CENTRUM INFORMATIKY A ANALÝZ, UNIVERZITNÍ ONKOLOGICKÉ CENTRUM, LF A MU BRNO 2
|
|
- Ivana Vávrová
- před 9 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 PŘÍSPĚVEK BIOSTATISTIKY K STANDARDIZACI HODNOCENÍ TESTŮ CHEMOREZISTENCE NÁDORŮ IN VITRO CONTRIBUTION OF BIOSTATISTICS TO THE STANDARDIZED EVALUATION OF TUMOR DRUG RESISTANCE TESTS +DUŠEK L. 1-2, KOPTÍKOVÁ J. 1, HAJDÚCH M. 3, NOSKOVÁ V. 3, LUĎKOVÁ A. 3, KAŠPÁREK I. 3 a ZLÁMALÍKOVÁ V. 2 1 CENTRUM INFORMATIKY A ANALÝZ, UNIVERZITNÍ ONKOLOGICKÉ CENTRUM, LF A MU BRNO 2 RECETOX, PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA, MU BRNO 3 LABORATOŘ EXPERIMENTÁLNÍ MEDICÍNY, FN A LF UP OLOMOUC " "korespondující autor: Centrum informatiky a analýz UOC, Veslařská 230B, Brno Souhrn: Ze specifické role testů chemorezistence nádorů v prediktivní onkologii vyplývá nutnost definovat jejich objektivní parametrické hodnocení s důrazem na jasnou biologickou interpretaci. U testů in vitro je tento úkol dominantně spjat s modelovým popisem možných odpovědí na cytostatika, tedy s analýzami a parametrizací křivek dávka-odpověď. Při základní typologii kalibračního souboru 46 buněčných nádorových linií testovaných na účinek 28 cytostatik (MTT test) byly popsány 3 modelové typy závislostí: sigmoidní funkce, "hormesis" model s rozdílným stupněm stimulace v nízkých dávkách cytostatika a křivky nestandardní s více sestupnými fázemi spojenými s odlišným mechanismem účinku ve vyšších koncentracích látky (5-fluorouracil, karboplatina, cisplatina). Celkové spektrum křivek však bylo více rozmanité v důsledku interakcí cytostatik s vlastnostmi a aktuálním stavem testovaných linií. Výsledný tvar křivky lze pouze částečně spojovat s mechanismem účinku aplikovaných cytostatik, do značné míry jej také ovlivňuje původ nádorového materiálu, rezistence, cytogenetické vlastnosti nebo aktuální stav proliferace buněk (především u látek ze skupiny mitotických jedů). Standardní analýza regresními modely je pak často limitována netypickým tvarem závislostí nebo omezeným počtem koncentračních úrovní testované látky. Práce dokládá využitelnost rovnice mediánového účinku jako diagnostické techniky umožňující jednotnou parametrizaci všech typů získaných křivek a vedoucí k odhadům minimální sady klinicky relevantních parametrů: hodnot EC 5 Q, prahové koncentrace látky (nebo vhodného odhadu EC X, např. EC 10 ) a podílu buněk přežívajících i v nejvyšší koncentraci cytostatika. Klíčová slova: chemorezistence nádorů, MTT test, křivky dávka - odpověď, statistická analýza, mediánový účinek Summary: Specific role of drug resistance tests in the concept of predictive oncology determines the necessity of objective parametric outputs with biologically clear interpretation. In the case of in vitro tests, the problem implies quantitative model description of dose response curves and standardization of descriptors. Comparative evaluation of the calibration data set (46 cell lines tested factorially for the effect of 28 different chemoterapeutic agents in MTT test) revealed 3 basic types of dose response relationships: sigmoidal curves, hormesis model with response stimulation in low concentrations and complex curves consisting of two or more sigmoidal (or hyperbolic) components that might be related to different mechanisms of influence (Carboplatin, Cisplatin, 5-Fluorouracil). Final spectrum of obtained curves was however more diverse as a consequence of numerous types of interaction between drug mechanism and properties of tumor cells. The dose-effect diversity could be only partially attributed to different mechanisms of influence, it however appeared to be significantly associated with the heterogeneity of tumor cells, namely with the degree of resistance. Model analyses performed on the calibration data set proved the median effect equation as an powerful diagnostic technique for uniform analysis of all dose response patterns that occurred in drug resistance tests. A minimum, but clinically relevant set of parameters was proposed to be routinely estimated from each curve: EC 5 0 estimates, threshold concentration (or proper alternative as EC X, e.g. EC 10 ) and fraction of cells surviving the highest applied concentration of examined compound. Key words: tumor drug resistance, MTT test, dose response curves, statistical analysis, median effect equation Úvod Testy chemorezistence nádorů in vitro představují jeden ze základních stavebních kamenů prediktivní onkologie jako oboru zaměřeného na bioindikaci a pravděpodobnostní predikci vývoje nádorových onemocnění pod vlivem chemoterapie a jiných léčebných procedur. In vitro testy hrají v celém procesu velmi specifickou roli zaměřenou především na zvýšení úspěšnosti konkrétních cyklů chemoterapie nebo na optimalizaci ucelených chemoterapeutických režimů. Představíme-li si však složitost léčby a různé cesty vývoje onemocnění v celé škále možností, je zřejmé, že funkční zapojení in vitro testů do celého procesu je možné pouze zajištěním průběžné zpětné konfrontace s reálnými klinickými výsledky. Koncové body vývoje nádorového onemocnění jako je pravděpodobnost relapsu či úmrtí mohou být úspěšně predikovány pouze pomocí modelů postihujících velmi heterogenní systém faktorů od klinických charakteristik pacienta, přes molekulární parametry nádoru až po parametry léčebného procesu. Z této situace tedy pro oblast testů chemorezistence vyplývá nutnost definovat objektivní parametrické výstupy korelující s reálnými klinickými daty a vedoucí k jasným biologickým interpretacím. Tento úkol je dominantně spjat s modelovým popisem možných odpovědí na cytostatika, tedy s analýzami a parametrizací křivek dávka - odpověď. Hodnocení závislostí dávka-odpověd není specifikem experimentální onkologie, ale zasahuje prakticky všechny oblasti biologického výzkumu a představuje téměř univerzální přírodovědný problém. Je logické, že nejintenzivněji je tato problematika rozvíjena v rámci oborů toxikologie a ekotoxikologie, které z testů toxicity a karcinogeneze odvozují parametry biologické účinnosti látek, často s legislativními a procedurálními důsledky pro jejich použití (21,17). Jako hlavní styčné body s onkologickým výzkumem lze kromě testů chemorezistence nádorů in vitro vymezit především testy karcinogeneze a mutageneze různých chemických látek, jejichž hodnocení kvalitativně zcela koresponduje s analýzami růstových testů a testů toxicity (19). V oblasti testů chemorezistence byly základy typologie křivek dávka - odpověď položeny v pracích Skipper a kol. (20) a Bruce a kol. (4). Shrnutí navržených klasifikací přinášejí Goldie a Coldman (8). Základním cílem této práce je kriticky shrnout současné možnosti analýzy a parametrizace křivek dávka - odpověď s ohledem na možné aplikace v testech chemorezistence nádorů. Na základě analýz kalibračního souboru 46 buněčných nádorových linií testovaných na účinek 28 cytostatik (MTT) jsou dokumentovány modelové typy závislostí a je doporučen jednotný analytický postup vedoucí ke klinicky relevantní parametrizaci testů. Možnosti parametrizace křivek dávka - odpověď pomocí regresních modelů Experimentální posouzení závislosti mezi dávkou látky (látek) a odpovědí biologického systému je v současnosti rutinní součástí toxikologických hodnocení. Pro standardní testy toxicity bylo možné vypracovat jednoznačné postupy analýzy dat vedoucí k parametrickým a statisticky verifíkovatelným výstupům. Zásadními přístupy k hodnocení je prosté srovnání vlivu jednotlivých koncentrací působící látky s kontrolou nebo komplexní modelové analýzy křivky dávka - odpověď. Jelikož typický experiment zahrnuje kontrolu a určitý počet testovaných koncentrací v několika opakováních, mohou být pro aktuální data téměř vždy využity oba postupy. Jako standardní a všeobecně přijatý výstup z modelových analýz byla navržena hodnota EC ("effective concentration") - koncentrace látky vyjadřující relativní míru účinku vzhledem ke kontrole. 22 KLINICKÁ ONKOLOGIE ZVLÁŠTNÍ ČÍSLO 2/2000
