CZ.1.07/2.2.00/ Obecný metabolismu. Cyklus trikarboxylových kyselin (citrátový cyklus, Krebsův cyklus) (8).

Podobné dokumenty
9. Citrátový cyklus, oxidační dekarboxylace pyruvátu a anaplerotické dráhy

CYKLUS TRIKARBOXYLOVÝCH KYSELIN A GLYOXYLÁTOVÝ CYKLUS

Citrátový cyklus. Tomáš Kučera.

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Citrátový a glyoxylátový cyklus

Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech

Katabolismus - jak budeme postupovat

METABOLISMUS SACHARIDŮ

Obecný metabolismus.

Centrální metabolické děje

METABOLISMUS SACHARIDŮ

METABOLISMUS SACHARIDŮ

1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu

Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět -

Regulace metabolických drah na úrovni buňky

Propojení metabolických drah. Alice Skoumalová

Úvod do buněčného metabolismu Citrátový cyklus. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1. LF UK

Štěpení lipidů. - potravou přijaté lipidy štěpí lipázy gastrointestinálního traktu

Didaktické testy z biochemie 2

Přehled energetického metabolismu

Intermediární metabolismus. Vladimíra Kvasnicová

Metabolismus mikroorganismů

1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu

Odbourávání a syntéza glukózy

Odbourávání lipidů, ketolátky

CZ.1.07/2.2.00/ Obecný metabolismus. Energetický metabolismus (obecně) (1).

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolusmus lipidů - anabolismus

Glykolýza Glukoneogeneze Regulace. Alice Skoumalová

Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie Napište vzorce aminokyselin Q a K

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Glykolýza a neoglukogenese

Biochemie jater. Eva Samcová

Metabolické dráhy. František Škanta. Glykolýza. Repetitorium chemie X. 2011/2012. Glykolýza. Jaký je osud pyruátu bez přítomnosti kyslíku?

Buněčné dýchání Ch_056_Přírodní látky_buněčné dýchání Autor: Ing. Mariana Mrázková

Otázka: Metabolismus. Předmět: Biologie. Přidal(a): Furrow. - přeměna látek a energie

Bp1252 Biochemie. #8 Metabolismus živin

Energetický metabolizmus buňky

Integrace a regulace savčího energetického metabolismu

POZNÁMKY K METABOLISMU SACHARIDŮ

11. Metabolismus lipidů

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Metabolismus sacharidů. VY_32_INOVACE_Ch0216.

sloučeniny C, H, O Cukry = glycidy = sacharidy staré názvy: uhlohydráty, uhlovodany, karbohydráty

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Citrátový cyklus. VY_32_INOVACE_Ch0218.

ANABOLISMUS SACHARIDŮ

Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie

DYNAMICKÁ BIOCHEMIE. Daniel Nechvátal ::

Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová

Ukázky z pracovních listů z biochemie pro SŠ A ÚVOD

Sylabus pro předmět Biochemie pro jakost

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolusmus lipidů - katabolismus

fce jater: (chem. továrna, jako 1. dostává všechny látky vstřebané GIT) METABOLICKÁ (jsou metabolicky nejaktivnější tkání v těle)

Sacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus)

Metabolismus lipidů. (pozn. o nerozpustnosti)

pátek, 24. července 15 GLYKOLÝZA

CZ.1.07/2.2.00/ Obecný metabolismu. Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze (3).

Regulace metabolických drah na úrovni buňky. SBT 116 Josef Fontana

Ukládání energie v buňkách

Respirace. (buněčné dýchání) O 2. Fotosyntéza Dýchání. Energie záření teplo BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3

- metabolismus soubor chemických reakcí probíhajících v živých organismech a mezi organismy a jejich životním prostředím

MitoSeminář II: Trochu výpočtů v bioenergetice. Souhrn. MUDr. Jan Pláteník, PhD. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK

AMPK AMP) Tomáš Kuc era. Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze

Repetitorium chemie 2016/2017. Metabolické dráhy František Škanta

Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy v Praze (

Intermediární metabolismus - SOUHRN - Vladimíra Kvasnicová

Metabolismus sacharidů

Efektivní adaptace začínajících učitelů na požadavky školské praxe

Lipidy. Nesourodá skupina látek Látky nerozpustné v polárních rozpouštědlech Složky: MK, alkoholy, N látky, sacharidy, kyselina fosforečná

Syntéza a degradace mastných kyselin. Martina Srbová

Aerobní odbourávání cukrů+elektronový transportní řetězec

Enzymologie. Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů.

