Monitorování hladiny biochemických markerů, včetně thiolových sloučenin

Podobné dokumenty
Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin

Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů

ASSAY OF NATURAL ANTIOXIDANTS POTENCY USING PIPETING ROBOT AND SPEKTROPHOTOMETRY

Úloha č. 15 Stanovení antiradikálové aktivity metodou DPPH

2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

1 Metody stanovení antioxidantů

1 Metody stanovení antioxidantů

SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE)

Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku

KATALOG DIAGNOSTICKÝCH SETŮ S K A L A B 2018

Sarkosin jako jednoduchý test na rakovinu prostaty analytická studie přednášky Natalia Cernei

Parametry metod automatické fotometrické analýzy

2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC

L 54/116 CS Úřední věstník Evropské unie

Vybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2

METALOTHIONEIN A JEHO ROLE V METABOLISMU VOLNÝCH RADIKÁLŮ. Branislav Ruttkay-Nedecký, Lukáš Nejdl, Markéta Vaculovičová, Vojtěch Adam a René Kizek

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv Stanovení obsahu celkového a volného tryptofanu metodou HPLC

Stanovení antioxidační aktivity a redukční síly na ječmeni jarním (Hordeum vulgare, L. cv. Bonus)

Spektrofotometrické stanovení fosforečnanů ve vodách

Sbohem, paní Bradfordová

Úvod k biochemickému praktiku. Petr Tůma

CS Úřední věstník Evropské unie L 54/89

DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii. Izolační a separační metody, 2018

Úvod k biochemickému. mu praktiku. Vladimíra Kvasnicová

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU A A VITAMÍNU E METODOU HPLC

MENDELOVA UNIVERZITA V BRNĚ AGRONOMICKÁ FAKULTA BAKALÁŘSKÁ PRÁCE

Průvodka. CZ.1.07/1.5.00/ Zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT. III/2 Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT. Pořadí DUMu v sadě 07

ANALYTICKÝ SYSTÉM PHOTOCHEM

Ústřední komise Chemické olympiády. 55. ročník 2018/2019 NÁRODNÍ KOLO. Kategorie E. Zadání praktické části Úloha 2 (30 bodů)

Tomáš Roušar, Pavla Žáková, Roman Kanďár, Vladimíra Mužáková, Jana Křenková

Úvod k biochemickému praktiku. Pavel Jirásek

Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce

Izolace nukleových kyselin

přístroji FIA QuickChem QC8500

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC

Ústřední komise Chemické olympiády. 55. ročník 2018/2019 NÁRODNÍ KOLO. Kategorie E. Řešení praktických částí

ŘADA KOVŮ, LP č. 1 REAKCE KOVŮ

Obr. 1. Struktura glukosaminu.

1. Proteiny. relativní. proteinu. Tento. České republiky.

Inkubace enzymů se substráty

Molekulová spektroskopie 1. Chemická vazba, UV/VIS

Ústřední komise Chemické olympiády. 55. ročník 2018/2019 TEST ŠKOLNÍHO KOLA. Kategorie E ŘEŠENÍ

EXTRAKCE, CHROMATOGRAFICKÉ DĚLENÍ (C18, TLC) A STANOVENÍ LISTOVÝCH BARVIV

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU LC/MS

CHEMICKÉ REAKCE A HMOTNOSTI A OBJEMY REAGUJÍCÍCH LÁTEK

Oxidace benzaldehydu vzdušným kyslíkem a roztokem

Stanovení účinnosti chemické dezinfekce vody ( chemické aspekty )

KA 2340/4-8up Chemické laboratorní metody v analýze potravin H1CL. Studijní podklady

Renáta Kenšová. Název: Školitel: Datum:

Chelatometrie. Stanovení tvrdosti vody

Gymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora

Měření koncentrace roztoku absorpčním spektrofotometrem

Název: Stanovení železa ve vzorcích krve pomocí diferenční pulzní voltametrie

KONTROLNÍ TEST ŠKOLNÍHO KOLA (70 BODŮ)

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

Izolace proteinů ze savčích buněk

Gymnázium a Střední odborná škola, Rokycany, Mládežníků 1115

Konfirmace HPLC systému

Spektroskopie v UV-VIS oblasti. UV-VIS spektroskopie. Roztok KMnO 4. pracuje nejčastěji v oblasti nm

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS

Kyslík a vodík. Bezbarvý plyn, bez chuti a zápachu, asi 14krát lehčí než vzduch. Běžně tvoří molekuly H2. hydridy (např.

IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)

Zajištění správnosti výsledků analýzy kotininu a kreatininu

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv Vydání 1 STANOVENÍ OBSAHU KOKCIDIOSTATIK METODOU LC-MS

Studium vlastností liposomů jako přenašečů léčiv pomocí různých analytických metod

Elektrochemický potenciál Standardní vodíková elektroda Oxidačně-redukční potenciály

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - aflatoxin B1, B2, G1 a G2

Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DRASLÍKU, SODÍKU, HOŘČÍKU A VÁPNÍKU METODOU FAAS/FAES

Spektroskopické é techniky a mikroskopie. Spektroskopie. Typy spektroskopických metod. Cirkulární dichroismus. Fluorescence UV-VIS

Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS

CS Úřední věstník Evropské unie L 54/85

STŘEDNÍ ODBORNÁ ŠKOLA a STŘEDNÍ ODBORNÉ UČILIŠTĚ, Česká Lípa, 28. října 2707, příspěvková organizace

Chemické rovnice. Úprava koeficientů oxidoredukčních rovnic

LABORATOŘ ANALÝZY POTRAVIN A PŘÍRODNÍCH PRODUKTŮ

Úvod do koroze. (kapitola, která bude společná všem korozním laboratorním pracím a kterou studenti musí znát bez ohledu na to, jakou práci dělají)

Praktické ukázky analytických metod ve vinařství

GALAVANICKÝ ČLÁNEK. V běžné životě používáme název baterie. Odborné pojmenování pro baterii je galvanický článek.

Příklady biochemických metod turbidimetrie, nefelometrie. Miroslav Průcha

Vliv selenu na metabolismus laboratorního potkana

STANOVENÍ CHLORIDŮ. Odměrné argentometrické stanovení chloridů podle Mohra

ZÁKLADNÍ CHEMICKÉ POJMY A ZÁKONY

ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE

ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK. Vyšetření moči

1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A

L 54/80 CS Úřední věstník Evropské unie

POKYNY FAKTORY OVLIVŇUJÍCÍ RYCHLOST REAKCÍ

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Transkript:

Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Monitorování hladiny biochemických markerů, včetně thiolových sloučenin Ing. Kateřina Tmejová, Ph. D., Mgr. et Bc. Markéta Komínková, Mgr. Natalia Cernei, Ph. D., Mgr. Zbyněk Heger, Ing. Branislav Ruttkay-Nedecký, Ph. D., Ing. Iva Blažková, MUDr. Jaromír Gumulec, Ing. et Ing. David Hynek, Ph. D., Mgr. Ondřej Zítka, Ph. D., Doc. RNDr. Pavel Kopel, Ph. D., Prof. Inf. René Kizek, Ph. D. ÚVOD Různé formy kyslíkových radikálů, které se tvoří například při intenzivní činnosti mitochondrií, musí být buňkou zlikvidovány. Pro tyto účely jsou syntetizovány látky, antioxidanty, které podléhají oxidaci namísto důležitých buněčných komponentů. Mezi antioxidanty patří metallothionein a glutathion, které vytvářejí oxidačně redukční prostředí a za určitých podmínek jsou schopni se vzájemně oxidovat či redukovat. To je důvod, proč působení oxidačních faktorů indukuje expresi MT v buňkách. Z fyzikálního hlediska sem patří například rentgenové záření, což potvrdilo několik studií. U myší, jejichž tělo bylo ozařováno rentgenovými paprsky, byl zjištěn zvýšený výskyt mrna metalothioneinu I (Shibuya, Satoh et al. 1995). Je předpokládáno, že MT funguje jako zhášeč radikálů či donor zinku enzymům účastnících se opravných procesů. Nízký redoxní potenciál thiolátového klastru MT umožňuje jeho oxidaci mírnými buněčnými oxidanty, které jsou neustále přítomné v buňce s dynamickou změnou jeho redoxního stavu. Vazba kovu (většinou zinku) je termodynamicky stabilní, ale oxidace thiolátového klastru MT vede k uvolnění kovů a vzniku MT-disulfidu anebo thioninu (dojde-li k uvolnění všech kovů z MT). Redukce MT disulfidu nebo thioninu je možná, pokud jsou k dispozici buněčná redukční činidla jako redukovaný glutathion (GSH) společně se selenem, jako katalyzátorem