2 Ekvivalenty k efektivní koncentraci jsou ED - efektivní dávka, LC - letální koncentrace, LD X - letální dávka. Pro závislosti vykazující různý stupeň rezistence biologického systému vůči nízkým až středním koncentracím byly zavedeny různé odhady prahové koncentrace látky, mezi které patří i v ekotoxikologii nejčastěji užívaný odhad NOEC (,,No Observable Effect Concentration"). Vývoj parametrizace křivek dávka - odpověď v environmentální legislativě a výzkumu nebyl přímočarý a v současnosti stále představuje vážné téma statistických prací a návrhů normativ (17). Pro celý proces je charakteristický odklon od statistických indikátorů významnosti bez jasné biologické interpretace, tedy například od testů srovnávajících účinek jednotlivých koncentrací látky mezi sebou. Je akcentována nutnost respektovat tvar závislosti dávka - odpověď, která často odráží mechanismus účinku testované látky (11,12,16). V legislativě týkající se nebezpečnosti chemických látek se prosadil systém komplexního testování funkčních závislostí s následným hodnocením parametrů typu EC. Hlavní výhody tohoto standardu - tedy podchycení typů křivek a validovatelný odhad jasně interpretevatelných parametrů - jsou zobecnitelné pro jakoukoli vědní disciplínu. Hodnoty EC X lze odhadnout na základě vhodně volených regresních modelů vyhovujících typu analyzované funkce. Normativní doporučení publikované radou expertů OECD pro oblast testů toxicity chemických látek (17) a dále shrnuté v práci Welpa (22) je zobrazeno na Obrázku 1. Doporučené modely jsou využitelné pro nejběžněji se vyskytující typy závislostí: sigmoidní křivku (Obr. 1a), sigmoidní až hyperbolickou závislost spojenou s odhadem prahové koncentrace (Obr. lb) a tzv. Hormesis model jako model vystihující pozitivní stimulaci biologického systému nízkými koncentracemi testované látky (Obr. lc). Aplikaci regresních modelů komplikuje heterogenita typů křivek dávka - odpověď Výše uvedená standardní doporučení a typy regresních modelů jsou plně zobecnitelné pouze pro rutinizované laboratorní testy s biologickým materiálem v reprodukovatelné kvalitě. Při hodnocení neznámého problému (nové látky, směsi látek, testy in vivo) by měl být preferován postup dovolující spíše flexibilní volbu analytické metody. V mnoha přírodovědných oborech včetně experimentální onkologie tedy dochází k pokusům o interpretovatelnou klasifikaci možných typů odpovědí biologických systémů, což zpětně ovlivňuje vývoj analýzy dat (např. 1,8,2). Příklad schematického popisu a obecné klasifikace křivek dávka - odpověď, aplikovatelný i na testy chemorezistence nádorů, je uveden v Tabulce 1. Rozmanitost křivek dávka-odpověď značně komplikuje standardizaci konečného počtu regresních modelů. Komplikované tvary reálných závislostí vedou často ke kompromisním úpravám jako jsou transformace původních dat, zavádění nových parametrů do regresních rovnic nebo matematické modifikace běžných regresních postupů (např. 18). Získané výstupy pak nejsou vzájemně srovnatelné a postrádají biologickou interpretaci. U netypických nebo komplikovaných závislostí je dále značně problematická znalost konvenčních regresních koeficientů (Obr. 1) zatížených variabilitou odhadu v důsledku kompromisního proložení modelu do experimentálních dat. Přesnost a spolehlivost iteračních metod nelineární regrese může být dále limitována omezeným počtem testovaných koncentrací. Jednotná parametrizace křivek dávka - odpověď pomocí rovnice mediánového účinku Rovnice mediánového účinku a s ní související diagnostické techniky představují jednoduchou alternativu nelineárních regresních modelů (14). Rovnice vyjadřuje funkční vztah podílu (frakce) zasažených (F z ) a nezasažených (F N ) částí biologického systému ke koncentracím aplikované látky (C) normalizovaných hodnotou EC 50 : F Z /F N = (C/EC 50 ) m [Rovnice 1] Koeficient m je předmětem odhadu ("koeficient Hillova typu"; 15) a vyjadřuje stupeň sigmoidity analyzované křivky. Hodnoty m = 1 indikují hyperbolický tvar, hodnoty m > 1 vyjadřují rostoucí sigmoiditu a hodnoty m < 1 jsou v literatuře citovány spíše vzácně, například jako indikace negativních vazeb mezi látkou a receptory alosterických systémů. Rovnice 1 slouží po logaritmické transformaci jako efektivní nástroj odhadu hodnot EC 50 (včetně S.E.) jednoduchou rovnicí regresní přímky: log (F Z /F N ) = m.log(c ) - m.log(ec 50 ) [Rovnice 2] Při F z = F N = 0,5 získáme odhad EC 50 jako m.[log(c)]/m = log(ec 50 ) [Rovnice 3] Jelikož je definičně dáno F z + F N = 1, pak lze rovnici 1 převést do následujících tvarů, F z = 1/[1 + (EC 50 /C)] m [Rovnice 4] C = EC 50 [F z / (1 - F Z )]1/m [Rovnice 5] které mohou být užitečné pro dílčí modelové odhady z křivky dávka - odpověď. Především rovnice [5] je účinným nástrojem pro odhad jakýchkoli hodnot EC X na základě znalosti EC 50 a exponentu m. KLINICKÁ ONKOLOGIE ZVLÁŠTNÍ ČÍSLO 2/
3
4
5 Konečný tvar sigmoidní křivky je nutno vnímat jako výsledek interakce mechanismu účinku cytostatika a stupně (případně typu) rezistence testovaného nádorového materiálu. Tato interakce se projevuje sníženou účinností nízkých až středních koncentrací (tzv. shoulder of the curve") nebo určitým podílem buněk rezistentních i vůči nejvyšší aplikované koncentraci látky. Typ modifikace křivky lze pouze částečně spojovat s konkrétním mechanismem účinku látky, do značné míry jej také ovlivňuje heterogenita nádorového materiálu (výskyt frakcí různě rezistentních buněk) nebo přímo původ a genetická konstituce nádorové linie. Zásadní vliv stupně rezistence nádorového materiálu na modifikace funkční závislosti dávka - odpověď publikovali také Goldie a Ling (7). Různé typy modifikací jsou pro 5 modelových linií dokumentovány na obrázku 3. Příkladem silné rezistence většiny modelových linií vůči nízkým až středním dávkám cytostatika může být účinek Prednisonu nebo obecně kortikoidů (obdobně působí u většiny linií také Mitoxantron), který vede až k závislosti typu Hormesis model (Obr. 3b). Obdobně "jednotný" rys má reakce většiny linií na Actinomycin D, kde je však na rozdíl od Prednisonu patrná vysoká citlivosti odrážející se v hyperbolickém tvaru závislosti. Reakce na Cytosinarabinosid (reprezentativní obraz účinku antimetabolitů) je jistým průměrem obou dosud popsaných typů a k významnému rozlišení linií je nezbytná