Fragment Analyzer UNIKÁTNÍ KAPILÁROVÝ FRAGMENTAČNÍ ANALYZÁTOR VÝBORNÉ VÝSLEDKY UNIKÁTNÍ VLASTNOSTI

Transkript

1 Fragment Analyzer UNIKÁTNÍ KAPILÁROVÝ FRAGMENTAČNÍ ANALYZÁTOR VÝBORNÉ VÝSLEDKY UNIKÁTNÍ VLASTNOSTI

2 Výborný přístroj, výborné výsledky Fragmentační analyzátor je automatizovaný kapilárový systém s CE značkou a byl navržen pro flexibilní práci poskytující řešení široké škále velikostí a koncentrací DNA/RNA. Různé gelové soupravy jsou použitelné s tou stejnou sadou kapilár. Systém využívá multikanálovou paralelní fluorescenční detekci pro zpracování dsdna fragmentů, gdna, vzorků pro Next Genaration Sequencing (NGS), plasmidů a kompletní nebo messenger RNA Unikátní vlastnosti Použití ve formátu s 12 nebo 96 kapilárami přímé paralelní vstřikování a separace 12 nebo 96 vzorků najednou Možnost vložení až 3 x 96 jamkových destiček společně pro zvýšení kapacity při méně uživatelských zásazích Možnost vložení dvou typů pufrů společně =) žádný čekací čas mezi jednotlivými metodami kvůli výměně pufrů Schopnost flexibilního zpracovávat kvalitativní i kvantitativní výsledky společně Široké spektrum aplikací pro různé druhy uživatelů Nový jednoduše ovladatelný analytický software PROSize 2.0 Malé rozměry: 61 cm (výška) x 38 cm (šířka) x 51 cm (hloubka) Hmotnost: 38,5 kg Výhody kapilárního systému: Systém je plně automatizován, kapiláry jsou automaticky plněny gelem, stejně jako vzorky jsou automaticky nasávány do kapiláry. Kapiláry nevyžadují žádnou denní údržbu, zůstávají stale ve stroji Kapilára lze být opakovaně použita pro nejméně 1,000 běhů Konsistentní výsledky Vysoké rozlišení Nízká spotřeba vzorku a rychlé výsledky Digitalizovaná výstupní data Vysoká kapacita a efektivita Úspora času díky co nejvyšší eliminaci manuálních kroků Vysoká reprodukovatelnost, citlivost a specificita Sample Tray Capillaries High Voltage Power Supply Sestava kapilár Fluorescence Excitation Detection Window CCD Detector Capillaries Outlet Outlet

3 Redukce manualních kroků a času potřebného k přípravě analýzy Pro vzorky použit 96 jamkový formát destičky možnost pipetování multikanálovou pipetou Jednokroková příprava gelu/pufru Reagencie stabilní ve stroji až 14 dní Potřeba pouze 2 µl vzorku Stejný proces zpracování pro všechny druhy analýz Krátké 15 min pro <3,000 bp. Rychlá separace 12 vzorků nebo celého 96 jamkového cyklu. Získejte vice výsledků za méně času! Žádný čekací čas mezi jednotlivými běhy, vzorky jsou zpracovávány v oddělných 12/96 kapilárách zároveň Celá destička pro Next Generation sequencing může být zpracována do 60 minut Do přístroje mohou být vkládány různé typy vzorků zároveň a navíc i v době, kdy stroj pracuje Instrument je stale připraven k práci Nízké náklady na vzorek Nižší provozní náklady ve srovnání s agarózovými/akrylamidovými gely a jinými analytickými prostředky Zobrazení dat v reálném čase Vidíte výsledky, jak byly vygenerovány, možnost změny podmínek během zpracování, kdykoliv potřebujete Kvalitativní analýza (DNF 900 až DNF 930) dostupné kity pro zpracování vzorků o velikosti bp nebo 35 1,500 bp nebo 35 5,000 bp nebo 75 15,000 nebo 75 20,000 bp (rozlišení 2-3bp). Pro detekci mutací dostupné dva typy kitů pro fragment do 1000 bp a od 1000 bp do 3000 bp. Detekce SSR s velkou jistotou Rozlišení až na 2 bp. DNF-900 Gel: Separace prokázala rozlišení 113 bp, 115 bp a 122 bp DNA fragmentů. 910 kit: Lepší rozlišení blíže menším fragmentům (př. Odlišení primerových dimerů) 920 kit: Lepší rozlišení větších fragmentů bp Kvantitativní analýza (DNF 479 až DNF 493) senzitivita až 5 pg/µl Kity standardní sensitivity a vysoké sensitivity pro NGS do velikosti bp Kity standardní sensitivity a vysoké sensitivity pro zpracování dlouhých fragmentů až bp Kity standardní sensitivity a vysoké sensitivity pro zpracování RNA Kity standardní sensitivity a vysoké sensitivity pro analýzu genomové DNA

