Interpretace hmotnostních spekter měkkých ionizačních technik

Podobné dokumenty
Vybranné interpretace měkkých MS a MS/MS spekter

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

No. 1- určete MW, vysvětlení izotopů

INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER

Základy interpretace hmotnostních spekter měřených s použitím měkkých ionizačních technik

Hmotnostní spektrometrie Kvalitativní analýza - Interpretace měkkých MS a MS/MS spekter

Autoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními prin

No. 1 MW=106. No. 2 MW=156 [C 6 H 5 ] + [M-H] + M CHO [C 4 H 3 ] + 51 M+1

Základní principy interpretace spekter

Základní principy interpretace spekter

HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE

Indentifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

Klinická a farmaceutická analýza. Petr Kozlík Katedra analytické chemie

LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) Použití GC-MS spektrometrie

Dusíkové pravidlo. Počet dusíků m/z lichá m/z sudá 0, 2, 4,... (sudý) EE + OE +.

Dusíkové pravidlo. Počet dusíků m/z lichá m/z sudá 0, 2, 4,... (sudý) EE + OE +. 1, 3, 5,... (lichý) OE +. EE +

Hmotnostní spektrometrie. Historie MS. Schéma MS

Úvod Obecný vzorec alkoholů je R-OH.

HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE - kvalitativní i kvantitativní detekce v GC a LC - pyrolýzní hmotnostní spektrometrie - analýza polutantů v životním

MENÍ A INTERPRETACE SPEKTER BIOMOLEKUL. Miloslav Šanda

Karboxylové kyseliny a jejich funkční deriváty

HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE

Hmotnostní spektrometrie - Mass Spectrometry (MS)

1. ročník Počet hodin

4. Chemická ionizace. (E el = ev, p CH4 = Pa, p M = 0,05 0,1 Pa) => 0,1 % analytu)

Základy interpretace MS spekter získaných měkkými ionizačními technikami. Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.

Základy interpretace hmotnostních spekter

Charakteristika Teorie kyselin a zásad. Příprava kyselin Vlastnosti + typické reakce. Významné kyseliny. Arrheniova teorie Teorie Brönsted-Lowryho

Sada 7 Název souboru Ročník Předmět Formát Název výukového materiálu Anotace

Organická chemie (KATA) rychlý souhrn a opakování

Iontové zdroje II. Iontový zdroj. Data. Vzorek. Hmotnostní analyzátor. Zdroj vakua. Iontové zdroje pracující za sníženého tlaku

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

Aminy a další dusíkaté deriváty

Zdroje iont používané v hmotnostní spektrometrii. Miloslav Šanda

Základní principy interpretace hmotnostních spekter malých molekul

H H C C C C C C H CH 3 H C C H H H H H H

Školní vzdělávací program

Hmotnostní spektrometrie

Laboratoř ze speciální analýzy potravin II. Úloha 3 - Plynová chromatografie (GC-MS)

ZŠ ÚnO, Bratří Čapků 1332

Kyslíkaté deriváty. 1) Hydroxyderiváty: a) Alkoholy b) Fenoly. řešení. Dle OH = hydroxylová skupina

Základní chemické pojmy

Substituční deriváty karboxylových kyselin

Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi

MATURITNÍ OTÁZKY Z CHEMIE

Obsah. 2. Mechanismus a syntetické využití nejdůležitějších organických reakcí Adiční reakce Elektrofilní adice (A E

Hmotnostní spektrometrie

4. ročník - seminář Vzdělávací obor - Člověk a příroda

Organické látky. Organická geochemie a rozpuštěný organický uhlík

10. Tandemová hmotnostní spektrometrie. Princip tandemové hmotnostní spektrometrie

Analytická technika HPLC-MS/MS a možnosti jejího využití v hygieně

Postup při interpretaci NMR spekter neznámého vzorku

Organická chemie pro biochemiky II část

CH 2 = CH 2 ethen systematický název propen CH 2 = CH CH 3 but-1-en CH 2 = CH CH 2 CH 3 but-2-en CH 3 CH = CH CH 3 buta-1,3-dien CH 2 = CH CH = CH 2

Vlastnosti. Pozor! H 3 C CH 3 H CH 3

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

Karbonylové sloučeniny

Hydroxysloučeniny Tento výukový materiál vznikl za přispění Evropské unie, státního rozpočtu ČR a Středočeského kraje Únor

Tabulace učebního plánu. Obecná chemie. Vzdělávací obsah pro vyučovací předmět : Ročník: 1.ročník a kvinta

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

1. nitrosloučeniny R-NO 2 CH 3 -NO aminosloučeniny R-NH 2 CH 3 -NH 2

Organická chemie 3.ročník studijního oboru - kosmetické služby.