znalost podílu buněk s absolutní resistencí vůči nejvyšší aplikované koncentraci. Poslední dokumentovaný typ - účinek Vinkristinu - nejvíce rozlišil testované linie, a to jak v nízkých, tak i vysokých koncentracích. Vysoká heterogenita odpovědí je typická i pro ostatní testované látky ze skupiny antimitotik a indikuje významný vliv vlastností nebo aktuálního stavu proliferace buněk v nádorovém materiálu. Určitá tendence k tzv. Hormesis modelu - tedy stimulace systému v nízkých koncentracích látky je zřetelná u celé řady cytostatik, avšak nejčastěji se vyskytuje u cytostatik účinných až ve vyšších koncentracích (kortikoidy, Mitoxantron, kyselina betulinová a kyselina beta keto betulinová) (Obr. 2). Statistická významnost těchto závislostí umožňuje jejich analýzu regresním modelem pro získání prahové koncentrace látek (Obr lc). Ačkoli míra projevu stimulace v nízkých dávkách je u jmenovaných cytostatik částečně ovlivněna designem testů (především počtem koncentrací testovaných pod prahovou úrovní látky), samotná přítomnost tohoto typu závislosti může být významným projevem určitého mechanismu účinku (6). Výskyt křivek s vícenásobným průběhem je typický pro účinek karboplatiny, cis-platiny a 5-fluorouracilu (Obr. 2). Tento jev lze Tabulka 3. Minimální doporučená sada parametrů a jejich příspěvek k rozlišení modelových typů křivek dávka-odpověď % buněk přeží- Analýza rovnicí vajících nejvyšší Látka Linie mediánového účinku' koncentraci cytostatika m EC 50 EC 10 (2000µgrml- 1 ) Vinkristin A 549 0,371 1,400 3, ,8 SK MEL 1 0,914-5, ,9 SK ES 0,268 0,017 4, ,2 CEM 0,791 0, ,1 RAMOS 1,945 0,005 1, ,5 Cytosin A 549 0,553 9,030 1/ ,5 arabinosid SK MEL , ,8 SK ES 0,515 5,690 7, ,8 CEM 0,661 0, ,2 RAMOS 0,477 2,512 2, ,7 Actinomycin-D A 549 0,659 0,224 7, ,7 SK MEL 0,952 1,250 1, ,8 SK ES 0,374 0,106 2, ,2 CEM 0,269 1, ,1 RAMOS 0,216 0,028 1, ,6 1 Parametr m představuje odhad sklonu diagnostických přímek získaný na základě rovnice [2]. Odhady hodnot ECx byly realizovány pomocí rovnic [3] a [5] a jsou uvedeny v µg.ml KLINICKÁ ONKOLOGIE ZVLÁŠTNÍ ČlSLO 2/2000
6 u některých cytostatik přiřadit nástupu odlišného mechanismu dokumentuje výstupy diagnostických diagramů, které vedou k příúčinku ve vyšších koncentracích látky. Například deriváty plati- mému odhadu koeficientu m (rovnice [2]) metodou lineární regreny mají ve vyšších koncentracích účinek DNA alkylační, zatím- se. Linearitu diagnostických grafu lze považovat za důkaz platnosti co v nízkých koncentracích významně inhibují telomerázovou rovnice pro analyzované typy křivek (15). U problematických sigaktivitu (5). Podobně je tomu i v případě 5-fluorouracilu, kde tato moidních odpovědí různě rezistentních linií lze linearity dosáhnout látka je na straně jedné známým inhibitorem thymidylátsyntetá- vypuštěním té části křivky, kde cytostatikum ještě nepůsobí zy a na straně druhé vykazuje podobně jako deriváty platiny inhi- "shoulder" - nízké koncentrace) nebo kde již dále neovlivňuje biční aktvitu na enzymový komplex telomerázy (10). V dalších studiích se pokusíme prokázat, zda se jedná o náhodnou koincineodpovídající nebo rezistentní buňky (vysoké koncentrace). Křiv- ky typu Hormesis model lze analyzovat vypuštěním oblasti stidenci dvou faktorů, nebo o kauzální vztah. Vícenásobný průběh mulace v nízkých koncentracích cytostatika a křivky s vícenásobkřivek vázaný na určitou látku odlišuje testy chemorezistence ným průběhem oddělenou analýzou jednotlivých částí. nádorů od klasické toxikologie, kde je takový tvar křivek spíše Metoda vedla velmi efektivně k odhadu hodnot EC 50 (rovnice [3]) vzácný (21,19). Obdobný typ křivek bývá popisován spíše v epi- a jakýchkoli hodnot ECx (rovnice [5]), pokud jich ve svém účindemiologických studiích jako náhlá změna závislosti mezi chro- ku daná látka dosahovala. Vyšší sklon přímek v diagnostických nickou expozicí dávce a rizikem nemoci v okamžiku, kdy se dáv- grafech indikuje vyšší stupeň sigmoidity (Obr. 4a, c), paralelní ka dostane k neznámé prahové hodnotě někdy nazývané průběh přímek je důkazem kvalitativně stejného typu závislosti change-point" - bod zlomu. odstupňovaného pouze stupněm rezistence (Obr. 4b). Analýza Ačkoli křivky se sigmoidním průběhem v souboru jednoznačně pře- opět potvrdila, že heterogenita tvarů křivek dávka - odpověď u tesvažují, v klasické podobě (hodnotitelné standardním regresním tů chemorezistence není dána pouze mechanismem účinku půsomodelem -17; Obr. la) se vyskytují pouze u některých mitotických bicích látek, ale také mírou a typem rezistence nádorových buněk jedů nebo antímetabolitů. U silně rezistentních linií (např. melanom (srov. Obr. 3,4). Z tohoto důvodu není možné klinicky relevant- SK MEL) dochází k modifikacím sigmoidy do podoby nehodnotí- ní parametrizaci založit pouze na odhadovaných hodnotách EC 50 telné běžnou regresí. Rovněž analýza křivek typu Hormesis mode- nebo na libovolném výběru většího množství hodnot ECx. Minilovou regresí (Obr. lc) je závislá na charakteru konkrétní závislos- mální sada parametrů (realizovatelná i v případě testování 6-8 ti a je otázkou zda výstup z modelové rovnice poskytne klinicky koncentrací) musí zahrnovat odhad EC 50 dále údaj o prahové konrelevantní parametry. Vícenásobné křivky dávka - odpověď nejsou centraci látky, který může být nahrazen vhodným odhadem ECx běžnými regresními postupy analyzovatelné a jejich modelová ana- (na zde prezentovaných datech byl jako optimum zvolen parametr lýza (např. dvousegmentovou logistickou regresí -18) neposkytne EC ), a dále odhad podílu buněk přežívajících i nejvyšší aplikoklinicky j asně interprete vatelné parametry. vanou koncentraci dané látky. 10 Tabulka 3 sumarizuje minimální parametrický záznam pro mode- Modelová analýza křivek MTT pomocí rovnice mediánového love typy cytostatik a buněčné linie s výsledkem potvrzujícím účinku závěry primárních analýz (srov. Obr. 3). Jednotlivé skupiny cyto- Rovnice mediánového účinku představuje velmi efektivní meto- statik jsou ve svém účinku různě ovlivňovány vlastnostmi a genedu jednotné analýzy všech pozorovaných typů křivek. Obrázek 4 tickou konstitucí testovaných linií a žádný z navržených parametrů KLINICKÁ ONKOLOGIE ZVLÁŠTNÍ ČÍSLO 2/
7
