PLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ
|
|
- Simona Musilová
- před 9 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 PLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ DALIBOR HÚSKA a, VOJTĚCH ADAM a,b, PETR BABULA c a RENÉ KIZEK a a Ústav chemie a biochemie, b Ústav výživy zvířat a pícninářství, Agronomická fakulta, Mendelova zemědělská a lesnická univerzita, Zemědělská 1, Brno, c Ústav přírodních léčiv, Farmaceutická fakulta, Veterinární a farmaceutická univerzita v Brně, Palackého 1-3, Brno kizek@sci.muni.cz Úvod Lidstvo na počátku 21. století řeší závažnou otázku spojenou se změnami klimatu a s tím souvisejícími závažnými globálními následky 1. Organizace spojených národů na svém zasedání panelu věnovanému klimatické změně vyhlásilo jednoznačnou účast antropogenní činnosti (Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC), Fourth Assessment Report, 2007) 2. Většina vlád světa panel klimatické změny přijala a zahájila programy směřující ke snížení emisí především skleníkových plynů. Nejvýznamnější roli v této oblasti mohou sehrát především programy trvalé udržitelnosti ve všech lidských činnostech. Do této oblasti je možné zařadit technologie využívající zelených rostlin pro zajištění výživy, zdraví anebo ochrany prostředí. Bylo zjištěno, že rostliny jsou schopné z prostředí přijímat různé sloučeniny (organické i anorganické) v nezanedbatelných koncentracích a ty ukládat nebo přeměňovat. Rostliny vykazující takové vlastnosti byly označeny jako hyperakumulátory a staly se základním kamenem v technologických procesech označených jako fytoremediace 3. Většina takových rostlin však nevykazuje rychlý vzestup biomasy, ale je možné z těchto rostlin vyhledávat vhodné úseky DNA (geny) pro zavedení takových vlastností do rostlin kulturních 4. Kulturní rostliny se vyznačují rychlým růstem biomasy a především s velmi dobře zvládnutou agrotechnikou. Kontaminované rostliny jsou následně uloženy na zabezpečených skládkách 5. Nyní díky klimatické změně však mohou rostliny nastoupit jako technologie získávající průmyslově využitelné suroviny z prostředí za relativně nízkých energetických vstupů. V dohledné době se tak hyperakumulátory a geneticky upravené rostliny se značnou hyperakumulační schopností mohou stát zelenými horníky při získávání zlata, stříbra, železa a dalších klíčových prvků z půd s jejich zvýšenými obsahy. Takové technologie budou vyžadovat řadu molekulárně-biologických úprav v genomech rostlin. Bude nezbytné jednotlivé geny nalézt, izolovat a následně také velmi pečlivě monitorovat. Exprese vnesených genů je sledována na úrovni mrna nebo výsledného proteinového produktu. Nejběžnější je sledování hladiny mrna většinou pomocí technik využívající polymerázové řetězové reakce (PCR, nebo real time-pcr). Proto, abychom byli schopni takové detekce, je potřebné izolovat dostatečné množství nedegradované celkové mrna s minimální kontaminací nežádoucími nukleovými kyselinami. Cílem této práce bylo navrhnout plně automatizovanou izolaci celkové mrna pomocí magnetizovatelných mikročástic z in vitro kultivovaných rostlin ve spojení s elektrochemickou detekcí na uhlíkových nanočásticích a na tištěných elektrodách. Experimentální část Chemikálie Jednotlivé koncentrace poly(a) byly míchány ze zásobního roztoku o koncentraci 100 µm připraveného z lyofilizované poly(a) (0,5 mg ml 1 ) Mr = (Sigma- Aldrich, Česká republika). Oligonukleotidy byly syntetizovány společností Sigma-Aldrich a purifikovány pomocí HPLC. Koncentrace zásobních roztoků byla stanovena spektrofotometricky při vlnové délce 260 nm na přístroji Spekord 210 (Analytic Jena, Německo). Pufry použité pro experimenty a) fosfátový pufr: 0,1 M-NaCl + 50 mm-na 2 HPO 4 + NaH 2 PO 4 a 0,2 M-NaCl mm-na 2 HPO 4 + NaH 2 PO 4 ; b) acetátový pufr: 0,2 M-CH 3 COOH + 0,2 M-CH 3 COONa. Ostatní použité chemikálie byly získány v čistotě ACS od společnosti Sigma. Magnetické mikročástice Byly zakoupeny od společnosti INVITROGENE (Norsko). Povrch těchto mikročástic je upraven navázáním oligonukleotidové sekvence (dt)25. Velikost částic se pohybuje kolem 2,80 ± 0,2 µm. Další magnetické mikročástice byly zakoupeny od firmy ROCHE (Německo). O modifikaci povrchu mikročástic není nic známo s ohledem na patentovou ochranu společnosti ROCHE. Tištěné elektrody Byly vyrobeny na Ústavu mikroelektroniky Vysokého učení technického v Brně technikou sítotisku. Pracovní elektroda byla uhlíková, referentní stříbrná (Ag/AgCl) a pomocná uhlíková. Na pracovišti Fyzikální elektroniky MU byly na povrch tištěných elektrod naneseny uhlíkové nanotrubice. Takové elektrody byly použity jako pracovní. Uhlíkové nanotrubice byly syntetizovány v mikroplasmě ve směsi s167
2 argonu, vodíku a methanu. Železo a nikl byl použit jako katalyzátor. Teplota depozice byla kolem 970 K (cit. 6 ). Eliminační voltametrie Metoda EVLS (eliminační voltametrie s lineárním skenem) byla uskutečněna pomocí programu EVLS z LSV (voltametrie s lineárním skenem) záznamů při různých rychlostech polarizace. Získané EVLS záznamy byly hodnoceny dle cit. 8. In vitro kultivace rostlin Obilky kukuřice odrůdy Gila byly sterilizovány v roztoku 5% chlornanu sodného v prostředí sterilního flow-boxu. Poté byly omyty v destilované vodě. Následně byla každá takto připravená obilka umístěna do připravené skleněné zkumavky s médiem. Kultivační médium bylo připraveno podle postupu a složením uvedeného Murashigem a Skoogem 7 s přídavkem pevné složky, kterou tvořil gerlit. Do média byly přidány koncentrace kademnatých iontů v podobě komplexu s EDTA v koncentracích (0, 5, 10, 25, 50 a 100 µm). Takto připravené experimentální rostliny byly umístěny do kultivačního boxu (Sanyo) s 14 h osvětlením 80 luxů, teplotou vzduchu 22 C a 60% vlhkostí vzduchu a 10 h tmy s teplotou vzduchu 18 C a 60% vlhkostí. Všechny experimenty byly uskutečněny ve třech nezávislých opakováních. Použité chemikálie byly testovány pro explantátové kultury a byly zakoupeny od společnosti Duchefa (Nizozemí). Měření fluorescence chlorofylu Měření fluorescence chlorofylu bylo provedeno zařízením vyrobeným na Ústavu mikroelektroniky Vysokého učení technického v Brně. Pás