UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE

Rozměr: px
Začít zobrazení ze stránky:

Download "UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE"

Transkript

1 UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA Katedra buněčné biologie BAKALÁŘSKÁ PRÁCE Role lipidových raftů při průniku adenylátcyklázového toxinu Bordetella pertussis cytoplasmatickou membránou Školitel: Ing. Peter Šebo, CSc. Konzultant: Ing. Tomáš Wald Praha 2010

2 Tato bakalářská práce byla vypracována v Laboratoři molekulární biologie bakteriálních patogenů v Mikrobiologickém ústavu AV ČR. Prohlášení Prohlašuji, že jsem bakalářskou práci vypracovala samostatně pod vedením Ing. Petera Šeba, CSc. a s použitím citované literatury. V Praze dne podpis 2

3 Obsah 1 Seznam zkratek Úvod Cytoplasmatická membrána buněk se zaměřením na fagocyty Membránové mikrodomény Kaveoly Lipidové rafty Bakterie Bordetella pertussis a její interakce s hostitelem Faktory virulence B. pertussis Struktura a funkce CyaA Molekulární mechanismus interakce CyaA s membránou hostitelských buněk a translokace AC domény do cytosolu Mechanismy vstupu dalších toxinů plasmatickou membránou Návrh projektu využití GPI-ukotveného integrinu CD11b/CD18 pro objasnění role transmebránových segmentů receptoru v translokaci AC domény Souhrn Použitá literatura

4 Abstrakt Bordetella pertussis způsobuje u lidí infekční onemocnění černý kašel. Tato gramnegativní bakterie produkuje adenylátcyklázový toxin (CyaA), což je člen rodiny RTX proteinů. Toxin váže CD11b/CD18 integrinový receptor myeloidních fagocytů a dopravuje do jejich cytosolu enzym adenylátcyklázu, která po aktivaci kalmodulinem katalyzuje přeměnu ATP na důležitou signální molekulu camp. Tím dojde k rychlému nárůstu camp uvnitř buňky vedoucímu k narušení mikrobicidní schopnosti fagocytů. Nejnovější výsledky ukazují, že translokace katalytické adenylátcyklázové domény napříč buněčnou membránou probíhá ve dvou krocích. Po úvodní vazbě CyaA na toxinový receptor nastane nejprve toxinem zprostředkovaný vtok vápenatých iontů do buňky, což indukuje přesun toxin-receptorového komplexu do lipidového raftu, kde dojde k translokaci adenylátcyklázové domény přes cytoplasmatickou membránu. Objevením tohoto dvoukrokového mechanismu bylo vytvořeno nové paradigma pro membránovou translokaci toxinů z rodiny RTX. Klíčová slova: Bordetella pertussis, adenylátcyklázový toxin, CyaA, lipidový raft Abstract The bacterium Bordetella pertussis is the causative agent of pertussis or whooping cough. The main virulent factor of this gram-negative bacterium is adenylate cyclase toxin, a member of the RTX protein family. After secretion, the toxin binds to CD11b/CD18 integrin receptor of myeloid phagocytic cells and consequently translocates its adenylate cyclase enzyme (AC) into the cytosol of the host cells. In the cytosol, the AC is activated by calmodulin, followed by rapid conversion of ATP into the signaling molecule camp, resulting in paralysis of bactericidal functions of phagocytic cells. Recently it was shown that translocation of the catalytic AC domain into the cytosol proceeds in two steps. After binding of CyaA to the receptor, the influx of calcium ions into the cell occurs. High local concentration of calcium induces the translocation of the CyaA- CD11b/CD18 complex into the lipid raft, where the translocation of adenylate cyclase enzyme into cytosol occurs. This work is aiming on the description of the new established paradigm dealing with membrane translocation of RTX toxins. Key words: Bordetella pertussis, adenylate cyclase toxin, CyaA, lipid raft 4

5 1 Seznam zkratek AC adenylátcykláza, adenylátcyklázový, -á ACP Acyl-Carrier Protein ACT adenylátcyklázový toxin ADP adenosin-5'-difosfát AK aminokyselina AMP adenosin-5'-monofosfát APC antigen prezentující buňka Asn asparagin Asp kyselina asparagová ATP adenosin-5'-trifosfát bp, bps párů bazí (z angl. base pairs) CaM kalmodulin camp adenosin-3',5'-cyklický monofosfát CTL cytotoxické T-lymfocyty CyaA adenylátcyklasový toxin bakterie Bordetella pertussis CyaC protein zprostředkovávající posttranslační modifikaci ACT DNA kyselina deoxyribonukleová DNT dermonekrotický toxin bakterie Bordetella pertussis EDTA kyselina ethylendiamintetraoctová FHA filamentózní hemaglutinin Gly glycin Ile isoleucin IS imunitní systém KDa kilodalton (jednotka molekulové hmotnosti) Leu leucin LPS lipopolysacharid Ltx leukotoxin z bakterie Actinobacillus actinomycetemcomitans Lys lysin MβCD methyl-β-cyklodextrin MHC hlavní histokompatibilní komplex (z angl. major histocompatibility complex) MK mastná kyselina/mastné kyseliny NK buňky přirozeně zabíječské buňky (z angl. natural killer) PHB prohibitin homology Phe fenylalanin PT pertusový toxin bakterie Bordetella pertussis RTX označení skupiny cytotoxinů (z angl. Repeats in ToXin) SDS dodecylsulfát sodný SDS-PAGE SDS-elektroforéza v polyakrylamidovém gelu TCT tracheální cytotoxin bakterie Bordetella pertussis X jakýkoliv aminokyselinový zbytek 5

6 2 Úvod Bakterie Bordetella pertussis produkuje adenylátcyklázový toxin (ACT, CyaA), který je jedním z hlavních faktorů virulence této bakterie a hraje klíčovou roli ve schopnosti Bordetella pertussis kolonizovat sliznice horních cest dýchacích (Weiss et al., 1986). CyaA je multifunkční protein (má vazebnou, enzymatickou, kanálo-tvornou a lytickou aktivitu), jehož cílovými buňkami jsou makrofágy, dendritické buňky, neutrofilní granulocyty a NK-buňky. CyaA se řadí do skupiny RTX (Repeats in ToXin) proteinů (Welch, 1995). Vazba toxinu na cytoplasmatickou membránu je zprostředkována receptorem CD11b/CD18, který se nachází na povrchu výše zmíněných myeloidních fagocytujících buněk imunitního systému (Guermonprez et al., 2001). CyaA po vazbě na cílovou membránu vytváří jednak kationselektivní kanál a jednak translokuje do cytosolu napadených buněk svoji N-koncovou adenylátcyklázovou (AC) doménu. Translokace nevyžaduje receptorem zprostředkovanou endocytózu (Bellalou et al., 1990, Hanski, 1989). Po aktivaci intracelulárním kalmodulinem katalyzuje AC doména rychlou a nekontrolovatelnou přeměnu ATP na camp, který slouží jako druhý posel buněčné signalizace (Hanski, 1989). Rapidní vzrůst intracelulární koncentrace camp pak vede k narušení signálních drah buňky, což má kromě jiného za následek i narušení baktericidních funkcí efektorových buněk imunitního systému hostitele, projevujících se neschopností fagocytózy a oxidativního vzplanutí (Hanski, 1989). Deplece ATP vede v extrémním případě k nekróze buňky (Basler et al., 2006). Působení toxinu CyaA tak umožňuje bakterii kolonizovat dýchací trakt, množit se a způsobit onemocnění (Benz et al., 1994, Rogel et al., 1992). Nedávno byl zpřesněn mechanismus, jakým CyaA translokuje svou AC doménu do cytosolu cílových buněk. Bylo objeveno, že po vazbě CyaA na receptor CD11b/CD18 hraje důležitou roli přesun komplexu toxin-integrin do lipidové mikrodomény cytoplasmatické membrány. Tyto mikrodomény bohaté na cholesterol a sfingomyelin vytvářejí zřejmě vhodné prostředí pro translokaci CyaA do cytosolu cílových buněk. Klíčovou úlohu v tomto přesunu má vstup vápníku do buňky a reorganizace aktinového cytoskeletu (Bumba et al., 2010, v tisku). V této bakalářské práci bych chtěla shrnout dosavadní poznatky o průniku adenylátcyklázového toxinu bakterie Bordetella pertussis cytoplasmatickou membránou, představit nové poznatky o vlivu membránových lipidových raftů v tomto procesu a porovnat mechanismus průniku s některými dalšími toxiny. 6

7 3 Cytoplasmatická membrána buněk se zaměřením na fagocyty Biologické membrány vytvářejí přirozené bariéry, které oddělují buňku od vnějšího prostředí a umožňují selektivní výměnu látek, iontů a metabolitů mezi vnějším a vnitřním prostředím. U eukaryot jsou na rozdíl od prokaryot membrány i uvnitř buňky, což má za následek kompartmentalizaci cytosolického prostoru do jednotlivých organel. Buněčné membrány jsou tvořeny dvojvrstvou amfipatických lipidických molekul, které se uspořádávají do termodynamicky nejvýhodnějších útvarů vůči vodě. Modelů popisujících strukturu buněčných membrán bylo v minulosti navrženo několik. Ukázkovým příkladem se stal model tekuté mozaiky, který popisuje plasmatickou membránu jako tekutou fázi, ve které se difuzním pohybem volně pohybují molekuly lipidů a bílkovin (Singer et al., 1972). Tento model byl později upraven a rozšířen tak, aby odpovídal novým poznatkům o různých typech membránových lipidů. V současné době je navržen nový model uspořádání biologických membrán, ve kterém se počítá s přítomností tzv. membránových mikrodomén (Simons et al., 1997). Fagocytické buňky (neutrofily, monocyty a jejich tkáňová forma makrofágy, myeloidní dendritické buňky a NK-buňky) na svém povrchu exprimují integrin CD11b/CD18. Tento receptor je rozpoznáván adenylátcyklázovým toxinem Bordetella pertussis (Guermonprez et al., 2001). Integriny tvoří velkou skupinu adhezivních molekul, z nichž některé váží membránové ligandy, jiné komponenty mezibuněčné hmoty. Receptor CD11b/CD18 rozeznává více než třicet ligandů proteinového i neproteinového charakteru. Funkcí integrinů je také zprostředkovat pohyb buněk. Integrin CD11b/CD18 je transmembránový glykoprotein. Skládá se ze dvou nekovalentně asociovaných podjednotek CD11b (α M ) a CD18 (β 2 ) a patří do rodiny β 2 integrinů. Ty se označují jako leukocytární integriny, protože jsou exprimovány pouze na leukocytech. Členy této rodiny jsou CD11a/CD18 (nazývaný též α L β 2, LFA-1), CD11b/CD18 (α M β 2, CR3, Mac- 1, Mo-1), CD11c/CD18 (α x β 2, p150/95) a CD11d/CD18 (α D β 2 ) (Harris et al., 2000). Obě podjednotky integrinu, CD11b i CD18, mají rozsáhlou extracelulární doménu, na kterou navazuje krátký transmembránový úsek a krátká cytosolická část. Vrchol extracelulární domény, a zároveň vazebné místo pro ligand, tvoří I-doména podjednotky CD11b, respektive I-like doména podjednotky CD18. Vazebné místo pro ligand existuje ve dvou konformačních stavech. Je-li integrin v klidovém (neaktivním) stavu, je extracelulární doména ohnutá směrem k membráně. Při přechodu integrinu do aktivovaného stavu se extracelulární doména 7