8 není schopen samostatně popsat všechny existující závislosti. Účinek mitotických jedů (zastoupeny Vinkristinem) nejvíce závisí na vlastnostech nebo aktuálním stavu buněk testované linie. Konkrétně Vinkristin jako látka působící primárně na formování mitotického aparátu může selektovat buňky, které nejsou aktuálně ve stavu mitózy (8). Tento jev se v analýzách projevuje výrazným rozlišením vzorků hodnotami EC 0 i účinností nejvyšších koncentrací, samozřejmě s logickým dopadem na hodnoty EC 50. Reakce vybraných linií na Cytosinarabinosid a Actinomycin D je kvalitativně podobná s různě intenzivním rozlišením v oblasti nízkých nebo vysokých koncentrací (Obr. 3, Tab. 3). Závěr - výhody a specifika techniky mediánového účinku Modelová analýza širokého spektra typů křivek umožňuje konstatovat, že rovnice mediánového účinkuje plně použitelnou technikou pro rutinní parametrizaci všech typů křivek dávka - odpověď vyskytujících se v testech chemorezistence nádorů. Jednoznačně hlavní výhodou doporučené techniky je přímočarý odhad vybraných hodnot ECx založený pouze na realizaci rovnice regresní přímky a umožňující zpětnou grafickou kontrolu. Dalším nesporným argumentem ve prospěch techniky mediánového účinku je nezávislost hodnocení konkrétních dat na mechanismu účinku testovaných látek - zaměření analýzy pouze na cílovou část křivky splňuje požadavky na jednoduchost analýzy. Toto hodnocení lze ovšem kdykoli doplnit regresním modelem vyhovujícím existujícímu vztahu. Rovnice mediánového účinkuje využitelná i pro křivky s menším množstvím testovaných koncentrací, kde je exaktní proložení regresních závislostí problematické - tedy pro rutinní hodnocení testů reálných nádorových vzorků, často limitovaných množstvím biologického materiálu. Jednoduchost diagnostických grafu vykreslujících přímkovou závislost log (F Z /F N ) na logaritmu koncentrací lze využít pro komparativní hodnocení většího množství křivek. Rostoucí hodnota sklonu přímek (parametr m) určuje stupeň sigmoidity závislosti a slouží k přímému odhadu plného spektra hodnot ECx (jsou - li danou látkou dosaženy). Zvláštností dat z testů chemorezistence ve srovnám s literaturou (14,15) je častý výskyt hodnot m < 1, který lze vysvětlit heterogenitou testovaného nádorového materiálu. Sigmoidní nebo hyperbolické průběhy většiny křivek analyzovaných pro tuto studii náhle v určité koncentraci cytostatika konči a vymezují tak pouze reakci té části buněčné populace, která je na látku aktuálně citlivá (i méně než % buněk, Tab. 3). Analýza relativně malého úseku osy Y (podíl přežívajících buněk) tak objektivně nedává dostatečný prostor pro hodnotu sklonu m vyšší než 1. Kdekoli je škála účinku testované látky dostatečně široká, hodnoty m se blíží 1 nebo tuto hranici významně převyšují a indikují tak hyperbolickou až sigmoidní závislost (např. linie RAMOS pod vlivem Vinkristinu, Obr. 3, Tab. 3). Prokazatelná heterogenita rezistence buněk v testovaných vzorcích byla hlavním důvodem k zařazení odhadů EC J0 a podílu buněk přežívajících nejvyšší koncentraci látky do minimální parametrické sady. Poděkování Práce je podpořena projektem MŠMTJ07/ , IGAMZ , MŠMTVZJ14/ a Nadací pro výzkum rakoviny v Olomouci. Literatura 1. Amador GA, Mayerhofer A, Barkte A: Genetics and Luteinizing Hormone Receptors. V: Bartke A., editor. Function of Somatic Cells in the Testis. Springer Verlag: New York, 1994, pp Boone MD: The effect of temperature on the potency of carbaryl for survival of tadpoles of the green frog (Rana clamitans). Env.Tox and Chem 1999:18 (7), Boos DD, Brownie C: Mixture models for continuous data in dose-response studies when some animals are unaffected by treatment. Biometrics 1991:47(4), Bruce WR, Meaker BE, Valeriote FA: Comparison of normal hematopoietic and transplanted lymphoma colony forming cells to chemotherapeutic agets administered in vivo. J Nat Cancer Inst 1966:37, Burger AM, Double JA, Newell DR: Inhibition of telomerase activity by cisplatin in human testicular cancer cells. Eur J Cancer 1997:33, Calabrese EJ, Baldwin LA: Chemical hormesis: its historical foundations as a biological hypothesis. Hum Exp Toxicol 2000:19, Goldie JH, Ling V: The evolution of drug resistance. Can J Oncol 1992:1, Goldie JH, Coldman AJ: Drug Resistance in Cancer. Mechanisms and Models. Cambridge University Press, 1998, Cambridge. 9. Hajduch M, Mihál V, Minafik J, Faber E, Šafářová M, Weigl E, Antálek P: Decreased in vitro chemosensitivity of tumor cells in patients suffering from malignant disease with poor curability. Cytotechnology 1996:18, Ishikawa T, Kamiyama M, Hisatomi H, Ichikawa Y, Momiyama N, Hamaguchi Y, Hasegawa S, Narita T, Shimada H: Telomerase enzyme activity and RNA expression in adriamycin-resistant human breast carcinoma MCF-7 cells. Cancer Lett 1999:141, Chapman PF, Crane M, Wiles JA, Noppert F, Mclndoe EC (Eds): Asking the right questions: ecotoxiclogy and statistics. Society of Environmental Toxicology and Chemistry - Europe. 1995, London. 12. Chapman PF, Crane M, Wiles JA, Noppert F, Mclndoe EC: Improving the quality of statistics in regulatory ecotoxicity tests. Ecotoxicology 1996a:l,l Chapman PM, Caldwell RS, Chapman PF: A warning: NOECs are innappropriate for regulatory use. Environ Toxicol Chem 1996b:l, Chou TC: Comparison of dose-effect relationships of carcinogens following low-dose chronic exposure and high -dose single injection: An analysis by the median-effect principle. Carcinogenesis 1980:1, Chou TC, Talalay P: Analysis of combined drug effects: A new lok at very old problem. Trends in Pharmacol Sci. 1983:4, Kooijman SALM: An alternative for NOEC exists, but the standard model has to be abandoned first. Oikos 1996:75, OECD: Report of the OECD workshop on statistical analysis of aquatic toxicity data, Brauschweig, Germany, October, Organization for Economic Co-operation and Development. 18. Pastor R, Guallar E: Use of two-segmented logistic regression to estimate change-points in epidemiologic studies. Am. J. Epidemiol 1998:148 (7), Schuurmann G, Markert B eds.: Ecotoxicology. Ecological fundamentals, chemical exposure and biological effects. A John Wiley & Sons, 1997, New York. 20. Skipper HE, Schabel FM Jr, Wilcox WS: Experiemental evaluation of potential anti-cancer agents. XTU On the criteriaand kinetics associated with 'Curability' of experiemntal leukemia. Cancer Chemother 1964:35, Yang RSH ed.: Toxicology of Chemical Mixtures. Case Studies, Mechanisms and Novel Approaches. Academic Press, 1994, London. 22. Welp G, Briimmer GW: Toxicity of Increased Amounts of Chemicals and the Dose-Responce Curves for Heterogenous Microbial Populations in Soil. Ecotoxicology and Environmental Safety 1997:37,37-t4. KLINICKÁ ONKOLOGIE ZVLÁŠTNÍ ClSLO 2/
přesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod
přesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod Měření Pb v polyethylenu 36 různými laboratořemi 0,47 0 ± 0,02 1 µmol.g -1 tj. 97,4 ± 4,3 µg.g -1 Měření
7 Regresní modely v analýze přežití
7 Regresní modely v analýze přežití Předpokládané výstupy z výuky: 1. Student rozumí významu regresního modelování dat o přežití 2. Student dokáže definovat pojmy poměr rizik a základní riziková funkce
Metody in silico. stanovení výpočtem
Metody in silico stanovení výpočtem Inovace a rozšíření výuky zaměřené na problematiku životního prostředí na PřF MU (CZ.1.07/2.2.00/15.0213) spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem
vzorek1 0.0033390 0.0047277 0.0062653 0.0077811 0.0090141... vzorek 30 0.0056775 0.0058778 0.0066916 0.0076192 0.0087291
Vzorová úloha 4.16 Postup vícerozměrné kalibrace Postup vícerozměrné kalibrace ukážeme na úloze C4.10 Vícerozměrný kalibrační model kvality bezolovnatého benzinu. Dle následujících kroků na základě naměřených
Urychlení úpravy krvetvorby poškozené cytostatickou terapií (5-fluorouracil a cisplatina) p.o. aplikací IMUNORu
Urychlení úpravy krvetvorby poškozené cytostatickou terapií (5-fluorouracil a cisplatina) p.o. aplikací IMUNORu Úvod Myelosuprese (poškození krvetvorby) patří mezi nejčastější vedlejší účinky chemoterapie.