Složení látek a chemická vazba Číslo variace: 1

Karboxylové kyseliny

HYDROXYDERIVÁTY. Alkoholy Fenoly Bc. Miroslava Wilczková

Přístupy k analýze opticky aktivních látek metodou HPLC

Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

3. ročník Vzdělávací obor - Člověk a příroda

Reakce aldehydů a ketonů s N-nukleofily

1. Uríme, které ionty souvisí s analytem a které ne

SADA VY_32_INOVACE_CH1

Gymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora

Hmotnostní spektrometrie

DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii. Izolační a separační metody, 2018

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

DUSÍK NITROGENIUM 14,0067 3,1. Doplňte:

GC-MS aplikace v toxikologii

Reaktivita karboxylové funkce

LEKCE 2b. NMR a chiralita, posunová činidla. Interpretace 13 C NMR spekter

Úvod do studia organické chemie

Alkeny. Alkeny. Největšíprůmyslový význam majíethen (ethylen) a propen (propylen) jako suroviny pro další přeměny nebo pro polymerace

Ethery, thioly a sulfidy

2. Polarita vazeb, rezonance, indukční a mezomerní

PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE bakalářský studijní obor Bioorganická chemie 2011

Moderní nástroje v analýze biomolekul

Chemie 8.ročník. Rozpracované očekávané výstupy žáka Učivo Přesuny, OV a PT. Pozorování, pokus a bezpečnost práce předmět chemie,význam

Iontové zdroje II. Iontový zdroj. Data. Vzorek. Hmotnostní analyzátor. Zdroj vakua. Iontové zdroje pracující za sníženého tlaku

Iontové zdroje. Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE

ÚSTAV CHEMIE A ANALÝZY POTRAVIN

17. DUSÍKATÉ DERIVÁTY, EL. POSUNY

Iontové zdroje I. Iontový zdroj. Data. Vzorek. Hmotnostní analyzátor. Zdroj vakua. Ionizace, vlastnosti iontových zdrojů, iontová optika

TEST + ŘEŠENÍ. PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE bakalářský studijní obor Bioorganická chemie 2010

Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

MATURITNÍ TÉMATA - CHEMIE. Školní rok 2012 / 2013 Třídy 4. a oktáva

Aldehydy, ketony, karboxylové kyseliny

Halogenderiváty. Halogenderiváty

Transkript:

Interpretace hmotnostních spekter měkkých ionizačních technik

Poznámky k interpretaci API spekter vliv funkčních skupin na fragmentaci lze orientačně seřadit: nitrát > fosfát ~ sulfát >> sulfonová kyselina > karboxylová kyselina > hydroxy skupina > nitro skupina > halogeny > ostatní funkční skupiny ve velké většině ionty se sudým počtem e - štěpení menšího počtu labilních vazeb ve srovnání s EI minimum nebo absence fragmentových iontů v MS 1 fragmentace pomocí CID (MS/MS, MS n ) knihovny ESI/APCI spekter neexistují s výjimkou biomolekul a individuálních knihoven pro omezený rozsah látek

Pravidlo sudého počtu e - (Even-Electron Rule) měkké ion.tech. 1/ E + EE + + R 2/ EE + EE + + EI E + + EI E + + R 1/ Fragmentace iontů s lichým počtem e - (E + ) mohou vznikat opět ionty s lichým počtem e - anebo se sudým počtem e - 2/ Fragmentace iontů se sudým počtem elektronů (EE + ) - přednostně vznikají opět ionty se sudým počtem elektronů - vznik kation-radikálů při fragmentaci iontů se sudým počtem elektronů vyžaduje energeticky nevýhodné rozdělení elektronového páru (popsané výjimky)

Dusíkové pravidlo Základní formulace (platí pro M R a E +. ): $ lichá M R = lichý počet dusíků v molekule $ sudá M R = sudý počet dusíků v molekule nebo bez dusíku Pro ionty EE + přesně naopak: lichá hodnota m/z znamená sudý počet dusíků nebo bez dusíku, sudá hodnota m/z lichý počet dusíků platí pro běžné organické prvky (C,,,, F, Si, P, S, Cl, Br, I) Počet dusíků m/z lichá m/z sudá 0, 2, 4,... (sudý) EE + E +. 1, 3, 5,... (lichý) E +. EE +

Dusíkové pravidlo Základní formulace (platí pro M R a E +. ): $ lichá M R = lichý počet dusíků v molekule $ sudá M R = sudý počet dusíků v molekule nebo bez dusíku Pro ionty EE + přesně naopak: lichá hodnota m/z znamená sudý počet dusíků nebo bez dusíku, sudá hodnota m/z lichý počet dusíků platí pro běžné organické prvky (C,,,, F, Si, P, S, Cl, Br, I) Počet dusíků m/z lichá m/z sudá 0, 2, 4,... (sudý) EE + E +. 1, 3, 5,... (lichý) E +. EE +