8 narovnává, a tím dochází k napřímení celého integrinu. Přechod integrinu do aktivovaného stavu je indukován různými stimuly, například vazbou ligandu. Přechodem do aktivovaného stavu dojde ke konformační změně, která způsobí odlišnou vazbu buněčných proteinů na cytosolické části integrinových podjednotek CD11b a CD18. To vede ke spuštění signalizačních kaskád CD11b/CD18 (Hynes, 2002). Přechod integrinu CD11b/CD18 z klidového do aktivovaného stavu znázorňuje model na obrázku 1. Obr. 1: Model přechodu integrinu CD11b/CD18 z klidového do aktivovaného stavu převzato z (Hynes, 2002), upraveno. Integrin CD11b/CD18 je dále schopen v cytoplasmatické membráně buňky interagovat s různými GPI-vázanými proteiny, které postrádají cytosolickou doménu, a poskytnout těmto povrchovým molekulám schopnost transmembránové signalizace (Agramonte-Hevia et al., 2002). 3.1 Membránové mikrodomény Studium lipidových raftů (membránových mikrodomén) začalo poměrně nedávno, když byla objevena schopnost detergentů solubilizovat membránu. Lipidové rafty jsou odolné vůči působení slabých neiontových detergentů (prvně byl použit 1% Triton X-100), a proto byly popsány jako detergent resistentní (insensitivní) či Triton insensitivní membránové domény (DRMs, DIMs, TIMs). Po přidání detergentu k buněčnému homogenátu a centrifugaci na hustotním sacharózovém gradientu dojde k oddělení DRMs od rozpustných složek membrány 8

9 (Jacobson et al., 1999). Oblast raftu, která je tvořená sfingolipidy a cholesterolem je tlustší, než okolní fluidní část plasmatické membrány. Dosud není zcela jasné, jestli je zesílen pouze vnější list membrány v místě raftu nebo i vnitřní list Kaveoly První nehomogenita buněčné membrány byla pozorována již v 50. letech 20. století díky rozvoji elektronové mikroskopie. Jednalo se o tzv. kaveoly (Obr. 2), které se později ukázaly jako typ lipidového raftu (Rothberg et al., 1992). Jsou to drobné jamkovité vchlípeniny o rozměrech nm, které byly doposud nalezeny pouze v plasmatické membráně určitých buněk (Lisanti et al., 1994). Obr. 2: Kaveoly na vnitřní straně plasmatické membrány. Ve výřezu je pro srovnání klatrinový váček. Převzato z (Rothberg et al., 1992). Pro kaveoly je typická přítomnost strukturního proteinu, který se nazývá kaveolin (Razani et al., 2002), a který odpovídá za zakřivení membrány a zformování kaveoly o dané velikosti a tvaru (Obr. 3). C-terminální konec molekuly kaveolinu je posttranslačně modifikován palmitoylací, která pravděpodobně souvisí s lokalizací proteinů do lipidových raftů (podobně jako myristoylace celé řady bílkovin) (Galbiati et al., 1999). N-terminální cytosolická doména kaveolinu může interagovat s jinými proteiny. Tyto proteiny se jednak soustředí v oblasti kaveol, navíc vazba na kaveolin může mít jak aktivační, tak inhibiční vliv na jejich signalizační funkci (Lisanti et al., 1994, Jacobson et al., 1999). Obr. 3: Znázornění strukturního proteinu kaveolinu, který formuje tvar kaveoly. Převzato z (Razani et al., 2002), upraveno. 9

10 3.1.2 Lipidové rafty Pod pojmem lipidové rafty se skrývá širší spektrum membránových struktur, které primárně nepotřebují ke svému utvoření ani kaveolin, ani jiné proteiny. Velikost lipidových raftů je desítky až stovky nm. Lipidy jednotlivých typů jsou schopné se od sebe oddělit a dochází k tzv. laterální segregaci lipidů, čili k oddělení fází, kdy fosfolipidy s dlouhými MK (nasycenými, rovnými) v membráně spontánně asociují. Vytvářejí tak shluky membránových segmentů vykazujících nižší fluiditu membrány (jsou rigidnější). V lipidových raftech se vyskytují specificky sfingolipidy a cholesterol (Ahmed et al., 1997). Sfingolipid je molekula aminoalkoholu (sfingosinu) a jedné MK, která je většinou dlouhá 18 a více uhlíků, a většinou je nasycená. Rovné, nasycené řetězce molekul se vedle sebe srovnají a vytvoří organizovanější strukturu než nenasycené MK. Sfingolipidy byly doposud nalezeny pouze ve vnějším listu plasmatické membrány. Předpokládá se, že vnitřní list raftu je tvořen glycerofosfolipidy, které mají také nasycené rovné dlouhé řetězce (Pike, 2004). Cholesterol je velmi významnou složkou raftů, protože struktura cholesterolu je důležitá pro fyzikální vlastnosti membrány. Díky svému neohebnému heterocyklickému jádru zabraňuje pohybu řetězců mastných kyselin v membráně, a snižuje tak tekutost membrán. Atomy v heterocyklu cholesterolu jsou rigidní a způsobují křehkost membrány, protože neumožňují plasticitu. Cholesterol má dále význam pro tloušťku membrány. Pokud ho vyextrahujeme z buňky, tak se domény rozpadají (Navratil et al., 2003). Proteiny přítomné v lipidových raftech mohou být periferní nebo integrální. Periferní proteiny jsou vázány na povrchu membrány pomocí protein-proteinových, případně proteinlipidových interakcí (Pike, 2004). V membránových doménách jsou soustředěny i rozličné signální systémy, především povrchové receptory, které jsou do plasmatické membrány vázány prostřednictvím glykosylfosfatidylinositolové kotvy (GPI). Přítomnost GPI vázaných bílkovin byla zjištěna hned v počátcích studia lipidových raftů (Jacobson et al., 1999, Lisanti et al., 1994, Stefanova et al., 1991). GPI kotva je jedním ze signálů pro lokalizaci do raftů. Jednotlivé kotvy se mohou lišit typem mastné kyseliny a ukazuje se, že různé typy GPI vázaných bílkovin jsou lokalizovány do různých typů raftů (Pike, 2004). 10

11 4 Bakterie Bordetella pertussis a její interakce s hostitelem Bordetella pertussis je striktně aerobní gramnegativní bakterie, která se přenáší z nakažené osoby na zdravého člověka kapénkovou infekcí. U lidí způsobuje infekční onemocnění horních cest dýchacích - černý nebo též dávivý kašel. Bakterie byla poprvé izolována J. Bordetem a O. Gengou v roce Bordetella pertussis nevstupuje do krevního řečiště a nerozšiřuje se do dalších tkání (Weiss et al., 1986). 4.1 Faktory virulence B. pertussis Bakterie B. pertussis produkuje několik faktorů virulence, díky nimž je schopna unikat aktivní imunitní odpovědi a usídlit se v hostiteli. Faktory virulence lze rozdělit na toxiny a adheziny (Obr. 4). Do skupiny adhezinů (na obrázku znázorněny modře) patří proteiny fimbrií, povrchový protein pertaktin, tracheální kolonizační faktor (TCF) a filamentózní hemaglutinin (FHA). Adheziny zajišťují vazbu bakterie na povrch buněk řasinkového respiračního epitelu a fagocytujících buněk. Druhou skupinou virulenčních faktorů jsou toxiny produkované bakterií (znázorněny červeně a hnědě), kterými jsou pertusový toxin (PT), tracheální cytotoxin (TCT), dermonekrotický toxin (DNT) a adenylátcyklázový toxin (CyaA, ACT) (Weiss et al., 1986). Obr. 4: Faktory virulence gramnegativní bakterie Bordetella pertussis. Převzato a upraveno z (Locht, 2001). 11

12 CyaA se řadí mezi RTX toxiny. RTX proteiny jsou sekretovány celou řadou gramnegativních bakterií, z nichž většina patří mezi lidské, živočišné nebo rostlinné patogeny (Welch, 1995). Označení RTX (Repeats in ToXin) vyplývá ze skutečnosti, že všechny proteiny této skupiny obsahují v C-koncové části molekuly opakující se nonapeptidové sekvence, které jsou schopné vázat Ca 2+. Skupina RTX toxinů zahrnuje cytotoxiny, které jsou dále rozděleny na hemolyziny a leukotoxiny. Hemolyziny jsou schopné lyzovat různé typy eukaryotních buněk, kdežto cílová specifita leukotoxinů je omezena na úzké spektrum buněk imunitního systému. RTX toxiny tvoří v cytoplasmatické membráně cílových buněk póry. Pro jejich biologickou aktivaci je nezbytná posttranslační modifikace mastnou kyselinou (Basar et al., 1999) a přítomnost vápenatých iontů (Welch, 1995). CyaA je sekretován z cytosolu bakterie do prostředí pomocí sekrečního aparátu typu I, který rozpoznává signální sekvenci umístěnou na C-konci proteinu (Rogel et al., 1992). 5 Struktura a funkce CyaA Adenylátcyklázový toxin je multifunkční protein o molekulové hmotnosti 177 kda, který je složen z 1706 aminokyselinových zbytků a je rozdělen na dvě základní funkční domény adenylátcyklázovou a hemolyzinovou (Benz et al., 1994) (Obr. 5). Obr. 5: Schematické znázornění molekuly CyaA. 1) Adenylátcyklázová doména Aminokyselinové zbytky na N-konci CyaA tvoří invazivní katalytickou adenylátcyklázovou doménu, která není součástí žádného z dalších známých RTX toxinů. Tuto doménu je CyaA schopen dopravovat přímo přes cytoplasmatickou membránu do cílových buněk. V bezprostřední blízkosti aminokyselinového zbytku 242 je vazebné místo 12

