Hydro. řecky voda. phobic z řeckého phobos strach

Podobné dokumenty
Skupenské stavy. Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Molekulární krystal vazebné poměry. Bohumil Kratochvíl

Opakování

Gelová permeační chromatografie

Mezimolekulové interakce

Supramolecular chemistry... Intermolecular interactions. Supramolecular chemistry is about design. Therefore people are important!

Vysokoúčinná kapalinová chromatografie

Chromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost

02 Nevazebné interakce

3. Stavba hmoty Nadmolekulární uspořádání

Nekovalentní interakce

Nekovalentní interakce

Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou

Fyzika biopolymerů. Struktura a vlastnosti vody, vodíková vazba

Biofyzikální chemie nekovalentní interakce, prostorové uspořádání proteinů, voda. Zita Purkrtová říjen - prosinec 2015

Názvosloví Konformace Isomerie. Uhlíky: primární (1 o ) sekundární (2 o ) terciární (3 o ) kvartérní (4 o )

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová

K otázce pokrytí publikační aktivity českých vysokých škol v bibliografických bázích dat

Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

Vysokoúčinná kapalinová chromatografie

Chemická vazba. John Dalton Amadeo Avogadro

Geochemie endogenních procesů 1. část

Třídění látek. Chemie 1.KŠPA

Mgr. Jakub Janíček VY_32_INOVACE_Ch1r0118

Kyselost, bazicita, pka

Základní stavební kameny buňky Kurz 1 Struktura -7

Roztok. Homogenní směs molekul, které mohou být v pevném, kapalném nebo plynném stavu. Pravé roztoky

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

Skupenské stavy látek. Mezimolekulární síly

Hydrofobní chromatografie

5. Stavy hmoty Kapaliny a kapalné krystaly

PLANÁRNÍ (PLOŠNÁ) CHROMATOGRAFIE

Přístupy k analýze opticky aktivních látek metodou HPLC

Gymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora

Co je proteomika? Proteom? Protein? Experimentální strategie proteomiky Vlastnosti AMK a proteinů

Roztoky - druhy roztoků

Chemická vazba. Příčinou nestability atomů a jejich ochoty tvořit vazbu je jejich elektronový obal.

Analýza aniontových tenzidů v čisticích prostředcích kapilární elektroforézou

Mýdla Ch_047_Deriváty uhlovodíků_mýdla Autor: Ing. Mariana Mrázková

Roztok. Homogenní směs molekul, které mohou být v pevném, kapalném nebo plynném stavu. Pravé roztoky

Kapaliny Molekulové vdw síly, vodíkové můstky

Acidobazické děje - maturitní otázka z chemie

Úvod do biochemie. Vypracoval: RNDr. Milan Zimpl, Ph.D.

Úvod do vysokoúčinné kapalinové chromatografie

Studijní materiál. Úvod do problematiky extrakčních metod. Vypracoval: RNDr. Ivana Borkovcová, Ph.D.

Chemie. Mgr. Petra Drápelová Mgr. Jaroslava Vrbková. Gymnázium, SOŠ a VOŠ Ledeč nad Sázavou

John Dalton Amadeo Avogadro

Voda polární rozpouštědlo

Částicové složení látek atom,molekula, nuklid a izotop

Heterogenní katalýza

Struktura. Velikost ionexových perliček Katex. Iontová výměna. Ionex (ion exchanger) Iontoměnič Měnič iontů. Katex (cation exchanger) Měnič kationtů

Disperzní soustavy. Pravé roztoky (analytické disperze) Látková koncentrace (molarita) Molalita. Rozdělení disperzních soustav

Superkritická fluidní extrakce (SFE) Superkritická fluidní extrakce

Průvodka. CZ.1.07/1.5.00/ Zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT. III/2 Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT

F1190: Lipidy. Přednáška je podporována grantovými prostředky z programu: Reforma a rozvoj výuky Biofyziky pro potřeby 21. století