100 Určení molekulové hmotnosti (API-MS) Positive-ion APCI MW = 400 100 401 [M+] + egative-ion 399 APCI m/z = 2 [M-] - % [M+a] + 423 % 0 [M+K] + 439 100 200 300 400 m/z 0 100 200 300 400 m/z m/z = 22 [M+] + [M+a] + [M+K] + m/z = 17 m/z = 38 [M+ 4 ] + m/z = 16

ejběžnější typy molekulárních aduktů + -

bvyklé kroky při interpretace API spekter Určení M R, ověření správnosti podle charakteristických aduktů [M+a] +, [M+K] +, [M+ 4 ] + ; méně často adukty s mobilní fází typu [M++methanol] + nebo [M++acetonitril] +, výjimečně dimerní ionty typu [2M+] +, [2M+a] + -většina aduktů má malou intenzitu (obvykle nejintenzivnější [M+a] + ), ale jejich význam pro potvrzení správnosti určení M R je velký, protože aduktové ionty se obvykle nevyskytují u fragmentů (jsou výjimky) - u záporných iontů kromě [M-] - lze v závislosti na složení mobilní fáze a matrici vzorku očekávat např. [M+Cl] -, [M+C 3 C] -, [M+C] -, apod. - typ a relativní intenzita aduktových iontů velmi výrazně závisí na složení mobilní fáze a obsahu solí v eluentu či vzorku Dusíkové pravidlo M+2 prvky: určení počtu Cl+Br, event. odhad přítomnosti S+Si MS/MS (MS n ) spektra, měření přesných hmot Sumarizace všech získaných informací a návrh struktury Retenční chování ověřit soulad s návrhem struktury Potvrzení s komerčním nebo syntetizovaným standardem

Uhlovodíky (C x y ), alkyl/aryl substituce alkany, alkeny, alkiny, aromáty pro alkyl substituci na aromatickém nebo obecně cyklickém systému očekávány ztráty alkenu (nebo alkanu, zejména u druhé a další ztráty pro více přítomnost více alkylů) podobně pro aryl substituci jsou obvyklé neutrální ztráty C 6 4 ( m/z 76) nebo C 6 6 ( m/z 78) ztráty alkyl/aryl radikálů jsou méně obvyklé, někdy se vyskytují v záporném módu (zejména pro APCI / APPI) pro uhlovodíky bez funkčních skupin nejvhodnější APCI / APPI v kladném módu, v ESI jen pomocí tvorby aduktů (Li, Ag, a, apod.)

Iontové funkční skupiny orientační pravidlo - čím polárnější je funkční skupina, tím větší vliv na ionizační a fragmentační chování lze očekávat anionické funkční skupiny (sulfát, sulfo, karboxy) - výborná ionizační účinnost a tím i citlivost v záporném módu (obecně vhodnější ESI než APCI), signál v kladném módu horší nebo žádný, částečně může vylepšit jiná protonovatelná skupina (např. 2 ) intenzivní adukty se sodným iontem (popř. K +, 4+ ), typicky zasolené vzorky kationické funkční skupiny (např. kvartérní aminy) vynikající signál v kladném ESI módu, pozor na silné paměťové efekty (lépe se těmto látkám zcela vyhnout), signál v záporném módu obvykle neposkytuje Více anionických funkčních skupin často rozsáhlá fragmentace, nízká intenzita [M-] - iontu vznik série násobně nabitých iontů typu [M-x] x- a jejich kombinace se sodnými adukty typu [M-(x+y)+ya] x- využití sérií vícenásobně nabitých iontů pro určení MW a počtu iontových skupin

Určení MW a počtu iontových skupin série iontů [M-x] x- a [M-(x+y)+ya] x- maximální pozorovaný náboj x a/nebo maximální počet vyměnitelných protonů y = počet iontových skupin Intens. 5 x10 3 2 309.85 310.06 m/z 0.25 C.I. Direct Green 26 MW = 1222 5 iontových skupin 1 Intens. 5 x10 243.24 310.31 310.56 310.81 311.07 0 309.5 310.0 310.5 311.0 m/z 1.25 M. olčapek, P. Jandera, J. Přikryl, Dyes Pigm., 43 (1999) 127 1.00 0.75 0.50 0.25 0.00 243.43 m/z 0.20 243.63 243.84 244.05 243.0 243.5 244.0 244.5 m/z

Funkční skupiny obsahující fosfor ( 31 P) Fosfor je monoizotopický R P R + P R P (R-) + P [M--P 3 ] - [ 2 P 4 ] -

Fosfátová skupina (RP 3 2 ) časté u biomolekul (peptidů, lipidů, cukrů) lze měřit nejlépe v ESI-, někdy i ESI+ (fosfolipidy), labilní iontová skupina adukty se sodným iontem a dalšími kationty diagnostické fragmenty m/z 79 [P 3 ] -, 97 [ 2 P 4 ] - [ 2 P 4 ] - [M-] - [P 3 ] - [M-- 2 ] - C. Antonio et al, J. Chromatogr. A 1172 (2007) 170

