LEKCE 7. Interpretace 13 C NMR spekter. Využití 2D experimentů. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm

Podobné dokumenty
LEKCE 3b. Využití 2D experimentů k přiřazení složitější molekuly. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm

LEKCE 2b. NMR a chiralita, posunová činidla. Interpretace 13 C NMR spekter

LEKCE 2a. Interpretace 13 C NMR spekter. NMR a chiralita, posunová činidla. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova)

Základní parametry 1 H NMR spekter

Naše NMR spektrometry

LEKCE 1b. Základní parametry 1 H NMR spekter. Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

spinový rotační moment (moment hybnosti) kvantové číslo jaderného spinu I pro NMR - jádra s I 0

Měření a interpretace NMR spekter

ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie NMR. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

Postup při interpretaci NMR spekter neznámého vzorku

Seminář NMR. Mgr. Zdeněk Moravec, Ph.D.; Ústav chemie, PřF MU,

Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

12.NMR spektrometrie při analýze roztoků

Spektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský

Základní parametry 1 H NMR spekter

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

Základy NMR 2D spektroskopie

Program. Materiály ke studiu NMR. Data, Soubory. Seminář z Analytické chemie B. \\PYR\SCRATCH\

COSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční

O Minimální počet valencí potřebných ke spojení vícevazných atomů = (24 C + 3 O + 7 N 1) * 2 = 66 valencí

Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice. konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TOCSY

Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Měření a interpretace NMR spekter

Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Autor: martina urbanová, jiří brus. Základní experimentální postupy NMR spektroskopie pevného stavu

Měření a interpretace NMR spekter

NMR spektroskopie Instrumentální a strukturní analýza

Laboratoř NMR Strukturní analýza a 2D NMR spektra

Spektrální metody NMR I. opakování

Nukleární magnetická rezonance (NMR)

SPEKTROSKOPIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

Nukleární magnetická rezonance (NMR)

NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÁ REZONANCE

NMR spektroskopie. Úvod

Korelační spektroskopie jako základ multidimensionální NMR spektroskopie

Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů

Techniky měření a interpretace NMR spekter. Bohumil Dolenský VŠCHT Praha místnost A28 linka 4110

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti LC-NMR 1. Jan Sýkora

Dvourozměrná NMR spektroskopie metody

Strukturní analýza. NMR spektroskopie

Chemický posun v uhlíkových NMR spektrech

projekce spinu magnetické kvantové číslo jaderného spinu - M I

Vznik NMR signálu a jeho další osud.

Studium komplexace -cyklodextrinu s diclofenacem s využitím NMR spektroskopie

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

Emise vyvolaná působením fotonů nebo částic

Vznik NMR signálu a jeho další osud.

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Techniky přenosu polarizace cross -polarizace a spinová difuse

Analýza směsí, kvantitativní NMR spektroskopie a využití NMR spektroskopie ve forenzní analýze

Techniky měření a interpretace NMR spekter

Dolenský, VŠCHT Praha, pracovní verze 1

Autoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními prin

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Heteronukleární korelační experimenty

Základy Mössbauerovy spektroskopie. Libor Machala

doc. Ing. Richard Hrabal, CSc. Ing. Hana Dvořáková, CSc. RNDr. Jan Lang, PhD. Číslo dveří A 42, telefon 3805,

ZÁKLADY SPEKTROMETRIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE

Vznik NMR signálu a jeho další osud.

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

INTERPRETACE INFRAČERVENÝCH SPEKTER

NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÁ REZONANČNÍ SPEKTROMETRIE

Využití NMR spektroskopie pro studium biomakromolekul RCSB PDB

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

Interakce fluoroforu se solventem

Modulace a šum signálu

Úvod do fyziky tenkých vrstev a povrchů. Spektroskopie Augerových elektron (AES), elektronová mikrosonda, spektroskopie prahových potenciál

NMR spektroskopie rádiové frekvence jádra spinovou rezonancí jader spinový moment lichý počet

INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER

(9) X-X a X-Y korelace zvýšení spektrálního rozlišení

Nekovalentní interakce

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Nekovalentní interakce

jako modelové látky pro studium elektronických vlivů při katalytických hydrogenacích

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

02 Nevazebné interakce

Bruker Data Analysis

Přednášky z lékařské biofyziky Biofyzikální ústav Lékařské fakulty Masarykovy univerzity, Brno