13 pro kalmodulin, který je zapotřebí pro aktivaci adenylátcyklázy. AC po aktivaci katalyzuje nekontrolovatelnou přeměnu vnitrobuněčného ATP na camp (adenosin-3',5'-cyklický monofosfát) (Hanski, 1989). Enzymatická aktivita AC domény se v cytoplasmě eukaryotických buněk díky vazbě kalmodulinu zvyšuje více než 1000 (Wolff et al., 1980). Tím dochází v buňkách k rychlému nárůstu koncentrace camp (až do 2 mmol/l), což vede k narušení baktericidních funkcí efektorových buněk imunitního systému a k apoptóze makrofágů (Basler et al., 2006). Díky stavu lokální imunosuprese v místě kolonizace patogenem tak dochází k rychlejšímu rozvoji onemocnění (Benz et al., 1994, Rogel et al., 1992). 2) Hemolyzinová doména Druhá, C-koncová část toxinu (AK ) se nazývá RTX hemolyzin a je homologní jak svojí primární strukturou, tak funkcí s ostatními RTX cytolyziny (Weiss et al., 1986). Tato část toxinu zabezpečuje vazbu CyaA s cytoplasmatickou membránou cílových buněk a průnik AC domény do jejich cytosolu (Sakamoto et al., 1992, Benz et al., 1994). RTX hemolyzinová doména obsahuje několik subdomén: a) Hydrofobní doména se nachází mezi aminokyselinovými zbytky a obsahuje několik po sobě jdoucích hydrofobních AK sekvencí vytvářejících transmembránové úseky, které jsou důležité pro tvorbu kation-selektivních kanálů v cytoplasmatické membráně cílových buněk. Transport iontů těmito kanály může vyvolat vstup vody do buněk a může způsobit osmotickou lyzi napadených buněk (Benz et al., 1994, Rogel et al., 1992, Sakamoto et al., 1992). Nicméně ve srovnání s ostatními hemolyziny RTX rodiny je tato hemolytická aktivita CyaA velmi nízká, což naznačuje, že hlavní úloha hemolyzinové části je zprostředkovat dopravu katalytické AC domény do cytosolu cílové buňky (Bellalou et al., 1990). b) Za hydrofobní doménou následuje přibližně 300 AK zbytků dlouhá acylační doména, jejíž C-koncová část je nutná pro posttranslační modifikaci toxinu. CyaA je totiž syntetizován jako inaktivní protoxin a kovalentní modifikace je nutná pro jeho aktivaci. Posttranslační modifikaci zajišťuje bakteriální protein CyaC o velikosti 22 kda. CyaC funguje jako acyltransferáza katalyzující přenos acylu z acyl-acp (Acyl-Carrier Protein) na protoxin (Rogel et al., 1992). Aktivace spočívá v tom, že zbytek kyseliny palmitové je kovalentně navázán prostřednictvím amidové vazby k ε-aminoskupině lysinových zbytků 860 a 983 (Basar et al., 1999). 13

14 c) Na C-koncové části proteinu se nachází mezi aminokyselinovými zbytky doména bohatá na glycin a aspartát, která je složena ze 45 repetitivních sekvencí nonapeptidů typu X-(Leu/Ile/Phe)-X-Gly-Gly-X-Gly-(Asp/Asn)-Asp. Na této doméně jsou vazebná místa pro vápenaté ionty. Vazba Ca 2+ vede k výrazným konformačním změnám v molekule CyaA, které jsou nezbytné jak pro hemolytickou aktivitu, tak pro translokaci katalytické AC domény do buněk (Rogel et al., 1992, Rose et al., 1995). Podle afinity k vápenatým iontům mohou být vazebná místa rozdělena do dvou tříd. Jedny vážou Ca 2+ s vysokou afinitou, prakticky ireversibilně. Jejich obsazení je nutné pro inzerci toxinu do membrány cílových buněk, ale také pro tvorbu iontových kanálů. Druhou třídu tvoří nízkoafinní vazebná místa. Jejich obsazení je nutné pouze pro přenos katalytické AC domény do cytosolu cílových buněk, pro tvorbu iontových kanálů však nikoliv (Rose et al., 1995). d) Poslední část tvoří C-koncový sekreční signál (Weiss et al., 1986, Sebo et al., 1993). 6 Molekulární mechanismus interakce CyaA s membránou hostitelských buněk a translokace AC domény do cytosolu Trojrozměrná struktura CyaA není zatím známa a i detaily mechanismu translokace toxinu přes lipidovou dvojvrstvu buněčných membrán zůstávají stále neobjasněny. Základní mechanismus spočívá v inzerci AC domény do cytoplasmatické membrány pomocí hemolyzinové části toxinu a v její translokaci do cytosolu hostitelské eukaryotní buňky (Bellalou et al., 1990, Sakamoto et al., 1992). CyaA pro prvotní interakci s cílovou membránou zřejmě nepotřebuje žádný specifický receptor. Vazba toxinu je zprostředkovaná pravděpodobně membránovými gangliosidy (Gordon et al., 1989) a glykoproteiny (Morova et al., 2008). Ty by měly umožnit přiblížení hydrofobní domény CyaA dostatečně blízko k lipidické dvojvrstvě s následným zanořením této domény do membrány (Gordon et al., 1989, Rogel et al., 1992). Přichycení přes glykoproteiny a gangliosidy má ale velmi nízkou afinitu. Celý proces vyžaduje strukturní integritu molekuly, kooperaci všech oblastí C-koncové části CyaA, posttranslační modifikaci mastnou kyselinou (palmitoylaci) a fyziologickou koncentraci Ca 2+ (Ladant et al., 1992). Mnohem účinnější je vazba CyaA zprostředkovaná specifickým receptorem CD11b/CD18 (konkrétně vazba na α řetězec tohoto integrinu, popsán výše v kapitole 3.2.). CyaA patří k nemnoha bakteriálním toxinům schopným translokovat svojí enzymatickou adenylátcyklázovou doménu přímo přes plasmatickou membránu do cytosolu 14

15 napadených buněk jiným mechanismem, než po receptorem zprostředkované endocytóze (Bellalou et al., 1990, Hanski, 1989). Pomocnou roli při průniku AC domény CyaA do cytosolu pravděpodobně hraje negativní klidový membránový potenciál, který je na plasmatické membráně většiny eukaryotních buněk. Jeho experimentálně navozené obrácení totiž inhibuje průnik toxinu do cytosolu (Otero et al., 1995). Původní představa o translokaci adenylátcyklázové domény do cytosolu byla taková, že katalytická AC doména proniká do buněk prostřednictvím transmembránového iontového kanálu, který byl vytvořen hydrofobní doménou po zanoření toxinu do membrány (Rogel et al., 1992). Tento předpoklad byl vyvrácen po zjištění průměru vznikajícího membránového póru, který je v rozmezí 0,6-0,8 nm a je striktně selektivní pro malé monovalentní a bivalentní kationty (Benz et al., 1994). Takový průměr kanálu je příliš malý na to, aby jím mohl procházet polypeptidový řetězec, i kdyby byl zcela rozvinutý. Dalším argumentem svědčícím proti průniku AC domény přes iontový kanál jsou výsledky pozorování, které naznačují, že přenos AC domény do buněk je realizován převážně monomery CyaA, zatímco tvorba membránových kanálů vyžaduje oligomerizaci molekul toxinu (Betsou et al., 1993). Je tedy pravděpodobné, že tvorba pórů následuje až po průniku AC domény do buněk, nebo probíhá současně s ním, ale mnohem pomaleji, v důsledku nutnosti oligomerizace CyaA (Otero et al., 1995). Průnik AC domény do buněk i tvorba kation-selektivního póru v membráně jsou tedy dva různé procesy s odlišnými mechanismy (Sakamoto et al., 1992, Osickova et al., 1999, Basler et al., 2007). Hypotéza, že translokace AC domény CyaA nejspíš vůbec nezávisí na schopnosti toxinu tvořit póry, byla upřesněna v letošní publikaci Osičkové a kolektivu. Pomocí mutace byl vytvořen konstrukt, který byl v podstatě neschopný permeabilizovat buňky formováním CyaA pórů a vyvolat únik draslíku, zatímco měl plnou schopnost translokovat AC doménu napříč buněčnou membránou (Osickova et al., 2010). CyaA se vyskytuje ve dvou konformacích a může reagovat s plasmatickou membránou současně dvěma různými způsoby, přičemž obě konformace se váží na receptor CD11b/CD18. První konformací je tzv. translokační prekurzor, který po inzerci do membrány zůstává monomerní a translokuje AC doménu do cytosolu. Současně umožňuje vstup Ca 2+ do buňky. AC doména je po navázání kalmodulinu v cytosolu schopna katalyzovat přeměnu ATP na camp. Druhý prekurzor CyaA (prekurzor póru) v membráně oligomerizuje a tvoří kation-selektivní pór, který způsobuje osmotickou lyzi buňky (Obr. 6). 15

16 Obr. 6: Model interakce CyaA s plasmatickou membránou. Převzato z (Basler et al., 2007), upraveno. Nedávno bylo také ukázáno, že vstup extracelulárního vápníku do buněčného cytosolu je doprovodným jevem translokace AC domény do buněk (Fiser et al., 2007). Současný pracovní model předpovídá, že jak vstup Ca 2+, tak AC translokace využívají stejný amfipatický transmembránový segment (α-helix a α-helix ) v doméně formující pór. Tyto segmenty obsahují dva páry negativně nabitých glutamátových zbytků (Glu 509 /Glu 516 a Glu 570 /Glu 581 ), které kontrolují translokaci pozitivně nabitých AC domén, formaci oligomerních pórů CyaA a kationtovou selektivitu těchto pórů (Basler et al., 2007, Osickova et al., 1999). Substitucí glutamátů prolinovými zbytky dojde ke zničení helixové struktury, což má za následek posun rovnováhy mezi AC translokací a pór formující aktivitou CyaA na buněčné membráně (Basler et al., 2007, Osickova et al., 1999, Vojtova-Vodolanova et al., 2009). Translokaci AC domény lze zcela zablokovat snížením teploty nebo vyvázáním Ca 2+ z extracelulárního prostředí (Rogel et al., 1992, Rose et al., 1995). V současnosti nejnovější práce (Bumba et al., 2010, v tisku) postulovala dvoukrokový mechanismus translokace adenylátcyklázové domény CyaA do fagocytů (zobrazeno na obrázku 7). Ukázala, že v prvním kroku váže CyaA integrinový receptor CD11b/CD18, který je lokalizovaný rovnoměrně po celé membráně, mimo lipidové rafty. Integrin má cytoplasmatickou část podjednotky CD18 svázanou s aktinovým cytoskeletem přes protein talin. Po interakci s receptorem vytvoří CyaA tzv. translokační intermediát, který se zapustí do lipidové dvojvrstvy v buněčné membráně. Částečné pronikání adenylátcyklázové domény do membrány je doprovázeno tvorbou póru a vzniká tak krátkodobě otevřená cesta pro vtok 16

