Česká sbírka mikroorganismů () DOPORUČENÉ KONTROLNÍ KMENY PRO IDENTIFIKAČNÍ TESTY V KLINICKÉ MIKROBIOLOGII - Bakteriologie K ověření kvality identifikačních souprav a testů používaných v klinické mikrobiologii nabízí Česká sbírka mikroorganismů seznam doporučených kontrolních kmenů. PŘEHLED POUŽÍVANÝCH TESTŮ PRO KLINICKOU BAKTERIOLOGII Test ANAEROtest 23 ATB agardiluční metoda (anaeroby) ATB disková difůzní metoda CLSI ATB mikrodiluční metoda CLSI ATB metody EUCAST Beta-glukuronidáza CAMP test Deaminace fenylalaninu Dekarboxylace lysinu Dekarboxylace ornitinu; Arginin dihydroláza ENTEROtest 24, ENTEROtest 24 N ENTERO-Rapid 24 E-test Fosfatáza Hydrolýza acetamidu Hydrolýza eskulinu Hydrolýza hippurátu Hydrolýza kaseinu Hydrolýza škrobu Hydrolýza želatiny Indol Kataláza King B médium (fluorescein) Koaguláza vázaná (clumping factor) Koaguláza volná KOH test Lecithináza (Egg-yolk agar) Leucin aminopeptidázový test (LAP) Test Metyl-červeňový test NEFERMtest 24 N OF test ONPG Oxidace glukonátu Oxidáza Pohyblivost Protein A Pyrrolidonyl arylaminázový test (PYR) Redukce nitrátů Rezistence k bacitracinu H Rezistence k methicilinu (oxacilinu) Rezistence k novobiocinu Rezistence k optochinu Rezistence k vankomycinu (enterokoky aminoglykosidy) Růst při různých teplotách Růst při 6,5 % NaCl Simmons citrát STAPHYtest 24 STREPTOtest 24 Triple Sugar Iron Agar (TSI) Urea Christensen Agar Utilizace acetamidu Utilizace malonátu Vibriostatické agens O/129 Voges-Proskauer test (acetoin) X a V faktor Žluč-eskulinový test IP 127.02 1/9
Česká sbírka mikroorganismů () SEZNAM KMENŮ identifikační testy Bakterie ŽD Bakterie ŽD Acinetobacter lwoffii 5581 Kytococcus sedentarius 2699 Aerococcus viridans 1914 Kytococcus sedentarius 2697 Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila 7232 Lactobacillus rhamnosus 1828 Bacillus cereus 2010 Myroides odoratus 3296 Bacillus coagulans 2013 Neisseria gonorrhoeae 4500 Bacillus subtilis subsp. subtilis 2216 Propionibacterium acnes 3343 Bacteroides fragilis 4712 Proteus hauseri 7011 Bacteroides thetaiotaomicron 4713 Proteus sp. 1799 Burkholderia sp. 3919 Pseudomonas aeruginosa 1960 Campylobacter jejuni subsp. jejuni 6214 Pseudomonas aeruginosa 3955 Clostridium perfringens 4435 Pseudomonas fluorescens 2115 Clostridium sordellii 4611 Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Enteritidis 4420 Cronobacter sakazakii 3461 Edwardsiella tarda 2238 Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Typhimurium 7205 Eggerthella lenta 4714 Enterobacter cloacae subsp. cloacae 1903 Serratia marcescens subsp. marcescens 303 Enterococcus cecorum 3659 Shigella flexneri 4422 303 Enterococcus faecalis 1875 Staphylococcus aureus subsp. aureus 3953 Enterococcus faecalis 4224 Staphylococcus aureus subsp. aureus 4223 Enterococcus faecalis 4647 Staphylococcus aureus subsp. aureus 4750 Enterococcus faecalis 7000 Staphylococcus epidermidis 2124 Enterococcus raffinosus 4216 Staphylococcus epidermidis 4418 Escherichia coli 3954 Staphylococcus gallinarum 3572 Escherichia coli 3988 Staphylococcus pseudintermedius 4710 Escherichia coli 4225 Staphylococcus lugdunensis 4069 Haemophilus haemoglobinophilus 6055 Staphylococcus nepalensis 7046 Haemophilus influenzae 4456 Staphylococcus saprophyticus subsp. 