Ing.Branislav Ruttkay-Nedecký, Ph.D., Ing. Lukáš Nejdl

Trendy v moderní HPLC

PŘÍPRAVKY NA BÁZI LIGNOSULFONÁTŮ

Předmět: KBB/BB1P; KBB/BUBIO

Úvod do vysokoúčinné kapalinové chromatografie

některé pórovité látky s obrovským povrchem jsou schopny vázat (adsorbovat) do svých pórů velké množství vody, organických a anorganických látek

Aminokyseliny, peptidy a bílkoviny

Interakce fluoroforu se solventem

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY

Separační metody v analytické chemii. Plynová chromatografie (GC) - princip

Cohesion: A Scientific History of Intermolecular Forces

Hmotnostní detekce v separačních metodách

Chemické speciality. Chemické speciality přednáška I

MOLEKULOVÉ MODELOVÁNÍ - STRUKTURA. Monika Pěntáková Katedra Farmaceutické chemie

2.3 CHEMICKÁ VAZBA. Molekula bílého fosforu P 4 a kyseliny sírové H 2 SO 4. Předpona piko p je dílčí jednotkou a udává velikost m.

Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková. záleží na tom, co chceme dělat 1) METHALOTIONEIN 2) GFP

Bílkoviny - proteiny

Vysokoúčinná kapalinová chromatografie. Petr Kozlík Katedra analytické chemie

Valenční elektrony a chemická vazba

Jméno autora: Mgr. Ladislav Kažimír Datum vytvoření: Číslo DUMu: VY_32_INOVACE_09_Ch_OB Ročník: I. Vzdělávací oblast: Přírodovědné

Molekulární dynamika vody a alkoholů

NÁPLŇOVÉ KOLONY PRO GC

Teorie kyselin a zásad poznámky 5.A GVN

TEORIE NETKANÝCH TEXTILIÍ. Kapky Kapilární délka. Simulace pomocí Isingova modelu. 7.přednáška

Kapaliny Molekulové vdw síly, vodíkové můstky

CHEMICKÁ VAZBA. Autor: Mgr. Stanislava Bubíková. Datum (období) tvorby: Ročník: osmý

Aktivita CLIL Chemie I.

SPE je metoda vhodná pro rychlou přípravu vzorků, která užívá

APLIKOVANÉ ELEKTROMIGRAČNÍ METODY

Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

Název: Ze společenského života molekul

Analýza kofeinu v kávě pomocí kapalinové chromatografie

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

Mezimolekulové interakce

Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat

Anorganické látky v buňkách - seminář. Petr Tůma některé slidy převzaty od V. Kvasnicové

Teorie hybridizace. Vysvětluje vznik energeticky rovnocenných kovalentních vazeb a umožňuje předpovědět prostorový tvar molekul.

Transkript:

Hydro řecky voda phobic z řeckého phobos strach

Hydrofobní efekt Dáme-li dvě hydrofobní molekuly do vody pozorujeme, že se silně přitahují. Vysoká přitažlivost molekul je výsledkem hydrofobního efektu. Hydrofobní látky (např.: olej, parafiny, apod.) nejsou rozpustné ve vodě jsou z vody vypuzovány, což je přisuzováno hydrofobnímu efektu. (Relativní) hydrofobicita je hodnota k porovnání. Rozdělovací koeficient n-oktanol-voda log P = c(v n-oktanolu) / c(ve vodě) Opak hydrofobicity je lipofilicita Opakem látky hydrofobní (lipofilní) je hydrofilní (lipofobní) A co látky fluorofilní a fluorofobní?

Hydrofobní efekt versus Similia similibus solvuntur Za jevem podobný se rozpouští v podobném je opak hydrofobního efektu. like-dissolves-like, similia similibus solvuntur Záleží na polaritě látek, odvozené od dielektrických vlastností (celkového dipólu). Ne vždy vede k očekávatelnému chování: metanol (ε r = 32,6) a toluen (ε r = 2,4) se mísí voda (ε r = 78,4) s isopropanolem (ε r = 18,3) se mísí Polarita vazeb? Cl Cl µ = 1,76 D ε S = 9,20 Cl Cl µ = 0 D ε S = 2,14 Hraje důležitější úlohu kvadropól (?) ale polarita vazeb prakticky stejná

Hydrofobní efekt Hydrofobicita je jeden z nejdiskutovanějších jevů současné chemie v roztoku a biochemie. Dotýká se nejrůznějších oblastí: čistící účinek mýdel a detergentů, vliv detergentů na povrchové napětí, nemísitelnost nepolárních látek s vodou, vznik biologických membrán a micel, skladba (folding) biologických makromolekul ve vodě, vznik klatrátů vody, vazba léku do receptoru. Hydrofobní interakce hrají roli při sebeskladbě vedoucí k agregaci nepolárních látek, či k tendenci nepolárních oligomerů přizpůsobit konformace ve vodě.