a MT se rekonstituuje v přítomností kovů jako je zinek za fyziologických podmínek. Tenhle proces představuje MT redoxní cyklus. Obr. 1 zobrazuje antioxidační mechanismus v důsledku působení oxidanty. Obr. 1: Antioxidační mechanismus v důsledku působení oxidanty. PRAKTICKÁ ČÁST měření oxidačního stresu Popis přístroje BS-400 Byl použit automatický spektrofotometr BS 400 (Mindray, China), který se skládá z kyvetového prostoru (temperovaný na 37 ± 0.1 C), reagenčního prostoru s karuselem pro reagencie a přípravu vzorků (temperovaný na 4 ± 1 C) a optického detektoru. Zdrojem světla je halogeno-wolframová žárovka. Přenos vzorků a reagencí zabezpečuje robotické

rameno s dávkovací jehlou. Obsah kyvet je promíchán automatickým míchadlem ihned po přidání činidla nebo vzorku o objemu 2-45µl. Kontaminace je minimalizována díky proplachování jak dávkovací jehly, tak míchadla MilliQ vodou. Pro detekci bylo možné využít vlnových délek: 340, 380, 412, 450, 505, 546, 570, 605, 660, 700, 740, 800 nm. Zařízení je plně kontrolováno softwarem BS400 (Mindray, China). Stanovení celkových proteinů pomocí Biuretovy metody Principem je reakce peptidové vazby s Cu (II) v alkalickém prostředí za tvorby modrofialového zbarvení. Do kyvety bylo napipetováno 150 μl biuretova činidla (100 mm vinan sodnodraselný, 100 mm NaOH, 15 mm KI, 6 mm CuSO 4 ) a následně bylo napipetováno 3 μl vzorku. Po 10 min inkubace při 37 C byla změřena absorbance při vlnové délce λ = 546 nm. Pro výpočet bylo použito hodnoty absorbance samotné reagencie a hodnoty absorbance po 10 minutové inkubaci se vzorkem. Stanovení antioxidační aktivity Výsledek antioxidační aktivity byl vyjádřen jako ekvivalent kyseliny galové. Sérum/ovoce/tkáň/nápoj mělo celkově takový antioxidační potenciál jako x koncentrace kyseliny galové. Jednotky jsou v μg/g. Stanovení antioxidační aktivity pomocí metody ABTS ABTS metoda je jedním z nejvíce používaných testů na stanovení koncentrace volných radikálů. Princip stanovení je založen na neutralizaci radikálkationtu vzniklého jedno elektronovou oxidací syntetického chromoforu ABTS (2,2 -azinobis(3-ethylbenzothiazolin- 6-sulfonátu) na radikál ABTS e- ABTS +. Tato reakce je monitorována spektrofotometricky, měří se změna absorbance. Do plastových kyvet bylo pipetováno 150 µl reagencie R1 (7 mm ABTS (2,2 -azinobis 3- ethylbenzothiazolin-6-sulfonová kyselina a 4,95 mm peroxodisíran draselný), následně bylo přidáno 3 µl vzorku. Absorbance byla měřena při λ = 660 nm po dobu 12 minut. Pro výpočet