2 Hlavní charakteristiky v analýze přežití
2 Hlavní charakteristiky v analýze přežití Předpokládané výstupy z výuky: 1. Student umí definovat funkci přežití, rizikovou funkci a kumulativní rizikovou funkci a zná funkční vazby mezi nimi 2. Student
analýzy dat v oboru Matematická biologie
INSTITUT BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita Komplexní přístup k výuce analýzy dat v oboru Matematická biologie Tomáš Pavlík, Daniel Schwarz, Jiří Jarkovský,
Úvod do nonhla-dq genetiky celiakie
Úvod do nonhla-dq genetiky celiakie František Mrázek HLA laboratoř, Ústav Imunologie LF UP a FN Olomouc Celiakie - časté chronické zánětlivé onemocnění tenkého střeva s autoimunitní a systémovou složkou
RNDr. Eva Janoušová doc. RNDr. Ladislav Dušek, Dr.
Analýza dat pro Neurovědy RNDr. Eva Janoušová doc. RNDr. Ladislav Dušek, Dr. Jaro 2014 Institut biostatistiky Janoušová, a analýz Dušek: Analýza dat pro neurovědy Blok 7 Jak hodnotit vztah spojitých proměnných
Hodnocení a modelování populačních dat na příkladu epidemiologie vážných chorob: I. Analýza dat, princip predikcí.
Hodnocení a modelování populačních dat na příkladu epidemiologie vážných chorob: I. Analýza dat, princip predikcí. Úvod do matematické biologie Tomáš Pavlík & O. Májek, L. Dušek, J. Mužík, E. Gelnarová,
Pravděpodobnost v závislosti na proměnné x je zde modelován pomocí logistického modelu. exp x. x x x. log 1
Logistická regrese Menu: QCExpert Regrese Logistická Modul Logistická regrese umožňuje analýzu dat, kdy odezva je binární, nebo frekvenční veličina vyjádřená hodnotami 0 nebo 1, případně poměry v intervalu
Kalibrace a limity její přesnosti
Univerzita Pardubice Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie Licenční studium chemometrie Statistické zpracování dat Kalibrace a limity její přesnosti Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě
Úloha 1: Lineární kalibrace
Úloha 1: Lineární kalibrace U pacientů s podezřením na rakovinu prostaty byl metodou GC/MS měřen obsah sarkosinu v moči. Pro kvantitativní stanovení bylo nutné změřit řadu kalibračních roztoků o různé
Analytické znaky laboratorní metody Interní kontrola kvality Externí kontrola kvality
Analytické znaky laboratorní metody Interní kontrola kvality Externí kontrola kvality RNDr. Alena Mikušková FN Brno Pracoviště dětské medicíny, OKB amikuskova@fnbrno.cz Analytické znaky laboratorní metody
1 Tyto materiály byly vytvořeny za pomoci grantu FRVŠ číslo 1145/2004.
Prostá regresní a korelační analýza 1 1 Tyto materiály byly vytvořeny za pomoci grantu FRVŠ číslo 1145/2004. Problematika závislosti V podstatě lze rozlišovat mezi závislostí nepodstatnou, čili náhodnou
Kalibrace analytických metod
Kalibrace analytických metod Petr Breinek BC_Kalibrace_2010 Měřící zařízení (zjednodušeně přístroje) pro měření fyzikálních veličin musí být výrobci kalibrovaná Objem: pipety Teplota (+37 C definovaná
EKONOMICKÁ APLIKACE KOMPOZIČNÍHO REGRESNÍHO MODELU
EKONOMICKÁ APLIKACE KOMPOZIČNÍHO REGRESNÍHO MODELU Klára Hrůzová 1,2, Karel Hron 1,2 1 Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci 2 Katedra
1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně
Obsah Předmluvy 1. Definice a historie oboru molekulární medicína 1.1. Historie molekulární medicíny 2. Základní principy molekulární biologie 2.1. Historie molekulární biologie 2.2. DNA a chromozomy 2.3.
Grantové projekty řešené OT v současnosti
Grantové projekty řešené OT v současnosti Grantové projekty řešené OT v současnosti GAČR č. P303/12/G163: Centrum interakcí potravních doplňků s léčivy a nutrigenetiky Doc. Doba řešení: 2012-2018 Potravní
Kalibrace a limity její přesnosti
Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Kalibrace a limity její přesnosti Semestrální práce Licenční studium GALILEO Interaktivní statistická analýza dat Brno, 2015
Hodnocení účinku cytostatik a inhibitorů histondeacetylázy na nádorové buňky in vitro
Hodnocení účinku cytostatik a inhibitorů histondeacetylázy na nádorové buňky in vitro T.Groh 1,2, J.Hraběta 1, T.Eckschlager 1 1 Klinika dětské hematologie a onkologie, 2.LF UK a FN Motol a 2 Katedra biochemie
Experimentální biologie Biomedicína
Analýza dat Experimentální biologie Biomedicína INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ Experimentáln lní biologie: modely dávkad vka-odpověď Model regression standards: example pα Y α Estimate of EC A. Výpočet
Zjišťování toxicity látek
Zjišťování toxicity látek 1. Úvod 2. Literární údaje 3. Testy in vitro 4. Testy na zvířatech in vivo 5. Epidemiologické studie 6. Zjišťování úrovně expozice Úvod Je známo 2 10 7 chemických látek. Prostudování
Interaktivní nástroje pro výuku léčebných standardů cytostatické léčby zhoubných nádorů Portál DIOS
Interaktivní nástroje pro výuku léčebných standardů cytostatické léčby zhoubných nádorů Portál DIOS Klimeš D., Dušek L., Kubásek J., Fínek J., Petruželka L., Zoláková A., Vyzula R. Historie projektu Snaha
laboratorní technologie
Kreatinin srovnání metod pro stanovení hladiny v moči D. Friedecký, R. Hušková, P. Chrastina, P. Hornik a T. Adam Kreatinin je jedním z nejčastěji stanovovaných analytů v biochemické laboratoři. V tomto
Přednáška XI. Asociace ve čtyřpolní tabulce a základy korelační analýzy
Přednáška XI. Asociace ve čtyřpolní tabulce a základy korelační analýzy Relativní riziko a poměr šancí Princip korelace dvou náhodných veličin Korelační koeficienty Pearsonůva Spearmanův Korelace a kauzalita
Posouzení linearity kalibrační závislosti
Posouzení linearity kalibrační závislosti Luděk Dohnal Referenční laboratoř pro klinickou biochemii,úkbld 1.LF UK a VFN, Karlovo nám. 32, 12111 Praha 2, ludek.dohnal@lf1.cuni.cz Paul Faigl FCDD, University
Nejistota měření. Thomas Hesse HBM Darmstadt
Nejistota měření Thomas Hesse HBM Darmstadt Prof. Werner Richter: Výsledek měření bez určení nejistoty měření je nejistý, takový výsledek je lépe ignorovat" V podstatě je výsledek měření aproximací nebo
Bezpečnost chemických výrob N Petr Zámostný místnost: A-72a tel.:
Bezpečnost chemických výrob N1111 Petr Zámostný místnost: A-72a tel.: 4222 e-mail: petr.zamostny@vscht.cz Rizika spojená s toxickými látkami Toxicita látek Zákonné limity pro práci s toxickými látkami
Hodnocení populačního přežití pacientů diagnostikovaných s C20 v ČR Projekt Diagnóza C20 - vzdělávání, výzkum a lékařská praxe
Hodnocení populačního přežití pacientů diagnostikovaných s C20 v ČR Projekt Diagnóza C20 - vzdělávání, výzkum a lékařská praxe CZ.2.17/1.1.00/32257 Motivace a cíle přednášky 1. Srovnání 5letého přežití
Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat
Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat Semestrální práce Licenční studium GALILEO Interaktivní statistická analýza
KALIBRACE A LIMITY JEJÍ PŘESNOSTI. Semestrální práce UNIVERZITA PARDUBICE. Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie
UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie KALIBRACE A LIMITY JEJÍ PŘESNOSTI Semestrální práce Licenční studium Galileo Interaktivní statistická analýza dat Brno 2016
Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie licenční studium Management systému jakosti Kalibrace a limity její přesnosti
Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie licenční studium Management systému jakosti Kalibrace a limity její přesnosti Autor: Přednášející: Prof. RNDr. Milan Meloun, DrS 1. VÝPOČET OBSAHU
10. Předpovídání - aplikace regresní úlohy
10. Předpovídání - aplikace regresní úlohy Regresní úloha (analýza) je označení pro statistickou metodu, pomocí nichž odhadujeme hodnotu náhodné veličiny (tzv. závislé proměnné, cílové proměnné, regresandu
Plánování experimentu
Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie licenční studium Management systému jakosti Autor: Ing. Radek Růčka Přednášející: Prof. Ing. Jiří Militký, CSc. 1. LEPTÁNÍ PLAZMOU 1.1 Zadání Proces
Využití a zneužití statistických metod v medicíně
Využití a zneužití statistických metod v medicíně Martin Hynek Gennet, Centre for Fetal Medicine, Prague EuroMISE Centre, First Faculty of Medicine of Charles University in Prague Statistika Existují tři
Zahrnutí alelického dropoutu
Sémantická interoperabilita v biomedicíně a zdravotnictví Mgr. Dalibor Slovák Oddělení medicínské informatiky a biostatistiky, ÚI AV ČR školitelka: Prof. RNDr. Jana Zvárová, DrSc. Ústav hygieny a epidemiologie,
Stanovení manganu a míry přesnosti kalibrace ( Lineární kalibrace )
Příklad č. 1 Stanovení manganu a míry přesnosti kalibrace ( Lineární kalibrace ) Zadání : Stanovení manganu ve vodách se provádí oxidací jodistanem v kyselém prostředí až na manganistan. (1) Sestrojte
Univerzita Pardubice Chemicko-technologická fakulta Katedra analytické chemie
Univerzita Pardubice Chemicko-technologická fakulta Katedra analytické chemie 12. licenční studium PYTHAGORAS Statistické zpracování dat 3.3 Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat Semestrální
Projekt CAMELIA Projekt ALERT
Projekt Alert akutní leukemie klinický registr x Web projektu Diskusní klub projektu Management dat Služby IS Help Zpět Analytické nástroje Prohlížeč dat Expertní služby x Projekt CAMELIA Projekt ALERT
Eva Fišerová a Karel Hron. Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci.