17 Ca 2+ do cytosolu. Vstup extracelulárních vápenatých iontů do buněk indukuje aktivaci Ca 2+ -dependentní proteázy calpain, která je lokalizována v submembránovém kompartmentu, a která štěpí protein talin navázaný na aktinový cytoskelet. Dojde k uvolnění komplexu toxinintegrin z asociace k aktinovému cytoskeletu. Následkem toho se komplex přesunuje do lipidového raftu. Jiné ukládání lipidů a specifické, cholesterolem rozvolněné prostředí raftu umožňuje kompletní translokaci pozitivně nabité AC domény přes buněčnou membránu. Proces je řízen negativním gradientem membránového potenciálu. V souvislosti s cholesterolem bylo také pozorováno, že jeho úbytek z buněčných membrán neměl vliv na úroveň vazby CyaA na CD11b-exprimující buňky, zatímco translokace AC domény napříč lipidovou dvojvrstvou buněčné membrány na obsahu cholesterolu závisela silně (Bumba et al., 2010, v tisku). Jakmile se AC doména ocitne na cytosolické straně buněčné membrány, tak je odstřižena od RTX motivu CyaA pomocí proteázy přítomné uvnitř buňky (Bumba et al., 2010, v tisku). Vazba cytosolického kalmodulinu (CaM) následně aktivuje AC enzym a katalyzuje neregulovanou přeměnu ATP na camp. Nadměrná produkce camp, případně spotřeba ATP, mohou vést k apoptóze nebo až k nekróze buňky. Navíc rušení buněčné signalizace, vyskytující se již při malých koncentracích toxinu (1 ng/ml a méně), efektivně zabraňuje oxidačnímu vzplanutí neutrofilů a fagocytů, a proto umožňuje bakterii přežít a kolonizovat hostitele, jak již bylo popsáno výše. Tyto výsledky umožnily navrhnout nový model mechanismu CyaA a prohloubily chápání jeho role ve virulenci B. pertussis. Obr. 7: Model znázorňující účast lipidového raftu při translokaci CyaA skrz buněčnou membránu. Převzato z (Bumba et al., 2010, v tisku), upraveno. 17

18 7 Mechanismy vstupu dalších toxinů plasmatickou membránou Zdá se, že i další bakteriální proteinové toxiny mohou používat lipidové rafty jako bránu k buněčnému vstupu. Na rozdíl od CyaA, který je schopný asociovat s rafty pouze po vazbě a mobilizaci svého receptoru CD11b/CD18, který není primárně součástí raftů, mohou některé ostatní toxiny využívat jako specifický receptor přímo část raftových komponentů, jako jsou cholesterol, sfingolipidy nebo GPI vázané proteiny (Lafont et al., 2004). Jedním z takových toxinů, který využívá lipidové rafty, je leukotoxin (Ltx) bakterie Actinobacillus actinomycetemcomitans, patřící také do skupiny RTX proteinů. Ltx se váže na integrin LFA-1 (CD11a/CD18), exprimovaný na lidských leukocytech a vyvolává změnu Ca 2+ koncentrace v buňce. Avšak na rozdíl od CyaA, který zajišťuje vstup extracelulárního vápníku do cytoplasmy, tento toxin způsobí po interakci s receptorem uvolnění Ca 2+ z vnitřních buněčných zásobáren (Taichman et al., 1991). To vede opět k aktivaci proteázy calpain, rozštěpení talinu (který kotví receptor k aktinovému cytoskeletu) a k mobilizaci komplexu toxin-integrin do oblastí plasmatické membrány bohatých na cholesterol (lipidových raftů). Asociace Ltx/LFA-1 s lipidovými rafty je zásadní pro buněčnou lyzi, protože rozpuštění raftů pomocí methyl-β-cyklodextrinu (MβCD) zruší schopnost Ltx zabíjet cílové buňky. Cytotoxicita Ltx je obnovena až ve chvíli, kdy je raft rekonstituován (Fong et al., 2006). Dalším toxinem využívajícím lipidové mikrodomény je antraxový toxin produkovaný Bacillus anthracis. Tento toxin vyvolává pohlcení svého receptoru pomocí klatrindependentní endocytózy, která je zprostředkována lipidovými rafty (Abrami et al., 2003). Toxin je složen ze tří podjednotek, které se nazývají edema faktor (EF), letální faktor (LF) a protektivní antigen (PA). Protektivní antigen antraxového toxinu se váže na buněčný receptor ATR (Antrax Toxin Receptor). Po navázání je PA štěpen membránově vázanými proteázami na dvě části, PA63 a PA83. PA63 je stále navázán na ATR a následně endocytován, PA83 zůstává na buněčném povrchu. PA63 může oligomerizovat a tvořit heptametry. Komplex heptamer PA-ATR se začne shlukovat v lipidových raftech. Na heptamer PA se naváže EF a LF, a tento komplex je transportován do endosomu. Nízké ph v endosomu vyvolá konformační změnu PA a tvorbu kanálu, který slouží k doručení EF a LF do cytosolu (Abrami et al., 2003). Edema faktor, což je kalmodulin-dependentní 18

19 adenylátcykláza, způsobuje v cytosolu přeměnu ATP na camp. Podobně jako u CyaA je pro tuto přeměnu nutný extracelulární Ca 2+. Zvýšením koncentrace Ca 2+ v cytosolu dochází k aktivaci eukaryotického kalmodulinu, který je klíčový pro aktivaci adenylátcyklázové aktivity toxinu (Kumar et al., 2002). LF je metaloproteáza, která štěpí všechny MAPK kinázy a je zodpovědná za buněčnou smrt makrofágů (Vitale et al., 1998). Stejně jako v případě CyaA dojede k asociaci antigenu s receptorem mimo raft. Receptor ATR má malou, pokud vůbec nějakou afinitu pro rafty, a tudíž se zdá, že k asociaci s raftem ho přiměje až vazba s heptametrem PA. Uměle navozená změna raftové integrity zabraňuje doručení LF/EF do cytosolu (Abrami et al., 2003). Posledním toxinem, který bych chtěla uvést jako příklad v souvislosti s uplatněním lipidových raftů, je aerolysin produkovaný bakterií Aeromonas hydrophila. Toxin je sekretován jako rozpustný prekurzor proaerolysin, který difunduje směrem k cílové buňce (van der Goot et al., 1993). Proaerolysin se váže na receptor, který je v membráně uchycen prostřednictvím GPI kotvy a vyskytuje se převážně v lipidových raftech, i když byl detekován i mimo tuto oblast (Abrami et al., 1999). Po vazbě na receptor je protoxin aktivován odštěpením terminálního peptidu pomocí proteáz produkovaných bakteriemi (Howard et al., 1985). Vazbou aerolysinu na receptory, které jsou lokalizovány převážně v membránových mikrodoménách, dojde k zakoncentrování toxinu na jednom místě. To má význam hlavně pro oligomerizaci toxinu. Oligomerizací vzniká amfipatický komplex podobný kruhu, který tvoří v membráně pór, kterým dochází k úniku malých molekul a iontů, jako je K + nebo Ca 2+. To vede k poškození membrány a k následné lyzi cílových buněk. Rozrušení mikrodomén brání shlukování toxinu na povrchu buňky a inhibuje oligomerizaci (Abrami et al., 1999). 8 Návrh projektu využití GPI-ukotveného integrinu CD11b/CD18 pro objasnění role transmebránových segmentů receptoru v translokaci AC domény Jak bylo popsáno výše, CyaA se váže s vysokou afinitou na integrinový receptor CD11b/CD18, který vystupuje v buněčné membráně jako zprostředkovatel translokace toxinu. Ale funkční význam transmembránové a cytosolické části integrinového receptoru je doposud neznámý. Je důležité položit otázku, jaká je úloha transmembránové domény pro vazbu CyaA na receptor CD11b/CD18 a vstup toxinu do buňky. 19

20 Bylo předpovězeno, že transmembránový segment CD11b a CD18 podjednotky může interagovat s transmembránovým segmentem CyaA a umožnit tak dočasný vstup vápníku přes buněčnou membránu. Hypotézu, že je transmembránová doména receptoru CD11b/CD18 opravdu potřeba pro vazbu CyaA, lze testovat pomocí variant integrinu, kde bude tato doména nahrazena sekvencí tzv. Decay accelerating factor for komplement (DAF), která signalizuje přichycení proteinu pomocí GPI kotvy v lipidových raftech. S použitím této varianty by bylo možné ověřit, zda je interakce transmembránové části receptoru s transmembránovou částí CyaA potřebná pro průnik CyaA do membrány, translokaci AC domény a tvorbu póru. Stejně tak by bylo možné ověřit přítomnost GPI vázaného integrinu v lipidových raftech pomocí sacharózové gradientové centrifugace a schopnost translokace AC domény do cytosolu. Této problematice bych se chtěla věnovat ve své diplomové práci. 9 Souhrn Ve své bakalářské práci jsem se snažila shrnout dosavadní poznatky o průniku CyaA bakterie Bordetella pertussis cytoplasmatickou membránou, představit nové poznatky o vlivu lipidových raftů v tomto procesu a porovnat mechanismus průniku s některými dalšími toxiny. Jsou to právě lipidové rafty, které hrají klíčovou roli v translokaci AC domény CyaA do cytosolu. Významný pokrok v chápání mechanismu translokace přinesla práce Bumby a kolektivu (Bumba et al., 2010, v tisku). Ta odhalila, že adenylátcyklázový toxin se nejprve naváže na integrin CD11b/CD18, to indukuje vtok extracelulárního vápníku do cytosolu a současně dojde k přesunu komplexu toxin-receptor do lipidového raftu. Významnou složkou lipidových raftů je cholesterol, který díky své struktuře umožní rozvolnění této mikrodomény. Takové prostředí je příznivé pro dokončení translokace AC domény přes buněčnou membránu. Z dalších toxinů využívá podobný mechanismus například Ltx produkovaný bakterií Actinobacillus actinomycetemcomitans, patřící také do RTX rodiny proteinů. Ten však způsobuje uvolnění cytosolického vápníku a nikoliv extracelulárního, jako v případě CyaA. Uvolnění Ca 2+ iontů pak vede ke stejné posloupnosti dějů, jako je tomu u CyaA. Také antraxový toxin bakterie Bacillus anthracis využívá lipidové rafty ke zprostředkování svého toxického účinku. Průnik jeho adenylátcyklázové domény do cytosolu hostitelské buňky je zajištěn klatrin-dependentní endocytózou receptoru ATR, na který je 20

21 prostřednictvím protektivního antigenu tato doména navázána. K endocytóze dochází v oblasti lipidových raftů. Aerolysinový toxin bakterie Aeromonas hydrophila se váže na receptor, který je v membráně uchycen prostřednictvím GPI kotvy. Tato forma uchycení se vyskytuje převážně v lipidových raftech. Vazbou toxinu na receptory, které jsou díky lokalizaci v raftech nahloučeny blízko sebe, dojde k zakoncentrování aerolysinu a usnadnění jeho oligomerizace. Ta je nutná pro tvorbu pórů v membráně, vedoucí k lyzi hostitelských buněk. Vzhledem k tomu, že se doposud nepodařilo zcela objasnit funkční význam transmembránové a cytosolické domény integrinu CD11b/CD18 pro vazbu CyaA na receptor a vstup toxinu do buňky, tak bych se této problematice chtěla věnovat ve své diplomové práci. 21