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Transport elektronů a oxidativní fosforylace

Fyziologie buňky. RNDr. Zdeňka Chocholoušková, Ph.D.

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolismus dusíkatých látek

Trávení a metabolismus

Dýchací řetězec (DŘ)

Energie fotonů je předávána molekulám chlorofylu A, který se zachyceným fotonem excituje (uvolní se energeticky bohatý elektron).

Metabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Metabolismus lipidů - odbourávání. VY_32_INOVACE_Ch0212

Buněčný metabolismus. J. Vondráček

Konsultační hodina. základy biochemie pro 1. ročník. Přírodní látky Úvod do metabolismu Glykolysa Krebsův cyklus Dýchací řetězec Fotosynthesa

Dýchací řetězec, oxidativní fosforylace, mitochondriální transportní systémy

Repetitorium chemie 2015/2016. Metabolické dráhy František Škanta

Biosyntéza a metabolismus bílkovin

12. Metabolismus lipidů a glycerolu. funkce karnitinu a β-oxidace

Diabetes mellitus. úplavice cukrová - heterogenní onemocnění působení inzulínu. Metabolismus glukosy. Insulin (5733 kda)

Metabolismus, taxonomie a identifikace bakterií. Karel Holada khola@lf1.cuni.cz

Energetika a metabolismus buňky

Nukleové kyseliny. Nukleové kyseliny. Genetická informace. Gen a genom. Složení nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie

ENZYMY. RNDr. Lucie Koláčná, Ph.D.

Eva Benešová. Dýchací řetězec

33.Krebsův cyklus. AZ Smart Marie Poštová

Stanovení vybraných enzymů. Roman Kanďár

Biochemie jater. Vladimíra Kvasnicová

Metabolismus aminokyselin 2. Vladimíra Kvasnicová

B4, 2007/2008, I. Literák

Brno e) Správná odpověď není uvedena. c) KHPO4. e) Správná odpověď není uvedena. c) 49 % e) Správná odpověď není uvedena.

Regulace metabolizmu lipidů

METABOLISMUS. Přeměna látek a energií. Souhrn všech procesů probíhajících v organismu s cílem získání a zpracování energie a stavebních látek

glukóza *Ivana FELLNEROVÁ, PřF UP Olomouc*

14. Fyziologie rostlin - fotosyntéza, respirace

Základy biochemie KBC / BCH. Metabolismus lipidů. Inovace studia biochemie prostřednictvím e-learningu CZ / /0407

FOTOSYNTÉZA ZÁKLAD ŽIVOTA NA ZEMI

Transkript:

mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii Z.1.07/2.2.00/28.0171 becný metabolismu. yklus trikarboxylových kyselin (citrátový cyklus, Krebsův cyklus) (8). Prof. RNDr. Pavel Peč, c. Katedra biochemie, Přírodovědecká fakulta UP, lomouc

Mastné kyseliny a triacylglyceroly. Mastné kyseliny mají čtyři fyziologické úlohy: a) Masné kyseliny jsou stavební jednotky fosfolipidů a glykolipidů b) Mnohé proteiny jsou modifikovány vazbou s mastnými kyselinami jako součást membrán. c) Mastné kyseliny jsou energeticky velmi bohaté.jsou skladovány jako triacylglyceroly (triglyceridy neutrální estery mastných kyselin s glycerolem). d) Deriváty mastných kyselin působí jako hormony nebo intracelulární poslové. dbourávání mastných kyselin probíhá v matrix mitochondrie (boxidace) za tvorby mnoha acetyl oa, které vstupují do citrátového cyklu.

