Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu)



Podobné dokumenty
Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic

Chřipka jako zoonóza

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Kvantové tečky. a jejich využití v bioanalýze. Jiří Kudr SPOLEČNĚ PRO VÝZKUM, ROZVOJ A INOVACE CZ/FMP.17A/0436

NANOMATERIÁLY, NANOTECHNOLOGIE, NANOMEDICÍNA

1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně

Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil

Martina Havlíčková Helena Jiřincová. NRL pro chřipku, Státní zdravotní ústav

2. Srovnání postupů izolace DNA kolonky vs. paramagnetické částice

NAŘÍZENÍ KOMISE (EU) /... ze dne , kterým se mění nařízení (ES) č. 847/2000, pokud jde o definici pojmu podobný léčivý přípravek

Nanobiotechnologie a bionanotechnologie

Výzkumné centrum genomiky a proteomiky. Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.

Obsah. Sarkosin Charakterizace slepičích protilátek proti sarkosinu. Dagmar Uhlířová

Tento rámcový přehled je určen všem studentům zajímajícím se o aktivní vědeckou práci.

Chřipka prasat z pohledu veterinárního lékaře

CHŘIPKA. Mgr. Marie Vilánková. Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D. Brno, 20. března 2014

METODY IDENTIFIKACE VIRU HIV

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:

Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche

Klinické formy sezónn. M.Havlíčková, H.Jiřincová, J.Kynčl

Aglutinace Mgr. Jana Nechvátalová

Respirační viry. MUDr. Jana Bednářová, Ph.D. OKM FN Brno

Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM

Uhlíkové struktury vázající ionty těžkých kovů

CHŘIPKOVÉ VIRY STRUKTURA, REPLIKACE, ANTIGENY, GENETICKÉ ZVLÁŠTNOSTI EMIL PAVLÍK

Pandemický plán Ústeckého kraje. MUDr. Josef Trmal Ph.D.

Izolace nukleových kyselin

Číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/ Název školy. Moravské gymnázium Brno, s.r.o. Autor. Mgr. Martin Hnilo. Biologie 1 Nebuněční viry.

Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..

Rekombinantní protilátky, bakteriofágy, aptamery a peptidové scaffoldy pro analytické a terapeutické účely Luděk Eyer

Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky

Nanostruktury a zobrazovací metody v medicíně

Fatální forma influenzy drůbeţe v chovu krůt

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

Magnetotaktické bakterie

DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod.

Diagnostika a epidemiologie HIV. Vratislav Němeček, Marek Malý NRL pro HIV/AIDS, Státní zdravotní ústav, Praha

9. Lipidy a biologické membrány

Co nového přinesl chřipkový kongres Toronto VI.2007

Název: Hmoto, jsi živá? I

Sérologická diagnostika chřipky možnosti a diagnostická úskalí

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Zpráva o postupu projektu TA

5. Lipidy a biomembrány

MAGNETICKÉ MATERIÁLY PRO BIORAFINACI POTRAVINÁŘSKÝCH ODPADŮ

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Laboratorní di agnostik HBV HCV a Vratislav Němeček Státní zdravotní stav ústav

Veronika Janů Šárka Kopelentová Petr Kučera. Oddělení alergologie a klinické imunologie FNKV Praha

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

IZOLACE DNA POMOCÍ MAGNETIZOVATELNÝCH ČÁSTIC A JEJICH VYUŽITÍ V DIAGNOSTICE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ

Biologická léčiva. Co jsou to biosimilars a jak se vyrábějí. Michal Hojný

Oddělení Povinné ukazatelé kvality Časové období r. 2015

Metody testování humorální imunity

Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014

HPV - Lidský papilomavirus průkaz DNA typů s vysokým rizikem kancerogenity. MUDr. Petra Novotná Laboratoře Mikrochem

Renáta Kenšová. Název: Školitel: Datum:

Terapeutické klonování, náhrada tkání a orgánů

Metody testování humorální imunity

Virus lidského imunodeficitu. MUDr. Jana Bednářová, PhD. OKM FN Brno

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

Analýza pandemie infekce A/H1N1 v Krajské nemocnici Liberec a jejího dopadu na intenzivní péči

ANALYTICKÉ ZKUŠEBNICTVÍ

9. Lipidy a biologické membrány

Advanced Therapies Products Produkty Moderní terapie a výrobní laboratoře. Barbara Kubešová

Diagnostika retrovirů Lentiviry - HIV. Vladislava Růžičková

PŘÍPRAVA ZDRAVOTNICKÉHO ZAŘÍZENÍ NA PANDEMII CHŘIPKY

Prezentace navazuje na základní znalosti z biochemie (lipidy, proteiny, sacharidy) Dynamický fluidní model membrány 2008/11

Vizualizace DNA ETHIDIUM BROMID. fluorescenční barva interkalační činidlo. do gelu do pufru barvení po elfu SYBR GREEN

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

Genetický screening predispozice k celiakii

CENÍK PRO SAMOPLÁTCE - INFEKČNÍ SÉROLOGIE

Tekuté biopsie u mnohočetného myelomu

GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI

STUDIE GENOMON VÝSKYT GENETICKY MODIFIKOVANÝCH POTRAVIN V TRŽNÍ SÍTI V ČR V ROCE M. Mendlová, V. Ostrý, J. Ruprich

Serologické vyšetřovací metody

Příprava na pandemii chřipky status quo

15 hodin praktických cvičení

Molekulární biotechnologie č.9. Cílená mutageneze a proteinové inženýrství

Úvod do biochemie. Vypracoval: RNDr. Milan Zimpl, Ph.D.