Ortogonální regrese pro 3-složkové kompoziční data využitím lineárních modelů Eva Fišerová a Karel Hron Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci
Aplikace výsledků projektu by měla vést ke zlepšení legislativy Evropské unie v oblasti regulace motorových emisí.
Představení projektu MEDETOX Jan Topinka 1, Michal Vojtíšek 2 1 Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i., jtopinka@biomed.cas.cz ; 2 Technická univerzita v Liberci Předmětem mezioborového projektu MEDETOX
Statistická analýza dat podzemních vod. Statistical analysis of ground water data. Vladimír Sosna 1
Statistická analýza dat podzemních vod. Statistical analysis of ground water data. Vladimír Sosna 1 1 ČHMÚ, OPZV, Na Šabatce 17, 143 06 Praha 4 - Komořany sosna@chmi.cz, tel. 377 256 617 Abstrakt: Referát
Základy biostatistiky II. Veřejné zdravotnictví 3.LF UK - II
Základy biostatistiky II Veřejné zdravotnictví 3.LF UK - II Teoretické rozložení-matematické modely rozložení Naměřená data Výběrové rozložení Teoretické rozložení 1 e 2 x 2 Teoretické rozložení-matematické
Plánování experimentu
SEMESTRÁLNÍ PRÁCE Plánování experimentu 05/06 Ing. Petr Eliáš 1. NÁVRH NOVÉHO VALIVÉHO LOŽISKA 1.1 Zadání Při návrhu nového valivého ložiska se v prvotní fázi uvažovalo pouze o změně designu věnečku (parametr
Kalkulace závažnosti komorbidit a komplikací pro CZ-DRG
Kalkulace závažnosti komorbidit a komplikací pro CZ-DRG Michal Uher a analytický tým projektu DRG Restart Ústav zdravotnických informací a statistiky ČR, Praha Institut biostatistiky a analýzy, Lékařská
ACOUSTIC EMISSION SIGNAL USED FOR EVALUATION OF FAILURES FROM SCRATCH INDENTATION
AKUSTICKÁ EMISE VYUŽÍVANÁ PŘI HODNOCENÍ PORUŠENÍ Z VRYPOVÉ INDENTACE ACOUSTIC EMISSION SIGNAL USED FOR EVALUATION OF FAILURES FROM SCRATCH INDENTATION Petr Jiřík, Ivo Štěpánek Západočeská univerzita v
KALIBRACE. Definice kalibrace: mezinárodní metrologický slovník (VIM 3)
KALIBRACE Chemometrie I, David MILDE Definice kalibrace: mezinárodní metrologický slovník (VIM 3) Činnost, která za specifikovaných podmínek v prvním kroku stanoví vztah mezi hodnotami veličiny s nejistotami
Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie
Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Semestrální práce Licenční studium Galileo Předmět Nelineární regrese Jiří Danihlík Olomouc, 2016 Obsah... 1 Hledání vhodného
O MOŽNOSTI ADJUSTACE IMISNÍCH KONCENTRACÍ NA METEOROLOGICKÉ PODMÍNKY. RNDr. Josef Keder, CSc.
O MOŽNOSTI ADJUSTACE IMISNÍCH KONCENTRACÍ NA METEOROLOGICKÉ PODMÍNKY RNDr. Josef Keder, CSc. Zadání úlohy V souladu s požadavkem zadavatele (MŽP) bude zpracována metodika, umožňující oprostit průměrné
CHOVÁNÍ SILOFUNKCÍ TESTŮ V COXOVĚ MODELU PROPORCIONÁLNÍCH RIZIK
CHOVÁNÍ SILOFUNKCÍ TESTŮ V COXOVĚ MODELU PROPORCIONÁLNÍCH RIZIK Aneta Andrášiková 1, Eva Fišerová 1, Silvie Bělašková 2 1 Univerzita Palackého v Olomouci, PřF, KMaAM 2 Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně,
Oficiální výsledky Národního programu mamografického screeningu v roce 2016
Oficiální výsledky Národního programu mamografického screeningu v roce 2016 Jan Daneš, Miroslava Skovajsová, Helena Bartoňková Analýza dat: Ondřej Májek, Ondřej Ngo, Markéta Kněžínková, Daniel Klimeš,
BUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY
BUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY 1 VÝZNAM BUNĚČNÉ TRANSFORMACE V MEDICÍNĚ Příklad: Buněčná transformace: postupná kumulace genetických změn Nádorové onemocnění: kolorektální karcinom 2 3 BUNĚČNÁ TRANSFORMACE
Vliv IMUNORu na krvetvorbu myší ozářených gama paprsky 60 Co
Vliv IMUNORu na krvetvorbu myší ozářených gama paprsky 6 Co Úvod Ionizující záření je výrazným myelotoxickým činitelem, tedy faktorem, poškozujícím krvetvorbu. Poškození krvetvorby po expozici osob ionizujícímu
HODNOCENÍ POVRCHOVÝCH ZMEN MECHANICKÝCH VLASTNOSTÍ PO ELEKTROCHEMICKÝCH ZKOUŠKÁCH. Klára Jacková, Ivo Štepánek
HODNOCENÍ POVRCHOVÝCH ZMEN MECHANICKÝCH VLASTNOSTÍ PO ELEKTROCHEMICKÝCH ZKOUŠKÁCH Klára Jacková, Ivo Štepánek Západoceská univerzita v Plzni, Univerzitní 22, 306 14 Plzen, CR, ivo.stepanek@volny.cz Abstrakt
Pravděpodobnost a matematická statistika Doc. RNDr. Gejza Dohnal, CSc. dohnal@nipax.cz
Pravděpodobnost a matematická statistika Doc. RNDr. Gejza Dohnal, CSc. dohnal@nipax.cz Pravděpodobnost a matematická statistika Doc. RNDr. Gejza Dohnal, CSc. dohnal@nipax.cz Pravděpodobnost a matematická
Korelační a regresní analýza. 1. Pearsonův korelační koeficient 2. jednoduchá regresní analýza 3. vícenásobná regresní analýza
Korelační a regresní analýza 1. Pearsonův korelační koeficient 2. jednoduchá regresní analýza 3. vícenásobná regresní analýza Pearsonův korelační koeficient u intervalových a poměrových dat můžeme jako
NÁVOD K POUŽITÍ VÁPNÍK 600 KATALOGOVÉ ČÍSLO 207
NÁVOD K POUŽITÍ VÁPNÍK 600 KATALOGOVÉ ČÍSLO 207 POUŽITÍ Souprava Vápník 600 se používá ke kvantitativnímu stanovení koncentrace vápenatých iontů v séru a moči. SOUHRN V lidském organismu je vázána převážná
8 Coxův model proporcionálních rizik I
8 Coxův model proporcionálních rizik I Předpokládané výstupy z výuky: 1. Student umí formulovat Coxův model proporcionálních rizik 2. Student rozumí významu regresních koeficientů modelu 3. Student zná
Statistika. Regresní a korelační analýza Úvod do problému. Roman Biskup
Statistika Regresní a korelační analýza Úvod do problému Roman Biskup Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích Ekonomická fakulta (Zemědělská fakulta) Katedra aplikované matematiky a informatiky 2008/2009
Chyby spektrometrických metod
Chyby spektrometrických metod Náhodné Soustavné Hrubé Správnost výsledku Přesnost výsledku Reprodukovatelnost Opakovatelnost Charakteristiky stanovení 1. Citlivost metody - směrnice kalibrační křivky 2.