Hydrofobní efekt - Buněčná membrána

Hydrofobní efekt - vazba aniontů

Hydrofobní efekt Lotus effect (a) a (b) Povrch lotosového listu (SEM) (c) Kapka vody na lotosovém listu; téměř kulový tvar (d) a (e) Laserem strukturovaný silanyzovaný povrch křemíku (f) Kapka vody na strukturovaném povrchu

Hydrofobní efekt Superhydrofobní povrch je vysoce hydrofobní, a je velmi obtížné ho smočit.... kontaktní úhel kapky vody je větší než 150... úhel při kterém kapka sjede z povrchu je menší než 10 S U P E R H Y D R O F O B I C I T A

Hydrofobní efekt Důmyslná mikro- a nanostruktura povrchu minimalizuje adhezní síly.... superhydrofobní povrchy... samočistící povrchy

Hydrophobic interaction chromatography ( HIC ) Separace proteinů a peptidů na základě jejich relativní hydrofobicity. Stacionární fáze má kovalentně vázané hydrofobní (lipofilní) skupiny, kterých je 10- až 100-krát méně než u RPC neb HIC je určeno pro analyty výrazně méně hydrofobní (lipofilní) než typické analyty RPC. Mobilní fází jsou neutrální koncentrované vodné roztoky solí (vysoká iontová síla), jejichž koncentrace (iontová síla) je postupně snižována (nebo je přídán PEG). Využitelné pro izolaci, čištění a characterizaci většiny rozpustných proteinů; charakterizace protilátek, čištění polypeptidů (glycopeptidy, jedů, izolace proteinů ze surových extraktů (několikrát vyšší kapacita než u RPC), izolace membránových proteinů a jejich komplexů.

Hydrophobic interaction chromatography ( HIC ) Žlutá barva hydrofobní skupiny Červená barva hydrofilní skupiny Vysolování

Hydrofobní efekt - Hofmeister series - Lyotropic series NH 4 + Rb + K + Na + Cs + Li + Mg 2+ Ca 2+ Ba 2+ NH 4 + K + Na + Li + Mg 2+ Ca 2+ guanidinium NH 4 + Cs + Rb + K + Na + H + Ca 2+ Mg 2+ Li + CH 3 COO - SO 2-4 HPO 2-4 F - Cl - Br - I - NO 3 ClO - 4 PO 3-4 SO 2-4 CH 3 COO - Cl - Br - NO - 3 ClO - 4 I - SCN - SO 2-4 HPO 2-4 CH 3 COO - citrát Cl - NO - 3 ClO - 3 I - ClO - 4 SCN - Kosmotropní (stabilizující) ionty Silně hydratované anionty Slabě hydratované kationty Anti-chaotropní Zvyšují: - povrchové napětí (náročnější vznik kavity) - stabilitu proteinů - hydrofobní interakce Snižují: - rozpustnost uhlovodíků (Salt out, vysolování, agregace) - denaturaci proteinů Chaotropní (destabilizující) ionty Slabě hydratované anionty Silně hydratované kationty Snižují: - povrchové napětí (snadnější vznik kavity) - stabilitu proteinů - hydrofobní interakce Zvyšují: - rozpustnost uhlovodíků (Salt in) - denaturaci proteinů

Hydrofobní efekt - Hofmeister series Franz Hofmeister: Zur Lehre von der Wirkung der Salze (About the science of the effect of salts) Arch. Exp. Pathol. Pharmakol., 1888, 24, 247-260.