světelných diod o vlnové délce 560 nm osvětluje terčík listu rostliny o ploše 50 mm 2. Poté je detegován signál fluorescence chlorofylu. Získaný signál je zaznamenáván do PC pomocí řídícího a vyhodnocovacího programu. Elektrochemická analýza na rtuťové elektrodě Elektrochemické stanovení s visící rtuťovou kapkovou elektrodou (HMDE; s plochou kapky 0,4 mm 2 ) jako pracovní elektrodou bylo provedeno pomocí přístroje AU- TOLAB analyzátor (EcoChemie, Holandsko), který byl napojený na VA-Stand 663 (Metrohm, Švýcarsko). Byla používána pracovní cela s tříelektrodovým zapojením. Referentní elektroda byla Ag/AgCl/3M KCl a pomocná elektroda byla uhlíková tyčinka. Základní elektrolyt acetátový pufr (ph 5,0). LSV parametry: počátek analýzy: 0 V, konec analýzy: 1,65 V, step potenciál: 5 mv, rychlost polarizace: 25, 50, 100, 200, 300, 400, 500 a 600 mv s 1. Elektrochemická analýza na uhlíkové elektrodě Elektrochemická analýza na uhlíkové pracovní elektrodě byla provedena na přístroji CH Instruments (USA), který byl tříelektrodově zapojen: referentní elektroda byla Ag/AgCl/3M KCl, pomocná elektroda byla uhlíková tyčinka a pracovní pastová uhlíková elektroda. Základní elektrolyt acetátový pufr (ph 5,0). SWV (square wave voltametrie parametry): počátek analýzy: 0 V, konec analýzy: 1,5 V, frekvence 120 Hz, step potenciál: 5 mv. Elektrochemická analýza na tištěných elektrodách Elektrochemické měření pomocí tištěných elektrod (SPE, Screen Printed Electrodes) bylo provedeno na přístroji PalmSens (Holandsko) při aplikaci multikanálové analýzy. Pro všechny elektrochemické analýzy byl používán jako základní elektrolyt acetátový pufr ph 5. SWV parametry: počátek analýzy: 0 V, konec analýzy: 1,5 V, frekvence 50 Hz, step potenciál: 5 mv. Postup izolace Izolace poly(a) byla prováděna pomocí paramagnetických částic Dynabeads Oligo (dt)25 od firmy Dynal (Oslo, Norsko). Zachycení nukleových kyselin (polya, ODN, mrna) na paramagnetické částice spočívá v hybridizaci mezi řetězcem adeninu, kterým je tvořena poly(a) a řetězcem thyminů, který je ukotven na povrchu paramagnetických částic. Paramagnetické částice byly přitahovány pomocí magnetického stojanu MPC S (Magnetic Particle Concentrator), který byl vyroben firmou Dynal Biotech ASA (Oslo, Norsko). Všechny experimenty s paramagnetickými částicemi byly prováděny za sterilních podmínek, které zajišťoval RNA/DNA UV cleaner box UVT-S-AR (Biosan, Litva). Pro centrifugaci a třepání vzorků byla využita centrifuga multi-spin MSC-3000 (Biosan), která byla umístěna v RNA/DNA UV cleaner box UVT-S-AR. Proces denaturace probíhal za konstantní teploty 85 C za využití Thermomixer 5355 Comfort/ Compact (Eppendorf, Německo). Plně automatická izolace technikou epmotions Plně automatizovaná analýza byla provedena na pipetovacím robotu epmotion 5075 (Eppendofr, Německo). Na pozici B4 je umístěn magnetický separátor (Promega). Pozice C1 a C4 jsou termostatovatelné (Epthermoadapter PCR96). Přenos zabezpečuje robotické rameno s pipetovacími nástavci (TS50, TS300, TS1000) a přemisťovacího gripperu (TG-T). Vzorky jsou umístěny v pozici B3 v adaptéru Ep0.5/1.5/2ml. V pozici B1 je umístěn Module Reservoir, kde jsou k dispozici promývací roztoky a odpad. Zařízení je ovládáno mikroprocesorem a editace programové sekvence byla provedena v epeditoru 4.0. Špičky jsou umístěny v pozicích A4 (eptips 50), A3 (eptips 300) a A2 (eptips 1000). Jako pracovní jednotky byly používány PCR 96 destičky. s168
3 A T Chem. Listy 103, s167 s171 (2009) Cena Merck 2009 Kapilární čipová elektroforéza Kvalita izolované mrna byla sledována za využití čipové kapilární elektroforézy na zařízení Experion (BioRad, USA). V analýze bylo využito RNAStSens Chips (BioRad, USA). Na čip se nanášely 2 µl vzorku. Celý proces analýzy je řízen a kontrolován pomocí PC. Výsledky a diskuse Trvale udržitelné získávání nerostných surovin za využití rostlin by mohlo přinést velmi zajímavé možnosti ve snížení emisí zvyšujících globální teplotu. Běžně se vyskytující rostliny nebudou schopny takové nároky uspokojit a je velmi pravděpodobné, že tyto rostliny budou geneticky upraveny s ohledem na zvýšení jejich průmyslového potenciálu. Za takovými cíli nesmí zaostat ani analytické techniky. Moderní analytické techniky musí být schopné monitorovat přítomnost takových genů (především jako specifické molekuly mrna) jak z hlediska monitorování případného rizika, tak z hlediska zvyšování účinnosti. Takové nároky výrazným způsobem zvýší tlak na zabezpečení velkého počtu analýz při maximální opakovatelnosti celého analytického postupu s minimálními lidskými zásahy. Pro takové účely jsou vhodné plně automatizované robotické stanice a různé způsoby on-line nebo off-line napojení s detekčním systémem. Izolace mrna za využití magnetických mikročástic Pro izolaci nukleových kyselin byly vypracovány různé postupy vycházející z odstranění interferujících proteinů a následného vysrážení alkoholem nebo ionty těžkých kovů. Klasická izolace vykazuje stále nejvyšší výtěžky nukleové kyseliny, ale je časově náročná a vnáší do postupu řadu systematických chyb způsobených lidským faktorem. Tento závažný problém je řešen několika různými způsoby, především za využití pevných sorbentů a nejnověji pomocí magnetizovatelných mini- a mikročástic. Příprava magnetických mikročástic pro poloautomatizovanou analýzu byla nedávno popsána v práci 8. Zkráceně je možné postup shrnout do následujících kroků: ze zásobního roztoku se odebere 10 µl mikročástic do mikrozkumavky, která se přenese do magnetického stojanu, přidá se 20 µl promývacího roztoku (0,1 M-NaCl + 50 mm- Na 2 HPO 4 + NaH 2 PO 4 ). Následně se mikrozkumavka přesune ze stojanu a krátce protřepe v ruce tak, aby se paramagnetické částice rozptýlily v promývacím roztoku. Následuje série kroků za použití přístroje multispin MSC- 3000, u kterého se střídá centrifugace a třepaní. Oba procesy se 6krát opakují. Po odstranění zbylého promývacího roztoku se k paramagnetickým částicím přidá hybridizační roztok, který je složen z NaCl, fosfátového pufru a inhibičního roztoku. Celkový objem hybridizačního roztoku i se vzorkem byl 30 µl. Hybridizace probíhala opět na