22 10 Použitá literatura Abrami, L., Liu, S.H., Cosson, P., Leppla, S.H. and van der Goot, F.G. (2003). Anthrax toxin triggers endocytosis of its receptor via a lipid raft-mediated clathrin-dependent process. Journal of Cell Biology 160, Abrami, L. and van der Goot, F.G. (1999). Plasma membrane microdomains act as concentration platforms to facilitate intoxication by aerolysin. Journal of Cell Biology 147, Agramonte-Hevia, J., Gonzalez-Arenas, A., Barrera, D. and Velasco-Velazquez, M. (2002). Gram-negative bacteria and phagocytic cell interaction mediated by complement receptor 3. Fems Immunology and Medical Microbiology 34, Ahmed, S.N., Brown, D.A. and London, E. (1997). On the origin of sphingolipid/cholesterolrich detergent-insoluble cell membranes: Physiological concentrations of cholesterol and sphingolipid induce formation of a detergent-insoluble, liquid-ordered lipid phase in model membranes. Biochemistry 36, Basar, T., Havlicek, V., Bezouskova, S., Halada, P., Hackett, M. and Sebo, P. (1999). The conserved lysine 860 in the additional fatty-acylation site of Bordetella pertussis adenylate cyclase is crucial for toxin function independently of its acylation status. Journal of Biological Chemistry 274, Basler, M., Knapp, O., Masin, J., Fiser, R., Maier, E., Benz, R., et al. (2007). Segments crucial for membrane translocation and pore-forming activity of Bordetella adenylate cyclase toxin. Journal of Biological Chemistry 282, Basler, M., Masin, H., Osicka, R. and Sebo, P. (2006). Pore-forming and enzymatic activities of Bordetella pertussis adenylate cyclase toxin synergize in promoting lysis of monocytes. Infection and Immunity 74, Bellalou, J., Sakamoto, H., Ladant, D., Geoffroy, C. and Ullmann, A. (1990). Deletions affecting hemolytic and toxin activities of Bordetella-pertussis adenylate cyclase. Infection and Immunity 58, Benz, R., Maier, E., Ladant, D., Ullmann, A. and Sebo, P. (1994). Adenylate cyclase toxin (CyaA) of Bordetella pertussis. Evidence for the formation of small ion-permeable channels and comparison with HlyA of Escherichia coli. Journal of Biological Chemistry 269, Betsou, F., Sebo, P. and Guiso, N. (1993). CyaC-mediated activation is important not only for toxic but also for protective activities of Bordetella pertussis adenylate cyclasehemolysin. Infection and Immunity 61, Bumba, L., Masin, J., R., F. and P., S. (2010, v tisku). Bordetella adenylate cyclase toxin mobilizes its β2 integrin receptor into lipid rafts to accomplish translocation across target cell membrane in two steps. PLoS Pathogens. Fiser, R., Masin, J., Basler, M., Krusek, J., Spulakova, V., Konopasek, I. and Sebo, P. (2007). Third activity of Bordetella adenylate cyclase (AC) toxin-hemolysin - Membrane translocation of AC domain polypeptide promotes calcium influx into CD11b(+) monocytes independently of the catalytic and hemolytic activities. Journal of Biological Chemistry 282, Fong, K.P., Pacheco, C.M.F., Otis, L.L., Baranwal, S., Kieba, I.R., Harrison, G., et al. (2006). Actinobacillus actinomycetemcomitans leukotoxin requires lipid microdomains for target cell cytotoxicity. Cellular Microbiology 8, Galbiati, F., Volonte, D., Meani, D., Milligan, G., Lublin, D.M., Lisanti, M.P. and Parenti, M. (1999). The dually acylated NH2-terminal domain of G(i1 alpha) is sufficient to target a green fluorescent protein reporter to caveolin-enriched plasma membrane domains - 22

23 Palmitoylation of caveolin-1 is required for the recognition of dually acylated G- protein alpha subunits in vivo. Journal of Biological Chemistry 274, Gordon, V.M., Young, W.W., Lechler, S.M., Gray, M.C., Leppla, S.H. and Hewlett, E.L. (1989). Adenylate cyclase toxins from Bacillus anthracis and Bordetella pertussis. Different processes for interaction with and entry into target cells. Journal of Biological Chemistry 264, Guermonprez, P., Khelef, N., Blouin, E., Rieu, P., Ricciardi-Castagnoli, P., Guiso, N., et al. (2001). The adenylate cyclase toxin of Bordetella pertussis binds to target cells via the alpha(m)beta(2) integrin (CD11b/CD18). Journal of Experimental Medicine 193, Hanski, E. (1989). Invasive adenylate cyclase toxin of Bordetella pertussis. Trends in Biochemical Sciences 14, Harris, E.S., McIntyre, T.M., Prescott, S.M. and Zimmerman, G.A. (2000). The leukocyte integrins. Journal of Biological Chemistry 275, Howard, S.P. and Buckley, J.T. (1985). Activation of the hole-forming toxin aerolysin by extracellular processing. Journal of Bacteriology 163, Hynes, R.O. (2002). Integrins: Bidirectional, allosteric signaling machines. Cell 110, Jacobson, K. and Dietrich, C. (1999). Looking at lipid rafts? Trends in Cell Biology 9, Kumar, P., Ahuja, N. and Bhatnagar, R. (2002). Anthrax edema toxin requires influx of calcium for inducing cyclic AMP toxicity in target cells. Infection and Immunity 70, Ladant, D., Glaser, P. and Ullmann, A. (1992). Insertional mutagenesis of Bordetella pertussis adenylate cyclase. Journal of Biological Chemistry 267, Lafont, F., Abrami, L. and van der Goot, F.G. (2004). Bacterial subversion of lipid rafts. Current Opinion in Microbiology 7, Lisanti, M.P., Scherer, P.E., Vidugiriene, J., Tang, Z.L., Hermanowskivosatka, A., Tu, Y.H., et al. (1994). Characterization of caveolin-rich membrane domains isolated from an endothelial-rich source: implications for human disease. Journal of Cell Biology 126, Locht, C. (2001). Bordetella pertussis virulence factors. Medecine Et Maladies Infectieuses 31, 20S-28S. Morova, J., Osicka, R., Masin, J. and Sebo, P. (2008). RTX cytotoxins recognize beta(2) integrin receptors through N-linked oligosaccharides. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105, Navratil, A.M., Bliss, S.P., Berghorn, K.A., Haughian, J.M., Farmerie, T.A., Graham, J.K., et al. (2003). Constitutive localization of the gonadotropin-releasing hormone (GnRH) receptor to low density membrane microdomains is necessary for GnRH signaling to ERK. Journal of Biological Chemistry 278, Osickova, A., Masin, J., Fayolle, C., Krusek, J., Basler, M., Pospisilova, E., et al. (2010). Adenylate cyclase toxin translocates across target cell membrane without forming a pore. Molecular Microbiology 75, Osickova, A., Osicka, R., Maier, E., Benz, R. and Sebo, P. (1999). An amphipathic alphahelix including glutamates 509 and 516 is crucial for membrane translocation of adenylate cyclase toxin and modulates formation and cation selectivity of its membrane channels. Journal of Biological Chemistry 274, Otero, A.S., Yi, X.B., Gray, M.C., Szabo, G. and Hewlett, E.L. (1995). Membrane depolarization prevents cell invasion by Bordetella pertussis adenylate cyclase toxin. Journal of Biological Chemistry 270,

24 Pike, L.J. (2004). Lipid rafts: heterogeneity on the high seas. Biochemical Journal 378, Razani, B., Woodman, S.E. and Lisanti, M.P. (2002). Caveolae: From cell biology to animal physiology. Pharmacological Reviews 54, Rogel, A. and Hanski, E. (1992). Distinct steps in the penetration of adenylate cyclase toxin of Bordetella pertussis into sheep erythrocytes. Translocation of the toxin across the membrane. Journal of Biological Chemistry 267, Rose, T., Sebo, P., Bellalou, J. and Ladant, D. (1995). Interaction of Calcium with Bordetella pertussis Adenylate Cyclase Toxin. Journal of Biological Chemistry 270, Rothberg, K.G., Heuser, J.E., Donzell, W.C., Ying, Y.S., Glenney, J.R. and Anderson, R.G.W. (1992). Caveolin, a protein component of caveolae membrane coats. Cell 68, Sakamoto, H., Bellalou, J., Sebo, P. and Ladant, D. (1992). Bordetella pertussis adenylate cyclase toxin. Structural and functional independence of the catalytic and hemolytic activities. Journal of Biological Chemistry 267, Sebo, P. and Ladant, D. (1993). Repeat sequences in the Bordetella pertussis adenylate cyclase toxin can be recognized as alternative carboxy-proximal secretion signals by the Escherichia coli alpha-haemolysin translocator. Molecular Microbiology 9, Simons, K. and Ikonen, E. (1997). Functional rafts in cell membranes. Nature 387, Singer, S.J. and Nicolson, G.L. (1972). The fluid mosaic model of the structure of cell membranes. Science 175, Stefanova, I., Horejsi, V., Ansotegui, I.J., Knapp, W. and Stockinger, H. (1991). GPIanchored cell-surface molecules complexed to protein tyrosine kinases. Science 254, Taichman, N.S., Iwase, M., Lally, E.T., Shattil, S.J., Cunningham, M.E. and Korchak, H.M. (1991). Early changes in cytosolic calcium and membrane potential induced by Actinobacillus actinomycetemcomitans leukotoxin in susceptible and resistant target cells. Journal of Immunology 147, van der Goot, F.G., Ausio, J., Wong, K.R., Pattus, F. and Buckley, J.T. (1993). Dimerization stabilizes the pore-forming toxin aerolysin in solution. Journal of Biological Chemistry 268, Vitale, G., Pellizzari, R., Recchi, C., Napolitani, G., Mock, M. and Montecucco, C. (1998). Anthrax lethal factor cleaves the N-terminus of MAPKKs and induces tyrosine/threonine phosphorylation of MAPKs in cultured macrophages. Biochemical and Biophysical Research Communications 248, Vojtova-Vodolanova, J., Basler, M., Osicka, R., Knapp, O., Maier, E., Cerny, J., et al. (2009). Oligomerization is involved in pore formation by Bordetella adenylate cyclase toxin. Faseb Journal 23, Weiss, A.A. and Hewlett, E.L. (1986). Virulence factors of Bordetella pertussis. Annual Review of Microbiology 40, Welch, R.A. (1995) Phylogenetic analyses of the RTX toxin family, pp Wolff, J., Cook, G.H., Goldhammer, A.R. and Berkowitz, S.A. (1980). Calmodulin activates prokaryotic adenylate cyclase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America-Biological Sciences 77,

9. Lipidy a biologické membrány

9. Lipidy a biologické membrány Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 9. Lipidy a biologické membrány Ivo Frébort Buněčné membrány Jádro buňky Golgiho aparát Funkce buněčných membrán Bariéry vůči toxickým látkám Pomáhají akumulovat