Degradace a tvorba mastných kyselin. Aktivovaná mastná kyselina je oxidována za tvorby dvojné vazby (FAD 2 ). Dvojná vazba je následně hydratována (vnese se kyslík z vody); vzniklý alkohol je oxidován na keton (NAD) a konečně je čtyřuhlíkatý fragment štěpen za účasti oa, vzniku acetyl oa a mastné kyseliny kratší o dva uhlíky. yntéza mastných kyselin je obráceným postupem degradace. Probíhá v cytoplasmě a aktivními prekurzory jsou acetyl oa a malonyl oa. Malonyl se kondenzuje s acetylem za tvorby čtyřuhlíkatého fragmentu. Fragment je dále redukován (NADP), dehydratován a znova redukován. Karbonyl se tak převádí na methylenovou skupinu za tvorby butyryl oa. Další malonyl oa se kondenzuje s butyrylovou jednotkou a proces se opakuje do délky řetězce 16. yntéza mastných kyselin u eukaryot probíhá na multifunkčním enzymovém komplexu.

Triacylglyceroly. Triacylglyceroly reprezentují velmi koncentrovanou formu skladované energie (savci adiposní tkáň). Výsledkem kompletní oxidace mastných kyselin je zisk 38 kj/g. Ze sacharidů a proteinů získáme jen 17 kj/g. Jeden gram bezvodého triglyceridu skladuje 6x více energie než jeden gram hydratovaného glykogenu. Kompletní oxidací palmitátu získáme 106 molekul ATP. Štěpení triglyceridů na mastné kyseliny a glycerol katalyzují specifické pankreatické lipasy. Acetyl oa vzniklý degradací mastných kyselin vstupuje v první řadě do citrátového cyklu. Další možností jeho využití je tvorba ketolátek a cholesterolu a z něho odvozených steroidních hormonů a žlučových kyselin.

itrátový cyklus (cyklus trikarboxylových kyselin, Krebsův cyklus) itrátový cyklus () je centrální cyklická metabolická dráha. Do citrátového cyklu vstupují degradační produkty ve formě dvouhlíkatého acetyl oa ze sacharidů, proteinů a mastných kyselin). Lokalizace : Proces: Počet stupňů a meziproduktů: 8 Produkty: matrix mitochondrie aerobní a amfibolický 1 GTP (ATP), 3 NAD, 1 FAD 2, 2 2. Redukované koenzymy NAD a FAD 2 jsou bezprostředně reoxidovány ve vnitřní mitochondriální membráně za účasti kyslíku a tvorby ATP a vody.

itrátový cyklus (cyklus trikarboxylových kyselin, Krebsův cyklus) techiometrie : Acetyl oa 3 NAD FAD GDP P i 2 2 2 2 3 NADP FAD 2 GTP 2 oa itrátový cyklus je konečná společná metabolická dráha aerobní oxidace energeticky bohatých molekul. yklus je důležitý zdroj stavebních jednotek pro tvorbu řady důležitých molekul. yklus je kontrolován na řadě stupňů.

citrátsynthasa. is 320 N 2 xaloacetát N 2 2 N 2 oa itryloa is 274 N is 274 Asp 375 2 2 oa 3 oa Asp 375 2 itrát 2

akonitasa. 2 2 2 2 2 itrát cisakonitát Isocitrát

isocitrátdehydrogenasa. 2 2 2 2 NAD NAD Mn 2 2 Mn 2 Isocitrát xalosukcinát 2xoglutarát

2oxoglutarátdehydrogenasa. 2 2 oa 2 2 2 NAD NAD oa 2xoglutarát ukcinyloa

První fáze sukcinyloa synthetasové reakce. 2 2 oa P 1 2 2 P 3 2 oa ukcinyloa ukcinylfosfát

Druhá fáze sukcinyloa synthetasové reakce. Enzym Enzym 2 2 P 3 2 N N 2 2 2 N P 3 2 N ukcinylfosfát is ukcinát 3Fosfois