přístroji multi-spin MSC-3000 po dobu 40 min. Po hybridizaci následovalo stejné promytí paramagnetických částic, které se opět 3krát opakovalo. Promyté paramagnetické částice s navázanou nukleovou kyselinou se umístily na Thermomixer 5355 a při teplotě 85 C po dobu 5 min probíhala denaturace. Poté se paramagnetické částice přitáhly magnetickým stojanem a roztok obsahující pouze mrna se odsál a přenesl do nové sterilní mikrozkumavky (obr. 1). Elektrochemická detekce mrna na různých pracovních elektrodách Izolovanou nukleovou kyselinu jsme analyzovali podle již optimalizovaného postupu technikou adsorptivního přenosu (5 µl vzorku) při době akumulace 240 s. Byla sledována závislost elektrochemických signálů adeninu na době polarizace u poly(a) a ODN-A20, ODN-A25, ODN- A30 a ODN-A40 (5 µg ml 1 ) při rychlostech polarizace 25, 50, 100, 200, 300, 400, 500 a 600 mv s 1. Na eliminačních voltamogramech studovaných nukleových kyselin byla jasně prokázána přítomnost typického signálu; píkprotipík (adsorbovaná částice) na povrchu pracovní elektrody 9. Pozorované redukční signály adeninu byly velmi Princip spojení elektrochemické detekce a magnetické separace TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT Povrch interakce vzorek Magnetické částice vazba Separační povrch AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTT Detekční povrch Signal CE e Ag/AgCl washing Obr. 1. Obrázek zachycení mrna pomocí magnetických částic. Interakce (probíhá interakce mezi magnetickou částicí a nukleovou kyselinou), separace (dochází k oddělení specificky zachycených molekul od ostatních), detekce (stanovení zachycené molekuly nukleové kyseliny) s169
4 dobře vyvinuté a symetrické. Jejich potenciál se měnil s rychlostí polarizace od pozitivnějších (kolem 1,395 V při rychlosti polarizace 25 mv s 1 ) do negativnějších (kolem 1,495 V, při rychlosti polarizace 600 mv s 1 ). Při vynesení závislosti výšky signálu (Ip) na rychlosti polarizace (v) byly získané závislosti lineární: polya (R 2 = 0,991), ODN-A20 (R 2 = 0,996), ODN-A25 (R 2 = 0,994), ODN- A30 (R 2 = 0,995) a ODN-A40 (R 2 = 0,993). Získané výsledky ukazují, že na povrchu pracovní elektrody probíhá difuzně řízená elektrodová reakce. Byly porovnány průměrné signály nukleových kyselin v elektrochemické nádobce a pomocí techniky adsorptivního přenosu. Signály v nádobce byly u všech studovaných nukleových kyselin signifikantně sníženy (t-test, P < 0,05). Studované molekuly byly, kromě detekce na HMDE, analyzovány také na tištěných uhlíkových elektrodách. Vzorek (3 µl) byl nanesen na povrch elektrody a následně akumulován po dobu 240 s. Poté byla SPE opláchnuta destilovanou vodou a probíhala elektrochemická analýza v acetátovém pufru (ph 5,0). Získané SWV signály adeninu byly pozorovány při průměrném potenciálu pro všechny studované molekuly +1,38 ± 0,02 V (n = 5). Jedno elektrochemické čidlo (SPE) bylo možné pro stanovení nukleové kyseliny použít opakovaně. Pracovní elektroda byla po ukončení analýzy opláchnuta destilovanou vodou a pomocí jemné aluminy a vatového tamponu mechanicky obnoven povrch. Při deseti opakováních elektrochemické detekce polya (30 µg ml 1 ) byla relativní směrodatná odchylka stanovení 8,8 %. Výsledek naznačuje, že SPE je možné opakovaně použít při analýze nukleových kyselin. V dalším experimentu byly sledovány závislosti na koncentraci studovaných nukleových kyselin a byly charakterizovány rovnicemi přímek, jejichž korelační koeficient neklesl pod 0,95. Limit detekce byl určen ředěním pro poly A: 25 ng ml 1 ; ODN-A20: 85 ng ml 1, ODN-A25: 70 ng ml 1, ODN-A30: 65 ng ml 1 a ODN-A40: 50 ng ml 1. Kromě použitého uhlíkového prášku k tisku pracovní elektrody byly vyzkoušeny také uhlíkové nanotrubice jako indikační elektrody. Prozatím velkou technologickou nevýhodou uhlíkových nanotrubic je obtížnost jejich přípravy a případně definovaného růstu na určeném pracovním povrchu. Proto jsme měli k dispozici pouze omezený počet pracovních elektrod. Získané signály nukleových kyselin na uhlíkových elektrodách s uhlíkovými nanočásticemi byly v průměru o 15 % vyšší v porovnání se signály nukleových kyselin na SPE. Vazba polya na magnetické částice za použití poloautomatizovaného a plně automatizovaného způsobu izolace Manuální izolace nukleové kyseliny (polya) je zatížena poměrně značnou experimentální chybou (7 až 10 %), která je způsobena obtížným dodržováním časových bodů jak v průběhu promývacích, tak hybridizačních kroků. Experimentální chyba je snížena asi o 1 2 % v případě, že je do experimentálního postupu zařazen termoblok s časovačem, řízenou teplotou a intenzitou třepání. Pozorovaná účinnost separace se pohybuje kolem 10 až 15 % ve shodě s dříve publikovanými výsledky 10. V případě, že do procesu přípravy je zařazen krok plně automatické přípravy magnetizovatelných částic, byla zvýšena účinnost separace polya na 30 až 55 % s experimentální chybou stále kolem 8 %. Z výsledků je tedy zřejmé, že automatizační krok výrazným způsobem omezil chyby způsobené experimentátorem a umožnil tak zvýšit účinnost separace nukleové kyseliny 11. V dalších experimentech byla provedena plně automatická izolace polya za využití robotického zařízení. Pro naše účely byla navržena následující pracovní sekvence: magnetizovatelné mikročástice (10 µl) se transportují do PCR destičky, promývací cyklus 3krát (50 µl), přidání vzorku (polya) (10 µl) a hybridizační roztok (30 µl), hybridizace 15 min, 25 C, promytí 3krát (50 µl). Následuje přenos PCR destičky na termostatovanou pozici, kde probíhá denaturace navázaného řetězce nukleové kyseliny. Účinnost separace polya (25 µg ml 1 ) se pohybovala kolem 40 % a experimentální chyba byla 6,5 % (n = 10). Plně automatický postup přináší časovou úsporu pracovníka a především snižuje experimentální chybu. Mezi technické problémy, které jsou stále spojené s využitím tohoto postupu, je odpařování analyzovaného vzorku. Za využití plně automatické techniky byla sledována vazba polya na DBT a ROCHE magnetické částice. Na DBT mikročástice byly nukleové kyseliny vázány s výtěžkem průměrně 45 %. Navíc bylo možné sledovat rostoucí trend elektrochemického signálu v závislosti