883 883 Haemophilus influenzae 4457 Saprophyticus Haemophilus influenzae 8432 Streptococcus agalactiae 6187 Haemophilus paraphrophilus 6051 Streptococcus constellatus subsp. Klebsiella pneumoniae subsp. 4985 constellatus 4043 pneumoniae Klebsiella pneumoniae subsp. 2318 Streptococcus pneumoniae 4501 pneumoniae Klebsiella pneumoniae subsp. 4415 Streptococcus pyogenes 7418 pneumoniae Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 5852 Streptococcus sanguinis 4047 Vibrio fluvialis 3689 *ŽD zaškrtnuté bakteriální kmeny dodáváme ve formě želatinových disků Použitá literatura Garcia, L.S. 2010. Clinical Microbiology Procedures Handbook. 3 rd edition. Vol. 1, Vol. 3. ASM Press, Washington, D.C. MacFaddin, J.F. 2000. Biochemical tests for identification of medical bacteria. 3 rd edition. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, USA. Murray, P., Baron, J.E., Pfaller, M.A., Tenover, F.C., Yolken, R.H. 1999. Manual of Clinical Microbiology. 7 th edition. ASM Press, Washington, D.C. IP 127.02 2/9
Česká sbírka mikroorganismů () Základní identifikační testy (bakteriologie) ANAEROtest 23 L. rhamnosus 1828 C. sordellii 4611 P. acnes 3343 ATB agardiluční metoda (anaeroby) ATB disková difůzní metoda CLSI ATB mikrodiluční metoda CLSI ATB EUCAST základní kontrola B. fragilis 4712 B. thetaiotaomicron 4713 C. perfringens 4435 E. lenta 4714 E. coli 3954 E. coli 4225 S. aureus 3953 P. aeruginosa 3955 E. faecalis 4224 H. influenzae 4456 H. influenzae 4457 N. gonorrhoeae 4500 S. pneumoniae 4501 E. coli 3954 E. coli 4225 P. aeruginosa 3955 S. aureus 4223 S.aureus 4750 E. faecalis 4224 E. faecalis 4647 H. influenzae 4456 H. influenzae S. pneumoniae 4457 4501 K. pneumoniae 4985 N. gonorrhoeae 4500 rozšířená kontrola E. coli 3954 E. coli 4225 P. aeruginosa 3955 K. pneumoniae 4985 S. aureus 4223 E. faecalis 4647 E. faecalis 4224 H. influenzae 4456 S. pneumoniae 4501 H. influenzae 8432 C. jejuni subsp. jejuni 6214 IP 127.02 3/9
Česká sbírka mikroorganismů () Beta-glukuronidáza CAMP test Deaminace fenylalaninu Dekarboxylace lysinu E. coli 4225 + K. pneumoniae 4985 - S. agalactiae 6187 + S. pyogenes S. pseudintermedius 7418 4710 - základní kmen pro test Proteus sp. 1799 + K. pneumoniae 4985 + E. cloacae 1903 - Dekarboxylace ornitinu; Arginin dihydroláza E. cloacae 1903 + K. pneumoniae 4985 - ENTEROtest 24 S. marcescens 303 Proteus sp. 1799 S. enterica 4420 E. cloacae 1903 ENTEROtest 24 N (inovovaný) E. coli 4225 Proteus sp. 1799 S. enterica 4420 E. cloacae 1903 K. pneumoniae 5852 E. tarda 2238 ENTERO-Rapid 24 E. cloacae 1903 E. coli 3988 Proteus sp. 1799 S. marcescens 303 IP 127.02 4/9