bylo použito hodnoty absorbance po přidání vzorku (2. minuta měření) a hodnoty absorbance po 12 minutách. Stanovení antioxidační aktivity pomocí DPPH testu Principem DPPH testu je schopnost stabilního volného radikálu 2,2-difenyl-1-pikrylhydrazylu reagovat s donory vodíku. DPPH vykazuje silnou absorpci v UV-VIS spektru. Při tomto testu se po redukci antioxidantem (AH) nebo radikálem (R ) roztok odbarví dle následující reakce DPPH + AH DPPH-H + A, DPPH + R DPPH-R. Do plastových kyvet bylo pipetováno 150 µl reagencie R1 (0,095 mm 2,2-difenyl-1-pikrylhydrazyl- DPPH ), následně bylo přidáno 15 µl měřeného vzorku. Absorbance byla měřena 12 minut při λ = 505 nm. Pro výpočet bylo použito hodnoty absorbance samotné a hodnoty absorbance po 12 minutách. Stanovení antioxidační aktivity pomocí metody DMPD Sloučenina DMPD (N,N-dimethyl-1,4-diaminobenzen) je působením železité soli v roztoku převedena na relativně stabilní a barevnou radikálovou formu DMPD +. Sloučeniny s antioxidační aktivitou jsou schopny DMPD + radikály zhášet a tím dochází k odbarvení roztoku a poklesu absorbance při λ = 505 nm. Do plastových kyvet bylo pipetováno 160 µl reagencie R1 (200 mm N, N-dimethyl-p-fenylendiamin-DMPD, 0,05 M FeCl 3, 0,1 M acetátový pufr ph 5,25), následně bylo přidáno 4 µl měřeného vzorku. Absorbance byla měřena 12 minut při λ = 505 nm. Pro výpočet bylo použito hodnoty absorbance samotné a hodnoty absorbance po 12 minutách. Stanovení antioxidační aktivity pomocí metody Free Radicals U této metody je využíváno schopnosti chlorofylinu (sodno-mědnatá sůl chlorofylu) přijímat a odevzdávat elektrony za současné stabilní změny absorpčního maxima. Tento děj je podmíněn alkalickým prostředím a přídavkem katalyzátoru. Do plastových kyvet bylo pipetováno 150 µl reagencie R1 (extrakt chlorofylinu, reakční pufr, katalyzátor) a následně bylo přidáno 6 µl vzorku. Absorbance byla měřena 12 minut při λ = 450 nm. Pro výpočet bylo použito poslední hodnoty měření.

Stanovení antioxidační aktivity pomocí metody FRAP Metoda FRAP (Ferric Reducing Antioxidant Power) je založena na redukci železitých komplexů TPTZ (2,4,6-tripyridyl-S-triazin) s chloridem železitým (FeCl 3 ), které jsou téměř bezbarvé (popř. slabě nahnědlé) a po redukci tvoří modře zbarvený železnatý komplex. Metoda má své limity spočívající v tom, že měření probíhá při nefyzilogicky nízké hodnotě ph (3,6) a nejsou zachyceny s komplexem pomalu reagující polyfenolické látky a thioly. Příprava reagencie: 1. 10 mm roztok TPTZ, doplnit po rysku 40 mm kyselinou chlorovodíkovou (HCl); 2. roztok 20 mm FeCl 3 ; 3. acetátový pufr 20 mm, ph 3.6; tyto tři roztoky se smíchají v poměru TPTZ: FeCl 3 : acetátový pufr 1:1:10. Reagence je použitelná týden při uskladnění v temném prostředí a teplotě 4 C. Do plastových kyvet bylo pipetováno 150 µl reagencie a následně bylo přidáno 3 µl vzorku. Absorbance byla měřena 12 minut při λ = 605 nm. Pro výpočet bylo použito hodnoty absorbance samotné a hodnoty absorbance po 12 minutách. Fotometrické stanovení malonyldialdehydu MDA podle Honga. Principem stanovení je reakce malonyldialdehydu (MDA) s kyselinou thiobarbiturovou (TBA) za vzniku TBA-MDA-TBA aduktu, který silně absorbuje při 532 nm. Trichloroctová kyselina (TCA) se přidává ke vzorku kvůli její schopnosti srážet proteiny, bilirubin, nenasycené mastné kyseliny a lipoproteiny. K 300 µl vzorku plasmy bylo přidáno 10 µl 0,5 M roztoku butylovaného hydroxytoluenu (BHT) v 96% ethanolu a 310 µl 20% TCA připravené v 0,6 M HCl. Po dvacetiminutovém stání v ledu byla směs centrifugována při 11 000 rpm 15minut. K 400 µl supernatantu byl přidáno 800 µl 30 mm kyseliny thiobarbiturové TBA a směs byla inkubována v termomixeru při 90 C 30 minut. Po ochlazení v ledě byla absorbance MDA měřena ve spektrofotometru při 535 nm a koncentrace byla odečtena z kalibrační křivky.