Funkční skupiny obsahující síru ( 32 S) M( 32 S) = 100% M+1 ( 33 S) = 0.79% M+2 ( 34 S) = 4.4% R S R + S R S (R-) + S [M--S 3 ] - [S 4 ] -

Sulfátová skupina (RS 3 ) [S 4 ] - m/z 97 - S 3 (- 80) S S - - 2 S 4 (- 98) intenzivní adukty se sodným iontem pro polysulfatované látky rozsáhlá fragmentace, nízká intenzita nebo absence [M-] - iontu (opakované ztráty 2 S 4 a/nebo S 3 ), násobně nabité ionty ideální pro ESI-, popř. MALDI- (APCI nelze)

Vliv zavedení iontové funkční skupiny (sulfát) APCI+ (alkohol) S 2 (C 2 ) 6 [M+] + 382 APCI+ MS 1 ESI- (sulfát) MS/MS [M+- (C ) -S ] 2 2 6 2 201 217 + [M+- 2(C 2) 6] 265 + [M+-2] 0.0 100 150 200 250 300 350 S 2 (C 2 ) 2 S 3 - [M--S3-C3C] 324 364 400 280 217 404 + - [M--S 3 ] 2 MS of m/z 404 [M-] - 0.0 100 150 200 250 300 350 400

Sulfonové kyseliny (RS 3 ) R S R + [M--S 3 ] - S R S R.. + S [S 3 ] -.

Sulfonové kyseliny (RS 3 ) S ESI- (APCI-) - S 3 (- 80) S - S 2 (- 64) - [S 3 ] -. m/z 80 vynikající citlivost v ESI-, lze i MALDI-, pro mono- a disulfonané sloučeniny lze s horší citlivostí i APCI- a APPI- intenzivní adukty se sodným iontem pro polysulfonované látky série násobně nabitých iontů a jejich aduktů s a +, ale nikoliv fragmentace v MS 1, proto snadné určení MW a počtu sulfo skupin typické ztráty v MS/MS jsou m/z 80 = S 3 (někdy může poskytnout i sulfát) a m/z 64 = S 2 (naprosto charakteristické) a radikál anion m/z 80 = [S 3 ] -.

ESI-MS barvivo Reactive Black 5 2 3 SC 2 C 2 2 S S 2 C 2 C 2 S 3 3 S S 3 2 sulfát 2 sulfo 2 azo 1 hydroxyl 1 amino MW=901 [M-2] 2- = 449.5

Funkční skupiny obsahující dusík ( 14 ) R 3 R + 3 R C 3 R C + 3 [M+- 3 ] + [M+- 3 ] + M( 14 ) = 100% M+1 ( 15 ) = 0.37%

Funkční skupiny obsahující dusík ( 14 )

Alifatické nitráty - výbušniny (R 2 ) bez aditiv úplná absence [M+] + / [M-] - iontů, intenzivní fragmenty m/z 62 = [ 3 ] -, m/z 46 = [ 2 ] -, obtížně intepretovatelné adukty a fragmenty přídavek CCl 4 (nebo halogenidu, octanu, mravenčanu) velmi charakteristická tvorba aduktů [M+Cl] -, [M+C 3 C] -, atd. u APCI X.M. Zhao, J. Yinon, J. Chromatogr. A, 977 (2002) 59

itro sloučeniny (R 2 )

itro sloučeniny (R 2 ) známá výjimka tvorby molekulárního radikál aniontu M -. v APCI- obecně hodně radikálových ztrát pro nitro látky: m/z 46 = 2., m/z 30 =.,někdy i ztráta m/z 17 =. méně obvyklé ztráty m/z 31 =, m/z 47 = 2-2 (- 46) - (- 16) - - (- 30) - ztráta m/z 30 =. itroso sloučeniny (R)

Dusíkaté sloučeniny dusíkové pravidlo; dusík je obvykle místem protonace Primární aminy R 2 ztráta amoniaku [M+- 3 ] + je spíše výjimečná Sekundární a terciární aminy R 1 R 2 nebo R 1 R 2 R 3 ionty typu [R 1 3 ] + a [R 2 3 ] + (na aminoskupině dochází obvykle k protonaci apřenosu vodíku při fragmentaci), analogicky [R 1 2 R 2 ] + či [R 1 R 2 R 3 ] + ionty vedle toho mohou být přítomny též ionty [R 1 ] + a [R 2 ] +, méně časté neutrální ztráty R 1 R 2 vedou ke vzniku iontů např. [M+-R 1 R 2 ] +, typický příklad ztráta dimethylaminu či podobného dialkylaminu ztráty radikálů R. méně obvyklé, nicméně v APCI- existují, např. [M--butyl] -. Kvartérní aminy (R) 4 + X - velice stabilní ionty [(R) 4 ] + s vysokou ionizační účinností (např. tetrabutylamoniová ion-párová činidla), PZR: velmi silné paměťové efekty!!! záporný mód není vhodný

