Dokumentace biologických objektů

Transkript

1 Dokumentace biologických objektů Slovní popis Schéma Kresba Fotografie (mikro-) Videozáznam potřeba zaznamenat pozorování Schematické samčí pohlavní orgány druhu Ptecticus kerteszi Schwarze Mückenlarve, Lebendpräparat ohne Deckglas, Dunkelfeld, Objektiv Plan Fl 4x, Leitz / Leica Vario-Okular 5x, Olympus Camedia C-7070, Olympus Elektronenblitz FL-36, Magdaléna Chumchalová

2 Slovní popis Slovní popis, používá se v anatomických a morfologických studiích, při tvorbě určovacích klíčů, atd. Samotný popis je často doplněn i zjištěnými rozměry buněk, organel, tkání či orgánů. Slovní popis ale nemůže postihnout všechny pozorované detaily, navíc výklad některých slov (především přídavných jmen a příslovcí) je velmi subjektivní. Proto je i slovní popis doplněn schématem, kresbou nebo fotografií.

3 Schéma Schéma je zjednodušený nákres pozorovaného objektu, přičemž nám jde o přibližné dodržení relativních poměrů velikostí zachycených částí A schematic drawing of a section through the human eye, with an enlarged schematic of the lens to the right.

4 Kresba Kresba je co nejvěrnější zachycení obrazu sledovaného objektu pomocí tužky (nebo tuše), přičemž zachováváme nejen relativní poměry velikostí, ale i vzájemnou polohu jednotlivých buněk (kreslíme konkrétní buňku nebo orgán, zasazené do jejich okolí). Má výhodu proostřování během kreslení a nezachycuje rušivé optické vjemy z jiných rovin ostrosti výhoda - pro věrné zachycení musí studovaný objekt opravdu důkladně prohlédnout, přičemž si často všimne podstatných detailů. Nevýhodou je subjektivita, potřeba určité kreslířské zručnosti a časová náročnost

5 Fotografie Nejobjektivnějším a nejvěrnějším zachycením obrazu v mikroskopu. Větší nároky na seřízení a čistotu optiky a kvalitu osvětlení. Nevýhoda - zachycení obrazu pouze v jedné rovině ostrosti a menší ilustrativnost oproti kresbě(nevyzvedává ani nepotlačuje některé detaily). Dokumentace pomocí videokamery obraz převeden do podoby patternu elektrických nábojů, které jsou buď následně čteny analogovým systémem, nebo jsou převedeny do digitální podoby - počítačové zpracování (analýzu obrazu) - riziko zkreslení informace. Dactylogyrus folkmanovae Asymphylodora markewitschi

6 Kresba Zásady: - nákres ne menší než 8 cm - obrysy obyčejnou tužkou (č.2) tenkou čárou, kterou potom ještě jednou obtáhneme, zvýrazníme a vyrovnáme - barevné tužky používáme výjimečně - nestínujeme, nešrafujeme - kreslíme vybrané místo (ne vše!) (např. jednu buňku z populace buněk nebo vybranou část tenkého řezu) - nutná správná poměrná velikost Popis kresby: - název obrázku - popis struktur v obrázku - údaj o zvětšení Výhody kresleného obrazu: - objekt je zobrazen plastičtěji bez nepodstatných struktur, artefaktů a jiných nečistot v preparátu. Kreslení biologických objektů nevyžaduje kreslířský talent, jen vůli, trpělivost a čas.

7 Jak a čím kreslíme? Zobrazování mikroskopických objektů kreslení z volné ruky záleží na zručnosti pomocí okuláru s čtvercovou sítí pro snadnější zachycení velikostních poměrů pomocí kreslícího zařízení (Abbeův kreslící přístroj, projekční zrcátko viz dále) Kreslící zařízení promítá obraz viděný v mikroskopu na pracovní desku vedle mikroskopu. V okuláru vidíme současně obraz objektu i obraz tužky. Kreslíme ostrou tužkou na papír, položený vedle mikroskopu. Kreslící zařízení umožňuje přesné a detailní kreslení při velkém zvětšení. kreslení z mikrofotografie

8 Kreslení z volné ruky Jedním okem do mikroskopu, druhým na papír. Papír na kreslení přidržíme lepicí páskou. Kresbu tužkou kopírujeme na pauzovací papír a vytahujeme tuší. Perokresbu můžeme lavírovat různě ředěnou tuší ("sépiové kresby"), stínovat tečkováním, příp. kolorovat barvami. Nevýhody: Neznáme přesné zvětšení obrazu. Obtížné dodržování proporcí ve vědecké práci nutné doplnění kresby o mikrofotografi. Kreslení z mikrofotografie zhotovení digitální mikrofotografie zvětšení na vhodnou velikost překreslení sledovaných struktur přes prosvěcovací zařízení na papír nevýhoda nemožnost proostřování, zachycena pouze jedna rovina dokreslení struktur kreslením z volné ruky

9 kreslete vždy tužkou na nelinkovaný papír velikosti A4 obrázek kreslete velký přes 1/2 až 2/3 stránky (je přehlednější a opět, kdybyste ho potřebovali převést do počítače, nerovnou čáru nakreslenou roztřesenou rukou lze vyhladit zmenšením obrázku, přehledně nakreslený detail vypadá dobře i po zmenšení) začněte rozvržením proporcí obrázku (buňky, části tkáně) v podobě lešení ze slabých čar vlastní obrázek kreslete plynulou čarou. Názory na stínování se různí, omezte ho na nezbytné minimum a použijte ho tam, kde pomůže k orientaci v obrázku každý obrázek by měl mít v záhlaví informaci, o jaký objekt jde (české a latinské druhové jméno), o jaký typ preparátu (příčný či podélný řez, roztlak, barveno čím), o jaký orgán jde, při jakém zvětšení byl obrázek pořizován, důležitá je úsečka s měřítkem. U dokumentace svých vzorků nezapomeňte na číslo vzorku, datum sběru a název lokality

10 Kreslení pomocí kreslícího zařízení Přesné kreslení - dodržení správných proporcí jednotlivých detailů i celkového tvaru objektu Přesné měřítko Prokreslení detailů Optický přístroj, který promítá do oka současně mikroskopický obraz a papír s kreslící rukou. Abbeův kreslicí přístroj 1883 Pro monokulární tubus mikroskopu

11 Abbeův kreslící přístroj a jeho modifikace zrcátko oko zrcátko hranoly okulár Zde se nasazuje na tubus mikroskopu Zde se nasazuje na tubus mikroskopu ostření tužky zrcátko preparát Základem Abbeova kreslícího přístroje jsou dva skleněné hranoly slepené do tvaru krychle (1). Jejich plocha je postříbřená, jen uprostřed je malý kulatý průzor bez stříbrného povlaku. Paprsky odražené od papíru dopadají na zrcátko, které je vrhá na postříbřenou plochu krychle, odtud se odrážejí kolmo vzhůru do oka. Nepostříbřeným okénkem přicházejí do oka současně paprsky z preparátu. PAPÍR 1 hranoly s okénkem 2 preparátová clona 3 clona regulující osvětlení papíru 4 okulár 5 zrcátko 6 papír 7 chod paprsků z mikroskopu Pohled zespodu

12 Popis funkčnosti zrcátkového kreslícího zařízení Upevňujeme ho na tubus mikroskopu. Těsně nad okulárem je odklopné pouzdro se dvěma hranoly, které jsou spolu slepeny do krychle. Jejich styčná plocha je postříbřena až na malý kruhový prostor uprostřed. Na delším rameni je připevněné zrcátko. Je otočné kolem vodorovné osy a má být skloněno v úhlu 45. Pod zrcátko dáme na stůl nebo na vhodnou podložku papír, na který budeme kreslit. Paprsky, které přicházejí z papíru jsou zrcátkem odraženy na postříbřenou styčnou plochu hranolů a odtud do oka. Současně procházejí paprsky z mikroskopu okénkem do oka a vidíme tak současně pozorovaný objekt a papír s tužkou. Obraz v mikroskopu i papír musí být přibližně stejně osvětlený, jinak vidíme špatně buď tužku (moc světla v mikroskopu) nebo preparát (moc světla na papíře). Vyzkoušíme tak, že položíme tužku špičkou na papír. Pokud je objekt na preparátu příliš velký, kreslíme na několikrát a části slepujeme. Překreslíme na pauzovací papír, vhodně zmenšíme. Nezapomeneme přikreslit i měřítko (preparát nahradíme mikrometrobjektivem a při stejném zvětšení okuláru i objektivu zakreslíme linky měřítka - např. 0.2 mm, 0.5 mm atd.) oko preparát okulár zrcátko PAPÍR.

13 Kreslící zařízení Studené světlo

14 Kresbu z papíru překreslujeme buď tuší na pauzovací papír, oskenujeme a dále upravíme pomocí grafických programů (Photoshop, Corel Draw) nebo překreslujeme na tabletu Adobe Ilustrátor, lepší software pro kreslení vektorové kreslení (hladké čáry) Možnosti grafické úpravy s sebou nesou ale i riziko zkreslení informace, čehož by si měl být badatel vždy vědom (upravené obrázky přestávají být objektivním a věrným zachycením mikroskopického obrazu).

15 Kreslení vlastních preparátů Kreslíte nebarvený preparát podle vlastního výběru Při zvětšení 40x Možnost zařadit fázový kontrast Po nakreslení vložíme do mikroskopu mikrometrobjektiv a nakreslíme měřítko podle velikosti objektu. Protokol: kresbu dokončíte měřítko zakreslíte úsečkou nepřerušovanou jednotlivými dílky, nahoru napíšete co jste kreslili při jakém zvětšení