Informace o studiu. Životní prostředí a zdraví Matematická biologie a biomedicína. studijní programy pro zdravou budoucnost
Informace o studiu Životní prostředí a zdraví Matematická biologie a biomedicína studijní programy pro zdravou budoucnost Proč RECETOX? Výzkumné centrum RECETOX poskytuje vzdělání v zajímavých oborech
Klasická a robustní ortogonální regrese mezi složkami kompozice
Klasická a robustní ortogonální regrese mezi složkami kompozice K. Hrůzová, V. Todorov, K. Hron, P. Filzmoser 13. září 2016 Kompoziční data kladná reálná čísla nesoucí pouze relativní informaci, x = (x
MÍRY ZÁVISLOSTI (KORELACE A REGRESE)
zhanel@fsps.muni.cz MÍRY ZÁVISLOSTI (KORELACE A REGRESE) 2.5 MÍRY ZÁVISLOSTI 2.5.1 ZÁVISLOST PEVNÁ, VOLNÁ, STATISTICKÁ A KORELAČNÍ Jednorozměrné soubory - charakterizovány jednotlivými statistickými znaky
INDUKTIVNÍ STATISTIKA
10. SEMINÁŘ INDUKTIVNÍ STATISTIKA 3. HODNOCENÍ ZÁVISLOSTÍ HODNOCENÍ ZÁVISLOSTÍ KVALITATIVNÍ VELIČINY - Vychází se z kombinační (kontingenční) tabulky, která je výsledkem třídění druhého stupně KVANTITATIVNÍ
Pravděpodobnost a matematická statistika Doc. RNDr. Gejza Dohnal, CSc.
Pravděpodobnost a matematická statistika Doc. RNDr. Gejza Dohnal, CSc. dohnal@nipax.cz Pravděpodobnost a matematická statistika 010 1.týden (0.09.-4.09. ) Data, typy dat, variabilita, frekvenční analýza
Jana Vránová, 3. lékařská fakulta UK
Jana Vránová, 3. lékařská fakulta UK Vznikají při zkoumání vztahů kvalitativních resp. diskrétních znaků Jedná se o analogii s korelační analýzou spojitých znaků Přitom předpokládáme, že každý prvek populace
Regresní analýza. Eva Jarošová
Regresní analýza Eva Jarošová 1 Obsah 1. Regresní přímka 2. Možnosti zlepšení modelu 3. Testy v regresním modelu 4. Regresní diagnostika 5. Speciální využití Lineární model 2 1. Regresní přímka 3 nosnost
SPRÁVNÁ INTERPRETACE INDIKÁTORŮ KVALITY MAMOGRAFICKÉHO SCREENINGU. Májek, O., Svobodník, A., Klimeš, D.
SPRÁVNÁ INTERPRETACE INDIKÁTORŮ KVALITY MAMOGRAFICKÉHO SCREENINGU Májek, O., Svobodník, A., Klimeš, D. Smysl indikátorů kvality Statisticky významné snížení úmrtnosti lze očekávat až po delší době, posouzení
Analýza dat na PC I.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita Analýza dat na PC I. Popisná analýza v programu Statistica IBA výuka Základní popisná statistika Popisná statistika
OBSAH. Proč monitoring CL. Jaký monitoring CL. Diskuze (?)
www.recetox.cz www.mou.cz Návrh monitoringu cytostatik na pracovištích v ČR www.cytostatika.cz Luděk Bláha, Pavel Odráška, Lenka Doležalová a kol. 14. Kongres Nemocničních lékárníků (listopad 2010, Hradec
TEPELNÉ ZPRACOVÁNÍ NIKLOVÝCH SUPERSLITIN HEAT TREATMENT OF HIGH-TEMPERATURE NICKEL ALLOYS. Božena Podhorná a Jiří Kudrman a Karel Hrbáček b
TEPELNÉ ZPRACOVÁNÍ NIKLOVÝCH SUPERSLITIN HEAT TREATMENT OF HIGH-TEMPERATURE NICKEL ALLOYS Božena Podhorná a Jiří Kudrman a Karel Hrbáček b a UJP PRAHA a.s., Nad Kamínkou 1345, 156 10 Praha Zbraslav, E-mail:
UNIVERZITA PARDUBICE
UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Vedoucí studia a odborný garant: Prof. RNDr. Milan Meloun, DrSc. Vyučující: Prof. RNDr. Milan Meloun, DrSc. Autor práce: ANDRII
C82,C83,C84,C85 - Ne-Hodgkinův lymfom
Report diagnózy C82,C83,C84,C85 - Ne-Hodgkinův lymfom Časový vývoj hrubé incidence a mortality Graf zobrazuje časový vývoj hrubé incidence (počet nových případů na 100000 osob) a hrubé mortality (počet
Kalibrace analytických metod. Miroslava Beňovská s využitím přednášky Dr. Breineka
Kalibrace analytických metod Miroslava Beňovská s využitím přednášky Dr. Breineka Měřící zařízení (zjednodušeně přístroje) pro měření fyzikálních veličin musí být výrobci kalibrovaná Objem: pipety Teplota
23. Matematická statistika
Projekt: Inovace oboru Mechatronik pro Zlínský kraj Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.08/03.0009 23. Matematická statistika Statistika je věda, která se snaží zkoumat reálná data a s pomocí teorii pravděpodobnosti
UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Nám. Čs. Legií 565, Pardubice
UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Nám. Čs. Legií 565, 532 10 Pardubice 10. licenční studium chemometrie STATISTICKÉ ZPRACOVÁNÍ DAT Semestrální práce KALIBRACE
Uni- and multi-dimensional parametric tests for comparison of sample results
Uni- and multi-dimensional parametric tests for comparison of sample results Jedno- a více-rozměrné parametrické testy k porovnání výsledků Prof. RNDr. Milan Meloun, DrSc. Katedra analytické chemie, Universita
KORELACE. Komentované řešení pomocí programu Statistica
KORELACE Komentované řešení pomocí programu Statistica Vstupní data I Data umístěná v excelovském souboru překopírujeme do tabulky ve Statistice a pojmenujeme proměnné, viz prezentace k tématu Popisná
UNIVERZITA PARDUBICE. 4.4 Aproximace křivek a vyhlazování křivek
UNIVERZITA PARDUBICE Licenční Studium Archimedes Statistické zpracování dat a informatika 4.4 Aproximace křivek a vyhlazování křivek Mgr. Jana Kubátová Endokrinologický ústav V Praze, leden 2012 Obsah
The target was to verify hypothesis that different types of seeding machines, tires and tire pressure affect density and reduced bulk density.