Více

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ BIOMEMRÁNA BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA - všechny buňky na povrchu plazmatickou membránu - Prokaryontní buňky (viry, bakterie, sinice) - Eukaryontní buňky vnitřní členění do soustavy membrán KOMPARTMENTŮ - za

Více

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 2. Posttranslační modifikace a skládání proteinů Ivo Frébort Biosyntéza proteinů Kovalentní modifikace proteinů Modifikace proteinu může nastat předtím než je

Více

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 2. Posttranslační modifikace a skládání proteinů Ivo Frébort Biosyntéza proteinů Kovalentní modifikace proteinů Modifikace proteinu může nastat předtím než je

Více

Struktura a funkce biomakromolekul

Struktura a funkce biomakromolekul Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 10. Struktury signálních komplexů Ivo Frébort Typy hormonů Steroidní hormony deriváty cholesterolu, regulují metabolismus, osmotickou rovnováhu, sexuální funkce

Více

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Katedra buněčné biologie Studijní obor: Imunologie DIPLOMOVÁ PRÁCE Adenylátcyklázový toxin Bordetella pertussis jako marker pro studium endocytózy komplementového

Více

Antigeny. Hlavní histokompatibilitní komplex a prezentace antigenu

Antigeny. Hlavní histokompatibilitní komplex a prezentace antigenu Antigeny Hlavní histokompatibilitní komplex a prezentace antigenu Antigeny Antigeny: kompletní (imunogen) - imunogennost - specificita nekompletní (hapten) - specificita antigenní determinanty (epitopy)

Více

Interakce adenylát cyklasového toxinu s komplementovým receptorem 3 Vztah struktury a funkce

Interakce adenylát cyklasového toxinu s komplementovým receptorem 3 Vztah struktury a funkce UNIVERZITA KARLOVA Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie DOKTORSKÁ DISERTAČNÍ PRÁCE 2008 Jana Morová UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie DOKTORSKÁ DISERTAČNÍ PRÁCE Interakce

Více

Specifická imunitní odpověd. Veřejné zdravotnictví

Specifická imunitní odpověd. Veřejné zdravotnictví Specifická imunitní odpověd Veřejné zdravotnictví MHC molekuly glykoproteiny exprimovány na všech jaderných buňkách (MHC I) nebo jenom na antigen prezentujících buňkách (MHC II) u lidí označovány jako

Více

PREZENTACE ANTIGENU A REGULACE NA ÚROVNI Th (A DALŠÍCH) LYMFOCYTŮ PREZENTACE ANTIGENU

PREZENTACE ANTIGENU A REGULACE NA ÚROVNI Th (A DALŠÍCH) LYMFOCYTŮ PREZENTACE ANTIGENU PREZENTACE ANTIGENU A REGULACE NA ÚROVNI Th (A DALŠÍCH) LYMFOCYTŮ PREZENTACE ANTIGENU Podstata prezentace antigenu (MHC restrikce) byla objevena v roce 1974 V současnosti je zřejmé, že to je jeden z klíčových

Více

Z meče pluh. Aneb od toxinu manipulujícího imunitní odpovědí k nástroji pro imunology. P. Šebo MBÚ AV ČR sebo@biomed.cas.cz

Z meče pluh. Aneb od toxinu manipulujícího imunitní odpovědí k nástroji pro imunology. P. Šebo MBÚ AV ČR sebo@biomed.cas.cz Sebolab 2011/12 Z meče pluh Aneb od toxinu manipulujícího imunitní odpovědí k nástroji pro imunology P. Šebo MBÚ AV ČR sebo@biomed.cas.cz OBECNĚ: Baktérie byly na Zemi ~3,5 miliardy let před námi Vyvíjely

Více

Výskyt MHC molekul. RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. ajor istocompatibility omplex. Funkce MHC glykoproteinů

Výskyt MHC molekul. RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. ajor istocompatibility omplex. Funkce MHC glykoproteinů RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie, PřF UP Olomouc = ajor istocompatibility omplex Skupina genů na 6. chromozomu (u člověka) Kódují membránové glykoproteiny, tzv. MHC molekuly, MHC molekuly

Více

TRANSPORT PŘES MEMBRÁNY, MEMBRÁNOVÝ POTENCIÁL, OSMÓZA

TRANSPORT PŘES MEMBRÁNY, MEMBRÁNOVÝ POTENCIÁL, OSMÓZA TRANSPORT PŘES MEMBRÁNY, MEMBRÁNOVÝ POTENCIÁL, OSMÓZA 1 VÝZNAM TRANSPORTU PŘES MEMBRÁNY V MEDICÍNĚ Příklad: Membránový transportér: CFTR (cystic fibrosis transmembrane regulator) Onemocnění: cystická fibróza

Více

Struktura a funkce biomakromolekul

Struktura a funkce biomakromolekul Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 4. Membránové proteiny Ivo Frébort Lipidová dvojvrstva Biologické membrány Integrální membránové proteiny Transmembránové proteiny Kovalentně ukotvené membránové

Více

Přírodní polymery proteiny

Přírodní polymery proteiny Přírodní polymery proteiny Funkční úloha bílkovin 1. Funkce dynamická transport kontrola metabolismu interakce (komunikace, kontrakce) katalýza chemických přeměn 2. Funkce strukturální architektura orgánů

Více

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ REGULACE APOPTÓZY 1 VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ Příklad: Regulace apoptózy: protein p53 je klíčová molekula regulace buněčného cyklu a regulace apoptózy Onemocnění: více než polovina (70-75%) nádorů

Více

PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY

PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY 1 VÝZNAM MEMBRÁNOVÝCH RECEPTORŮ V MEDICÍNĚ Příklad: Membránové receptory: adrenergní receptory (receptory pro adrenalin a noradrenalin) Funkce: zprostředkování

Více

Systém HLA a prezentace antigenu. Ústav imunologie UK 2.LF a FN Motol

Systém HLA a prezentace antigenu. Ústav imunologie UK 2.LF a FN Motol Systém HLA a prezentace antigenu Ústav imunologie UK 2.LF a FN Motol Struktura a funkce HLA historie struktura HLA genů a molekul funkce HLA molekul nomenklatura HLA systému HLA asociace s nemocemi prezentace

Více

Komplementový systém a nespecifická imunita. Jana Novotná Ústav lékařské chemie a biochemie 2 LF UK

Komplementový systém a nespecifická imunita. Jana Novotná Ústav lékařské chemie a biochemie 2 LF UK Komplementový systém a nespecifická imunita Jana Novotná Ústav lékařské chemie a biochemie 2 LF UK IMUNITA = OBRANA 1. Rozpoznání vlastní a cizí 2. Specifičnost imunitní odpovědi 3. Paměť zachování specifických

Více

Funkce imunitního systému

Funkce imunitního systému Téma: 22.11.2010 Imunita specifická nespecifická,, humoráln lní a buněč ěčná Mgr. Michaela Karafiátová IMUNITA je soubor vrozených a získaných mechanismů, které zajišťují obranyschopnost (rezistenci) jedince

Více

Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat

Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat Biologie buňky 1665 - Robert Hook (korek, cellulae = buňka) Cytologie - věda zabývající se studiem buňek Buňka ozákladní funkční a stavební jednotka živých organismů onejmenší známý uspořádaný dynamický

Více

Univerzita Karlova v Praze - 1. lékařská fakulta. Buňka. Ústav pro histologii a embryologii

Univerzita Karlova v Praze - 1. lékařská fakulta. Buňka. Ústav pro histologii a embryologii Univerzita Karlova v Praze - 1. lékařská fakulta Buňka. Stavba a funkce buněčné membrány. Transmembránový transport. Membránové organely, buněčné kompartmenty. Ústav pro histologii a embryologii Doc. MUDr.

Více

PŘENOS SIGNÁLU V BUŇCE. Nela Pavlíková

PŘENOS SIGNÁLU V BUŇCE. Nela Pavlíková PŘENOS SIGNÁLU V BUŇCE Nela Pavlíková nela.pavlikova@lf3.cuni.cz Odpovědi na otázky Co za ligand aktivuje receptor spřažený s G-proteinem obsahující podjednotku α T? Opsin. Co prochází otevřenými CNGC

Více

Svoluji k zapůjčení své diplomové práce ke studijním účelům a prosím, aby byla vedena přesná evidence vypůjčovatelů. Převzaté údaje je vypůjčovatel

Svoluji k zapůjčení své diplomové práce ke studijním účelům a prosím, aby byla vedena přesná evidence vypůjčovatelů. Převzaté údaje je vypůjčovatel Svoluji k zapůjčení své diplomové práce ke studijním účelům a prosím, aby byla vedena přesná evidence vypůjčovatelů. Převzaté údaje je vypůjčovatel povinen řádně ocitovat. UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká

Více

Struktura a funkce biomakromolekul

Struktura a funkce biomakromolekul Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 3. Enzymy a proteinové motory Ivo Frébort Enzymová katalýza Mechanismy enzymové katalýzy o Ztráta entropie při tvorbě komplexu ES odestabilizace komplexu ES

Více

STRUKTURNÍ SKUPINY ADHEZIVNÍCH MOLEKUL

STRUKTURNÍ SKUPINY ADHEZIVNÍCH MOLEKUL STRUKTURNÍ SKUPINY ADHEZIVNÍCH MOLEKUL - INTEGRINY LIGANDY) - SELEKTINY (SACHARIDOVÉ LIGANDY) - ADHEZIVNÍ MOLEKULY IMUNOGLOBULINOVÉ SKUPINY - MUCINY (LIGANDY SELEKTIN - (CD5, CD44, SKUPINA TNF-R AJ.) AKTIVACE

Více

9. Lipidy a biologické membrány

9. Lipidy a biologické membrány Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 9. Lipidy a biologické membrány Ivo Frébort Buněčné membrány Jádro buňky Golgiho aparát Funkce buněčných membrán Bariéry vůči toxickým látkám Pomáhají akumulovat

Více

5. Lipidy a biomembrány

5. Lipidy a biomembrány 5. Lipidy a biomembrány Obtížnost A Co je chybného na často slýchaném konstatování: Biologická membrána je tvořena dvojvrstvou fosfolipidů.? Jmenujte alespoň tři skupiny látek, které se podílejí na výstavbě

Více

Bílkoviny a rostlinná buňka

Bílkoviny a rostlinná buňka Bílkoviny a rostlinná buňka Bílkoviny Rostliny --- kontinuální diferenciace vytváření orgánů: - mitotická dělení -zvětšování buněk a tvorba buněčné stěny syntéza bílkovin --- fotosyntéza syntéza bílkovin

Více

Proteiny Genová exprese. 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D.