Anizotropie fluorescence

Magnetická rezonance (3)

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

Procvičování uhlovodíky pracovní list

Magnetická rezonance (3)

Fotoelektronová spektroskopie Instrumentace. Katedra materiálů TU Liberec

Elektronová mikroanalýz Instrumentace. Metody charakterizace nanomateriálů II

Cestující do Prahy. Smlouva s Katedrou analytické chemie UPOL o úhradě cestovních výdajů (Denisa Vlčková nebo Ing. Petra Táborská)

Teorie chemické vazby a molekulární geometrie Molekulární geometrie VSEPR

RTG difraktometrie 1.

Nukleární magnetická rezonanční spektrometrie

CH 2 = CH 2 ethen systematický název propen CH 2 = CH CH 3 but-1-en CH 2 = CH CH 2 CH 3 but-2-en CH 3 CH = CH CH 3 buta-1,3-dien CH 2 = CH CH = CH 2

doc. Ing. Richard Hrabal, CSc. Ing. Hana Dvořáková, CSc. doc. RNDr. Jan Lang, PhD. Ing. Jan Prchal, Ph.D.

ATOMOVÁ FYZIKA JADERNÁ FYZIKA

NMR biomakromolekul RCSB PDB. Progr. NMR

NMR spektrometr. Interpretace NMR spektra

Transkript:

LEKCE 7 Interpretace 13 C MR spekter Využití 2D experimentů ppm 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 ppm Zpracování, výpočet a databáze MR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova)

Interpretace 13 C MR spekter rozsah chemických posunů: 0-300 ppm vzhledem k většímu rozsahu lépe rozlišitelné než 1 spektra chemické posuny závisí více na hybridizaci daného C (sp 3 < sp <sp 2 ) než na povaze sousedních skupin C=O v ketonech Aromatika, alkeny Alifatické C 3, C 2, C Alkyny C=O kyselin, aldehydů, esterů 210 150 100 80 50 0 TMS ppm

Interpretace 13 C MR spekter Přirozené zastoupení: 13 C: 1.11% ( 1 : 99.98%) Citlivost: 13 C, ( 1 ) 4 (13C) 1 je 64x citlivější jen z důvodu 1 je tedy 6400x citlivější, měření na více scanů interakce 13 C - 13 C nepozorovatelné (1:10000) interakce 1-13 C komplikují vzhled spektra užití dekaplinku (saturace, vyrovnání obsazenosti hladin) odstranění interakce s protony 90 detekce 13 C: t D1 1 : ozařování dekapling

Interpretace 13 C MR spekter - dekaplink 90 detekce 13 C: t D1 1 : ozařování dekapling Intenzity signálů v dekaplovaném spektru nejsou úměrné počtu odpovídajících jader C!!! vzhledem k OE dochází až na 200% navýšení intenzity signálu: OE = 1+ C během následných pulsů se spinový systém není schopen dostat do rovnováhy (T 1 relaxace) oba efekty se nejvíc projevují na nízké intenzitě kvartérních uhlíků

J interakce v 13 C 1 J interakce v 13 C 2 CCl 4 13 C spektrum 13 C spektrum počet čar v multipletu 2 n I +1 deuterované rozpouštědlo I = 1 CCl 3 CDCl 3 C 2 Cl 2 CD 2 Cl 2 C 3 Cl (CD 3 ) 2 SO

13 C spektra ( 1 dekaplink) nedekaplovaná: zachování multiplicity, ale značné snížení intenzity OC 3 C 3 C 3 dekaplovaná: odstranění interakce s protony, přehlednější spektrum, zvýšení intenzity signálů C 3 O O O

APT (attached proton test) Využívá přenosu polarizace přes 1 J(C,). Předpoklad: 1 J(C,) jsou podobné a hodnota t D je nastavena na 1 / J. Modulace amplitudy C 2 4 1 C 2,3 C C 3 1 J(C,) je závislá na hybridizaci: ethan ethylen acetylen 1 J(C,) [z] 124.9 156.4 249.0 hybridizace sp 3 sp 2 sp

13 C spektra dekaplovaná: odstranění interakce s protony, přehlednější spektrum, zvýšení intenzity signálů OC 3 J-modulovaná (APT): podle počtu připojených protonů pozitivní (C, C 2 ) nebo negativní (C, C 3 ) amplituda C, C 3 C, C 2 C 3 O O O