Česká sbírka mikroorganismů () E-test E. coli 3954 E. coli 4225 P. aeruginosa 3955 S. aureus 4223 E. faecalis 4224 E. faecalis 4647 H. influenzae 4456 H. influenzae 4457 N. gonorrhoeae 4500 S. pneumoniae 4501 Fosfatáza Hydrolýza acetamidu Hydrolýza eskulinu Hydrolýza hippurátu Hydrolýza kaseinu Hydrolýza škrobu Hydrolýza želatiny Indol S. saprophyticus 883 - P. aeruginosa 1960 + P. fluorescens 2115 - A. hydrophila 7232 + P. aeruginosa 3955 - S. agalactiae 6187 + S. pyogenes 7418 - B. subtilis 2216 + E. coli 4225 - B. subtilis 2216 + E. coli 4225 - P. aeruginosa 1960 + P. aeruginosa 3955 - IP 127.02 5/9
Česká sbírka mikroorganismů () Kataláza S. pyogenes 7418 - King B médium (fluorescein) P. aeruginosa 3955 + Koaguláza vázaná (clumping factor) S. epidermidis 2124 - Koaguláza volná KOH test S. epidermidis 2124 - E. coli 3988 + S. aureus 3953 - Lecithináza (Egg-yolk agar) B. cereus 2010 + Leucin aminopeptidázový test (LAP) E. faecalis 4224 + A. viridans 1914 - Metyl-červeňový test NEFERMtest 24 N K. pneumoniae 2318 - P. aeruginosa 1960 M. odoratus 3296 Burkholderia sp. 3919 C. sakazakii 3461 IP 127.02 6/9
Česká sbírka mikroorganismů () Médium Kontrolní kmeny Kontrola kvality OFtest Fermentace glukózy Oxidace glukózy K. pneumoniae 4415 + + P. aeruginosa 3955 - + A. lwoffii 5581 - - ONPG Oxidace glukonátu Oxidáza Pohyblivost Protein A Proteus sp. 1799 - P. aeruginosa 1960 + E. coli 4225 - P. aeruginosa 3955 + S. aureus 3953 - S. epidermidis 2124 - Pyrrolidonyl arylaminázový test (PYR) E. faecalis 7000 + S. agalactiae 6187 - Redukce nitrátů P. aeruginosa 3955 + A. lwoffii 5581 - Rezistence k bacitracinu H Vlastnost S. pyogenes 7418 citlivý H. influenzae 4457 rezistentní Rezistence k methicilinu (oxacilinu) Vlastnost S. aureus 4750 rezistentní S. aureus 4223 citlivý IP 127.02 7/9
Česká sbírka mikroorganismů () Rezistence k novobiocinu Rezistence k optochinu Vlastnost S. saprophyticus 883 rezistentní S. aureus 3953 citlivý Vlastnost S. pneumoniae 4501 rezistentní S. constellatus 4043 citlivý Rezistence k vankomycinu (enterokoky aminoglykosidy) E. faecalis E. faecalis 4224 4647 citlivý rezistentní Růst při různých teplotách Vlastnost B. coagulans 2013 růst při 56 C P. aeruginosa 1960 růst při 37 i 42 C P. fluorescens 2115 růst při 5 C Růst při 6,5 % NaCl Simmons citrát STAPHYtest 24 STREPTOtest 24 Růst E. faecalis 4224 + S. sanguinis 4047 - E. cloacae 1903 + S. epidermidis 4418 S. gallinarum 3572 S. lugdunensis 4069 S. nepalensis 7046 S. sciuri. 4657 K. sedentarius 2699 E. cecorum 3659 E. raffinosus 4216 S. sanguinis 4047 E. faecalis 1875 K. sedentarius 2699 IP 127.02 8/9
Česká sbírka mikroorganismů () Triple Sugar Iron Agar (TSI) Růst ŠA Vpich Plyn H 2 S * šikmý agar Urea Christensen Agar Utilizace acetamidu Utilizace malonátu + + + - S. enterica 4420 + - + + + S. flexneri 4422 + - + - - P. aeruginosa 3955 + - - - - Růst Barva - P. hauseri 7011 + + (červená) S. enterica 7205 + - P. aeruginosa 3955 + K. pneumoniae 4985 + Vibriostatické agens O/129 Vlastnost A. hydrophila 7232 rezistentní V. fluvialis 3689 citlivý Voges-Proskauer test (acetoin) K. pneumoniae 4415 + X a V faktor Žluč-eskulinový test Vlastnost H. haemoglobinophilus 6055 vyžaduje pouze X faktor H. paraphrophilus 6051 vyžaduje pouze V faktor Růst E. faecalis 4224 + S. sanguinis 4047 - Dotazy: bacteria@sci.muni.cz Objednávky: order@sci.muni.cz Brno 2/2018 IP 127.02 9/9