Azo sloučeniny organická barviva ( 2 )

Azo sloučeniny organická barviva ( 2 ) Y + 14 Y Y - 14 X - 14 X X + 14-2 (- 28) azo skupina je typicky doprovázené řadou dalších polárních funkčních skupin (sulfo, sulfát, karboxy, amino, atd.) v molekule barviva, které podléhají fragmentaci přednostně zajímavá a typická je přesmyková ztráta m/z 28 = 2 (analogie EI)

ESI-MS/MS barvivo Mordant Black 15 MW = 389 1 sulfo 1 nitro 1 azo 2 hydroxyl

itrily (RC) neutrální ztráta m/z 27 = C, tato ztráta může být běžně pozorována i u dusíkatých heterocyklických sloučenin (nebo ztráta m/z 41 = acetonitril či obecně alkylnitril) a aromatických aminů, málo specifické nepatří mezi příliš preferované fragmentační cesty, pokud je přítomna jiná polárnější funkční skupina, pak ztráta nitrilu obvykle málo významná -oxidy labilní vazba s iontovým charakterem, tato část molekuly bývá často primárním místem štěpení příklad: skupina,-dimethylaminooxid vznikající metabolizmem dimefluronu se primárně štěpí, čímž lze identifikovat místo oxidace v metabolitu pozorovaná preference tvorby aduktů s chloridem [M+Cl] - v záporném ESI módu (pro malé množství dat není jasné, zda lze zobecnit)

alogeny ( 19 F, 35 Cl, 79 Br, 127 I) R X R + X [M+-X] +

alogeny monoizotopické 19 F a 127 I monoizotopické prvky jsou oblíbené pro kalibrační směsi obecně ve spektrech ztráty F (20) nebo I (128), ale ztráta F vůbec nemusí být pozorována (zejména v případě substituce F na aromátu) a přítomnost F se pozná pouze podle zvýšení MW o 18 ( MW = F = 18) ionty m/z 19 [F] - nebo m/z 127 [I] - mohou být důležité diagnostické ionty při záznamu záporných iontů (MS nebo lépe MS/MS), pozor na nastavení m/z rozsahu (m/z 19 lze spolehlivě diagnostikovat na kvadrupólu, IT nelze) pro polyfluorované nebo perfluorované sloučeniny opakované ztráty F, F 2 nebo F., což může vést k poklesu intenzity [M+] + / [M-] - iontů, tento typ látek se měří spíše na GC/MS; typické ionty m/z 69 [CF 3 ] + pro perfluorované látky, m/z 113 [CF 3 C] - pro kyselinu trifluoroctovou a její deriváty přítomnost jódu v molekule je natolik neobvyklá, že je většinou očekávána předem na základě předběžných informací

alogeny Cl, Br Cl 100% Poměr izotopů - Cl (- 36) 35 36 32% 37 m/z 35 Cl : 37 Cl = 3 : 1 n * Cl = (3a + b) n Br Poměr izotopů 79 Br : 81 Br = 1 : 1 - Br (- 80) 79 80 81 m/z n * Br = (a + b) n pro poly- a perhalogenované sloučeniny opakované ztráty X nebo X. (zejména Br. ), což vede k výraznému poklesu [M+] + či [M-] - iontů

Funkční skupiny obsahující kyslík ( 16 ) R R + R R + [M+- 2 ] + [M+- 2 2 ] + R R + [M+- 2 ] +

Funkční skupiny obsahující kyslík ( 16 ) Methoxy skupina M( 16 ) = 100% M+1 ( 17 ) = 0.04% M+2 ( 18 ) = 0.2% R C 3 R + C 3 [M+-C 3 ] + R C 3 R.. + C 3 [M+-C 3 ] +.

Karboxylové kyseliny (RC) R C R C + [M+- 2 ] + R C R + C [M--C 2 ] -

Karboxylové kyseliny (RC) C APCI- ESI- C - - C 2 (- 44) lze použít záporný mód všech API technik i MALDI, v případě dalších funkčních skupin možný i záznam kladných iontů naprosto charakteristická ztráta m/z 44 = C 2, může být intenzivní již v MS 1, typické pro záznam záporných iontů, často i v kladném módu (další ztráty 2, C, 2 +C), u alifatických kyselin ztráta C 2 méně výrazná v oblasti nízkých m/z může být pozorován ion m/z 44 [C 2 ] -, jiné ztráty nejsou polykarboxyláty (nebo kombinace karboxy + sulfo skupin) tvoří aduktové ionty záměnou kyselých protonů za sodné ionty podobně jako sulfo kyseliny falešná interpretace m/z 44 téměř vyloučena, jediná možná záměna je ztráta radikálu 2 C. pro dusíkaté heterocykly obsahující karbonylovou skupinu, avšak tato ztráta nebývá jednotně 44 v obou módech polarity, ale doprovázena m/z 43 = C