Proteiny Genová exprese. 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D. Proteiny Genová exprese 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D. Bílkoviny (proteiny), 15% 1g = 17 kj Monomer = aminokyseliny aminová skupina karboxylová skupina α -uhlík postranní řetězec Znát obecný vzorec

Více

2) Vztah mezi člověkem a bakteriemi

2) Vztah mezi člověkem a bakteriemi INFEKCE A IMUNITA 2) Vztah mezi člověkem a bakteriemi 3) Normální rezistence k infekci Infekční onemocnění je nejčastější příčina smrti na světě 4) Faktory ovlivňující vážnost infekce 1. Patogenní faktory

Více

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován

Více

IMUNOGENETIKA I. Imunologie. nauka o obraných schopnostech organismu. imunitní systém heterogenní populace buněk lymfatické tkáně lymfatické orgány

IMUNOGENETIKA I. Imunologie. nauka o obraných schopnostech organismu. imunitní systém heterogenní populace buněk lymfatické tkáně lymfatické orgány IMUNOGENETIKA I Imunologie nauka o obraných schopnostech organismu imunitní systém heterogenní populace buněk lymfatické tkáně lymfatické orgány lymfatická tkáň thymus Imunita reakce organismu proti cizorodým

Více

Mendělejevova tabulka prvků

Mendělejevova tabulka prvků Mendělejevova tabulka prvků V sušině rostlin je obsaženo přibližně 45% uhlíku, 42% kyslíku, 6,5% vodíku, 1,5% dusíku a 5% minerálních prvků. Tzv. organogenní prvky (C, O, H, N) představují tedy 95% veškerých

Více

VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ

VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ FUNKCE PROTEINŮ 1 VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ Příklad: protein: dystrofin onemocnění: Duchenneova svalová dystrofie 2 3 4 FUNKCE PROTEINŮ: 1. Vztah struktury a funkce proteinů 2. Rodiny proteinů

Více

rní tekutinu (ECF), tj. cca 1/3 celkového množstv

rní tekutinu (ECF), tj. cca 1/3 celkového množstv Představují tzv. extracelulárn rní tekutinu (ECF), tj. cca 1/3 celkového množstv ství vody v tělet (voda tvoří 65-75% váhy v těla; t z toho 2/3 vody jsou vázanv zané intracelulárn rně) Lymfa (míza) Tkáňový

Více

Intracelulární Ca 2+ signalizace

Intracelulární Ca 2+ signalizace Intracelulární Ca 2+ signalizace Vytášek 2009 Ca 2+ je universální intracelulární signalizační molekula (secondary messenger), která kontroluje řadu buměčných metabolických a vývojových cest intracelulární

Více

Eva Benešová. Dýchací řetězec

Eva Benešová. Dýchací řetězec Eva Benešová Dýchací řetězec Dýchací řetězec Během oxidace látek vstupujících do různých metabolických cyklů (glykolýza, CC, beta-oxidace MK) vznikají NADH a FADH 2, které následně vstupují do DŘ. V DŘ

Více

Protinádorová imunita. Jiří Jelínek

Protinádorová imunita. Jiří Jelínek Protinádorová imunita Jiří Jelínek Imunitní systém vs. nádor l imunitní systém je poslední přirozený nástroj organismu jak eliminovat vlastní buňky které se vymkly kontrole l do boje proti nádorovým buňkám

Více

Lodish et al, Molecular Cell Biology, 4-6 vydání Alberts et al, Molecular Biology of the Cell, 4 vydání

Lodish et al, Molecular Cell Biology, 4-6 vydání Alberts et al, Molecular Biology of the Cell, 4 vydání Lodish et al, Molecular Cell Biology, 4-6 vydání Alberts et al, Molecular Biology of the Cell, 4 vydání http://web.natur.cuni.cz/~zdenap/zdenateachingnf.html CHEMICKÉ SLOŽENÍ BUŇKY BUŇKA: 99 % C, H, N,

Více

Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.

Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I. Toxikodynamika toxikodynamika (řec. δίνευω = pohánět, točit) interakce xenobiotika s cílovým místem (buňkou, receptorem) biologická odpověď jak xenobiotikum působí na organismus toxický účinek nespecifický

Více

MEMBRÁNOVÉ STRUKTURY EUKARYONTNÍCH BUNĚK

MEMBRÁNOVÉ STRUKTURY EUKARYONTNÍCH BUNĚK MEMBRÁNOVÉ STRUKTURY EUKARYONTNÍCH BUNĚK PLASMATICKÁ MEMBRÁNA EUKARYOTICKÝCH BUNĚK Všechny buňky (prokaryotické a eukaryotické) jsou ohraničeny membránami zajišťujícími integritu a funkci buněk Ochrana

Více

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová Struktura proteinů - testík na procvičení Vladimíra Kvasnicová Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová c) kyselina acetoctová d) kyselina glutamová Mezi proteinogenní

Více

Metabolismus bílkovin. Václav Pelouch

Metabolismus bílkovin. Václav Pelouch ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE 2004 Metabolismus bílkovin Václav Pelouch kapitola ve skriptech - 3.2 Výživa Vyvážená strava člověka musí obsahovat: cukry (50 55 %) tuky (30 %) bílkoviny (15 20 %)

Více

Hemoglobin a jemu podobní... Studijní materiál. Jan Komárek

Hemoglobin a jemu podobní... Studijní materiál. Jan Komárek Hemoglobin a jemu podobní... Studijní materiál Jan Komárek Bioinformatika Bioinformatika je vědní disciplína, která se zabývá metodami pro shromážďování, analýzu a vizualizaci rozsáhlých souborů biologických

Více

Obranné mechanismy člověka a jejich role v průběhu infekčních onemocnění

Obranné mechanismy člověka a jejich role v průběhu infekčních onemocnění Obranné mechanismy člověka a jejich role v průběhu infekčních onemocnění Obranu proti infekci zajišťuje imunitní systém Při infekci dochází ke střetu dvou živých organismů mikroba a hostitele Mikroorganismy

Více

INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II

INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II 1 VÝZNAM INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE V MEDICÍNĚ Příklad: Intracelulární signalizace: aktivace Ras proteinu (aktivace receptorové kinázy aktivace Ras aktivace kinázové kaskády

Více

Interakce buněk s mezibuněčnou hmotou. B. Dvořánková

Interakce buněk s mezibuněčnou hmotou. B. Dvořánková Interakce buněk s mezibuněčnou hmotou B. Dvořánková Obsah přednášky Buňka a její organely Extracelulární matrix Interakce buněk s ECM i navzájem Kultivace buněk in vitro Buněčné jádro Alberts: Molecular

Více

ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE

ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE Základní funkce imunitního systému Chrání integritu organizmu proti škodlivinám zevního a vnitřního původu: chrání organizmus proti patogenním mikroorganizmům a jejich

Více

Imunitní systém.

Imunitní systém. Imunitní systém Karel.Holada@LF1.cuni.cz Klíčová slova Imunitní systém Antigen, epitop Nespecifická, vrozená Specifická, adaptivní Buněčná a humorální Primární a sekundární lymfatické orgány Myeloidní

Více

Rostlinná cytologie. Přednášející: RNDr. Jindřiška Fišerová, Ph.D. Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK

Rostlinná cytologie. Přednášející: RNDr. Jindřiška Fišerová, Ph.D. Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK Rostlinná cytologie MB130P30 Přednášející: RNDr. Kateřina Schwarzerová,PhD. RNDr. Jindřiška Fišerová, Ph.D. Přijďte na katedru experimentální biologie rostlin vypracovat svou bakalářskou nebo diplomovou

Více

BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ

BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ SPOLEČNÉ ZNAKY ŽIVÉHO - schopnost získávat energii z živin pro své životní potřeby - síla aktivně odpovídat na změny prostředí - možnost růstu, diferenciace a reprodukce

Více

Prokaryotická X eukaryotická buňka. Hlavní rozdíl organizace genetického materiálu (u prokaryot není ohraničen)

Prokaryotická X eukaryotická buňka. Hlavní rozdíl organizace genetického materiálu (u prokaryot není ohraničen) Prokaryotická X eukaryotická buňka Hlavní rozdíl organizace genetického materiálu (u prokaryot není ohraničen) Cytoplazmatická membrána osemipermeabilní ofosfolipidy, bílkoviny otransport látek, receptory,

Více

Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin. doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie

Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin. doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 1. 20 aminokyselin, kódovány standardním genetickým kódem, proteinogenní, stavebními

Více

Svoluji k zapůjčení své diplomové práce ke studijním účelům a prosím, aby byla vedena přesná evidence vypůjčovatelů. Převzaté údaje je vypůjčovatel

Svoluji k zapůjčení své diplomové práce ke studijním účelům a prosím, aby byla vedena přesná evidence vypůjčovatelů. Převzaté údaje je vypůjčovatel Svoluji k zapůjčení své diplomové práce ke studijním účelům a prosím, aby byla vedena přesná evidence vypůjčovatelů. Převzaté údaje je vypůjčovatel povinen řádně ocitovat. UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká

Více

Základy imunologických metod: interakce antigen-protilátka využití v laboratorních metodách

Základy imunologických metod: interakce antigen-protilátka využití v laboratorních metodách Základy imunologických metod: interakce antigen-protilátka využití v laboratorních metodách Obecné principy reakce antigenprotilátka 1929 Kendall a Heidelberg Precipitační reakce Oblast nadbytku protilátky

Více

RECEPTORY CYTOKINŮ A PŘENOS SIGNÁLU. Jana Novotná

RECEPTORY CYTOKINŮ A PŘENOS SIGNÁLU. Jana Novotná RECEPTORY CYTOKINŮ A PŘENOS SIGNÁLU Jana Novotná Co jsou to cytokiny? Skupina proteinů a peptidů (glykopeptidů( glykopeptidů), vylučovaných živočišnými buňkami a ovlivňujících buněčný růst (též růstové

Více

MEMBRÁNOVÝ PRINCIP BUŇKY

MEMBRÁNOVÝ PRINCIP BUŇKY MEMBRÁNOVÝ PRINCIP BUŇKY Gorila východní horská Gorilla beringei beringei Uganda, 2018 jen cca 880 ex. Biologie 9, 2018/2019, Ivan Literák MEMBRÁNOVÝ PRINCIP BUŇKY MEMBRÁNOVÝ PRINCIP BUŇKY živá buňka =

Více

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Mária Majeská Čudejková 3. Proteosyntéza Centrální dogma molekulární biologie Rozluštění genetického kódu in vitro Marshall Nirenberg a Heinrich Matthaei zjistili,

Více

(molekulární) biologie buňky

(molekulární) biologie buňky (molekulární) biologie buňky Buňka základní principy Molecules of life Centrální dogma membrány Metody GI a MB Interakce Struktura a funkce buňky - principy proteiny, nukleové kyseliny struktura, funkce

Více

Struktura a funkce biomakromolekul

Struktura a funkce biomakromolekul Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 7. Interakce DNA/RNA - protein Ivo Frébort Interakce DNA/RNA - proteiny v buňce Základní dogma molekulární biologie Replikace DNA v E. coli DNA polymerasa a

Více

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Mária Čudejková 2. Transkripce genu a její regulace Transkripce genetické informace z DNA na RNA Transkripce dvou genů zachycená na snímku z elektronového mikroskopu.