Stanovení glukosy Enzymatické kolorimetrické stanovení glukózy probíhalo podle následujících reakcí: GOD glukóza + O 2 kyselina glukonová + H 2 O 2 POD 2 H 2 O 2 + fenol + 4-AAP 4 H 2 O + červený chinon Do plastových kyvet bylo pipetováno 200 µl reagencie (0.1 M fosfátový pufr ph 7.5, 0.75mM fenol, 0,25 mm 4aminoantipyrin (4-AAP), glukózooxidáza 15kU/l, peroxidáza 1.5 U/l), následně bylo přidáno 20 µl měřeného vzorku. Absorbance byla měřena 10 minut při λ = 505. Pro výpočet bylo použito hodnoty absorbance samotné reagencie a hodnoty absorbance po 10 minutové inkubaci se vzorkem. PRAKTICKÁ ČÁST měření GSH, GSSG Vzorky byly před analýzou uchovávány při -80 C. Do eppendorfek budou naváženy vzorky rostlin 0,1 g. Tyto vzorky budou rozrušeny působením tekutého dusíku a dále drceny pomocí misky po dobu 2 minut. K vzorku bude vždy přidáno 1 ml fosfátového pufru ph 7 a dále drceno. Následovat bude použití ultrazvukové jehly po dobu 2 min a vortexování 15 min. Takto připravené vzorky. Takto připravené vzorky budou přesunuty do centrifugy a centrifugovány při 4 C, 25000g, 20 min. Supernatant bude rozdělen na alikvoty 1. pro stanovení na spektrofotometrii a 2. pro stanovení na HPLC. Pro HPLC stanovení přidáme 5 % TFA (ředěno z 20%), opět centrifugujeme a supernatant injektujeme do HPLC-ED systému. Stanovení obsahu GSH, GSSG HPLC-ED systém byl složen ze dvou chromatografických pump Model 582 ESA (ESA Inc., Chelmsford, MA) (pracovní rozsah 0.001-9.999 ml.min -1 ) a chromatografické kolony s reverzní fází Zorbax eclipse AAA C18 (150 4.6; 3,5 µm velikost částic, Agilent Technologies, USA) a dvanácti-kanálového CoulArray elektrochemického detektoru (Model

5600A, ESA, USA). Detektor je složen ze tří průtočných analytických komůrek (Model 6210, ESA, USA). Každá komůrka obsahuje čtyři analytické cely. Jedna analytická cela obsahuje dvě referentní (hydrogen paládiové), dvě pomocné a jednu porézní grafitovou pracovní elektrodu. Elektrochemický detektor je uložen v řídícím modulu, jehož celý prostor je termostatován. Vzorek (20 µl) byl injektován automaticky pomocí autosampleru (Model 542, ESA, USA), který má v sobě zabudován i termostatovaný prostor pro kolonu. Vzorky byly během analýzy uchovány v karuselu při teplotě 8 C. Kolona byla termostatována na 30 C. Průtok mobilní fáze byl 1 ml.min-1. Mobilní fáze se skládala z A: kyseliny trifluorooctové (80 mm) a B: 100% Met-OH. Látky byly eluovány následujícím lineárně vzestupným gradientem: 0-7 min (3 %B), 8-15 min (15 %B), 25 min (30 %B), 28-33 min (98 %B), 37 45 min (3 %B). Detekce separovaných látek probíhala při aplikovaném potenciálu 900 mv. Doba jedné analýzy byla 45 minut.