Třetí fáze sukcinyl oa synthetasové reakce. Enzym Enzym G P P N 3 N N N 2 P 3 G P P P GDP 3Fosfois is GTP

ukcinyloa synthetasa (sukcinátthiokinasa). avčí enzym obvykle katalyzuje tvorbu GTP z GDP a P i. U rostlin a bakterií je to ATP z ADP a P i. ATP a GTP jsou energeticky ekvivalentní, díky enzymu nukleosiddifosfátkinasa dochází k přechodu: GTP ADP GDP ATP D G o =!! Reakce katalyzovaná sukcinyloa synthetasou je další příklad fosforylace na úrovni substrátu (nezávisí na přítomnosti kyslíku). Reakce probíhá ve třech stupních: A) ukcinyloa reaguje s P i za tvorby sukcinylfosfátu a oa. B) Transfer fosfátu z sukcinylfosfátu na is enzymu za uvolnění sukcinátu. ) Fosfát z enzymu je přenesen na GDP za tvorby GTP. V tomto bodě citrátového cyklu je acetyl kompletně oxidován na dvě 2, dva NAD a GTP. Další část cyklu je převod sukcinátu na oxaloacetát

sukcinátdehydrogenasa. EFAD EFAD 2 ukcinát Fumarát

Mechanismus sukcinátdehydrogenasy. Fumarát Karbaniontový přechodový stav Malát

Pyruvátdehydrogenasový komplex. Lokalizace komplexu: játra Přenos dvouhlíkatých produktů mezi komponentami komplexu: alifatická raménka s koncem. Koenzymy: FAD, NAD, oa, lipoamid (amid kys. lipoové), thiamindifosfát(tpp) Komponenty enzymového komplexu: E 1 pyruvátdegydrogenasa (oxidativní dekarboxylace pyruvátu) E 2 dihydrolipoyltransacetylasa (přenos acetylu na oa) E 3 dihydrolipoyldehydrogenasa (regenerace oxid. formy lipoamidu)

Pyruvátdehydrogenasa (E 1 ). 3 R 2 R 1 N TPP E 1 E 1 3 Pyruvát 2 3 R 2 R 1 N E 1 3 ydroxyethyltpp E 1

Dihydrolipoyltranacetylasa (E 2 ) 3 R 2 3 R 2 R 1 N 3 E 1 3 R 2 N R 1 3 E 1 R 1 N TPP E 1 3 E 1 E 2 E 2 LipoamidE 2 E 2 AcetyldihydrolipoamidE 2

Transesterifikace (E 2 ). oa 3 oa 3 AcetyloA E 2 E 2 AcetyldihydrolipoamidE 2 DihydrolipoamidE 2

Dihydrolipoyldehydrogenasa (E 3 ). Regenerace lipoamidu. FAD FAD E 3 (oxidovaná forma) E 2 E 3 (redukovaná forma) E 2

malátdehydrogenasa. NAD NAD Malát xaloacetát

Pyruvátdehydrogenasový komplex je regulován allostericky a reversibilní fosforylací. Konečný produktem glykolýzy s uhlíkovým řetězcem je pyruvát. Před vstupem do musí být oxidačně převeden na acetyl oa a 2. Děje se tak v játrech na pyruvátdehyydrogenasovém komplexu. Proces převodu pyruvátu na acetyl oa je ireversibilní což je příčinou, že acetyl oa nemůže být převeden zpět na glukosu. Pyruvátdehydrogenasový komplex je inhibován v transacetylasové části (E 2 ) nadbytkem produktu acetylem oa. Další regulace je na části dihydrolipoyldehydrogenase (E 3 ), který inhibuje NAD. Klíčovou reakcí regulace komplexu u eukaryot je kovalentní modifikace komplexu fosforylací. Fosforylace pyruvátdehydrogenasové komponenty (E 1 ) katalyzovaná specifickou kinasou zastaví aktivitu komplexu úplně. K obnovení aktivity dojde působením specifické fosfatasy.

Regulace pyruvátdehydrogenasového komplexu. Zjednodušeně: Rostoucí poměry ATP/ADP, NAD/NAD a acetyl oa/oa vyvolávají fosforylaci a tím deaktivaci komplexu. Pyruvátdehydrogenasový komplex je vypínán za situace, kdy je dostatek energie a biosyntetických jednotek. Na druhé straně: pyruvát a ADP jsou signály nízkého stavu energie aktivující dehydrogenasu inhibicí kinasy. Insulin urychluje tvorbu acetyl oa stimulací defosforylace komplexu. Následkem toho je glukosa převáděna na pyruvát. Důležitost této kovalentní kontroly můžeme demonstrovat na lidech, kteří trpí deficitem fosfatasy. Pyruvátdehydrogenasa je normálně fosforylována a tedy neaktivní, glukosa je převáděna na kyselinu mléčnou. Dochází k neregulované laktátové acidose mnohé tkáně jsou nefunkční (p mimo optimum).