Více

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Organismy se skládají z molekul rozličných látek Jednotlivé látky si organismus vytváří sám z jiných látek,

Více

Humorální imunita. Nespecifické složky M. Průcha

Humorální imunita. Nespecifické složky M. Průcha Humorální imunita Nespecifické složky M. Průcha Humorální imunita Výkonné složky součásti séra Komplement Proteiny akutní fáze (RAF) Vztah k zánětu rozdílná funkce zánětu Zánět jako fyziologický kompenzační

Více

Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození

Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození bunka - stejná genetická výbava - funkce (proliferace, produkce látek atd.) závisí na diferenciaci diferenciace tkán - specializovaná produkce

Více

Obecný metabolismus.

Obecný metabolismus. mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 Obecný metabolismus. Regulace glykolýzy a glukoneogeneze (5). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie,

Více

Energetický metabolizmus buňky

Energetický metabolizmus buňky Energetický metabolizmus buňky Buňky vyžadují neustálý přísun energie pro tvorbu a udržování biologického pořádku (život). Tato energie pochází z energie chemických vazeb v molekulách potravy (energie

Více

Obsah. Seznam zkratek... 15. Předmluva k 5. vydání... 21

Obsah. Seznam zkratek... 15. Předmluva k 5. vydání... 21 Obsah Seznam zkratek... 15 Předmluva k 5. vydání... 21 1 Základní pojmy, funkce a složky imunitního systému... 23 1.1 Hlavní funkce imunitního systému... 23 1.2 Antigeny... 23 1.3 Druhy imunitních mechanismů...

Více

Mechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová

Mechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová Mechanismy hormonální regulace metabolismu Vladimíra Kvasnicová Osnova semináře 1. Obecný mechanismus působení hormonů (opakování) 2. Příklady mechanismů účinku vybraných hormonů na energetický metabolismus

Více

Prezentace navazuje na základní znalosti z biochemie (lipidy, proteiny, sacharidy) Dynamický fluidní model membrány 2008/11

Prezentace navazuje na základní znalosti z biochemie (lipidy, proteiny, sacharidy) Dynamický fluidní model membrány 2008/11 RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie PřF UP Olomouc Prezentace navazuje na základní znalosti z biochemie (lipidy, proteiny, sacharidy) Rozšiřuje přednášky: Stavba cytoplazmatické membrány Membránový

Více

Vnitřní prostředí organismu. Procento vody v organismu

Vnitřní prostředí organismu. Procento vody v organismu Vnitřní prostředí organismu Procento vody v organismu 2 Vnitřní prostředí organismu Obsah vody v různých tkáních % VODY KREV 83% SVALY 76% KŮŽE 72% KOSTI 22% TUKY 10% ZUBNÍ SKLOVINA 2% 3 Vnitřní prostředí

Více

Lipidy a biologické membrány

Lipidy a biologické membrány Lipidy a biologické membrány Rozdělení a struktura lipidů Biologické membrány - lipidové složení Membránové proteiny Transport látek přes membrány Přenos informace přes membrány Lipidy Nesourodá skupina

Více

Biosyntéza a degradace proteinů. Bruno Sopko

Biosyntéza a degradace proteinů. Bruno Sopko Biosyntéza a degradace proteinů Bruno Sopko Obsah Proteosyntéza Post-translační modifikace Degradace proteinů Proteosyntéza Tvorba aminoacyl-trna Iniciace Elongace Terminace Tvorba aminoacyl-trna Aminokyselina

Více

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 2. PLASMATICKÁ MEMBRÁNA

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 2. PLASMATICKÁ MEMBRÁNA LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 2. PLASMATICKÁ MEMBRÁNA TEORETICKÝ ÚVOD: Cytoplasmatická membrána je lipidová dvouvrstva o tloušťce asi 5 nm oddělující buňku od okolního prostředí. Nejvíce jsou v

Více

Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce

Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce 1. Máte pufr připravený smísením 150 ml CH3COOH o c = 0,2 mol/l a 100 ml CH3COONa o c = 0,25 mol/l. Jaké bude ph pufru, pokud přidáme 10 ml

Více

Obsah. Seznam zkratek Předmluva k 6. vydání... 23

Obsah. Seznam zkratek Předmluva k 6. vydání... 23 Obsah Seznam zkratek... 17 Předmluva k 6. vydání... 23 1 Základní pojmy, funkce a složky imunitního systému... 25 1.1 Hlavní funkce imunitního systému... 25 1.2 Antigeny... 25 1.3 Druhy imunitních mechanismů...

Více

Adenylát cyklázový toxin bakterie Bordetella pertussis: mechanizmus úniku draselných iontů z makrofágů

Adenylát cyklázový toxin bakterie Bordetella pertussis: mechanizmus úniku draselných iontů z makrofágů Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Katedra genetiky a mikrobiologie Adenylát cyklázový toxin bakterie Bordetella pertussis: mechanizmus úniku draselných iontů z makrofágů Eva Pospíšilová

Více

BIOMEMBRÁNY. Sára Jechová, leden 2014

BIOMEMBRÁNY. Sára Jechová, leden 2014 BIOMEMBRÁNY Sára Jechová, leden 2014 zajišťují ohraničení buněk- plasmatické membrány- okolo buněčné protoplazmy, bariéra v udržování rozdílů mezi prostředím uvnitř buňky a okolím a organel= intercelulární

Více

Metody práce s proteinovými komplexy

Metody práce s proteinovými komplexy Metody práce s proteinovými komplexy Zora Nováková, Zdeněk Hodný Proteinové komplexy tvořeny dvěma a více proteiny spojenými nekovalentními vazbami Van der Waalsovy síly vodíkové můstky hydrofobní interakce

Více

RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie, PřF UP Olomouc

RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie, PřF UP Olomouc RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie, PřF UP Olomouc Výukové materiály: http://www.zoologie.upol.cz/osoby/fellnerova.htm Prezentace navazuje na základní znalosti Biochemie a cytologie. Bezprostředně

Více

Buněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky

Buněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky Buněčný cyklus Replikace DNA a dělení buňky 2 Regulace buněčného dělení buněčný cyklus: buněčné dělení buněčný růst kontrola kvality potomstva (dceřinných buněk) bránípřenosu nekompletně zreplikovaných

Více

Bílkoviny - proteiny

Bílkoviny - proteiny Bílkoviny - proteiny Proteiny jsou složeny z 20 kódovaných aminokyselin L-enantiomery Chemická struktura aminokyselin R představuje jeden z 20 různých typů postranních řetězců R Hlavní řetězec je neměnný

Více

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení

Více

Intracelulární detekce Foxp3

Intracelulární detekce Foxp3 Intracelulární detekce Foxp3 Ústav imunologie 2.LFUK a FN Motol Daniela Rožková, Jan Laštovička T regulační lymfocyty (Treg) Jsou definovány funkčně svou schopností potlačovat aktivaci a proliferaci CD4+

Více

Bp1252 Biochemie. #11 Biochemie svalů

Bp1252 Biochemie. #11 Biochemie svalů Bp1252 Biochemie #11 Biochemie svalů Úvod Charakteristickou funkční vlastností svalu je schopnost kontrakce a relaxace Kontrakce následuje po excitaci vzrušivé buněčné membrány je přímou přeměnou chemické

Více

Mnohobuněčné kvasinky

Mnohobuněčné kvasinky Laboratoř buněčné biologie PROJEKT Mnohobuněčné kvasinky Libuše Váchová ve spolupráci s laboratoří Prof. Palkové (PřFUK) Do laboratoře přijímáme studenty se zájmem o vědeckou práci Kontakt: vachova@biomed.cas.cz

Více

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. OBVSB/Obecná virologie Tento projekt je spolufinancován Evropským

Více

d) Kanály e) Přenašeče a co-transportéry, mediátory difúze a sekundární aktivní transport f) Intracelulární transport proteinů

d) Kanály e) Přenašeče a co-transportéry, mediátory difúze a sekundární aktivní transport f) Intracelulární transport proteinů MBR2 2016 2) Membránový transport 1 d) Kanály e) Přenašeče a co-transportéry, mediátory difúze a sekundární aktivní transport f) Intracelulární transport proteinů d) Kanály Rostliny: iontové kanály a akvaporiny

Více

Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta

Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Studijní program: Mikrobiologie Radovan Fišer Fluorescenční studie bakteriálních membránových proteinů a buněčné signalizace (Fluorescence studies of bacterial

Více

Univerzita Karlova v Praze

Univerzita Karlova v Praze Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Katedra genetiky a mikrobiologie Diplomová práce Příprava a charakterizace rekombinantního adenylát cyklázového toxoidu bakterie Bordetella pertussis nesoucího

Více

THE YIN AND YANG OF A BACTERIAL TOXIN

THE YIN AND YANG OF A BACTERIAL TOXIN THE YIN AND YANG OF A BACTERIAL TOXIN Fooling host Immunity and delivering T cell vaccines P. Šebo PRAGUE Institute of Microbiology Academy of Sciences of the CR Bordetella pertussis The agent of whooping

Více

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/ I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í I ti d j dělá á í Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním

Více

HLA - systém. Marcela Vlková

HLA - systém. Marcela Vlková HLA - systém Marcela Vlková Hlavní histokompatibilitní komplex Jedná se o genetický systém, který je primárně zodpovědný za rozeznávání vlastního od cizorodého (Major Histocompatibility Complex). U člověka

Více

Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor)

Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor) RNAi Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor) Místo silné pigmentace se objevily rostliny variegované a dokonce bílé Jorgensen pojmenoval tento fenomén

Více

V organismu se bílkoviny nedají nahradit žádnými jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.

V organismu se bílkoviny nedají nahradit žádnými jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy. BÍLKOVINY Bílkoviny jsou biomakromolekulární látky, které se skládají z velkého počtu aminokyselinových zbytků. Vytvářejí látkový základ života všech organismů. V tkáních vyšších organismů a člověka je

Více

ve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv

ve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv Urbanová Anna ve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv strukturní rysy mrna proces degradace každá mrna v

Více

Transport a sekrece bakterií a kvasinek

Transport a sekrece bakterií a kvasinek Transport a sekrece bakterií a kvasinek Proteiny prokaryotních mikroorganismů určené k transportu obsahují na N- terminálním konci sekvence nazývané signální peptidy. Základní fosfolipidová molekula Základní

Více

Regulace metabolických drah na úrovni buňky

Regulace metabolických drah na úrovni buňky Regulace metabolických drah na úrovni buňky EB Obsah přednášky Obecné principy regulace metabolických drah na úrovni buňky regulace zajištěná kompartmentací metabolických dějů změna absolutní koncentrace

Více