INFLUENCE OF TRACTOR AND SEEDING MACHINE WEIGHT AND TIRE PRESSURE ON SOIL CHARACTERISTICS VLIV HMOTNOSTI TRAKTORU A SECÍHO STROJE A TLAKU V PNEUMATIKÁCH NA PŮDNÍ VLASTNOSTI Svoboda M., Červinka J. Department
Semestrální práce. 2. semestr
Licenční studium č. 89002 Semestrální práce 2. semestr PŘEDMĚT 2.2 KALIBRACE A LIMITY JEJÍ PŘESNOSTI Příklad 1 Lineární kalibrace Příklad 2 Nelineární kalibrace Příklad 3 Rozlišení mezi lineární a nelineární
Studium Ekotoxikologie na PřF MU v Brně
Studium Ekotoxikologie na PřF MU v Brně Základní informace RNDr. Jakub Hofman, Ph.D. hofman@recetox.muni.cz Bi0005 Úvod do obecné biologie úterý 19/10, 26/10 a 2/11 v 19 hod Kamenice 5, A11/306 Životní
Bezpečnost chemických výrob N111001
8.11.21 Bezpečnost chemických výrob N1111 Petr Zámostný místnost: A-72a tel.: 4222 e-mail: petr.zamostny@vscht.cz Rizika spojená s toxickými látkami Toxicita látek Zákonné limity pro práci s toxickými
PARAMETRICKÁ STUDIE VÝPOČTU KOMBINACE JEDNOKOMPONENTNÍCH ÚČINKŮ ZATÍŽENÍ
PARAMETRICKÁ STUDIE VÝPOČTU KOMBINACE JEDNOKOMPONENTNÍCH ÚČINKŮ ZATÍŽENÍ Ing. David KUDLÁČEK, Katedra stavební mechaniky, Fakulta stavební, VŠB TUO, Ludvíka Podéště 1875, 708 33 Ostrava Poruba, tel.: 59
Univerzita Pardubice SEMESTRÁLNÍ PRÁCE. Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat. 2015/2016 RNDr. Mgr. Leona Svobodová, Ph.D.
Univerzita Pardubice SEMESTRÁLNÍ PRÁCE Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat 2015/2016 RNDr. Mgr. Leona Svobodová, Ph.D. Úloha Nalezení vhodného modelu pro popis reakce TaqMan real-time PCR
CREEP AUSTENITICKÉ LITINY S KULIČKOVÝM GRAFITEM CREEP OF AUSTENITIC DUCTILE CAST IRON
METAL 9 9... 9, Hradec nad Moravicí CREEP AUSTENITICKÉ LITINY S KULIČKOVÝM GRAFITEM CREEP OF AUSTENITIC DUCTILE CAST IRON Vlasák, T., Hakl, J., Čech, J., Sochor, J. SVUM a.s., Podnikatelská, 9 Praha 9,
PRŮZKUMOVÁ ANALÝZA JEDNOROZMĚRNÝCH DAT Exploratory Data Analysis (EDA)
PRŮZKUMOVÁ ANALÝZA JEDNOROZMĚRNÝCH DAT Exploratory Data Analysis (EDA) Reprezentativní náhodný výběr: 1. Prvky výběru x i jsou vzájemně nezávislé. 2. Výběr je homogenní, tj. všechna x i jsou ze stejného
CYKLICKÁ VRYPOVÁ ZKOUŠKA PRO HODNOCENÍ VÝVOJE PORUŠENÍ A V APROXIMACI ZKOUŠKY OPOTŘEBENÍ. Markéta Podlahová, Ivo Štěpánek, Martin Hrdý
CYKLICKÁ VRYPOVÁ ZKOUŠKA PRO HODNOCENÍ VÝVOJE PORUŠENÍ A V APROXIMACI ZKOUŠKY OPOTŘEBENÍ. Markéta Podlahová, Ivo Štěpánek, Martin Hrdý Západočeská univerzita v Plzni, Univerzitní 22, 306 14 Plzeň, ČR,
VÝZKUM VLASTNOSTÍ SMĚSI TEKBLEND Z HLEDISKA JEJÍHO POUŽITÍ PRO STAVBU ŽEBRA
Vladimír Petroš, VŠB Technická univerzita Ostrava, 17. listopadu 15/2172, 708 33 Ostrava, Poruba, tel.: +420 597325287, vladimir.petros@vsb.cz; Jindřich Šancer, VŠB Technická univerzita Ostrava, 17. listopadu
R.A. Burger, 1 M.F. Brady, 2 J. Rhee, 3 M.A. Sovak, 3 H. Nguyen, 3 M.A. Bookman 4
NEZÁVISLÉ RADIOLOOGICKÉ HODNOCENÍ STUDIE FÁZE III GOG218 S BEVACIZUMABEM (BEV) V PRIMÁRNÍ LÉČBĚ POKROČILÉHO EPITELOVÉHO NÁDORU VAJEČNÍKŮ, PRIMÁRNÍHO NÁDORU PERITONEA NEBO VEJCOVODŮ. R.A. Burger, 1 M.F.
Návrh postupu pro stanovení četnosti překročení 24hodinového imisního limitu pro suspendované částice PM 10
Návrh postupu pro stanovení četnosti překročení 24hodinového imisního limitu pro suspendované částice PM 1 Tento návrh byl vypracován v rámci projektu Technologické agentury ČR č. TA23664 Souhrnná metodika
Mnohobarevná cytometrie v klinické diagnostice
Mnohobarevná cytometrie v klinické diagnostice Mgr. Marcela Vlková, Ph.D. Ústav klinické imunologie a alergologie, FN u sv. Anny v Brně Průtoková cytometrie v klinické laboratoři Relativní a absolutní
Lineární regrese. Komentované řešení pomocí MS Excel
Lineární regrese Komentované řešení pomocí MS Excel Vstupní data Tabulka se vstupními daty je umístěna v oblasti A1:B11 (viz. obrázek) na listu cela data Postup Základní výpočty - regrese Výpočet základních
OSA. maximalizace minimalizace 1/22
OSA Systémová analýza metodika používaná k navrhování a racionalizaci systémů v podmínkách neurčitosti vyšší stupeň operační analýzy Operační analýza (výzkum) soubor metod umožňující řešit rozhodovací,
FAKTOROVÉ PLÁNOVÁNÍ A HODNOCENÍ EXPERIMENTŮ PŘI ÚPRAVĚ VODY
Citace Štrausová K., Dolejš P.: Faktorové plánování a hodnocení experimentů při úpravě vody. Sborník konference Pitná voda 2010, s.95-100. W&ET Team, Č. Budějovice 2010. ISBN 978-80-254-6854-8 FAKTOROVÉ
Terapie hairy-cell leukémie
Terapie hairy-cell leukémie David Belada, II.interní klinika, OKH FN a LF v Hradci Králové Lymfomové fórum 2010 Grand Hotel Bellevue, Vysoké Tatry 12.-14.3.2010 Úvod Poprvé popsána v roce 1958 (Bouroncle
Monitoring složek ŽP - instrumentální analytické metody
Monitoring složek ŽP - instrumentální analytické metody Seznámení se základními principy sledování pohybu polutantů v životním prostředí. Přehled používaných analytických metod. Způsoby monitoringu kvality
Epidemiologie zhoubného novotvaru prostaty (C61) v České republice
Epidemiologie zhoubného novotvaru prostaty (C61) v České republice Mužík J. 1,2, Krejčí D. 1,2, Svobodová I. 1,2, Májek O. 1,2, Jana Prausová 3, Marek Babjuk 1,4, Dušek L. 1,2 1 Institut biostatistiky
Průmyslová ekologie 2010, Žďár n/s
QSAR a QTTR V ODHADU RIZIK EXPOZICE CHEMICKÝM LÁTKÁM (METODY IN SILICO) a A JEJICH VALIDACE Miloň Tichý, Marián Rucki Státní zdravotní ústav, Šrobárova 48, 10042 Praha 10 mtichy@szu.cz Průmyslová ekologie