na délce řetězce (směrnice rovnice přímky a = 16,5). V případě magnetických mikročástic ROCHE byla výtěžnost průměrně 25 %. Pozorovaný elektrochemický signál nerostl s ohledem na délku řetězce zachyceného ODN. In vitro kultivované rostliny kukuřice Rostliny kukuřice byly vystaveny abiotickému stresu způsobenému kademnatými ionty. Z růstové charakteristiky je zřejmé, že se zvyšující se koncentrací kademnatých iontů a dobou kultivace byl růst rostlin více inhibován. Nejvýraznější změny v růstu byly pozorovány u aplikované koncentrace 50 µm. U těchto rostlin byly pozorovatelné maximálně 1 2 převážně zmenšené listy na konci experimentu. U kontrolní varianty byly zaznamenány dobře vyvinuté 4 až 5 listy. Histochemicky byly sledovány změny v pletivech. K 3 [Fe(CN) 6 ] je v pletivech redukován látkami s volnými SH skupinami na modře zbarvené redukční produkty (šipky, obr. 2). U kontrolních rostlin byla přítomnost látek s volnými SH skupinami omezena pouze na rhizodermis. Vyšší syntéza látek s -SH skupinami byla pozorována v případě 10 µm koncentrace Cd(II). Naopak téměř žádné látky s volnými SH skupinami nebyly prokázány u dvou nejvyšších koncentrací kadmia. Zde bylo pozorováno, že v buňkách mezodermis docházelo k syntéze červeně zbarvených látek (označeno X), tj. látek ze skupiny polyfenolů s výraznými antioxidačními vlastnost- s170
5 1 µa 35 K 5 µm 10 µm 25 µm 50 µm 100 µm K 10 µm 25 µm X 50 µm X 100 µm Koncentrace nukleové kyseliny (µg/ml) stonek kořen Aplikovaná koncentrace kadmia (µm) Obr. 2. Fotografie explantátové kultury kukuřice vystavené kademnatým iontům. Srovnání anatomických změn v kořenech. LSV elektrochemické záznamy signálů mrna izolované přímo z pletiv in vitro kultivovaných rostlin. Hladina mrna detegovaná v pátý den experimentu mi (obr. 2). Změny ve fluorescenci chlorofylu mohou být považovány za jasné fyziologické ukazatele stresu u rostlin. Rostliny vystavené abiotickému stresu jsou nuceny zvýšit syntézu různých biologicky aktivních molekul, jako jsou sloučeniny obsahující volné SH skupiny (glutathion, fytochelatiny, metalothioneinu podobné proteiny). Řada takových molekul je syntetizována chemickou reakcí, avšak enzymy účastnící se těchto reakcí jsou genově regulovány. Z těchto příčin je možné pozorovat zvýšenou expresi určité skupiny genů, které povedou k nárůstu hladiny celkové mrna (transkriptomu) v rostlinách. U všech analyzovaných vzorků byla získána mrna pomocí magnetizovatelných mikročástic, která se analyzovala jak na HMDE, tak na SPE. Přítomnost a kvalita získané mrna byla ověřena na kapilární elektroforéze. Na získaných voltametrických záznamech byly pozorovány dobře rozlišené píky při potenciálu kolem 1,5 V. Množství izolované mrna se pohybovalo od 10 do 30 µg ml 1 po jejich přepočtu na polya. V takto velmi dobře charakterizované mrna je možné hledat specifickou sekvenci konkrétního genu. V oblasti stresové reakce na kademnaté ionty u rostlin jsou to geny spojené s aktivitou thiolových sloučenin (glutathionu a fytochelatinu). Závěr Izolace a detekce nukleových kyselin bude hrát stále významnější roli v oblasti trvale udržitelných průmyslově využitelných technologií. LITERATURA 1. Abbott A.: Nature 374, 584 (1995). 2. Rosenzweig C., Karoly D., Vicarelli M., Neofotis P., Wu Q., Casassa G., Menzel A., Root T. L., Estrella N., Seguin B., Tryjanowski P., Liu C., Rawlins S., Imeson A.: Nature 453, 353 (2008). 3. Salt D., Smith R., Raskin I.: Ann. Rev. Plant Phys. Plant Mol. Biol. 49, 643 (1998). 4. M. C., Feng X., Feng X., He Y., Liang D., Marton L.: Environ. Geochem. Health 28, 103 (2006). 5. Supalkova V., Huska D., Diopan V., Hanustiak P., Zitka O., Stejskal K., Baloun J., Pikula J., Havel L., Zehnalek J., Adam V., Trnkova L., Beklova M., Kizek R.: Sensors 7, 932 (2007). 6. Jasek O., Elias M., Zajickova L., Kudrle V., Bublan M., Matejkova J., Rek A., Bursik J., Kadlecikova M.: Mater. Sci. Eng. C-Biomimetic Supramol. Syst. 26, 1189 (2005). 7. Gamborg O. L., Murashige T., Thorpe T. A., Vasil I. K.: In Vitro-J. Tiss. Cult. Assoc. 12, 473 (1976). 8. Huska D., Adam V., Kizek R.: Talanta, odesláno Trnkova L., Kizek R., Dracka O.: Electroanalysis 12, 905 (2000). 10. Palecek E., Billova S., Havran L., Kizek R., Miculkova A., Jelen F.: Talanta 56, 919 (2002). 11. Huska D., Krizkova S., Adam V., Hubalek J., Trnkova L., Prusa R., Havel L., Kizek R.: Tumor Biology 28, 124 (2007). Prezentované výsledky bylo možné získat za podpory projektů: FRVŠ A GA AV KAN s171
PLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ. univerzita, Zemědělská 1, 613 00 Brno
PLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ Dalibor Húska 1, Vojtěch Adam 1,2, Petr Babula 3, René Kizek 1 1 Ústav chemie a biochemie
Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin Ing. Kateřina Tmejová, Ph. D.,
Chem. Listy 104, 177 185 (2010)
ELEKTROCHEMICKÁ DETEKCE mrna IZOLOVANÉ Z ROSTLINNÝCH PLETIV ZA VYUŽITÍ PARA- MAGNETICKÝCH MIKROČÁSTIC Věnováno pdesátému výročí udělení Nobelovy ceny Prof. Jroslvu Heyrovskému DALIBOR HÚSKA *, VOJTĚCH
Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM
Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM Životní prostředí Obranné mechanismy Rostlinná buňka Živočišná buňka 2GS - M M GSH VAKUOLA GSH GSH *Aktivace* PC -
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie IZOLACE GENOMOVÉ DNA Deoxyribonukleová kyselina (DNA) představuje základní genetický materiál většiny
Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
IZOLACE DNA POMOCÍ MAGNETIZOVATELNÝCH ČÁSTIC A JEJICH VYUŽITÍ V DIAGNOSTICE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ
IZOLACE DNA POMOCÍ MAGNETIZOVATELNÝCH ČÁSTIC A JEJICH VYUŽITÍ V DIAGNOSTICE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ Marcela Vlčnovská 1, Kristýna Šmerková 1, Simona Dostálová 2, Jiří Sochor 1, René Kizek 1* 1 Ústav chemie
VYUŽITÍ TEPELNÉHO ZMLŽOVAČE V AAS
1 VYUŽITÍ TEPELNÉHO ZMLŽOVAČE V AAS JAN KNÁPEK Katedra analytické chemie, Přírodovědecká fakulta MU, Kotlářská 2, Brno 611 37 Obsah 1. Úvod 2. Tepelný zmlžovač 2.1 Princip 2.2 Konstrukce 2.3 Optimalizace
Vliv selenu, zinku a kadmia na růstový vývoj česneku kuchyňského (Allium sativum L.)