4 Uživatelsky nenáročný software pro zpracování dat Pro konečnou analýzu je využíván uživaletelsky velmi jednoduchý PROSize 2.0 Analytical Software. Software pro analýzu dat PROSize je navržen pro zjednodušení identifikace fragmentů, automatizování rutinního vyhodnocování a podávání zpráv. Flexibilní zobrazení dat Data mohou být zobrazena v elektroforetogramu nebo může být gel digitálně zobrazen pro jakoukoliv kombinaci řádků, sloupců nebo individuálních vzorků. Možný výběr šablon pro zobrazení jednotlivých jamek nebo jejich překryvů a funkce individuálního nastavení kontrastu, zobrazení/skrytí markerů, zoom/autoscale a kopírování do jiné aplikace. Scoring a výstupy Tvořte, ukládejte a importujte kritéria scoringových analýz nebo kritéria smear analýz. Výsledky jsou zobrazeny ihned v tabulce analýzy hledaného znaku nebo smear analýz. Výsledky mohou být exportovány přímo z tabulky pomocí myši nebo exportovány do Excelu nebo PDF. Standardní workflow: Smíchat 2 µl vzorku + 22 µl ředícího roztoku Vložit destičku do stroje Naplnit automaticky kapiláry Automatická separace fragmentů Kvalitativní nebo kvantitativní analýza

5 Možné aplikace 1. Zpracování DNA fragmentů Umožňuje zpracování široké škály velikostí fragmentů Kvalitativní markery dodávány s kity, možnost využití i vlastních markerů Velmi rychlá separace fragmenty do 15 minut 2. Zpracování fragmentů pro Next generation sequencing Možnost využití specifických gelů pro každou sadu velikostí fragmentů Kapiláry jsou po každém vzorku, proplachovány nedochází k efektu přenosu zbytku vzorku do dalšího vzorku Rychlá separace: Rodič 1, Rodič 2 a Hetero SSR vzorky. Fragmenty DNA o velikostech 313 bp a 423 bp odpovídající < 10% chyba. Vnější peaky reprezentují 200 bp/700 bp markery. Čas migrace pro 700 bp vysoký marker byl 13 min. 3. RNA aplikace K dispozici kity pro vysoko i nízko koncentrované vzorky Použití pouze 2 µ vzorku pro přesnou kvantifikaci Ve výsledku vidět přesně RQN (RNA Quality number), možná kontrola degradace vzorku, porovnání korelace RIN. Tři hlavní cíle: 1) plocha před 18s 2) kompletní plocha 18s a 28s peaku 3) poměr 28s ku 18s peaku Barevně vyznačené plochy obou peaků 4. Detekce mutací Automatizovaná detekce heteroduplexů Velikost fragmentů 35-5,000 bp Dostupné dva typy kitů pro fragment do 1000 bp a od 1000 bp do 3000 bp Velmi efektivní zařízení pro vyhledávání indukovaných nebo wild mutací - metoda tillingu zejména ve velkém množství vzorků Směsná DNA (ekvivalent 8 diploidních organismů), amplifikovaná, štěpená a oddělená. Neštěpený fragment je 632 bp; štěpené fragmenty jsou 415 bp a 217 bp.

6 5. Genomová DNA Jediný přístroj, který je schopen separovat fragmenty obrovských rozměrů, provádět kvalitativní i kvantitativní analýzu společně Generováno číslo GQN (genomic quality number) Nastavitelný treshold (1-10 scale) 6. Plasmidová DNA Separace plasmidových forem (lineárnní, kruhové, supercoiled) Překryvové zobrazení různých forem plasmidů B1: Supercoiled 6000bp Plasmid DNA; B3: otevřený cirkulární 6000bp Plasmid DNA; B5: Linearizovaný 6000bp Plasmid DNA; B7: Genomic DNA; B12: Supercoiled DNA marker Výhradní distributor Technické parametry Maximální počet zpracovávaných vzorků: závisí na typu, buď 12 nebo 96 vzorků Maximální bezobslužná kapacita vzorků: až 288 vzorků; nelimitováno robotickým ramenem Minimální objem vzorku: 20 μl tekutiny pro vstřikování; požadováno nejméně 1 μl vzorku Rozsah velikosti gelů: bp; 35-1,500 bp; 75-15,000 bp; 75-20,000 bp Dostupné soupravy: NGS analýza fragmentu, genomové DNA, celkové RNA, mrna a TILLiNG Rozlišení: závisí na typu gelu; nízká 2 bp Přesnost: obvykle 5% nebo lepší Detekce citlivosti: nízká 5 pg/μl; 100pg/μL stěr Světelný zdroj: 1,000 mw LED, 470 nm excitační vlnová délka Detektor: vysoká citlivost CCD; nm emisní vlnová délka Software: kontrola přístroje Fragment Analyzer, analýza dat PROSize Formát exportovaných dat: Microsoft Excel, možnost binárního výstupu Podmínky prostředí: pro použití uvnitř, v normálním laboratorním prostředí C Rozmezí relativní vlhkosti: < 80% (nekondenzující) Napájení: VAC; Hz; 15 A (k dispozici i alternativní konfigurace) Rozměry přístroje: plně nakonfigurován 61 cm h x 38 cm š x 51 cm d (24 x 14 x 20 in) Váha přístroje: 38,5 kg (85 lbs) Výrobce BioVendor Laboratorní medicína a.s., Karásek 1767/1, Brno Tel.: , Fax: , info@biovendor.cz, Bruker Daltonik GmbH, Bremen, Germany, Tel.: +49 (0) , Fax. +49 (0) sales@bdal.de,