Hydrophilic interaction chromatography ( HILIC ) též Aqueous Normal Phase Pro separace hydrofilních látek. Stacionární fáze hydrofilní silikagel, případně modifikovaný aminoskupinami, dioly, amidy, zwitteriony,... Mobilní fází jsou vodné tlumiče (obvykle na základě formiátu či acetátu amonného) s vysokým podílem organického rozpouštědla mísitelného s vodou (např. 50-95% acetonitrilu). acetone < iso-propanol ~ propanol < acetonitrile < ethanol < dioxane < DMF ~ methanol < water

Hydrophilic interaction chromatography ( HILIC ) 2011 2013 Stationary and mobile phases in hydrophilic interaction chromatography: a review Pavel Jandera Department of Analytical Chemistry, Faculty of Chemical Technology, University of Pardubice, Studentská 573, CZ-53210 Pardubice, Czech Republic Analytica Chimica Acta, Volume 692, Issues 1 2, 29 April 2011, Pages 1 25 http://dx.doi.org/10.1016/j.aca.2011.02.047

Hydrofobní efekt Hydrophobic Effect: Formation of Micelles and Biological Membranes. Charles Tanford Hardcover: 208 pages, John Wiley & Sons Inc (November 1973) SBN-10: 0471844608, ISBN-13: 978-0471844600 January 18, 1980, Edition: 2nd ISBN-10: 0471048933, ISBN-13: 978-0471048930 THEMIS LAZARIDIS: Solvent Size vs Cohesive Energy as the Origin of Hydrophobicity, Accounts of Chemical Research, 34 (12), 2001, 931-937. ROLAND SCHMID: Recent Advances in the Description of the Structure of Water, the Hydrophobic Effect, and the Like-Dissolves-Like Rule, Monatshefte für Chemie, 132, 2001, 1295-1326. LAWRENCE R. PRATT: Molecular Theory of Hydrophobic Effects: She is too mean to have her name repeated., Annu. Rev. Phys. Chem., 53, 2002, 409-36. CHUNG-JUNG TSAI, JACOB V. MAIZEL, Jr., RUTH NUSSINOV: The Hydrophobic Effect: A New Insight from Cold Denaturation and a Two-State Water Structure, Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology, 37 (2), 2002, 55-69. NOEL T. SOUTHALL, KEN A. DILL, A. D. J. HAYMET: A View of the Hydrophobic Effect, J. Phys. Chem. B, 106, 2002, 521-533. CAREL JAN VAN OSS: Long-range and short-range mechanisms of hydrophobic attraction and hydrophilic repulsion in specific and aspecific interactions, Journal of Molecular Recognition, 16, 2003, 177-190. B. WIDOM, P. BHIMALAPURAM, KENICHIRO KOGA: The hydrophobic effect, Phys. Chem. Chem. Phys., 5, 2003, 3085-3093. JACK KYTE: The basis of the hydrophobic effect, Biophysical Chemistry, 100, 2003, 193-203.

Hydrofobní efekt Termodynamické parametry (kj.mol -1 ) transféru uhlovodíku z plynné fáze či organického rozpouštědla do vody při 298 K G H S Cp positivní a úměrná ploše hydrofobního povrchu negativní a úměrná ploše hydrofobního povrchu = vzniká více vazeb velká a negativní = vyšší uspořádání = není entropicky preferováno velká a úměrná ploše hydrofobního povrchu Tyto charakteristiky poukazují na vznik nových nekovalentních vazeb a na vyšší uspořádání systému.

Hydrofobní efekt V pevné fázi vody (v ledu) je každá molekula vody zapojena do čtyř vodíkových vazeb. Dvakrát jako akceptor a dvakrát jako donor. V kapalné fázi je každá molekula vody zapojena do ca. 3,4 vodíkových vazeb.

Hydrofobní efekt Molekuly vody, které jsou v přímém kontaktu s hydrofobní látkou musí zamrznout, aby dosáhly maximálního počtu vodíkových vazeb. Zamrznutím se sníží entropie molekul vody. Čím větší je plocha takového kontaktu, tím více entropie je celkově ztraceno. Systém se snaží minimalizovat tuto ztrátu tím, že se snaží minimalizovat tento povrch, což vede k agregaci hydrofobních molekul ve stále větší celky.