Regulace citrátového cyklu. itrátový cyklus je nastaven tak, aby optimálně produkoval potřebný ATP. Primární kontrolními reakcemi jsou allosterické regulace enzymů: Isocitrátdehydrogenasy. 2xoglutarátdehydrogenasy. Isocitrátdehydrogenasa je allostericky stimulována ADP což vede ke zvýšení afinity enzymu k substrátům. Kooperují isocitrát, NAD a Mg 2. NAD naopak inhibuje isocitrátdehydrogenasu vytěsněním NAD. Dalším inhibitorem je ATP. PZR: řada stupňů využívá NAD nebo FAD, kterých je dostatek jen, když je hladina energie na nízké úrovni.

Regulace citrátového cyklu. Druhým kontrolním místem je 2oxoglutarátdehydrogenasa. Enzym je homologem pyruvátdehydrogenasy a proto i jeho regulace je analogická. Enzym je inhibován sukcinyl oa a NAD. Navíc je enzym inhibován vysokým energetickým nábojem vysoká hladina ATP vede k inhibici enzymu. U mnoha bakterií je místem inhibice také vstup acetyl oa do cyklu. itrátsynthasa je allostericky inhibována ATP. Působením ATP dochází ke zvýšení hodnoty K m pro acetyl oa!! Když hladina ATP vzroste je méně enzymu saturováno acetyl oa a vytváří se méně citrátu.

itrátový cyklus jako zdroj biosyntetických prekurzorů. Meziprodukty slouží jako prekurzory řady biosyntéz. xaloacetát aminotransferasová reakce aspartát. Z Asp další aminokyseliny, pyrimidiny a puriny. xaloacetát glukoneogenez resyntéza glukosy. ukcinyl oa porfyriny, hem, chlorofyl. 2xoglutarát Glu, další aminokyseliny, puriny. itrát mastné kyseliny, steroly. ouhrnně je odnětí meziproduktů označeno jako reakce kataplerotické na rodíl od reakcí anaplerotických. Anaplerotické reakce naopak doplňují meziprodukty metabolických drah. U např. karboxylace pyruvátu získáme oxaloacetát, který reakcí s citrátsynthasou poskytne citrát.

Meziprodukty, pokud jsou využity k biosyntézám, musí být rychle doplněny. Jak je oxaloacetát doplňován? avci postrádají enzym pro přímou přeměnu acetyl oa na oxaloacetát nebo kterýkoliv další meziprodukt (viz glyoxylátový cyklus u mikroorganismů a rostlin). xaloacetát je doplňován karboxylací pyruvátu pyruvátkarboxylasou (koenzym biotin). Pyruvát 2 ATP 2 oxaloacetát ADP P i 2 Pyruvátkarboxylasa je významným enzymem glukoneogeneze. Enzym je aktivován acetyl oa signál potřeby oxaloacetátu! Pokud je hladina energie vysoká je oxaloacetát přeměňován na glukosu. Při nízké hladině energie doplňuje oxaloacetát meziprodukt. Anaplerotická reakce může se doplňovat kterýkoliv meziprodukt!!

Toxicita arsenitanů a organických sloučenin As (inhibice pyruvátdehydrogenasového komplexu Maryša ). As As 2 2 Arsenitan R Dihydrolipoamid R R 1 As rganická sloučenina arsenu R 1 As R R 2

ir ans Adolf KREB (19001981) 1900 Narozen v Německu. 1918 Nastoupil na studium mediciny. 1923 Absolvoval studium mediciny. 1925 Získal Ph.D. na univerzitě v amburku. 1932 bjev močovinového cyklu. 1933 Emigrace do Velké Britanie. 1937 bjev citrátového cyklu neboli Krebsova cyklu. 1945 Ustanoven profesorem na univerzitě v heffieldu. 1953 Udělena Nobelova cena v oboru Fyziologie a lékařství. 1954 Profesor na univerzitě v xfordu. 1958 Povýšen do šlechtického stavu (ir). 1981 Zemřel v xfordu, VB.