Vliv selenu, zinku a kadmia na růstový vývoj česneku kuchyňského (Allium sativum L.) Botanická charakteristika: ČESNEK KUCHYŇSKÝ (ALLIUM SATIVUM L.) Pravlastí je Džungarsko (severní Čína) v Střední Asii,
ENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY
ENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY Autor: Mgr. Stanislava Bubíková Datum (období) tvorby: 28. 3. 2013 Ročník: devátý Vzdělávací oblast: Člověk a příroda / Chemie / Organické sloučeniny 1 Anotace: Žáci se seznámí
Modifikace uhlíkové pastové elektrody pro stanovení stříbrných iontů
Název: Školitel: Modifikace uhlíkové pastové elektrody pro stanovení stříbrných iontů Mgr. Dana Dospivová Datum: 24.2.212 Reg.č.projektu: CZ.1.7/2.3./2.148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce v oblasti
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit
Sekvenční injekční analýza laboratoř na ventilu (SIA-LOV) (Stanovení obsahu heparinu v injekčním roztoku)
Sekvenční injekční analýza laboratoř na ventilu (SIA-LOV) (Stanovení obsahu heparinu v injekčním roztoku) Teorie: Sekvenční injekční analýza (SIA) je další technikou průtokové analýzy, která umožňuje snadnou
CVIČENÍ 3: VODNÍ PROVOZ (POKRAČOVÁNÍ), MINERÁLNÍ VÝŽIVA. Pokus č. 1: Stanovení celkové a kutikulární transpirace listů analýzou transpirační křivky
CVIČENÍ 3: VODNÍ PROVOZ (POKRAČOVÁNÍ), MINERÁLNÍ VÝŽIVA Pokus č. 1: Stanovení celkové a kutikulární transpirace listů analýzou transpirační křivky Analýza transpiračních křivek, založená na vážení odříznutých
Voltametrie (laboratorní úloha)
Voltametrie (laboratorní úloha) Teorie: Voltametrie (přesněji volt-ampérometrie) je nejčastěji používaná elektrochemická metoda, kdy se na pracovní elektrodu (rtuť, platina, zlato, uhlík, amalgamy,...)
Stanovení olovnatých iontů zapouzdřených v liposomech The determination of lead ions encapsulated in liposomes
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Anotace Stanovení olovnatých iontů zapouzdřených v liposomech The determination of lead ions encapsulated in liposomes Olovo je těžký kov, který je toxický i při
OPTIMALIZACE METODY ANODICKÉ ROZPOUŠTĚCÍ VOLTAMETRIE PRO ANALÝZU BIOLOGICKÝCH VZORKŮ S OBSAHEM RTUTI
Středoškolská technika 212 Setkání a prezentace prací středoškolských studentů na ČVUT OPTIMALIZACE METODY ANODICKÉ ROZPOUŠTĚCÍ VOLTAMETRIE PRO ANALÝZU BIOLOGICKÝCH VZORKŮ S OBSAHEM RTUTI Eliška Marková
ELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINÁZY-9 A KOLAGENU. univerzita v Brně, Zemědělská 1, 613 00 Brno
ELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINÁZY-9 A KOLAGENU Ondřej Zítka 1,2, Dalibor Húska 2, Vojtěch Adam 2,3, Libuše Trnková 4, René Kizek 2 1 Ústav biochemie, Přírodovědecká
) se ve vodě ihned rozpouští za tvorby amonných solí (iontová, disociovaná forma NH 4+ ). Vzájemný poměr obou forem závisí na ph a teplotě.
Amoniakální dusík Amoniakální dusík se vyskytuje téměř ve všech typech vod. Je primárním produktem rozkladu organických dusíkatých látek živočišného i rostlinného původu. Organického původu je rovněž ve
GRAFEN VERSUS MWCNT; POROVNÁNÍ DVOU FOREM UHLÍKU V DETEKCI TĚŽKÉHO KOVU. Název: Školitel: Mgr. Dana Fialová. Datum: 15.3.2013
Název: Školitel: GRAFEN VERSUS MWCNT; POROVNÁNÍ DVOU FOREM UHLÍKU V DETEKCI TĚŽKÉHO KOVU Mgr. Dana Fialová Datum: 15.3.2013 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce
Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic
Název: Školitel: Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic Veronika Vlahová Datum: 21. 3. 214 Reg.č.projektu: CZ.1.7/2.3./2.148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce v oblasti
Izolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
Příloha 2. Návod pro laboratorní úlohu
Příloha 2. Návod pro laboratorní úlohu VYSOKÁ ŠKOLA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ V PRAZE ÚSTAV CHEMIE A ANALÝZY POTRAVIN Technická 5, 166 28 Praha 6 tel./fax.: + 42 224 353 185; jana.hajslova@vscht.cz Analýza
Agronomická fakulta. Ústav pěstování, šlechtění rostlin a rostlinolékařství. Zemědělská 1, 613 00 Brno, Česká republika. Report č.
Mendelova univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav pěstování, šlechtění rostlin a rostlinolékařství Zemědělská 1, 613 00 Brno, Česká republika Report č.1 Typ Produkt Indikace Plodina Lokalita Pokus
ELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINASY-9 A KOLAGENU
ELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINASY-9 A KOLAGENU ONDŘEJ ZÍTKA a,b, DALIBOR HÚSKA b, VOJTĚCH ADAM b,c, LIBUŠE TRNKOVÁ d a RENÉ KIZEK b a Ústav biochemie, Přírodovědecká
Sure-MeDIP I. with magnetic beads and MNase. www.krd.cz
Sure-MeDIP I with magnetic beads and MNase www.krd.cz 1 Obsah soupravy a skladování MeDIP souprava obsahuje reagencie na provedení 25 reakcí. Souprava je rozdělen do dvou částí, jedna je distribuována
Obr. 1. Struktura glukosaminu.
3. Stanovení glukosaminu ve výživových doplňcích pomocí kapilární elektroforézy Glukosamin (2-amino-2-deoxyglukózamonosacharid je široce distribuován ve tkáních lidského organismu jako složka je klíčovou
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií PROTOKOL: Experimenty s deoxyribonukleovou kyselinou vykazující peroxidázovou aktivitu VYUČUJÍCÍ: Ing.Branislav Ruttkay-Nedecký, PhD., Ing. Lukáš Nejdl Anotace DNA
STUDIUM POVRCHOVÉ MODIFIKACE STŘÍBRNÝCH NANOČÁSTIC A JEJICH MOŽNÉ VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII
STUDIUM POVRCHOVÉ MODIFIKACE STŘÍBRÝCH AOČÁSTIC A JEJICH MOŽÉ VYUŽITÍ V AALYTICKÉ CHEMII Pavel Žvátora, Kamil Záruba, Pavel Řezanka, Vladimír Král Ústav analytické chemie, Fakulta chemicko-inženýrská,
Název: Vypracovala: Datum: 7. 2. 2014. Zuzana Lacková
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace,
Magnetické částice pro detekci nádorových onemocnění, založené na protilátkách Vojtěch Adam
Název: Školitel: Magnetické částice pro detekci nádorových onemocnění, založené na protilátkách Vojtěch Adam Datum: 7..203 Reg.č.projektu: CZ..07/2.4.00/3.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního
Koroze obecn Koroze chemická Koroze elektrochemická Koroze atmosférická
Koroze Úvod Jako téma své seminární práce v T-kurzu jsem si zvolil korozi, zejména korozi železa a oceli. Větší část práce jsem zpracoval experimentálně, abych zjistil podmínky urychlující nebo naopak
Uhlíkové struktury vázající ionty těžkých kovů
Uhlíkové struktury vázající ionty těžkých kovů 7. června/june 2013 9:30 h 17:30 h Laboratoř metalomiky a nanotechnologií, Mendelova univerzita v Brně a Středoevropský technologický institut Budova D, Zemědělská
Inovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie CZ.1.07/2.2.00/15.0247
Papírová a tenkovrstvá chromatografie Jednou z nejrozšířenějších analytických metod je bezesporu chromatografie, umožňující účinnou separaci látek nutnou pro spolehlivou identifikaci a kvantifikaci složek
ZMĚNA KLIMATU A JEJÍ DOPADY NA RŮST A VÝVOJ POLNÍCH PLODIN
ZMĚNA KLIMATU A JEJÍ DOPADY NA RŮST A VÝVOJ POLNÍCH PLODIN Zdeněk Žalud 1, Miroslav Trnka 1, Daniela Semerádová 1, Martin Dubrovský 1,2 1 Ústav agrosystémů a bioklimatologie, Mendelova zemědělská a lesnická
Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253
Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Část 4 - Nástřik vzorku Dávkovače vzorků/injektory Dávkování vzorků je jednou z klíčových záležitostí v HPLC. Ani nejlepší kolona
SYLVIE SKALIČKOVÁ a, PAVEL KOPEL b, ONDŘEJ ZÍTKA b, LIBUŠE TRNKOVÁ b, VOJTĚCH ADAM a,b a RENÉ KIZEK a,b. Experimentální část. Úvod
NANOČÁSTICEMI MODIFIKOVANÁ ELEKTRODA ZE SKELNÉHO UHLÍKU V MIKROPRŮTOKOVÉM USPOŘÁDÁNÍ PRO ANALÝZU NUKLEOVÝCH KYSELIN OBSAHUJÍCÍCH OPAKOVANÉ SEKVENCE ADENINU SYLVIE SKALIČKOVÁ a, PAVEL KOPEL b, ONDŘEJ ZÍTKA
(syrovátka kyselá). Obsahuje vodu, mléčný cukr, bílkoviny, mléčnou kyselinu, vitamíny skupiny B.
Některá omezení využitelnosti syrovátky jako dekontaminačního média Markéta SEQUENSOVÁ, Ivan LANDA Fakulta životního prostředí, ČZU, Praha marketasq@seznam.cz, landa@fzp.cz Abstrakt Sanační technologie
Renáta Kenšová. Název: Školitel: Datum: 24. 10. 2014
Název: Školitel: Sledování distribuce zinečnatých iontů v kuřecím zárodku za využití moderních technik Monitoring the distribution of zinc ions in chicken embryo using modern techniques Renáta Kenšová
Potenciometrické stanovení disociační konstanty
Potenciometrické stanovení disociační konstanty TEORIE Elektrolytická disociace kyseliny HA ve vodě vede k ustavení disociační rovnováhy: HA + H 2O A - + H 3O +, kterou lze charakterizovat disociační konstantou
Základy pedologie a ochrana půdy
Základy pedologie a ochrana půdy 6. přednáška VZDUCH V PŮDĚ = plynná fáze půdy Význam (a faktory jeho složení): dýchání organismů výměna plynů mezi půdou a atmosférou průběh reakcí v půdě Formy: volně
Výzkumné centrum genomiky a proteomiky. Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Výzkumné centrum genomiky a proteomiky Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i. Systém pro sekvenování Systém pro čipovou analýzu Systém pro proteinovou analýzu Automatický sběrač buněk Systém pro sekvenování
Denitrifikace odpadních vod s vysokou koncentrací dusičnanů
Denitrifikace odpadních vod s vysokou koncentrací dusičnanů Dorota Horová, Petr Bezucha Unipetrol výzkumně vzdělávací centrum, a.s., Ústí nad Labem dorota.horova@unicre.cz Souhrn Biologická denitrifikace
Vizualizace DNA ETHIDIUM BROMID. fluorescenční barva interkalační činidlo. do gelu do pufru barvení po elfu SYBR GREEN
ETHIDIUM BROMID fluorescenční barva interkalační činidlo do gelu do pufru barvení po elfu Vizualizace DNA SYBR GREEN Barvení proteinů Coommassie Brilliant Blue Coomassie Blue x barvení stříbrem Porovnání
Seminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
Od polarografie k elektrochemii na rozhraní dvou kapalin
Od polarografie k elektrochemii na rozhraní dvou kapalin Vladimír Mareček Ústav fyzikální chemie Jaroslava Heyrovského AV ČR 1. Počátky elektrochemie 2. Rtuťová kapková elektroda 3. Polarografie 4. Rozhraní
Stanovení chmelových silic metodou SPME GC
Stanovení chmelových silic metodou SPME GC Eva Kašparová, Martin Adam, Karel Ventura Katedra analytické chemie, Fakulta chemicko-technologická, Univerzita Pardubice, nám. Čs. legií 565, 532 1 Pardubice,
P + D PRVKY Laboratorní práce
Téma: Reakce sloučenin železa a kobaltu P + D PRVKY Laboratorní práce Úkol 1: Určete, které vlivy se podílí na korozi železa. Koroze je označení pro děj probíhající na povrchu některých kovů. Na jejím
Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou
Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou Úkol Stanovte obsah cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce pomocí kapilární elektroforézy. Teoretická část Cholesterol je steroidní
ČIDLO PRO MĚŘENÍ KONCENTRACE CHLORU TYP CSCT 43
ČIDLO PRO MĚŘENÍ KONCENTRACE CHLORU TYP CSCT 43 Návod k používání a údržbě! OBSAH 1. Rozsah použití... strana 2 2. Rozsah dodávky... strana 3 3. Uvedení do provozu... strana 3 4. Měření... strana 4 5.
Biologické materiály k biochemickému vyšetření
Biologické materiály k biochemickému vyšetření RNDr. Bohuslava Trnková, ÚKBLD 1. LF UK ls 1 Správný odběr vzorku - první předpoklad k získání správného výsledku preanalytická fáze analytická fáze - vlastní
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
č. 98/2011 Sb. VYHLÁŠKA ze dne 30. března 2011 o způsobu hodnocení stavu útvarů povrchových vod, způsobu hodnocení ekologického potenciálu silně
č. 98/2011 Sb. VYHLÁŠKA ze dne 30. března 2011 o způsobu hodnocení stavu útvarů povrchových vod, způsobu hodnocení ekologického potenciálu silně ovlivněných a umělých útvarů povrchových vod a náležitostech
BUNĚČNÁ STĚNA - struktura a role v rostlinné buňce
BUNĚČNÁ STĚNA - struktura a role v rostlinné buňce Buněčná stěna O buněčné stěně: Buněčná stěna je nedílnou součástí každé rostlinné buňky a je jednou z charakteristických struktur odlišujících buňku rostlinnou
ZÁSADY SPRÁVNÉ LABORATORNÍ PRAXE VYBRANÁ USTANOVENÍ PRAKTICKÉ APLIKACE
ZÁSADY SPRÁVNÉ LABORATORNÍ PRAXE VYBRANÁ USTANOVENÍ PRAKTICKÉ APLIKACE Zabezpečování jakosti v laboratorní praxi je významnou součástí práce každé laboratoře. Problematiku jakosti řeší řada předpisů, z
Fakulta životního prostředí v Ústí nad Labem. Pokročilé metody studia speciace polutantů. (prozatímní učební text, srpen 2012)
Fakulta životního prostředí v Ústí nad Labem Pokročilé metody studia speciace polutantů (prozatímní učební text, srpen 2012) Obsah kurzu: 1. Obecné strategie speciační analýzy. a. Úvod do problematiky
ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ
Kurz praktické NMR spektroskopie 10. - 12. říjen 2011, Praha ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ POSTUPY NMR ROZTOKŮ A KAPALIN Jana Svobodová Ústav Makromolekulární chemie AV ČR, v.v.i. Bruker 600 Avance III PŘÍSTROJOVÉ
STANOVENÍ VODNÍHO POTENCIÁLU REFRAKTOMETRICKY
Úloha č. 1 Stanovení vodního potenciálu refraktometricky - 1 - STANOVENÍ VODNÍHO POTENCIÁLU REFRAKTOMETRICKY VODNÍ POTENCIÁL A JEHO SLOŽKY Termodynamický stav vody v buňce můžeme porovnávat se stavem čisté
Analýza biologicky aktivních látek VOJTĚCH ADAM
Analýza biologicky aktivních látek VOJTĚCH ADAM Obsah I. Nízkomolekulární biologicky aktivní thioly II. Metalothionein III.Nukleové kyseliny Obsah I. Nízkomolekulární biologicky aktivní thioly II. Metalothionein
Pufry, pufrační kapacita. Oxidoredukce, elektrodové děje.
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Pufry, pufrační kapacita. Oxidoredukce, elektrodové děje. Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka, Tomáš Navrátil
EXTRAKCE, CHROMATOGRAFICKÉ DĚLENÍ (C18, TLC) A STANOVENÍ LISTOVÝCH BARVIV
Úloha č. 7 Extrakce a chromatografické dělení (C18 a TLC) a stanovení listových barviv -1 - EXTRAKCE, CHROMATOGRAFICKÉ DĚLENÍ (C18, TLC) A STANOVENÍ LISTOVÝCH BARVIV LISTOVÁ BARVIVA A JEJICH FYZIOLOGICKÝ
Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách
Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách Teorie Stanovení celkových proteinů Celkové množství proteinů lze stanovit pomocí několika metod; například: Hartree-Lowryho
ELEKTROCHEMICKÉ STANOVENÍ cis-pt V KOMPLEXECH S DNA
ELEKTROCHEMICKÉ STANOVENÍ cis-pt V KOMPLEXECH S DNA Dana Dospivova 1, Kristyna Smerkova 1, Soňa Křížková 1,2, Marketa Ryvolova 1,2, David Hynek 1,2, Vojtech Adam 1,2, Pavel Kopel 1,2, Marie Stiborova 3,
Polymorfismus délky restrikčních fragmentů
Polymorfismus délky restrikčních fragmentů Princip: Chemikálie: PCR produkt z předchozího praktického cvičení Endonukleáza KpnI 10 U μl -1 Pufr pro KpnI 10 koncentrovaný (Tris-HCl 100 mmol l -1 ph 7,5,
OBECNÁ CHEMIE František Zachoval CHEMICKÉ ROVNOVÁHY 1. Rovnovážný stav, rovnovážná konstanta a její odvození Dlouhou dobu se chemici domnívali, že jakákoliv chem.
Analyzátory OPTI firmy ROCHE
Analyzátory OPTI firmy ROCHE - øešení kritických situací Prof. MUDr. Jaroslav Racek, DrSc., MUDr. Vlasta Petøíková, Zuzana Pešková Ústav klinické biochemie a laboratorní diagnostiky Lékaøské fakulty UK
EXTRAKČNÍ METODY. Studijní materiál. 1. Obecná charakteristika extrakce. 2. Extrakce kapalina/kapalina LLE. 3. Alkalická hydrolýza
Studijní materiál EXTRAKČNÍ METODY 1. Obecná charakteristika extrakce 2. Extrakce kapalina/kapalina LLE 3. Alkalická hydrolýza 4. Soxhletova extrakce 5. Extrakce za zvýšené teploty a tlaku PLE, ASE, PSE
VÝZVA K PODÁNÍ NABÍDEK DO VÝBĚROVÉHO ŘÍZENÍ NA VEŘEJNOU ZAKÁZKU MALÉHO ROZSAHU ZADÁVACÍ PODMÍNKY
VÝZVA K PODÁNÍ NABÍDEK DO VÝBĚROVÉHO ŘÍZENÍ NA VEŘEJNOU ZAKÁZKU MALÉHO ROZSAHU ZADÁVACÍ PODMÍNKY Název zakázky: Systém pro čištění DNA a RNA 1. Identifikační údaje zadavatele Název zadavatele: ÚSTAV HEMATOLOGIE
MINIATURIZACE PRŮTOKOVÝCH ELEKTROCHEMICKÝCH CEL PRO GENEROVÁNÍ TĚKAVÝCH SLOUČENIN. Jakub Hraníček
MINIATURIZACE PRŮTOKOVÝCH ELEKTROCHEMICKÝCH CEL PRO GENEROVÁNÍ TĚKAVÝCH SLOUČENIN Jakub Hraníček Katedra analytické chemie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, Albertov 6, 128 43 Praha 2 E-mail:
Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH. VII. Spektroskopie a fotochemie
Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH VII. Spektroskopie a fotochemie Karel Berka Univerzita Palackého v Olomouci Katedra Fyzikální chemie karel.berka@upol.cz Spektroskopie Analýza světla Excitované Absorbované
umožňují enzymatické systémy živé protoplazmy, nezbytný je kyslík,
DÝCHÁNÍ ROSTLIN systém postupných oxidoredukčních reakcí v živých buňkách, při kterých se z organických látek uvolňuje energie, která je zachycena jako krátkodobá energetická zásoba v ATP, umožňují enzymatické
Chem. Listy 104, 186 190 (2010)
Chem. Listy, 8 9 () VOLTAMETRICKÉ STANOVENÍ -NITROPYRENU A -AMINOPYRENU NA BOREM DOPOVANÉ DIAMANTOVÉ FILMOVÉ ELEKTRODĚ OKSANA YOSYPCHUK*, KAROLINA PECKOVÁ a JIŘÍ BAREK Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká
Reakce kyselin a zásad
seminář 6. 1. 2011 Chemie Reakce kyselin a zásad Známe několik teorií, které charakterizují definují kyseliny a zásady. Nejstarší je Arrheniova teorie, která je platná pro vodné prostředí, podle které
Hydrofobní chromatografie
Hydrofobní chromatografie Hydrofobicita proteinu insulin malwmrllpl lallalwgpd paaafvnqhl cgshlvealy lvcgergffy tpktrreaed lqvgqvelgg gpgagslqpl alegslqkrg iveqcctsic slyqlenycn vliv soli na protein Stacionární
Stanovení izoelektrického bodu kaseinu
Stanovení izoelektrického bodu kaseinu Shlukování koloidních částic do větších celků makroskopických rozměrů nazýváme koagulací. Ke koagulaci koloidních roztoků bílkovin dochází porušením solvatačního
PRAKTIKUM II. Oddělení fyzikálních praktik při Kabinetu výuky obecné fyziky MFF UK. Název: Elektrická vodivost elektrolytů. stud. skup.
Oddělení fyzikálních praktik při Kabinetu výuky obecné fyziky MFF UK PRAKTIKUM II. Úloha č. 26 Název: Elektrická vodivost elektrolytů Pracoval: Lukáš Vejmelka stud. skup. FMUZV 73) dne 12.12.2013 Odevzdal
Chemické veličiny, vztahy mezi nimi a chemické výpočty
SBÍRKA ŘEŠENÝCH PŘÍKLADŮ PRO PROJEKT PŘÍRODNÍ VĚDY AKTIVNĚ A INTERAKTIVNĚ CZ.1.07/1.1.24/01.0040 Chemické veličiny, vztahy mezi nimi a chemické výpočty Mgr. Jana Žůrková, 2013, 20 stran Obsah 1. Veličiny
Hybridizace nukleových kyselin
Hybridizace nukleových kyselin Tvorba dvouřetězcových hybridů za dvou jednořetězcových a komplementárních molekul Založena na schopnosti denaturace a renaturace DNA. Denaturace DNA oddělení komplementárních
CHEMICKY ČISTÁ LÁTKA A SMĚS
CHEMICKY ČISTÁ LÁTKA A SMĚS Látka = forma hmoty, která se skládá z velkého množství základních stavebních částic: atomů, iontů a... Látky se liší podle druhu částic, ze kterých se skládají. Druh částic
1 DATA: CHYBY, VARIABILITA A NEJISTOTY INSTRUMENTÁLNÍCH MĚŘENÍ. 1.5 Úlohy. 1.5.1 Analýza farmakologických a biochemických dat
1 DATA: CHYBY, VARIABILITA A NEJISTOTY INSTRUMENTÁLNÍCH MĚŘENÍ 1.5 Úlohy Úlohy jsou rozděleny do čtyř kapitol: B1 (farmakologická a biochemická data), C1 (chemická a fyzikální data), E1 (environmentální,
Jednotné pracovní postupy testování odrůd STANOVENÍ OBSAHU TANINŮ V ČIROKU SPEKTROFOTOMETRICKY
5321.1 Stanovení obsahu taninů v čiroku Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU TANINŮ V ČIROKU SPEKTROFOTOMETRICKY 1 Účel a rozsah Postup je určen pro stanovení obsahu taninů v zrnech čiroku. 2 Princip Taniny se ze
COSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční
y x COSY 90 y chem. posuv J vazba 90 x : : inphase dublet, disperzní inphase dublet, disperzní antiphase dublet, absorpční antiphase dublet, absorpční diagonální pík krospík + - - + podmínky měření a zpracování
Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu)
Název: Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu) Školitel: Ludmila Krejčová, MVDr. Datum: 7.11. 2013 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního
IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)
17.1 Izolace DNA (kit DNeasy Plant Mini) Strana 1 IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini) 1 Účel a rozsah Postup slouží k získání deoxyribonukleové kyseliny (DNA) ze vzorku pomocí komerčního kitu DNeasy Plant
POMALÉM PÍSKOVÉM. Ing. Lucie Javůrková, Ph.D. RNDr. Jana Říhová Ambrožová, Ph.D. Jaroslav Říha
APLIKACE GEOTEXTILIE NA POMALÉM PÍSKOVÉM FILTRU Ing. Lucie Javůrková, Ph.D. RNDr. Jana Říhová Ambrožová, Ph.D. Jaroslav Říha Úvod 2004 - Experiment s geotextilií na modelu (ÚV Velebudice) - hodnoceny 3
Oborový workshop pro ZŠ CHEMIE
PRAKTICKÁ VÝUKA PŘÍRODOVĚDNÝCH PŘEDMĚTŮ NA ZŠ A SŠ CZ.1.07/1.1.30/02.0024 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Oborový workshop pro ZŠ CHEMIE
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
DOPLŇKOVÝ STUDIJNÍ MATERIÁL CHEMICKÉ VÝPOČTY. Zuzana Špalková. Věra Vyskočilová
DOPLŇKOVÝ STUDIJNÍ MATERIÁL CHEMICKÉ VÝPOČTY Zuzana Špalková Věra Vyskočilová BRNO 2014 Doplňkový studijní materiál zaměřený na Chemické výpočty byl vytvořen v rámci projektu Interní vzdělávací agentury
5. BEZPEČNOSTNÍ OPATŘENÍ PŘI POUŽITÍ A MANIPULACI
N-Histofine Simple Stain AP (M) Univerzální imuno-alkalická fosfatáza polymer, anti-myší N-Histofine imunohistochemické barvicí reagens Skladovat při 2-8 C 1. ÚVOD Firma Nichirei vyvinula jedinečný imunohistochemický
Základy analýzy potravin Přednáška 8. Důvody pro analýzu bílkovin v potravinách. určování původu suroviny, autenticita výrobku
BÍLKOVINY Důvody pro analýzu bílkovin v potravinách posuzování nutriční hodnoty celkový obsah bílkovin aminokyselinové složení bílkoviny, volné aminokyseliny obsah cizorodých nebo neplnohodnotných bílkovin
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - ZEARALENON
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - ZEARALENON 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení zearalenonu v krmivech. 1 Zearalenon (ZON) je charakterizován
ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN
ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN Možnosti stanovení Listeria monocytogenes popis metod a jejich princip Mária Strážiková Aleš Holfeld Obsah Charakteristika Listeria monocytogenes Listerióza Metody detekce
[ ][ ] Kyseliny a zásady. Acidobazické rovnováhy. Výpočet ph silných jednosytných kyselin (zásad) Autoprotolýza vody
Aidoziké rovnováhy při idozikýh rovnováháh (proteolytikýh) přeno vodíkového ktiontu mezi ionty (molekulmi) zúčtněnými v rovnováze kyelin donor protonů zád keptor protonů KYELINA 1 zád ZÁADA 1 kyelin vod