Kyslíkaté sloučeniny ztráta vody m/z 18 - teoreticky možná téměř pro všechny kyslíkaté sloučeniny diagnostická hodnota je malá, nutno posuzovat i intenzitu iontu alifatické alkoholy velice intezivní ztráta vody již v MS 1, v APCI většinou 100% intenzitu již v MS 1 (často i v ESI), v MS/MS ion [M+- 2 ] + opět převládá fenoly a chinony ztráta vody může být patrná, ale oproti alkoholům nižší relativní intenzita, někdy ztráta radikálu. (např. nitro látky), přesmyková ztráta m/z 28 = C polyhydroxylované sloučeniny (např. cukry) nutné použít ESI, opakované ztráty vody, pokles intenzity [M+] + / [M-] - ketony - analogicky -štěpení u EI vznikají [R 1 C] + a [R 2 C] +, někdy též ztráta vody [M+- 2 ] + s velmi malou intenzitou aldehydy ztráta C pozorovaná v obou módech polarity (nespecifické, běžné např. pro karbonyl v cyklické struktuře), někdy ztráta m/z 30 = C estery při absenci dalších funkčních skupin vhodnější záznam kladných iontů, typická ztráta alkoholu R 2 z esterové funkční skupiny R 1 CR 2 (např. ztráta methanolu u methylesteru) následovaná ztrátou C, dále vznik karbonylových iontů [R 1 C] + obecně výrazné analogie s EI, zejména při použití APCI

Shrnutí vlivu funkčních skupin na fragmentaci K. Levsen et al., J. Mass Spectrom.,42 (2007) 1024

becný postup PLC/MS/MS identifikace (analýza metabolitů, přírodních extraktů, syntetických produktů) A/ lavní (cílová, výchozí, parentní) látka struktura známá, dostatečné množství standardu -změření a detailní interpretace všech možných MS experimentů, lze využít i přímé infúze (různé ionizační techniky, obě polarity záznamu, různé typy analyzátorů, chromatografické chování, UV spektra z PDA detektoru) Cíl: a) znalost chování hlavní látky při ionizaci, fragmentaci a PLC retenci kvůli uplatnění analogie pro identifikaci vedlejších látek (metabolitů, meziproduktů, nečistot, minoritních složek, atd.) b) volba optimálních podmínek pro vlastní analýzu vzorku B/ Standardy vedlejších látek pokud jsou k dispozici, provést vše viz A/ C/ PLC/MS analýza vzhledem ke komplexnosti uvedených typů vzorků není vhodné vynechání separačního kroku, jinak ztráta informace - volba PLC podmínek optimalizace separace, MS kompatibilní podmínky -měřit oba módy polarity, podle charakteristických iontů určení M R všech hlavních složek a maximálního počtu minoritních píků -ověřovat a rozlišovat koeluce pomocí rekonstrukce iontových proudů (RIC)

becný postup PLC/MS/MS identifikace D/ PLC/auto MS/MS experimentálně lze provést zároveň s C/ PLC/MS - interpretace následně po určení M R z PLC/MS - optimální volba podmínek (práh citlivosti threshold ), počet iontů pro kolize, kolizní energie, exkluze iontů, ukončení exkluze, atd.) by měla zajistit změření MS/MS spekter pro všechny píky včetně koelucí, obvykle pro ionty [M+] + nebo [M-] -, možnost interaktivní úpravy nastavení v průběhu analýzy - ne vždy se podaří, obtížné nastavení u koelucí, chvostování píků, stopových složek (D2/ PLC/manuální MS/MS - dodatečné experimenty v případě chybějících důležitých MS/MS spekter, nutnosti doměření MS 3 či in-source CID +MS 2 ) E/ Měření přesných hmot pomocí QqTF, rbitrap, FTICR, určení elementárního složení pro prekurzorové i produktové ionty (kalibrace, <3 ppm) F/ Sumarizace a korelace všech dostupných dat retenční chování, UV spektra z PDA detekce, určení M R, interpretace MS/MS spekter, další spektrální informace + základní chemický cit = návrh struktury (nebo aspoň její části) G/ věření návrhu struktury pomocí identického standardu

100% PLC/MS/MS identifikace nečistoty ečistota 8.00 Acid Red 118 12.72 UV chromatogram Int. Time [min] ESI spektrum nečistoty v záporném módu [M-] - ESI spektrum Acid Red 118 v záporném módu [M-]- M R =512 M M R =540 R =28

PLC/MS/MS barviva a nečistoty -S 2 (186) 250 2 IDETICKÉ 3 C 2 S C 2 C 3 355-2 (327) -S 3 (275) 237 459 80 - S 3 -S 2 (186) 250 2 IDETICKÉ 3 C 2 S 355-2 (327) -S 3 (275) 237 431 80 - S 3

Identifikace produktů syntézy Výchozí látka čekávaný produkt Cl C Cl C m/z 129 m/z 207 (E +. ) + = m/z 208 (EE + ) Zadání syntetika: Potvrdit strukturu očekávaného produktu syntézy. Cíl servisních měření: Co nejrychleji a nejsnadněji dát jasnou odpověď na otázku. Volba MS podmínek: 1/ Ionizační technika? Polarita záznamu? 2/ Separace? 3/ Měření přesných hmot?