DEPT (Distortionles Enhancement by Polarization Transfer) Využití přenosu polarizace (předání polarizace citlivého jádra ( 1 ) méně citlivému ( 13 C)). Editace signálů dle posledního pulsu získáme separátní spektra pro primární (C 3 ), sekundární (C 2 ), a terciární (C) uhlíky. Měří se 3 experimenty pro různé hodnoty úhlu (45, 90, 135). 90 180 přenos polarizace 13 C: 1/2J 1/2J 90 180 1 : 1/2J { 1 }

DEPT - závislosti intenzit signálů na úhlu 1 pulsu 45 90 135 C C 2 C 3 orst Friebolin: Basic One- and Two-Dimensional MR Spectroscopy, Wiley VC, 2005

DEPT 13 C dec. C, C, C 2 a C 3 DEPT 45 C, C 2 a C 3 DEPT 90 C DEPT 135 C + C 3 C 2 orst Friebolin: Basic One- and Two-Dimensional MR Spectroscopy, Wiley VC, 2005

Možnosti zpracování spekter na VŠCT: Topspin (Bruker Biospin) Možnost instalace ve vaší laboratoři!!!

Mnova MR (dříve MestRe-C) K dispozici 45denní zkušební verze; plnohodnotná verze je zpoplatněná.

ACD/LABS ACD MR Processor: Možnost importu dat naměřených na VŠCT. Zpracování a analýza 1D a 2D spekter. a VŠCT je dostupná celoškolní licence MR Manager SUITE. Součástí tohoto balíčku jsou kromě 1D a 2D MR procesoru i prediktory C,,, F a P MR spekter a databáze. Instalační soubory pro celoškolní licenci ACD/Labs v. 12 naleznete po připojení k serveru \\habr\install\aplikace Možnost stažení akademické verze ze stránek výrobce: (http://www.acdlabs.com/resources/freeware/)

ACD MR Predictor: Rychlá a přesná předpověď 1, 13 C, 15, 19 F a 31 P MR spekter, chemických posunů a interakčních konstant. Výpočet 2D experimentů (COSY, ETCOR, TOCSY, MQC/MBC/SQC). ACD MR Manager: ACD MR DB: ACD V LABORATOŘI MR: MR Manager Suite Umožňuje import, zpracování a interpretaci 1D MR dat a tvorbu databází experimentálních dat. Databáze obsahuje množství struktur a chemických posunů. ( 1 : 202 200 struktur, 13 C: 191 900 struktur, 15 : 9 097 struktur, 19 F: 16 700 struktur, 31 P: 27 200 struktur.) Aldrich MR Library for ACD/Labs: Databáze obsahuje 35 164 1 a 13 C chemických stuktur.

Kompletní přiřazení signálů složitější molekuly 1 6 5 7 2 5 4 3 3 4 2 8 9 1 COSY: 1 1 korelace (přes 2-4 vazby) MQC: 1-13 C korelace (přes 1vazbu) MBC: 1-13 C ( 15 ) korelace (přes 2-4 vazby)

1 spektrum 8 2 5 4 3 2 1

COSY: 1 1 korelace (přes 2-4 vazby) ppm 2 8 1.0 1.5 2.0 5 2.5 4 3 2 1 3.0 3.5 4.0 4.5 Interpretace: diagonála - píky původního 1D spektra mimodiagonální píky (krospíky) indikují spin-spinovou interakci mezi jádry (J = 3-15 z) interpretace: od krospíku se vede horizontální a vertikální linie, průsečíky na diagonále určují pozici interagujících jader 5.0 5.5 6.0 6.5 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 ppm

APT (attached protone test) 2 8 5 4 3 2 1

MQC: 1-13 C korelace (přes 1vazbu) epřímá detekce: excitace 1, přenos polarizace na X jádro, detekce 1 zvýšení citlivosti jader s nízkým Experimenty MQC nebo SQC poskytují korelace jader 1 s X jádry ( 13 C, 15 ) přímo na ně vázanými, přenos magnetizace se děje tedy přes jedno vazebnou interakční konstantu J X. 1 J C 1 J C R C C C Ve spektrech se objeví pouze X jádra, která mají přímo vázaný atom 1. elze využít pro identifikaci kvarterních uhlíků!!!