Hydrofobní efekt

Hydrofobní efekt - Gas hydrates - Water Clathrates Scanning electron microscope image of gas hydrate L. Stern, USGS Gas Hydrates Project

Hydrofobní efekt - Gas hydrates - Water Clathrates

Hydrofobní efekt - Gas hydrates - Water Clathrates

Hydrofobní efekt Entalpie a entropie jsou tedy značně závislé na teplotě.

Hydrofobní efekt Specific Ion Effects on Water Structure and Dynamics beyond the First Hydration Shell Angewandte Chemie International Edition Volume 50, Issue 2, pages 352-353, 5 DEC 2010 DOI: 10.1002/anie.201004501 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.201004501/full#fig1

Born-Haber cyclus H + G HG gas G HG H gas + G gas HG gas desolv G H desolv G G solv G HG G H Sol + G Sol HG Sol G = G gas HG + G desolv H + G desolv G + G solv HG Nechybí tu ještě něco!?!?!?! = 0

Born-Haber cyclus H Sol + G Sol HG + Sol Sol Rozpouštědlo s velkou kohezní silou může řídit komplexaci.

Hydrofobní efekt... Kohezní síly... Povrchové napětí

Hydrofobní efekt The hydrophobic effect is a unique organizing force, based on repulsion of solute by the solvent instead of attractive forces at the site of organization Tanford, Science 1978. Mechanism of the hydrophobic effect. Tanford (1980) recognized, in the last edition of his book (The Hydrophobic Effect) that hydrophobic attraction is driven by the free energy of cohesion of water.

Hydrofobní efekt Dáme-li dvě hydrofobní molekuly do vody pozorujeme, že se silně přitahují.! Toto pozorování je ve skutečnosti velmi zavádějící neb interakce mezi hydrofobní molekulou a molekulou vody je silnější než interakce mezi dvěma hydrofobními molekulami. Vysoká přitažlivost molekul je výsledkem hydrofobního efektu. HYDROFOBNÍ MOLEKULA HYDROFOBNÍ MOLEKULA MOLEKULA VODY disperzní interakce indukovaných dipólů < interakce indukovaného < dipólů s permanentním interakce permanentních dipólů, vodíková vazba HYDROFOBNÍ MOLEKULA MOLEKULA VODY MOLEKULA VODY

Hydrophobic attraction Hydrophobic attraction is the strongest non-covalent, nonelectrostatic binding force occurring between particles, molecules of polymers, immersed in water. The attraction between two apolar surfaces, or between one apolar and one polar surface, in water, is traditionally called the hydrophobic effect. It is perhaps the designation hydrophobic which has, so far, prevented a more general understanding of the mechanism behind the hydrophobic effect. The name hydrophobic is a misnomer. Hydrophobic surfaces (i.e. apolar surfaces) do not fear water, on the contrary, hydrophobic surfaces attract water (Hildebrand, 1979). For instance very hydrophobic materials, such as Teflon, or alkanes, when immersed in water attract water molecules with a free energy of about 40 50 mj.m -2, which is not negligible.

Hydrofobní efekt Paradoxně, hydrofobní molekuly mají rády molekuly vody ( H < 0) a rády by maximalizovaly kontakt s molekulami vady. Bohužel molekuly vody nemají rády hydrofobní látky a raději váží sami sebe. Přesnější by tedy bylo nazývat vodu lipofobní než nazývat uhlovodíky hydrofobními. Obecně rozšířené tvrzení, že hydrofobní molekuly odpuzují molekuly vody, je převážně nepravdivé. Hydrofobní interakce? Hydrofobní přitažlivost? Hydrofobní síly? Methylové skupiny spolu interagují hydrofobní interakcí.

Hydrofilicita... Lipofilicita... Fluorofilicita 250 200 Uhlovodíky CH 4 - C 8 H 18 a C 10 H 22 Perfluorované uhlovodíky CF 4 - C 8 F 18 a C 10 F 22 150 100 Voda Halogeny 50 0-50 0 100 200 300 400 500 600-100 -150-200 -250-300 Vodík Vzácné plyny He, Ne, Ar, Kr, Xe