Identifikace produktů syntézy 516[M+] + [M+] + [M+] + 507 682 [2M-2-Cl] 2-496 M -. M -. 506 681

Identifikace produktů syntézy 228 MS/MS = 682 200 480 682 228 MS/MS = 516 200 480 516 Cl 228 MS/MS = 507 200 507 C

Identifikace produktů syntézy Výchozí látka Cl Cl čekávaný produkt C C Produkt 1 Produkt 2 Produkt 3 C Cl

ESI-MS/MS analýza peptidů Schéma značení fragmentových iontů peptidů z 3 y 3 x 3 z 2 x 2 y 1 y 2 z 1 x 1 R1 R2 R3 R4 2 C C C C C C C C a 1 b 1 c 1 a 2 c 2 a 3 b 3 b 2 c 3 (typická písemková otázka)

ESI-MS/MS spektrum peptidu Série iontů typu b a y

Metabolismus xenobiotik Základní funkce metabolismu xenobiotik (látky cizí organismu léčiva, pesticidy, kontaminanty, atd.) je transformace na derivát s vyšší rozpustností ve vodě, kterýmůže být snáze eliminován z těla Metabolismus xenobiotik má dva základní kroky: I. fáze reakce funkčních skupin II. fáze konjugační reakce I. fáze II. fáze S 3 Experimentální přístup PLC/MS v obou módech polarity, správná volba ionizační techniky Určení molekulové hmotnosti: I. fáze APCI, ESI, APPI, II. fáze ESI Identifikace metabolitů je založena na interpretaci MS/MS spekter, retenčního chování, UV spekter z PDA detektoru, popř. informací z dalších spektrálních technik

Defekty atomových hmotností Element ominal atomic mass [Da] Mass defect [mda] 1 +7.8 C 12 0 14 +3.1 16-5.1 F 19-1.6 Si 28-23.1 P 31-26.2 S 32-27.9 Cl 35-31.1 Br 79-81.7 I 127-95.5 ejběžnější metabolické reakce I. fáze Metabolic reaction (elemental composition change) -44 Decarboxylation (-C 2 ) +10.2-18 Alcohol dehydration (- 2 ) +10.6-14 Demethylation (-C 2 ) -15.7-2 Ring formation (- 2 ) -15.7 +2 Ring opening (+ 2 ) +15.7 +14 ydroxylation and cyclization (+- 2 ) -20.7 ydroxylation (+) -5.1 +16 Epoxidation (+) -5.1 xidation (+) -5.1 +34 Epoxidation and hydration (+ 2 2 ) +5.5 ominal mass shift [ΔDa] Exact mass shift [mda]

ejběžnější metabolické reakce II. fáze ominal mass shift [ΔDa] Conjugation reaction (elemental composition change) Drug functional group Exact mass shift [mda] +14 Methylation (+C 2 ) 2,, S +15.7 +42 Acetyl conjugation (+C 2 2 ) 2, 2, S 2 2, +10.6 +57 Glycine conjugation (+C 2 3 ) C +21.5 +79 Phosphorylation (+P 3 ) -41.5 +80 Sulfation (+S 3 ) 2, S 2 2, -43.2 +162 Glucosylation (+C 6 10 5 ), C +52.8 +176 Glucuronidation (+C 6 8 6 ) +32.1 +220 Indirect carbamate glucuronidation of amines (+C 7 8 8 ) 2 + C 2 +21.9 +306-X Glutathione conjugation halide substitution (-X+C 10 16 6 3 S) alide (X) +76.0 +305 Glutathione conjugation via epoxidation (+C 10 15 6 3 S) Aromatic +68.2 V review celkem popsáno 54 metabolických reakcí I. fáze a 25 reakcí II. fáze M. olčapek, L. Kolářová, M. obilis, Anal. Bioanal. Chem, 216 (2008) 1962

Metabolismus dimefluronu Dimefluron (DMF) - 3,9-dimethoxy-5-(2-dimethylaminoethoxy)- 7-benzo[c]fluoren-7-one-hydrochlorid potenciální antineoplastikum vzorky: krysí výkaly C 3 3 C 3 C C 3 P. Císař et al., J. Pharm. Biomed. Anal., 37 (2005) 1059

DMF MW = 377 C 3 I.S. MW = 391 C 3 3 C 3 C C 3 3 C C 3 C 3 1 2 MW = 349 MW = 363 3 C 3 C C 3 3,9--desmethyl DMF 3 C C 3 3--desmethyl DMF 4 5 MW = 379 3 C MW = 363 3 C C 3 3 C -desmethyl DMF C 3 3 C C 3 DMF -oxid 3 MW = 363 C 3 3 C C 3 9--desmethyl DMF 6 MW = 393 3 C C 3 3 C C 3 redukovaný DMF