MQC: 1-13 C korelace (přes 1vazbu) 2 8 5 4 3 2 1 Interpretace: asymetrické spektrum (na rozdíl od COSY) krospíky indikují přímé 1-13 C interakce interpretace: od krospíku se vede horizontální a vertikální linie, průsečíky na osách určují pozice interagujících jader

MBC: 1-13 C korelace (přes 2-4 vazby) Experiment MBC koreluje jádra 1 s jádry X ( 13 C, 15 ) přes dvě nebo tři vazby (interakce dalekého dosahu). Přenos magnetizace se děje přes tří/dvou vazebnou interakční konstantu J X. 3 J C 2 J C C C C a rozdíl od MQC můžeme identifikovat X jádra, které nemají přímo vázaný atom 1, např. kvarterních uhlíků. Ve spektru se objeví i interakce ostatních X jader s atomy 1 vzdálené o tři/dvě vazby. Využití při přiřazování aromatických systémů: 1 J(C,): 160 z 2 J(C,): -3.4 až 1.6 z Alifatické systémy: nejednoznačné výsledky vzhledem k většímu rozsahu interakčních konstant 2,3 J(C,) R 3 J(C,): 5.0 až 11.1 z 4 J(C,): -0.9 až -2.0 z

MBC: 1-13 C korelace (přes 2-4 vazby) ppm 20 2 8 30 40 50 60 5 4 3 2 1 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 9.0 8.5 8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 ppm Interpretace: nepřímá detekce asymetrické spektrum krospíky indikují interakce 1-13 C přes 2 a 3 vazby (4 vazby) krospíky také s kvarterními uhlíky!!!! od krospíku se vede horizontální a vertikální linie, průsečíky na osách určují pozici interagujících jader někdy nejsou dokonale potlačeny krospíky jednovazebné interakce 1 J(,C)

MBC: 1-13 C korelace (přes 2-4 vazby) ppm 120 125 O 130 135 2 6 5 8 140 4 145 C 3 O 1 150 O O 155 3 C C 3 160 8.6 8.4 8.2 8.0 7.8 7.6 7.4 7.2 7.0 6.8 6.6 6.4 6.2 6.0 ppm

MBC: 1-13 C korelace (přes 2-4 vazby) ppm 120 125 O 130 135 140 145 150 2 6 C 3 O O 5 4 O 1 8 155 3 C C 3 160 8.6 8.4 8.2 8.0 7.8 7.6 7.4 7.2 7.0 6.8 6.6 6.4 6.2 6.0 ppm

MR dusíku jádro spin (I) el. quadrupol. moment (eq) přiroz. zast. (%) relat. citlivost 14 1 1.67 x 10-2 99.63 1.01 x 10-3 15 1/2-0.37 1.04 x 10-3 1 1/2-99.99 1.00 2 1 2.87 x 10-3 0.015 9.65 x 10-3 13 C 1/2-1.11 1.59 x 10-2 quadrupoly: jádra s I 1, distribuce náboje není sférická, čím vyšší eq, tím rychlejší relaxace, tím širší čáry, neprojeví se interakce počet spinových stavů (2I+1) quadrupolu 2 a 14 je 3: CDCl 3 v 13 C MR 1:1:1, 4+ v 1 spektru 1:1:1 14 není použitelný pro určování struktury, využitelný pro studium symetrie, mobility a vazebných interakcí 15 vhodný pro určování struktury, ale málo citlivý

1-15 MBC 1-15 MBC koreluje jádra 1 s jádry 15 přes dvě nebo tři vazby. Přenos magnetizace se děje přes tří/dvou vazebnou interakční konstantu J. epřímá detekce: excitace 1, přenos polarizace na 15, detekce 1 - zvýšení citlivosti jader s nízkým.

Ph 1 7 1-15 MBC 3 9 Ph ipr 3 9-9 -9-9 -9-7 -3-7 -1-1 8 C 2 Me 2 8 C 2 Me 2

MBC k rozlišení 7 a 9 izomerů purinových bazí 2, 8 -C 3 2 6 Cl 5 4 C 3 7 8 9 nebo Cl 6 2 7 5 8 4 9 C 3

MBC k rozlišení 7 a 9 izomerů purinových bazí 2, 8 -C 3 2 6 Cl 5 4 C 3 7 8 9 nebo Cl 6 2 7 5 8 4 9 C 3