Lékařská mikrobiologie současné možnosti oboru v AČR

Chlíbek Roman. Katedra epidemiologie Fakulta vojenského zdravotnictví UO Hradec Králov. lové

2) Vztah mezi člověkem a bakteriemi

Informace o záměru projektu AstroBioCentra

Počítačová chemie. výpočetně náročné simulace chemických a biomolekulárních systémů. Zora Střelcová

ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN

Tisková zpráva závěrečné zprávy projektu

Nanotechnologie a Nanomateriály na PřF UJEP Pavla Čapková

Nanotransportéry pro teranostické aplikace

Precipitační a aglutinační reakce

ZÁSADY SPRÁVNÉ LABORATORNÍ PRAXE VYBRANÁ USTANOVENÍ PRAKTICKÉ APLIKACE

Virové hepatitidy. MUDr. Jana Bednářová, PhD. OKM FN Brno

Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii

Mediální odraz pandemické chřipky. Prof. MUDr. Roman Prymula, CSc., Ph.D.

Chřipka podceňované onemocnění

Studijní materiál speciál č. 41 Říjen 2007 Lze předvídat novou pandemii chřipky? (The Next Influenza Pandemic. Can It Be Predicted?

Transkript:

Název: Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu) Školitel: Ludmila Krejčová, MVDr. Datum: 7.11. 2013 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu

Izolace chřipkového proteinu pomocí paramagnetických částic Paramagnetické částice (MPs) - nejčastěji vyrobené z magnetitu nebo maghemitu - jsou využívány pro izolaci, separaci a transport molekul (nukleových kyselin, proteinů) nebo i celých buněk - MPs jsou schopny reagovat na vnější magnetické pole, čehož se využívá pro efektivní separaci molekul ze vzorku Modifikované paramagnetické částice - velikost částic se pohybuje v rozsahu 1-100nm (nanočástice) nebo 1-100 µm (mikročástice) - částice a na ně navázané molekuly se mohou rychle aglomerovat nebo resuspendovat v médiu v závislosti na změnu vnějšího magnetického pole - tyto magnetické vlastnosti MPs se široce používají při izolaci nukleových kyselin, proteinů a dalších molekul. Výhodou magnetické separace je možnost modifikace povrchu MPs (tedy obalení povrchu látkou biologického původu, která má afinitu k látce, kterou potřebujeme izolovat Modifikované paramagnetické částice - detail

Principy izolace pomocí MPs - využívá se afinity dvou látek (streptavidin-biotin, antigen-protilátka, enzym-substrát) - jestliže potřebujeme izolovat antigen můžeme MPs modifikovat protilátkou - jestliže potřebujeme izolovat DNA modifikujeme jeden konec DNA biotinem a povrch MPs modifikujeme streptavidinem Tento způsob izolace biomolekul je ve spojení s detekcí (např.: elektrochemickou) méně náročný na čas a vybavení laboratoře a je vysoce senzitivní. Další velká výhoda je to, že při izolaci ze vzorku nezáleží na typu matrice ( to co je ve vzorku mimo cílovou molekulu proteiny, sacharidy ) Využití MPs: cílený transport léčiv, genová terapie, diagnostika onemocnění Paramagnetické částice

Chřipka - je akutní infekční onemocnění způsobené viry z čeledi Orthomyxoviridae - chřipkové viry jsou považovány za potencionální původce pandemie - největší pandemií byla Španělská chřipka (1918) - nebezpečí spočívá v rychlosti mutace chřipkových virů až 100x větší v porovnání s ostatními (Ebola) - Antivirotika dostupná jsou, ale některé subtypy chřipky vykazují rezistenci až v 70% PB2 PB1 PA HA NP NA M1+M2 NS1+NS2 PB1, PB2, PA (transkripční komplex) M2( iontový kanál) Lipidová dvojvrstva NS2 M1 (matrix protein) HA(hemaglutinin) NA(neuraminidáza) NP(nucleocapsida) Schéma chřipkového virionu model chřipkového virionu

Izolace pomocí paramagnetických částic vazba chřipkového proteinu Principy izolace pomocí MPs značeného glykanu - využívá se afinity dvou látek (glykan a hemaglutinin) - glykanem je v tomto případě zbytek sialové kyseliny, která se vyskytuje na povrchu buněk plicních sklípků - Hemaglutinin (povrchový antigen chřipky) vykazuje vysokou afinitu k sialové kyselině) - Hemaglutininy i sialová kyseliny jsou druhově specifické

Izolace od chřipky odvozeného oligonukleotidu pomocí paramagnetických částic A B 3x promytí vazba glycanu + Gly Gly vazba H5N1 C Gly + CdS 3x promytí Gly CdS ultrazvuk D Gly CdS + 3x promytí Gly CdS 3x promytí Electrochemická detekce proteinu a Cd: + CdS Schéma H5N1-CdS electrochemické izolace a detekce. A streptavidinem značená magnetická částice (MPs), B biotinylovaný glycan který se naváže ke streptavidinem značené MPs (afinita biotin-streptavidin), C vazba hemaglutininu, který byl předem značen kvanotvou tečkou (CdS), D Electrochemická detekce proteinu (hemaglutinin) a Cd ( z kvantové tečky).

Izolace chřipkového proteinu pomocí paramagnetických částic Tento způsob izolace je ve spojení s detekcí (např.: elektrochemickou) méně náročný na čas a vybavení laboratoře a je vysoce senzitivní. Další velká výhoda je to, že při izolaci ze vzorku nezáleží na typu matrice. Využití této metody: diagnostika chřipkových virů

Děkuji Vám za pozornost Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu