzymu proenzym ENZYM substrát produkt nabídka substrátu tu dostupnost koenzymů odčerp erpávání produktu Martin Vejražka, 2007

Konverze proenzymu např.. cílenc lená proteolýza koagulační kaskáda aktivace trávic vicích ch enzymů

Koagulační kaskáda XII XIIa XI XIa IX IXa + VIIIa VIIa III VII vnitřní X Xa + Va zevní II IIa XIIIa I Ia fibrinová síť společný

Degradace enzymu regulace genové exprese regulace konverze proenzymu regulace katalytické účinnosti regulace degradace enzymu proenzym ENZYM substrát produkt nabídka substrátu tu dostupnost koenzymů odčerp erpávání produktu Martin Vejražka, 2007

Degradace enzymu Často zález leží na konformaci bílkovinyb Molekuly enzymu s navázaným substrátem tem bývají chráněny ny

Degradace enzymu Grapefruitová šťáva významně zvyšuje degradaci střevn evního cytochromu P450 aktivita enzymu se sníží o polovinu během několika n hodin zvýší se dostupnost a účinek mnoha léků

Nabídka substrátů

Koncentrace složek reakce regulace genové exprese regulace konverze proenzymu regulace katalytické účinnosti regulace degradace enzymu proenzym ENZYM substrát produkt nabídka substrátu tu dostupnost koenzymů odčerp erpávání produktu Martin Vejražka, 2007

Kompartmentace různá koncentrace substrátů různá regulace isoenzymů cytozolový izoenzym člunky pro substrát mitochondriáln lní izoenzym

Kompartmentace Tvorba makromolekulárn rních komplexů enzymů předávání produktů substr substrátů, vysoké lokáln lní koncentrace přenos konformačních změn

Koncentrace substrátu tu koncentrace substrátu tu koncentrace volného substrátu tu

Katalytická účinnost

Regulace katalytické účinnosti regulace genové exprese regulace konverze proenzymu regulace katalytické účinnosti regulace degradace enzymu proenzym ENZYM substrát produkt nabídka substrátu tu dostupnost koenzymů odčerp erpávání produktu Martin Vejražka, 2007

Katalytická účinnost Inhibitory v regulaci metabolismu nebývají,, ale: léky, jedy Alosterická modifikace Kovalentní modifikace Interakce mezi podjednotkami

Inhibitory lat. in + habeō = držím m v rukou, na uzdě Kompetitivní soutěž ěží se substrátem tem Ostatní nekompetitivní,, akompetitivní,, smíš íšené (nebudeme rozlišovat) ovat)

Kompetitivní inhibice Inhibitor často strukturně podobný substrátu tu Účinek zález leží na poměru koncentrací poměru afinit Reverzibilní

Kompetitivní inhibitory v Kontrola Komp. inh. [S]

Kompetitivní inhibice N H N HO N H N N N xantinoxidáza N N OH OH hypoxantin OH kyselina močov ová N H N N N OH alopurinol

Nekompetitivní inhibice Inhibitor se substrátem tem nesoutěž ěží Snížen ení koncentrace funkčního enzymu Reverzibilní Ireverzibilní

Nekompetitivní inhibitory v Kontrola Nekomp. inh. [S]

Nekompetitivní inhibice O OH OH kys. salicylová O OH O O O + HO H 2 C CH C R O O H 2 C CH C R O kys. acetylosalicylová R Ser Obrázky z webu firmy Bayer Health Care: http://www.aspirin.cz/aspirin/world/history/1/index.asp (11/2007) R

Alosterické modifikátory Nejsou strukturně podobné substrátům m / koenzymům Váží se na místm stě vzdálen leném aktivnímu centru Mění konformaci enzymové molekuly

Alosterické inhibitory enzym substrát alosterický inhibitor

Alosterické inhibitory enzym substrát alosterický inhibitor

Alosterická regulace makromolekula Zpětnovazebný inhibitor je často poslední nízkomolekulární látka před p makromolekulou

Alosterická regulace makromolekula Obvykle se reguluje první prakticky nevratná reakce

Alosterická regulace

Vícenásobná zpětn tná vazba Kumulativní účinek modifikátor torů se sčítás Multivalentní jeden zpomalí,, dva zastaví Kooperativní mezi tímt

Saturace alosterického enzymu v Kooperativita Kontrola Aloster. inh. [S]

Kooperace substrátů

Kooperace substrátů

Kooperace substrátů

Kooperace substrátů

Kooperativita Málo substrátu: tu: šetří se v Kontrola Aloster. inh. Hodně substrátu: tu: uklízí se [S]

Alosterická inhibice v v Kontrola Aloster. inh. Kontrola Aloster. inh. [S] [S] K-typ V-typ

Kovalentní modifikace enzymů Reverzibilní fosforylace OH skupin Mimo aktivní centrum Kinázy (vnáš ášejí fosfát t z ATP) Ser, Thr Tyr Fosfataázy (defosforylace hydrolýza esterové vazby)

Fosforylace a defosforylace Ser Thr Tyr HO CH 2 OH CH 3 CH C HO CH OH HO CH 2 OH H 2 N O CH C CH C ATP P i ATP H 2 N P i O ATP P i H 2 N O ADP H 2 O ADP H 2 O ADP H 2 O - O O - P O O H 2 N CH 2 CH C OH O - O O - P O O CH 3 CH CH H 2 N C OH O - O O - P O O H 2 N CH 2 CH C OH O

Fosforylace nervová a hormonáln lní regulace ATP ATP ATP ATP

Jiné kovalentní modifikace acetylace ribosylace sulfatace isoprenylace

Sestavování podjednotek (interakce protein-protein) protein) Katalytická podjednotka Regulační podjednotka vazba camp kalmodulin váže e Ca 2+ G-proteiny vazba GTP/GDP