DMF (ESI-MS a MS n ) ESI+ C 3 [M+] + 3 C 3 C C 3 [M+a] + [M+K] + ESI- MW = 377 žádný signál MS 2 (378) MS 3 (378-333) [378-C 3 C 3 ] + [333-C] + [333-2 ] + 378

9-- or 3--desmethyl DMF MW = 363 ESI+ 3 C [M+] + [M-] - 3 C C 3 [M+a] + [M+K] + [2M-] - MS 2 (364) MS 2 (362) [364-C 3 C 3 ] + [362-(C 3 ) 2 C 2 C 2 ] - [362-(C 3 ) 2 ] - 364 ESIshodná spektra pro 3,9--desmethyl DMF (MW = 349)

-desmethyl DMF ESI+ [M+] + C 3 3 C [2M+] + 3 C MW = 363 MS 2 (364) [364-C 3 2 ] + [364-C 3 CC 2 ] + ESI- žádný signál 364

Redukovaný DMF C 3 ESI+ 3 C 3 C ESI- [M+] + [M-] - C 3 MW = 379 [M+a] + MS 2 (380) [380-2 ] + [362-(C 3 ) 2 CC 2 ] + [319-C 2 ] + [362-C 3 C 2 ] + 380 MS 2 (378) [378-C] - [378-(C 3 ) 2 C 2 C 2 ] - [306-C] - [350-C 3 ] - 378

UV spektra DMF C 3 Redukovaný DMF C 3 3 C 3 C C 3 3 C 3 C C 3 mau 1000 mau 1500 800 600 1000 400 200 500 200 250 300 350 nm 200 250 300 350 nm

Standardy 1 1 PLC/ESI-MS 3-- 3,9-- 9-- ESI+ ESI- 3 2 redukovaný 2 6 DMF 7 8 I.S. 4 5 -desmethyl -oxid 1 - MW = 349 2 - MW = 363 3 - MW = 363 4 - MW = 379 5 - MW = 363 6 - MW = 393 7 - MW = 377 8 - MW = 391 3 6 PLC podmínky: 0 min 40%, 20 min - 80% acetonitril / 5 mm C 3 C 4 ve vodě (p=3), kolona Supelco Discovery (250x4 mm), F=1ml/min, T=30 C.

PLC/ESI-MS Vzorky ESI+ 7 8 ESI- 16.6 min 1 3 26 45 1 2 3 metabolity II. fáze ionty: [M+a] +, [M- 2 +] +, atd., sudé MW adukty s glycinem nebo kyselinou glukuronovou metabolity I. fáze od t r = 16 min

PLC/ESI-MS a MS/MS (zvětšená oblast metabolitů I. fáze od t R =16 min) ESI+ 1 3 2 6 4 5 DMF I.S. 7 8 3,9--desmethyl DMF 9--desmethyl DMF 3--desmethyl DMF redukovaný DMF -desmethyl DMF -oxid DMF MW = 349 MW = 363 MW = 379 MW = 363 MW = 393 MW = 377 MW = 391

[M+] + MS 2 10 MW = 349 2 C 3-31 C 2 CC 3-57 3 C 3 C 3--desmethyl -desmethyl DMF C 2 C 3-43 7 DMF 8 I.S. 3,9-- 3-- 9-- 1 3 2 9 redukovaný 6 -desmethyl -oxid 4 5

[M+] + [M+] + 13 MW = 379 2 C 3-31 MS 2 C 2 CC 3-57 3 C C 3 C 3 3 C -methyl redukovaný -desmethyl DMF C 2 C 3-43 7 DMF 8 I.S. 3,9-- 3-- 9-- 1 3 11 10 2 9 redukovaný 6 -desmethyl -oxid 4 5

Metabolismus dimefluronu 1 3 C C 3 3 C 3 3 C C 3 C 3 3 C C 3 MW = 349 MW = 363 3,9--desmethyl DMF 9--desmethyl DMF MW = 365 reduk. 9--desmethyl DMF 15 3 C 2 3 C C 3 3 C MW = 363 3--desmethyl DMF C 3 3 C C 3 DMF MW = 377 3 C 6 C 3 3 C C 3 MW = 393 reduced DMF 3 C 3 C 14 3 C 3 C C 3 MW = 365 reduk. 3--desmethyl DMF MW = 349 10 3--desmethyl -desmethyl DMF 3 C 4 MW = 349 11 C 3 C 3 3 C MW = 379 -desmethyl DMF 3 C 9--desmethyl -desmethyl DMF 5 3 C 13 C 3 3 C C 3 3 C MW = 363 DMF -oxid C 3 3 C MW = 365 reduk. -desmethyl DMF